BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: halleri_transcript_ahg.fa
           32,672 sequences; 38,939,717 total letters



Query= AT1G65440.1

Length=5362
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  Ahg925610 jgi|Araly1|925610|scaffold_201171.1                       7797    0.0  
  Ahg907098 jgi|Araly1|907098|Al_scaffold_0002_179                    2566    0.0  


> Ahg925610 jgi|Araly1|925610|scaffold_201171.1
Length=4961

 Score = 7797 bits (4222),  Expect = 0.0
 Identities = 4514/4657 (97%), Gaps = 11/4657 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  120   TTCTAATTTGTTGAGATAAACATGGCGAGGAACGCAATCTCTGACGATGAAGAGGATCAT  179
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     TTCTAATTGGTTGAGATAAACATGGCGAGGAACGCAATCTCTGACGATGAAGAGGATCAT  60

Query  180   GAGCTTGAGGATGACGACGGAGAGCCAGTTCATGGAGATCCAGCtgagcatgatgaaaac  239
             ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||
Sbjct  61    GAGCTAGAGGATGATGACGGAGAGCCAGTTCATGGAAATCCAGTTGAGCACGATGACAAC  120

Query  240   gatgatgaagaagatgatgatgacgttgggaatgagtatgagaatgatgGGTTCATAGTG  299
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121   GATGATGAAGAAGATGATGATGACGTTGGGAATGAGTATGAGAATGATGGGTTCATAGTG  180

Query  300   AATGATgaagacgaagaggaagaagaggaagaagacgaagaaaggaaagatagcgatgag  359
             ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  181   AATGATGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGAAGAGGACGAAGAAAGGAAAAATAGCGATGAG  240

Query  360   gagaggcagaaaaagaagaagaaacgaaagaaaaaggACGAAGGTCTTGATGAAGATGAT  419
             |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  241   GAGAGGCAGAAAAAGAAGAAGAAACGAAGGAAAAAGGACGAAGATCTTGATGAAGATGAT  300

Query  420   TATTTGCTTCTACAAGATAACAACGTCAAATTCAAAAAGAGGCAGTATAAGCGGTTGAAG  479
             ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  301   TATCTGCTTCTCCAAGATAACAACGTCAAATTCGAAAAGAGGAAGTATAAGCGGTTGAAG  360

Query  480   AAAGCTCAAAGGGAACAGGGA-AATGG-CCAGGGAGAATCATCCGATGATGAGTTTGATA  537
             ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  361   AAAGCTCAAAGGGAA-AGGGACAATGGTCC-GGGGGAATCATCCGATGATGAGTTTGATG  418

Query  538   GTAGAGGTGGAACTAGGAGAAGTGCTGAGGATAAGATCAAAGACAGGCTGTTtgatgatg  597
             | ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  419   GGAGAGGTGGAGCTAAAAGAAGTGCTGAGGATAAGATCAAAGACAGGCTTTTTGATGATG  478

Query  598   ttgatgttgatgatccacctgatgatgtaggtgatgaGGAAGACTTAGTTGTGGAAGAAG  657
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  479   TTGATGTTGATGATCCACCTGATGATGTAGGTGATGAGGAAGACTTAGTTGTGGAAGAAG  538

Query  658   ATGTAGTTGGGAGCGAGGATGAAATGGCAGATTTTATTGTAGATGAAGATGATGAGCATG  717
             ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct  539   ATGTAGTTGGGAGCGAGGACGAAATGGCAGATTTTATTGTAGATGAAGATGATGGGCTTG  598

Query  718   GTCCTCCTAAGAGGGGCAACTCGAAGAAAAAGAAATATAGGCAGGGATCAGATATTACTG  777
             || ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct  599   GTGCTCCTAAGAGGGGGAACTCGAAAAAAAAGAAATTTAGGCAGGGATCAGATATTAATG  658

Query  778   CTATGCGAGATGCTAATGAAATATTTGGTGATGTTGACGAATTATTAACAATTCGCAAAA  837
             |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  659   CTATGCGAGACGCTAATGAAATATTTGGTGATGTTGACGAATTATTGACAATTCGCAAAA  718

Query  838   AGGGTTTGGCATCTAATCAAAGGATGGAAAGAAGGCTCGAAGATGAGTTTGAACCAACTG  897
             ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  719   AGGGTTTGGCATCTAGTGAAAGGATGGAAAGAAGGCTCGAAGATGAGTTTGAACCAACTG  778

Query  898   TTCTTTCTGAGAAATATATGACAGGGAATGATGATGAAATCCGCCAGCTTGATATTCCTG  957
             |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  779   TTCTTTCTGAGAAATATATGACAGGGAAAGATGATGAAATTCGCCAGCTTGATATTCCTG  838

Query  958   AGAGAATGCAGATATCTGAAGAAAGCACCGGAAGCCCTCCTGTAGATGAAATTAGCATTG  1017
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  839   AGAGAATGCAGATATCTGAAGAAAGCACCGGAAGCCCTCCTGTAGATGAAATTAGCATTG  898

Query  1018  AAGAAGAAAGCAATTGGATATATGCTCAACTTGCTTCCCAACTTAGAGAATCTGATGGAA  1077
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||
Sbjct  899   AAGAAGAAAGCAATTGGATATATGCTCAACTTGCTTCTCTACTTAAAGAATCTGATGGAA  958

Query  1078  CTTTTGATGGGCGGGGTTTCTCGGTTAATAAGGATGACATCGCAAAATTTTTGGAGCTAC  1137
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  959   CTTTTGATGGGCGGGGTTTCTCGGTTAATAAGGATGACATCGCAAAATTTTTGGAGCTAC  1018

Query  1138  ATCATGTGCAGAAATTAGAGATACCGTTTATAGCTATGTACCGAAAGGAGCAATGCCGGA  1197
             ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1019  ATCATGTGCAGAAATTAGAGATACCCTTTATAGCTATGTACCGAAAGGAGCAATGCCGGA  1078

Query  1198  GCTTGTTGGACACTGGTGATTTTGATGGCGCCAATCAAGGCAAGAAACCTGAGACCAAGT  1257
             |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  1079  GCTTGTTGGACACTGGTGATGTTGATGGCGCCAATCAAGACAAGAAACCTGAGACCAAGT  1138

Query  1258  GGCATAAGGTCTTCTGGATGATTCATGACTTGGATAAGAAGTGGCTCCTTCTTCGAAAAA  1317
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1139  GGCATAAGGTCTTCTGGATGATTCATGACTTGGATAAGAAGTGGCTCCTTCTTCGAAAAA  1198

Query  1318  GGAAAATGGCGTTGCATGGTTACTATACAAAACGTTACGAAGAAGAGTCTAGGAGGGTCT  1377
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1199  GGAAAATGGCGTTGCATGGTTACTATACAAAACGTTACGAAGAAGAGTCTAGGAGGGTCT  1258

Query  1378  ATGATGAAACAAGACTTAATCTAAATCAGTATCTTTTTGAATCAGTCATTAAGTCTCTTA  1437
             |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  1259  ATGATGAAACTAGACTTAATCTAAACCAGTATCTTTTTGAATCAGTCATTAAGTCCCTTA  1318

Query  1438  AAGTTGCAGAAACAGAAAGAGAAGTTGATGATGTAGATTCCAAGTTCAACTTGCATTTTC  1497
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  1319  AAGTTGCAGAAACAGAAAGAGAAGTTGATGATGTAGATTCCAAGTTCAACTTGCATTTCC  1378

Query  1498  CTCCCGGTGAAATTGGTGTTGATGAAGGGCAGTATAAGAGGCCGAAAAGGAAATCACAAT  1557
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1379  CTCCCGGTGAAATTGGTGTTGATGAAGGGCAGTATAAGAGGCCGAAAAGGAAATCACAAT  1438

Query  1558  ATAGCATCTGCAGTAAAGCAGGGCTCTGGGAGGTTGCAAACAAATTTGGGTATAGTGCTG  1617
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1439  ATAGCATCTGCAGTAAAGCGGGGCTCTGGGAGGTTGCAAACAAATTTGGGTATAGTGCTG  1498

Query  1618  AGCAACTGGGACTTGCATTGTCCCTAGAAAAACTGGTTGATGAGCTTGAGGATGCAAAGG  1677
             ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct  1499  AGCAATTGGGACTTGCATTGTCCTTAGAAAAACTGGTTGATGAACTTGAGGACGCAAAGG  1558

Query  1678  AAACACCAGAGGAGATGGCTAAAAACTTTGTGTGCGCAATGTTTGAAAATTCTCTGGCAG  1737
             |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |
Sbjct  1559  AAACACCAGAGGAGATGGCTCAGAACTTTGTGTGCGCAATGTTTGAAAATCCTCAGGCCG  1618

Query  1738  TTCTGAAAGGTGCACGGCATATGGCTGCAGTTGAGATAAGTTGCGAGCCATCAGTCAAAA  1797
             ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  1619  TTCTGAAGGGTGCACGGCATATGGCTGCAATTGAGATAAGTTGTGAGCCATCAGTCAAAA  1678

Query  1798  AGTATGTCCGTGGCATTTATATGGAGAATGCAGTGGTCTCAACAAGTCCAACAGCAGATG  1857
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1679  AGTATGTCCGTGGCATTTATATGGAGAATGCAGTGGTCTCAACAAGTCCAACAGCAGATG  1738

Query  1858  GAAATACAGTAATTGATTCGTTCCATCAGTTTTCTGGGATTAAGTGGTTGCGTGAAAAGC  1917
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct  1739  GAAATACAGTAATAGATTCGTTCCATCAGTTTTCTGGCATTAAGTGGTTACGTGAAAAGC  1798

Query  1918  CATTGAGCAAGTTTGAGGGTGCACAATGGCTTCTCATTCAGAAGGGAGAAGAGGAGAAAC  1977
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  1799  CATTGAGCAAGTTTGAGGGTGCACAATGGCTTCTCATTCAGAAGGCAGAAGAGGAGAAAC  1858

Query  1978  TTCTTCAAGTAACCTTCAAGCTGCCTGAGAATTACATGAATAGGCTAATTAGCGACTGCA  2037
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  1859  TTCTTCAAGTAACCTTCAAGCTGCCTGAGAATTACATGAATAGGCTAATTAGTGACTGCA  1918

Query  2038  ATGAACACTATCTAAGTGTTGGTGTTAGTAAGTATGCTCAACTCTGGAATGAGCAAAGAA  2097
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1919  ATGAACACTATCTAAGTGTTGGTGTTAGTAAGTATGCTCAACTCTGGAATGAGCAAAGAA  1978

Query  2098  AGTTGATATTGGAGGATGCACTTCATGCTTTTCTTTTGCCATCAATGGAGAAAGAAGCAA  2157
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1979  AGTTGATAGTGGAGGATGCACTTCATGCTTTTCTTTTGCCATCAATGGAGAAAGAAGCAA  2038

Query  2158  GATCCTTGCTAACTAGCAGAGCGAAGAGTCGGTTGCTTTCAGAGTATGGACAGGCTTTGT  2217
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2039  GATCCTTGCTAACTAGCAGAGCGAAGAGTCGGTTGCTTTCAGAGTATGGACAGGCTTTGT  2098

Query  2218  GGAACAAGGTGTCTGCAGGGCCATACCAAAAGAAAGAAATGGACATTAATTTAGATGAGG  2277
             ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||
Sbjct  2099  GGAACAAGGTGTCTGCAGGGCCATATCAAAAGAAAGAAATGGACATGAATTCAGATGAGG  2158

Query  2278  AAGCTGCACCGAGGGTCATGGCATGTTGTTGGGGACCTGGGAAGCCACCAAATACATTTG  2337
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  2159  AAGCTGCACCGAGGGTCATGGCATGTTGTTGGGGACCTGGAAAGCCACCAAATACATTTG  2218

Query  2338  TGATGCTGGACTCATCAGGTGAGGTGCTTGACGTGCTTTATGCTGGATCCCTTACATCGC  2397
             ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  2219  TGATGCTGGACTCATCAGGCGAGGTGCTTGACGTGCTTTATGCTGGATCCCTCACATCGC  2278

Query  2398  GATCTCAAAATGTTAACGACCAGCAACGTAAAAAGAGTGACCAGGATCGTGTTTTAAAGT  2457
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2279  GATCTCAAAATGTCAACGACCAGCAACGTAAAAAGAGTGACCAGGATCGTGTTTTAAAGT  2338

Query  2458  TTATGATGGACCACCAACCGCATGTTGTGGCTTTAGGAGCTGTCAATTTGTCTTGTACTC  2517
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2339  TTATGATGGACCACCAACCGCATGTTGTGGCTTTAGGAGCTGTCAATTTGTCTTGTACTC  2398

Query  2518  GTCTGAAGGATGATATTTATGAGGTCATATTCCAGATGGTGGAGGAAAAACCTAGAGATG  2577
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2399  GTCTGAAGGATGATATTTATGAGGTCATATTCCAGATGGTGGAGGAAAAACCTAGAGATG  2458

Query  2578  TCGGACATGGGATGGATGATTTAAGCATTGTTTATGTGGATGAATCACTTCCTAGGCTAT  2637
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  2459  TCGGACATGGGATGGATGATTTAAGCATTGTTTATGTGGATGAATCGCTTCCTAGGCTAT  2518

Query  2638  ATGAAAATTCTCGAATCTCGGGTGAACAGCTACCTCAGCAGTCAGGGAACGTGAGACGTG  2697
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct  2519  ATGAAAATTCTCGAATCTCGGGTGAACAGCTACCTCAGCAGTCAGGGATCGTGAAACGTG  2578

Query  2698  CAGTTGCTCTTGGACGCTATCTCCAGAATCCACTAGCAATGGTGGCAACTTTATGCGGTC  2757
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  2579  CAGTTGCTCTTGGACGCTATCTCCAGAATCCACTAGCGATGGTGGCAACTTTATGCGGTC  2638

Query  2758  CAGGTCGGGAAATTTTGTCTTGGAAGCTTCATCCCTTGGAGAATTTTCTTCAGCTAGATG  2817
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  2639  CAGGTCGGGAAATTTTGTCTTGGAAGCTTCATCCGTTGGAGAATTTTCTTCAGCTAGACG  2698

Query  2818  AGAAGTATGGAATGGTTGAGCAGGTTATGGTTGACATTACAAACCAGGTTGGAATCGATA  2877
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2699  AGAAGTATGGAATGGTTGAGCAGGTTATGGTTGACATTACAAACCAGGTTGGAATCGATA  2758

Query  2878  TTAACTTGGCAGCTAGCCATGATTGGTTCTTTTCTCCTTTACAGTTCATTTCTGGACTTG  2937
             |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  2759  TTAACTTGGCAGCTAGCCATGAGTGGTTCTTTTCTCCTTTACAGTTCATATCTGGACTTG  2818

Query  2938  GGCCTCGGAAAGCTGCATCCTTGCAGAGGTCGCTTGTAAGAGCTGGTTCAATCTTTGTCC  2997
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  2819  GGCCTCGGAAAGCTGCATCCTTGCAGAGGTCGCTTGTAAGAGCTGGTTCAATATTTGTCC  2878

Query  2998  GCAAGGACCTGATAATGCATGGACTTGGTAAAAAGGTTTTTGTAAATGCTGCCGGTTTCT  3057
             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  2879  GCAAGGACCTAATAATGCATGGACTTGGTAAAAAGGTTTTTGTAAATGCAGCCGGTTTCT  2938

Query  3058  TGCGCATCCGCAGAAGTGGGCTGGCTGCTAGTAGCAGTCAATTTATTGACTTATTGGATG  3117
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  2939  TGCGCATCCGCAGAAGTGGGCTGGCTGCTAGTAGCAGTCAATTTATCGACTTATTGGATG  2998

Query  3118  ACACCAGAATCCATCCAGAGTCGTATAGTCTTGCTCAAGAATTGGCGAAAGATATATATG  3177
             |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2999  ACACCAGAATCCATCCCGAGTCATATAGTCTTGCGCAAGAATTGGCGAAAGATATATATG  3058

Query  3178  ATGAGGATGTCAGAGGTGATTCAAATGATGATGAGGATGCGATAGAAATGGCTATTGAGC  3237
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  3059  ATGAGGATGTCAGAGGTGATTCAAATGATGATGAGGATGCAATAGAAATGGCTATTGAGC  3118

Query  3238  ATGTGAGAGATCGGCCAGCTTCTTTGAGAAAAGTTGTCCTTGATGAATATCTTGCCAGCA  3297
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3119  ATGTGAGAGATCGGCCAGCTTCTTTGAGAAAAGTTGTCCTTGATGAATATCTTGCCAGCA  3178

Query  3298  AGAAACGGGAGAATAAGAAGGAAACTTATAGCAATATCATAAGAGAATTAAGTTGTGGTT  3357
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  3179  AGAAACGGGAGAATAAGAAGGAAACTTATAGCAATATCATAAGAGAATTAAGCTGTGGTT  3238

Query  3358  TCCAGGATTGGCGGATACCATTTAAAGAGCCAAGTCCAGATGAAGAATTTTACATGATTT  3417
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3239  TCCAGGATTGGCGGATACCATTTAAAGAGCCAAGTCCAGATGAAGAATTTTACATGATTT  3298

Query  3418  CAGGTGAAACTGAGGACACCATAGCGGAGGGCAGAATTGTCCAGGCCAGTGTTCGGAGAT  3477
             ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3299  CAGGTGAAACTGAGGACACCATAGCTGAGGGCAGAATTGTCCAGGCCAGTGTTCGGAGAT  3358

Query  3478  TGCAGAATGGAAGAGCCATATGTGTATTAGATTCTGGGTTAACTGGGATGCTTATGAAGG  3537
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3359  TGCAGAATGGAAGAGCCATATGTGTATTAGATTCTGGGTTAACTGGGATGCTTATGAAGG  3418

Query  3538  AAGATTTCTCAGATGATGGGAGAGATATTGTTGACTTGGCGGACCAGCTGAAAGAAGGCG  3597
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  3419  AAGATTTCTCAGATGATGGGAGAGATATTGTTGACTTGGCGGACCAACTGAAAGAAGGCG  3478

Query  3598  ATATCCTCACATGCAAGATCAAATCGATTCAAAAGCAGAGGTATCAAGTGTTCCTTATTT  3657
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3479  ATATCCTAACATGCAAGATCAAATCGATTCAAAAGCAGAGGTATCAAGTGTTCCTTATTT  3538

Query  3658  GCAAAGAAAGTGAAATGAGAAACAACAGACACCAGCATAACCAGAATGTGGATGCATATT  3717
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  3539  GCAAAGAAAGTGAAATGAGAAACAACAGACACCAGCATAACCAGAATGTGGATGCTTATT  3598

Query  3718  ACCATGAGGATAGAAACAGTCTCCAGCTTGTAAAAGAGAAGGCTCGAAAGGAAAAAGAGC  3777
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  3599  ACCATGAGGATAGAAACAGTCTCCAGCTTGTAAAAGAGAAAGCTCGAAAGGAAAAAGAGC  3658

Query  3778  TGGTGAGGAAGCATTTTAAGTCTCGGATGATTGTCCATCCCCGCTTTCAGAATATCACAG  3837
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3659  TGGTGAGGAAGCATTTTAAGTCTCGGATGATTGTCCATCCCCGCTTTCAGAATATCACAG  3718

Query  3838  CTGACCAAGCAACAGAGTATTTGTCTGACAAAGACTTTGGAGAAAGCATTGTTCGTCCAA  3897
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3719  CTGACCAAGCAACAGAGTATTTGTCTGACAAAGACTTTGGAGAAAGCATTGTTCGTCCAA  3778

Query  3898  GTTCTCGAGGACTCAACTTTTTAACTTTGACCCTCAAGATTTATGATGGAGTTTACGCTC  3957
             ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3779  GTTCTCGAGGACTCAACTTTTTAACTTTGACGCTCAAGATTTATGATGGAGTTTACGCTC  3838

Query  3958  ACAAGGAGATAGCTGAAGGTGGGAAAGAAAACAAGGACATTACAAGCCTACAGTGTATTG  4017
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  3839  ACAAGGAGATAGCTGAAGGTGGGAAAGAAAACAAGGACATCACAAGCCTACAGTGTATTG  3898

Query  4018  GGAAGACCCTGACAATTGGAGAGGACACCTTCGAGGATCTAGATGAGGTCATGGATCGAT  4077
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3899  GGAAGACCCTGACAATTGGAGAGGACACCTTCGAGGATCTAGATGAGGTCATGGATCGAT  3958

Query  4078  ATGTTGATCCTTTGGTATCTCATCTTAAGACAATGCTCAACTATCGGAAATTCCGTAAGG  4137
             ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  3959  ATGTTGATCCTTTGGTATCTCATCTTAAGACCATGCTCAACTATCGGAAATTCCGAAAGG  4018

Query  4138  GGACCAAATCAGAAGTAGATGATCTTCTTAGGATCGAGAAGGGCGAAAATCCTTCAAGAA  4197
             || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  4019  GGTCCAAATCAGAAGTAGATGATCTTCTTAGGATCGAGAAGGGAGAAAATCCTTCAAGAA  4078

Query  4198  TAGTTTATTGTTTTGGGATTTCACACGAACATCCAGGCACTTTTATTCTGTCTTACATAA  4257
             ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4079  TAGTTTACTGTTTTGGGATTTCACATGAACATCCAGGCACTTTTATTCTGTCTTACATAA  4138

Query  4258  GGAGCACAAACCCACATCATGAGTATATAGGTTTATATCCCAAGGGATTTAAGTTCAGGA  4317
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4139  GGAGCACAAACCCACATCATGAGTATATAGGTTTATATCCCAAGGGATTTAAGTTCAGGA  4198

Query  4318  AAAGGATGTTTGAGGACATTGATCGGCTTGTGGCATACTTCCAGAGGCATATTGATGACC  4377
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4199  AAAGGATGTTTGAGGACATTGATAGGCTTGTGGCATACTTCCAGAGGCATATTGATGACC  4258

Query  4378  CATTGCAAGAATCGGCGCCATCAATCAGGTCTATTGCTGCCAAGGTACCGATGAGAAGCC  4437
             ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4259  CATTGCAAGAATCGGTGCCATCGCTCAGGTCTATTGCTGCCAAGGTACCGATGAGAAGCC  4318

Query  4438  CAGCAGACCATGGATCATCTGGAGGAAGTGGTTGGGGTAGTTCTCAGAGTGAAGGAGGCT  4497
             ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct  4319  CAGCAGACCATGGCTCGTCTGGAGGAAGTGATTGGGGTAGTTCTCAGAATGAAGGAGGGT  4378

Query  4498  GGAAAGGTAA-CTC-GGATCGTTCAGGCTCAG-GGAGAGGCGGTGAGTACAGAAATGGTG  4554
             ||||||| |  ||| || |  | ||   |||  |||| || |||||||| ||||||||||
Sbjct  4379  GGAAAGG-AGGCTCAGG-TAATGCATT-TCAAAGGAGGGGTGGTGAGTATAGAAATGGTG  4435

Query  4555  GTGGACGTGATGGACATCCAAGTGGAGCGCCTAGGCCATATGGTGGCCGTGGACGTGGTC  4614
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4436  GTGGACGTGATGGACATCCAAGTGGAGCGCCTAGGCCATATGGTGGCCGTGGACGTGGTC  4495

Query  4615  GAGGCAGAGGACGGAGGGATGATATGAATAGTGATAGACAAGATGGTAACGGAGATTGGG  4674
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  4496  GAGGCAGAGGACGGAGGGATGATATGAATAGTGATAGACAAGATGGTAATGGAGATTGGG  4555

Query  4675  GTAATAATGATACTGGAACTGCAGATGGAGGTTGGGGAAATAGTGGTGGCGGTGGTTGGG  4734
             |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||
Sbjct  4556  GTAATAATGATACTGGAACTGGTGATGGAGGTTGGGGAAGTAGTGGTGTCGGCGCTTGGG  4615

Query  4735  GAAGCGAGTCTGCTGGTAAAAAGACTGGTGGTGGCAG  4771
             |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct  4616  GAAGCGAGTCTGCTGGTAAAAAGAGTGGTGGTG-CAG  4651


> Ahg907098 jgi|Araly1|907098|Al_scaffold_0002_179
Length=3720

 Score = 2566 bits (1389),  Expect = 0.0
 Identities = 2937/3659 (80%), Gaps = 207/3659 (6%)
 Strand=Plus/Plus

Query  789   GCTAATGAAATATTTGGTGATGTTGACGAATTATT-AACAATTCGCAAAAAGGGTTTGGC  847
             |||||||| ||||||||||||  ||| ||||| || || | |||| | ||||| ||| ||
Sbjct  181   GCTAATGATATATTTGGTGATCCTGAAGAATTGTTGAA-ACTTCGGAGAAAGGATTTAGC  239

Query  848   ATCTAATC-AAAGGATGGAAAGAAGGCTCGAAGATGAGTTTGAACCAACTGTTCTTTCTG  906
              | ||| | ||| ||| ||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||| ||||
Sbjct  240   GTATAA-CGAAAAGATCGAAAGAAAGTTAGAAGATGAGTTTGAACCAATTGTTCTCTCTG  298

Query  907   AGAAATATATGACAGGGAATGATGATGAAATCCGCCAGCTTGATATTCCTGAGAGAATGC  966
             |||| |||||||||  ||| |||||||||||  |  |||||||| |||||||||||||||
Sbjct  299   AGAAGTATATGACACAGAAAGATGATGAAATTAGGAAGCTTGATGTTCCTGAGAGAATGC  358

Query  967   AGATA-TCTGAAGAAAG-CACCGGAAGCCCTCCTGTAGATGAAATTAGCATTGAAGAAGA  1024
             ||||| || |||| ||| ||| |||| | |||| || ||||| |||||||||||||||||
Sbjct  359   AGATATTC-GAAG-AAGTCACTGGAAACGCTCCCGTCGATGATATTAGCATTGAAGAAGA  416

Query  1025  AAGCAATTGGATATATGCTCAACTTGCTTCCCAACTTAGAGAATCTGATGGAACTTTTGA  1084
              ||||| ||||| ||||||| | ||| ||     |  | |||| |  || |       | 
Sbjct  417   GAGCAACTGGATTTATGCTCGA-TTGGTT-----C--A-AGAA-C--AT-G-------G-  455

Query  1085  TGGGCGGGGTTTCTCGGTTAATAAGGATGACATCGCAAAATTTTTGGAGCT-ACATCATG  1143
             |   |   |||| | |||||| || |||||||| |  | |||||||||| |  | |||||
Sbjct  456   T---CCAAGTTTTTTGGTTAACAAAGATGACATTGTGAGATTTTTGGAGATGTC-TCATG  511

Query  1144  TGCAGAAATTAGAGATACCGTTTATAGCTATGTACCGAAAGGAGCAATGCCGGAGCTTGT  1203
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||
Sbjct  512   TGCAGAAGTTAGAGATACCGTTTATAGCTATGTACCGGAAGGAGCAGTGTCGGAGTTTGT  571

Query  1204  TGGACA---CTGGTGAT-TTTG-A-TGGCGCCAATCAAGGCAAGAAACCTGAGACCAAGT  1257
             ||||||   ||| ||||  | | | ||    |||||    |||||| | |||||||||||
Sbjct  572   TGGACAGTTCTGATGATGATGGTAGTGATTTCAATCTTCTCAAGAAGCTTGAGACCAAGT  631

Query  1258  GGCATAAGGTCTTCTGGATGATTCATGACTTGGATAAG-AAGTGGCTCCTTCTTCGAAAA  1316
             || |||| ||||||||||||||||| || |||||| || |||||||| |||||||| |||
Sbjct  632   GGAATAAAGTCTTCTGGATGATTCAAGATTTGGAT-AGAAAGTGGCTTCTTCTTCGGAAA  690

Query  1317  AGGAAAATGGCGTTGCATGGTTACTATACAAAACGTTACGAAGAAG-AGTCTAGGAGGGT  1375
             |||||||  ||||||  |||||||| ||| |||||||  ||||||| |  || | | |||
Sbjct  691   AGGAAAACCGCGTTGTTTGGTTACTTTACCAAACGTTTTGAAGAAGAAACCT-GCA-GGT  748

Query  1376  CTATGATGAAACAAGACTTAATCTAAATCAGTATCTTTTTGAATCAGTCATTAAGTCTCT  1435
             |  ||||         || ||  | ||  ||  |||||||||||| || || ||||||||
Sbjct  749   C--TGAT---------CTGAA--T-AA-GAG--TCTTTTTGAATCGGTTATGAAGTCTCT  791

Query  1436  TAAAGTTGCAGAAACAGAAAGAGAAGTTGATGATGTAGATTCCAAGTTCAACTTGCATTT  1495
             |||||  || || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct  792   TAAAGCGGCGGAGACAGAGAGAGAAGTTGATGATGTAGACTCAAAGTTCAACTTGCATTT  851

Query  1496  TCCTCCCGGTGAAATTGGTGTTGATGAAGGGCAGTATAAGAGGCCGAAAAGGAAATCACA  1555
             |||||   |||  |   |  | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct  852   TCCTCATTGTG--A---G-ATCGATGAAGGACAGTATAAGAGGCCGAATAGGAAATCGCA  905

Query  1556  ATATAGCATCTGCAGTAAAGCAGGGCTCTGGGAGGTTGCAAACAAATTTGGGTATAGTGC  1615
              ||||||||||| || |||   ||  || ||||  |||||||||| ||||| ||||| ||
Sbjct  906   TTATAGCATCTGTAGCAAATTTGGAATCCGGGAATTTGCAAACAAGTTTGGTTATAGCGC  965

Query  1616  TGAGCAACTGGGACTTGCATTGTC-CCT-AGAAA-AACTGGTTGATGAGCTTGAGGATGC  1672
             ||||||| ||||| |||| ||||| | | |||||    | |||||||||||||| |||||
Sbjct  966   TGAGCAATTGGGATTTGCGTTGTCTCTTGAGAAAGTTTTTGTTGATGAGCTTGAAGATGC  1025

Query  1673  AAAGGAAACACCAGAGGAGATGGCTA-AAAACTTTGTGTGCGCAATGTTTGAAAATTCTC  1731
             |||| ||||||||||||||||||| |    ||| |   || |||||||||||| || |||
Sbjct  1026  AAAGAAAACACCAGAGGAGATGGC-ATTGTACTATAAATGTGCAATGTTTGAAGATCCTC  1084

Query  1732  TGGCAGTTCTGAAAGGTGCACGGCATATGGCTGCAGTTGAGATAAGTTGCGAGCCA-TCA  1790
               |  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |
Sbjct  1085  AAGTTGTTCTTAAAGGCGCACGGCATGTGGCTGCGGTTGAGATAAGCTGCGAGCCATTGA  1144

Query  1791  GTCAAAAAGTATGTCCGTGGCATTTATATGGAGAATGCAGTGGTCTCAACAAGTCCAACA  1850
              | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct  1145  -TTAAAAAGTATGTTCGCGGGATTTATATGGAGAATGCAGTAGTCTCAACGAGTCCAACA  1203

Query  1851  GCAGATGGAAATACAGTAATTGATTCGTTCCATCAGTTTTCTG-GGATTAAGTGGTTGCG  1909
              |||||||  ||   || || ||||| ||||||| |||||||| || |||||||||| ||
Sbjct  1204  CCAGATGGGGATGTGGTTATAGATTCTTTCCATCGGTTTTCTGCGG-TTAAGTGGTTACG  1262

Query  1910  TGAAAAGCCATTGAGCAAGTTTGAGGGTGCACAATGGCTTCTCATTCAGAAGGGAGAAGA  1969
              |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||
Sbjct  1263  CGAAAAGCCATTGAGAAAGTTTGAAGGTACACAATGGCTTCTTATTCAGAAAGCAGAAGA  1322

Query  1970  GGAGAAACTTCTTCAAGTAACCTTCAAGCTGCCTGAGAATTACATGAATAGGCTAATTAG  2029
              ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||
Sbjct  1323  AGAGAAGCTTCTTCAAGTAACTTTCAAGCTGCCTGAGAATCAGATGAATAGGATAATTAG  1382

Query  2030  CGACTGCAATGAACACTATCTAAGTGTTGGTGTTAGTAAGTATGCTCAACTCTGGAATGA  2089
              || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1383  TGAATGCAGTGAACACTATCTAAGTGTTGGTGTTAGTAAGTATGCTCAACTCTGGAATGA  1442

Query  2090  GCAAAG-AAAGTTGATATTGGAGGATGCACTTCATGCTTTTCTTTTGCCATCAATGGAGA  2148
             ||| || ||| |||||| ||||||| ||  |||| | |||||||||||| ||||||||||
Sbjct  1443  GCAGAGGAAA-TTGATACTGGAGGACGCGGTTCACGGTTTTCTTTTGCCGTCAATGGAGA  1501

Query  2149  AAGAAGCAAGATCCTTGCTAACTAGCAGAGCGAAGAGTCGGTTGCTTTCAGAGTATGGAC  2208
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  1502  AAGAAGCAAGATCCTTGCTAACTAGCAGAGCGAAGACTCGGTTGCTTTCAGAGTATGGAC  1561

Query  2209  AGGCTTTGTGGAACAAGGTGTCTGCAGGGCCATACCAAAAGAA-AGA-AATGGACATTAA  2266
             ||| ||| ||||| || |||||| |||||||||| | || ||| | | |||  | || | 
Sbjct  1562  AGGTTTTATGGAAAAAAGTGTCTTCAGGGCCATATCGAAGGAATA-ATAAT--A-AT-AC  1616

Query  2267  TTTAGATGAGGAAGCTGCACCGAGGGTCATGGCATGTTGTTGGGGACCTGGGAAGCCACC  2326
              |  |||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| || |||  
Sbjct  1617  CTCGGATGAGGAAGCTGCGCCGAGGGTCCTAGCTTGTTGTTGGGGACCTGGAAATCCAG-  1675

Query  2327  AAA-TACATTTGTGATGCTGGACTCATCAGGTGAGGTGCTTGACGTGCTTTATGCTGGAT  2385
             ||| ||||||||||||||| || ||||| || ||| || |||| |||||||| || ||||
Sbjct  1676  AAACTACATTTGTGATGCTTGATTCATCGGGAGAGTTGGTTGATGTGCTTTACGCAGGAT  1735

Query  2386  CCCTTACATCGCGATCTCAAAATGTTAACGACCAGCAACGTAAAAAGA-GTGACCAGGAT  2444
             || || ||||||| ||||   |||| || |||||| |||||||||||| | || || |||
Sbjct  1736  CCATTGCATCGCGGTCTCGGGATGTAAATGACCAGAAACGTAAAAAGAAG-GATCAAGAT  1794

Query  2445  CGTGTTTTAAAGTTTATGATG-GACCACCAACCGCATGTTGTGGCTTTAGGAGCTGTCAA  2503
             ||| ||  ||||||||| | | ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct  1795  CGTCTTCGAAAGTTTATAA-GAGACCATCAACCAAATGTTGTGGCTTTAGCAGCTG-CAA  1852

Query  2504  -TTTGTCTTGTACT-CGTCTGAAGGATGATATTTATGAGGTCATATTCCAGATGGTGGAG  2561
              ||||  ||||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| 
Sbjct  1853  ATTTGAGTTGTG-TACGTCTGAAGGATGAGATTTATGAGGTTATATTCCAAATGGTGGAA  1911

Query  2562  GAAAAACC-TAGAGATGTCGGA-CATGGGATGGATGATTTAAGCATTG-TTTATGTGGAT  2618
             |||   || |   | ||| | | | ||||||  |||| |||  || || |||||| ||||
Sbjct  1912  GAACTGCCGTCT-GTTGTAGAAGC-TGGGATTTATGACTTAC-CAGTGGTTTATGCGGAT  1968

Query  2619  GAATCACTTCCTAGGCTATATGAAAATTCTCGAATCTCGGGTGAACAGCTACCTCAGCAG  2678
             ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  | ||||| |||||||| |||
Sbjct  1969  GAATCTCTTCCTAGGCTATACGAAAATTCTAGAATCTCAAGAGAACAACTACCTCAACAG  2028

Query  2679  TCAGGGAACGTGAGACGTGCAGTTGCTCTTGGACGCTATCTCCAGAATCCACTAGCAATG  2738
              ||||||  |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  2029  GCAGGGATTGTGAAACGCGCAGTTGCTCTTGGACGTTATCTCCAGAATCCATTAGCAATG  2088

Query  2739  GTGGCAACTTTATGCGGTCCAGGTCGGGAAATTTTGTCTTGGAAGCTTCATCCCTTGGA-  2797
              |  |||| |||||||||||||||   || |||||||| |||||||| ||| | ||| | 
Sbjct  2089  ATCTCAACCTTATGCGGTCCAGGTAAAGATATTTTGTCATGGAAGCTACATTCTTTGCAA  2148

Query  2798  GAATTTTCTTCAGCTAGATGAGAAGTATG-GAATGGTTGAGCAGGTTATGGTTGACATTA  2856
             || ||||||| | | |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct  2149  GA-TTTTCTTGATCCAGATGAGAAGTATGAGA-TGGTTGAGCAAGTTATGGTTGAC-TTA  2205

Query  2857  -CAAACCAGGTTGGAATCGATATTAA-CTTGGCAGCTAGCCATGATTGGTTCTTTT-CTC  2913
              |||| || ||||||||||| ||||| || ||| || |||||||| ||| | |||| |||
Sbjct  2206  ACAAATCAAGTTGGAATCGACATTAATCT-GGCTGCGAGCCATGAATGGCT-TTTTGCTC  2263

Query  2914  CTTTACAGTTCATTTCTGGACTTGGGCCTCGGAAAGCTGCATCCTTGCAGAGGTCGCTTG  2973
             ||||||||||  |||| || ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct  2264  CTTTACAGTTTGTTTCAGGGCTTGGCCCTAGGAAAGCTGCATCTTTGCAGAGGTCTCTTG  2323

Query  2974  TAAGAGCTGGTTCAATCTTTGTCCGCAAGGACCTGATAA-TGCATGGACTTGGTAAAAAG  3032
             | ||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| 
Sbjct  2324  TTAGATCTGGTTCGATATTTGTCCGCAAGGAACTGATAAAT-CATGGGCTTGGTAAAAAA  2382

Query  3033  GTTTTTGTAAATGCTGCCGGTTTCTTGCGCATCCGCAGAAGTGGGCTGGCT-GCTAGTAG  3091
              |||| |||||||| || |||||||| || || || || |||||| ||||| | ||||||
Sbjct  2383  CTTTTCGTAAATGCAGCTGGTTTCTTACGGATTCGTAGGAGTGGGTTGGCTTG-TAGTAG  2441

Query  3092  CAGTCAATTTATTGACTTATTGGATGACACCAGAATCCATCCAGAGTCGTATAGTCTTGC  3151
             ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||  |||||||
Sbjct  2442  CAGCCAATTTATTGACTTGTTGGATGACACTAGAATACATCCGGAATCATACGGTCTTGC  2501

Query  3152  TCAAGAATTGGCGAAAGATATATATGA-TGAGGATGTCAGAGGTGATTCAAATGATGATG  3210
              |||||||||||||||||| | ||| | | | |||  | |   | |   | ||||||| |
Sbjct  2502  GCAAGAATTGGCGAAAGATGTTTAT-ACTCATGATA-CTG---TAAG--AGATGATGAGG  2554

Query  3211  AGGATGCGATAGAAATGGCTATTGAGCATGTGAGAGATCG-GCCAGCTTCTTTGAG-AAA  3268
             | ||||| ||||| ||||| || ||| |||| |||||| | ||||||||||||||| |||
Sbjct  2555  ATGATGCAATAGAGATGGCGATAGAGTATGTAAGAGAT-GAGCCAGCTTCTTTGAGGAAA  2613

Query  3269  AGTTGTCCTTGATGAATATCTTGCCA-GCAAGAAACGGGAGAATAAGAAGGAAACTTATA  3327
             | | || |||||||| ||| |||  | ||||||| |  ||||||||||||||||||||||
Sbjct  2614  A-TCGTTCTTGATGAGTAT-TTGAGAAGCAAGAACCAAGAGAATAAGAAGGAAACTTATA  2671

Query  3328  GCAATATCATAAGAGAATTAAGTTGTGGTTTCCAGGATTGGCGGA-TACCATTTAAAGAG  3386
             |   |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| | | |  |||||||||
Sbjct  2672  GTTTTATCATGAGAGAATTAAGCTGTGGTTTTCAGGATTGGCGAAGT-CTGTTTAAAGAG  2730

Query  3387  CCA-AGTCCAGATGAAGAATTTTACATGATTTCAGGTGAAACTGAGGACACCATAGCG-G  3444
                 | |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  | || || || | | |
Sbjct  2731  GTTGA-TCCAGATGAAGAGTTTTATATGATTTCTGGTGAAACCAAAGAAACTATTG-GTG  2788

Query  3445  A-GGGCAGAATTGTCCAGGCCAGTGTTCGGAGA-T-TGCAGAATGG-AAGAGCCATATGT  3500
             | ||| |||||||| ||||||| ||||  || | | | || | ||| || ||||| ||||
Sbjct  2789  AAGGG-AGAATTGTGCAGGCCACTGTTAAGAAAGTAT-CA-AGTGGTAA-AGCCAAATGT  2844

Query  3501  GTATTAGATTCTGGGTTAACTGGGATGCT-TATGAAGGAAGATTTCTCAGATGATGGGAG  3559
             |||||||||| ||| ||| ||||||| || | | |||||||||| ||| |||||||| ||
Sbjct  2845  GTATTAGATTGTGGATTACCTGGGATTCTCT-TAAAGGAAGATTACTCGGATGATGGTAG  2903

Query  3560  AGATATTGTTGACTTGGCGGACCAGCTGAAAGAAGGCGATATCCTCACATGCAAGATCAA  3619
             |||||| ||||| ||  |  || | |||   |||||| ||||| |||| |||||||||||
Sbjct  2904  AGATATCGTTGATTTATCAAACAAACTGTGTGAAGGCTATATCGTCACTTGCAAGATCAA  2963

Query  3620  ATCGATTCAAAAGCAGAGGTATCAAGTGTTCCTTATTTGCAAAGAAAGTGAAATGAGAAA  3679
             ||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||
Sbjct  2964  ATCAATTCTAAAGCAAAGGTATCATGTGTTACTTGTCTGCAAAGAAAGCGAAATGAGAAA  3023

Query  3680  CAACAGACACCAGCATAACCAGAATGTGGATGCAT-ATTACCATGAGGAT-A--GAAACA  3735
              |||||  |  | | |  || | |||| |||| || ||||||| |||||  |  |||| |
Sbjct  3024  GAACAGG-A--ATC-T--CCGGGATGTCGATG-ATTATTACCACGAGGAGGAACGAAAAA  3076

Query  3736  GTCTCCAGCTTGTA-AAAGAGAAGGCTCG-AAAGGAAAAAGAGCTGGTGAGGAAGCATTT  3793
              | ||| | | | | |||||||| || |  |||| |    ||       || ||||| ||
Sbjct  3077  ATGTCCTGATAG-AGAAAGAGAAAGCCCCTAAAG-A----GA-------AG-AAGCAGTT  3122

Query  3794  TAAGTCTCGGATGATTGTCCATCCCCGCTTTCAGAATATCACAGCTGACCAAGCAACAGA  3853
             |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||| 
Sbjct  3123  TAAGTCTCGGATGATTGTTCATCCTCGGTTTCAGAACATCACTGCTGAGCAAGCAACAGG  3182

Query  3854  GTATTTGTCTGACAAAGACT-TTGGAGAAAGCATTGTTCGTCCAAGTTCTCGAGGACTCA  3912
             |||||||||| | || || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |
Sbjct  3183  GTATTTGTCTTATAA-GAATATTGGAGAAAGCATTGTTCGTCCAAGCTCACGAGGACTGA  3241

Query  3913  A-CTTTTTAACTTTGACCCTCAAGATTTAT-GATGGA-GTTTACGCTCACAAGGAGATAG  3969
             | | | | | ||||||   ||||||||| | |||  | || || ||| ||||||||||| 
Sbjct  3242  ATCATCTGA-CTTTGATGATCAAGATTT-TCGATA-ATGTGTATGCTAACAAGGAGATAA  3298

Query  3970  -CTGAAGGTGGGAAAGAAAACAAGGACATTACA-AGCCTACAGTGTATTGGGAAGACCCT  4027
              | ||||||| ||| || ||||||||||| |   ||| ||||  |||||||||| ||  |
Sbjct  3299  TC-GAAGGTGAGAAGGAGAACAAGGACAT-AGTGAGCTTACAACGTATTGGGAAAACATT  3356

Query  4028  GACAATTGGAGAG-GACACCTTCGAGGATCTAGATGAGGTCATGGATCGATATGTTGATC  4086
             || |||||| ||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct  3357  GAAAATTGG-GAATGAAACCTTCGAGGATCTAGATGAGGTAATGGATCGGTATGTTGATC  3415

Query  4087  CTTTGGTATCTCATCTTAAGACAATGCTCAACTATCGGAAATTCCGTAAGGGGACCAAA-  4145
             |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| || |  ||||| ||| 
Sbjct  3416  CTTTGGTAACTCATCTTATGACAATGCTAAACTACCGCAAATTTCGGACTGGGAC-AAAG  3474

Query  4146  TCAGAAGTAGATGATCTTCTTAGGATCGAGAAGGGCGAAAATCCTTCAA-GAATAGTTTA  4204
             || ||| |||||||||||||| || | |||||||||| ||||||   || |  |||||||
Sbjct  3475  TCGGAAATAGATGATCTTCTTCGGGTTGAGAAGGGCGTAAATCCGAAAATGG-TAGTTTA  3533

Query  4205  TTGTTTTGG-GATTTCACACGAACATCCAGGCA-CTTT-TATTCTGTCTTACATAAGGAG  4261
               ||||||| | |||| || ||||||||||| | |||| ||||  |||||||||| | | 
Sbjct  3534  CAGTTTTGGTG-TTTCGCATGAACATCCAGGGAGCTTTATATT--GTCTTACATACG-AT  3589

Query  4262  CA-CAAACCCACATCATGAGTATATAGGTTTATATCCCAA-GGGATTTAAGTTCAGGAAA  4319
             |  ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||
Sbjct  3590  CCGCAAACCCGCACCATGAGTATATCGGTTTATA-CCCAAAGGGATTCAAGTTCAGGAAA  3648

Query  4320  AGGATGTTTG-AGGA-CATTGATCGGCTTG-TGGCATACTTCCAGAGGCATATTGATGA  4375
             || ||||||| || | | |||||  ||||| || | || ||| |||| ||| |||||||
Sbjct  3649  AGAATGTTTGGAG-ATC-TTGATAAGCTTGCTG-CTTATTTCAAGAGACATGTTGATGA  3704



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 203037151955


  Database: halleri_transcript_ahg.fa
    Posted date:  Sep 25, 2014  2:02 AM
  Number of letters in database: 38,939,717
  Number of sequences in database:  32,672



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5