BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G65440.1
Length=5362
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg925610 jgi|Araly1|925610|scaffold_201171.1 7797 0.0
Ahg907098 jgi|Araly1|907098|Al_scaffold_0002_179 2566 0.0
> Ahg925610 jgi|Araly1|925610|scaffold_201171.1
Length=4961
Score = 7797 bits (4222), Expect = 0.0
Identities = 4514/4657 (97%), Gaps = 11/4657 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 120 TTCTAATTTGTTGAGATAAACATGGCGAGGAACGCAATCTCTGACGATGAAGAGGATCAT 179
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TTCTAATTGGTTGAGATAAACATGGCGAGGAACGCAATCTCTGACGATGAAGAGGATCAT 60
Query 180 GAGCTTGAGGATGACGACGGAGAGCCAGTTCATGGAGATCCAGCtgagcatgatgaaaac 239
||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||
Sbjct 61 GAGCTAGAGGATGATGACGGAGAGCCAGTTCATGGAAATCCAGTTGAGCACGATGACAAC 120
Query 240 gatgatgaagaagatgatgatgacgttgggaatgagtatgagaatgatgGGTTCATAGTG 299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GATGATGAAGAAGATGATGATGACGTTGGGAATGAGTATGAGAATGATGGGTTCATAGTG 180
Query 300 AATGATgaagacgaagaggaagaagaggaagaagacgaagaaaggaaagatagcgatgag 359
||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 181 AATGATGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGAAGAGGACGAAGAAAGGAAAAATAGCGATGAG 240
Query 360 gagaggcagaaaaagaagaagaaacgaaagaaaaaggACGAAGGTCTTGATGAAGATGAT 419
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 241 GAGAGGCAGAAAAAGAAGAAGAAACGAAGGAAAAAGGACGAAGATCTTGATGAAGATGAT 300
Query 420 TATTTGCTTCTACAAGATAACAACGTCAAATTCAAAAAGAGGCAGTATAAGCGGTTGAAG 479
||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 301 TATCTGCTTCTCCAAGATAACAACGTCAAATTCGAAAAGAGGAAGTATAAGCGGTTGAAG 360
Query 480 AAAGCTCAAAGGGAACAGGGA-AATGG-CCAGGGAGAATCATCCGATGATGAGTTTGATA 537
||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 AAAGCTCAAAGGGAA-AGGGACAATGGTCC-GGGGGAATCATCCGATGATGAGTTTGATG 418
Query 538 GTAGAGGTGGAACTAGGAGAAGTGCTGAGGATAAGATCAAAGACAGGCTGTTtgatgatg 597
| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 419 GGAGAGGTGGAGCTAAAAGAAGTGCTGAGGATAAGATCAAAGACAGGCTTTTTGATGATG 478
Query 598 ttgatgttgatgatccacctgatgatgtaggtgatgaGGAAGACTTAGTTGTGGAAGAAG 657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 479 TTGATGTTGATGATCCACCTGATGATGTAGGTGATGAGGAAGACTTAGTTGTGGAAGAAG 538
Query 658 ATGTAGTTGGGAGCGAGGATGAAATGGCAGATTTTATTGTAGATGAAGATGATGAGCATG 717
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 539 ATGTAGTTGGGAGCGAGGACGAAATGGCAGATTTTATTGTAGATGAAGATGATGGGCTTG 598
Query 718 GTCCTCCTAAGAGGGGCAACTCGAAGAAAAAGAAATATAGGCAGGGATCAGATATTACTG 777
|| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 599 GTGCTCCTAAGAGGGGGAACTCGAAAAAAAAGAAATTTAGGCAGGGATCAGATATTAATG 658
Query 778 CTATGCGAGATGCTAATGAAATATTTGGTGATGTTGACGAATTATTAACAATTCGCAAAA 837
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 659 CTATGCGAGACGCTAATGAAATATTTGGTGATGTTGACGAATTATTGACAATTCGCAAAA 718
Query 838 AGGGTTTGGCATCTAATCAAAGGATGGAAAGAAGGCTCGAAGATGAGTTTGAACCAACTG 897
||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 AGGGTTTGGCATCTAGTGAAAGGATGGAAAGAAGGCTCGAAGATGAGTTTGAACCAACTG 778
Query 898 TTCTTTCTGAGAAATATATGACAGGGAATGATGATGAAATCCGCCAGCTTGATATTCCTG 957
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 779 TTCTTTCTGAGAAATATATGACAGGGAAAGATGATGAAATTCGCCAGCTTGATATTCCTG 838
Query 958 AGAGAATGCAGATATCTGAAGAAAGCACCGGAAGCCCTCCTGTAGATGAAATTAGCATTG 1017
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 AGAGAATGCAGATATCTGAAGAAAGCACCGGAAGCCCTCCTGTAGATGAAATTAGCATTG 898
Query 1018 AAGAAGAAAGCAATTGGATATATGCTCAACTTGCTTCCCAACTTAGAGAATCTGATGGAA 1077
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||
Sbjct 899 AAGAAGAAAGCAATTGGATATATGCTCAACTTGCTTCTCTACTTAAAGAATCTGATGGAA 958
Query 1078 CTTTTGATGGGCGGGGTTTCTCGGTTAATAAGGATGACATCGCAAAATTTTTGGAGCTAC 1137
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 CTTTTGATGGGCGGGGTTTCTCGGTTAATAAGGATGACATCGCAAAATTTTTGGAGCTAC 1018
Query 1138 ATCATGTGCAGAAATTAGAGATACCGTTTATAGCTATGTACCGAAAGGAGCAATGCCGGA 1197
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019 ATCATGTGCAGAAATTAGAGATACCCTTTATAGCTATGTACCGAAAGGAGCAATGCCGGA 1078
Query 1198 GCTTGTTGGACACTGGTGATTTTGATGGCGCCAATCAAGGCAAGAAACCTGAGACCAAGT 1257
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 GCTTGTTGGACACTGGTGATGTTGATGGCGCCAATCAAGACAAGAAACCTGAGACCAAGT 1138
Query 1258 GGCATAAGGTCTTCTGGATGATTCATGACTTGGATAAGAAGTGGCTCCTTCTTCGAAAAA 1317
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139 GGCATAAGGTCTTCTGGATGATTCATGACTTGGATAAGAAGTGGCTCCTTCTTCGAAAAA 1198
Query 1318 GGAAAATGGCGTTGCATGGTTACTATACAAAACGTTACGAAGAAGAGTCTAGGAGGGTCT 1377
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199 GGAAAATGGCGTTGCATGGTTACTATACAAAACGTTACGAAGAAGAGTCTAGGAGGGTCT 1258
Query 1378 ATGATGAAACAAGACTTAATCTAAATCAGTATCTTTTTGAATCAGTCATTAAGTCTCTTA 1437
|||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1259 ATGATGAAACTAGACTTAATCTAAACCAGTATCTTTTTGAATCAGTCATTAAGTCCCTTA 1318
Query 1438 AAGTTGCAGAAACAGAAAGAGAAGTTGATGATGTAGATTCCAAGTTCAACTTGCATTTTC 1497
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1319 AAGTTGCAGAAACAGAAAGAGAAGTTGATGATGTAGATTCCAAGTTCAACTTGCATTTCC 1378
Query 1498 CTCCCGGTGAAATTGGTGTTGATGAAGGGCAGTATAAGAGGCCGAAAAGGAAATCACAAT 1557
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1379 CTCCCGGTGAAATTGGTGTTGATGAAGGGCAGTATAAGAGGCCGAAAAGGAAATCACAAT 1438
Query 1558 ATAGCATCTGCAGTAAAGCAGGGCTCTGGGAGGTTGCAAACAAATTTGGGTATAGTGCTG 1617
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1439 ATAGCATCTGCAGTAAAGCGGGGCTCTGGGAGGTTGCAAACAAATTTGGGTATAGTGCTG 1498
Query 1618 AGCAACTGGGACTTGCATTGTCCCTAGAAAAACTGGTTGATGAGCTTGAGGATGCAAAGG 1677
||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 1499 AGCAATTGGGACTTGCATTGTCCTTAGAAAAACTGGTTGATGAACTTGAGGACGCAAAGG 1558
Query 1678 AAACACCAGAGGAGATGGCTAAAAACTTTGTGTGCGCAATGTTTGAAAATTCTCTGGCAG 1737
|||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |
Sbjct 1559 AAACACCAGAGGAGATGGCTCAGAACTTTGTGTGCGCAATGTTTGAAAATCCTCAGGCCG 1618
Query 1738 TTCTGAAAGGTGCACGGCATATGGCTGCAGTTGAGATAAGTTGCGAGCCATCAGTCAAAA 1797
||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1619 TTCTGAAGGGTGCACGGCATATGGCTGCAATTGAGATAAGTTGTGAGCCATCAGTCAAAA 1678
Query 1798 AGTATGTCCGTGGCATTTATATGGAGAATGCAGTGGTCTCAACAAGTCCAACAGCAGATG 1857
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1679 AGTATGTCCGTGGCATTTATATGGAGAATGCAGTGGTCTCAACAAGTCCAACAGCAGATG 1738
Query 1858 GAAATACAGTAATTGATTCGTTCCATCAGTTTTCTGGGATTAAGTGGTTGCGTGAAAAGC 1917
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1739 GAAATACAGTAATAGATTCGTTCCATCAGTTTTCTGGCATTAAGTGGTTACGTGAAAAGC 1798
Query 1918 CATTGAGCAAGTTTGAGGGTGCACAATGGCTTCTCATTCAGAAGGGAGAAGAGGAGAAAC 1977
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1799 CATTGAGCAAGTTTGAGGGTGCACAATGGCTTCTCATTCAGAAGGCAGAAGAGGAGAAAC 1858
Query 1978 TTCTTCAAGTAACCTTCAAGCTGCCTGAGAATTACATGAATAGGCTAATTAGCGACTGCA 2037
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1859 TTCTTCAAGTAACCTTCAAGCTGCCTGAGAATTACATGAATAGGCTAATTAGTGACTGCA 1918
Query 2038 ATGAACACTATCTAAGTGTTGGTGTTAGTAAGTATGCTCAACTCTGGAATGAGCAAAGAA 2097
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1919 ATGAACACTATCTAAGTGTTGGTGTTAGTAAGTATGCTCAACTCTGGAATGAGCAAAGAA 1978
Query 2098 AGTTGATATTGGAGGATGCACTTCATGCTTTTCTTTTGCCATCAATGGAGAAAGAAGCAA 2157
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1979 AGTTGATAGTGGAGGATGCACTTCATGCTTTTCTTTTGCCATCAATGGAGAAAGAAGCAA 2038
Query 2158 GATCCTTGCTAACTAGCAGAGCGAAGAGTCGGTTGCTTTCAGAGTATGGACAGGCTTTGT 2217
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2039 GATCCTTGCTAACTAGCAGAGCGAAGAGTCGGTTGCTTTCAGAGTATGGACAGGCTTTGT 2098
Query 2218 GGAACAAGGTGTCTGCAGGGCCATACCAAAAGAAAGAAATGGACATTAATTTAGATGAGG 2277
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||
Sbjct 2099 GGAACAAGGTGTCTGCAGGGCCATATCAAAAGAAAGAAATGGACATGAATTCAGATGAGG 2158
Query 2278 AAGCTGCACCGAGGGTCATGGCATGTTGTTGGGGACCTGGGAAGCCACCAAATACATTTG 2337
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2159 AAGCTGCACCGAGGGTCATGGCATGTTGTTGGGGACCTGGAAAGCCACCAAATACATTTG 2218
Query 2338 TGATGCTGGACTCATCAGGTGAGGTGCTTGACGTGCTTTATGCTGGATCCCTTACATCGC 2397
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2219 TGATGCTGGACTCATCAGGCGAGGTGCTTGACGTGCTTTATGCTGGATCCCTCACATCGC 2278
Query 2398 GATCTCAAAATGTTAACGACCAGCAACGTAAAAAGAGTGACCAGGATCGTGTTTTAAAGT 2457
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2279 GATCTCAAAATGTCAACGACCAGCAACGTAAAAAGAGTGACCAGGATCGTGTTTTAAAGT 2338
Query 2458 TTATGATGGACCACCAACCGCATGTTGTGGCTTTAGGAGCTGTCAATTTGTCTTGTACTC 2517
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2339 TTATGATGGACCACCAACCGCATGTTGTGGCTTTAGGAGCTGTCAATTTGTCTTGTACTC 2398
Query 2518 GTCTGAAGGATGATATTTATGAGGTCATATTCCAGATGGTGGAGGAAAAACCTAGAGATG 2577
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2399 GTCTGAAGGATGATATTTATGAGGTCATATTCCAGATGGTGGAGGAAAAACCTAGAGATG 2458
Query 2578 TCGGACATGGGATGGATGATTTAAGCATTGTTTATGTGGATGAATCACTTCCTAGGCTAT 2637
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2459 TCGGACATGGGATGGATGATTTAAGCATTGTTTATGTGGATGAATCGCTTCCTAGGCTAT 2518
Query 2638 ATGAAAATTCTCGAATCTCGGGTGAACAGCTACCTCAGCAGTCAGGGAACGTGAGACGTG 2697
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 2519 ATGAAAATTCTCGAATCTCGGGTGAACAGCTACCTCAGCAGTCAGGGATCGTGAAACGTG 2578
Query 2698 CAGTTGCTCTTGGACGCTATCTCCAGAATCCACTAGCAATGGTGGCAACTTTATGCGGTC 2757
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2579 CAGTTGCTCTTGGACGCTATCTCCAGAATCCACTAGCGATGGTGGCAACTTTATGCGGTC 2638
Query 2758 CAGGTCGGGAAATTTTGTCTTGGAAGCTTCATCCCTTGGAGAATTTTCTTCAGCTAGATG 2817
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2639 CAGGTCGGGAAATTTTGTCTTGGAAGCTTCATCCGTTGGAGAATTTTCTTCAGCTAGACG 2698
Query 2818 AGAAGTATGGAATGGTTGAGCAGGTTATGGTTGACATTACAAACCAGGTTGGAATCGATA 2877
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2699 AGAAGTATGGAATGGTTGAGCAGGTTATGGTTGACATTACAAACCAGGTTGGAATCGATA 2758
Query 2878 TTAACTTGGCAGCTAGCCATGATTGGTTCTTTTCTCCTTTACAGTTCATTTCTGGACTTG 2937
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2759 TTAACTTGGCAGCTAGCCATGAGTGGTTCTTTTCTCCTTTACAGTTCATATCTGGACTTG 2818
Query 2938 GGCCTCGGAAAGCTGCATCCTTGCAGAGGTCGCTTGTAAGAGCTGGTTCAATCTTTGTCC 2997
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2819 GGCCTCGGAAAGCTGCATCCTTGCAGAGGTCGCTTGTAAGAGCTGGTTCAATATTTGTCC 2878
Query 2998 GCAAGGACCTGATAATGCATGGACTTGGTAAAAAGGTTTTTGTAAATGCTGCCGGTTTCT 3057
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2879 GCAAGGACCTAATAATGCATGGACTTGGTAAAAAGGTTTTTGTAAATGCAGCCGGTTTCT 2938
Query 3058 TGCGCATCCGCAGAAGTGGGCTGGCTGCTAGTAGCAGTCAATTTATTGACTTATTGGATG 3117
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2939 TGCGCATCCGCAGAAGTGGGCTGGCTGCTAGTAGCAGTCAATTTATCGACTTATTGGATG 2998
Query 3118 ACACCAGAATCCATCCAGAGTCGTATAGTCTTGCTCAAGAATTGGCGAAAGATATATATG 3177
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2999 ACACCAGAATCCATCCCGAGTCATATAGTCTTGCGCAAGAATTGGCGAAAGATATATATG 3058
Query 3178 ATGAGGATGTCAGAGGTGATTCAAATGATGATGAGGATGCGATAGAAATGGCTATTGAGC 3237
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3059 ATGAGGATGTCAGAGGTGATTCAAATGATGATGAGGATGCAATAGAAATGGCTATTGAGC 3118
Query 3238 ATGTGAGAGATCGGCCAGCTTCTTTGAGAAAAGTTGTCCTTGATGAATATCTTGCCAGCA 3297
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3119 ATGTGAGAGATCGGCCAGCTTCTTTGAGAAAAGTTGTCCTTGATGAATATCTTGCCAGCA 3178
Query 3298 AGAAACGGGAGAATAAGAAGGAAACTTATAGCAATATCATAAGAGAATTAAGTTGTGGTT 3357
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3179 AGAAACGGGAGAATAAGAAGGAAACTTATAGCAATATCATAAGAGAATTAAGCTGTGGTT 3238
Query 3358 TCCAGGATTGGCGGATACCATTTAAAGAGCCAAGTCCAGATGAAGAATTTTACATGATTT 3417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3239 TCCAGGATTGGCGGATACCATTTAAAGAGCCAAGTCCAGATGAAGAATTTTACATGATTT 3298
Query 3418 CAGGTGAAACTGAGGACACCATAGCGGAGGGCAGAATTGTCCAGGCCAGTGTTCGGAGAT 3477
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3299 CAGGTGAAACTGAGGACACCATAGCTGAGGGCAGAATTGTCCAGGCCAGTGTTCGGAGAT 3358
Query 3478 TGCAGAATGGAAGAGCCATATGTGTATTAGATTCTGGGTTAACTGGGATGCTTATGAAGG 3537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3359 TGCAGAATGGAAGAGCCATATGTGTATTAGATTCTGGGTTAACTGGGATGCTTATGAAGG 3418
Query 3538 AAGATTTCTCAGATGATGGGAGAGATATTGTTGACTTGGCGGACCAGCTGAAAGAAGGCG 3597
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3419 AAGATTTCTCAGATGATGGGAGAGATATTGTTGACTTGGCGGACCAACTGAAAGAAGGCG 3478
Query 3598 ATATCCTCACATGCAAGATCAAATCGATTCAAAAGCAGAGGTATCAAGTGTTCCTTATTT 3657
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 ATATCCTAACATGCAAGATCAAATCGATTCAAAAGCAGAGGTATCAAGTGTTCCTTATTT 3538
Query 3658 GCAAAGAAAGTGAAATGAGAAACAACAGACACCAGCATAACCAGAATGTGGATGCATATT 3717
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3539 GCAAAGAAAGTGAAATGAGAAACAACAGACACCAGCATAACCAGAATGTGGATGCTTATT 3598
Query 3718 ACCATGAGGATAGAAACAGTCTCCAGCTTGTAAAAGAGAAGGCTCGAAAGGAAAAAGAGC 3777
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3599 ACCATGAGGATAGAAACAGTCTCCAGCTTGTAAAAGAGAAAGCTCGAAAGGAAAAAGAGC 3658
Query 3778 TGGTGAGGAAGCATTTTAAGTCTCGGATGATTGTCCATCCCCGCTTTCAGAATATCACAG 3837
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3659 TGGTGAGGAAGCATTTTAAGTCTCGGATGATTGTCCATCCCCGCTTTCAGAATATCACAG 3718
Query 3838 CTGACCAAGCAACAGAGTATTTGTCTGACAAAGACTTTGGAGAAAGCATTGTTCGTCCAA 3897
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3719 CTGACCAAGCAACAGAGTATTTGTCTGACAAAGACTTTGGAGAAAGCATTGTTCGTCCAA 3778
Query 3898 GTTCTCGAGGACTCAACTTTTTAACTTTGACCCTCAAGATTTATGATGGAGTTTACGCTC 3957
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3779 GTTCTCGAGGACTCAACTTTTTAACTTTGACGCTCAAGATTTATGATGGAGTTTACGCTC 3838
Query 3958 ACAAGGAGATAGCTGAAGGTGGGAAAGAAAACAAGGACATTACAAGCCTACAGTGTATTG 4017
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3839 ACAAGGAGATAGCTGAAGGTGGGAAAGAAAACAAGGACATCACAAGCCTACAGTGTATTG 3898
Query 4018 GGAAGACCCTGACAATTGGAGAGGACACCTTCGAGGATCTAGATGAGGTCATGGATCGAT 4077
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3899 GGAAGACCCTGACAATTGGAGAGGACACCTTCGAGGATCTAGATGAGGTCATGGATCGAT 3958
Query 4078 ATGTTGATCCTTTGGTATCTCATCTTAAGACAATGCTCAACTATCGGAAATTCCGTAAGG 4137
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3959 ATGTTGATCCTTTGGTATCTCATCTTAAGACCATGCTCAACTATCGGAAATTCCGAAAGG 4018
Query 4138 GGACCAAATCAGAAGTAGATGATCTTCTTAGGATCGAGAAGGGCGAAAATCCTTCAAGAA 4197
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4019 GGTCCAAATCAGAAGTAGATGATCTTCTTAGGATCGAGAAGGGAGAAAATCCTTCAAGAA 4078
Query 4198 TAGTTTATTGTTTTGGGATTTCACACGAACATCCAGGCACTTTTATTCTGTCTTACATAA 4257
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4079 TAGTTTACTGTTTTGGGATTTCACATGAACATCCAGGCACTTTTATTCTGTCTTACATAA 4138
Query 4258 GGAGCACAAACCCACATCATGAGTATATAGGTTTATATCCCAAGGGATTTAAGTTCAGGA 4317
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4139 GGAGCACAAACCCACATCATGAGTATATAGGTTTATATCCCAAGGGATTTAAGTTCAGGA 4198
Query 4318 AAAGGATGTTTGAGGACATTGATCGGCTTGTGGCATACTTCCAGAGGCATATTGATGACC 4377
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4199 AAAGGATGTTTGAGGACATTGATAGGCTTGTGGCATACTTCCAGAGGCATATTGATGACC 4258
Query 4378 CATTGCAAGAATCGGCGCCATCAATCAGGTCTATTGCTGCCAAGGTACCGATGAGAAGCC 4437
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4259 CATTGCAAGAATCGGTGCCATCGCTCAGGTCTATTGCTGCCAAGGTACCGATGAGAAGCC 4318
Query 4438 CAGCAGACCATGGATCATCTGGAGGAAGTGGTTGGGGTAGTTCTCAGAGTGAAGGAGGCT 4497
||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 4319 CAGCAGACCATGGCTCGTCTGGAGGAAGTGATTGGGGTAGTTCTCAGAATGAAGGAGGGT 4378
Query 4498 GGAAAGGTAA-CTC-GGATCGTTCAGGCTCAG-GGAGAGGCGGTGAGTACAGAAATGGTG 4554
||||||| | ||| || | | || ||| |||| || |||||||| ||||||||||
Sbjct 4379 GGAAAGG-AGGCTCAGG-TAATGCATT-TCAAAGGAGGGGTGGTGAGTATAGAAATGGTG 4435
Query 4555 GTGGACGTGATGGACATCCAAGTGGAGCGCCTAGGCCATATGGTGGCCGTGGACGTGGTC 4614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4436 GTGGACGTGATGGACATCCAAGTGGAGCGCCTAGGCCATATGGTGGCCGTGGACGTGGTC 4495
Query 4615 GAGGCAGAGGACGGAGGGATGATATGAATAGTGATAGACAAGATGGTAACGGAGATTGGG 4674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4496 GAGGCAGAGGACGGAGGGATGATATGAATAGTGATAGACAAGATGGTAATGGAGATTGGG 4555
Query 4675 GTAATAATGATACTGGAACTGCAGATGGAGGTTGGGGAAATAGTGGTGGCGGTGGTTGGG 4734
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||
Sbjct 4556 GTAATAATGATACTGGAACTGGTGATGGAGGTTGGGGAAGTAGTGGTGTCGGCGCTTGGG 4615
Query 4735 GAAGCGAGTCTGCTGGTAAAAAGACTGGTGGTGGCAG 4771
|||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 4616 GAAGCGAGTCTGCTGGTAAAAAGAGTGGTGGTG-CAG 4651
> Ahg907098 jgi|Araly1|907098|Al_scaffold_0002_179
Length=3720
Score = 2566 bits (1389), Expect = 0.0
Identities = 2937/3659 (80%), Gaps = 207/3659 (6%)
Strand=Plus/Plus
Query 789 GCTAATGAAATATTTGGTGATGTTGACGAATTATT-AACAATTCGCAAAAAGGGTTTGGC 847
|||||||| |||||||||||| ||| ||||| || || | |||| | ||||| ||| ||
Sbjct 181 GCTAATGATATATTTGGTGATCCTGAAGAATTGTTGAA-ACTTCGGAGAAAGGATTTAGC 239
Query 848 ATCTAATC-AAAGGATGGAAAGAAGGCTCGAAGATGAGTTTGAACCAACTGTTCTTTCTG 906
| ||| | ||| ||| ||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||| ||||
Sbjct 240 GTATAA-CGAAAAGATCGAAAGAAAGTTAGAAGATGAGTTTGAACCAATTGTTCTCTCTG 298
Query 907 AGAAATATATGACAGGGAATGATGATGAAATCCGCCAGCTTGATATTCCTGAGAGAATGC 966
|||| ||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 299 AGAAGTATATGACACAGAAAGATGATGAAATTAGGAAGCTTGATGTTCCTGAGAGAATGC 358
Query 967 AGATA-TCTGAAGAAAG-CACCGGAAGCCCTCCTGTAGATGAAATTAGCATTGAAGAAGA 1024
||||| || |||| ||| ||| |||| | |||| || ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 359 AGATATTC-GAAG-AAGTCACTGGAAACGCTCCCGTCGATGATATTAGCATTGAAGAAGA 416
Query 1025 AAGCAATTGGATATATGCTCAACTTGCTTCCCAACTTAGAGAATCTGATGGAACTTTTGA 1084
||||| ||||| ||||||| | ||| || | | |||| | || | |
Sbjct 417 GAGCAACTGGATTTATGCTCGA-TTGGTT-----C--A-AGAA-C--AT-G-------G- 455
Query 1085 TGGGCGGGGTTTCTCGGTTAATAAGGATGACATCGCAAAATTTTTGGAGCT-ACATCATG 1143
| | |||| | |||||| || |||||||| | | |||||||||| | | |||||
Sbjct 456 T---CCAAGTTTTTTGGTTAACAAAGATGACATTGTGAGATTTTTGGAGATGTC-TCATG 511
Query 1144 TGCAGAAATTAGAGATACCGTTTATAGCTATGTACCGAAAGGAGCAATGCCGGAGCTTGT 1203
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||
Sbjct 512 TGCAGAAGTTAGAGATACCGTTTATAGCTATGTACCGGAAGGAGCAGTGTCGGAGTTTGT 571
Query 1204 TGGACA---CTGGTGAT-TTTG-A-TGGCGCCAATCAAGGCAAGAAACCTGAGACCAAGT 1257
|||||| ||| |||| | | | || ||||| |||||| | |||||||||||
Sbjct 572 TGGACAGTTCTGATGATGATGGTAGTGATTTCAATCTTCTCAAGAAGCTTGAGACCAAGT 631
Query 1258 GGCATAAGGTCTTCTGGATGATTCATGACTTGGATAAG-AAGTGGCTCCTTCTTCGAAAA 1316
|| |||| ||||||||||||||||| || |||||| || |||||||| |||||||| |||
Sbjct 632 GGAATAAAGTCTTCTGGATGATTCAAGATTTGGAT-AGAAAGTGGCTTCTTCTTCGGAAA 690
Query 1317 AGGAAAATGGCGTTGCATGGTTACTATACAAAACGTTACGAAGAAG-AGTCTAGGAGGGT 1375
||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| | || | | |||
Sbjct 691 AGGAAAACCGCGTTGTTTGGTTACTTTACCAAACGTTTTGAAGAAGAAACCT-GCA-GGT 748
Query 1376 CTATGATGAAACAAGACTTAATCTAAATCAGTATCTTTTTGAATCAGTCATTAAGTCTCT 1435
| |||| || || | || || |||||||||||| || || ||||||||
Sbjct 749 C--TGAT---------CTGAA--T-AA-GAG--TCTTTTTGAATCGGTTATGAAGTCTCT 791
Query 1436 TAAAGTTGCAGAAACAGAAAGAGAAGTTGATGATGTAGATTCCAAGTTCAACTTGCATTT 1495
||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 792 TAAAGCGGCGGAGACAGAGAGAGAAGTTGATGATGTAGACTCAAAGTTCAACTTGCATTT 851
Query 1496 TCCTCCCGGTGAAATTGGTGTTGATGAAGGGCAGTATAAGAGGCCGAAAAGGAAATCACA 1555
||||| ||| | | | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 852 TCCTCATTGTG--A---G-ATCGATGAAGGACAGTATAAGAGGCCGAATAGGAAATCGCA 905
Query 1556 ATATAGCATCTGCAGTAAAGCAGGGCTCTGGGAGGTTGCAAACAAATTTGGGTATAGTGC 1615
||||||||||| || ||| || || |||| |||||||||| ||||| ||||| ||
Sbjct 906 TTATAGCATCTGTAGCAAATTTGGAATCCGGGAATTTGCAAACAAGTTTGGTTATAGCGC 965
Query 1616 TGAGCAACTGGGACTTGCATTGTC-CCT-AGAAA-AACTGGTTGATGAGCTTGAGGATGC 1672
||||||| ||||| |||| ||||| | | ||||| | |||||||||||||| |||||
Sbjct 966 TGAGCAATTGGGATTTGCGTTGTCTCTTGAGAAAGTTTTTGTTGATGAGCTTGAAGATGC 1025
Query 1673 AAAGGAAACACCAGAGGAGATGGCTA-AAAACTTTGTGTGCGCAATGTTTGAAAATTCTC 1731
|||| ||||||||||||||||||| | ||| | || |||||||||||| || |||
Sbjct 1026 AAAGAAAACACCAGAGGAGATGGC-ATTGTACTATAAATGTGCAATGTTTGAAGATCCTC 1084
Query 1732 TGGCAGTTCTGAAAGGTGCACGGCATATGGCTGCAGTTGAGATAAGTTGCGAGCCA-TCA 1790
| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |
Sbjct 1085 AAGTTGTTCTTAAAGGCGCACGGCATGTGGCTGCGGTTGAGATAAGCTGCGAGCCATTGA 1144
Query 1791 GTCAAAAAGTATGTCCGTGGCATTTATATGGAGAATGCAGTGGTCTCAACAAGTCCAACA 1850
| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 1145 -TTAAAAAGTATGTTCGCGGGATTTATATGGAGAATGCAGTAGTCTCAACGAGTCCAACA 1203
Query 1851 GCAGATGGAAATACAGTAATTGATTCGTTCCATCAGTTTTCTG-GGATTAAGTGGTTGCG 1909
||||||| || || || ||||| ||||||| |||||||| || |||||||||| ||
Sbjct 1204 CCAGATGGGGATGTGGTTATAGATTCTTTCCATCGGTTTTCTGCGG-TTAAGTGGTTACG 1262
Query 1910 TGAAAAGCCATTGAGCAAGTTTGAGGGTGCACAATGGCTTCTCATTCAGAAGGGAGAAGA 1969
|||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||
Sbjct 1263 CGAAAAGCCATTGAGAAAGTTTGAAGGTACACAATGGCTTCTTATTCAGAAAGCAGAAGA 1322
Query 1970 GGAGAAACTTCTTCAAGTAACCTTCAAGCTGCCTGAGAATTACATGAATAGGCTAATTAG 2029
||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||
Sbjct 1323 AGAGAAGCTTCTTCAAGTAACTTTCAAGCTGCCTGAGAATCAGATGAATAGGATAATTAG 1382
Query 2030 CGACTGCAATGAACACTATCTAAGTGTTGGTGTTAGTAAGTATGCTCAACTCTGGAATGA 2089
|| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1383 TGAATGCAGTGAACACTATCTAAGTGTTGGTGTTAGTAAGTATGCTCAACTCTGGAATGA 1442
Query 2090 GCAAAG-AAAGTTGATATTGGAGGATGCACTTCATGCTTTTCTTTTGCCATCAATGGAGA 2148
||| || ||| |||||| ||||||| || |||| | |||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1443 GCAGAGGAAA-TTGATACTGGAGGACGCGGTTCACGGTTTTCTTTTGCCGTCAATGGAGA 1501
Query 2149 AAGAAGCAAGATCCTTGCTAACTAGCAGAGCGAAGAGTCGGTTGCTTTCAGAGTATGGAC 2208
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1502 AAGAAGCAAGATCCTTGCTAACTAGCAGAGCGAAGACTCGGTTGCTTTCAGAGTATGGAC 1561
Query 2209 AGGCTTTGTGGAACAAGGTGTCTGCAGGGCCATACCAAAAGAA-AGA-AATGGACATTAA 2266
||| ||| ||||| || |||||| |||||||||| | || ||| | | ||| | || |
Sbjct 1562 AGGTTTTATGGAAAAAAGTGTCTTCAGGGCCATATCGAAGGAATA-ATAAT--A-AT-AC 1616
Query 2267 TTTAGATGAGGAAGCTGCACCGAGGGTCATGGCATGTTGTTGGGGACCTGGGAAGCCACC 2326
| |||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| || |||
Sbjct 1617 CTCGGATGAGGAAGCTGCGCCGAGGGTCCTAGCTTGTTGTTGGGGACCTGGAAATCCAG- 1675
Query 2327 AAA-TACATTTGTGATGCTGGACTCATCAGGTGAGGTGCTTGACGTGCTTTATGCTGGAT 2385
||| ||||||||||||||| || ||||| || ||| || |||| |||||||| || ||||
Sbjct 1676 AAACTACATTTGTGATGCTTGATTCATCGGGAGAGTTGGTTGATGTGCTTTACGCAGGAT 1735
Query 2386 CCCTTACATCGCGATCTCAAAATGTTAACGACCAGCAACGTAAAAAGA-GTGACCAGGAT 2444
|| || ||||||| |||| |||| || |||||| |||||||||||| | || || |||
Sbjct 1736 CCATTGCATCGCGGTCTCGGGATGTAAATGACCAGAAACGTAAAAAGAAG-GATCAAGAT 1794
Query 2445 CGTGTTTTAAAGTTTATGATG-GACCACCAACCGCATGTTGTGGCTTTAGGAGCTGTCAA 2503
||| || ||||||||| | | ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 1795 CGTCTTCGAAAGTTTATAA-GAGACCATCAACCAAATGTTGTGGCTTTAGCAGCTG-CAA 1852
Query 2504 -TTTGTCTTGTACT-CGTCTGAAGGATGATATTTATGAGGTCATATTCCAGATGGTGGAG 2561
|||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 1853 ATTTGAGTTGTG-TACGTCTGAAGGATGAGATTTATGAGGTTATATTCCAAATGGTGGAA 1911
Query 2562 GAAAAACC-TAGAGATGTCGGA-CATGGGATGGATGATTTAAGCATTG-TTTATGTGGAT 2618
||| || | | ||| | | | |||||| |||| ||| || || |||||| ||||
Sbjct 1912 GAACTGCCGTCT-GTTGTAGAAGC-TGGGATTTATGACTTAC-CAGTGGTTTATGCGGAT 1968
Query 2619 GAATCACTTCCTAGGCTATATGAAAATTCTCGAATCTCGGGTGAACAGCTACCTCAGCAG 2678
||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |||
Sbjct 1969 GAATCTCTTCCTAGGCTATACGAAAATTCTAGAATCTCAAGAGAACAACTACCTCAACAG 2028
Query 2679 TCAGGGAACGTGAGACGTGCAGTTGCTCTTGGACGCTATCTCCAGAATCCACTAGCAATG 2738
|||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2029 GCAGGGATTGTGAAACGCGCAGTTGCTCTTGGACGTTATCTCCAGAATCCATTAGCAATG 2088
Query 2739 GTGGCAACTTTATGCGGTCCAGGTCGGGAAATTTTGTCTTGGAAGCTTCATCCCTTGGA- 2797
| |||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| | ||| |
Sbjct 2089 ATCTCAACCTTATGCGGTCCAGGTAAAGATATTTTGTCATGGAAGCTACATTCTTTGCAA 2148
Query 2798 GAATTTTCTTCAGCTAGATGAGAAGTATG-GAATGGTTGAGCAGGTTATGGTTGACATTA 2856
|| ||||||| | | |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 2149 GA-TTTTCTTGATCCAGATGAGAAGTATGAGA-TGGTTGAGCAAGTTATGGTTGAC-TTA 2205
Query 2857 -CAAACCAGGTTGGAATCGATATTAA-CTTGGCAGCTAGCCATGATTGGTTCTTTT-CTC 2913
|||| || ||||||||||| ||||| || ||| || |||||||| ||| | |||| |||
Sbjct 2206 ACAAATCAAGTTGGAATCGACATTAATCT-GGCTGCGAGCCATGAATGGCT-TTTTGCTC 2263
Query 2914 CTTTACAGTTCATTTCTGGACTTGGGCCTCGGAAAGCTGCATCCTTGCAGAGGTCGCTTG 2973
|||||||||| |||| || ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 2264 CTTTACAGTTTGTTTCAGGGCTTGGCCCTAGGAAAGCTGCATCTTTGCAGAGGTCTCTTG 2323
Query 2974 TAAGAGCTGGTTCAATCTTTGTCCGCAAGGACCTGATAA-TGCATGGACTTGGTAAAAAG 3032
| ||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||
Sbjct 2324 TTAGATCTGGTTCGATATTTGTCCGCAAGGAACTGATAAAT-CATGGGCTTGGTAAAAAA 2382
Query 3033 GTTTTTGTAAATGCTGCCGGTTTCTTGCGCATCCGCAGAAGTGGGCTGGCT-GCTAGTAG 3091
|||| |||||||| || |||||||| || || || || |||||| ||||| | ||||||
Sbjct 2383 CTTTTCGTAAATGCAGCTGGTTTCTTACGGATTCGTAGGAGTGGGTTGGCTTG-TAGTAG 2441
Query 3092 CAGTCAATTTATTGACTTATTGGATGACACCAGAATCCATCCAGAGTCGTATAGTCTTGC 3151
||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||
Sbjct 2442 CAGCCAATTTATTGACTTGTTGGATGACACTAGAATACATCCGGAATCATACGGTCTTGC 2501
Query 3152 TCAAGAATTGGCGAAAGATATATATGA-TGAGGATGTCAGAGGTGATTCAAATGATGATG 3210
|||||||||||||||||| | ||| | | | ||| | | | | | ||||||| |
Sbjct 2502 GCAAGAATTGGCGAAAGATGTTTAT-ACTCATGATA-CTG---TAAG--AGATGATGAGG 2554
Query 3211 AGGATGCGATAGAAATGGCTATTGAGCATGTGAGAGATCG-GCCAGCTTCTTTGAG-AAA 3268
| ||||| ||||| ||||| || ||| |||| |||||| | ||||||||||||||| |||
Sbjct 2555 ATGATGCAATAGAGATGGCGATAGAGTATGTAAGAGAT-GAGCCAGCTTCTTTGAGGAAA 2613
Query 3269 AGTTGTCCTTGATGAATATCTTGCCA-GCAAGAAACGGGAGAATAAGAAGGAAACTTATA 3327
| | || |||||||| ||| ||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2614 A-TCGTTCTTGATGAGTAT-TTGAGAAGCAAGAACCAAGAGAATAAGAAGGAAACTTATA 2671
Query 3328 GCAATATCATAAGAGAATTAAGTTGTGGTTTCCAGGATTGGCGGA-TACCATTTAAAGAG 3386
| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| | | | |||||||||
Sbjct 2672 GTTTTATCATGAGAGAATTAAGCTGTGGTTTTCAGGATTGGCGAAGT-CTGTTTAAAGAG 2730
Query 3387 CCA-AGTCCAGATGAAGAATTTTACATGATTTCAGGTGAAACTGAGGACACCATAGCG-G 3444
| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | || || || | | |
Sbjct 2731 GTTGA-TCCAGATGAAGAGTTTTATATGATTTCTGGTGAAACCAAAGAAACTATTG-GTG 2788
Query 3445 A-GGGCAGAATTGTCCAGGCCAGTGTTCGGAGA-T-TGCAGAATGG-AAGAGCCATATGT 3500
| ||| |||||||| ||||||| |||| || | | | || | ||| || ||||| ||||
Sbjct 2789 AAGGG-AGAATTGTGCAGGCCACTGTTAAGAAAGTAT-CA-AGTGGTAA-AGCCAAATGT 2844
Query 3501 GTATTAGATTCTGGGTTAACTGGGATGCT-TATGAAGGAAGATTTCTCAGATGATGGGAG 3559
|||||||||| ||| ||| ||||||| || | | |||||||||| ||| |||||||| ||
Sbjct 2845 GTATTAGATTGTGGATTACCTGGGATTCTCT-TAAAGGAAGATTACTCGGATGATGGTAG 2903
Query 3560 AGATATTGTTGACTTGGCGGACCAGCTGAAAGAAGGCGATATCCTCACATGCAAGATCAA 3619
|||||| ||||| || | || | ||| |||||| ||||| |||| |||||||||||
Sbjct 2904 AGATATCGTTGATTTATCAAACAAACTGTGTGAAGGCTATATCGTCACTTGCAAGATCAA 2963
Query 3620 ATCGATTCAAAAGCAGAGGTATCAAGTGTTCCTTATTTGCAAAGAAAGTGAAATGAGAAA 3679
||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2964 ATCAATTCTAAAGCAAAGGTATCATGTGTTACTTGTCTGCAAAGAAAGCGAAATGAGAAA 3023
Query 3680 CAACAGACACCAGCATAACCAGAATGTGGATGCAT-ATTACCATGAGGAT-A--GAAACA 3735
||||| | | | | || | |||| |||| || ||||||| ||||| | |||| |
Sbjct 3024 GAACAGG-A--ATC-T--CCGGGATGTCGATG-ATTATTACCACGAGGAGGAACGAAAAA 3076
Query 3736 GTCTCCAGCTTGTA-AAAGAGAAGGCTCG-AAAGGAAAAAGAGCTGGTGAGGAAGCATTT 3793
| ||| | | | | |||||||| || | |||| | || || ||||| ||
Sbjct 3077 ATGTCCTGATAG-AGAAAGAGAAAGCCCCTAAAG-A----GA-------AG-AAGCAGTT 3122
Query 3794 TAAGTCTCGGATGATTGTCCATCCCCGCTTTCAGAATATCACAGCTGACCAAGCAACAGA 3853
|||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 3123 TAAGTCTCGGATGATTGTTCATCCTCGGTTTCAGAACATCACTGCTGAGCAAGCAACAGG 3182
Query 3854 GTATTTGTCTGACAAAGACT-TTGGAGAAAGCATTGTTCGTCCAAGTTCTCGAGGACTCA 3912
|||||||||| | || || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |
Sbjct 3183 GTATTTGTCTTATAA-GAATATTGGAGAAAGCATTGTTCGTCCAAGCTCACGAGGACTGA 3241
Query 3913 A-CTTTTTAACTTTGACCCTCAAGATTTAT-GATGGA-GTTTACGCTCACAAGGAGATAG 3969
| | | | | |||||| ||||||||| | ||| | || || ||| |||||||||||
Sbjct 3242 ATCATCTGA-CTTTGATGATCAAGATTT-TCGATA-ATGTGTATGCTAACAAGGAGATAA 3298
Query 3970 -CTGAAGGTGGGAAAGAAAACAAGGACATTACA-AGCCTACAGTGTATTGGGAAGACCCT 4027
| ||||||| ||| || ||||||||||| | ||| |||| |||||||||| || |
Sbjct 3299 TC-GAAGGTGAGAAGGAGAACAAGGACAT-AGTGAGCTTACAACGTATTGGGAAAACATT 3356
Query 4028 GACAATTGGAGAG-GACACCTTCGAGGATCTAGATGAGGTCATGGATCGATATGTTGATC 4086
|| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 3357 GAAAATTGG-GAATGAAACCTTCGAGGATCTAGATGAGGTAATGGATCGGTATGTTGATC 3415
Query 4087 CTTTGGTATCTCATCTTAAGACAATGCTCAACTATCGGAAATTCCGTAAGGGGACCAAA- 4145
|||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| || | ||||| |||
Sbjct 3416 CTTTGGTAACTCATCTTATGACAATGCTAAACTACCGCAAATTTCGGACTGGGAC-AAAG 3474
Query 4146 TCAGAAGTAGATGATCTTCTTAGGATCGAGAAGGGCGAAAATCCTTCAA-GAATAGTTTA 4204
|| ||| |||||||||||||| || | |||||||||| |||||| || | |||||||
Sbjct 3475 TCGGAAATAGATGATCTTCTTCGGGTTGAGAAGGGCGTAAATCCGAAAATGG-TAGTTTA 3533
Query 4205 TTGTTTTGG-GATTTCACACGAACATCCAGGCA-CTTT-TATTCTGTCTTACATAAGGAG 4261
||||||| | |||| || ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | |
Sbjct 3534 CAGTTTTGGTG-TTTCGCATGAACATCCAGGGAGCTTTATATT--GTCTTACATACG-AT 3589
Query 4262 CA-CAAACCCACATCATGAGTATATAGGTTTATATCCCAA-GGGATTTAAGTTCAGGAAA 4319
| ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||
Sbjct 3590 CCGCAAACCCGCACCATGAGTATATCGGTTTATA-CCCAAAGGGATTCAAGTTCAGGAAA 3648
Query 4320 AGGATGTTTG-AGGA-CATTGATCGGCTTG-TGGCATACTTCCAGAGGCATATTGATGA 4375
|| ||||||| || | | ||||| ||||| || | || ||| |||| ||| |||||||
Sbjct 3649 AGAATGTTTGGAG-ATC-TTGATAAGCTTGCTG-CTTATTTCAAGAGACATGTTGATGA 3704
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 203037151955
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5