BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G65580.1
Length=3729
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg475657 jgi|Araly1|475657|fgenesh2_kg.2__787__AT1G65580.1 5758 0.0
> Ahg475657 jgi|Araly1|475657|fgenesh2_kg.2__787__AT1G65580.1
Length=3660
Score = 5758 bits (3118), Expect = 0.0
Identities = 3482/3655 (95%), Gaps = 36/3655 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 79 TTTG-TACCGAAAAACTCGTCGTCTCTCTCTGCTCCAAGTAAAAGCTTCAAGTCCAATAC 137
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 19 TTTGCTACCGAAAAACTCGTCGTCTCTCTCTGCTCCAAGTAAAA-CTTCAAGTCCATTAC 77
Query 138 TCATGGAAGATCGTCAAAACGATCAAAACGATGACGTTTTCTCCTTC-T-TCT-CTCC-T 193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |
Sbjct 78 TCATGGAAGATCGTCAAAACGATCAAAACGATGACGTTTTCTCCTTCTTCTCTCCTCCTT 137
Query 194 -----TC--C-TTCTCCGCCGCAACTCCGTCCACGCTTTTCAACCGTTCAGCTTACTCCT 245
|| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 138 ACGAATCTACTTTCTCCGCCGCGACTCCATCCACGCTTTTCAACCGTTCAGCTTACTCCT 197
Query 246 CTTCATCTTCCTCCGGCGACGATGAATCTCAGCCTTCCGTCGACGACAGCAACAAACGTA 305
| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 198 CCTCGTCTTCCTCCGGCGACGATGAATCTCAGCCTTCCGTTGACGACAGCAACAAACGAA 257
Query 306 TCGATTACATGATCCAATTTCTCGACCGGAGACTAAGCGAAGACGGTAATCACGACGGGA 365
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 258 TCGATTACATGATCCAATTTCTAGACCGGAGACTAAGCGAAGACGGTAACCACGACGGGA 317
Query 366 TCGGTGATGGAAACGGCTCCGATTCGTTACCGGAATTTGTTGGTAAGTGTGGTGAATCTG 425
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 318 TCGGTGATGGAAACGGCTCCGATTCGCTACCGGAAATTGTTGGTAAGTGTGGTGAATCTG 377
Query 426 GGATCTTCAAAGTTCCGATTAGGTCAGCGGTTCATCCGAATCGACCACCTAGTCTTGATG 485
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 378 GGATCTTTAAAGTTCCGATTAGGTCAGCGGTTCATCCGAATCGACCACCGAGTCTTGATG 437
Query 486 TGAGACCTCATCCATTGAGAGAAACTCAAATTGGGAGGTTTTTGAGGACAATGACTAGTA 545
||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 438 TGAGACCTCATCCGTTGAGAGAAACTCAACTTGGGAGGTTTTTGAGGACGATGACTAGTA 497
Query 546 CTGAGAGACAGTTATGGACTGGTGGTGAGGATGGTGCGTTGAGAGTTTGGGAGTTTAGTG 605
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 498 CTGAGAGACAATTATGGACTGGAGGTGAGGATGGTGCGTTGAGAGTTTGGGAGTTTAGTG 557
Query 606 AATTGTATGGAAGTGGGAGGGGATTAGAGGTAGAGGATACGGCGCCGTATAAGGAGAGTT 665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 558 AATTGTATGGAAGTGGGAGGGGATTAGAGGTAGAGGATACGGCGCCGTATAAGGAGAGTT 617
Query 666 TAGGGAATGAGTTTGGGTCTGCTGCTGTTGTTTGTATGATTGGTGATGAAGGTAGTAGAG 725
||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 618 TAGGGAATGAGATTGGG--T-CTGCTGTTGTTTGTATGATTGGTGATGAAGGTAGTAGAG 674
Query 726 TTGTTTGGAGTGGACATAGAGATGGGAGGATTAGGTGTTGGAGATTGAGAGGTGATCATG 785
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 675 TTGTTTGGAGTGGGCATAGAGATGGGAGGATTAGGTGTTGGAGATTGAGAGGTGATCATG 734
Query 786 GTATTGAAGAAGCTTTGTCATGGCAAGCTCATCGTGGTCCGGTTCTCTCCATTGCCATTT 845
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 735 GTATTGAAGAAGCTTTGTCGTGGCAAGCTCATCGTGGTCCGGTTCTCTCCATTGCCATTT 794
Query 846 CGGCTTATGGAGATATATGGTCAGGGTCTGAGGGAGGTGCTCTTAAAGTTTGGCCCTGGG 905
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 795 CGGCTTATGGAGATATATGGTCAGGGTCTGAGGGAGGCGCTCTTAAAGTTTGGCCCTGGG 854
Query 906 ACGGTGCTCTTGGGAAGTCGCTTTCTTTGAAGATGGAAGAAAGGCACATGGCTGCGTTAG 965
|| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 855 AC---GCTCTTGGGAAGTCTCTCTCTTTGAAGATGGAAGAAAGGCACATGGCTGCGTTAT 911
Query 966 CAGTTGAAAGATCGTATATTGACCCTAGGAACATGGTTTCGGCCAATGGATTTGCTAATA 1025
| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 912 CTGTAGAGAGATCGTATATTGACCCTAGGAACATGGTTTCAGCCAATGGATTTGCTAATA 971
Query 1026 CATTAACGTCAGATGTTACATTCCTAGTATCTGATCATACAAGGGCAAGAGTATGGAGTG 1085
|||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 972 CATTAACGTCAGATGTGACATTCCTTTTATCTGATCATACAAGGGCAAGAGTATGGAGTG 1031
Query 1086 CTAGTCCCCTGACGTTTGCTATATGGGATGCTCGCACTAGGGATTTGATCAAAGTATTCA 1145
|||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032 CTAGTCCCCTAACGTTTGCTTTATGGGATGCTCGCACTAGGGATTTGATCAAAGTATTCA 1091
Query 1146 ATATTGATGGGCAGCTCGAGAATCGACCTGAAAATTCTGTATATCCTGATTTTGGGAGTG 1205
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1092 ATATTGATGGGCAGCTCGAGAATCGAACTGAAAATTCTGTATATCCTGATTTTGGGAGTG 1151
Query 1206 AGGAAGAGGGGAAGATGAAGGTAACTGCTTCCAAA-AAAGAGAAAGCTCAATCTTCTCTT 1264
|||||||||| |||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 1152 AGGAAGAGGGCAAGATGAAAATAACTGCTT-CAAAGAAGGAGAAAGCTCAATCTTCTCTT 1210
Query 1265 GGTTTCTTTCAGCGGTCTCGTAATGC-CATTATGGGAGCAGCTGATGCTGTTCGTCGTGC 1323
|||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1211 GGTTTCTTTCAGCGGTCTCGTAATGCTC-TTATGGGAGCAGCTGATGCTGTTCGTCGTGC 1269
Query 1324 TGCAACGAAAGGAGGGTTTTGTGATGATAGTAGGAAAACTGAGGCTATTGTCATATCAGT 1383
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1270 TGCAACGAAAGGGGGGTTTTGTGATGATAGTAGGAAAACTGAGGCTATTGTCATATCAGT 1329
Query 1384 TGATGGAATGATTTGGACAGGAAGTTCAAATGGTATACTTATGCGATGGGACGGAAATGG 1443
||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1330 TGATGGACTTATTTGGACAGGAAGTTCAAATGGCGTACTTATGCGATGGGATGGAAATGG 1389
Query 1444 TAATTGCTTGCAAGAGTTCGCATACGAGTCCTCTGGTATTCTCTGCATGTTCACTTTTTG 1503
||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 1390 TAATTGCTTGCAAGAGTTCTCATACCAGTCCTCTGGTATTCTGTGCATGTTCACTTTCTG 1449
Query 1504 TTCTCGACTGTGGGTTGGTTATTCCAACGGCACTGTTCAAGTATGGGACCTTGAGGGAAA 1563
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 1450 TTCTCGACTGTGGGTTGGTTATTCCAACGGCACTGTTCAGGTATTGGACCTTGAGGGAAA 1509
Query 1564 GCTGCTTGGTGGATGGGTAGCTCATAGTGGACCTGTAATAAAAATGGCTATCGGGGCTGG 1623
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1510 GCTGCTTGGTGGATGGGTAGCTCATAGTGGACCTGTAATAAAAATGGCTATCGGGGCTGG 1569
Query 1624 TTATTTATTTACCCTTGCAAATCATGGAGGTATTCGTGGATGGAATGTTACTTCTCCTGG 1683
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1570 TTATTTATTCACCCTTGCAAATCATGGAGGTATTCGTGGATGGAATGTTACTTCTCCTGG 1629
Query 1684 GCCCCTTGACAATGTACTGCGGGCCGAGTTGGCTGGGAAAGAATTTTTATATTCAAGGAT 1743
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1630 GCCCCTTGACAATGTACTGCGGGCCGAGTTGGCTGGGAAAGAATTTTTATATTCAAGGAT 1689
Query 1744 AGAGAATCTGAAAATATTAGCTGGTACGTGGAATGTTGGAGAGGGGAGAGC-ATCAACCG 1802
|||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||
Sbjct 1690 AGAGAATCTGAAAATACTAGCTGGTACATGGAATGTTGGAGAGGGCAGAGCGA-CAACCG 1748
Query 1803 ACTCACTTGTATCTTGGCTAGGCTGTGCTGCAACTGGAGTTGAGATTGTAGTTGTTGGAC 1862
|||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1749 ACTCACTTATATCTTGGCTAGGTTGTACTGCAACTGGAGTTGAGATCGTAGTTGTTGGAC 1808
Query 1863 TGCAAGAAGTTGAAATGGGAGCAGGAGTTCTTGCAATGTCCGCAGCAAAAGAAACGGTGG 1922
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1809 TGCAAGAAGTTGAAATGGGAGCAGGAGTGCTTGCAATGTCCGCAGCAAAAGAAACAGTGG 1868
Query 1923 GACTTGAGGGTAGTCCGCTTGGTCAGTGGTGGCTGGATATGATCGGGAAAACTTTGGATG 1982
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1869 GACTTGAGGGTAGTCCACTTGGTCAGTGGTGGCTGGATATGATTGGGAAAACTTTGGATG 1928
Query 1983 AGGGTTCATCGTTTGTTCGTGTTGGCTCTAGGCAACTGGCAGGGTTGCTCATTTGTGTAT 2042
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1929 AGGGTTCATCGTTTGTTCGTGTGGGTTCTAGGCAACTGGCAGGGTTGCTCATTTGTGTAT 1988
Query 2043 GGGTTAGACATGACCTTAAACCTCACGTGGGGGATGTTGACGCTGCTGCGGTTCCTTGTG 2102
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1989 GGGTTAGACATGACCTTAAACCTTACGTGGGAGATGTTGACGCTGCTGCGGTTCCTTGTG 2048
Query 2103 GTTTTGGACGAGCAATTGGTAACAAGGGTGCTGTAGGTGTGCGACTCAGAATGTATGATC 2162
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2049 GTTTTGGACGAGCAATTGGTAATAAGGGTGCTGTAGGTGTGCGACTCAGAATGTATGATC 2108
Query 2163 GAGTACTGTGCTTTGTAAATTGTCATTTTGCTGCACATCTAGAAGCTGTTAATC-GGCGA 2221
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||
Sbjct 2109 GAGTACTGTGCTTTGTAAATTGTCATTTTGCTGCACATCTAGATGCTGTGAA-CAGGCGA 2167
Query 2222 AATGCTGACTTCGACCATGTTTATCGAACAATGACCTTCTCACGGCAGTCTAGTTCACTC 2281
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2168 AATGCTGACTTTGACCATGTTTATCGAACAATGACCTTCTCACGGCAGTCTAGTTCACTC 2227
Query 2282 AATGCAGGAGTTGCTGGTGCGTCATTTGGTGTTACAATGCCTCGTGGTGGCAATGCTTTG 2341
||||| ||||| ||||| || |||||||||||| || | |||||||||||||||||| |
Sbjct 2228 AATGCGGGAGTCGCTGGCGCATCATTTGGTGTTTCAGTACCTCGTGGTGGCAATGCTACG 2287
Query 2342 GGTGTCAATACAATCGAAGCAAGGCCTGAACTATCTGAGGCAGACATGGTCATATTTCTT 2401
|||||||| | | | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2288 GGTGTCAACATAGTTGAAGCAAGGCCTGAATTATCGGAGGCAGACATGGTCATATTTGTT 2347
Query 2402 GGAGATTTTAATTACCGTTTGGATGATATAACGTATGATGAAACAAGGGATTTCATATCT 2461
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2348 GGAGATTTTAATTACCGTTTGGATGATATAACTTATGATGAAACAAGGGATTTCATTTCT 2407
Query 2462 CAAAGATGTTTTGATTGGCTAAGAGAAAAGGATCAGCTACATACTGAAATGGAAGCTGGG 2521
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2408 CAAAGATGTTTTGATTGGCTAAGAGAAAAAGATCAGCTACATGCTGAAATGGAAGCTGGG 2467
Query 2522 AATGTTTTTCAAGGGATGCGTGAAGCAATTATCAGGTTCCCTCCAACATACAAATTTGAA 2581
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2468 AATGTTTTTCAAGGGATGCGTGAAGCAATTATCAGGTTCCCTCCAACATACAAGTTTGAA 2527
Query 2582 AGGCACCAAGCTGGTCTAGCAGGATATGATTCTGGGGAAAAGAAGCGGATTCCTGCCTGG 2641
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2528 AGGCACCAAGCTGGTCTAGCAGGATATGATTCCGGAGAAAAGAAGCGGATTCCTGCCTGG 2587
Query 2642 TGTGACAGGATTCTATATCGCGATAATAAGAAACATTTGGGAGCTGAGTGCAGTTTGGAT 2701
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2588 TGTGACAGGATTCTATATCGCGATAACAAGAAACATTTGGGAGCTGAGTGCAGTTTGGAT 2647
Query 2702 TGTCCAGTGGTGTCTTCTATATCACAGTATGATGCCTGCATGGAAGTGACAGACAGTGAC 2761
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2648 TGTCCAGTGGTGTCTTCTGTATCACAGTATGATGCCTGCATGGATGTGACAGACAGTGAC 2707
Query 2762 CACAAGCCCGTACGCTGTGTATTTAGTGTCAAGATTGCCCGGGTTGATGAGTCAGTCAGG 2821
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2708 CACAAGCCCGTCCGCTGTGTATTTAGTGTCAAGATTGCCCGGGTTGATGAGTCTGTCAGA 2767
Query 2822 AGACAAGAATATGGGAACATCATAAACTCGAATAAGAAAATCAAGGTCTTGCTTGGAGAG 2881
|||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 2768 AGACAAGAATTTGGGAGCATCATAAACTCGAATAAGAAAATCAAAGTTTTGCTTGGAGAG 2827
Query 2882 TTAAGCAAGGTTCCAGAAACAATTGTCAGCACCAATAATATTATTCTCCAAAATCAGGAT 2941
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2828 TTAAGCAAGGTTCCAGAAACAATTGTCAGCACCAATAATATTATTCTCCAAAATCAGGAT 2887
Query 2942 TCAACTATCCTGCGTATCACAAATAAGAGTGAGAAGAACATCGCTTTCTTCAAAATAATT 3001
||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2888 TCAACAATTCTGCGTATCACAAACAAGAGTGAGAAGAACATCGCTTTCTTCAAAATAATT 2947
Query 3002 TGTGAAGGTCAATCTAAAATCGAGGAGGACGGTCAGGCACACGACCACCGAGCAAGAGGC 3061
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 2948 TGTGAAGGTCAATCTAACATCGAGGAGGACGGTCAGGCACATGATCACCGAGCAAGAGGC 3007
Query 3062 TCTTTCGGGTTTCCCCAGTGGCTGGAGGTGTCTCCAGGAACTGGCACAATCAAACCAAAC 3121
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3008 TCTTTTGGGTTTCCCCAGTGGCTGGAGGTGTCTCCAGGAACTGGCACAATCAAACCAAAC 3067
Query 3122 CAAATAGCCGAGGTTTCAGTGCATCTGGAAGACTTCCCAACAGTAGAAGAGTTTGTGGAC 3181
|||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3068 CAAATAGCCGAGGTATCAGTCCATCTCGAAGACTTCCCAACAGTAGAAGAGTTTGTAGAC 3127
Query 3182 GGTGTTGCTCAGAACTCTTGGTGTGAAGACACAAGAGACAAGGAAGTCATATTGGTCCTC 3241
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3128 GGTGTTGCACAGAATTCTTGGTGTGAAGACACAAGAGACGAGGAAGTCATATTGGTCCTT 3187
Query 3242 GTGGTCCACGGAAGGTTCTCGACTGAGACAAGAAAGCATAGAATCCGTGTGCGTCACTGC 3301
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3188 GTGGTCCACGGAAGATTCTCGACTGAGACAAGAAAGCATAGAATCCGTGTGCGTCACTGC 3247
Query 3302 CCTCGTGGTGGACCTGCAAAGAACCATTTCAATGATGGAACCAAAACCTCGGGACAAATA 3361
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 3248 CCTCGTGGTGGACCTGCAAAGAACCATTTCAATGATAGACCCAAAACCTCGGGACAAATA 3307
Query 3362 AACGCTCTTCATCGCTCCGATTATCATCAGCTAAGCAATACTCTTGATGTGGTTGAGCAG 3421
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3308 AACGCTCTTCATCGCTCCGATTATCATCAGCTAAGCAATACTCTTGATGTGGTTGAGCAG 3367
Query 3422 CTAAAGAACTTGCACAGTCCATAGAGCCATTTTTAACTGTACAGTGAGACGAACAGAAGG 3481
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3368 CTAAAGAACTTGCACAGTCCATAGAGCCATTTTTAAGTGTACAGTGAGACGAACAGAAGG 3427
Query 3482 AGAAAGCAACCTCGTTGCCGTGTTAAGTAATTGTAACTCGTTTTTGTGTGTTTAATGGGA 3541
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3428 AGAAAGCAACCTCGTTGACGTGTTAAGTAATTGTAACTTGTTTTTGTGTGTTTAATGGGA 3487
Query 3542 AAATTTGTGTGGAATGA---Gaaaa--aaaaaaaTGAAGATTAGCTTCTTACGTTTTTTG 3596
|||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3488 AAATTTGTGTGGAAAAAAAAGAAAATTAAAAAAA-GAAGATTAGCTTCTTACGTTTTTTG 3546
Query 3597 TTTAAGAGGCTAATTACGTTTCTTATGAATGGGA-TATGTTCTACAAGTGTTATTTTATT 3655
|| ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3547 TTAAAGAGGCTAATTACGTTGCTTATGCA-GGGAATATGTTCTACAAGTGTTATTTTGTT 3605
Query 3656 TTATATGTCCGTATGAGTTATGTGTAACACTATTGTATCTAATGATCATTCTGAT 3710
|||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 3606 TTATTTCTCCGTATGAGTAATGTGTAACATTATTGTAACTAATGATCATGCTGAT 3660
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 140889135246
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5