BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT1G65440.1 Length=5362 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg925610 jgi|Araly1|925610|scaffold_201171.1 7797 0.0 Ahg907098 jgi|Araly1|907098|Al_scaffold_0002_179 2566 0.0 > Ahg925610 jgi|Araly1|925610|scaffold_201171.1 Length=4961 Score = 7797 bits (4222), Expect = 0.0 Identities = 4514/4657 (97%), Gaps = 11/4657 (0%) Strand=Plus/Plus Query 120 TTCTAATTTGTTGAGATAAACATGGCGAGGAACGCAATCTCTGACGATGAAGAGGATCAT 179 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 TTCTAATTGGTTGAGATAAACATGGCGAGGAACGCAATCTCTGACGATGAAGAGGATCAT 60 Query 180 GAGCTTGAGGATGACGACGGAGAGCCAGTTCATGGAGATCCAGCtgagcatgatgaaaac 239 ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| Sbjct 61 GAGCTAGAGGATGATGACGGAGAGCCAGTTCATGGAAATCCAGTTGAGCACGATGACAAC 120 Query 240 gatgatgaagaagatgatgatgacgttgggaatgagtatgagaatgatgGGTTCATAGTG 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 GATGATGAAGAAGATGATGATGACGTTGGGAATGAGTATGAGAATGATGGGTTCATAGTG 180 Query 300 AATGATgaagacgaagaggaagaagaggaagaagacgaagaaaggaaagatagcgatgag 359 ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 181 AATGATGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGAAGAGGACGAAGAAAGGAAAAATAGCGATGAG 240 Query 360 gagaggcagaaaaagaagaagaaacgaaagaaaaaggACGAAGGTCTTGATGAAGATGAT 419 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 241 GAGAGGCAGAAAAAGAAGAAGAAACGAAGGAAAAAGGACGAAGATCTTGATGAAGATGAT 300 Query 420 TATTTGCTTCTACAAGATAACAACGTCAAATTCAAAAAGAGGCAGTATAAGCGGTTGAAG 479 ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 301 TATCTGCTTCTCCAAGATAACAACGTCAAATTCGAAAAGAGGAAGTATAAGCGGTTGAAG 360 Query 480 AAAGCTCAAAGGGAACAGGGA-AATGG-CCAGGGAGAATCATCCGATGATGAGTTTGATA 537 ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 AAAGCTCAAAGGGAA-AGGGACAATGGTCC-GGGGGAATCATCCGATGATGAGTTTGATG 418 Query 538 GTAGAGGTGGAACTAGGAGAAGTGCTGAGGATAAGATCAAAGACAGGCTGTTtgatgatg 597 | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 419 GGAGAGGTGGAGCTAAAAGAAGTGCTGAGGATAAGATCAAAGACAGGCTTTTTGATGATG 478 Query 598 ttgatgttgatgatccacctgatgatgtaggtgatgaGGAAGACTTAGTTGTGGAAGAAG 657 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 479 TTGATGTTGATGATCCACCTGATGATGTAGGTGATGAGGAAGACTTAGTTGTGGAAGAAG 538 Query 658 ATGTAGTTGGGAGCGAGGATGAAATGGCAGATTTTATTGTAGATGAAGATGATGAGCATG 717 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct 539 ATGTAGTTGGGAGCGAGGACGAAATGGCAGATTTTATTGTAGATGAAGATGATGGGCTTG 598 Query 718 GTCCTCCTAAGAGGGGCAACTCGAAGAAAAAGAAATATAGGCAGGGATCAGATATTACTG 777 || ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || Sbjct 599 GTGCTCCTAAGAGGGGGAACTCGAAAAAAAAGAAATTTAGGCAGGGATCAGATATTAATG 658 Query 778 CTATGCGAGATGCTAATGAAATATTTGGTGATGTTGACGAATTATTAACAATTCGCAAAA 837 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 659 CTATGCGAGACGCTAATGAAATATTTGGTGATGTTGACGAATTATTGACAATTCGCAAAA 718 Query 838 AGGGTTTGGCATCTAATCAAAGGATGGAAAGAAGGCTCGAAGATGAGTTTGAACCAACTG 897 ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 719 AGGGTTTGGCATCTAGTGAAAGGATGGAAAGAAGGCTCGAAGATGAGTTTGAACCAACTG 778 Query 898 TTCTTTCTGAGAAATATATGACAGGGAATGATGATGAAATCCGCCAGCTTGATATTCCTG 957 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 779 TTCTTTCTGAGAAATATATGACAGGGAAAGATGATGAAATTCGCCAGCTTGATATTCCTG 838 Query 958 AGAGAATGCAGATATCTGAAGAAAGCACCGGAAGCCCTCCTGTAGATGAAATTAGCATTG 1017 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 839 AGAGAATGCAGATATCTGAAGAAAGCACCGGAAGCCCTCCTGTAGATGAAATTAGCATTG 898 Query 1018 AAGAAGAAAGCAATTGGATATATGCTCAACTTGCTTCCCAACTTAGAGAATCTGATGGAA 1077 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| Sbjct 899 AAGAAGAAAGCAATTGGATATATGCTCAACTTGCTTCTCTACTTAAAGAATCTGATGGAA 958 Query 1078 CTTTTGATGGGCGGGGTTTCTCGGTTAATAAGGATGACATCGCAAAATTTTTGGAGCTAC 1137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 959 CTTTTGATGGGCGGGGTTTCTCGGTTAATAAGGATGACATCGCAAAATTTTTGGAGCTAC 1018 Query 1138 ATCATGTGCAGAAATTAGAGATACCGTTTATAGCTATGTACCGAAAGGAGCAATGCCGGA 1197 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1019 ATCATGTGCAGAAATTAGAGATACCCTTTATAGCTATGTACCGAAAGGAGCAATGCCGGA 1078 Query 1198 GCTTGTTGGACACTGGTGATTTTGATGGCGCCAATCAAGGCAAGAAACCTGAGACCAAGT 1257 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1079 GCTTGTTGGACACTGGTGATGTTGATGGCGCCAATCAAGACAAGAAACCTGAGACCAAGT 1138 Query 1258 GGCATAAGGTCTTCTGGATGATTCATGACTTGGATAAGAAGTGGCTCCTTCTTCGAAAAA 1317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1139 GGCATAAGGTCTTCTGGATGATTCATGACTTGGATAAGAAGTGGCTCCTTCTTCGAAAAA 1198 Query 1318 GGAAAATGGCGTTGCATGGTTACTATACAAAACGTTACGAAGAAGAGTCTAGGAGGGTCT 1377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1199 GGAAAATGGCGTTGCATGGTTACTATACAAAACGTTACGAAGAAGAGTCTAGGAGGGTCT 1258 Query 1378 ATGATGAAACAAGACTTAATCTAAATCAGTATCTTTTTGAATCAGTCATTAAGTCTCTTA 1437 |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1259 ATGATGAAACTAGACTTAATCTAAACCAGTATCTTTTTGAATCAGTCATTAAGTCCCTTA 1318 Query 1438 AAGTTGCAGAAACAGAAAGAGAAGTTGATGATGTAGATTCCAAGTTCAACTTGCATTTTC 1497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1319 AAGTTGCAGAAACAGAAAGAGAAGTTGATGATGTAGATTCCAAGTTCAACTTGCATTTCC 1378 Query 1498 CTCCCGGTGAAATTGGTGTTGATGAAGGGCAGTATAAGAGGCCGAAAAGGAAATCACAAT 1557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1379 CTCCCGGTGAAATTGGTGTTGATGAAGGGCAGTATAAGAGGCCGAAAAGGAAATCACAAT 1438 Query 1558 ATAGCATCTGCAGTAAAGCAGGGCTCTGGGAGGTTGCAAACAAATTTGGGTATAGTGCTG 1617 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1439 ATAGCATCTGCAGTAAAGCGGGGCTCTGGGAGGTTGCAAACAAATTTGGGTATAGTGCTG 1498 Query 1618 AGCAACTGGGACTTGCATTGTCCCTAGAAAAACTGGTTGATGAGCTTGAGGATGCAAAGG 1677 ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct 1499 AGCAATTGGGACTTGCATTGTCCTTAGAAAAACTGGTTGATGAACTTGAGGACGCAAAGG 1558 Query 1678 AAACACCAGAGGAGATGGCTAAAAACTTTGTGTGCGCAATGTTTGAAAATTCTCTGGCAG 1737 |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | Sbjct 1559 AAACACCAGAGGAGATGGCTCAGAACTTTGTGTGCGCAATGTTTGAAAATCCTCAGGCCG 1618 Query 1738 TTCTGAAAGGTGCACGGCATATGGCTGCAGTTGAGATAAGTTGCGAGCCATCAGTCAAAA 1797 ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1619 TTCTGAAGGGTGCACGGCATATGGCTGCAATTGAGATAAGTTGTGAGCCATCAGTCAAAA 1678 Query 1798 AGTATGTCCGTGGCATTTATATGGAGAATGCAGTGGTCTCAACAAGTCCAACAGCAGATG 1857 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1679 AGTATGTCCGTGGCATTTATATGGAGAATGCAGTGGTCTCAACAAGTCCAACAGCAGATG 1738 Query 1858 GAAATACAGTAATTGATTCGTTCCATCAGTTTTCTGGGATTAAGTGGTTGCGTGAAAAGC 1917 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct 1739 GAAATACAGTAATAGATTCGTTCCATCAGTTTTCTGGCATTAAGTGGTTACGTGAAAAGC 1798 Query 1918 CATTGAGCAAGTTTGAGGGTGCACAATGGCTTCTCATTCAGAAGGGAGAAGAGGAGAAAC 1977 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1799 CATTGAGCAAGTTTGAGGGTGCACAATGGCTTCTCATTCAGAAGGCAGAAGAGGAGAAAC 1858 Query 1978 TTCTTCAAGTAACCTTCAAGCTGCCTGAGAATTACATGAATAGGCTAATTAGCGACTGCA 2037 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1859 TTCTTCAAGTAACCTTCAAGCTGCCTGAGAATTACATGAATAGGCTAATTAGTGACTGCA 1918 Query 2038 ATGAACACTATCTAAGTGTTGGTGTTAGTAAGTATGCTCAACTCTGGAATGAGCAAAGAA 2097 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1919 ATGAACACTATCTAAGTGTTGGTGTTAGTAAGTATGCTCAACTCTGGAATGAGCAAAGAA 1978 Query 2098 AGTTGATATTGGAGGATGCACTTCATGCTTTTCTTTTGCCATCAATGGAGAAAGAAGCAA 2157 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1979 AGTTGATAGTGGAGGATGCACTTCATGCTTTTCTTTTGCCATCAATGGAGAAAGAAGCAA 2038 Query 2158 GATCCTTGCTAACTAGCAGAGCGAAGAGTCGGTTGCTTTCAGAGTATGGACAGGCTTTGT 2217 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2039 GATCCTTGCTAACTAGCAGAGCGAAGAGTCGGTTGCTTTCAGAGTATGGACAGGCTTTGT 2098 Query 2218 GGAACAAGGTGTCTGCAGGGCCATACCAAAAGAAAGAAATGGACATTAATTTAGATGAGG 2277 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| Sbjct 2099 GGAACAAGGTGTCTGCAGGGCCATATCAAAAGAAAGAAATGGACATGAATTCAGATGAGG 2158 Query 2278 AAGCTGCACCGAGGGTCATGGCATGTTGTTGGGGACCTGGGAAGCCACCAAATACATTTG 2337 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2159 AAGCTGCACCGAGGGTCATGGCATGTTGTTGGGGACCTGGAAAGCCACCAAATACATTTG 2218 Query 2338 TGATGCTGGACTCATCAGGTGAGGTGCTTGACGTGCTTTATGCTGGATCCCTTACATCGC 2397 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2219 TGATGCTGGACTCATCAGGCGAGGTGCTTGACGTGCTTTATGCTGGATCCCTCACATCGC 2278 Query 2398 GATCTCAAAATGTTAACGACCAGCAACGTAAAAAGAGTGACCAGGATCGTGTTTTAAAGT 2457 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2279 GATCTCAAAATGTCAACGACCAGCAACGTAAAAAGAGTGACCAGGATCGTGTTTTAAAGT 2338 Query 2458 TTATGATGGACCACCAACCGCATGTTGTGGCTTTAGGAGCTGTCAATTTGTCTTGTACTC 2517 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2339 TTATGATGGACCACCAACCGCATGTTGTGGCTTTAGGAGCTGTCAATTTGTCTTGTACTC 2398 Query 2518 GTCTGAAGGATGATATTTATGAGGTCATATTCCAGATGGTGGAGGAAAAACCTAGAGATG 2577 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2399 GTCTGAAGGATGATATTTATGAGGTCATATTCCAGATGGTGGAGGAAAAACCTAGAGATG 2458 Query 2578 TCGGACATGGGATGGATGATTTAAGCATTGTTTATGTGGATGAATCACTTCCTAGGCTAT 2637 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2459 TCGGACATGGGATGGATGATTTAAGCATTGTTTATGTGGATGAATCGCTTCCTAGGCTAT 2518 Query 2638 ATGAAAATTCTCGAATCTCGGGTGAACAGCTACCTCAGCAGTCAGGGAACGTGAGACGTG 2697 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 2519 ATGAAAATTCTCGAATCTCGGGTGAACAGCTACCTCAGCAGTCAGGGATCGTGAAACGTG 2578 Query 2698 CAGTTGCTCTTGGACGCTATCTCCAGAATCCACTAGCAATGGTGGCAACTTTATGCGGTC 2757 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2579 CAGTTGCTCTTGGACGCTATCTCCAGAATCCACTAGCGATGGTGGCAACTTTATGCGGTC 2638 Query 2758 CAGGTCGGGAAATTTTGTCTTGGAAGCTTCATCCCTTGGAGAATTTTCTTCAGCTAGATG 2817 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2639 CAGGTCGGGAAATTTTGTCTTGGAAGCTTCATCCGTTGGAGAATTTTCTTCAGCTAGACG 2698 Query 2818 AGAAGTATGGAATGGTTGAGCAGGTTATGGTTGACATTACAAACCAGGTTGGAATCGATA 2877 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2699 AGAAGTATGGAATGGTTGAGCAGGTTATGGTTGACATTACAAACCAGGTTGGAATCGATA 2758 Query 2878 TTAACTTGGCAGCTAGCCATGATTGGTTCTTTTCTCCTTTACAGTTCATTTCTGGACTTG 2937 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2759 TTAACTTGGCAGCTAGCCATGAGTGGTTCTTTTCTCCTTTACAGTTCATATCTGGACTTG 2818 Query 2938 GGCCTCGGAAAGCTGCATCCTTGCAGAGGTCGCTTGTAAGAGCTGGTTCAATCTTTGTCC 2997 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2819 GGCCTCGGAAAGCTGCATCCTTGCAGAGGTCGCTTGTAAGAGCTGGTTCAATATTTGTCC 2878 Query 2998 GCAAGGACCTGATAATGCATGGACTTGGTAAAAAGGTTTTTGTAAATGCTGCCGGTTTCT 3057 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2879 GCAAGGACCTAATAATGCATGGACTTGGTAAAAAGGTTTTTGTAAATGCAGCCGGTTTCT 2938 Query 3058 TGCGCATCCGCAGAAGTGGGCTGGCTGCTAGTAGCAGTCAATTTATTGACTTATTGGATG 3117 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2939 TGCGCATCCGCAGAAGTGGGCTGGCTGCTAGTAGCAGTCAATTTATCGACTTATTGGATG 2998 Query 3118 ACACCAGAATCCATCCAGAGTCGTATAGTCTTGCTCAAGAATTGGCGAAAGATATATATG 3177 |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2999 ACACCAGAATCCATCCCGAGTCATATAGTCTTGCGCAAGAATTGGCGAAAGATATATATG 3058 Query 3178 ATGAGGATGTCAGAGGTGATTCAAATGATGATGAGGATGCGATAGAAATGGCTATTGAGC 3237 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 3059 ATGAGGATGTCAGAGGTGATTCAAATGATGATGAGGATGCAATAGAAATGGCTATTGAGC 3118 Query 3238 ATGTGAGAGATCGGCCAGCTTCTTTGAGAAAAGTTGTCCTTGATGAATATCTTGCCAGCA 3297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3119 ATGTGAGAGATCGGCCAGCTTCTTTGAGAAAAGTTGTCCTTGATGAATATCTTGCCAGCA 3178 Query 3298 AGAAACGGGAGAATAAGAAGGAAACTTATAGCAATATCATAAGAGAATTAAGTTGTGGTT 3357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 3179 AGAAACGGGAGAATAAGAAGGAAACTTATAGCAATATCATAAGAGAATTAAGCTGTGGTT 3238 Query 3358 TCCAGGATTGGCGGATACCATTTAAAGAGCCAAGTCCAGATGAAGAATTTTACATGATTT 3417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3239 TCCAGGATTGGCGGATACCATTTAAAGAGCCAAGTCCAGATGAAGAATTTTACATGATTT 3298 Query 3418 CAGGTGAAACTGAGGACACCATAGCGGAGGGCAGAATTGTCCAGGCCAGTGTTCGGAGAT 3477 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3299 CAGGTGAAACTGAGGACACCATAGCTGAGGGCAGAATTGTCCAGGCCAGTGTTCGGAGAT 3358 Query 3478 TGCAGAATGGAAGAGCCATATGTGTATTAGATTCTGGGTTAACTGGGATGCTTATGAAGG 3537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3359 TGCAGAATGGAAGAGCCATATGTGTATTAGATTCTGGGTTAACTGGGATGCTTATGAAGG 3418 Query 3538 AAGATTTCTCAGATGATGGGAGAGATATTGTTGACTTGGCGGACCAGCTGAAAGAAGGCG 3597 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3419 AAGATTTCTCAGATGATGGGAGAGATATTGTTGACTTGGCGGACCAACTGAAAGAAGGCG 3478 Query 3598 ATATCCTCACATGCAAGATCAAATCGATTCAAAAGCAGAGGTATCAAGTGTTCCTTATTT 3657 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3479 ATATCCTAACATGCAAGATCAAATCGATTCAAAAGCAGAGGTATCAAGTGTTCCTTATTT 3538 Query 3658 GCAAAGAAAGTGAAATGAGAAACAACAGACACCAGCATAACCAGAATGTGGATGCATATT 3717 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3539 GCAAAGAAAGTGAAATGAGAAACAACAGACACCAGCATAACCAGAATGTGGATGCTTATT 3598 Query 3718 ACCATGAGGATAGAAACAGTCTCCAGCTTGTAAAAGAGAAGGCTCGAAAGGAAAAAGAGC 3777 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 3599 ACCATGAGGATAGAAACAGTCTCCAGCTTGTAAAAGAGAAAGCTCGAAAGGAAAAAGAGC 3658 Query 3778 TGGTGAGGAAGCATTTTAAGTCTCGGATGATTGTCCATCCCCGCTTTCAGAATATCACAG 3837 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3659 TGGTGAGGAAGCATTTTAAGTCTCGGATGATTGTCCATCCCCGCTTTCAGAATATCACAG 3718 Query 3838 CTGACCAAGCAACAGAGTATTTGTCTGACAAAGACTTTGGAGAAAGCATTGTTCGTCCAA 3897 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3719 CTGACCAAGCAACAGAGTATTTGTCTGACAAAGACTTTGGAGAAAGCATTGTTCGTCCAA 3778 Query 3898 GTTCTCGAGGACTCAACTTTTTAACTTTGACCCTCAAGATTTATGATGGAGTTTACGCTC 3957 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3779 GTTCTCGAGGACTCAACTTTTTAACTTTGACGCTCAAGATTTATGATGGAGTTTACGCTC 3838 Query 3958 ACAAGGAGATAGCTGAAGGTGGGAAAGAAAACAAGGACATTACAAGCCTACAGTGTATTG 4017 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 3839 ACAAGGAGATAGCTGAAGGTGGGAAAGAAAACAAGGACATCACAAGCCTACAGTGTATTG 3898 Query 4018 GGAAGACCCTGACAATTGGAGAGGACACCTTCGAGGATCTAGATGAGGTCATGGATCGAT 4077 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3899 GGAAGACCCTGACAATTGGAGAGGACACCTTCGAGGATCTAGATGAGGTCATGGATCGAT 3958 Query 4078 ATGTTGATCCTTTGGTATCTCATCTTAAGACAATGCTCAACTATCGGAAATTCCGTAAGG 4137 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3959 ATGTTGATCCTTTGGTATCTCATCTTAAGACCATGCTCAACTATCGGAAATTCCGAAAGG 4018 Query 4138 GGACCAAATCAGAAGTAGATGATCTTCTTAGGATCGAGAAGGGCGAAAATCCTTCAAGAA 4197 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 4019 GGTCCAAATCAGAAGTAGATGATCTTCTTAGGATCGAGAAGGGAGAAAATCCTTCAAGAA 4078 Query 4198 TAGTTTATTGTTTTGGGATTTCACACGAACATCCAGGCACTTTTATTCTGTCTTACATAA 4257 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4079 TAGTTTACTGTTTTGGGATTTCACATGAACATCCAGGCACTTTTATTCTGTCTTACATAA 4138 Query 4258 GGAGCACAAACCCACATCATGAGTATATAGGTTTATATCCCAAGGGATTTAAGTTCAGGA 4317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4139 GGAGCACAAACCCACATCATGAGTATATAGGTTTATATCCCAAGGGATTTAAGTTCAGGA 4198 Query 4318 AAAGGATGTTTGAGGACATTGATCGGCTTGTGGCATACTTCCAGAGGCATATTGATGACC 4377 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4199 AAAGGATGTTTGAGGACATTGATAGGCTTGTGGCATACTTCCAGAGGCATATTGATGACC 4258 Query 4378 CATTGCAAGAATCGGCGCCATCAATCAGGTCTATTGCTGCCAAGGTACCGATGAGAAGCC 4437 ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4259 CATTGCAAGAATCGGTGCCATCGCTCAGGTCTATTGCTGCCAAGGTACCGATGAGAAGCC 4318 Query 4438 CAGCAGACCATGGATCATCTGGAGGAAGTGGTTGGGGTAGTTCTCAGAGTGAAGGAGGCT 4497 ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | Sbjct 4319 CAGCAGACCATGGCTCGTCTGGAGGAAGTGATTGGGGTAGTTCTCAGAATGAAGGAGGGT 4378 Query 4498 GGAAAGGTAA-CTC-GGATCGTTCAGGCTCAG-GGAGAGGCGGTGAGTACAGAAATGGTG 4554 ||||||| | ||| || | | || ||| |||| || |||||||| |||||||||| Sbjct 4379 GGAAAGG-AGGCTCAGG-TAATGCATT-TCAAAGGAGGGGTGGTGAGTATAGAAATGGTG 4435 Query 4555 GTGGACGTGATGGACATCCAAGTGGAGCGCCTAGGCCATATGGTGGCCGTGGACGTGGTC 4614 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4436 GTGGACGTGATGGACATCCAAGTGGAGCGCCTAGGCCATATGGTGGCCGTGGACGTGGTC 4495 Query 4615 GAGGCAGAGGACGGAGGGATGATATGAATAGTGATAGACAAGATGGTAACGGAGATTGGG 4674 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 4496 GAGGCAGAGGACGGAGGGATGATATGAATAGTGATAGACAAGATGGTAATGGAGATTGGG 4555 Query 4675 GTAATAATGATACTGGAACTGCAGATGGAGGTTGGGGAAATAGTGGTGGCGGTGGTTGGG 4734 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| Sbjct 4556 GTAATAATGATACTGGAACTGGTGATGGAGGTTGGGGAAGTAGTGGTGTCGGCGCTTGGG 4615 Query 4735 GAAGCGAGTCTGCTGGTAAAAAGACTGGTGGTGGCAG 4771 |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct 4616 GAAGCGAGTCTGCTGGTAAAAAGAGTGGTGGTG-CAG 4651 > Ahg907098 jgi|Araly1|907098|Al_scaffold_0002_179 Length=3720 Score = 2566 bits (1389), Expect = 0.0 Identities = 2937/3659 (80%), Gaps = 207/3659 (6%) Strand=Plus/Plus Query 789 GCTAATGAAATATTTGGTGATGTTGACGAATTATT-AACAATTCGCAAAAAGGGTTTGGC 847 |||||||| |||||||||||| ||| ||||| || || | |||| | ||||| ||| || Sbjct 181 GCTAATGATATATTTGGTGATCCTGAAGAATTGTTGAA-ACTTCGGAGAAAGGATTTAGC 239 Query 848 ATCTAATC-AAAGGATGGAAAGAAGGCTCGAAGATGAGTTTGAACCAACTGTTCTTTCTG 906 | ||| | ||| ||| ||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||| |||| Sbjct 240 GTATAA-CGAAAAGATCGAAAGAAAGTTAGAAGATGAGTTTGAACCAATTGTTCTCTCTG 298 Query 907 AGAAATATATGACAGGGAATGATGATGAAATCCGCCAGCTTGATATTCCTGAGAGAATGC 966 |||| ||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| Sbjct 299 AGAAGTATATGACACAGAAAGATGATGAAATTAGGAAGCTTGATGTTCCTGAGAGAATGC 358 Query 967 AGATA-TCTGAAGAAAG-CACCGGAAGCCCTCCTGTAGATGAAATTAGCATTGAAGAAGA 1024 ||||| || |||| ||| ||| |||| | |||| || ||||| ||||||||||||||||| Sbjct 359 AGATATTC-GAAG-AAGTCACTGGAAACGCTCCCGTCGATGATATTAGCATTGAAGAAGA 416 Query 1025 AAGCAATTGGATATATGCTCAACTTGCTTCCCAACTTAGAGAATCTGATGGAACTTTTGA 1084 ||||| ||||| ||||||| | ||| || | | |||| | || | | Sbjct 417 GAGCAACTGGATTTATGCTCGA-TTGGTT-----C--A-AGAA-C--AT-G-------G- 455 Query 1085 TGGGCGGGGTTTCTCGGTTAATAAGGATGACATCGCAAAATTTTTGGAGCT-ACATCATG 1143 | | |||| | |||||| || |||||||| | | |||||||||| | | ||||| Sbjct 456 T---CCAAGTTTTTTGGTTAACAAAGATGACATTGTGAGATTTTTGGAGATGTC-TCATG 511 Query 1144 TGCAGAAATTAGAGATACCGTTTATAGCTATGTACCGAAAGGAGCAATGCCGGAGCTTGT 1203 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| Sbjct 512 TGCAGAAGTTAGAGATACCGTTTATAGCTATGTACCGGAAGGAGCAGTGTCGGAGTTTGT 571 Query 1204 TGGACA---CTGGTGAT-TTTG-A-TGGCGCCAATCAAGGCAAGAAACCTGAGACCAAGT 1257 |||||| ||| |||| | | | || ||||| |||||| | ||||||||||| Sbjct 572 TGGACAGTTCTGATGATGATGGTAGTGATTTCAATCTTCTCAAGAAGCTTGAGACCAAGT 631 Query 1258 GGCATAAGGTCTTCTGGATGATTCATGACTTGGATAAG-AAGTGGCTCCTTCTTCGAAAA 1316 || |||| ||||||||||||||||| || |||||| || |||||||| |||||||| ||| Sbjct 632 GGAATAAAGTCTTCTGGATGATTCAAGATTTGGAT-AGAAAGTGGCTTCTTCTTCGGAAA 690 Query 1317 AGGAAAATGGCGTTGCATGGTTACTATACAAAACGTTACGAAGAAG-AGTCTAGGAGGGT 1375 ||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| | || | | ||| Sbjct 691 AGGAAAACCGCGTTGTTTGGTTACTTTACCAAACGTTTTGAAGAAGAAACCT-GCA-GGT 748 Query 1376 CTATGATGAAACAAGACTTAATCTAAATCAGTATCTTTTTGAATCAGTCATTAAGTCTCT 1435 | |||| || || | || || |||||||||||| || || |||||||| Sbjct 749 C--TGAT---------CTGAA--T-AA-GAG--TCTTTTTGAATCGGTTATGAAGTCTCT 791 Query 1436 TAAAGTTGCAGAAACAGAAAGAGAAGTTGATGATGTAGATTCCAAGTTCAACTTGCATTT 1495 ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| Sbjct 792 TAAAGCGGCGGAGACAGAGAGAGAAGTTGATGATGTAGACTCAAAGTTCAACTTGCATTT 851 Query 1496 TCCTCCCGGTGAAATTGGTGTTGATGAAGGGCAGTATAAGAGGCCGAAAAGGAAATCACA 1555 ||||| ||| | | | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct 852 TCCTCATTGTG--A---G-ATCGATGAAGGACAGTATAAGAGGCCGAATAGGAAATCGCA 905 Query 1556 ATATAGCATCTGCAGTAAAGCAGGGCTCTGGGAGGTTGCAAACAAATTTGGGTATAGTGC 1615 ||||||||||| || ||| || || |||| |||||||||| ||||| ||||| || Sbjct 906 TTATAGCATCTGTAGCAAATTTGGAATCCGGGAATTTGCAAACAAGTTTGGTTATAGCGC 965 Query 1616 TGAGCAACTGGGACTTGCATTGTC-CCT-AGAAA-AACTGGTTGATGAGCTTGAGGATGC 1672 ||||||| ||||| |||| ||||| | | ||||| | |||||||||||||| ||||| Sbjct 966 TGAGCAATTGGGATTTGCGTTGTCTCTTGAGAAAGTTTTTGTTGATGAGCTTGAAGATGC 1025 Query 1673 AAAGGAAACACCAGAGGAGATGGCTA-AAAACTTTGTGTGCGCAATGTTTGAAAATTCTC 1731 |||| ||||||||||||||||||| | ||| | || |||||||||||| || ||| Sbjct 1026 AAAGAAAACACCAGAGGAGATGGC-ATTGTACTATAAATGTGCAATGTTTGAAGATCCTC 1084 Query 1732 TGGCAGTTCTGAAAGGTGCACGGCATATGGCTGCAGTTGAGATAAGTTGCGAGCCA-TCA 1790 | ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | | Sbjct 1085 AAGTTGTTCTTAAAGGCGCACGGCATGTGGCTGCGGTTGAGATAAGCTGCGAGCCATTGA 1144 Query 1791 GTCAAAAAGTATGTCCGTGGCATTTATATGGAGAATGCAGTGGTCTCAACAAGTCCAACA 1850 | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct 1145 -TTAAAAAGTATGTTCGCGGGATTTATATGGAGAATGCAGTAGTCTCAACGAGTCCAACA 1203 Query 1851 GCAGATGGAAATACAGTAATTGATTCGTTCCATCAGTTTTCTG-GGATTAAGTGGTTGCG 1909 ||||||| || || || ||||| ||||||| |||||||| || |||||||||| || Sbjct 1204 CCAGATGGGGATGTGGTTATAGATTCTTTCCATCGGTTTTCTGCGG-TTAAGTGGTTACG 1262 Query 1910 TGAAAAGCCATTGAGCAAGTTTGAGGGTGCACAATGGCTTCTCATTCAGAAGGGAGAAGA 1969 |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| | |||||| Sbjct 1263 CGAAAAGCCATTGAGAAAGTTTGAAGGTACACAATGGCTTCTTATTCAGAAAGCAGAAGA 1322 Query 1970 GGAGAAACTTCTTCAAGTAACCTTCAAGCTGCCTGAGAATTACATGAATAGGCTAATTAG 2029 ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| Sbjct 1323 AGAGAAGCTTCTTCAAGTAACTTTCAAGCTGCCTGAGAATCAGATGAATAGGATAATTAG 1382 Query 2030 CGACTGCAATGAACACTATCTAAGTGTTGGTGTTAGTAAGTATGCTCAACTCTGGAATGA 2089 || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1383 TGAATGCAGTGAACACTATCTAAGTGTTGGTGTTAGTAAGTATGCTCAACTCTGGAATGA 1442 Query 2090 GCAAAG-AAAGTTGATATTGGAGGATGCACTTCATGCTTTTCTTTTGCCATCAATGGAGA 2148 ||| || ||| |||||| ||||||| || |||| | |||||||||||| |||||||||| Sbjct 1443 GCAGAGGAAA-TTGATACTGGAGGACGCGGTTCACGGTTTTCTTTTGCCGTCAATGGAGA 1501 Query 2149 AAGAAGCAAGATCCTTGCTAACTAGCAGAGCGAAGAGTCGGTTGCTTTCAGAGTATGGAC 2208 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1502 AAGAAGCAAGATCCTTGCTAACTAGCAGAGCGAAGACTCGGTTGCTTTCAGAGTATGGAC 1561 Query 2209 AGGCTTTGTGGAACAAGGTGTCTGCAGGGCCATACCAAAAGAA-AGA-AATGGACATTAA 2266 ||| ||| ||||| || |||||| |||||||||| | || ||| | | ||| | || | Sbjct 1562 AGGTTTTATGGAAAAAAGTGTCTTCAGGGCCATATCGAAGGAATA-ATAAT--A-AT-AC 1616 Query 2267 TTTAGATGAGGAAGCTGCACCGAGGGTCATGGCATGTTGTTGGGGACCTGGGAAGCCACC 2326 | |||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| || ||| Sbjct 1617 CTCGGATGAGGAAGCTGCGCCGAGGGTCCTAGCTTGTTGTTGGGGACCTGGAAATCCAG- 1675 Query 2327 AAA-TACATTTGTGATGCTGGACTCATCAGGTGAGGTGCTTGACGTGCTTTATGCTGGAT 2385 ||| ||||||||||||||| || ||||| || ||| || |||| |||||||| || |||| Sbjct 1676 AAACTACATTTGTGATGCTTGATTCATCGGGAGAGTTGGTTGATGTGCTTTACGCAGGAT 1735 Query 2386 CCCTTACATCGCGATCTCAAAATGTTAACGACCAGCAACGTAAAAAGA-GTGACCAGGAT 2444 || || ||||||| |||| |||| || |||||| |||||||||||| | || || ||| Sbjct 1736 CCATTGCATCGCGGTCTCGGGATGTAAATGACCAGAAACGTAAAAAGAAG-GATCAAGAT 1794 Query 2445 CGTGTTTTAAAGTTTATGATG-GACCACCAACCGCATGTTGTGGCTTTAGGAGCTGTCAA 2503 ||| || ||||||||| | | ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct 1795 CGTCTTCGAAAGTTTATAA-GAGACCATCAACCAAATGTTGTGGCTTTAGCAGCTG-CAA 1852 Query 2504 -TTTGTCTTGTACT-CGTCTGAAGGATGATATTTATGAGGTCATATTCCAGATGGTGGAG 2561 |||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct 1853 ATTTGAGTTGTG-TACGTCTGAAGGATGAGATTTATGAGGTTATATTCCAAATGGTGGAA 1911 Query 2562 GAAAAACC-TAGAGATGTCGGA-CATGGGATGGATGATTTAAGCATTG-TTTATGTGGAT 2618 ||| || | | ||| | | | |||||| |||| ||| || || |||||| |||| Sbjct 1912 GAACTGCCGTCT-GTTGTAGAAGC-TGGGATTTATGACTTAC-CAGTGGTTTATGCGGAT 1968 Query 2619 GAATCACTTCCTAGGCTATATGAAAATTCTCGAATCTCGGGTGAACAGCTACCTCAGCAG 2678 ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| ||| Sbjct 1969 GAATCTCTTCCTAGGCTATACGAAAATTCTAGAATCTCAAGAGAACAACTACCTCAACAG 2028 Query 2679 TCAGGGAACGTGAGACGTGCAGTTGCTCTTGGACGCTATCTCCAGAATCCACTAGCAATG 2738 |||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2029 GCAGGGATTGTGAAACGCGCAGTTGCTCTTGGACGTTATCTCCAGAATCCATTAGCAATG 2088 Query 2739 GTGGCAACTTTATGCGGTCCAGGTCGGGAAATTTTGTCTTGGAAGCTTCATCCCTTGGA- 2797 | |||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| | ||| | Sbjct 2089 ATCTCAACCTTATGCGGTCCAGGTAAAGATATTTTGTCATGGAAGCTACATTCTTTGCAA 2148 Query 2798 GAATTTTCTTCAGCTAGATGAGAAGTATG-GAATGGTTGAGCAGGTTATGGTTGACATTA 2856 || ||||||| | | |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||| Sbjct 2149 GA-TTTTCTTGATCCAGATGAGAAGTATGAGA-TGGTTGAGCAAGTTATGGTTGAC-TTA 2205 Query 2857 -CAAACCAGGTTGGAATCGATATTAA-CTTGGCAGCTAGCCATGATTGGTTCTTTT-CTC 2913 |||| || ||||||||||| ||||| || ||| || |||||||| ||| | |||| ||| Sbjct 2206 ACAAATCAAGTTGGAATCGACATTAATCT-GGCTGCGAGCCATGAATGGCT-TTTTGCTC 2263 Query 2914 CTTTACAGTTCATTTCTGGACTTGGGCCTCGGAAAGCTGCATCCTTGCAGAGGTCGCTTG 2973 |||||||||| |||| || ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct 2264 CTTTACAGTTTGTTTCAGGGCTTGGCCCTAGGAAAGCTGCATCTTTGCAGAGGTCTCTTG 2323 Query 2974 TAAGAGCTGGTTCAATCTTTGTCCGCAAGGACCTGATAA-TGCATGGACTTGGTAAAAAG 3032 | ||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| Sbjct 2324 TTAGATCTGGTTCGATATTTGTCCGCAAGGAACTGATAAAT-CATGGGCTTGGTAAAAAA 2382 Query 3033 GTTTTTGTAAATGCTGCCGGTTTCTTGCGCATCCGCAGAAGTGGGCTGGCT-GCTAGTAG 3091 |||| |||||||| || |||||||| || || || || |||||| ||||| | |||||| Sbjct 2383 CTTTTCGTAAATGCAGCTGGTTTCTTACGGATTCGTAGGAGTGGGTTGGCTTG-TAGTAG 2441 Query 3092 CAGTCAATTTATTGACTTATTGGATGACACCAGAATCCATCCAGAGTCGTATAGTCTTGC 3151 ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||||| Sbjct 2442 CAGCCAATTTATTGACTTGTTGGATGACACTAGAATACATCCGGAATCATACGGTCTTGC 2501 Query 3152 TCAAGAATTGGCGAAAGATATATATGA-TGAGGATGTCAGAGGTGATTCAAATGATGATG 3210 |||||||||||||||||| | ||| | | | ||| | | | | | ||||||| | Sbjct 2502 GCAAGAATTGGCGAAAGATGTTTAT-ACTCATGATA-CTG---TAAG--AGATGATGAGG 2554 Query 3211 AGGATGCGATAGAAATGGCTATTGAGCATGTGAGAGATCG-GCCAGCTTCTTTGAG-AAA 3268 | ||||| ||||| ||||| || ||| |||| |||||| | ||||||||||||||| ||| Sbjct 2555 ATGATGCAATAGAGATGGCGATAGAGTATGTAAGAGAT-GAGCCAGCTTCTTTGAGGAAA 2613 Query 3269 AGTTGTCCTTGATGAATATCTTGCCA-GCAAGAAACGGGAGAATAAGAAGGAAACTTATA 3327 | | || |||||||| ||| ||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||| Sbjct 2614 A-TCGTTCTTGATGAGTAT-TTGAGAAGCAAGAACCAAGAGAATAAGAAGGAAACTTATA 2671 Query 3328 GCAATATCATAAGAGAATTAAGTTGTGGTTTCCAGGATTGGCGGA-TACCATTTAAAGAG 3386 | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| | | | ||||||||| Sbjct 2672 GTTTTATCATGAGAGAATTAAGCTGTGGTTTTCAGGATTGGCGAAGT-CTGTTTAAAGAG 2730 Query 3387 CCA-AGTCCAGATGAAGAATTTTACATGATTTCAGGTGAAACTGAGGACACCATAGCG-G 3444 | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | || || || | | | Sbjct 2731 GTTGA-TCCAGATGAAGAGTTTTATATGATTTCTGGTGAAACCAAAGAAACTATTG-GTG 2788 Query 3445 A-GGGCAGAATTGTCCAGGCCAGTGTTCGGAGA-T-TGCAGAATGG-AAGAGCCATATGT 3500 | ||| |||||||| ||||||| |||| || | | | || | ||| || ||||| |||| Sbjct 2789 AAGGG-AGAATTGTGCAGGCCACTGTTAAGAAAGTAT-CA-AGTGGTAA-AGCCAAATGT 2844 Query 3501 GTATTAGATTCTGGGTTAACTGGGATGCT-TATGAAGGAAGATTTCTCAGATGATGGGAG 3559 |||||||||| ||| ||| ||||||| || | | |||||||||| ||| |||||||| || Sbjct 2845 GTATTAGATTGTGGATTACCTGGGATTCTCT-TAAAGGAAGATTACTCGGATGATGGTAG 2903 Query 3560 AGATATTGTTGACTTGGCGGACCAGCTGAAAGAAGGCGATATCCTCACATGCAAGATCAA 3619 |||||| ||||| || | || | ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| Sbjct 2904 AGATATCGTTGATTTATCAAACAAACTGTGTGAAGGCTATATCGTCACTTGCAAGATCAA 2963 Query 3620 ATCGATTCAAAAGCAGAGGTATCAAGTGTTCCTTATTTGCAAAGAAAGTGAAATGAGAAA 3679 ||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2964 ATCAATTCTAAAGCAAAGGTATCATGTGTTACTTGTCTGCAAAGAAAGCGAAATGAGAAA 3023 Query 3680 CAACAGACACCAGCATAACCAGAATGTGGATGCAT-ATTACCATGAGGAT-A--GAAACA 3735 ||||| | | | | || | |||| |||| || ||||||| ||||| | |||| | Sbjct 3024 GAACAGG-A--ATC-T--CCGGGATGTCGATG-ATTATTACCACGAGGAGGAACGAAAAA 3076 Query 3736 GTCTCCAGCTTGTA-AAAGAGAAGGCTCG-AAAGGAAAAAGAGCTGGTGAGGAAGCATTT 3793 | ||| | | | | |||||||| || | |||| | || || ||||| || Sbjct 3077 ATGTCCTGATAG-AGAAAGAGAAAGCCCCTAAAG-A----GA-------AG-AAGCAGTT 3122 Query 3794 TAAGTCTCGGATGATTGTCCATCCCCGCTTTCAGAATATCACAGCTGACCAAGCAACAGA 3853 |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||| Sbjct 3123 TAAGTCTCGGATGATTGTTCATCCTCGGTTTCAGAACATCACTGCTGAGCAAGCAACAGG 3182 Query 3854 GTATTTGTCTGACAAAGACT-TTGGAGAAAGCATTGTTCGTCCAAGTTCTCGAGGACTCA 3912 |||||||||| | || || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | Sbjct 3183 GTATTTGTCTTATAA-GAATATTGGAGAAAGCATTGTTCGTCCAAGCTCACGAGGACTGA 3241 Query 3913 A-CTTTTTAACTTTGACCCTCAAGATTTAT-GATGGA-GTTTACGCTCACAAGGAGATAG 3969 | | | | | |||||| ||||||||| | ||| | || || ||| ||||||||||| Sbjct 3242 ATCATCTGA-CTTTGATGATCAAGATTT-TCGATA-ATGTGTATGCTAACAAGGAGATAA 3298 Query 3970 -CTGAAGGTGGGAAAGAAAACAAGGACATTACA-AGCCTACAGTGTATTGGGAAGACCCT 4027 | ||||||| ||| || ||||||||||| | ||| |||| |||||||||| || | Sbjct 3299 TC-GAAGGTGAGAAGGAGAACAAGGACAT-AGTGAGCTTACAACGTATTGGGAAAACATT 3356 Query 4028 GACAATTGGAGAG-GACACCTTCGAGGATCTAGATGAGGTCATGGATCGATATGTTGATC 4086 || |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct 3357 GAAAATTGG-GAATGAAACCTTCGAGGATCTAGATGAGGTAATGGATCGGTATGTTGATC 3415 Query 4087 CTTTGGTATCTCATCTTAAGACAATGCTCAACTATCGGAAATTCCGTAAGGGGACCAAA- 4145 |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| || | ||||| ||| Sbjct 3416 CTTTGGTAACTCATCTTATGACAATGCTAAACTACCGCAAATTTCGGACTGGGAC-AAAG 3474 Query 4146 TCAGAAGTAGATGATCTTCTTAGGATCGAGAAGGGCGAAAATCCTTCAA-GAATAGTTTA 4204 || ||| |||||||||||||| || | |||||||||| |||||| || | ||||||| Sbjct 3475 TCGGAAATAGATGATCTTCTTCGGGTTGAGAAGGGCGTAAATCCGAAAATGG-TAGTTTA 3533 Query 4205 TTGTTTTGG-GATTTCACACGAACATCCAGGCA-CTTT-TATTCTGTCTTACATAAGGAG 4261 ||||||| | |||| || ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | | Sbjct 3534 CAGTTTTGGTG-TTTCGCATGAACATCCAGGGAGCTTTATATT--GTCTTACATACG-AT 3589 Query 4262 CA-CAAACCCACATCATGAGTATATAGGTTTATATCCCAA-GGGATTTAAGTTCAGGAAA 4319 | ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||| Sbjct 3590 CCGCAAACCCGCACCATGAGTATATCGGTTTATA-CCCAAAGGGATTCAAGTTCAGGAAA 3648 Query 4320 AGGATGTTTG-AGGA-CATTGATCGGCTTG-TGGCATACTTCCAGAGGCATATTGATGA 4375 || ||||||| || | | ||||| ||||| || | || ||| |||| ||| ||||||| Sbjct 3649 AGAATGTTTGGAG-ATC-TTGATAAGCTTGCTG-CTTATTTCAAGAGACATGTTGATGA 3704 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 203037151955 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5