BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G64790.2
Length=8334
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg315447 jgi|Araly1|315447|fgenesh1_pm.C_scaffold_2000480 8216 0.0
Ahg907723 jgi|Araly1|907723|Al_scaffold_0002_804 603 9e-171
> Ahg315447 jgi|Araly1|315447|fgenesh1_pm.C_scaffold_2000480
Length=7623
Score = 8216 bits (4449), Expect = 0.0
Identities = 4702/4824 (97%), Gaps = 18/4824 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3293 GTTCTATATCATGTGCTAGGTGTTGTTCCCGCGTATCAAGCATCAGTTGGACCTGCACTG 3352
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2818 GTTCTATATCATGTTCTAGGTGTTGTTCCCGCATATCAAGCATCAGTTGGACCTGCACTG 2877
Query 3353 AATGAATTGTGTCTTGGATTGCAAGCAGATGATGTCGCAAATGCGCTCTATGGAGTCTAT 3412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2878 AATGAATTGTGTCTTGGATTGCAAGCAGATGATGTCGCAAATGCGCTCTATGGAGTCTAT 2937
Query 3413 TCAAAAGATGTTCATGTCAGACTCGCCTGCTTAAACGCTGTGAAGTGTATTCCAGCTGTT 3472
||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 2938 TCAAAAGATGTTCATGTCAGAATGGCCTGCTTGAACGCTGTAAAGTGTATCCCAGCTGTT 2997
Query 3473 TCCAAATGCTCCCTTCCTCAGAATGTTAAAATAGCAACAAACATTTGGATAGCTCTACAT 3532
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2998 TCCAAATGCTCCCTTCCTCAGAAAGTTAATATAGCAACAAATATTTGGATAGCTCTACAT 3057
Query 3533 GACCCTGAAAAGTCAGTGGCTGAATCAGCAGATGATTTATGGGCCCGCTATGGTCATGAT 3592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3058 GACCCTGAAAAGTCAGTGGCTGAATCAGCAGATGATTTATGGGCCCGCTATGGTCATGAT 3117
Query 3593 TTGGGGACTGATTATTCAGGAATCTTTAAAGCACTTTCTCATATAAATCTCAACGTCCGT 3652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 3118 TTGGGGACTGATTATTCAGGAATCTTTAAAGCACTTTCTCATATAAATCTCAATGTTCGT 3177
Query 3653 TTAGCTGCAGCAGAAGCACTGGCTGATGCTCTTCATGAAAGCCCGTCATCAATCCAGTTA 3712
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 3178 TTAGCTGCAGCAGAAGCACTGGCTGATGCTCTTCATGAAAGCCCGGCATCAATCCAGCTA 3237
Query 3713 TCCCTTTCAACTTTATTTTCTCTGTACATCCGTGATGCTACGTCTGGTGAGGATGTCTTT 3772
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3238 TCTCTTTCAACTTTATTTTCTCTGTACATCCGTGATGCTACGTCTGGTGAGGATGTCTTT 3297
Query 3773 GATGCTGGTTGGATAGGAAGGCAAGGAATTGCCTTAGCACTGCAATCTGCTGCTGACGTA 3832
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3298 GATGCTGGTTGGATAGGAAGGCAAGGAATTGCCTTAGCACTGCAATCTGCTGCTGACGTA 3357
Query 3833 TTGACAACAAAGGACCTTCCTGCTGTTATGACCTTTTTGATATCCCGCGCACTGGCTGAT 3892
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3358 TTGACAACAAAGGACCTTCCTGCTGTTATGACCTTTTTGATATCCCGCGCACTGGCTGAT 3417
Query 3893 CCCAACACAGATGTTCGTGGAAAGATGATCAATGCTGGTATCATGATTATTGATAAGCAT 3952
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3418 CCCAACACAGATGTTCGTGGAAAGATGATCAATGCTGGTATCATGATTATTGATAAGCAT 3477
Query 3953 GGCAAAGAAAACGTTTCATTGCTGTTCCCCATCTTTGAGAATTATTTAAATAAAGAGGCA 4012
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3478 GGGAAAGAAAACGTTTCATTGCTGTTCCCCATCTTTGAGAATTATTTAAATAAAGAGGCA 3537
Query 4013 TCTGATGAAGAGGAATATGACTTGGTTCGTGAGGGTGTTGTTATATTCACTGGAGCACTA 4072
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3538 TCTGATGAAGAGGAATATGACCTGGTTCGTGAGGGTGTTGTTATATTCACTGGAGCACTA 3597
Query 4073 GCAAAGCACTTAGCAAGAGATGATCCTAAAGTACATAATGTTGTGGAAAAGCTGTTGGAG 4132
||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3598 GCAAAGCACTTGGCAAAAGATGATCCTAAAGTCCATAATGTTGTGGAAAAGCTGTTGGAG 3657
Query 4133 GTGTTGAATACACCATCAGAATCTGTGCAACGTGCTGTCTCGACATGCCTTTCTCCACTT 4192
|||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3658 GTGTTGAACACACCATCAGAATCTGTGCAACGAGCAGTCTCAACATGCCTTTCTCCACTT 3717
Query 4193 GTGTTATCAAAGCAAGAGGAGGCCCCTGCCCtttttttGAGGCTCTTGGATAAGCTAATG 4252
||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3718 GTGCTATCAAAGCAAGAGGATGCCCCTGCCCTTTTTTTGAGGCTCTTGGATAAGCTAATG 3777
Query 4253 AAGAGTGATAAATATGGTGAGCGTAGAGGAGCAGCTTTTGGTCTTGCGGGAGTAGTTATG 4312
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3778 AAGAGTGATAAATATGGTGAGCGTAGAGGAGCAGCTTTTGGTCTTGCGGGAGTAGTTATG 3837
Query 4313 GGCTTTGGAATTTCTAGCTTGAAGAAATATGGTCTTATAGTCACTTTGCAAGAAGCACTT 4372
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3838 GGCTTTGGAATTTCTAGCTTGAAGAAATATGGTCTTATAGTCACTTTGCAAGAAGCACTT 3897
Query 4373 ATTGACAGAAATTCTGCTAAACGTCGTGAAGGAGCATTACTCGCATTTGAATGCCTCTGC 4432
||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3898 ATTGACAGAAATTCTGCGAAACGCCGTGAAGGAGCACTACTTGCATTTGAATGCCTCTGC 3957
Query 4433 GAGAAGCTTGGAAAATTATTTGAACCGTATGTGATAAAGATGTTACCCTTACTTCTGGTG 4492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3958 GAGAAGCTTGGAAAATTATTTGAACCGTATGTGATAAAGATGTTACCTTTACTTCTGGTG 4017
Query 4493 TCGTTCTCTGACCAAGTCGGAGCAGTTCGCGAAGCAGCAGAATGTGCTGCTCGAGCTATG 4552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4018 TCGTTCTCTGACCAAGTCGGAGCAGTTCGCGAAGCAGCAGAATGTGCTGCTCGAGCTATG 4077
Query 4553 ATGTCTCAACTATCTGCATATGGTGTGAAACTTGTCCTTCCTTCTCTACTCAAGGGACTT 4612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4078 ATGTCTCAACTATCTGCATATGGTGTGAAACTTGTCCTTCCTTCTCTACTCAAGGGACTT 4137
Query 4613 GAAGATAAAGCATGGAGAACAAAGCAAAGCAGTGTACAGCTCCTCGGTGCTATGGCATTT 4672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4138 GAAGATAAAGCATGGAGAACAAAGCAAAGCAGTGTACAGCTCCTCGGTGCTATGGCATTT 4197
Query 4673 TGTGCTCCTCAGCAACTGTCCCAATGTCTTCCTAGGGTTGTGCCAAAACTTACAGAGGTG 4732
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 4198 TGTGCTCCTCAGCAACTGTCTCAATGTCTTCCTAGGGTTGTGCCAAAACTTAC--A---G 4252
Query 4733 TTTAAAACTATACAGGTTTTGACGGATACACATCCAAAAGTCCAGTCAGCCGGGCAGTTA 4792
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4253 -------------AGGTTTTGACAGATACACATCCAAAAGTCCAGTCAGCTGGGCAGTTA 4299
Query 4793 GCACTTCAGCAGGTTGGAAGTGTCATAAAGAACCCAGAGATATCCTCTCTTGTCCCCACC 4852
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4300 GCTCTTCAGCAGGTTGGAAGTGTCATAAAGAACCCAGAAATATCCTCTCTTGTCCCCACG 4359
Query 4853 CTTCTATTGGCCTTAACAGATCCCAATGAGTACACACGCCATGCTCTTGACACCCTTCTT 4912
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||
Sbjct 4360 CTTCTGTTGGCCTTAACAGATCCCAATGAGTACACACGACATTCTCTTGACACCCTTCTT 4419
Query 4913 CAAACAACATTCGTTAATTCTGTTGATGCCCCCTCGCTTGCACTGTTGGTACCAATAGTA 4972
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4420 CAAACAACATTCGTTAATTCTGTTGATGCCCCCTCGCTTGCACTATTGGTACCAATAGTT 4479
Query 4973 CATAGAGGATTGAGAGAAAGAAGTTCTGAAACAAAAAAGAAAGCTTCTCAAATTGTCGGT 5032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4480 CATAGAGGATTGAGAGAAAGAAGTTCTGAAACAAAAAAGAAAGCTTCTCAAATTGTCGGT 4539
Query 5033 AATATGTGTTCTTTGGTGACAGAGCCAAAGGATATGATTCCTTACATAGGATTGCTCCTT 5092
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4540 AATATGTGTTCTTTGGTGACAGAGCCAAAGGATATGATTCCTTACATAGGATTGCTCCTT 4599
Query 5093 CCTGAGGTTAAAAAGGTTCTTGTGGATCCAATTCCCGAAGTACGTTCTGTTGCAGCAAGG 5152
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4600 CCTGAGGTTAAAAAGGTTCTTGTGGATCCAATTCCCGAGGTACGTTCTGTTGCAGCAAGG 4659
Query 5153 GCTGTTGGGTCACTTATTAGAGGAATGGGAGAGGATAATTTCCCAGATCTTGTTCCGTGG 5212
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4660 GCTGTTGGGTCACTTATCAGAGGAATGGGAGAGGATAATTTCCCAGATCTTGTTCCGTGG 4719
Query 5213 CTGTTTGAAACTCTAAAATCTGATACAAGCAATGTTGAAAGATATGGAGCCGCTCAGGGA 5272
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4720 CTGTTTGAAACTCTAAAATCTGATACAAGCAATGTTGAAAGATATGGAGCTGCTCAGGGA 4779
Query 5273 TTAAGTGAGGTTATAGCAGCTCTTGGGACAGATTACTTTGAGAATATACTTCCTGACCTC 5332
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4780 TTAAGTGAGGTTATAGCAGCTCTTGGGACAGATTACTTTGAGAATATACTTCCTGATCTC 4839
Query 5333 ATTCGTCATTGTTCTCATCAAAAAGCATCGGTCCGAGATGGATACCTTACGCTTTTCAAG 5392
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4840 ATTCGTCATTGTTCTCATCAAAAAGCATCAGTCCGAGATGGATACCTTACGCTTTTCAAG 4899
Query 5393 TTCTTGCCAAGATCCTTGGGTGCTCAGTTCCAGAAGTACTTGCAGCTTGTTTTACCGGCC 5452
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4900 TTCTTGCCAAGATCCTTGGGTGCTCAGTTCCAGAAGTACTTGCAGCTTGTTTTACCGGCT 4959
Query 5453 ATTCTGGATGGTCTTGCCGATGAGAATGAATCTGTTCGTGATGCAGCCCTGGGGGCTGGC 5512
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4960 ATTCTGGATGGTCTTGCCGATGAGAATGAATCTGTTCGTGATGCGGCCCTGGGGGCTGGC 5019
Query 5513 CATGTACTGGTGGAGCACCATGCAACAACGTCTCTGCCTCTTCTTCTTCCAGCTGTGGAG 5572
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5020 CATGTACTGGTGGAGCACCATGCAACAACGTCTCTGCCTCTTCTTCTTCCAGCTGTGGAG 5079
Query 5573 GATGGTATTTTCAATGATAATTGGCGTATCCGTCAAAGTTCTGTTGAACTGCTTGGGGAT 5632
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5080 GATGGTATTTTCAATGATAATTGGCGTATCCGTCAAAGTTCTGTTGAACTGCTTGGGGAT 5139
Query 5633 CTATTGTTCAAGGTTGCTGGTACATCGGGCAAAGCTCTACTGGAGGGTGGAAGTGATGAT 5692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5140 CTATTGTTCAAGGTTGCTGGTACATCGGGCAAAGCTCTACTGGAGGGTGGAAGTGATGAT 5199
Query 5693 GAAGGTGCAAGTACTGAAGCGCAGGGTCGTGCCATTATTGATATTTTAGGAATGGACAAG 5752
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5200 GAAGGTGCAAGTACTGAAGCGCAGGGTCGTGCCATTATTGATATTTTAGGAATGGACAAG 5259
Query 5753 CGCAATGAAGTTCTTGCAGCGTTATATATGGTCCGGACTGATGTTAGTTTGTCTGTTCGT 5812
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5260 CGCAATGAAGTTCTTGCGGCGTTATATATGGTCCGGACTGATGTTAGTTTGTCTGTTCGT 5319
Query 5813 CAGGCGGCACTACATGTATGGAAAACCATCGTAGCAAATACACCAAAGACGTTGAAGGAA 5872
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5320 CAGGCGGCACTACATGTATGGAAAACCATTGTAGCAAATACACCAAAGACGTTGAAGGAA 5379
Query 5873 ATAATGCCAATTTTGATGAGTACCTTAATTTCTTCTTTGGCATCACCATCTTCTGAGAGG 5932
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5380 ATAATGCCAATTTTGATGAGTACCTTAATTTCTTCTTTGGCATCACCATCTTCTGAGAGG 5439
Query 5933 CGCCAGGTAGCAGGAAGATCACTTGGAGAGCTGGTTAGGAAGCTTGGTGAAAGGGTGCTT 5992
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5440 CGCCAGGTAGCAGGAAGATCACTTGGAGAGCTGGTTAGGAAGCTTGGTGAAAGGGTGCTT 5499
Query 5993 CCTCTTATCATTCCAATTTTATCTAAAGGACTGAAAGACCCAGATGTTGACAAAAGACAA 6052
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5500 CCTCTTATCATTCCAATTTTATCTAAAGGACTGAAAGACCCAGATGTTGACAAAAGACAA 5559
Query 6053 GGTGTATGCATTGGCCTGAATGAAGTGATGGCAAGTGCTGGAAGGAGTCAGTTGCTGAGT 6112
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5560 GGTGTATGTATTGGCCTGAATGAAGTGATGGCAAGTGCTGGAAGGAGTCAGTTGCTGAGT 5619
Query 6113 TTCATGGATCAGCTTATTCCCACAATTAGGACAGCACTTTGTGATAGTGCTCTCGAGGTT 6172
|||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5620 TTCATGGATCAGCTCATTCCCACAATTCGGACGGCACTTTGTGATAGTGCTCTTGAGGTT 5679
Query 6173 CGGGAATCTGCTGGACTAGCATTCAGCACTCTGTATAAGAGTGCTGGACTGCAAGCAATG 6232
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 5680 CGGGAATCTGCTGGACTAGCATTCAGCACTCTGTATAAGAGTGCTGGATTGCAAGCAATG 5739
Query 6233 GATGAGATTATTCCAACTCTTTTGGAAGCCTTAGAAGATGATGAAATGTCTACTACTGCC 6292
||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5740 GATGAGATTATCCCAACTCTTCTGGAAGCCTTAGAAGATGATGAAATGTCTACTACTGCC 5799
Query 6293 TTGGATGGACTTAAACAAATTATAAGTGTTAGGACAGCAGCTGTTCTTCCACACATCTTG 6352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5800 TTGGATGGACTTAAACAAATTATAAGTGTTAGGACAGCAGCTGTTCTCCCACACATCTTG 5859
Query 6353 CCCAAGCTTGTCCATCTTCCTCTCTCTGCCTTAAATGCTCATGCTTTGGGAGCCTTAGCT 6412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5860 CCCAAGCTTGTCCATCTTCCTCTCTCTGCCTTAAATGCTCATGCTTTGGGAGCCTTAGCT 5919
Query 6413 GAGGTTGCTGGTGCTGGTTTTAACACGCATCTTGGGACCATACTTCCTGCTTTGCTCTCT 6472
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5920 GAGGTTGCTGGTGCTGGTTTTAACACGCATCTCGGGACCATACTTCCTGCTTTGCTCTCT 5979
Query 6473 GCAATGGGAGGTGAAAACAAGGAAGTCCAAGAATTGGCACAAGAGGCCGCAGAGAGAGTG 6532
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 5980 GCAATGGGAGATGAAAACAAGGAAGTCCAAGAATTGGCACAGGAGGCCGCAGAGAGGGTG 6039
Query 6533 GTGCTTGTCATTGATGAAGAAGGCGTTGAGACTCTATTATCAGAACTTCTCAAAGGAGTG 6592
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6040 GTCCTTGTCATTGATGAAGAAGGAGTTGAGACTCTATTATCAGAACTTCTCAAAGGAGTG 6099
Query 6593 TCTGATAGTCAGGCTTCAATTAGAAGAAGTTCTGCATATCTGATTGGTTACTTCTTCAAG 6652
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6100 TCTGATAGTCAGGCTTCAATTAGAAGAAGTTCCGCATATCTGATTGGTTACTTCTTCAAG 6159
Query 6653 AGTAGCAAGCTTTACTTAATTGATGAAGCTCCAAACATGATATCTACCTTGATTGTTATG 6712
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6160 AGTAGCAAGCTTTACTTAATTGATGAAGCTCCAAACATGATATCTACCTTGATTGTTATG 6219
Query 6713 CTCAGTGATTCTGATTCAACAACGGTTGCGGTTTCCTGGGAAGCTTTGGCTAGGGTTATT 6772
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6220 CTCAGTGATTCTGATTCAACAACTGTTGCGGTTTCCTGGGAAGCTTTGGCTAGGGTTATT 6279
Query 6773 GGTTCAGTTCCAAAGGAAGTACTTCCTTCATATATAAAACTTGTACGTGATGCTGTATCT 6832
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6280 GGTTCAGTTCCAAAGGAAGTACTTCCTTCATATATAAAACTTGTACGTGATGCTGTATCT 6339
Query 6833 ACAGCTAGGGACAAAGAGCGCAGGAAGCGTAAGGGAGGATATGTTGTTATTCCTGGTCTA 6892
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6340 ACTGCTAGGGACAAAGAGCGCAGGAAGCGGAAGGGAGGATATGTTGTTATTCCTGGTCTA 6399
Query 6893 TGCCTCCCCAAGTCCCTTAAGCCATTACTTCCAGTATTTCTACAGGGTCTAATAAGTGGA 6952
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 6400 TGCCTCCCCAAATCCCTTAAGCCATTACTTCCAGTATTTCTACAGGGTCTAATTAGTGGA 6459
Query 6953 TCTGCTGAACTAAGAGAGCAAGCTGCAATTGGTCTTGGTGAACTTATTGAAGTTACTAGC 7012
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 6460 TCCGCTGAACTAAGAGAGCAAGCTGCAATTGGTCTTGGTGAGCTTATAGAAGTTACTAGC 6519
Query 7013 GAGCAAGCTTTGAAGGAGTTCGTCATACCTATAACAGGGCCTCTTATTCGAATCATTGGA 7072
|||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 6520 GAGCAAGCATTAAAGGAGTTCGTCATACCTATAACAGGGCCTCTTATTCGAATCATAGGG 6579
Query 7073 GACCGGTTTCCATGGCAAGTCAAAAGTGCTATCTTGGCTACATTAATCATCCTAATACAA 7132
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6580 GACCGGTTTCCATGGCAAGTCAAAAGTGCTATCTTGGCTACATTAATCATCCTAATACAA 6639
Query 7133 AGGGGTGGGATGGCGCTAAAGCCATTCCTCCCTCAACTGCAAACAACATTTGTCAAGTGT 7192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6640 AGGGGTGGGATGGCGCTAAAGCCATTCCTCCCTCAACTGCAAACAACATTTGTCAAGTGT 6699
Query 7193 CTGCAAGACTCTACAAGGACCATCCGTTCTAGTGCTGCGGTTGCCCTGGGAAAGCTTAGT 7252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 6700 CTGCAAGACTCTACAAGGACCATCCGTTCTAGTGCTGCGCTTGCCCTGGGAAAGCTTAGC 6759
Query 7253 GCATTAAGCACAAGGATTGACCCATTAGTTGGTGATTTGATGACAAGTTTCCAGGCTGCA 7312
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6760 GCATTAAGCACGAGGATTGACCCATTAGTTGGTGATTTGATGACAAGTTTCCAGGCTGCA 6819
Query 7313 GATTCTGGGGTACGTGAGGCCATCCTATCTGCAATGAGAGGTGTAATAAAGCATGCTGGG 7372
|||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6820 GATTCTGGTGTACATGAGGCCATCCTATCTGCAATGAGAGGTGTAATAAAGCATGCTGGG 6879
Query 7373 AAGAGCATTGGGCCTGCTGTTAGAGTACGCATTTTTGATCTCCTAAAGGATCTAATGCAC 7432
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6880 AAGAGCATTGGGCCTGCTGTTAGAGTACGCATCTTTGATCTCCTAAAGGATCTAATGCAC 6939
Query 7433 CATGAGGATGACCAAGTTCGAATATCTGCCACAAGCATGCTGGGTGTTTTATCACAGTAC 7492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6940 CATGAGGATGACCAAGTTCGAATATCTGCCACAAGCATGCTGGGTGTTTTATCACAGTAC 6999
Query 7493 TTGGAAGCTGCACAACTCAGTGTTCTGCTTCAAGAGGTCAATGATTTATCTGCTTCGCAA 7552
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||
Sbjct 7000 TTGGAAGCTGCACAACTTAGTGTTCTGCTTCAAGAAGTCAAAGATTTATCGGCTTCACAA 7059
Query 7553 AATTGGGGTGCTAGGCATGGCTCAGTTCTCTGCATTTCATCCTTGCTGAAACACAATCCT 7612
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 7060 AATTGGGGTGCTAGGCATGGCTCAGTTCTCTGTATTTCATCCTTGCTGAAGTACAATCCT 7119
Query 7613 TCCACCATTATGACGTCATCGCTCTTTTCCTCTATGTTAAATTCTCTTAAGAGCTCTTTG 7672
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7120 TCAACCATTATGACGTCATCACTCTTTTCCTCTATGTTAAATTCTCTTAAGAGCTCTTTG 7179
Query 7673 AAGGATGAGAAGTTTCCATTACGTGAAAGCTCGACAAAGGCCTTGGGAAGGCTTTTGCTA 7732
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7180 AAGGATGAGAAGTTTCCATTACGGGAAAGCTCGACAAAGGCCTTGGGAAGGCTTTTGCTA 7239
Query 7733 AAACAACTTGCGACGGATCCTTCCAACACAAAAGTGGTTATCGATGTCCTTTCATCGATT 7792
| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7240 AGACAACTTGCAACGGATCCTTCCAACACAAAAGTGGTTATCGATGTCCTTTCATCGATT 7299
Query 7793 GTCTCAGCTTTGCATGATGATTCGAGTGAGGTTCGAAGAAGAGCACTCTCTTCACTTAAA 7852
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct 7300 GTCTCAGCTTTGCATGATGATTCGAGTGAGGTTCGAAGAAGATCACTATCTTCACTTAAA 7359
Query 7853 GCTTTTGCAAAAGATAATCCATCAGCAACCATGGCAAATATAAGTGTTATCGGACCTCCT 7912
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7360 GCTTTTGCAAAAGATAATCCATCAGCAACCATGGCAAATATAAGTGTTATCGGACCTCCT 7419
Query 7913 CTAGCTGAATGTTTGAAGGATGGGAACACACCAGTGAGACTTGCTGCAGAAAGATGTGCT 7972
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7420 CTTGCTGAATGTTTGAAGGATGGGAACACACCAGTGAGACTTGCTGCAGAAAGATGTGCT 7479
Query 7973 TTGCACGTGTTCCAATTAACAAAAGGCGCAGAAAATGTTCAAGCAGCTCAAAAATACATT 8032
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7480 TTGCACGTGTTCCAATTAACCAAGGGCGCAGAAAATGTTCAAGCAGCTCAAAAATACATT 7539
Query 8033 ACAGGATTGGATGCCCGACGGTTATCCAAGTTTCCTGAACAAAGCGATGACAGTGAAAGC 8092
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7540 ACAGGATTGGATGCCCGACGGTTATCCAAGTTTCCTGAACAAAGCGATGACAGTGAAAGT 7599
Query 8093 GATGATGATAATGTAAGTGGGTAG 8116
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7600 GATGATGATAATGTAAGTGGGTAG 7623
Score = 1692 bits (916), Expect = 0.0
Identities = 977/1007 (97%), Gaps = 2/1007 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 383 ATGGCTTCTCCGTTGGAGTCTCTTCTCTCCATCTCTGGCTCTGTCTCTACAAGCTCCACT 442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTTCTCCGTTGGAGTCTCTTCTCTCCATCTCTGGCTCTGTCTCTACAAGCTCCACT 60
Query 443 TTAATCAGACTCCGGATCTTCCGCCATGATATCCCCGAGATTCTCCAGAATTCCGATATG 502
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 61 TTAATCAGACTCCGGATCTTCCGCCATGATATCCCGGAGATTCTTCAGAATTCCGATATG 120
Query 503 ACGTCTGATATTGCGCCTGTTATAGTTGACATGATATTCCAAACATTGGCTATATATGAT 562
||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 ACGTCTGATATTGCGCCTGTTCTGGTTGACATGATATTCCAAACATTGGCTATATATGAT 180
Query 563 GACCGTGCCTCACGGAAAGCTGTAGATGATTTGATTGTAAAGGGACTGGGAAATGTTACC 622
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||
Sbjct 181 GACCGTGCCTCACGGAAAGCTGTGGATGATTTGATTGTAAAGGGCCTGGAAAATGTTACT 240
Query 623 TTCATGAAAACTTTTGCGGCCATGCTTGTTCAAGTTATGGAAAAGCAGTTGAAATTTTGT 682
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 241 TTCATGAAAACTTTTGCGGCCATGCTTGTACAAGTTATGGAAAAGCAGTTGAGATTTTGT 300
Query 683 TTTGATACAGTCTGTTACAGACTACTAATTTGGTCATGTCTTCTTCTGGAAAAAAGTCAA 742
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 301 TTTGATACAGTCTGTTACAGACTACTAATTTGGTCATGTCTTCTTCTGGGAAAAAGTCAA 360
Query 743 TTCGCTACTGTTTCGAAGAATGCATTTGTTAGAGTTGCATCAACGCAGGCTTCATTACTT 802
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 361 TTCGCTACGGTTTCGAAGAATGCATTTGTTAGAGTAGCATCAACACAGGCTTCATTACTT 420
Query 803 CGTATCATTATGGAGAGCTCTTTCCGTATGCGGAGGGCTTGTAAAAGATTTATGTTCCAT 862
|||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CGTATCATTATGGAGAGCTCTTTCCGCATGCAGAGGGCTTGTAAAAGATTTATGTTCCAT 480
Query 863 TTGTTCTCTCAGTCACAAGCTATCTACAGTTTATATATGGATGAAGTTAAAGGTTCACGG 922
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 481 TTGTTCTCTCAGTCACAAGCTATCTACAGTTTATATATGGATGAAGTCAAAGGTTCCCGG 540
Query 923 ATTCCGTACAAGGATAGCCCTGAGTTATTAGGACTACTGCTTGAGTTCTCTTGTTCGTCT 982
|||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 ATTCCGTATAAGGATAGCCCTGAATTATTAGGACTACTGCTTGAGTTCTCTTGTTCGTCT 600
Query 983 CCTGCTCTATTTGAACAGTCAAAGGCCATATTTGTTGATATCTATGTTAAAGATGTCCTG 1042
|||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 CCTGCTCTATTTGAACAGTCCAAGGCCATATTTGCTGATATCTATGTTAAAGATGTCCTG 660
Query 1043 AATTCTAGAGAAAAGCAGAAACCAAATCTTAGTAATTGTTTCAAACCTCTTCTTCAACGC 1102
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 AATTCTAGAGAAAAGCAGAAACAAAATCTTAGTAATTGTTTCAAACCTCTTCTTCAACGC 720
Query 1103 TTGTCACATGAGGAATTCCAAACTGTCATCCTTCCTGCAGCTGTTAAAATGTTGAAGCGT 1162
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 TTGTCGCATGAGGAATTCCAAACTGTCATCCTTCCTGCAGCTGTTAAAATGTTGAAGCGT 780
Query 1163 AATCCAGAAATTGTCCTGGAATCAGTTGGATTTCTATTAGCAAATGTAAACATTGATCTA 1222
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 AATCCAGAAATTGTCCTGGAAGCAGTTGGATTTCTATTAGCAAATGTAAACATTGATCTA 840
Query 1223 AGTAAGTATGCCCTGGAACTGCTACCAGTTATACTACCACAGGCTCGGCATACGGATGAA 1282
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 AGTAAGTATGCCCTGGAACTGCTAACAGTTATACTACCACAGGCTCGGCATACGGATGAA 900
Query 1283 GACAGGCGTC-TAGGAGCTTTATCAATGGTTATGTGCTTAAGTGAAAAATCAAGTAATCC 1341
|||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 GACAGGCGTCAT-GGAGCTTTGTCAATGGTTAGGTGCTTAAGTGAAAAATCAAGTAATCC 959
Query 1342 TGATACTATAGAAGCAATGTTTGCGTCAGTTAAAGCCATAATTGGAG 1388
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 TGATACTATAGAAGCAATGTTTGCGTCAGTTAAAGCCATAATTGGAG 1006
Score = 1404 bits (760), Expect = 0.0
Identities = 810/835 (97%), Gaps = 0/835 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2458 TGTTTGCAAGAGTCTACTTGGACCAATGGGTTTAACGAGTGCTAAAACTCCGGAGCAGCA 2517
|||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||
Sbjct 1866 TGTTTGGAAGAGTCTACTTGGACCAATGGGTTTAATGAGTCCTAAAACTCCCGAGCAGCA 1925
Query 2518 AGCGGCCGTATATTCCTTGTCCACCATGATGTCTCTGGCACCAGAGGATACATTCACAGT 2577
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1926 AGCGGCCGTATATTCCTTGTCCACAATGATGTCTCTGGCACCAGAGGATACATTCACAGT 1985
Query 2578 GTTCAAGATGCATCTACAAGACCTTCCAGATCGACTGTCTCATGATATGCTCTCAGAGAC 2637
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1986 GTTTAAGATGCATCTACAAGACCTTCCAGATCGACTGTCTCATGATATGCTTTCAGAGAC 2045
Query 2638 TGACATTAAGATCTTTCATACACCTGAGGGGATGCTTTTAAGTGAGCAAGGTGTCTATGT 2697
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2046 TGACATTAAGATCTTTCATACACCTGAGGGAATGCTTTTAAGTGAGCAAGGTATCTATGT 2105
Query 2698 TGCTCAGACAATTGGTGCCAAGTATACAAAGCAGGAGCCGAGTTCTAATCATTCTCTAAA 2757
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2106 TGCTCAGACGATTGGTGCCAAGTACACAAAGCAGGAGCCGAGTTCTAATCATTCTTTAAA 2165
Query 2758 GAAAGGATTGGCTAGTAGAGAAACTGCAAACTCAGGGAGAAGGGACACTGCAAAGTTGAC 2817
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2166 GAAAGGATTGGCTAGTAGAGAAACTGCAAATTCGGGGAGAAGGGACACTGCAAAGTTGAC 2225
Query 2818 AAAGAAAGCTGACAAAGGAAAAACGGCAAAGGAAGAGGCACGGGAACTGATGCTCAAAGA 2877
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2226 CAAGAAAGCTGACAAAGGAAAAACGGCGAAGGAAGAGGCACGGGAACTGATGCTCAAAGA 2285
Query 2878 GGAGGCCTCAACACGGGAAAATGTTCACAGGATACAAAAAAGTCTTTCGTTGGTGCTTCA 2937
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2286 AGAGGCCTCAACACGGGAAAATGTTCACAGGATACAAAAAAGTCTTTCGTTGGTGCTTCA 2345
Query 2938 TGCCCTTGGGGAGATGGGTCTTGCTAATCCTGTGTTTTGTCACAGCCAGTTACCTTTTTT 2997
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2346 TGCCCTTGGGGAGATGGGTCTTGCTAATCCTGTGTTTTGTCACAGTCAGTTACCTTTTTT 2405
Query 2998 GGCTACTTTTTTGGATCCATTGCTGCGATCACCTATTGTAAGTGCTGCAGCCTTTGAAAA 3057
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2406 GGCTACTTTTTTGGATCCATTGCTGCGATCACCTATTGTAAGTGCTGCAGCCTTTGAAAA 2465
Query 3058 CTTGGTGAAGCTTGCACGTTGTACAGTTCAGCCACTGTGTAACTGGGCTCTAGAAATTTC 3117
|||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2466 CTTGGTGAAGCTTGCAAGGTGTACAGTTCAGCCTCTGTGTAACTGGGCTCTAGAAATTTC 2525
Query 3118 AACTGCTCTGCGTTTGATCGCGATTGATGAAGTTGATACTTCATTTGATTTTCGTCCATC 3177
|||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2526 AACTGCTCTGCGCTTGATTGCGATTGATGAAGTTGATACTTCATCTGATTTTCGTCCATC 2585
Query 3178 AGTTGACAAGGCTGGGAAAACATATGAGGGTCTTTTTGAGAGGATTGTAAATGGGTTATC 3237
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2586 AGTTGACAAGGCTGGGAAAACATATGAGGGTCTTTTTGAGAGGATTGTAAATGGGTTATC 2645
Query 3238 GATATCTTGTAAATCAGGACCACTTCCTGTAGATACATTCACGTTCATTTTCCCG 3292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2646 AATATCTTGTAAATCAGGACCACTTCCTGTAGATACATTCACGTTCATTTTCCCG 2700
Score = 1134 bits (614), Expect = 0.0
Identities = 652/671 (97%), Gaps = 0/671 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1721 ATATCAGACTTGCTATCCCCTTTAATTCAACTTGTAAAGACGGGATTTACAAAGGCAGTA 1780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1207 ATATCAGACTTGCTATCCCCTTTAATTCAACTTGTAAAGACGGGATTTACAAAGGCAGTA 1266
Query 1781 CAACGTCTGGATGGGATATATGCGCTACTGATCGTTTCCAAAATTGCTGCCTGTGACATC 1840
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1267 CAACGTCTGGATGGGATATATGCTCTACTGATCGTTTCCAAAATTGCTGCCTGTGACATC 1326
Query 1841 AAAGCAGAGGATACTATGGTGAAGGAGAAATTATGGACTTTGATATCTCAAAATGAGCCT 1900
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1327 AAAGCAGAGGATACTATGGTGAAGGAGAAACTATGGACTTTGATATCTCTAAATGAGCCT 1386
Query 1901 TCACTTGTGCAAATTACTTTGGCCTCAAAACTTTCAAGTGATGATTGTGTAGTATGTGTA 1960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1387 TCACTTGTGCAAATTACTTTGGCCTCAAAACTTTCAAGTGATGATTGTGAAGTATGTGCC 1446
Query 1961 GACCTTCTTGAGGTGCTCCTTGTGGAACACTCCTCCAGGGTTTTGGAAGCATTTTCATTG 2020
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1447 GACCTTCTTGAGGCGCTCCTCGTGGAACACTCCTCCAGGGTTTTGGAAGCATTTTCATTG 1506
Query 2021 AAATCACTATCACAGTTGCTTCTCTTTCTGCTTTGCCATCCAAGCTGGAATGTTCGTAAA 2080
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1507 AAATCACTATCACAGTTGCTTCTCTTTCTACTTTGCCATCCAAGCTGGAATGTTCGTAAA 1566
Query 2081 ACAGCTTACAATTCTGTTACGAAGATCTTCCTCGCGACTTCACAGCTAGCCACTACTCTT 2140
||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1567 ACAGCGTACAATGCTGTTACAAAGATCTTCCTCGCAACTTCACAGCTAGCCACTACTCTT 1626
Query 2141 TTAGACGAGTTCTCGGATTTTCTTTCCATAACTGGGGACCAAATCGTTTCTTCTAGAACC 2200
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1627 TTAGACGAGTTCTCGGATTTTCTTTCCATAACTGGGGACCAACTCGTTTCTTCTAGAACC 1686
Query 2201 AGTGACGCAGATAATCCCGCGGATCATCAAGCTCCTTTCGTCCCCTCTGTAGAGGTGTTA 2260
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1687 AGTGACGCAGATAATCCCGTGGATCATCAAGCTCCTTTCGTCCCTTCTGTAGAGGTGTTA 1746
Query 2261 GTGAAGGCTTTGATTGTCATTTCATCGGCAGCAGTTGCTGGACCTCCAAGCTCATGGATT 2320
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1747 GTGAAAGCTTTGATTGTCATTTCATCGGCAGCAGTTGCTGGACCTCCAAGCTCATGGATT 1806
Query 2321 GTTCGTGCCATATTTTGCTCGCATCATCCCAGCATAGTTGGTACTGGAAAAAGAGATGCT 2380
||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1807 GTTCGAGCCATATTCTGCTCGCATCATCCCAGCATAGTTGGTACTGGAAAAAGAGATGCT 1866
Query 2381 GTTTGGAAGAG 2391
|||||||||||
Sbjct 1867 GTTTGGAAGAG 1877
Score = 185 bits (100), Expect = 4e-45
Identities = 106/109 (97%), Gaps = 0/109 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1573 AGCTTCATGGGCATCACGATCTTCTGTTGCCATCCAACCAAACTTAGTATCTTTCATTGC 1632
|||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1098 AGCTTCATGGGCATCACGATCTTCTGATGCTATCCAACCAAACTTAGTTTCTTTCATTGC 1157
Query 1633 TGCCGGCCTTAAGGAGAAAGAAGCTCTAAGGAGGGGGCATCTCCGCTGT 1681
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1158 TGCCGGCCTTAAGGAGAAAGAAGCTCTAAGGAGGGGGCATCTCCGCTGT 1206
Score = 165 bits (89), Expect = 5e-39
Identities = 93/95 (98%), Gaps = 0/95 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1441 AGTGCAAGAACTGGCAAGTGCTCCTGAAGGAAAGTATATTGGTAGTTTGTCGAGGACGAT 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1005 AGTGCAAGAACTGGCAAGTGCTCCTGAAGGAAAGTATATTGGTAGTTTGTCGAGGGCGAT 1064
Query 1501 ATGCAGCTTTCTCATAGCCTGCTACAAGGATGAAG 1535
||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1065 ATGCAGCTTTCTCATAGCCTGCTACAAAGATGAAG 1099
> Ahg907723 jgi|Araly1|907723|Al_scaffold_0002_804
Length=7431
Score = 603 bits (326), Expect = 9e-171
Identities = 359/375 (96%), Gaps = 2/375 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 4009 GGCATCTGATGAAGAGGAATATGACTTGGTTCGTGAGGGTGTTGTTATATTCACTGGAGC 4068
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1593 GGCATCTGATGAAGAGGAATATGACCTGGTTCGTGAGGGTGTTGTTATATTCACTGGAGC 1652
Query 4069 ACTAGCAAAGCACTTAGCAAGAGATGATCCTAAAGTACATAATGTTGTGGAAAAGCTGTT 4128
||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1653 ACTAGCAAATCACTTGGCAAAAGATGATCCTAAAGTCCATAATGTTGTGGAAAAGCTGTT 1712
Query 4129 GGAGGTGTTGAATACACCATCAGAATCTGTGCAACGTGCTGTCTCGACATGCCTTTCTCC 4188
|||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||| ||||||
Sbjct 1713 GGAGGTGTTGAACACACCATCAGAATCTGTGAAACGAGCAGTCACAACATGCCCTTCTCC 1772
Query 4189 ACTTGTGTTATCAAAGCAAGAGGAGGCCCCTGCCCtttttttGAGGCTCTTGGATAAGCT 4248
||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773 ACTTGTGCTATCAAAGCAAGAGGATGCCCCTGCCCTTTTTTTGAGGCTCTTGGATAAGCT 1832
Query 4249 AATGAAGAGTGATAAATATGGTGAGCGTAGAGGAGCAGCTTTTGGTCTTGCGGGAGTAGT 4308
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1833 AATGAAGAGTGATAAATATGGTGAGCGTAGAGGAGCAGCTTTTGGTCTTGCGGGAGTAGT 1892
Query 4309 TATGGGCTTTGGAATTTCTAGCTTGAAGAAATATGGTCTTATAGTCACTTTGCAAGAAGC 4368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1893 TATGGGCTTTGGAATTTCTAGCTTGAAGAAATATGGTCTTATAGTCACTTTGCAAGAAGC 1952
Query 4369 ACTTA--TTGACAGA 4381
||||| ||||||||
Sbjct 1953 ACTTAAATTGACAGA 1967
Score = 542 bits (293), Expect = 2e-152
Identities = 325/341 (95%), Gaps = 0/341 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2397 AAAAGTGTCTCAAAACTTGTGGTTTTGATGTTGCTACTTTTTTGTCTACCAATGGGGAAA 2456
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 974 AAAAGTGTCTCAACACTTGTGGTTTTGATGTTGCTACTTTTTTGTCTACCAATGTGGAAA 1033
Query 2457 GTGTTTGCAAGAGTCTACTTGGACCAATGGGTTTAACGAGTGCTAAAACTCCGGAGCAGC 2516
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||
Sbjct 1034 GTGTTTGCAAGAGTCTACTTGGACCAATGGGTTTAATGAGTCCTAAAACTCCTGAGCAGC 1093
Query 2517 AAGCGGCCGTATATTCCTTGTCCACCATGATGTCTCTGGCACCAGAGGATACATTCACAG 2576
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct 1094 CAGCGGCAGTATATTCCTTGTCCACCATGATGTCTCTTGCACCAGAGGTTACATTCACAG 1153
Query 2577 TGTTCAAGATGCATCTACAAGACCTTCCAGATCGACTGTCTCATGATATGCTCTCAGAGA 2636
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||
Sbjct 1154 TGTTTAAGATGCATCTACAAGACCTTCCAGATCGACTGTCTCATAATATGCTTTCAGAGA 1213
Query 2637 CTGACATTAAGATCTTTCATACACCTGAGGGGATGCTTTTAAGTGAGCAAGGTGTCTATG 2696
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1214 CTGACATTAAGATCTTTCATACACCTGAGGGAATGCTTTTAAGTGAGCAAGGTATCTATG 1273
Query 2697 TTGCTCAGACAATTGGTGCCAAGTATACAAAGCAGGAGCCG 2737
|||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1274 TTGCTCAGACGATTGGTGCCAAGTACACAAAGCAGGAGCCG 1314
Score = 525 bits (284), Expect = 2e-147
Identities = 335/359 (93%), Gaps = 5/359 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2035 GTTGCTTCTCTTTCT-GCTTTGCCATCCAAGCTGGAATGTTCGTAAAACAGCTTACAATT 2093
||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6426 GTTACTTCTCTTTCTAG-TTTGCCATCCAAGCTGGAATGTTCGTAAAACAGCTTACAATT 6484
Query 2094 CTGTTACGAAGATCTTCCTCGCGACTTCACAGCTAGCCACTACTCTTTTAGACGAGTTCT 2153
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 6485 CTGTTACGAATATCTTCCTCGCAACTTCACAGCTAGCCACTACTCTTTTAGACGACTTCT 6544
Query 2154 CGGATTTTCTTTCCA---TAACTGGGGACCAAATCGTTTCTTCTAGAACCAGTGACGCAG 2210
||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 6545 CGGATTTCCTTTCCACCATAACTGGGGACCAAATCGTTTATTCTAGAACCAGTGACGCAG 6604
Query 2211 ATAATCCCGCGGATCATCAAGCTCCTTTCGTCCCCTCTGTAGAGGTGTTAGTGAAGGCTT 2270
|||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 6605 ATAATCCCATGGATCATCAAGCTCCTTTCGTCCCTTCTGTAGAGGTTTTAGTGAAGGCTT 6664
Query 2271 TGATTGTCATTTCATCGGCAGCAGTTGCTGGACCTCCAAGCTCATGGATTGTTCGTGCCA 2330
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 6665 TGATTGTCATTTCATCGGCAGCAGTTACTGGACCTCCAAGCTCATGGACTGTTCAAGCCA 6724
Query 2331 TATTTTGCTCGCATCATCCCAGCATAGTTGGTACTGGAAAAAGAGATGCTGTTTGGAAG 2389
|||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||
Sbjct 6725 TATTCTGCTCGCATCATCCCAGCGTAGTTGGTACTGGAACAAGAGAAGATGTTTGGAAG 6783
Score = 510 bits (276), Expect = 5e-143
Identities = 330/357 (92%), Gaps = 0/357 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2033 CAGTTGCTTCTCTTTCTGCTTTGCCATCCAAGCTGGAATGTTCGTAAAACAGCTTACAAT 2092
|||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4 CAGTTGCTTCAATTTCTACTTTGCCATCCAAGCTGGAATGTTCGTAAAACAGCTTACAAT 63
Query 2093 TCTGTTACGAAGATCTTCCTCGCGACTTCACAGCTAGCCACTACTCTTTTAGACGAGTTC 2152
|||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 64 TCTGTTCCAAAGATCTTCCTCGCAACTTCACAGCTAGCCACTACACTTTTAGACGAGTTC 123
Query 2153 TCGGATTTTCTTTCCATAACTGGGGACCAAATCGTTTCTTCTAGAACCAGTGACGCAGAT 2212
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 124 TCGTATTTTCTTTCCATAACTGGGGACCAAATCGTTTCTTCTAGAACCAGTGACGCAGAT 183
Query 2213 AATCCCGCGGATCATCAAGCTCCTTTCGTCCCCTCTGTAGAGGTGTTAGTGAAGGCTTTG 2272
||| || ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 184 AATTTCGTGGATCATCAAGTTTCTTTCGTCCCTTCTGTAGAGGTTTTAGTGAAGGCTTTG 243
Query 2273 ATTGTCATTTCATCGGCAGCAGTTGCTGGACCTCCAAGCTCATGGATTGTTCGTGCCATA 2332
||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||
Sbjct 244 ATTGTCATTTCATCGGCAGTAGTTACTGGACCTCCATGCTCATGGATTGTTCGAGCTATA 303
Query 2333 TTTTGCTCGCATCATCCCAGCATAGTTGGTACTGGAAAAAGAGATGCTGTTTGGAAG 2389
|| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | ||||||||||
Sbjct 304 TTCTGCTTGCATCATCCCAGCGTACTTGGTACTGGAAAAAGAAAAGATGTTTGGAAG 360
Score = 486 bits (263), Expect = 9e-136
Identities = 294/309 (95%), Gaps = 2/309 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 5281 GGTTATAGCAGCTCTTGGGACAGATTACTTTGAGAATATACTTCCTGACCTCATTCGTCA 5340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3927 GGTTATAGCAGCTCTTGGGACAGATTACTTTGAGAATATACTTCCTGACCTCATTCGTCA 3986
Query 5341 TTGTTCTCATCAAAAAGCATCGGTCCGAGATGGATACCTTACGCTTTTCAAGTTCTTGCC 5400
||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3987 TTGTTCTTATCAAAAAGCATCAGTCCGAGATGGATACCTTACGCTTTTCAAGTTCTTACC 4046
Query 5401 AAGATCCTTGGGTGCTCAGTTCCAGAAGTACTTGCAGCTTGTTTTACCGGCCATTCTG-G 5459
|||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 4047 AAGATCCTTGGGTGCTCAATTCGAGAAGTACTTGCAGCTTGTCTTACCGGCCATTCTGAG 4106
Query 5460 ATGGTCTTGCCGATGAGAATGAATCTGTTCGTGATGCAGCCCTGGGGGCTGGCCATGTAC 5519
|| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4107 -TGATCTTGCCCATGAGAATGAATCTGTTCGTGATGCAGCCCTGGGGGCTGGCCATGTAC 4165
Query 5520 TGGTGGAGCACCATGCAACAACGTCTCTGCCTCTTCTTCTTCCAGCTGTGGAGGATGGTA 5579
|||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 4166 TGGTGGAGCACCATGCTATAACGTCTCTACCTCTTCTTCGTCCAGTTGTGGAGGATGGTA 4225
Query 5580 TTTTCAATG 5588
|||||||||
Sbjct 4226 TTTTCAATG 4234
Score = 388 bits (210), Expect = 3e-106
Identities = 243/258 (94%), Gaps = 5/258 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 5392 GTTCTTGCCAAGATCCTTGGGTGCTCAGTTCCAGAAGTACTTGCAGCTTGTTTTACCGGC 5451
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 681 GTTCTTGCCAAGATCCTTGGCTGCTCAGTTCCAGAAGTACTTGCAGCTTGTTTTACCGGC 740
Query 5452 CATTCTGGATGGTCTTGCCGATGAGAATGAATCTGTTCGTGATGCAGCCCTGGGGGCTGG 5511
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CATTCTGGATGGTTTTGCCGATGAGAATGAATCTGTTCATGATGCAGCCCTGGGGGCTGG 800
Query 5512 CCATGTACTGGTGGAGCACCATGCA-ACAACGTCTCTGCCTCTTCTTCTTCCAGCTGTGG 5570
|||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 801 CCATATACTGGTGGAGCACCATG-ATACAGCGTCTCTGCCTCTTCTTCTTCCAGCTGCGG 859
Query 5571 AGGATGGTATTTTCAATGATAATTGGCGTATCCGTCAAAGTTCTGTTGAAC-TGCTTGGG 5629
|||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||
Sbjct 860 AGGATGGTATTT-CGATGATAATTGGCATATCCGTCAAAGTTCTGTGGAACCT-CTTGGG 917
Query 5630 GATCTATTGTTCAAGGTT 5647
|||||||||||||||||
Sbjct 918 TATCTATTGTTCAAGGTT 935
Score = 387 bits (209), Expect = 1e-105
Identities = 243/259 (94%), Gaps = 4/259 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 2742 CTAATCATTCTCTAAAGAAAGGATTGGCTAGTAGAGAAACTGCAAACTCAGGGAGAAGGG 2801
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 425 CTAATCATTCTCTAAAGAAAGGATTGGCTGGTAGAGAAACTGCAAATTTGGGGAGAAGGG 484
Query 2802 ACACTGCAAAGTTGA-CAA-AGAAAGCTGACAAAGGAAAAACGGCAAAGGAAGAGGCACG 2859
||||||||||||||| ||| || | || |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 485 ACACTGCAAAGTTGACCAAGGGACA-CT-ACAAAGGAAAAACGGCAAAGGAAGAGTCACG 542
Query 2860 GGAACTGATGCTCAAAGAGGAGGCCTCAACACGGGAAAATGTTCACAGGATACAAAAAAG 2919
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 543 GGAACTGATGCTCAAAGAGGAGGCCTCAACACGGGAAATTGTTCACATGATACAAAAAAG 602
Query 2920 TCTTTCGTTGGTGCTTCATGCCCTTGGGGAGATGGGTCTTGCTAATCCTGTGTTTTGTCA 2979
|||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 603 TCTTTCGTTGGTGCTTCATGCCCTTGGGGAAATTGGTCTTGCCAATCCTGTGTTTTGTCA 662
Query 2980 CAGCCAGTTACCTTTTTTG 2998
|||||||||||||||||||
Sbjct 663 CAGCCAGTTACCTTTTTTG 681
Score = 379 bits (205), Expect = 2e-103
Identities = 280/313 (89%), Gaps = 18/313 (6%)
Strand=Plus/Plus
Query 2912 CAAAAAAGTCTTTCGTTGGTGCTTCATGCCCTTGGGGAGATGGGTCTTGCTAATCCTGTG 2971
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2797 CAAAAAAGTCTTTCGTTGGTGCTTCATGCCCTTGGGGAGATGGGTCTTGCCAATCCTGTG 2856
Query 2972 TTTTGTCACAGCCAGTTAC-------C-T-T---T-T--T-T--GGCTACTTTTTTGGAT 3013
||||||||||||||||||| | | | | | | | |||||||||||||||
Sbjct 2857 TTTTGTCACAGCCAGTTACAGTTTTACATATCCATATGCTATAAAGCTACTTTTTTGGAT 2916
Query 3014 CCATTGCTGCGATCACCTATTGTAAGTGCTGCAGCCTTTGAAAACTTGGTGAAGCTTGCA 3073
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 2917 CCATTGCTGCGATCACCTATTGTAAGTGCTGCAGCCTTTGAAAACTTGGAGATGCTTGCA 2976
Query 3074 CGTTGTACAGTTCAGCCACTGTGTAACTGGGCTCTAGAAATTTCAACTGCTCTGCGTTTG 3133
| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 2977 AGGTGTACAGTTCAGCCACTGTGTAACTGGGCTCTCGAAATTTCAACTTCTCTGCGCTTG 3036
Query 3134 ATCGCGATTGATGAAGTTGATACTTCATTTGATTTTCGTCCATCAGTTGACAAGGCTGGG 3193
| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||
Sbjct 3037 ACCGCGATTGATGAACTTGATGCTTCATCTGATTTTCGTCCATCAATTGACAAGGATGGG 3096
Query 3194 AAAACATATGAGG 3206
|||||||||||||
Sbjct 3097 AAAACATATGAGG 3109
Score = 353 bits (191), Expect = 1e-95
Identities = 214/225 (95%), Gaps = 2/225 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 5940 TAGCAGGAAGATCACTTGGAGAGCTGGTTAGGAAGCTTGGTGAAAGGGTGCTTCCTCTTA 5999
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4274 TAGCAGGAAGATCACTTGGAGAGCTGGTTAGGAAGCTTGGTGAAAGGGTGCTTCCTCTTA 4333
Query 6000 TCATTCCAATTTTATCTAAAGGACTGAAAGACCCAGATGTTGACAAAAGACAAGGTGTAT 6059
||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4334 TCATTCCAAAATTATCTAAGGGACTGACCGACCCAGATGTTGACAAAAGACAAGATGTAT 4393
Query 6060 GCATTGGCCTGAATGAAGTGATGGCAAGTGCTGGAAGGAGTCAGTTGCTGAGTTTCATGG 6119
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4394 GCATTGGCCTGAATGAAGTGATGGCAACTGCTGGAAGGAGTCAGTTGCTGAGTTTCATGG 4453
Query 6120 ATCAGCTTATTCCCACAATTAGGACAG-CACTTTGTGATAGTGCT 6163
||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||
Sbjct 4454 ATCAGCTCATTCCCACAATTCGGAC-GTCACTTTGTGATAGTGCT 4497
Score = 342 bits (185), Expect = 2e-92
Identities = 201/209 (96%), Gaps = 0/209 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 6653 AGTAGCAAGCTTTACTTAATTGATGAAGCTCCAAACATGATATCTACCTTGATTGTTATG 6712
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4870 AGTAGCAAGCTTTACTTAATTGATGAAGCTCCAAACATGATATCTACCTTGATTGTTATG 4929
Query 6713 CTCAGTGATTCTGATTCAACAACGGTTGCGGTTTCCTGGGAAGCTTTGGCTAGGGTTATT 6772
|||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4930 CTCAGTGATTCTGATTCAACGACTGTTACGGTTTCCTGGGAAGCTTTGGCTAAGGTTATC 4989
Query 6773 GGTTCAGTTCCAAAGGAAGTACTTCCTTCATATATAAAACTTGTACGTGATGCTGTATCT 6832
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4990 GGTTCAGTTCCAAAGGAAGTACTTCCTTCATATATAAAACTTGTACGTGATGTTGTATCT 5049
Query 6833 ACAGCTAGGGACAAAGAGCGCAGGAAGCG 6861
|||||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 5050 ACAGCTAGGGACCAAGAGCGCATGAAGCG 5078
Score = 270 bits (146), Expect = 1e-70
Identities = 305/374 (82%), Gaps = 41/374 (11%)
Strand=Plus/Plus
Query 6212 AGTGCTGGACTGCAAGCAATGGATGAGATTATTCCAACTCTTTTGGAAGCCTTAGAAGAT 6271
||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4492 AGTGCTGGATTGCAAGCAATGGATGAAATTATCCCAACTCTTCTGGAAGCCTTAGAAGAT 4551
Query 6272 GATGAAATGTCTACTACTGCCTTGGATGGACTTAAACAAATTATAA-G---T-GT-TA-- 6323
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||
Sbjct 4552 GATGAAATGTCTACTACTGCCTTGGATGGACTTAAACAAATTATAAGGTTCTCTTCTACT 4611
Query 6324 G-GACAGCA-GCTGTTCTTCCACAC-ATCTT-GCCCA--AGCTTGTCCATCTTCCTCTC- 6376
| | || ||| ||||||| | | || || | || ||| ||| |||||| | |
Sbjct 4612 GTCTCCTCAGGCTCTTCTTCC-C-CTATGTTAGGACAGCAGC-TGT---TCTTCCACACA 4665
Query 6377 TC-TG-CCTTAA--ATGCT-CATGCTT--TGGGAGCCTTAGCTGAGGTTGCTGGTGCTGG 6429
|| || || || || | ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4666 TCTTGTCC--AAGCTTG-TCCAT-CTTCCTCTCTCCCTTGGCTGAGGTTGCTGGTGCTGG 4721
Query 6430 TTTTAACACGCATCTTGGGACCATACTTCCTGCTTTGCTCTCTGCAATGGGAGGTGAAAA 6489
||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4722 TTTTAACACGCATCTCGGGACCATACTTCCTATTTTGCTCTCTGCAATGGGAGATGAAAA 4781
Query 6490 CAAGGAAGTCCAAGAATTGGCACAAGAGGCCGCAGAGAGAGTGGTGCTTGTCATTGATGA 6549
|||||||||||||||||||||||||||| || | | |||| ||||||||||||||
Sbjct 4782 CAAGGAAGTCCAAGAATTGGCACAAGAG-----AG-G-G--TGGTCCTTGTCATTGATGA 4832
Query 6550 AGAAGGCGTTGAGA 6563
|||||| |||||||
Sbjct 4833 AGAAGGAGTTGAGA 4846
Score = 259 bits (140), Expect = 2e-67
Identities = 165/176 (94%), Gaps = 6/176 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 5106 AGGTTCTTGTGGATCCAATTCCCGAAG-TACGTTCTGTTGCAGCAAGGGCTGTTGGGTCA 5164
|||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3707 AGGTTCTTGTGGATCCAATTCCTG-AGTTACGTTCTGTTGCAGCGAGGGCTGTTGGGTCA 3765
Query 5165 CTTATTAGAGGAATGGGAGAGGATAATTTCCCAGATCTTGTTCCGTGGCTGTTTGAAACT 5224
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3766 CTTATTAGAGGAATGGGAGAGGATAATTTCCCAGATCTTGTTCCGTGGCTGTTTGAAACT 3825
Query 5225 CTAAAATCTGATACAAGCAATGTTGAAAGATATGG-AGCC---GCTCAGGGATTAA 5276
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||
Sbjct 3826 CTAAATTCTGATACAAGCAATGTTGAAAGATATGGGATACAATGCTCAGGGATTAA 3881
Score = 243 bits (131), Expect = 2e-62
Identities = 167/184 (91%), Gaps = 3/184 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 2292 CAGTTGCTGGACCTCCAAGCTCATGGATTGTTCGTGCCATATTTTGCTCGCATCATCCCA 2351
|||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 5477 CAGTTGCTGGACCTTCTAGCTCATGGATTGTTCGTGCCATATTTTACTTGCATCATCCCA 5536
Query 2352 GCATAGTTGGTACTGGAAAAAGAGATGCTGTTTGGAAGAGATTGCAAAAGTGTCTCAAAA 2411
|||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 5537 GCATCGTTGGTACTAGAAAAAGAGATGTTGTTTGGAAGAGATTGCAAAAGTGTCGCAAAC 5596
Query 2412 CTTGTGGTTTTGATGTTGCTACTTTTTTGTCTACCAATGGGGAAAGTGTTTGCAAG-AGT 2470
| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| | |
Sbjct 5597 CCCGTGGTTATGATGTTGCTACTTTTT-GTCTACCAATAGAGAAAGTGTTTGCAAGCA-T 5654
Query 2471 CTAC 2474
||||
Sbjct 5655 CTAC 5658
Score = 211 bits (114), Expect = 6e-53
Identities = 137/148 (93%), Gaps = 2/148 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 4233 GGCTCTTGGATAAGCTAATGAAGAGTGATAAATATGGTGAGCGTAGAGGAGCAGCT-TTT 4291
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||
Sbjct 5078 GGCTCTTGGATAAGCTAATGGAGAGTGATAAATATGGTGAGCGTAGAGAAGCAG-TGTTT 5136
Query 4292 GGTCTTGCGGGAGTAGTTATGGGCTTTGGAATTTCTAGCTTGAAGAAATATGGTCTTATA 4351
||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 5137 GGTGTTGAGAGAGTAGTTATGGGCTTTGGAATTTCTAGCTTGACGAAATATGGTCTTATA 5196
Query 4352 GTCACTTTGCAAGAAGCACTTATTGACA 4379
|| ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 5197 GTTACTCCGCAAGAAGCACTTATTGACA 5224
Score = 209 bits (113), Expect = 2e-52
Identities = 127/134 (95%), Gaps = 0/134 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3575 GCCCGCTATGGTCATGATTTGGGGACTGATTATTCAGGAATCTTTAAAGCACTTTCTCAT 3634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3247 GCCCGCTATGGTCATGATTTGGGGACTGATTATTCAGGAATATTTAAAGCACTTTCTCAT 3306
Query 3635 ATAAATCTCAACGTCCGTTTAGCTGCAGCAGAAGCACTGGCTGATGCTCTTCATGAAAGC 3694
||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3307 ATAAATCTCAATGTCTGTTTAGCTGCAGCAGAACCACTGGCTGATGCTCTTTATGAAAGC 3366
Query 3695 CCGTCATCAATCCA 3708
|| ||||||||||
Sbjct 3367 TCGACATCAATCCA 3380
Score = 209 bits (113), Expect = 2e-52
Identities = 136/146 (93%), Gaps = 5/146 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 3543 AGTCAGTGGCTGAATCAGCAGATGATTTATGGGCCCGCTATGGTCATGATTTGGGGACTG 3602
|||||||||||||||||||||||||| ||| || | | |||||||||||||||||||||
Sbjct 7288 AGTCAGTGGCTGAATCAGCAGATGATATAT-GG--C-C-ATGGTCATGATTTGGGGACTG 7342
Query 3603 ATTATTCAGGAATCTTTAAAGCACTTTCTCATATAAATCTCAACGTCCGTTTAGCTGCAG 3662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 7343 ATTATTCAGGAATCTTTAAAGCACTTTCTCATATAAATCTCAATGTCCGTTTAGCTGCAG 7402
Query 3663 CAGAAGCACTGGCTGATGCTCTTCAT 3688
|||||||| |||| ||| ||||||||
Sbjct 7403 CAGAAGCATTGGCAGATTCTCTTCAT 7428
Score = 202 bits (109), Expect = 4e-50
Identities = 119/124 (96%), Gaps = 0/124 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3887 GCTGATCCCAACACAGATGTTCGTGGAAAGATGATCAATGCTGGTATCATGATTATTGAT 3946
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 3382 GCTGATCCCAACAAAGATGTTCGTGGAAAGATGATCAATGCTGGTAACGTGATTATTGAT 3441
Query 3947 AAGCATGGCAAAGAAAACGTTTCATTGCTGTTCCCCATCTTTGAGAATTATTTAAATAAA 4006
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3442 AAGCATGGCAAAGAAAACGTTTCATTGTTGTTCCCCATCTTTGAAAATTATTTAAATAAA 3501
Query 4007 GAGG 4010
||||
Sbjct 3502 GAGG 3505
Score = 176 bits (95), Expect = 2e-42
Identities = 115/125 (92%), Gaps = 0/125 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2740 TTCTAATCATTCTCTAAAGAAAGGATTGGCTAGTAGAGAAACTGCAAACTCAGGGAGAAG 2799
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||
Sbjct 2670 TTCTAATCATTCTCTAAAGAAAGGATTGGCTGGTAGAGAAACTACAAATTTGGGGAGAAG 2729
Query 2800 GGACACTGCAAAGTTGACAAAGAAAGCTGACAAAGGAAAAACGGCAAAGGAAGAGGCACG 2859
||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2730 GGACATTGCAAAGTTGACCAAGAAAGCTGAAAAAGGAAAAACGGCAAAGGAAGAGGCAAG 2789
Query 2860 GGAAC 2864
| |||
Sbjct 2790 GAAAC 2794
Score = 163 bits (88), Expect = 2e-38
Identities = 98/103 (95%), Gaps = 0/103 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2103 AGATCTTCCTCGCGACTTCACAGCTAGCCACTACTCTTTTAGACGAGTTCTCGGATTTTC 2162
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
Sbjct 5357 AGATCTTTCTCGCAACTTCACAGCTAGCCACTACTCTTTTAGACGAGTTCTTGGATTTCC 5416
Query 2163 TTTCCATAACTGGGGACCAAATCGTTTCTTCTAGAACCAGTGA 2205
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 5417 TTTCCATAACTGGGGACCAGATCGTTTCTTCTAGAACCAGTGA 5459
Score = 122 bits (66), Expect = 3e-26
Identities = 75/79 (95%), Gaps = 1/79 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3312 GTGTTGTTCCCGCGTATCAAGCATCAGTTGGACCTGCACTGAATGAATTGTGTCTTGGAT 3371
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3138 GTGTTGTTCCCGCATATCAAGCATCAGTTGGACCTGCG-TGAATGAATTGTGTCTTGGAT 3196
Query 3372 TGCAAGCAGATGATGTCGC 3390
||||||||| |||||||||
Sbjct 3197 TGCAAGCAGCTGATGTCGC 3215
Score = 121 bits (65), Expect = 1e-25
Identities = 77/83 (93%), Gaps = 0/83 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2465 AAGAGTCTACTTGGACCAATGGGTTTAACGAGTGCTAAAACTCCGGAGCAGCAAGCGGCC 2524
|||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 6931 AAGAGTCTACTTGGACCAATGGGTTTAATGAGTCCTAAAACTCCCGAGCAGCAAGCGGCA 6990
Query 2525 GTATATTCCTTGTCCACCATGAT 2547
||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 6991 GTATATTCCTTGTACACAATGAT 7013
Score = 119 bits (64), Expect = 4e-25
Identities = 99/114 (87%), Gaps = 10/114 (9%)
Strand=Plus/Plus
Query 3775 TGCTGGTTGGAT--AGGAAGGCAAGGAATTGCCTTAGCACTGCAATCTGCTGCTGACGTA 3832
|||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |
Sbjct 1408 TGCTTGTTGAATCCAGGAAGGCAAGGAATAACCTTAGCACTGCAA--T-CTGCTG-C--- 1460
Query 3833 TTGACAACAAAGGACCTTCCTGCTGTTATGACCTTTTTGATATCCCGCGCACTG 3886
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1461 -TGACAACAAAGGACCTTCCTGCTGTTATGACCTTATTGATATCCCGCGCACTG 1513
Score = 99.0 bits (53), Expect = 5e-19
Identities = 57/59 (97%), Gaps = 0/59 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1920 TGGCCTCAAAACTTTCAAGTGATGATTGTGTAGTATGTGTAGACCTTCTTGAGGTGCTC 1978
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||
Sbjct 5288 TGGCCTCAAAACTTTCAAGTGATGATTGTGTAGTATGTGTCGACCTTCTTGCGGTGCTC 5346
Score = 93.5 bits (50), Expect = 2e-17
Identities = 58/62 (94%), Gaps = 0/62 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2587 GCATCTACAAGACCTTCCAGATCGACTGTCTCATGATATGCTCTCAGAGACTGACATTAA 2646
|||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 GCATCTACAAGATCTTCCCGATAAACTGTCTCATGATATGCTCTCAGAGACTGACATTAA 419
Query 2647 GA 2648
||
Sbjct 420 GA 421
Score = 87.9 bits (47), Expect = 1e-15
Identities = 53/56 (95%), Gaps = 0/56 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4861 GGCCTTAACAGATCCCAATGAGTACACACGCCATGCTCTTGACACCCTTCTTCAAA 4916
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct 3627 GGCCTTAACAGATCCCAATGAGTACACACGACATTCTCTTGACATCCTTCTTCAAA 3682
Score = 60.2 bits (32), Expect = 2e-07
Identities = 37/39 (95%), Gaps = 1/39 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 5606 CAAAGTTCTGTTGAACTGCTTGGGGATCTATTGTTCAAG 5644
|||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4235 CAAA-TTTTGTTGAACTGCTTGGGGATCTATTGTTCAAG 4272
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 315834827706
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5