BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G66530.1
Length=1991
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg480296 jgi|Araly1|480296|fgenesh2_kg.3__2997__AT1G66530.1 2717 0.0
Ahg475759 jgi|Araly1|475759|fgenesh2_kg.2__889__AT1G66530.1 2713 0.0
Ahg925691 jgi|Araly1|925691|scaffold_201252.1 2560 0.0
Ahg329048 jgi|Araly1|329048|fgenesh1_pm.C_scaffold_7001275 2254 0.0
Ahg904298 jgi|Araly1|904298|Al_scaffold_0003_1426 1565 0.0
Ahg349990 jgi|Araly1|349990|fgenesh1_pg.C_scaffold_6000583 564 1e-159
Ahg935985 jgi|Araly1|935985|scaffold_500176.1 448 1e-124
> Ahg480296 jgi|Araly1|480296|fgenesh2_kg.3__2997__AT1G66530.1
Length=1790
Score = 2717 bits (1471), Expect = 0.0
Identities = 1689/1795 (94%), Gaps = 12/1795 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 51 TCTGCTTCAATTTCG--ATGGCAACCATTGTAGCTAGTAAAGAATTCACCGGAAATCCAA 108
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||
Sbjct 1 TCTGCTTCAATTTCGATATGGCAACCATTGTAGCTAATAAAGAATTTACGGGAAATCCAA 60
Query 109 GACGCCAACTCGCTAAGCTCTTCGATGTGTCGCTTAAGTTAACGGTTCCTGATGAACCTA 168
|| | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 61 GAAGACAACTGGCTAAGCTCTTTGATGTGTCTCTTAAATTAACAGTTCCTGATGAACCTA 120
Query 169 ATGTTGAGCCCTTGATCGAGCCTGGCAAATTTGGAGATTACCAATGTAACAATGCAATGG 228
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 ATGTTGAGCCCTTGATTGAGCCTGGCAAATTTGGAGATTACCAATGTAACAATGCAATGG 180
Query 229 GACTATGGTCTC-TAATTAAAGGAAAGGGTACGCAG-TTCCGTGGTCCTCCCGCTGTTGG 286
|||||||||| | | || |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||
Sbjct 181 GACTATGGTC-CATTATCAAAGGAAAGGGTACGCAGTTTAAG-GGTCCTCCCGCTGTTGG 238
Query 287 ACAGGCTCTTATTCAGAGTCTCCCTACTTCTGAGATGGTGGAATCATGCTCTATAGCTGG 346
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 239 ACAGGCTCTTATTAAGAGTCTCCCTACTTCTGAGATGGTGGAATCATGCTCTATAGCTGG 298
Query 347 TCCTGGATTTGTTAATGTTGTACTATCATCTAAGTGGATGGCTAAGAGTATTGAAAATAT 406
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 299 ACCTGGATTTGTTAATGTTGTACTATCGGCTAAGTGGATGGCTAAGAGTATTGAAAATAT 358
Query 407 GCTTGTTGATGGGATTGATACATGGGCACCTACTCTTTCGGTTAAGAGAGCTGTAGTTGA 466
|||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 359 GCTTATCGATGGAATTGATACATGGGCGCCTACTCTTTCAGTTAAGAGAGCTGTAGTTGA 418
Query 467 TTTTTCCTCTCCCAACATTGCTAAAGAAATGCATGTTGGTCATCTTAGATCAACTATCAT 526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 419 TTTTTCCTCTCCCAACATTGCTAAAGAAATGCATGTTGGTCATCTAAGATCAACTATTAT 478
Query 527 TGGTGACACTCTAGCTCGCATGCTCGAGTACTCAAAGGTTGAAGTTCTTCGCAGAAACCA 586
||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 479 CGGTGATACGCTTGCTCGTATGCTCGAGTACTCAAAGGTTGAAGTTCTACGCAGAAACCA 538
Query 587 TGTTGGTGACTGGGGAACACAGTTTGGGATGCTAATTGAGTTTCTCTTTGAGAAATTTCC 646
||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 539 TGTTGGTGACTGGGGAACACAGTTTGGCATGCTGATTGAGTTTCTCTTTGAGAAATTTCC 598
Query 647 TGATACAGAGAGTGTGACCGAGACAGCTATTGGAGATCTTCAGGTGTTTTAC-AGAGAAT 705
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||
Sbjct 599 TGATACAGATAGTGTGACCGAGACAGCAATTGGAGATCTTCAGATGTTTTACAAGA-AAT 657
Query 706 CAAAATTGAAATTTGATTTGAATCCTGAGTTTAAGGAAAAAGCACAACAGGCTGTGGTCC 765
|||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 CAAAATTGAAATTTGATTTGGATCCGGAGTTTAAGGAAAAAGCACAACAGGCTGTGGTCC 717
Query 766 GTCTTCAGGGTGGAGATCCTGTTTACCGCCAGGCATGGGCTAAGATTTGCGAAATCAGCC 825
|||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 718 GTCTACAGGGTGGAGATCCTGTTTACCGCAAGGCTTGGGCTAAGATTTGTGAAATCAGCC 777
Query 826 GAAACGAGTTTGCCAAGGTTTACAAACGCCTTCGAATCGAGCTTGAAGAAAAGGGAGAAA 885
||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 778 GAAACGAGTTTGCCAAGGTGTACCAACGCCTTCGAGTCGAGCTTGAAGAAAAGGGAGAAA 837
Query 886 GCTTTTACAACCCTTATATCGCTAACGTAATTGAGGAATTGAGCAGCAAGGGGTTAGTTG 945
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 838 GCTTTTACAACCCTTATATCGCTAACGTAATTGAGGAATTGAGCAGCAAGGGGTTAGTTG 897
Query 946 AAGAAAGTAAAGGTGCTCGTGTGATATTCATTGAAGGCTTTAAAATCCCACTCATTGTTG 1005
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 898 AAGAAAGTAAAGGTGCTCGTGTGATATTCATCGAAGGCTTTAAAGCCCCACTCATTGTTG 957
Query 1006 TAAAGAGTGATGGTGGTTTTAACTATGCCTCAACTGATCTAACTGCTCTTTGGTATCGGC 1065
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 958 TAAAGAGTGACGGTGGTTTTAACTATGCCTCAACAGATCTGACTGCTCTTTGGTATCGGC 1017
Query 1066 TTAATGAAGAGAAAGCTGAGTGGATTATATATGTGACCGACGTTGGCCAGCAGCAGCATT 1125
||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |
Sbjct 1018 TTAATGAAGAGAAAGCTGAGTGGATAATATATTTGACCGACTTTGGCCAGCAGCAGCACT 1077
Query 1126 TTGATATGTTCTTCAAAGCTGCCAGAAAAGCAGGATGGCTTCCAGACGATGATAAAACTT 1185
|| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1078 TTCATATGTTCTTCAAAGCTGCCAGAAAAGCAGGCTGGCTTCCAGACGATGATAAAACTT 1137
Query 1186 ACCCTAGAGTTAGCCATGTTGGTTTTGGTCTTGTCCTTGGAGATGATAACAAGCGATTTA 1245
|||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1138 ACCCTAGAGTTAATCATGTTGGTTTTGGTCTTGTTCTTGGAGATGATAACAAGCGATTTA 1197
Query 1246 GAACTCGGGCAGCAGAGGTAGTCCGCCTAG-CTGATTTGCTAGATGAGGCCAAGGATCGC 1304
|||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1198 GAACTCGGTCAACAGAGGTAGTCCGCCTAGTC-GATTTACTAGATGAGGCCAAGGATCGC 1256
Query 1305 AGTAAAGCTGCCCTTATTGAGCGCGGTAAGGACAAAGAATGGTCACCCGAGGAGCTGGAC 1364
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1257 AGTAAAGCTGCCCTTATTGAGCGTGGTAAGGACAAAGAATGGACACCCGAGGAGCTGGAC 1316
Query 1365 CAAATAGCTGAGGCAGTTGGATATGGTGCCCTGAAGTATGCTGACCTGAAGACCAACAGA 1424
|||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317 CAAACAGCTGAGTCAGTTGGATACGGTGCGCTGAAGTATGCTGACCTGAAGACCAACAGA 1376
Query 1425 ATT-ACGGGTTATACTTTTAGCTTTGATCAAATGCTTAATGACAAGGGAGATACAGCCGT 1483
|| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1377 -TTGACGGGTTATACTTTCAGCTTTGATCAAATGCTTAATGACAAGGGAGATACAGCCGT 1435
Query 1484 TTACCTTCTCTACGCCCATGCTCGGATCTGCTCAATCATCAGAAAGTCTGGAAAAGACAT 1543
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 1436 TTACCTTCTTTACGCCCATGCTCGGATCTGCTCAATCATAAGAAAGTCTGGCAAAGACAT 1495
Query 1544 AGATGAGCTAAAAAAGACAGGAAAGATAGCGTTGGATCATGCAGCCGAACGGGCACTAGG 1603
||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1496 AGATGAGCTGAAAAAGACAGGAAAGATAGCATTGGATCATGCAGCGGAACGGGCACTGGG 1555
Query 1604 GCTTCACCTGCTTCAGTTTGCTGAGACGGTGGAGGAAGCGTGCACCACATTGTTACCGAA 1663
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1556 GCTTCACCTACTTCAATTTGCTGAGACGGTGGAGGAAGCATGCACCACATTGTTACCGAA 1615
Query 1664 TGTGCTTTGCAAGTACCTTTACTACTTATCCGAAGAGTTCACCAAATTTTACTCCAATTG 1723
|||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 1616 TGTGCTGTGCAAATACCTTTACTACTTATCTGAAGAGTTCACCAAATTCTACTCCAGTTG 1675
Query 1724 TCAGGTGAATGGTTCGGCCGAGGAGACGAGCCGTCTCTTACTTTGCGAAGCAACGGCTAT 1783
||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||| || |||||||| || ||
Sbjct 1676 TCAGGTGAATGGTTCAGCAGAGGAGACAAGCCGTCTCCTACTATGTGAAGCAACAGCCAT 1735
Query 1784 AGTCATGCGGAAATGCTTCCACCTTCTTGGAATCACCCCTGTTTACAAGCTTTGA 1838
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1736 AGTCATGCGGAAATGCTTCCACCTTCTTGGAATCACCCCTGTTTACAAGCTTTGA 1790
> Ahg475759 jgi|Araly1|475759|fgenesh2_kg.2__889__AT1G66530.1
Length=1825
Score = 2713 bits (1469), Expect = 0.0
Identities = 1693/1803 (94%), Gaps = 8/1803 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 63 TCGATGGCAACCATTGTAGCTAGTAAAGAATTCACCGGAAATCCAAGACGCCAACTCGCT 122
|||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1 TCGATGGCAACCATTGTAGCTAATAAAGAATTTACGGGAAACCCAAGACGCCAACTCGCT 60
Query 123 AAGCTCTTCGATGTGTCGCTTAAGTTAACGGTTCCTGATGAACCTAATGTTGAGCCCTTG 182
|||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 AAGCTCTTTGAGGTGTCTCTTAAATTAACAGTTCCTGATGAACCTAATGTTGAGCCCTTG 120
Query 183 ATCGAGCCTGGCAAATTTGGAGATTACCAATGTAACAATGCAATGGGACTATGGT-CTCT 241
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 121 ATTGAGCCTGGAAAATTTGGAGATTACCAATGTAACAATGCAATGGGACTATGGTCCT-T 179
Query 242 AATTAAAGGAAAGGGTACGCAGTTCCGTGGTCCTCCCGCTGTTGGACAGGCTCTTATTCA 301
|| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 180 TATCAAAGGAAAGGGTACACAGTTCCGTGGTCCTCCCGCTGTTGGACAGGCTCTTATTAA 239
Query 302 GAGTCTCCCTACTTCTGAGATGGTGGAATCATGCTCTATAGCTGGTCCTGGATTTGTTAA 361
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 240 GAATCTCCCTAGTTCTGAGATGGTGGAATCATGCTCTATAGCTGGACCTGGATTTGTTAA 299
Query 362 TGTTGTACTATCATCTAAGTGGATGGCTAAGAGTATTGAAAATATGCTTGTTGATGGGAT 421
|||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 300 TGTTGTGCTATCAGCTAAGTGGATAGCTAAGAGTATTGAAAATATGCTTGTTGATGGAAT 359
Query 422 TGATACATGGGCACCTACTCTTTCGGTTAAGAGAGCTGTAGTTGATTTTTCCTCTCCCAA 481
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 TGATACATGGGCGCCTACTCTTTCGGTTAAGAGAGCTGTAGTTGATTTTTCCTCTCCCAA 419
Query 482 CATTGCTAAAGAAATGCATGTTGGTCATCTTAGATCAACTATCATTGGTGACACTCTAGC 541
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||
Sbjct 420 CATTGCTAAAGAAATGCATGTTGGTCATCTAAGATCAACTATTATCGGTGACACGCTTGC 479
Query 542 TCGCATGCTCGAGTACTCAAAGGTTGAAGTTCTTCGCAGAAACCATGTTGGTGACTGGGG 601
||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 TCGTATGCTCGAGTACTCTAAGGTTGAAGTTCTACGTAGAAACCATGTTGGTGACTGGGG 539
Query 602 AACACAGTTTGGGATGCTAATTGAGTTTCTCTTTGAGAAATTTCCTGATACAGAGAGTGT 661
|||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 540 AACACAGTTTGGCATGTTGATTGAGTTTCTCTTTGAGAAATTTCCTGATACAGATAGTGT 599
Query 662 GACCGAGACAGCTATTGGAGATCTTCAGGTGTTTTAC-AGAGAATCAAAATTGAAATTTG 720
||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||
Sbjct 600 GACTGAGACAGCAATTGGAGATCTTCAGATGTTTTACAAGA-AATCAAAATTGAGATTTG 658
Query 721 ATTTGAATCCTGAGTTTAAGGAAAAAGCACAACAGGCTGTGGTCCGTCTTCAGGGTGGAG 780
||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 659 ATTTGGATCCGGAGTTTAAGGAAAAGGCACAACAGGCTGTGGTCCGTCTACAGGGTGGAG 718
Query 781 ATCCTGTTTACCGCCAGGCATGGGCTAAGATTTGCGAAATCAGCCGAAACGAGTTTGCCA 840
|||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 719 ATCCTGTTTACCGCAAGGCTTGGGCTAAGATTTGTGAAATCAGCCGAAATGAGTTTGCCA 778
Query 841 AGGTTTACAAACGCCTTCGAATCGAGCTTGAAGAAAAGGGAGAAAGCTTTTACAACCCTT 900
|||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 779 AGGTGTACCAACGCCTTCGAGTCGAGCTTGAAGAAAAGGGAGAAAGCTTTTACAACCCTT 838
Query 901 ATATCGCTAACGTAATTGAGGAATTGAGCAGCAAGGGGTTAGTTGAAGAAAGTAAAGGTG 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||
Sbjct 839 ATATCGCTAACGTAATTGAGGAATTGAGCAGCAAGGGGTTAGTTGAAGAAAATGAAGGTG 898
Query 961 CTCGTGTGATATTCATTGAAGGCTTTAAAATCCCACTCATTGTTGTAAAGAGTGATGGTG 1020
|||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||
Sbjct 899 CTCGTGTGATATTCGTCGAAGGCTTTAACATCCCACTCATGGTTGTAAAGAGTAACGGTG 958
Query 1021 GTTTTAACTATGCCTCAACTGATCTAACTGCTCTTTGGTATCGGCTTAATGAAGAGAAAG 1080
|||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 GTTTTAACTATGCCTCTACCGATCTGACTGCTCTTTGGTATCGGCTTAATGAAGAGAAAG 1018
Query 1081 CTGAGTGGATTATATATGTGACCGACGTTGGCCAGCAGCAGCATTTTGATATGTTCTTCA 1140
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||
Sbjct 1019 CTGAGTGGATTATATATTTGACCGACCTTGGCCAGCAGCAGCACTTTCATATGTTCTTCA 1078
Query 1141 AAGCTGCCAGAAAAGCAGGATGGCTTCCAGACGATGATAAAACTTACCCTAGAGTTAGCC 1200
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1079 AAGCTGCCAGAAAAGCAGGCTGGCTTCCAGACGATGACAAAACTTACCCTAGAGTTAACC 1138
Query 1201 ATGTTGGTTTTGGTCTTGTCCTTGGAGATGATAACAAGCGATTTAGAACTCGGGCAG-CA 1259
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1139 ATGTTGGTTTTGGTCTTGTCCTTGGAGCTGATAACAAGCGATTTAGAACTCGGGCAAAC- 1197
Query 1260 GAGGTAGTCCGCCTAGCTGATTTGCTAGATGAGGCCAAGGATCGCAGTAAAGCTGCCCTT 1319
||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1198 GAGGTAGTCCGACTAGTTGATTTGCTAGATGAGGCCAAGGATCGCAGTAAAGCTGCCCTT 1257
Query 1320 ATTGAGCGCGGTAAGGACAAAGAATGGTCACCCGAGGAGCTGGACCAAATAGCTGAGGCA 1379
|||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 ATTGAGCGAGGTAAGGACAAAGAATGGACACCTGAGGAGCTGGACCAAATAGCTGAGGCA 1317
Query 1380 GTTGGATATGGTGCCCTGAAGTATGCTGACCTGAAGACCAACAGAATT-ACGGGTTATAC 1438
|||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 1318 GTTGGATACGGTGCGCTGAAGTTTGCTGACCTGAAGACCAACAGA-TTGACGGGTTATAC 1376
Query 1439 TTTTAGCTTTGATCAAATGCTTAATGACAAGGGAGATACAGCCGTTTACCTTCTCTACGC 1498
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1377 TTTCAGCTTTGATCAAATGCTTAATGACAAGGGAGATACAGCCGTTTACCTTCTTTACGC 1436
Query 1499 CCATGCTCGGATCTGCTCAATCATCAGAAAGTCTGGAAAAGACATAGATGAGCTAAAAAA 1558
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1437 CCATGCTCGGATCTGCTCAATCATAAGAAAGTCTGGCAAAGACATAGATGAGCTAAAAAG 1496
Query 1559 GACAGGAAAGATAGCGTTGGATCATGCAGCCGAACGGGCACTAGGGCTTCACCTGCTTCA 1618
||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1497 GACAGGAAAGATAGCATTGGATCATGCAGCGGAACGGGCACTGGGGCTTCACCTGCTTCA 1556
Query 1619 GTTTGCTGAGACGGTGGAGGAAGCGTGCACCACATTGTTACCGAATGTGCTTTGCAAGTA 1678
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 1557 ATTTGCTGAGACGGTTGAGGAAGCGTGCACCACATTGTTACCGAACGTGCTGTGCAAGTA 1616
Query 1679 CCTTTACTACTTATCCGAAGAGTTCACCAAATTTTACTCCAATTGTCAGGTGAATGGTTC 1738
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1617 CCTTTACTACTTATCCGAAGAGTTCACCAAATTCTACTCCAATTGTCAGGTGAATGGTTC 1676
Query 1739 GGCCGAGGAGACGAGCCGTCTCTTACTTTGCGAAGCAACGGCTATAGTCATGCGGAAATG 1798
|| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1677 AGCAGAGGAGACAAGCCGTCTCTTACTTTGCGAAGCAACGGCTATAGTCATGCGGAAATG 1736
Query 1799 CTTCCACCTTCTTGGAATCACCCCTGTTTACAAGCTTTGATGCTTGACAATGAACCTAAC 1858
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||| ||| |
Sbjct 1737 CTTCTACCTTCTTGGAATCACCCCTGTTTACAAGCTTTGATCCATCATAATGAAACTACC 1796
Query 1859 CAA 1861
|||
Sbjct 1797 CAA 1799
> Ahg925691 jgi|Araly1|925691|scaffold_201252.1
Length=1913
Score = 2560 bits (1386), Expect = 0.0
Identities = 1630/1747 (93%), Gaps = 19/1747 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 115 AACTCGCTAAGCTCTTCGATGTGTCGCTTAAGTTAACGGTTCCTGATGAACCTAATGTTG 174
|||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 179 AACTCGCTAAGCTCTTTGAGGTGTCTCTTAAATTAACTGTTCCTGATGAACCTAACGTTG 238
Query 175 AGCCCTTGATCGAGCCTGGCAAATTTGGAGATTACCAATGTAACAATGCAATGGGACTAT 234
|||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 239 AGCCCTTGATTGAGCCTGCCAAATTCGGAGATTACCAATGTAACAATGCAATGGGACTAT 298
Query 235 GGTCTC-TAATTAAAGGAAAGGGTACGCAGTTC-CGTGGTCCTCCCGCTGTTGGACAGGC 292
|||| | | ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 299 GGTC-CATTATTAAAGGAAAGGGTACACAGTTCAAG-GGTCCTCCCGCTGTTGGACAGGC 356
Query 293 TCTTATTCAGAGTCTCCCTACTTCTGAGATGGTGGAATCATGCTCTATAGCTGGTCCTGG 352
||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 357 TCTTATTAAGAATCTCCCTAGTTCTGAGATGGTGGAATCATGCTCTATAGCTGGACCTGG 416
Query 353 ATTTGTTAATGTTGTACTATCATCTAAGTGGATGGCTAAGAGTATTGAAAATATGCTTGT 412
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 417 ATTTGTTAATGTTGTACTATCAGCTAAGTGGATAGCTAAGAGTATTGAAAATATGCTTAT 476
Query 413 TGATGGGATTGATACATGGGCACCTACTCTTTCGGTTAAGAGAGCTGTAGTTGATTTTTC 472
||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 477 CGATGGAATTGATACATGGGCGCCTACTCTTTCTGTTAAGAGAGCTGTAGTTGATTTTTC 536
Query 473 CTCTCCCAACATTGCTAAAGAAATGCATGTTGGTCATCTTAGATCAACTATCATTGGTGA 532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 537 CTCTCCCAACATTGCTAAAGAAATGCATGTTGGTCATCTAAGATCAACTATCATTGGTGA 596
Query 533 CACTCTAGCTCGCATGCTCGAGTACTCAAAGGTTGAAGTTCTTCGCAGAAACCATGTTGG 592
|| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 597 TACGCTTGCTCGTATGCTCGAGTACTCAAAGGTTGAAGTTCTACGCAGAAACCATGTTGG 656
Query 593 TGACTGGGGAACACAGTTTGGGATGCTAATTGAGTTTCTCTTTGAGAAATTTCCTGATAC 652
||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 657 TGACTGGGGAACACAGTTTGGCATGTTGATTGAGTTTCTCTTTGAGAAATTTCCTGATAC 716
Query 653 AGAGAGTGTGACCGAGACAGCTATTGGAGATCTTCAGGTGTTTTAC-AGAGAATCAAAAT 711
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||
Sbjct 717 AGATAGTGTGACCGAGACAGCAATTGGAGATCTTCAGATGTTTTACAAGA-AATCAAAAT 775
Query 712 TGAAATTTGATTTGAATCCTGAGTTTAAGGAAAAAGCACAACAGGCTGTGGTCCGTCTTC 771
||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 776 TGAGATTTGATTTGGATCCGGAGTTTAAGGAAAAGGCACAACAGGCTGTGGTCCGTCTAC 835
Query 772 AGGGTGGAGATCCTGTTTACCGCCAGGCATGGGCTAAGATTTGCGAAATCAGCCGAAACG 831
||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 836 AGGGTGGAGATCCTGTTTACCGCAAGGCTTGGGCTAAGATTTGTGAAATCAGCCGAAATG 895
Query 832 AGTTTGCCAAGGTTTACAAACGCCTTCGAATCGAGCTTGAAGAAAAGGGAGAAAGCTTTT 891
||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 896 AGTTTGCCAAGGTGTACCAACGCCTTCGAGTCGAGCTTGAAGAAAAGGGAGAAAGCTTTT 955
Query 892 ACAACCCTTATATCGCTAACGTAATTGAGGAATTGAGCAGCAAGGGGTTAGTTGAAGAAA 951
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 956 ACAACCCTTATATCGCTAACGTAATTGAGGAATTGAGCAGCAAGGGGTTAGTTGAAGAAA 1015
Query 952 GTAAAGGTGCTCGTGTGATATTCATTGAAGGCTTTAAAATCCCACTCATTGTTGTAAAGA 1011
| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1016 ATGAAGGTGCTCGTGTGATATTCGTCGAAGGCTTTAACATCCCACTCATGGTTGTAAAGA 1075
Query 1012 GTGATGGTGGTTTTAACTATGCCTCAACTGATCTAACTGCTCTTTGGTATCGGCTTAATG 1071
|| | |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1076 GTAACGGTGGTTTTAACTATGCCTCTACCGATCTGACTGCTCTTTGGTATCGGCTTAATG 1135
Query 1072 AAGAGAAAGCTGAGTGGATTATATATGTGACCGACGTTGGCCAGCAGCAGCATTTTGATA 1131
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||
Sbjct 1136 AAGAGAAAGCTGAGTGGATTATATATTTGACCGACCTTGGCCAGCAGCAGCACTTTCATA 1195
Query 1132 TGTTCTTCAAAGCTGCCAGAAAAGCAGGATGGCTTCCAGACGATGATAAAACTTACCCTA 1191
||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1196 TGTTCTTTAAAGCTGCCAGAAAAGCAGGCTGGCTTCCAGACGATGACAAAACTTACCCTA 1255
Query 1192 GAGTTAGCCATGTTGGTTTTGGTCTTGTCCTTGGAGATGATAACAAGCGATTTAGAACTC 1251
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256 GAGTTAACCATGTTGGTTTTGGTCTTGTCCTTGGAGCTGATAACAAGCGATTTAGAACTC 1315
Query 1252 GGGCAG-CAGAGGTAGTCCGCCTAGCTGATTTGCTAGATGAGGCCAAGGATCGCAGTAAA 1310
||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1316 GGGCAAAC-GAGGTAGTCCGACTAGTTGATTTGCTAGATGAGGCCAAGGATCGCAGTAAA 1374
Query 1311 GCTGCCCTTATTGAGCGCGGTAAGGACAAAGAATGGTCACCCGAGGAGCTGGACCAAATA 1370
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
Sbjct 1375 GCTGCCCTTATTGAGCGAGGTATGGACAAAGAATGGACACCTGAGGAGCTGGACCAAACA 1434
Query 1371 GCTGAGGCAGTTGGATATGGTGCCCTGAAGTATGCTGACCTGAAGACCAACAGAATT-AC 1429
||||||||||||| ||| |||| | | | ||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 1435 GCTGAGGCAGTTG-ATACGGTG---T-A--T--GCTGACCTGAAGACCAACAGA-TTGAC 1484
Query 1430 GGGTTATACTTTTAGCTTTGATCAAATGCTTAATGACAAGGGAGATACAGCCGTTTACCT 1489
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1485 GGGTTATACTTTCAGCTTTGATCAAATGCTTAATGACAAGGGAGATACAGCCGTTTACCT 1544
Query 1490 TCTCTACGCCCATGCTCGGATCTGCTCAATCATCAGAAAGTCTGGAAAAGACATAGATGA 1549
||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1545 TCTTTACGCCCATGCTCGGATCTGCTCAATCATAAGAAAGTCTGGCAAAGACATAGATGA 1604
Query 1550 GCTAAAAAAGACAGGAAAGATAGCGTTGGATCATGCAGCCGAACGGGCACTAGGGCTTCA 1609
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 1605 GCTAAAAAAGACAGGAAAGATAGCATTGGATCATGCAGCGGAACGGGCACTGGGGCTTCA 1664
Query 1610 CCTGCTTCAGTTTGCTGAGACGGTGGAGGAAGCGTGCACCACATTGTTACCGAATGTGCT 1669
||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1665 CCTGCTTCAATTTGCTGAGACGGTTGAGGAAGCGTGCACCACATTGTTACCGAACGTGCT 1724
Query 1670 TTGCAAGTACCTTTACTACTTATCCGAAGAGTTCACCAAATTTTACTCCAATTGTCAGGT 1729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1725 GTGCAAGTACCTTTACTACTTATCCGAAGAGTTCACCAAATTCTACTCCAATTGTCAGGT 1784
Query 1730 GAATGGTTCGGCCGAGGAGACGAGCCGTCTCTTACTTTGCGAAGCAACGGCTATAGTCAT 1789
||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1785 GAATGGTTCAGCAGAGGAGACAAGCCGTCTCTTACTTTGCGAAGCAACAGCTATAGTCAT 1844
Query 1790 GCGGAAATGCTTCCACCTTCTTGGAATCACCCCTGTTTACAAGCTTTGATGCTTGACAAT 1849
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||
Sbjct 1845 GCGGAAATGCTTCTACCTTCTTGGAATCACCCCTGTTTACAAGCTTTGATCCATCATAAT 1904
Query 1850 GAACCTA 1856
||| |||
Sbjct 1905 GAAACTA 1911
> Ahg329048 jgi|Araly1|329048|fgenesh1_pm.C_scaffold_7001275
Length=1773
Score = 2254 bits (1220), Expect = 0.0
Identities = 1601/1782 (90%), Gaps = 37/1782 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 80 AGCTAGTAAAGAATTCACCGGAAATCCAAGACGCCAACTCGCTAAGCTCTTCGATGTGTC 139
||||| | |||| || || ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 6 AGCTAATGAAGAGTTTACGGGAAATCTAAAACGCCAACTCGCTAAGCTCTTTGATGTGTC 65
Query 140 GCTTAAGTTAACGGTTCCTGATGAACCTAATGTTGAGCCCTTGAT--C-G----AGC-C- 190
|| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | | || |
Sbjct 66 TCTAAAATTAACGGTTCCTGATGAACCTAGTGTTGAGCCCTTGGTGGCTGCCTCCGCTCT 125
Query 191 TGGCAAATTTGGAGATTACCAATGTAACAATGCAATGGGACTATGGTCTC-TAATTAAAG 249
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 126 TGGAAAATTTGGAGATTACCAATGTAACAATGCAATGGGACTATGGTC-CATAATTAAAG 184
Query 250 GAAAGGGTACGCAGTTC-CGTGGTCCTCCCGCTGTTGGACAGGCTCTTATTCAGAGTCTC 308
|||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||
Sbjct 185 GAAAGGGTACTCAGTTCAAG-GGTCCTCCAGCTGTTGGACAGGCCCTTGTTAAGAGTCTC 243
Query 309 CCTACTTCTGAGATGGTGGAATCATGCTCTATAGCTGGTCCTGGATTTGTTAATGTTGTA 368
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||
Sbjct 244 CCTACTTCTGAGATGGTGGAATCATGCTCTGTAGCTGGACCTGGCTTTATTAATGTTGTA 303
Query 369 CTATCATCTAAGTGGATGGCTAAGAGTATTGAAAATATGCTTGTTGATGGGA-TTGATAC 427
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||| ||
Sbjct 304 CTATCAGCTAAGTGGATGGCTAAGAGTATTGAAAATATGCTCATCAAT-GGAGTTGACAC 362
Query 428 ATGGGCACCTACTCTTTCGGTTAAGAGAGCTGTAGTTGATTTTTCCTCTCCCAACATTGC 487
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 363 ATGGGCACCTACTCTTTCCGTTAAGAGAGCTGTAGTTGATTTTTCCTCTCCCAACATTGC 422
Query 488 TAAAGAAATGCATGTTGGTCATCTTAGATCAACTATCATTGGTGACACTCTAGCTCGCAT 547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 423 AAAAGAAATGCATGTTGGTCATCTTAGATCAACTATCATTGGTGACACGCTAGCTCGCAT 482
Query 548 GCTCGAGTACTCAAAGGTTGAAGTTCTTCGCAGAAACCATGTTGGTGACTGGGGAACACA 607
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 483 GCTCGAGTACTCAAATGTTGAAGTTCTACGCAGAAACCATGTTGGTGACTGGGGAACACA 542
Query 608 GTTTGGGATGCTAATTGAGTTTCTCTTTGAGAAATTTCCTGATACAGAGAGTGTGACCGA 667
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 543 GTTTGGCATGCTAATTGAGTACCTCTTTGAGAAATTTCCTGATACAGATAGTGTGACTGA 602
Query 668 GACAGCTATTGGAGATCTTCAGGTGTTTTACAGAGA-ATCAAAAT-TGAAATTTGATTTG 725
|||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||| ||
Sbjct 603 GACAGCAATTGGAGATCTTCAGGTGTTTTACA-AGGCATCAAAACAT-AAATTTGATCTG 660
Query 726 AATCCTGAGTTTAAGGAAAAAGCACAACAGGCTGTGGTCCGTCTT-CAGGGTGGAGATCC 784
|| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||
Sbjct 661 GATGAGGACTTTAAGGAAAAAGCACAACAGGCTGTGGTCCGT-TTACAGGGTGGTGATCC 719
Query 785 TGTTTACCGCCAGGCATGGGCTAAGATTTGCGAAATCAGCCGAAAC-GAGTTTGCCAAGG 843
||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 720 TGTTTACCGTAAGGCTTGGGCTAAGATCTGTGACATCAGCCGAA-CTGAGTTTGCCAAGG 778
Query 844 TTTACAAACGCCTTCGAATCGAGCTTGAAGAAAAGGGAGAAAGCTTTTACAACCCTTATA 903
||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 779 TTTACCAACGCCTTCGAGTTGAGCTTGAAGAAAAGGGAGAAAGCTTTTACAACCCTTATA 838
Query 904 TCGCTAACGTAATTGAGGAATTGAGCAGCAAGGGGTTAGTTGAAGAAAGTAAAGGTGCTC 963
| ||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||
Sbjct 839 TTGCTAAAGTAATTGAGGAATTGAATAGCAAGGGATTGGTTGAAGAAAGTGAAGGTGCTC 898
Query 964 GTGTGATATTCATTGAAGGCTTTAAAATCCCACTCATTGTTGTAAAGAGTGATGGTGGTT 1023
||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 899 GTGTGATTTTCCTTGAAGGCTTTGACATCCCACTCATGGTTGTAAAGAGTGATGGTGGTT 958
Query 1024 TTAACTATGCCTCAACTGATCTAACTGCTCTTTGGTATCGGCTTAATGAAGAGAAAGCTG 1083
|||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||
Sbjct 959 TTAACTATGCCTCAACAGATCTGACTGCTCTTTGGTACCGGCTCAACGAAGAGAAAGCTG 1018
Query 1084 AGTGGATTATATATGTGACCGACGTTGGCCAGCAGCAGCATTTTGATATGTTCTTCAAAG 1143
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 1019 AGTGGATTATATATGTGACCGATGTTGGCCAGCAGCAGCACTTTAATATGTTCTTCAAAG 1078
Query 1144 CTGCCAGAAAAGCAGGATGGCTTCCAGACGATGATAAAACTTACCCTAGAGTTAGCCATG 1203
|||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1079 CTGCCAGAAAAGCAGGTTGGCTTCCAGACAATGATAAAACTTACCCTAGAGTTAACCATG 1138
Query 1204 TTGGTTTTGGTCTTGTCCTTGGAGATGATAACAAGCGATTTAGAACTCGGGCAGCAGAGG 1263
||||||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||||||||| ||| |||| |
Sbjct 1139 TTGGTTTTGGTCTCGTCCTCGGGGAAGATGGCAAGCGATTTAGAACTCGTGCAACAGATG 1198
Query 1264 TAGTCCGCCTAGCTGATTTGCTAGATGAGGCCAAGGA-TCGCAGTAAAGCT-GCCCTTAT 1321
|||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||
Sbjct 1199 TAGTCCGCCTAGTTGATTTGTTAGATGAGGCCAAG-ACTCGCAGTAAA-CTTGCCCTTAT 1256
Query 1322 TGAGCGCGGTAAGGACAAAGAATGGTCACCCGAGGAGCTGGACCAAATAGCTGAGGCAGT 1381
||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1257 TGAGCGCGGCAAGGACAAAGAATGGACACCGGAGGAACTGGACCAAACAGCTGAGGCAGT 1316
Query 1382 TGGATATGGTGCCCTGAAGTATGCTGACCTGAAGACCAACAGAATTA-CGGGTTATACTT 1440
|||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||
Sbjct 1317 TGGATATGGTGCGGTAAAGTATGCTGACCTGAAGAACAACAGA-TTAACAAATTATACTT 1375
Query 1441 TTAGCTTTGATCAAATGCTTAATGACAAGGGAGATACAGCCGTTTACCTTCTCTACGCCC 1500
| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 1376 TCAGCTTTGATCAAATGCTTAATGACAAGGGAAATACAGCCGTTTACCTTCTTTACGCTC 1435
Query 1501 ATGCTCGGATCTGCTCAATCATCAGAAAGTCTGGAAAAGACATAGATGAGCTAAAAAAGA 1560
||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||
Sbjct 1436 ATGCTCGGATCTGTTCAATCATCAGAAAGTCTGGCAAAGACATAGATGAGCTGAGAAAGA 1495
Query 1561 CAGGAAAGA-TAGCGTTGGATCATGCAGCCGAACGGGCACTAGGGCTTCACCTGCTTC-A 1618
||||||| | |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| |
Sbjct 1496 CAGGAAA-ACTAGCATTGGATCATGCAGATGAACGAGCACTGGGGCTTCACTTGCTTCGA 1554
Query 1619 GTTTGCTGAGACGGTGGAGGAAGCGTGCACCA-CATTGTTACCGAATGTGCTTTGCAAGT 1677
|||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||| ||||| ||| |||
Sbjct 1555 -TTTGCTGAGACGGTTGAGGAAGCTTGCACCAAC-TTGTTACCGAGCGTGCTGTGCGAGT 1612
Query 1678 ACCTTTACTACTTATCCGAAGAGTTCACCAAATTTTACTCCAATTGTCAGGTGAATGGTT 1737
|||| ||| | ||||| ||| | | ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1613 ACCTCTACAATTTATCTGAACACTACACCAGATTCTACTCCAATTGTCAGGTCAATGGTT 1672
Query 1738 CGGCC-GAGGAGACGAGCCGTCTCTTACTTTGCGAAGCAACGGCTATAGTCATGCGGAAA 1796
| || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 1673 CA-CCAGAGGAGACAAGCCGTCTCCTACTTTGTGAAGCAACGGCCATAGTTATGCGGAAA 1731
Query 1797 TGCTTCCACCTTCTTGGAATCACCCCTGTTTACAAGCTTTGA 1838
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||
Sbjct 1732 TGCTTCCACCTTCTTGGAATCACTCCTGTTTACAAGATTTGA 1773
> Ahg904298 jgi|Araly1|904298|Al_scaffold_0003_1426
Length=1740
Score = 1565 bits (847), Expect = 0.0
Identities = 1480/1774 (83%), Gaps = 89/1774 (5%)
Strand=Plus/Plus
Query 88 AAGAATTCACCGGAAATC-CAAGAC-GCCAACTCGCT-AAGCTCTTCGATGTGTCGCTTA 144
|||||||||| | ||||| || || | || |||| | |||||||| |||| ||| || |
Sbjct 17 AAGAATTCACTGAAAATCTGAA-ACAG-CAGCTCG-TGAAGCTCTTTGATGCGTCTCTGA 73
Query 145 AGTTAACGGTTCCTGATGAACCTAATGTTGAGCCCTTGATCGAGCCTGGCAAATTTGGAG 204
| ||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||| | | | ||| ||||| | ||
Sbjct 74 AATTAACGGTTCCAGATGAACCTAGTGTTAAGCCTTTGGTTGTGGTTGGAAAATTCGAAG 133
Query 205 ATTACCAATGTAACAATGCAATGGGACTATGGTCTCTAA-TTAAAGGAAAGGGTACGCAG 263
|||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||
Sbjct 134 ATTACCAATGTAACAATGCAATGGGACTATGGTC-CAAAGTTAAAGGAAAGGGTACTCAA 192
Query 264 TTC-CGTGGTCCTCCCGCTGTTGGACAGGCTCTTATT-CAGAGTCTCCCTACTTCTGAGA 321
||| | | ||||| ||||||| | |||| ||| || || | ||||||||||| ||| |
Sbjct 193 TTCAC-TCGTCCTTTAGCTGTTGCAGAGGCCCTTGTTACA-AATCTCCCTACTTGTGATA 250
Query 322 TGGTGGAATCATGCTCTATAGCTGGTCCTGGATTTGTTA-ATGTTGTACTATCATCTAAG 380
|||||| | | || || || | || | ||| | | || | ||| | |||
Sbjct 251 TGGTGG-A--A---TC-AT-GC---T-CT-G--TTG-CACAACCTGGA-TAT-GT-TAA- 290
Query 381 TGGATGGCTAAGAGTATTGAAAATATGCTTGTTGATGGGATTGATACATGGGCACCTACT 440
| | | | |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 291 T-G-T---T---AGTATTGAAAATATGCTTATCAATGGGATTGAGACATGGGCGCCTACT 342
Query 441 CTTTCGGTTAAGAGAGCTGTAGTTGATTTTTCCTCTCCCAACATTGCTAAAG-AAATGCA 499
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||
Sbjct 343 CTTTCAGTTAAGAGAGCTGTAGTTGATTTTTCCTCTCCAAATATTGC-AAAGAAAATGCA 401
Query 500 TGTTGGTCATCTT-AGATCAACTATCATTGGTGACACTC-TAGCTCGCATGCTCGAGTAC 557
|||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||
Sbjct 402 TGTTGGTCAT-TTAAGATCAACTATCATCGGTGACAC-CATAGCTCGTATGCTCGAGTAC 459
Query 558 TCAAAGGTTGAAGTTCTTCGCAGAAACCATGTTGGTGACTGGGGAACACAGTTTGGGATG 617
|| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 460 TCTAATGTTGAAGTTCTACGCAGAAACCATGTTGGTGACTGGGGAACACAGTTTGGCATG 519
Query 618 CTAATTGAGTTTCTCTTTGAGAAATTTCCTGATACAGAGAGTGTGACCGAGACAGCTATT 677
||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||| || |||||||| |||
Sbjct 520 TTAATTGAGTACCTCTTTGAGAAATTTCCTGATTCAAATAGTGCGATGGAGACAGCAATT 579
Query 678 GGAGATCTTCAGGT-GTTTTACAGAG-AATCAAAATTGAAATTTGATTTG-A-ATCCT-G 732
| |||| |||| || ||| |||| || ||||||| ||||||||| || | || | |
Sbjct 580 GAAGATATTCA-GTCGTTATACA-AGCCATCAAAAACGAAATTTGA--TGCAGAT-TTAG 634
Query 733 AGTTTAAG-GAAAAAGCACAACAGGCTGTGGTCCGTCTTCAGGGTGGAGATCCTGTTTAC 791
| |||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 635 ACTTTAAGCG-AAAGGCACAACAGGCCGTGGTCCGTCTACAGGGTGGAGATCCTGTATAC 693
Query 792 CGCCAGGCATGGGCTAAGA-TTTGCGAAATCAGCCGAAACGAGTT-TGCCAAGGTTTA-C 848
| | || | | ||| || | |||| |||||||||||| ||| || |||| || |||| |
Sbjct 694 CACAAGAC-TTGGCAAAAACTTTGTGAAATCAGCCGAGCCGA-TTATGCCGAGATTTATC 751
Query 849 AAACGCCTTCGAATCGAGCTTGAAGAAAAGGGAGAAAGCTTTTACAACCCTTATATCGCT 908
||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 752 -AACGCCTTCGAGTTGAGCTTGAAGAAAAGGGAGAAAGCTTTTACAAACCTTATATTGCT 810
Query 909 AACGTAATTGAGGAATTGAGCAGCAAGGGGTTAGTTGAAGAAAGTAAAGGTGCTCGTGTG 968
||| | ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 811 AACATGATTGAGGAATTGAATAGCAAGGGTTTGGTTGAAGAAAGTGATGGTGCTCGTGTG 870
Query 969 ATATTCATTGAAGGCTTTAA-AATCCCACT-CATTG-TTGTAAAGAGTGATGGTGGTTTT 1025
|| ||||| ||| ||| || ||| ||| | || || |||| ||||||||||||||||||
Sbjct 871 ATGTTCATCAAAGACTTCAAGAAT-CCA-TGCA-TGCTTGTTAAGAGTGATGGTGGTTTT 927
Query 1026 AACTATGCCTCAACTGATCTAACTGCTCTTTGGTATCGGCTTAATGAAGAGAAAGCTGAG 1085
| ||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 928 ACCTATGACACAACAGATCTTGCTGCTCTTTGGTATCGGCTTAATGAAGAGAAAGCTGAG 987
Query 1086 TGGATTATATATGTGACCGACGTTGGCCAGCAGCAGCATTTTGATATGTTCTTCAAAGCT 1145
|||||||| |||||||| || | |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct 988 TGGATTATTTATGTGACAGATGCTGGCCAGCAGGAGCACTTTGATAGGTTCTTCAAAGCT 1047
Query 1146 GCCAGAAAAGCAGGATGGCTTCCAGACGATGATAAAACTTACCCTAGAGTTAGCCATGTT 1205
|| ||| ||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1048 GCTAGACAAGTAGGTTGGCTTCCAGACAATGATGAAACTTACCCTAGAGTTAGCCATGTT 1107
Query 1206 G-GTTTTGGTCTTGTCCTTGGAGATGATAACAAGCGATTTAGAACTCGGGC-AGCAGAGG 1263
|||| ||| | ||| || || ||| |||||| ||||||| ||| | || |||
Sbjct 1108 AAGTTT-GGTGTAGTCAAGGGGGAAGATGGCAAGCGGTTTAGAAATCGCGATAG-AGAAA 1165
Query 1264 TAGTCCGC-CTAGCTGATTTGCTAGATGAGGCCAAGGA-TCGCAGTAAAGCTGCCCTTAT 1321
|||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 1166 TAGTCC-CTCTAGCTGATTTGCTAGATGAGGCCAAG-ACTCGCAGTAAAGCTGCCCTTAT 1223
Query 1322 TGAGCGCGGTAAGGACAAAGAATGGTCACCCGAGGAGCTGGACCAAATAGCTGAGGCAGT 1381
|||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |
Sbjct 1224 TGAGCGTGCTAAGGAAAAAGAATGGACACCCGAGGAGCTGGACCAAACAGCTGAGGCAAT 1283
Query 1382 TGGATATGGTGCCCTGAAGTATGCTGACCTGAAGACCAACAGAAT-TACGGGTTATACTT 1440
|||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||| | | ||| | ||||| |
Sbjct 1284 TGGATATGGTGCGGTGAAGTATGCTGACTTGATGAACAACATA-TCTACAGATTATAAGT 1342
Query 1441 TTAGCTTTGATCAAATGCTTAATGACAAGGGAGATACAGCCGTTTACCTTCTCTACGCCC 1500
| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| |
Sbjct 1343 TCAGCTACGATAAAATGCTTAATGACAAGGGAAATACAGCTGTGTACCTTCTTTACGCTC 1402
Query 1501 ATGCTCGGATCTGCTCAATCATCA-GAAAGTCTGGAAAAGACATAGATGAGCT-AAAAAA 1558
|||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1403 ATGCTCGGATCTGCTCAATCATCAAGAA-GTCTGGCAAAGACATAGATGAGCTTAAAAAA 1461
Query 1559 GACAGGAAAGATAGCGTTGGATCATGC-AGCCGAACGGGCACTAGGGCTTCACCTGCTTC 1617
|| |||||| |||| ||||| ||||| | ||| | ||||| || ||||| ||||||
Sbjct 1462 -ACTGGAAAGTTAGCATTGGACCATGCTAAT-GAAAGAGCACTTGGACTTCATTTGCTTC 1519
Query 1618 AGTTTGCTGAGACGGTGGAGGAAGCGTGCACCACATTGTTACCGAATGTGCTTTGCAAGT 1677
| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| | | || ||| |||
Sbjct 1520 AATTTGCTGAGACGGTTGAGGAAGCATGCACCAAATTGTTACCGCACATACTGTGCGAGT 1579
Query 1678 ACCTTTACTACTTATCCGAAGAGT-TCACCAAATTTTACTCCAATTGTCAGGTGAATGGT 1736
|||| ||| | ||||| ||| | | | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1580 ACCTCTACGATTTATCTGAACACTAT-ACGAAATTCTACTCCAATTGTCAGGTCAATGGT 1638
Query 1737 TCGGCCGAGGAGACGAGCCGTCTCTTACTTTGCGAAGCAACGGCTATAGTCATGCGGAAA 1796
|| || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1639 TCAGCAGAGGAGACAAGCCGTCTCCTACTTTGTGAAGCAACGGCCATAGTCATGCGGAAA 1698
Query 1797 TGCTTCCACCTTCTTGGAATCACCCCTGTTTACA 1830
||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1699 TGCTTCCACCTTCTTGGAATCACTCCTGTTTACA 1732
> Ahg349990 jgi|Araly1|349990|fgenesh1_pg.C_scaffold_6000583
Length=1254
Score = 564 bits (305), Expect = 1e-159
Identities = 429/489 (88%), Gaps = 8/489 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1354 AGGAGCTGGACCAAATAGCTGAGGCAGTTGGATATGGTGCCCTGAAGTATGCTGACCTGA 1413
|||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||
Sbjct 770 AGGAGCTGGACCTAACAGCTGAGGCAATTGGATACAGTGTGGTGAAGTTTGCTGACCTGA 829
Query 1414 AGACCAACAGAATT-ACGGGTTATACTTTTAGCTTTGATCAAATGCTTAATGACAAGGGA 1472
||| |||||| ||| | |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 830 AGAACAACAG-ATTGTCAAGTTATACTTTCAGCTATGATCAAATGCTTTGTGACAAGGGA 888
Query 1473 GATACAGCCGTTTACCTTC-TCTACGCCCATGCTCGGATCTGCTCAATCATCAGAAAGTC 1531
| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAAACAGCCGTTTACCTTCAT-TACGCCCATGCTCGGATCTGCTCAATCATCAGAAAGTC 947
Query 1532 TGGAAAAGACATAGATGAGCTAAAAAAGACAGGAAAGATAGCGTTGGATCATGCAGCCGA 1591
||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||
Sbjct 948 TGGCAAAGACATAGATGAGCTGAAAAAGGCAGGAAAGCTAGCATTGGATCATGCAGACGA 1007
Query 1592 ACGGGCACTAGGGCTTCACCTGCTTCAGTTTGCTGAGACGGTGGAGGAAGCGTGCACCAC 1651
||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1008 ACGGGCACTGGGGCTTCACCTGCTTCAATTTGCCGAGACGGTTGAGGAAGCGTGCACCAA 1067
Query 1652 ATTGTTACCGAATGTGCTTTGCAAGTACCTTTACTACTTATCCGAAGAGTTCACCAAATT 1711
| |||||||| | ||| | ||| ||||||| ||| |||||||||| ||| | |||||||
Sbjct 1068 ACTGTTACCGCACGTGGTATGCGAGTACCTCTACGGCTTATCCGAACAGTGCTCCAAATT 1127
Query 1712 TTACTC-CAATTGTCAGGTGAATGGTTCGGCCGAGGAGACGAGCCGTCTCTTACTTTGCG 1770
||| | |||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||| ||||||| |
Sbjct 1128 CTAC-CACAATTGTCAGGTCATTGGTTCAGCAGAGGAGACAAGCCGTCTCCTACTTTGTG 1186
Query 1771 AAGCAAC-GGCTATAGTCATGCGGAAATGCTTCCACCTTCTTGGAATCACCCCTGTTTAC 1829
||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1187 AAGCAACTGGC-ATAGTCATGCGGAAATGCTTCCACCTACTTGGAATCACCCCTGTTTAT 1245
Query 1830 AAGCTTTGA 1838
|||||||||
Sbjct 1246 AAGCTTTGA 1254
> Ahg935985 jgi|Araly1|935985|scaffold_500176.1
Length=1207
Score = 448 bits (242), Expect = 1e-124
Identities = 371/430 (86%), Gaps = 21/430 (5%)
Strand=Plus/Plus
Query 461 AGTTGATTTTTCCTCTCCCAACATTGCTAAAGAAATGCATGTTGGTCATCTT-AGATCAA 519
||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||
Sbjct 418 AGTTGATTTTTCCTCTCCCAACATTGCAAAATAAATACATGTTGGTCATCTTAAGATCAA 477
Query 520 CTATCATTGGTGACACT-CTAGCTCGCATGCTCGAGTACTCAAAGGTTGAAGTTCTTCGC 578
||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 478 CTATCATCGGTGACA-TGCTAGCTCGCATGCTCGAGTACTCAAAGGTTGAAGTTCTACGC 536
Query 579 AGAAACCATGTTGGTGACTGGGGAACACAGTTTGGGATGCTAATTGAGTTTCTCTTTGAG 638
||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||
Sbjct 537 AGAAACCATGTTGATGATTGGGGAACAAAGTTTGGCATGCTAATTGAGTACCTCTTTGAG 596
Query 639 AAATTTCCTGATACAGAGAGTGTGACCGAGACAGCTATTGGAGATCTTCA--GGTGTTTT 696
||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || | | | || | ||||||||
Sbjct 597 AAATTTCCTGATACAGATAGTGTGATCGAGACAG--AT-GTCGTTTTTGATAGGTGTTTT 653
Query 697 ACAGAGA-ATCAAAATT-GAAATTTGATTTGAATCCTGAGTTTAAGGAAAAAGCACAACA 754
||| || ||||||| |||||||||| || || || |||||||||| |||||||||
Sbjct 654 ACA-AGGCATCAAAAAAAGAAATTTGATCTGGATGAGGACTTTAAGGAAAGAGCACAACA 712
Query 755 GGCTGTGGTCCGTCTTCAGG-G-----TGGAGATCCTGTTTACCGCCAGGCATGGGCTAA 808
|||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||| |||| ||||||||
Sbjct 713 AGCTGTGGTCCGTCTACAGGCGCAGGGTGGTGATCCTGTTTACCGTAAGGCTTGGGCTAA 772
Query 809 GATTTGCGAAATCAGCCGAAAC-GAGTTTGCCAAGGTTTA-CAAACGCCTTCGAATCGAG 866
||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||
Sbjct 773 GATCTGTGAAATCAGCCGAA-CTGAGTTTGCCAAGGTTTATCAA-CGCCTTCGAGTTGAG 830
Query 867 CTTGAAGAAA 876
||||||||||
Sbjct 831 CTTGAAGAAA 840
Score = 327 bits (177), Expect = 1e-88
Identities = 273/317 (86%), Gaps = 15/317 (5%)
Strand=Plus/Plus
Query 88 AAGAATTCACCGGAAATCCAAGACGCCAACTCGCTAAGCTCTTCGATGTGTCG-CTTAAG 146
||||||| || ||||||| || |||||||||||| |||||||| | ||||| | || ||
Sbjct 106 AAGAATTTACGGGAAATCTAAAACGCCAACTCGCGAAGCTCTTGGTTGTGT-GTCTAAAA 164
Query 147 TTAACGGTTCCTGATGAACCTAATGTTGAGCCCTTGAT--C-G----AGC--CTGGCAAA 197
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | | | || |||| |||
Sbjct 165 TTAACGGTTCCTGATGAACCTAGTTTTGAGCCCTTGGTGGCTGCCTCCGCTGCTGGAAAA 224
Query 198 TTTGGAGATTACCAATGTAACAATGCAATGGGACTATGGTCTC-TAATTAAAGGAAAGGG 256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 225 TTTGGAGATTACCAATGTAACAATGCAATGGGACTATGGTC-CATAATTAAAGGAAAGGG 283
Query 257 TACGCAGTTCC-GTGGTCCTCCCGCTGTTGGACAGGCTCTTATTCAGAGTCTCCCTACTT 315
||| |||||| | |||||||| |||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||
Sbjct 284 TACTCAGTTCAAG-GGTCCTCCAGCTGTTGGACTGGCCCTTGTTAAGAGTCTCCCTACTT 342
Query 316 CTGAGATGGTGGAATCATGCTCTATAGCTGGTCCTGGATTTGTTAATGTTGTACTATCAT 375
||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| | | ||||||| |||||||||
Sbjct 343 CTGAGATGGTGGAATCATGCTCTGTAGCTAGACCTGGCTATATTAATGTCGTACTATCAG 402
Query 376 CTAAGTGGATGGCTAAG 392
|||||||||||||||||
Sbjct 403 CTAAGTGGATGGCTAAG 419
Score = 326 bits (176), Expect = 5e-88
Identities = 279/326 (86%), Gaps = 17/326 (5%)
Strand=Plus/Plus
Query 1069 ATGAAGAGAAAGCTGAGTGGATTATATATGTGACCGAC-GTTGGCCAGCAGCAGCATTTT 1127
|||||||||||||| ||||||| |||||| |||| | | ||||||| ||||||| ||
Sbjct 853 ATGAAGAGAAAGCTCAGTGGATGATATATAACACCG-CTGCTGGCCAGGAGCAGCA-CTT 910
Query 1128 GA-TATGTTCTTCAAAGCTGCCAGAAAAGCAGGATGGCTTCCAGACGATGATAAAACTTA 1186
| || ||||||| | | ||||| ||| |||||||||| | |||| ||||||||
Sbjct 911 AAGTACGTTCTTC--A------A-AAAAGAAGGTTGGCTTCCAGGCAATGAGAAAACTTA 961
Query 1187 CCCTAGAGTTAGCCATGTTGGTTTTGGTCTTGTCCTTGGAGATGATAACAAGCGATTTAG 1246
||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||
Sbjct 962 CCCTAGAGTTAACCATGTTGGTTTTGGTCTCGTCCTTGGGGAAGATGGCAAGCGATTTAG 1021
Query 1247 AACTCGGGCAGCAGAGGTAGTCCGCCTAGCTGATTTGCTAGATGAGGCCAAGGA-TCGCA 1305
|||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||
Sbjct 1022 AACTCGGGCAACAGATGTAGTCCGCCTAGTTGATTTGGTAGATGAGGCCAA-GACTCGCA 1080
Query 1306 GTAAAGC-TGCCCTTATTGAGCGCGGTAAGGACAAAGAATGGTCACCCGAGGAGCTGGAC 1364
||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||
Sbjct 1081 GTAAA-CTTGCCCTTATTGAGCGCGGTAAGGACAAAGAATGGACACCAGAGGAACTGGAC 1139
Query 1365 CAAATAGCTGAGGCAGTTGGATATGG 1390
|||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 1140 CAAACAACTGAGGCAGTTGGATATGG 1165
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 74847331425
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5