BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT1G66530.1 Length=1991 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg480296 jgi|Araly1|480296|fgenesh2_kg.3__2997__AT1G66530.1 2717 0.0 Ahg475759 jgi|Araly1|475759|fgenesh2_kg.2__889__AT1G66530.1 2713 0.0 Ahg925691 jgi|Araly1|925691|scaffold_201252.1 2560 0.0 Ahg329048 jgi|Araly1|329048|fgenesh1_pm.C_scaffold_7001275 2254 0.0 Ahg904298 jgi|Araly1|904298|Al_scaffold_0003_1426 1565 0.0 Ahg349990 jgi|Araly1|349990|fgenesh1_pg.C_scaffold_6000583 564 1e-159 Ahg935985 jgi|Araly1|935985|scaffold_500176.1 448 1e-124 > Ahg480296 jgi|Araly1|480296|fgenesh2_kg.3__2997__AT1G66530.1 Length=1790 Score = 2717 bits (1471), Expect = 0.0 Identities = 1689/1795 (94%), Gaps = 12/1795 (1%) Strand=Plus/Plus Query 51 TCTGCTTCAATTTCG--ATGGCAACCATTGTAGCTAGTAAAGAATTCACCGGAAATCCAA 108 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| Sbjct 1 TCTGCTTCAATTTCGATATGGCAACCATTGTAGCTAATAAAGAATTTACGGGAAATCCAA 60 Query 109 GACGCCAACTCGCTAAGCTCTTCGATGTGTCGCTTAAGTTAACGGTTCCTGATGAACCTA 168 || | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct 61 GAAGACAACTGGCTAAGCTCTTTGATGTGTCTCTTAAATTAACAGTTCCTGATGAACCTA 120 Query 169 ATGTTGAGCCCTTGATCGAGCCTGGCAAATTTGGAGATTACCAATGTAACAATGCAATGG 228 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 ATGTTGAGCCCTTGATTGAGCCTGGCAAATTTGGAGATTACCAATGTAACAATGCAATGG 180 Query 229 GACTATGGTCTC-TAATTAAAGGAAAGGGTACGCAG-TTCCGTGGTCCTCCCGCTGTTGG 286 |||||||||| | | || |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| Sbjct 181 GACTATGGTC-CATTATCAAAGGAAAGGGTACGCAGTTTAAG-GGTCCTCCCGCTGTTGG 238 Query 287 ACAGGCTCTTATTCAGAGTCTCCCTACTTCTGAGATGGTGGAATCATGCTCTATAGCTGG 346 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 239 ACAGGCTCTTATTAAGAGTCTCCCTACTTCTGAGATGGTGGAATCATGCTCTATAGCTGG 298 Query 347 TCCTGGATTTGTTAATGTTGTACTATCATCTAAGTGGATGGCTAAGAGTATTGAAAATAT 406 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 299 ACCTGGATTTGTTAATGTTGTACTATCGGCTAAGTGGATGGCTAAGAGTATTGAAAATAT 358 Query 407 GCTTGTTGATGGGATTGATACATGGGCACCTACTCTTTCGGTTAAGAGAGCTGTAGTTGA 466 |||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 359 GCTTATCGATGGAATTGATACATGGGCGCCTACTCTTTCAGTTAAGAGAGCTGTAGTTGA 418 Query 467 TTTTTCCTCTCCCAACATTGCTAAAGAAATGCATGTTGGTCATCTTAGATCAACTATCAT 526 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct 419 TTTTTCCTCTCCCAACATTGCTAAAGAAATGCATGTTGGTCATCTAAGATCAACTATTAT 478 Query 527 TGGTGACACTCTAGCTCGCATGCTCGAGTACTCAAAGGTTGAAGTTCTTCGCAGAAACCA 586 ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 479 CGGTGATACGCTTGCTCGTATGCTCGAGTACTCAAAGGTTGAAGTTCTACGCAGAAACCA 538 Query 587 TGTTGGTGACTGGGGAACACAGTTTGGGATGCTAATTGAGTTTCTCTTTGAGAAATTTCC 646 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 539 TGTTGGTGACTGGGGAACACAGTTTGGCATGCTGATTGAGTTTCTCTTTGAGAAATTTCC 598 Query 647 TGATACAGAGAGTGTGACCGAGACAGCTATTGGAGATCTTCAGGTGTTTTAC-AGAGAAT 705 ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| Sbjct 599 TGATACAGATAGTGTGACCGAGACAGCAATTGGAGATCTTCAGATGTTTTACAAGA-AAT 657 Query 706 CAAAATTGAAATTTGATTTGAATCCTGAGTTTAAGGAAAAAGCACAACAGGCTGTGGTCC 765 |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 658 CAAAATTGAAATTTGATTTGGATCCGGAGTTTAAGGAAAAAGCACAACAGGCTGTGGTCC 717 Query 766 GTCTTCAGGGTGGAGATCCTGTTTACCGCCAGGCATGGGCTAAGATTTGCGAAATCAGCC 825 |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct 718 GTCTACAGGGTGGAGATCCTGTTTACCGCAAGGCTTGGGCTAAGATTTGTGAAATCAGCC 777 Query 826 GAAACGAGTTTGCCAAGGTTTACAAACGCCTTCGAATCGAGCTTGAAGAAAAGGGAGAAA 885 ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 778 GAAACGAGTTTGCCAAGGTGTACCAACGCCTTCGAGTCGAGCTTGAAGAAAAGGGAGAAA 837 Query 886 GCTTTTACAACCCTTATATCGCTAACGTAATTGAGGAATTGAGCAGCAAGGGGTTAGTTG 945 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 838 GCTTTTACAACCCTTATATCGCTAACGTAATTGAGGAATTGAGCAGCAAGGGGTTAGTTG 897 Query 946 AAGAAAGTAAAGGTGCTCGTGTGATATTCATTGAAGGCTTTAAAATCCCACTCATTGTTG 1005 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 898 AAGAAAGTAAAGGTGCTCGTGTGATATTCATCGAAGGCTTTAAAGCCCCACTCATTGTTG 957 Query 1006 TAAAGAGTGATGGTGGTTTTAACTATGCCTCAACTGATCTAACTGCTCTTTGGTATCGGC 1065 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 958 TAAAGAGTGACGGTGGTTTTAACTATGCCTCAACAGATCTGACTGCTCTTTGGTATCGGC 1017 Query 1066 TTAATGAAGAGAAAGCTGAGTGGATTATATATGTGACCGACGTTGGCCAGCAGCAGCATT 1125 ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| | Sbjct 1018 TTAATGAAGAGAAAGCTGAGTGGATAATATATTTGACCGACTTTGGCCAGCAGCAGCACT 1077 Query 1126 TTGATATGTTCTTCAAAGCTGCCAGAAAAGCAGGATGGCTTCCAGACGATGATAAAACTT 1185 || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1078 TTCATATGTTCTTCAAAGCTGCCAGAAAAGCAGGCTGGCTTCCAGACGATGATAAAACTT 1137 Query 1186 ACCCTAGAGTTAGCCATGTTGGTTTTGGTCTTGTCCTTGGAGATGATAACAAGCGATTTA 1245 |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1138 ACCCTAGAGTTAATCATGTTGGTTTTGGTCTTGTTCTTGGAGATGATAACAAGCGATTTA 1197 Query 1246 GAACTCGGGCAGCAGAGGTAGTCCGCCTAG-CTGATTTGCTAGATGAGGCCAAGGATCGC 1304 |||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1198 GAACTCGGTCAACAGAGGTAGTCCGCCTAGTC-GATTTACTAGATGAGGCCAAGGATCGC 1256 Query 1305 AGTAAAGCTGCCCTTATTGAGCGCGGTAAGGACAAAGAATGGTCACCCGAGGAGCTGGAC 1364 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1257 AGTAAAGCTGCCCTTATTGAGCGTGGTAAGGACAAAGAATGGACACCCGAGGAGCTGGAC 1316 Query 1365 CAAATAGCTGAGGCAGTTGGATATGGTGCCCTGAAGTATGCTGACCTGAAGACCAACAGA 1424 |||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1317 CAAACAGCTGAGTCAGTTGGATACGGTGCGCTGAAGTATGCTGACCTGAAGACCAACAGA 1376 Query 1425 ATT-ACGGGTTATACTTTTAGCTTTGATCAAATGCTTAATGACAAGGGAGATACAGCCGT 1483 || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1377 -TTGACGGGTTATACTTTCAGCTTTGATCAAATGCTTAATGACAAGGGAGATACAGCCGT 1435 Query 1484 TTACCTTCTCTACGCCCATGCTCGGATCTGCTCAATCATCAGAAAGTCTGGAAAAGACAT 1543 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct 1436 TTACCTTCTTTACGCCCATGCTCGGATCTGCTCAATCATAAGAAAGTCTGGCAAAGACAT 1495 Query 1544 AGATGAGCTAAAAAAGACAGGAAAGATAGCGTTGGATCATGCAGCCGAACGGGCACTAGG 1603 ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct 1496 AGATGAGCTGAAAAAGACAGGAAAGATAGCATTGGATCATGCAGCGGAACGGGCACTGGG 1555 Query 1604 GCTTCACCTGCTTCAGTTTGCTGAGACGGTGGAGGAAGCGTGCACCACATTGTTACCGAA 1663 ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1556 GCTTCACCTACTTCAATTTGCTGAGACGGTGGAGGAAGCATGCACCACATTGTTACCGAA 1615 Query 1664 TGTGCTTTGCAAGTACCTTTACTACTTATCCGAAGAGTTCACCAAATTTTACTCCAATTG 1723 |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct 1616 TGTGCTGTGCAAATACCTTTACTACTTATCTGAAGAGTTCACCAAATTCTACTCCAGTTG 1675 Query 1724 TCAGGTGAATGGTTCGGCCGAGGAGACGAGCCGTCTCTTACTTTGCGAAGCAACGGCTAT 1783 ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||| || |||||||| || || Sbjct 1676 TCAGGTGAATGGTTCAGCAGAGGAGACAAGCCGTCTCCTACTATGTGAAGCAACAGCCAT 1735 Query 1784 AGTCATGCGGAAATGCTTCCACCTTCTTGGAATCACCCCTGTTTACAAGCTTTGA 1838 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1736 AGTCATGCGGAAATGCTTCCACCTTCTTGGAATCACCCCTGTTTACAAGCTTTGA 1790 > Ahg475759 jgi|Araly1|475759|fgenesh2_kg.2__889__AT1G66530.1 Length=1825 Score = 2713 bits (1469), Expect = 0.0 Identities = 1693/1803 (94%), Gaps = 8/1803 (0%) Strand=Plus/Plus Query 63 TCGATGGCAACCATTGTAGCTAGTAAAGAATTCACCGGAAATCCAAGACGCCAACTCGCT 122 |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1 TCGATGGCAACCATTGTAGCTAATAAAGAATTTACGGGAAACCCAAGACGCCAACTCGCT 60 Query 123 AAGCTCTTCGATGTGTCGCTTAAGTTAACGGTTCCTGATGAACCTAATGTTGAGCCCTTG 182 |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 AAGCTCTTTGAGGTGTCTCTTAAATTAACAGTTCCTGATGAACCTAATGTTGAGCCCTTG 120 Query 183 ATCGAGCCTGGCAAATTTGGAGATTACCAATGTAACAATGCAATGGGACTATGGT-CTCT 241 || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct 121 ATTGAGCCTGGAAAATTTGGAGATTACCAATGTAACAATGCAATGGGACTATGGTCCT-T 179 Query 242 AATTAAAGGAAAGGGTACGCAGTTCCGTGGTCCTCCCGCTGTTGGACAGGCTCTTATTCA 301 || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 180 TATCAAAGGAAAGGGTACACAGTTCCGTGGTCCTCCCGCTGTTGGACAGGCTCTTATTAA 239 Query 302 GAGTCTCCCTACTTCTGAGATGGTGGAATCATGCTCTATAGCTGGTCCTGGATTTGTTAA 361 || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 240 GAATCTCCCTAGTTCTGAGATGGTGGAATCATGCTCTATAGCTGGACCTGGATTTGTTAA 299 Query 362 TGTTGTACTATCATCTAAGTGGATGGCTAAGAGTATTGAAAATATGCTTGTTGATGGGAT 421 |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 300 TGTTGTGCTATCAGCTAAGTGGATAGCTAAGAGTATTGAAAATATGCTTGTTGATGGAAT 359 Query 422 TGATACATGGGCACCTACTCTTTCGGTTAAGAGAGCTGTAGTTGATTTTTCCTCTCCCAA 481 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 360 TGATACATGGGCGCCTACTCTTTCGGTTAAGAGAGCTGTAGTTGATTTTTCCTCTCCCAA 419 Query 482 CATTGCTAAAGAAATGCATGTTGGTCATCTTAGATCAACTATCATTGGTGACACTCTAGC 541 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || Sbjct 420 CATTGCTAAAGAAATGCATGTTGGTCATCTAAGATCAACTATTATCGGTGACACGCTTGC 479 Query 542 TCGCATGCTCGAGTACTCAAAGGTTGAAGTTCTTCGCAGAAACCATGTTGGTGACTGGGG 601 ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct 480 TCGTATGCTCGAGTACTCTAAGGTTGAAGTTCTACGTAGAAACCATGTTGGTGACTGGGG 539 Query 602 AACACAGTTTGGGATGCTAATTGAGTTTCTCTTTGAGAAATTTCCTGATACAGAGAGTGT 661 |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 540 AACACAGTTTGGCATGTTGATTGAGTTTCTCTTTGAGAAATTTCCTGATACAGATAGTGT 599 Query 662 GACCGAGACAGCTATTGGAGATCTTCAGGTGTTTTAC-AGAGAATCAAAATTGAAATTTG 720 ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||| Sbjct 600 GACTGAGACAGCAATTGGAGATCTTCAGATGTTTTACAAGA-AATCAAAATTGAGATTTG 658 Query 721 ATTTGAATCCTGAGTTTAAGGAAAAAGCACAACAGGCTGTGGTCCGTCTTCAGGGTGGAG 780 ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 659 ATTTGGATCCGGAGTTTAAGGAAAAGGCACAACAGGCTGTGGTCCGTCTACAGGGTGGAG 718 Query 781 ATCCTGTTTACCGCCAGGCATGGGCTAAGATTTGCGAAATCAGCCGAAACGAGTTTGCCA 840 |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct 719 ATCCTGTTTACCGCAAGGCTTGGGCTAAGATTTGTGAAATCAGCCGAAATGAGTTTGCCA 778 Query 841 AGGTTTACAAACGCCTTCGAATCGAGCTTGAAGAAAAGGGAGAAAGCTTTTACAACCCTT 900 |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 779 AGGTGTACCAACGCCTTCGAGTCGAGCTTGAAGAAAAGGGAGAAAGCTTTTACAACCCTT 838 Query 901 ATATCGCTAACGTAATTGAGGAATTGAGCAGCAAGGGGTTAGTTGAAGAAAGTAAAGGTG 960 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| Sbjct 839 ATATCGCTAACGTAATTGAGGAATTGAGCAGCAAGGGGTTAGTTGAAGAAAATGAAGGTG 898 Query 961 CTCGTGTGATATTCATTGAAGGCTTTAAAATCCCACTCATTGTTGTAAAGAGTGATGGTG 1020 |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||| Sbjct 899 CTCGTGTGATATTCGTCGAAGGCTTTAACATCCCACTCATGGTTGTAAAGAGTAACGGTG 958 Query 1021 GTTTTAACTATGCCTCAACTGATCTAACTGCTCTTTGGTATCGGCTTAATGAAGAGAAAG 1080 |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 959 GTTTTAACTATGCCTCTACCGATCTGACTGCTCTTTGGTATCGGCTTAATGAAGAGAAAG 1018 Query 1081 CTGAGTGGATTATATATGTGACCGACGTTGGCCAGCAGCAGCATTTTGATATGTTCTTCA 1140 ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| Sbjct 1019 CTGAGTGGATTATATATTTGACCGACCTTGGCCAGCAGCAGCACTTTCATATGTTCTTCA 1078 Query 1141 AAGCTGCCAGAAAAGCAGGATGGCTTCCAGACGATGATAAAACTTACCCTAGAGTTAGCC 1200 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || Sbjct 1079 AAGCTGCCAGAAAAGCAGGCTGGCTTCCAGACGATGACAAAACTTACCCTAGAGTTAACC 1138 Query 1201 ATGTTGGTTTTGGTCTTGTCCTTGGAGATGATAACAAGCGATTTAGAACTCGGGCAG-CA 1259 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1139 ATGTTGGTTTTGGTCTTGTCCTTGGAGCTGATAACAAGCGATTTAGAACTCGGGCAAAC- 1197 Query 1260 GAGGTAGTCCGCCTAGCTGATTTGCTAGATGAGGCCAAGGATCGCAGTAAAGCTGCCCTT 1319 ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1198 GAGGTAGTCCGACTAGTTGATTTGCTAGATGAGGCCAAGGATCGCAGTAAAGCTGCCCTT 1257 Query 1320 ATTGAGCGCGGTAAGGACAAAGAATGGTCACCCGAGGAGCTGGACCAAATAGCTGAGGCA 1379 |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1258 ATTGAGCGAGGTAAGGACAAAGAATGGACACCTGAGGAGCTGGACCAAATAGCTGAGGCA 1317 Query 1380 GTTGGATATGGTGCCCTGAAGTATGCTGACCTGAAGACCAACAGAATT-ACGGGTTATAC 1438 |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct 1318 GTTGGATACGGTGCGCTGAAGTTTGCTGACCTGAAGACCAACAGA-TTGACGGGTTATAC 1376 Query 1439 TTTTAGCTTTGATCAAATGCTTAATGACAAGGGAGATACAGCCGTTTACCTTCTCTACGC 1498 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1377 TTTCAGCTTTGATCAAATGCTTAATGACAAGGGAGATACAGCCGTTTACCTTCTTTACGC 1436 Query 1499 CCATGCTCGGATCTGCTCAATCATCAGAAAGTCTGGAAAAGACATAGATGAGCTAAAAAA 1558 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1437 CCATGCTCGGATCTGCTCAATCATAAGAAAGTCTGGCAAAGACATAGATGAGCTAAAAAG 1496 Query 1559 GACAGGAAAGATAGCGTTGGATCATGCAGCCGAACGGGCACTAGGGCTTCACCTGCTTCA 1618 ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1497 GACAGGAAAGATAGCATTGGATCATGCAGCGGAACGGGCACTGGGGCTTCACCTGCTTCA 1556 Query 1619 GTTTGCTGAGACGGTGGAGGAAGCGTGCACCACATTGTTACCGAATGTGCTTTGCAAGTA 1678 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct 1557 ATTTGCTGAGACGGTTGAGGAAGCGTGCACCACATTGTTACCGAACGTGCTGTGCAAGTA 1616 Query 1679 CCTTTACTACTTATCCGAAGAGTTCACCAAATTTTACTCCAATTGTCAGGTGAATGGTTC 1738 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1617 CCTTTACTACTTATCCGAAGAGTTCACCAAATTCTACTCCAATTGTCAGGTGAATGGTTC 1676 Query 1739 GGCCGAGGAGACGAGCCGTCTCTTACTTTGCGAAGCAACGGCTATAGTCATGCGGAAATG 1798 || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1677 AGCAGAGGAGACAAGCCGTCTCTTACTTTGCGAAGCAACGGCTATAGTCATGCGGAAATG 1736 Query 1799 CTTCCACCTTCTTGGAATCACCCCTGTTTACAAGCTTTGATGCTTGACAATGAACCTAAC 1858 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||| ||| | Sbjct 1737 CTTCTACCTTCTTGGAATCACCCCTGTTTACAAGCTTTGATCCATCATAATGAAACTACC 1796 Query 1859 CAA 1861 ||| Sbjct 1797 CAA 1799 > Ahg925691 jgi|Araly1|925691|scaffold_201252.1 Length=1913 Score = 2560 bits (1386), Expect = 0.0 Identities = 1630/1747 (93%), Gaps = 19/1747 (1%) Strand=Plus/Plus Query 115 AACTCGCTAAGCTCTTCGATGTGTCGCTTAAGTTAACGGTTCCTGATGAACCTAATGTTG 174 |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct 179 AACTCGCTAAGCTCTTTGAGGTGTCTCTTAAATTAACTGTTCCTGATGAACCTAACGTTG 238 Query 175 AGCCCTTGATCGAGCCTGGCAAATTTGGAGATTACCAATGTAACAATGCAATGGGACTAT 234 |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 239 AGCCCTTGATTGAGCCTGCCAAATTCGGAGATTACCAATGTAACAATGCAATGGGACTAT 298 Query 235 GGTCTC-TAATTAAAGGAAAGGGTACGCAGTTC-CGTGGTCCTCCCGCTGTTGGACAGGC 292 |||| | | ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| Sbjct 299 GGTC-CATTATTAAAGGAAAGGGTACACAGTTCAAG-GGTCCTCCCGCTGTTGGACAGGC 356 Query 293 TCTTATTCAGAGTCTCCCTACTTCTGAGATGGTGGAATCATGCTCTATAGCTGGTCCTGG 352 ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 357 TCTTATTAAGAATCTCCCTAGTTCTGAGATGGTGGAATCATGCTCTATAGCTGGACCTGG 416 Query 353 ATTTGTTAATGTTGTACTATCATCTAAGTGGATGGCTAAGAGTATTGAAAATATGCTTGT 412 |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | Sbjct 417 ATTTGTTAATGTTGTACTATCAGCTAAGTGGATAGCTAAGAGTATTGAAAATATGCTTAT 476 Query 413 TGATGGGATTGATACATGGGCACCTACTCTTTCGGTTAAGAGAGCTGTAGTTGATTTTTC 472 ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 477 CGATGGAATTGATACATGGGCGCCTACTCTTTCTGTTAAGAGAGCTGTAGTTGATTTTTC 536 Query 473 CTCTCCCAACATTGCTAAAGAAATGCATGTTGGTCATCTTAGATCAACTATCATTGGTGA 532 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 537 CTCTCCCAACATTGCTAAAGAAATGCATGTTGGTCATCTAAGATCAACTATCATTGGTGA 596 Query 533 CACTCTAGCTCGCATGCTCGAGTACTCAAAGGTTGAAGTTCTTCGCAGAAACCATGTTGG 592 || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 597 TACGCTTGCTCGTATGCTCGAGTACTCAAAGGTTGAAGTTCTACGCAGAAACCATGTTGG 656 Query 593 TGACTGGGGAACACAGTTTGGGATGCTAATTGAGTTTCTCTTTGAGAAATTTCCTGATAC 652 ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 657 TGACTGGGGAACACAGTTTGGCATGTTGATTGAGTTTCTCTTTGAGAAATTTCCTGATAC 716 Query 653 AGAGAGTGTGACCGAGACAGCTATTGGAGATCTTCAGGTGTTTTAC-AGAGAATCAAAAT 711 ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| Sbjct 717 AGATAGTGTGACCGAGACAGCAATTGGAGATCTTCAGATGTTTTACAAGA-AATCAAAAT 775 Query 712 TGAAATTTGATTTGAATCCTGAGTTTAAGGAAAAAGCACAACAGGCTGTGGTCCGTCTTC 771 ||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | Sbjct 776 TGAGATTTGATTTGGATCCGGAGTTTAAGGAAAAGGCACAACAGGCTGTGGTCCGTCTAC 835 Query 772 AGGGTGGAGATCCTGTTTACCGCCAGGCATGGGCTAAGATTTGCGAAATCAGCCGAAACG 831 ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct 836 AGGGTGGAGATCCTGTTTACCGCAAGGCTTGGGCTAAGATTTGTGAAATCAGCCGAAATG 895 Query 832 AGTTTGCCAAGGTTTACAAACGCCTTCGAATCGAGCTTGAAGAAAAGGGAGAAAGCTTTT 891 ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 896 AGTTTGCCAAGGTGTACCAACGCCTTCGAGTCGAGCTTGAAGAAAAGGGAGAAAGCTTTT 955 Query 892 ACAACCCTTATATCGCTAACGTAATTGAGGAATTGAGCAGCAAGGGGTTAGTTGAAGAAA 951 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 956 ACAACCCTTATATCGCTAACGTAATTGAGGAATTGAGCAGCAAGGGGTTAGTTGAAGAAA 1015 Query 952 GTAAAGGTGCTCGTGTGATATTCATTGAAGGCTTTAAAATCCCACTCATTGTTGTAAAGA 1011 | |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct 1016 ATGAAGGTGCTCGTGTGATATTCGTCGAAGGCTTTAACATCCCACTCATGGTTGTAAAGA 1075 Query 1012 GTGATGGTGGTTTTAACTATGCCTCAACTGATCTAACTGCTCTTTGGTATCGGCTTAATG 1071 || | |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1076 GTAACGGTGGTTTTAACTATGCCTCTACCGATCTGACTGCTCTTTGGTATCGGCTTAATG 1135 Query 1072 AAGAGAAAGCTGAGTGGATTATATATGTGACCGACGTTGGCCAGCAGCAGCATTTTGATA 1131 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||| Sbjct 1136 AAGAGAAAGCTGAGTGGATTATATATTTGACCGACCTTGGCCAGCAGCAGCACTTTCATA 1195 Query 1132 TGTTCTTCAAAGCTGCCAGAAAAGCAGGATGGCTTCCAGACGATGATAAAACTTACCCTA 1191 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1196 TGTTCTTTAAAGCTGCCAGAAAAGCAGGCTGGCTTCCAGACGATGACAAAACTTACCCTA 1255 Query 1192 GAGTTAGCCATGTTGGTTTTGGTCTTGTCCTTGGAGATGATAACAAGCGATTTAGAACTC 1251 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1256 GAGTTAACCATGTTGGTTTTGGTCTTGTCCTTGGAGCTGATAACAAGCGATTTAGAACTC 1315 Query 1252 GGGCAG-CAGAGGTAGTCCGCCTAGCTGATTTGCTAGATGAGGCCAAGGATCGCAGTAAA 1310 ||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1316 GGGCAAAC-GAGGTAGTCCGACTAGTTGATTTGCTAGATGAGGCCAAGGATCGCAGTAAA 1374 Query 1311 GCTGCCCTTATTGAGCGCGGTAAGGACAAAGAATGGTCACCCGAGGAGCTGGACCAAATA 1370 ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | Sbjct 1375 GCTGCCCTTATTGAGCGAGGTATGGACAAAGAATGGACACCTGAGGAGCTGGACCAAACA 1434 Query 1371 GCTGAGGCAGTTGGATATGGTGCCCTGAAGTATGCTGACCTGAAGACCAACAGAATT-AC 1429 ||||||||||||| ||| |||| | | | ||||||||||||||||||||| || || Sbjct 1435 GCTGAGGCAGTTG-ATACGGTG---T-A--T--GCTGACCTGAAGACCAACAGA-TTGAC 1484 Query 1430 GGGTTATACTTTTAGCTTTGATCAAATGCTTAATGACAAGGGAGATACAGCCGTTTACCT 1489 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1485 GGGTTATACTTTCAGCTTTGATCAAATGCTTAATGACAAGGGAGATACAGCCGTTTACCT 1544 Query 1490 TCTCTACGCCCATGCTCGGATCTGCTCAATCATCAGAAAGTCTGGAAAAGACATAGATGA 1549 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1545 TCTTTACGCCCATGCTCGGATCTGCTCAATCATAAGAAAGTCTGGCAAAGACATAGATGA 1604 Query 1550 GCTAAAAAAGACAGGAAAGATAGCGTTGGATCATGCAGCCGAACGGGCACTAGGGCTTCA 1609 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct 1605 GCTAAAAAAGACAGGAAAGATAGCATTGGATCATGCAGCGGAACGGGCACTGGGGCTTCA 1664 Query 1610 CCTGCTTCAGTTTGCTGAGACGGTGGAGGAAGCGTGCACCACATTGTTACCGAATGTGCT 1669 ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1665 CCTGCTTCAATTTGCTGAGACGGTTGAGGAAGCGTGCACCACATTGTTACCGAACGTGCT 1724 Query 1670 TTGCAAGTACCTTTACTACTTATCCGAAGAGTTCACCAAATTTTACTCCAATTGTCAGGT 1729 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1725 GTGCAAGTACCTTTACTACTTATCCGAAGAGTTCACCAAATTCTACTCCAATTGTCAGGT 1784 Query 1730 GAATGGTTCGGCCGAGGAGACGAGCCGTCTCTTACTTTGCGAAGCAACGGCTATAGTCAT 1789 ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1785 GAATGGTTCAGCAGAGGAGACAAGCCGTCTCTTACTTTGCGAAGCAACAGCTATAGTCAT 1844 Query 1790 GCGGAAATGCTTCCACCTTCTTGGAATCACCCCTGTTTACAAGCTTTGATGCTTGACAAT 1849 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| Sbjct 1845 GCGGAAATGCTTCTACCTTCTTGGAATCACCCCTGTTTACAAGCTTTGATCCATCATAAT 1904 Query 1850 GAACCTA 1856 ||| ||| Sbjct 1905 GAAACTA 1911 > Ahg329048 jgi|Araly1|329048|fgenesh1_pm.C_scaffold_7001275 Length=1773 Score = 2254 bits (1220), Expect = 0.0 Identities = 1601/1782 (90%), Gaps = 37/1782 (2%) Strand=Plus/Plus Query 80 AGCTAGTAAAGAATTCACCGGAAATCCAAGACGCCAACTCGCTAAGCTCTTCGATGTGTC 139 ||||| | |||| || || ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 6 AGCTAATGAAGAGTTTACGGGAAATCTAAAACGCCAACTCGCTAAGCTCTTTGATGTGTC 65 Query 140 GCTTAAGTTAACGGTTCCTGATGAACCTAATGTTGAGCCCTTGAT--C-G----AGC-C- 190 || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | | || | Sbjct 66 TCTAAAATTAACGGTTCCTGATGAACCTAGTGTTGAGCCCTTGGTGGCTGCCTCCGCTCT 125 Query 191 TGGCAAATTTGGAGATTACCAATGTAACAATGCAATGGGACTATGGTCTC-TAATTAAAG 249 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| Sbjct 126 TGGAAAATTTGGAGATTACCAATGTAACAATGCAATGGGACTATGGTC-CATAATTAAAG 184 Query 250 GAAAGGGTACGCAGTTC-CGTGGTCCTCCCGCTGTTGGACAGGCTCTTATTCAGAGTCTC 308 |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| Sbjct 185 GAAAGGGTACTCAGTTCAAG-GGTCCTCCAGCTGTTGGACAGGCCCTTGTTAAGAGTCTC 243 Query 309 CCTACTTCTGAGATGGTGGAATCATGCTCTATAGCTGGTCCTGGATTTGTTAATGTTGTA 368 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||| Sbjct 244 CCTACTTCTGAGATGGTGGAATCATGCTCTGTAGCTGGACCTGGCTTTATTAATGTTGTA 303 Query 369 CTATCATCTAAGTGGATGGCTAAGAGTATTGAAAATATGCTTGTTGATGGGA-TTGATAC 427 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||| || Sbjct 304 CTATCAGCTAAGTGGATGGCTAAGAGTATTGAAAATATGCTCATCAAT-GGAGTTGACAC 362 Query 428 ATGGGCACCTACTCTTTCGGTTAAGAGAGCTGTAGTTGATTTTTCCTCTCCCAACATTGC 487 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 363 ATGGGCACCTACTCTTTCCGTTAAGAGAGCTGTAGTTGATTTTTCCTCTCCCAACATTGC 422 Query 488 TAAAGAAATGCATGTTGGTCATCTTAGATCAACTATCATTGGTGACACTCTAGCTCGCAT 547 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 423 AAAAGAAATGCATGTTGGTCATCTTAGATCAACTATCATTGGTGACACGCTAGCTCGCAT 482 Query 548 GCTCGAGTACTCAAAGGTTGAAGTTCTTCGCAGAAACCATGTTGGTGACTGGGGAACACA 607 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 483 GCTCGAGTACTCAAATGTTGAAGTTCTACGCAGAAACCATGTTGGTGACTGGGGAACACA 542 Query 608 GTTTGGGATGCTAATTGAGTTTCTCTTTGAGAAATTTCCTGATACAGAGAGTGTGACCGA 667 |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct 543 GTTTGGCATGCTAATTGAGTACCTCTTTGAGAAATTTCCTGATACAGATAGTGTGACTGA 602 Query 668 GACAGCTATTGGAGATCTTCAGGTGTTTTACAGAGA-ATCAAAAT-TGAAATTTGATTTG 725 |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||| || Sbjct 603 GACAGCAATTGGAGATCTTCAGGTGTTTTACA-AGGCATCAAAACAT-AAATTTGATCTG 660 Query 726 AATCCTGAGTTTAAGGAAAAAGCACAACAGGCTGTGGTCCGTCTT-CAGGGTGGAGATCC 784 || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| Sbjct 661 GATGAGGACTTTAAGGAAAAAGCACAACAGGCTGTGGTCCGT-TTACAGGGTGGTGATCC 719 Query 785 TGTTTACCGCCAGGCATGGGCTAAGATTTGCGAAATCAGCCGAAAC-GAGTTTGCCAAGG 843 ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||||| | ||||||||||||| Sbjct 720 TGTTTACCGTAAGGCTTGGGCTAAGATCTGTGACATCAGCCGAA-CTGAGTTTGCCAAGG 778 Query 844 TTTACAAACGCCTTCGAATCGAGCTTGAAGAAAAGGGAGAAAGCTTTTACAACCCTTATA 903 ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 779 TTTACCAACGCCTTCGAGTTGAGCTTGAAGAAAAGGGAGAAAGCTTTTACAACCCTTATA 838 Query 904 TCGCTAACGTAATTGAGGAATTGAGCAGCAAGGGGTTAGTTGAAGAAAGTAAAGGTGCTC 963 | ||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||| Sbjct 839 TTGCTAAAGTAATTGAGGAATTGAATAGCAAGGGATTGGTTGAAGAAAGTGAAGGTGCTC 898 Query 964 GTGTGATATTCATTGAAGGCTTTAAAATCCCACTCATTGTTGTAAAGAGTGATGGTGGTT 1023 ||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 899 GTGTGATTTTCCTTGAAGGCTTTGACATCCCACTCATGGTTGTAAAGAGTGATGGTGGTT 958 Query 1024 TTAACTATGCCTCAACTGATCTAACTGCTCTTTGGTATCGGCTTAATGAAGAGAAAGCTG 1083 |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| Sbjct 959 TTAACTATGCCTCAACAGATCTGACTGCTCTTTGGTACCGGCTCAACGAAGAGAAAGCTG 1018 Query 1084 AGTGGATTATATATGTGACCGACGTTGGCCAGCAGCAGCATTTTGATATGTTCTTCAAAG 1143 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| Sbjct 1019 AGTGGATTATATATGTGACCGATGTTGGCCAGCAGCAGCACTTTAATATGTTCTTCAAAG 1078 Query 1144 CTGCCAGAAAAGCAGGATGGCTTCCAGACGATGATAAAACTTACCCTAGAGTTAGCCATG 1203 |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1079 CTGCCAGAAAAGCAGGTTGGCTTCCAGACAATGATAAAACTTACCCTAGAGTTAACCATG 1138 Query 1204 TTGGTTTTGGTCTTGTCCTTGGAGATGATAACAAGCGATTTAGAACTCGGGCAGCAGAGG 1263 ||||||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||||||||| ||| |||| | Sbjct 1139 TTGGTTTTGGTCTCGTCCTCGGGGAAGATGGCAAGCGATTTAGAACTCGTGCAACAGATG 1198 Query 1264 TAGTCCGCCTAGCTGATTTGCTAGATGAGGCCAAGGA-TCGCAGTAAAGCT-GCCCTTAT 1321 |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| || |||||||| Sbjct 1199 TAGTCCGCCTAGTTGATTTGTTAGATGAGGCCAAG-ACTCGCAGTAAA-CTTGCCCTTAT 1256 Query 1322 TGAGCGCGGTAAGGACAAAGAATGGTCACCCGAGGAGCTGGACCAAATAGCTGAGGCAGT 1381 ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||| Sbjct 1257 TGAGCGCGGCAAGGACAAAGAATGGACACCGGAGGAACTGGACCAAACAGCTGAGGCAGT 1316 Query 1382 TGGATATGGTGCCCTGAAGTATGCTGACCTGAAGACCAACAGAATTA-CGGGTTATACTT 1440 |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||| Sbjct 1317 TGGATATGGTGCGGTAAAGTATGCTGACCTGAAGAACAACAGA-TTAACAAATTATACTT 1375 Query 1441 TTAGCTTTGATCAAATGCTTAATGACAAGGGAGATACAGCCGTTTACCTTCTCTACGCCC 1500 | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct 1376 TCAGCTTTGATCAAATGCTTAATGACAAGGGAAATACAGCCGTTTACCTTCTTTACGCTC 1435 Query 1501 ATGCTCGGATCTGCTCAATCATCAGAAAGTCTGGAAAAGACATAGATGAGCTAAAAAAGA 1560 ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| Sbjct 1436 ATGCTCGGATCTGTTCAATCATCAGAAAGTCTGGCAAAGACATAGATGAGCTGAGAAAGA 1495 Query 1561 CAGGAAAGA-TAGCGTTGGATCATGCAGCCGAACGGGCACTAGGGCTTCACCTGCTTC-A 1618 ||||||| | |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| | Sbjct 1496 CAGGAAA-ACTAGCATTGGATCATGCAGATGAACGAGCACTGGGGCTTCACTTGCTTCGA 1554 Query 1619 GTTTGCTGAGACGGTGGAGGAAGCGTGCACCA-CATTGTTACCGAATGTGCTTTGCAAGT 1677 |||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||| ||||| ||| ||| Sbjct 1555 -TTTGCTGAGACGGTTGAGGAAGCTTGCACCAAC-TTGTTACCGAGCGTGCTGTGCGAGT 1612 Query 1678 ACCTTTACTACTTATCCGAAGAGTTCACCAAATTTTACTCCAATTGTCAGGTGAATGGTT 1737 |||| ||| | ||||| ||| | | ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1613 ACCTCTACAATTTATCTGAACACTACACCAGATTCTACTCCAATTGTCAGGTCAATGGTT 1672 Query 1738 CGGCC-GAGGAGACGAGCCGTCTCTTACTTTGCGAAGCAACGGCTATAGTCATGCGGAAA 1796 | || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct 1673 CA-CCAGAGGAGACAAGCCGTCTCCTACTTTGTGAAGCAACGGCCATAGTTATGCGGAAA 1731 Query 1797 TGCTTCCACCTTCTTGGAATCACCCCTGTTTACAAGCTTTGA 1838 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| Sbjct 1732 TGCTTCCACCTTCTTGGAATCACTCCTGTTTACAAGATTTGA 1773 > Ahg904298 jgi|Araly1|904298|Al_scaffold_0003_1426 Length=1740 Score = 1565 bits (847), Expect = 0.0 Identities = 1480/1774 (83%), Gaps = 89/1774 (5%) Strand=Plus/Plus Query 88 AAGAATTCACCGGAAATC-CAAGAC-GCCAACTCGCT-AAGCTCTTCGATGTGTCGCTTA 144 |||||||||| | ||||| || || | || |||| | |||||||| |||| ||| || | Sbjct 17 AAGAATTCACTGAAAATCTGAA-ACAG-CAGCTCG-TGAAGCTCTTTGATGCGTCTCTGA 73 Query 145 AGTTAACGGTTCCTGATGAACCTAATGTTGAGCCCTTGATCGAGCCTGGCAAATTTGGAG 204 | ||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||| | | | ||| ||||| | || Sbjct 74 AATTAACGGTTCCAGATGAACCTAGTGTTAAGCCTTTGGTTGTGGTTGGAAAATTCGAAG 133 Query 205 ATTACCAATGTAACAATGCAATGGGACTATGGTCTCTAA-TTAAAGGAAAGGGTACGCAG 263 |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || Sbjct 134 ATTACCAATGTAACAATGCAATGGGACTATGGTC-CAAAGTTAAAGGAAAGGGTACTCAA 192 Query 264 TTC-CGTGGTCCTCCCGCTGTTGGACAGGCTCTTATT-CAGAGTCTCCCTACTTCTGAGA 321 ||| | | ||||| ||||||| | |||| ||| || || | ||||||||||| ||| | Sbjct 193 TTCAC-TCGTCCTTTAGCTGTTGCAGAGGCCCTTGTTACA-AATCTCCCTACTTGTGATA 250 Query 322 TGGTGGAATCATGCTCTATAGCTGGTCCTGGATTTGTTA-ATGTTGTACTATCATCTAAG 380 |||||| | | || || || | || | ||| | | || | ||| | ||| Sbjct 251 TGGTGG-A--A---TC-AT-GC---T-CT-G--TTG-CACAACCTGGA-TAT-GT-TAA- 290 Query 381 TGGATGGCTAAGAGTATTGAAAATATGCTTGTTGATGGGATTGATACATGGGCACCTACT 440 | | | | |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||| Sbjct 291 T-G-T---T---AGTATTGAAAATATGCTTATCAATGGGATTGAGACATGGGCGCCTACT 342 Query 441 CTTTCGGTTAAGAGAGCTGTAGTTGATTTTTCCTCTCCCAACATTGCTAAAG-AAATGCA 499 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| Sbjct 343 CTTTCAGTTAAGAGAGCTGTAGTTGATTTTTCCTCTCCAAATATTGC-AAAGAAAATGCA 401 Query 500 TGTTGGTCATCTT-AGATCAACTATCATTGGTGACACTC-TAGCTCGCATGCTCGAGTAC 557 |||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||| Sbjct 402 TGTTGGTCAT-TTAAGATCAACTATCATCGGTGACAC-CATAGCTCGTATGCTCGAGTAC 459 Query 558 TCAAAGGTTGAAGTTCTTCGCAGAAACCATGTTGGTGACTGGGGAACACAGTTTGGGATG 617 || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 460 TCTAATGTTGAAGTTCTACGCAGAAACCATGTTGGTGACTGGGGAACACAGTTTGGCATG 519 Query 618 CTAATTGAGTTTCTCTTTGAGAAATTTCCTGATACAGAGAGTGTGACCGAGACAGCTATT 677 ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||| || |||||||| ||| Sbjct 520 TTAATTGAGTACCTCTTTGAGAAATTTCCTGATTCAAATAGTGCGATGGAGACAGCAATT 579 Query 678 GGAGATCTTCAGGT-GTTTTACAGAG-AATCAAAATTGAAATTTGATTTG-A-ATCCT-G 732 | |||| |||| || ||| |||| || ||||||| ||||||||| || | || | | Sbjct 580 GAAGATATTCA-GTCGTTATACA-AGCCATCAAAAACGAAATTTGA--TGCAGAT-TTAG 634 Query 733 AGTTTAAG-GAAAAAGCACAACAGGCTGTGGTCCGTCTTCAGGGTGGAGATCCTGTTTAC 791 | |||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct 635 ACTTTAAGCG-AAAGGCACAACAGGCCGTGGTCCGTCTACAGGGTGGAGATCCTGTATAC 693 Query 792 CGCCAGGCATGGGCTAAGA-TTTGCGAAATCAGCCGAAACGAGTT-TGCCAAGGTTTA-C 848 | | || | | ||| || | |||| |||||||||||| ||| || |||| || |||| | Sbjct 694 CACAAGAC-TTGGCAAAAACTTTGTGAAATCAGCCGAGCCGA-TTATGCCGAGATTTATC 751 Query 849 AAACGCCTTCGAATCGAGCTTGAAGAAAAGGGAGAAAGCTTTTACAACCCTTATATCGCT 908 ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct 752 -AACGCCTTCGAGTTGAGCTTGAAGAAAAGGGAGAAAGCTTTTACAAACCTTATATTGCT 810 Query 909 AACGTAATTGAGGAATTGAGCAGCAAGGGGTTAGTTGAAGAAAGTAAAGGTGCTCGTGTG 968 ||| | ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | |||||||||||| Sbjct 811 AACATGATTGAGGAATTGAATAGCAAGGGTTTGGTTGAAGAAAGTGATGGTGCTCGTGTG 870 Query 969 ATATTCATTGAAGGCTTTAA-AATCCCACT-CATTG-TTGTAAAGAGTGATGGTGGTTTT 1025 || ||||| ||| ||| || ||| ||| | || || |||| |||||||||||||||||| Sbjct 871 ATGTTCATCAAAGACTTCAAGAAT-CCA-TGCA-TGCTTGTTAAGAGTGATGGTGGTTTT 927 Query 1026 AACTATGCCTCAACTGATCTAACTGCTCTTTGGTATCGGCTTAATGAAGAGAAAGCTGAG 1085 | ||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 928 ACCTATGACACAACAGATCTTGCTGCTCTTTGGTATCGGCTTAATGAAGAGAAAGCTGAG 987 Query 1086 TGGATTATATATGTGACCGACGTTGGCCAGCAGCAGCATTTTGATATGTTCTTCAAAGCT 1145 |||||||| |||||||| || | |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| Sbjct 988 TGGATTATTTATGTGACAGATGCTGGCCAGCAGGAGCACTTTGATAGGTTCTTCAAAGCT 1047 Query 1146 GCCAGAAAAGCAGGATGGCTTCCAGACGATGATAAAACTTACCCTAGAGTTAGCCATGTT 1205 || ||| ||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1048 GCTAGACAAGTAGGTTGGCTTCCAGACAATGATGAAACTTACCCTAGAGTTAGCCATGTT 1107 Query 1206 G-GTTTTGGTCTTGTCCTTGGAGATGATAACAAGCGATTTAGAACTCGGGC-AGCAGAGG 1263 |||| ||| | ||| || || ||| |||||| ||||||| ||| | || ||| Sbjct 1108 AAGTTT-GGTGTAGTCAAGGGGGAAGATGGCAAGCGGTTTAGAAATCGCGATAG-AGAAA 1165 Query 1264 TAGTCCGC-CTAGCTGATTTGCTAGATGAGGCCAAGGA-TCGCAGTAAAGCTGCCCTTAT 1321 |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| Sbjct 1166 TAGTCC-CTCTAGCTGATTTGCTAGATGAGGCCAAG-ACTCGCAGTAAAGCTGCCCTTAT 1223 Query 1322 TGAGCGCGGTAAGGACAAAGAATGGTCACCCGAGGAGCTGGACCAAATAGCTGAGGCAGT 1381 |||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | Sbjct 1224 TGAGCGTGCTAAGGAAAAAGAATGGACACCCGAGGAGCTGGACCAAACAGCTGAGGCAAT 1283 Query 1382 TGGATATGGTGCCCTGAAGTATGCTGACCTGAAGACCAACAGAAT-TACGGGTTATACTT 1440 |||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||| | | ||| | ||||| | Sbjct 1284 TGGATATGGTGCGGTGAAGTATGCTGACTTGATGAACAACATA-TCTACAGATTATAAGT 1342 Query 1441 TTAGCTTTGATCAAATGCTTAATGACAAGGGAGATACAGCCGTTTACCTTCTCTACGCCC 1500 | |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| | Sbjct 1343 TCAGCTACGATAAAATGCTTAATGACAAGGGAAATACAGCTGTGTACCTTCTTTACGCTC 1402 Query 1501 ATGCTCGGATCTGCTCAATCATCA-GAAAGTCTGGAAAAGACATAGATGAGCT-AAAAAA 1558 |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1403 ATGCTCGGATCTGCTCAATCATCAAGAA-GTCTGGCAAAGACATAGATGAGCTTAAAAAA 1461 Query 1559 GACAGGAAAGATAGCGTTGGATCATGC-AGCCGAACGGGCACTAGGGCTTCACCTGCTTC 1617 || |||||| |||| ||||| ||||| | ||| | ||||| || ||||| |||||| Sbjct 1462 -ACTGGAAAGTTAGCATTGGACCATGCTAAT-GAAAGAGCACTTGGACTTCATTTGCTTC 1519 Query 1618 AGTTTGCTGAGACGGTGGAGGAAGCGTGCACCACATTGTTACCGAATGTGCTTTGCAAGT 1677 | |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| | | || ||| ||| Sbjct 1520 AATTTGCTGAGACGGTTGAGGAAGCATGCACCAAATTGTTACCGCACATACTGTGCGAGT 1579 Query 1678 ACCTTTACTACTTATCCGAAGAGT-TCACCAAATTTTACTCCAATTGTCAGGTGAATGGT 1736 |||| ||| | ||||| ||| | | | || ||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1580 ACCTCTACGATTTATCTGAACACTAT-ACGAAATTCTACTCCAATTGTCAGGTCAATGGT 1638 Query 1737 TCGGCCGAGGAGACGAGCCGTCTCTTACTTTGCGAAGCAACGGCTATAGTCATGCGGAAA 1796 || || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1639 TCAGCAGAGGAGACAAGCCGTCTCCTACTTTGTGAAGCAACGGCCATAGTCATGCGGAAA 1698 Query 1797 TGCTTCCACCTTCTTGGAATCACCCCTGTTTACA 1830 ||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1699 TGCTTCCACCTTCTTGGAATCACTCCTGTTTACA 1732 > Ahg349990 jgi|Araly1|349990|fgenesh1_pg.C_scaffold_6000583 Length=1254 Score = 564 bits (305), Expect = 1e-159 Identities = 429/489 (88%), Gaps = 8/489 (2%) Strand=Plus/Plus Query 1354 AGGAGCTGGACCAAATAGCTGAGGCAGTTGGATATGGTGCCCTGAAGTATGCTGACCTGA 1413 |||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||| Sbjct 770 AGGAGCTGGACCTAACAGCTGAGGCAATTGGATACAGTGTGGTGAAGTTTGCTGACCTGA 829 Query 1414 AGACCAACAGAATT-ACGGGTTATACTTTTAGCTTTGATCAAATGCTTAATGACAAGGGA 1472 ||| |||||| ||| | |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| Sbjct 830 AGAACAACAG-ATTGTCAAGTTATACTTTCAGCTATGATCAAATGCTTTGTGACAAGGGA 888 Query 1473 GATACAGCCGTTTACCTTC-TCTACGCCCATGCTCGGATCTGCTCAATCATCAGAAAGTC 1531 | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 889 AAAACAGCCGTTTACCTTCAT-TACGCCCATGCTCGGATCTGCTCAATCATCAGAAAGTC 947 Query 1532 TGGAAAAGACATAGATGAGCTAAAAAAGACAGGAAAGATAGCGTTGGATCATGCAGCCGA 1591 ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||| Sbjct 948 TGGCAAAGACATAGATGAGCTGAAAAAGGCAGGAAAGCTAGCATTGGATCATGCAGACGA 1007 Query 1592 ACGGGCACTAGGGCTTCACCTGCTTCAGTTTGCTGAGACGGTGGAGGAAGCGTGCACCAC 1651 ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1008 ACGGGCACTGGGGCTTCACCTGCTTCAATTTGCCGAGACGGTTGAGGAAGCGTGCACCAA 1067 Query 1652 ATTGTTACCGAATGTGCTTTGCAAGTACCTTTACTACTTATCCGAAGAGTTCACCAAATT 1711 | |||||||| | ||| | ||| ||||||| ||| |||||||||| ||| | ||||||| Sbjct 1068 ACTGTTACCGCACGTGGTATGCGAGTACCTCTACGGCTTATCCGAACAGTGCTCCAAATT 1127 Query 1712 TTACTC-CAATTGTCAGGTGAATGGTTCGGCCGAGGAGACGAGCCGTCTCTTACTTTGCG 1770 ||| | |||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||| ||||||| | Sbjct 1128 CTAC-CACAATTGTCAGGTCATTGGTTCAGCAGAGGAGACAAGCCGTCTCCTACTTTGTG 1186 Query 1771 AAGCAAC-GGCTATAGTCATGCGGAAATGCTTCCACCTTCTTGGAATCACCCCTGTTTAC 1829 ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1187 AAGCAACTGGC-ATAGTCATGCGGAAATGCTTCCACCTACTTGGAATCACCCCTGTTTAT 1245 Query 1830 AAGCTTTGA 1838 ||||||||| Sbjct 1246 AAGCTTTGA 1254 > Ahg935985 jgi|Araly1|935985|scaffold_500176.1 Length=1207 Score = 448 bits (242), Expect = 1e-124 Identities = 371/430 (86%), Gaps = 21/430 (5%) Strand=Plus/Plus Query 461 AGTTGATTTTTCCTCTCCCAACATTGCTAAAGAAATGCATGTTGGTCATCTT-AGATCAA 519 ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| Sbjct 418 AGTTGATTTTTCCTCTCCCAACATTGCAAAATAAATACATGTTGGTCATCTTAAGATCAA 477 Query 520 CTATCATTGGTGACACT-CTAGCTCGCATGCTCGAGTACTCAAAGGTTGAAGTTCTTCGC 578 ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 478 CTATCATCGGTGACA-TGCTAGCTCGCATGCTCGAGTACTCAAAGGTTGAAGTTCTACGC 536 Query 579 AGAAACCATGTTGGTGACTGGGGAACACAGTTTGGGATGCTAATTGAGTTTCTCTTTGAG 638 ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| Sbjct 537 AGAAACCATGTTGATGATTGGGGAACAAAGTTTGGCATGCTAATTGAGTACCTCTTTGAG 596 Query 639 AAATTTCCTGATACAGAGAGTGTGACCGAGACAGCTATTGGAGATCTTCA--GGTGTTTT 696 ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || | | | || | |||||||| Sbjct 597 AAATTTCCTGATACAGATAGTGTGATCGAGACAG--AT-GTCGTTTTTGATAGGTGTTTT 653 Query 697 ACAGAGA-ATCAAAATT-GAAATTTGATTTGAATCCTGAGTTTAAGGAAAAAGCACAACA 754 ||| || ||||||| |||||||||| || || || |||||||||| ||||||||| Sbjct 654 ACA-AGGCATCAAAAAAAGAAATTTGATCTGGATGAGGACTTTAAGGAAAGAGCACAACA 712 Query 755 GGCTGTGGTCCGTCTTCAGG-G-----TGGAGATCCTGTTTACCGCCAGGCATGGGCTAA 808 |||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||||| Sbjct 713 AGCTGTGGTCCGTCTACAGGCGCAGGGTGGTGATCCTGTTTACCGTAAGGCTTGGGCTAA 772 Query 809 GATTTGCGAAATCAGCCGAAAC-GAGTTTGCCAAGGTTTA-CAAACGCCTTCGAATCGAG 866 ||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||| Sbjct 773 GATCTGTGAAATCAGCCGAA-CTGAGTTTGCCAAGGTTTATCAA-CGCCTTCGAGTTGAG 830 Query 867 CTTGAAGAAA 876 |||||||||| Sbjct 831 CTTGAAGAAA 840 Score = 327 bits (177), Expect = 1e-88 Identities = 273/317 (86%), Gaps = 15/317 (5%) Strand=Plus/Plus Query 88 AAGAATTCACCGGAAATCCAAGACGCCAACTCGCTAAGCTCTTCGATGTGTCG-CTTAAG 146 ||||||| || ||||||| || |||||||||||| |||||||| | ||||| | || || Sbjct 106 AAGAATTTACGGGAAATCTAAAACGCCAACTCGCGAAGCTCTTGGTTGTGT-GTCTAAAA 164 Query 147 TTAACGGTTCCTGATGAACCTAATGTTGAGCCCTTGAT--C-G----AGC--CTGGCAAA 197 |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | | | || |||| ||| Sbjct 165 TTAACGGTTCCTGATGAACCTAGTTTTGAGCCCTTGGTGGCTGCCTCCGCTGCTGGAAAA 224 Query 198 TTTGGAGATTACCAATGTAACAATGCAATGGGACTATGGTCTC-TAATTAAAGGAAAGGG 256 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| Sbjct 225 TTTGGAGATTACCAATGTAACAATGCAATGGGACTATGGTC-CATAATTAAAGGAAAGGG 283 Query 257 TACGCAGTTCC-GTGGTCCTCCCGCTGTTGGACAGGCTCTTATTCAGAGTCTCCCTACTT 315 ||| |||||| | |||||||| |||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||| Sbjct 284 TACTCAGTTCAAG-GGTCCTCCAGCTGTTGGACTGGCCCTTGTTAAGAGTCTCCCTACTT 342 Query 316 CTGAGATGGTGGAATCATGCTCTATAGCTGGTCCTGGATTTGTTAATGTTGTACTATCAT 375 ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| | | ||||||| ||||||||| Sbjct 343 CTGAGATGGTGGAATCATGCTCTGTAGCTAGACCTGGCTATATTAATGTCGTACTATCAG 402 Query 376 CTAAGTGGATGGCTAAG 392 ||||||||||||||||| Sbjct 403 CTAAGTGGATGGCTAAG 419 Score = 326 bits (176), Expect = 5e-88 Identities = 279/326 (86%), Gaps = 17/326 (5%) Strand=Plus/Plus Query 1069 ATGAAGAGAAAGCTGAGTGGATTATATATGTGACCGAC-GTTGGCCAGCAGCAGCATTTT 1127 |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| | | ||||||| ||||||| || Sbjct 853 ATGAAGAGAAAGCTCAGTGGATGATATATAACACCG-CTGCTGGCCAGGAGCAGCA-CTT 910 Query 1128 GA-TATGTTCTTCAAAGCTGCCAGAAAAGCAGGATGGCTTCCAGACGATGATAAAACTTA 1186 | || ||||||| | | ||||| ||| |||||||||| | |||| |||||||| Sbjct 911 AAGTACGTTCTTC--A------A-AAAAGAAGGTTGGCTTCCAGGCAATGAGAAAACTTA 961 Query 1187 CCCTAGAGTTAGCCATGTTGGTTTTGGTCTTGTCCTTGGAGATGATAACAAGCGATTTAG 1246 ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||| Sbjct 962 CCCTAGAGTTAACCATGTTGGTTTTGGTCTCGTCCTTGGGGAAGATGGCAAGCGATTTAG 1021 Query 1247 AACTCGGGCAGCAGAGGTAGTCCGCCTAGCTGATTTGCTAGATGAGGCCAAGGA-TCGCA 1305 |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||| Sbjct 1022 AACTCGGGCAACAGATGTAGTCCGCCTAGTTGATTTGGTAGATGAGGCCAA-GACTCGCA 1080 Query 1306 GTAAAGC-TGCCCTTATTGAGCGCGGTAAGGACAAAGAATGGTCACCCGAGGAGCTGGAC 1364 ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| Sbjct 1081 GTAAA-CTTGCCCTTATTGAGCGCGGTAAGGACAAAGAATGGACACCAGAGGAACTGGAC 1139 Query 1365 CAAATAGCTGAGGCAGTTGGATATGG 1390 |||| | ||||||||||||||||||| Sbjct 1140 CAAACAACTGAGGCAGTTGGATATGG 1165 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 74847331425 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5