BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G66950.1
Length=4557
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg925919 jgi|Araly1|925919|scaffold_201480.1 6479 0.0
Ahg482613 jgi|Araly1|482613|fgenesh2_kg.4__1673__AT2G36380.1 5481 0.0
> Ahg925919 jgi|Araly1|925919|scaffold_201480.1
Length=4393
Score = 6479 bits (3508), Expect = 0.0
Identities = 4116/4410 (93%), Gaps = 40/4410 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 26 TCGTTGGCAATGGCCGCAATGCTAGGACGAGATGAAG-ATCCGGTCGGAGCATTGAGTGG 84
||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| ||| || |||| ||
Sbjct 12 TCGTTGGCAATGGCCACAATGTTAGGACGAGATG-AGAATCCGGTAGGAACAATGAGCGG 70
Query 85 GAGAGTGAGTTTGGCCTCCACCAGTCACAGGAGTTTGGTCGGAGCTTCCAAAAGCTTTC- 143
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 71 GAGAGTGAGTTTGGCCTCAACCAGTCACAGGAGTTTGGTCGGAGCTTCCAAAAG-TTTCA 129
Query 144 GAGATGTGTTCATG-C-CTCAAACTGACGAGGTGTTTGGGAGGAGCGAACGTCGGGAGGA 201
|||| ||||| || | || | | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 130 GAGACGTGTT--TGTCTCTGAGGCGGACGAGGTTTTTGGGAGGAGCGAACGGCGGGAGGA 187
Query 202 AGATGACATGGAGCTCCGATGGGCGGCGATTGAGAGATTGCCGACGTTTGATCGGCTACG 261
|||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 188 AGATGACATGGAGCTCCGGTGGGCGGCGATTGAGCGATTGCCAACGTTTGATCGGCTACG 247
Query 262 TAAAGGGATGTTGCCGCAAACGTCGGCTAACGGGAAGATTGAGCTTGAGGATATTGAC-C 320
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| |||||
Sbjct 248 TAAAGGGATGTTGCCGCAAACGTCGGTTAACGGGAACATTAAGCTGGAGGAGGTTGACTT 307
Query 321 TAACAAGGCTCGAACCTAAGGATAAGAAACACCTTATGGAAATGATTTTGAGTTTCGTTG 380
|| || || | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 308 TATGAA-TCTTGCACCTAAGGAGAAGAAACAACTTATGGAAATGATTTTGAGTTTCGTTG 366
Query 381 AAGAAGACAATGAAAAGTTTCTACGT-GATTTGAGAGAAAGAACAGATAGAGTGGGAATT 439
|||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 367 AAGAAGACAACGAAAAGTTTCTACGTGGA-TTGAGAGAAAGAACAGACAGAGTGGGAATC 425
Query 440 GAAGTTCCAAAAATTGAAGTAAGGTATGAGAATATTTCAGTGGAAGGAGATGTGCGTAGT 499
|||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 426 GAAGCTCCGAAAATCGAAGTAAGGTATGAGAACATTTCAGTCGAAGGAGATGTGCGTAGT 485
Query 500 GCAAGTAGAGCGCTTCCTACTCTCTTCAACGTCACCTTGAATACAT-TGGAGAGCATTCT 558
||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 486 GCAAGTAGAGCTCTTCCTACTCTCTTCAACGTTACCTTGAATAC-TATGGAGAGCATTCT 544
Query 559 TGGATTCTTCCACCTCCTTCCATCTAAAAGGAAAAAGATTCAGATACTAAAAGATATCAG 618
||||||||| || || || || ||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||
Sbjct 545 TGGATTCTTTCATCTTCTCCCTTCTAAAAAGAGGAAGATAGAGATACTTAAAGATATCAG 604
Query 619 CGGCATTGTCAAACCATCAAGGATGACTTTATTACTTGGTCCACCAAGCTCAGGAAAAAC 678
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 605 TGGCATTGTCAAACCATCTAGGATGACTTTATTACTTGGTCCACCAAGTTCAGGGAAAAC 664
Query 679 AACTTTGTTACAAGCTTTGGCTGGGAAGCTCGATGACACTCTCCAGATGTCGGGGAGGAT 738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 665 AACTTTGTTACAAGCTTTGGCTGGGAAGCTCGATGACACCCTCCAGATGTCGGGGAGGAT 724
Query 739 AACATATTGCGGTCATGAGTTTCGCGAGTTTGTACCTCAAAAGACGTGTGCATACATCAG 798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 725 AACATATTGCGGTCATGAGTTTCGCGAGTTTGTACCTCAAAAGACGTGTGCATACATCAG 784
Query 799 TCAACATGACCTTCACTTTGGAGAAATGACGGTGAGAGAGATACTGGATTTTTCGGGACG 858
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 785 TCAACATGACCTTCACTTTGGAGAAATGACGGTTAGAGAGACACTGGATTTTTCGGGACG 844
Query 859 ATGTCTAGGTGTTGGAAGTCGGTACCAGTTGATGTCTGAGCTTTCAAGGAGGGAGAAAGA 918
||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 845 ATGTCTAGGTGTTGGGACTCGGTACCAGTTGATGGCTGAGCTTTCAAGGAGGGAGAAAGA 904
Query 919 AGAGGGAATAAAGCCAGACCCTAAAATTGATGCATTCATGAAATCCATTGCTATATCAGG 978
|||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 905 AGAGGGGATAAAACCAGACCCTGAAATTGATGCATTCATGAAATCCATTGCCATATCCGG 964
Query 979 GCAAGAAACTAGCTTGGTTACAGATTATGTACTTAAGATACTTGGTCTAGACATTTGTGC 1038
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 965 CCAAGAAACTAGTTTGGTTACAGATTATGTACTTAAGATACTTGGTCTAGACATTTGTGC 1024
Query 1039 TGACATACTTGCTGGAGACGTAATGAGAAGAGGTATTTCTGGTGGACAGAAGAAGCGTCT 1098
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1025 TGACATACTTGTTGGAGACGTAATGAGAAGAGGTATTTCTGGTGGACAGAAGAAGCGTCT 1084
Query 1099 AACAACAGGAGAGATGTTGGTAGGACCTGCGAGAGCTCTTTTTATGGATGAAATATCAAC 1158
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1085 AACAACAGGAGAGATGTTGGTAGGACCGGCGAGAGCTCTTTTCATGGATGAAATATCAAC 1144
Query 1159 AGGGTTGGATAGTTCCACAACATTTCAAATTTGCAAGTTCATGAGGCAACTAGTTCATAT 1218
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1145 AGGATTGGATAGTTCCACAACATTTCAAATTTGCAAGTTCATGAGGCAATTAGTTCATAT 1204
Query 1219 CTCGGATGTCACGATGATTATTTCGCTTCTACAACCAGCACCAGAGACATTCGAGCTTTT 1278
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1205 ATCAGATGTCACGATGATTATTTCGCTTCTACAACCGGCACCAGAGACATTTGAGCTTTT 1264
Query 1279 TGACGACATTATCTTGCTTTCCGAGGGCCAAATTGTCTACCAAGGCCCACGGGACAACGT 1338
||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1265 CGACAACATTATCCTGCTCTCTGAGGGCCAAATTGTCTACCAAGGCCCACGAGACAACGT 1324
Query 1339 TCTTGAGTTCTTTGAATACTTTGGTTTCCAATGTCCTGAAAGAAAAGGGGTTGCAGACTT 1398
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 1325 TCTTGAGTTCTTTGAGTACTTTGGTTTCCAATGTCCTGAAAGGAAAGGGGTTGCAGATTT 1384
Query 1399 TCTACAAGAAGTTACGTCTAAGAAGGACCAAGAACAGTATTGGAACAAGAGAGAACAACC 1458
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1385 TCTTCAAGAAGTTACGTCTAAGAAGGACCAAGAACAGTATTGGAACAAGAGAGAACAACC 1444
Query 1459 TTATAACTATGTGTCCGTAAGTGATTTTTCAAGCGGCTTTAGTACTTTCCACACCGGGCA 1518
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct 1445 TTATACCTATGTGTCCGTAAGTGATTTTTCAAGCGGCTTTAATACTTTTCACACCGGGCA 1504
Query 1519 GA-AACTTACTTCAGAATTCAGGGTTCCCTATGACAAAGCTAAAACTCATTCTGCTGCAC 1577
| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1505 -ACAACTTACTTCAGAATTTAGGGTTCCATATGAAAAAGCTAAAACCCATTCTGCTGCAC 1563
Query 1578 TAGTCACACAAAAGTATGGTATATCAAACTGGGAGCTCTTCAAAGCATGCTTTGATAGGG 1637
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1564 TAGTCACACAAAAGTATGGTATATCAAATTGGGAGCTGTTCAAAGCATGCTTTGATAGGG 1623
Query 1638 AATGGTTGCTTATGAAACGCAACTCCTTTGTGTATGTGTTCAAGACCGTCCAGATAACAA 1697
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 1624 AATGGTTGCTTATGAAACGTAACTCCTTTGTGTATGTTTTCAAGACCGTCCAGATAACCA 1683
Query 1698 TCATGTCTTTGATTACCATGACGGTCTATCTTAGGACAGAAATGCATGTTGGTACCGTGC 1757
|||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1684 TCATGTCTTTGATTGCCATGACGGTTTATTTTAGGACAGAAATGCATGTTGGCACCGTGC 1743
Query 1758 GAGATGGTCAAAAGTTTTATGGTGCTATGTTTTTCAGCTTGATCAATGTTATGTTTAATG 1817
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1744 GAGATGGTCAAAAGTTTTATGGTGCTATGTTTTTCAGCTTGATCAATGTAATGTTTAATG 1803
Query 1818 GACTAGCTGAACTAGCATTCACAGTGATGAGGCTCCCGGTGTTCTACAAGCAGAGGGACT 1877
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||
Sbjct 1804 GACTAGCTGAACTAGCATTCACAGTGATGAGGCTCCCTGTTTTCTACAAACAGAGGGACT 1863
Query 1878 TCTTGTTCTACCCTCCATGGGCTTTTGCCTTACCTGCTTGGCTTCTGAAGATTCCATTAT 1937
|||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||| ||||
Sbjct 1864 TCTTGTTCTATCCTCCATGGGCTTTCGCTTTACCAGCGTGGCTTTTGAAGATTCCGTTAT 1923
Query 1938 CTCTTATCGAATCAGGAATATGGATTGGTCTTACGTATTATACTATCGGTTTTGCTCCTT 1997
||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924 CTCTTATCGAATCTGGAATATGGATCGGTCTTACATATTATACTATCGGTTTTGCTCCTT 1983
Query 1998 CCGCTGCAAGGTTTTTCCGGCAGTTGCTAGCATACTTCTGTGTGAATCAGATGGCCCTTT 2057
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1984 CCGCTGCAAGGTTTTTCCGGCAGTTGCTGGCATACTTCTGTGTGAATCAGATGGCCCTTT 2043
Query 2058 CTTTGTTTAGATTCCTTGGAGCCATTGGAAGAACAGAAGTAATCTCTAACTCAATCGGAA 2117
| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
Sbjct 2044 CCTTGTTTAGATTCCTTGGAGCAATTGGAAGAACAGAAGTAATTTCTAACTCAATTGGGA 2103
Query 2118 CGTTCACATTGCTAATTGTATTTACTCTTGGAGGCTTCATTATTGCTAAAGATGACATTC 2177
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2104 CCTTCACATTGCTGATTGTATTTACTCTTGGAGGCTTCATTATTGCTAAAGATGACATTC 2163
Query 2178 -GACCGTGGATGACTTGGGCTTATTATATGTCCCCTATGATGTATGGACAGACTGCTATT 2236
| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2164 AG-CCGTGGATGACTTGGGCCTATTATATGTCCCCTATGATGTATGGACAGACTGCTATT 2222
Query 2237 GTTATGAATGAATTTCTCGATGAGAGATGGAGCAGTCCCAACTATGATACCCGCATCAAC 2296
|||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2223 GTTATGAATGAATTTCTCGATGAGCGATGGAGTAGTCCCAACAATGATACCCGCATCAAT 2282
Query 2297 GCGAAAACAGTTGGAGAAGTCCTACTAAAGAGCCGGGGCTTCTTTACGGAGCCATACTGG 2356
||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2283 GCGAAAACAGTTGGAGAAGTCTTGCTTAAGAGCCGGGGCTTCTTTACGGAGCCATACTGG 2342
Query 2357 TTTTGGATATGTATTGTGGCACTACTTGGATTTTCTTTGTTGTTCAATCTCTTCTACATA 2416
|||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 2343 TTTTGGATCTGTATCGTGGCATTACTTGGGTTTTCTTTGTTGTTTAATCTCTTTTACATA 2402
Query 2417 CTAGCCTTGATGTATTTGAACCCTCTTGGTAACTCCAAAGCTACAGTTGTGGAAGAAGGT 2476
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2403 CTAGCCTTGATGTATTTGAACCCTCTTGGTAACTCTAAAGCCGCAGTTGTGGAAGAAGGT 2462
Query 2477 AAAGACAAACAAAAAGGGGAAAACCGTGGAACAGAAGGTTCTGTTGTGGAACTTAATAGT 2536
||||| ||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 2463 AAAGAGAAACAGAAAG-------C-----AACAGAAGGTTCTGTACTGGAACTAAATAGT 2510
Query 2537 TCTTCAAATAAAGGGCCAAAGAGAGGAATGGTTTTACCTTTTCAACCACTTTCTCTTGCA 2596
|||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2511 TCTTCAGGTCATGGGACAAAGAGAGGAATGGTTTTACCTTTTCAACCACTTTCTCTTGCA 2570
Query 2597 TTCAACAATGTGAACTACTACGTTGATATGCCTTCAGAAATGAAGGCGCAAGGAGTGGAA 2656
||||| ||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2571 TTCAAAAATGTAAACTACTATGTGGATATGCCTACAGAAATGAAGGCGCAAGGAGTTGAA 2630
Query 2657 GGCGATCGTCTTCAATTACTAAGAGACGTTGGTGGAGCTTTCAGGCCAGGCATATTGACA 2716
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2631 AGCGATCGTCTTCAATTACTAAGAGATGTTGGTGGAGCTTTCAGGCCAGGAATATTGACA 2690
Query 2717 GCATTGGTTGGTGTCAGTGGTGCAGGTAAGACAACATTAATGGATGTCTTAGCCGGTAGG 2776
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||
Sbjct 2691 GCATTGGTCGGTGTTAGTGGTGCAGGTAAGACAACCTTAATGGATGTCTTGGCTGGTAGG 2750
Query 2777 AAAACTGGAGGGTACATCGAAGGGAGTATAAGCATATCTGGTTACCCAAAGAACCAA-AC 2835
||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2751 AAAACAGGAGGCTACGTCGAAGGGAGTATAAGCATATCTGGTTACCCAAAGAACCAAGA- 2809
Query 2836 AACATTTGCTAGAGTCAGTGGTTACTGTGAACAAAATGACATCCATTCTCCACATGTTAC 2895
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 2810 AACATTTGCTCGAGTCAGTGGTTACTGTGAACAAAATGATATCCACTCTCCACATGTTAC 2869
Query 2896 CGTTTATGAATCCCTCATCTATTCAGCTTGGCTTCGTCTTTCCACCGATATAGACATCAA 2955
|||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||
Sbjct 2870 CGTTTATGAATCTCTTATCTATTCAGCATGGCTTCGTCTTTCCGCCGATATAGATACCAA 2929
Query 2956 AACACGAGAGCTGTTTGTTGAAGAAGTAATGGAGTTGGTTGAGCTCAAACCTCTTAGAAA 3015
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2930 AACACGAGAGATGTTTGTTGAAGAAGTAATGGAGTTGGTGGAGCTCAAACCTCTTAGAAA 2989
Query 3016 CTCTATAGTTGGCCTTCCTGGAGTAGATGGTCTTTCAACCGAACAGAGGAAGAGGCTTAC 3075
|||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||
Sbjct 2990 CTCTATAGTTGGTCTTCCTGGGGTAAATGGTCTTTCTACAGAACAGAGGAAAAGGCTTAC 3049
Query 3076 TATTGCGGTTGAATTGGTAGCTAACCCATCAATAATCTTCATGGATGAACCAACATCTGG 3135
|||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3050 TATTGCAGTTGAGTTGGTAGCAAACCCATCAATAATCTTCATGGATGAGCCAACATCTGG 3109
Query 3136 TCTTGATGCAAGAGCTGCCGCTATTGTTATGCGTACTGTTAGGAATACCGTTGATACAGG 3195
||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3110 TCTGGATGCAAGAGCTGCCGCTATTGTTATGCGCACTGTTAGGAATACCGTTGATACAGG 3169
Query 3196 GAGGACTGTTGTCTGTACAATTCACCAGCCTAGCATCGACATTTTCGAATCATTCGATGA 3255
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 3170 GAGGACTGTTGTTTGTACAATTCACCAGCCTAGCATCGACATTTTTGAATCCTTCGATGA 3229
Query 3256 GCTTTTGTTGATGAAACGTGGAGGCCAAGTTATATATGCTGGAAGTCTAGGGCATCACTC 3315
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 3230 GCTTTTGTTGATGAAACGTGGAGGCCAAGTTATATATGCTGGAAGTCTTGGGCATCAATC 3289
Query 3316 TCAGAAACTAGTTGAATATTTTGAGGCTGTTGAAGGGGTTCCAAAGATCAATGACGGATA 3375
||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3290 TCAGAAACTTGTTGAATACTTTGAGGCTGTTGAAGGGGTTCCAAAGATCAAAGACGGATA 3349
Query 3376 CAATCCTGCGACGTGGATGCTTGACGTTACTACTCCTTCAATGGAGTCACAAATGAGCCT 3435
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |
Sbjct 3350 CAATCCTGCGACGTGGATGCTTGACGTCACTACTCCTTCAATAGAATCACAAATGAGCTT 3409
Query 3436 GGACTTTGCTCAAATATTCTCCAACTCCTCTCTTTATCGGAGAAATCAAGAACTCATCAA 3495
||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||
Sbjct 3410 GGACTTTGCACAAATATTCGCCAACTCCTCTCTTTATCAGAGAAATCAAGAACTCAT-AA 3468
Query 3496 -AGATTTAAGTACTCCACCACCTGGATCAAAGGATGTCTACTTCA-AAACAAAGTACGCG 3553
||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||
Sbjct 3469 CAGAGCTCAGTACTCCACCACCGGGATCAAAGGATGTCTACTTCCGAAACAA-GTACGCG 3527
Query 3554 CAATCGTTTTCTACTCAAACCAAAGCTTGCTTCTGGAAACAGTATTGGTCATATTGGAGA 3613
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3528 CAATCGTTTTCTACTCAAACCAAAGCTTGCTTCTGGAAACAGTATTGGTCATATTGGAGA 3587
Query 3614 CATCCTCAGTACAATGCCATTCGGTTTCTCATGACAGTGGTCATTGGCGTCTTGTTTGGT 3673
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 3588 CATCCTCAGTACAATGCCATTCGGTTTCTCATGACAGTAGTCATTGGTGTCTTGTTTGGT 3647
Query 3674 CTAATTTTCTGGCAAATAGGAACAAAAACAGAAAACGAACAAGACCTGAATAATTTCTTT 3733
|||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3648 CTAATTTTCTGGCAAATAGGAACAAAAATAGAGAACGAACAAGACTTGAATAATTTCTTT 3707
Query 3734 GGAGCCATGTACGCTGCTGTATTGTTCCTCGGTGCCTTAAACGCTGCAACAGTTCAGCCC 3793
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 3708 GGAGCCATGTATGCTGCTGTATTGTTCCTCGGTGCCACCAACGCTGCAACAGTTCAACCC 3767
Query 3794 GCAATTGCCATTGAGCGAACGGTCTTTTACCGCGAAAAAGCCGCTGGAATGTACTCCGCC 3853
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3768 GCAATTGCCATTGAGCGAACCGTGTTTTACCGCGAAAAAGCCGCTGGAATGTACTCTGCC 3827
Query 3854 ATTCCATATGCAATTTCGCAGGTAGCAGTGGAAATCATGTACAACACGATACAAACCGGA 3913
||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3828 ATTCCCTATGCAATTTCTCAGGTAGTAGTGGAAATCATGTACAACACGATACAAACCGGA 3887
Query 3914 GTTTACACGCTGATTCTATATTCAATGATCGGATGTAACTGGACTATGGCCAAATTCTTG 3973
||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3888 GTTTACACGCTAATCCTATACTCAATGATTGGATGTGACTGGACTGTGGCCAAATTCTTG 3947
Query 3974 TGGTTCTACTACTACATGTTAACAAGCTTCATCTACTTTACGCTATACGGTATGATGCTT 4033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3948 TGGTTCTACTACTACATGTTAACAAGCTTCATCTACTTTACGCTATACGGTATGATGCTT 4007
Query 4034 ATGGCCTTGACACCAAACTATCAGATTGCCGGAATCTGCATGTCCTTCTTCCTCAGTCTT 4093
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4008 ATGGCCTTGACACCAAACTATCAGATTGCCGGAATCTGCATGTCCTTCTTCCTCAGTCTT 4067
Query 4094 TGGAACCTCTTCTCCGGTTTCCTCATCCCCAGACCGCAAATACCTATATGGTGGAGATGG 4153
||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4068 TGGAATCTTTTCTCCGGTTTCCTCATTCCAAGACCGCAAATACCAATATGGTGGAGATGG 4127
Query 4154 TACTACTGGGCAACACCTGTGGCTTGGACATTGTATGGACTCATCACATCTCAAGTAGGA 4213
|||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4128 TACTACTGGGCATCACCTGTGGCTTGGACATTATACGGAATCATCACATCTCAAGTAGGA 4187
Query 4214 GACAAGGATTCAATGGTGCACATTAGTGGAATCGGAGACATAGATCTCAAAACGTTGCTC 4273
||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4188 GACAAGGATTCGATAGTGCACATCAGTGGAATCGGAGACATAGATCTGAAAACGTTGCTC 4247
Query 4274 AAAGAAGGATTTGGGTTTGAACATGACTTCTTACCAGTTGTAGCAGTTGTTCACATCGCT 4333
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4248 AAAGAAGGGTTTGGGTTTGAACATGACTTCTTACCAGTTGTAGCGGTTGTTCACATCGCT 4307
Query 4334 TGGATCTTACTCTTTCTCTTTGTCTTCGCCTATGGTATCAAGTTTCTCAACTTCCAAAGA 4393
|||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4308 TGGATCCTGCTCTTTCTCTTTGTCTTCGCATATGGTATCAAGTTTCTGAACTTCCAAAGA 4367
Query 4394 AGGTGAAGAGAGAACCTTAATAGAAAGAGT 4423
||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 4368 AGGTGAAGA-A---CCTTAATAGAAAGAGT 4393
> Ahg482613 jgi|Araly1|482613|fgenesh2_kg.4__1673__AT2G36380.1
Length=4491
Score = 5481 bits (2968), Expect = 0.0
Identities = 4020/4523 (89%), Gaps = 92/4523 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 44 ATGCTAGGACGAGATGAAGATCCGGTCGGAGCATTGAGTGGGAGAGTG-AGTTTGGCCTC 102
||| |||||||||| ||||||| |||| || || |||| ||||||| | || || || ||
Sbjct 1 ATGTTAGGACGAGACGAAGATCTGGTCCGAACAATGAGCGGGAGAG-GAAGCTTAGCGTC 59
Query 103 CACCAGTCACAGGAGTTTGGTCGGA---GCTTCCAAAAGCTTTC-GAGATGTGTTC-ATG 157
| | |||||| ||||||| | |||| ||||| |||||| ||| ||||||||||| |
Sbjct 60 CTCAAGTCACCGGAGTTTAGCCGGAGCTGCTTCAAAAAGC-TTCAGAGATGTGTTCGCT- 117
Query 158 CCTCAAACTGACGAGGTGTTTGG-GAGGAGCGAACGTCGGGAGGAAGATGACATGGAGCT 216
|| | ||| ||||| ||||| || | |||||||| | | || ||||||||| |||||||
Sbjct 118 CCCCCAACGGACGACGTGTTCGGTG-GGAGCGAAAGAAGAGAAGAAGATGACGTGGAGCT 176
Query 217 CCGATGGGCGGCGATTGAGAGATTGCCGACGTT-TGATCGGCTACGTAAAGGGATGTTGC 275
||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 177 CCGGTGGGCGGCGCTTGAGAGGTTACCGAC-TTACGATCGGCTACGAAAAGGTATGTTGC 235
Query 276 CGCAAACGTCGGCT-AACGGGAAGATT-GAGCTTGAGGATA-TTGACCTAAC-AAGGCTC 331
|||||||| ||| | |||||||||||| || ||||| || | ||||||| || || ||
Sbjct 236 CGCAAACGACGG-TCAACGGGAAGATTGGA-CTTGAAGA-AGTTGACCTCACGAA-TCTT 291
Query 332 GAACCTAAGGATAAGAAACACCTTATGGAAATGATTTTGAGTTTCGTTGAAGAAGACAAT 391
| |||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 292 GCACCTAAAGAGAAGAAACATCTTATGGAAATAATTTTGAAATTCGTTGAAGAAGATAAC 351
Query 392 GAAAAGTTTCTACG-TGATTTGAGAGAAAGAACAGATAGAGTGGGAATTGAAGTTCCAAA 450
||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||
Sbjct 352 GAAAAGTTTCTCCGCAGA-TTGAGAGAAAGAACTGACAGAGTAGGAATCGAAGTTCCGAA 410
Query 451 AATTGAAGTAAGGTATGAGAATATTTCAGTGGAAGGAGATGTGCGTAGTGCAAGTAGAGC 510
||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 411 AATAGAAGTAAGATATGAGAATATTTCAGTGGAAGGAGATGTTCGTAGTGCAAGCAGAGC 470
Query 511 GCTTCCTACTCTCTTCAACGTCACCTTGAATACATTGGAGAGCATTCTTGGATTCTTCCA 570
||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 471 TCTTCCGACTCTCTTCAACGTCACTTTGAATACAATCGAGAGCATTCTTGGATTATTCCA 530
Query 571 CCTCCTTCCATCTAA-AAGGA-AAAAGATTCAGATACTAAAAGATATCAGCGGCATTGTC 628
||||||||||||||| || || ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||
Sbjct 531 CCTCCTTCCATCTAAGAA-GAGGAAA-ATTCAGATACTTAAAGAGATCAGTGGCATTATC 588
Query 629 AAACCATCAAGGATGACTTTATTACTTGGTCCACCAAGCTCAGGAAAAACAACTTTGTTA 688
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 589 AAACCATCAAGGATGACTTTATTACTTGGTCCACCAAGTTCAGGGAAAACAACTTTGTTA 648
Query 689 CAAGCTTTGGCTGGGAAGCTCGATGACACTCTCCAGATGTCGGGGAGGATAACATATTGC 748
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||
Sbjct 649 CAAGCTTTAGCTGGGAAGCTCGATGACACTCTCCAGATGTCTGGGAGGATAACTTACTGC 708
Query 749 GGTCATGAGTTTCGCGAGTTTGTACCTCAAAAGACGTGTGCATACATCAGTCAACATGAC 808
|||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||
Sbjct 709 GGTCATGAGTTTCGTGAGTTTGTTCCTCAGAAGACGTGTGCCTACATTAGTCAGCATGAC 768
Query 809 CTTCACTTTGGAGAAATGACGGTGAGAGAGATAC--TGGATTTTTC-GGGACGATGTCTA 865
||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| || | ||||||||
Sbjct 769 CTTCACTTTGGAGAAATGACGGTGAGAGA-A-ACGGTGGATTTTTCTGGCA-GATGTCTA 825
Query 866 GGTGTTGGAAGTCGGTACCAG-TTGATGTCTGAGCTTTCAAGGAGGGAGAAAGAAGAGGG 924
|||||||| | |||||||||| || || ||||||| ||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 826 GGTGTTGGGACTCGGTACCAGCTT-TTGACTGAGCTCTCAAGGAGGGAGAGAGAAGCTGG 884
Query 925 AATAAAGCCAGACCCTAAAATTGATGCATTCATGAAATCCATTGCTATATCAGGG-CAAG 983
||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||
Sbjct 885 AATTAAGCCAGACCCTGAAATTGATGCATTCATGAAATCCATTGCCATATC-GGGCCAAG 943
Query 984 AAACTAGCTTGGTTACAGATTATGTACTTAAGATACTTGGTCTAGACATTTGTGCTGACA 1043
||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 944 AAACTAGTTTGGTTACAGACTATGTACTTAAGTTACTTGGTCTGGACATTTGTGCTGACA 1003
Query 1044 TACTTGCTGGAGACGTAATGAGAAGAGGTATTTCTGGTGGACAGAAGAAGCGTCTAACAA 1103
||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 1004 CACTTGTTGGAGATGTGATGAGACGAGGTATTTCTGGTGGACAGCGGAAACGTCTAACAA 1063
Query 1104 CAGGAGAGATGTTGGTAGGACCTGCGAGAGCTCTTTTTATGGATGAAATATCAACAGGGT 1163
||||||||||||| || ||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1064 CAGGAGAGATGTTAGTTGGACCAGCAACAGCTCTTTTCATGGATGAAATATCAACAGGGT 1123
Query 1164 TGGATAGTTCCACAACATTTCAAATTTGCAAGTTCATGAGGCAACTAGTTCATATCTCGG 1223
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 1124 TGGATAGTTCCACAACATTCCAAATTTGCAAGTTCATGAGGCAACTAGTTCATATCGCTG 1183
Query 1224 ATGTCACGATGATTATTTCGCTTCTACAACCAGCACCAGAGACATTCGAGCTTTTTGACG 1283
||||||| ||| | ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||
Sbjct 1184 ATGTCACTATGGTCATTTCGCTTCTACAACCTGCTCCCGAGACATTTGAGCTTTTCGACG 1243
Query 1284 ACATTATCTTGCTTTCCGAGGGCCAAATTGTCTACCAAGGCCCACGGGACAACGTTCTTG 1343
|||||||| | || || ||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||
Sbjct 1244 ACATTATCCTACTCTCAGAGGGTCAAATTGTCTACCAGGGGTCACGAGACAACGTTCTTG 1303
Query 1344 AGTTCTTTGAATACTTTGGTTTCCAATGTCCTGAAAGAAAAGGGGTTGCAGACTTTCTAC 1403
|||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |
Sbjct 1304 AGTTCTTTGAGTACATGGGTTTCCAATGTCCTGAAAGGAAAGGTATTGCAGATTTTCTGC 1363
Query 1404 AAGAAGTTACGTCTAAGAAGGACCAAGAACAGTATTGGAACAAGAGAGAACAACCTTATA 1463
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 1364 AAGAAGTTACGTCTAAGAAGGACCAAGAACAGTACTGGAACAGGAGAGAACAACCTTACA 1423
Query 1464 ACTATGTGTCCGT-AAGTGATTTTTCAAGCGGCTTTAGTACTTTCCACACCGGGCAGA-A 1521
|||||||||| || || |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||| | |
Sbjct 1424 ACTATGTGTCAGTGAA-TGATTTTTCAAGCGGCTTCAATTCTTTTCACACCGGGCA-ACA 1481
Query 1522 ACTTACTTCAGAATTCAGGGTTCCCTATGACAAAGCTAAAACTCATTCTGCTGCACTAGT 1581
|||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||
Sbjct 1482 ACTTGCTTCAGAATTCAGGGTTCCTTATGACAAAGCTAAAACCCATCCTGCTGCCCTAGT 1541
Query 1582 CACACAAAAGTATGGTATATCAAACTGGGAGCTCTTCAAAGCATGCTTTGATAGGGAATG 1641
|| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 1542 GACTCAAAAGTATGGTATATCAAACAAGGATCTGTTCAAGGCATGCTTTGATAGAGAATG 1601
Query 1642 G-TTGCTTATGAAACGCAACTCCTTTGTGTATGTGTTCAAGACCGTCCAGATAACAATCA 1700
| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1602 GCTT-CTTATGAAACGTAACTCCTTTGTGTATGTGTTCAAGACCGTCCAGATAACCATCA 1660
Query 1701 TGTCTTTGATTACCATGACGGTCTATCTTAGGACAGAAATGCATGTTGGTACCGTGCGAG 1760
||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || || |||| ||
Sbjct 1661 TGTCTTTGATTGCCATGACAGTCTATTTTAGGACAGAAATGCATGTCGGCACGGTGCAAG 1720
Query 1761 ATGGTCAAAAGTTTTATGGTGCTATGTTTTTCAGCTTGATCAATGTTATGTTTAATGGAC 1820
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | ||||||||||||
Sbjct 1721 ATGGTCAAAAGTTTTATGGTGCTCTCTTTTTCAGCTTGATAAATCTAATGTTTAATGGAA 1780
Query 1821 TAGCTGAACTAGCATTCACAGTGATGAGGCTCCCGGTGTTCTACAAGCAGAGGGACTTCT 1880
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 1781 TGGCTGAACTAGCATTCACAGTGATGAGGCTCCCGGTTTTCTTCAAGCAGAGGGACTTCT 1840
Query 1881 TGTTCTACCCTCCATGGGCTTTTGCCTTACCTGCTTGGCTTCTGAAGATTCCATTATCTC 1940
||||||| |||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1841 TGTTCTATCCTCCATGGGCTTTCGCCTTACCCGGTTTTCTTCTGAAGATTCCATTATCTC 1900
Query 1941 TTATCGAATCAGGAATATGGATTGGTCTTACGTATTATACTATCGGTTTTGCTCCTTCCG 2000
|||| ||||||| |||||||| | |||||| || || ||||| |||||||||||||| |
Sbjct 1901 TTATTGAATCAGTTATATGGATCGCTCTTACATACTACACTATTGGTTTTGCTCCTTCTG 1960
Query 2001 CTGCAAGGTTTTTCCGGCAGTTGCTAGCATACTTCTGTGTGAATCAGATGGCCCTTTCTT 2060
|||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1961 CTGCCAGGTTCTTCCGGCAGTTGCTTGCATACTTCTGTGTGAATCAGATGGCACTTTCTT 2020
Query 2061 TGTTTAGATTCCTTGGAGCCATTGGAAGAACAGAAGTAATCTCTAACTCAATCGGAACGT 2120
| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| ||| || |
Sbjct 2021 TATTTAGATTCCTTGGAGCCCTTGGACGAACAGAAGTAATCGCCAACTCGGGCGGGACAT 2080
Query 2121 TCA-CATTGCTAATTGTATTTACTCTTGGAGGCTTCATTATTGCTAAAGATGACATTCGA 2179
| | |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 2081 T-AGCATTGCTAGTCGTATTTGTTCTTGGAGGCTTCATTATTGCTAAAGATGACATCCCA 2139
Query 2180 CCGTGGATGACTTGGGCTTATTATATGTCCCCTATGATGTATGGACAGACTGCTATT-GT 2238
| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||
Sbjct 2140 TCATGGATGACTTGGGCCTATTATATATCCCCTATGATGTATGGACAGACTGC-ATTAGT 2198
Query 2239 TATGAATGAATTTCTCGATGAGAGATGGAGCAGTCCCAACTATGATACCCGCATCAACGC 2298
||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||
Sbjct 2199 TATGAATGAATTTCTGGATGAGCGATGGGGCAGTCCAAACAATGATACACGCATCAACGC 2258
Query 2299 GAAAACAGTTGGAGAAGTCCTACTAAAGAGCCGGGGCTTCTTTACGGAGCCATACTGGTT 2358
||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||
Sbjct 2259 GAAAACAGTTGGAGAAGTCTTGCTGAAGAGCCGAGGCTTCTTTACAGAACCATATTGGTT 2318
Query 2359 TTGGATATGTATTGTGGCACTACTTGGATTTTCTTTGTTGTTCAATC-TCTTCTACATAC 2417
|||||| ||||||| ||| |||||||| ||| || |||||||||| | |||| ||||||
Sbjct 2319 TTGGATCTGTATTGGGGCGCTACTTGGGTTTACTGTGTTGTTCAA-CTTCTTTTACATAA 2377
Query 2418 TAGCCTTGATGTATTTGAACCCTCTTGGTAACTCCAAAGCTACAGTTGTGGAAGAAGGTA 2477
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2378 TAGCTTTGATGTATTTGAACCCTCTCGGTAACTCCAAAGCTACAGTTGTGGAAGAAGGTA 2437
Query 2478 AAGACAAACAAAAAGGG-GAAAACCGTGGAACAGAAGGTTCTGTTGTGGAACTTAATAGT 2536
|||||||||| |||||| | | ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||
Sbjct 2438 AAGACAAACAGAAAGGGAGTCA-CCGTGGAACAGGAGGTTCTGTAGTGGAACTTACTAGT 2496
Query 2537 TCTTCAAATAAAGGGCCAAAGAGAGGAATGGTTTTACCTTTTCAACCACTTTCTCTTGCA 2596
|||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||
Sbjct 2497 ACTTCAAATCATGGACCAAAGAGAGGAATGGTTTTACCTTTCCAACCTCTTTCGCTTGCA 2556
Query 2597 TTCAACAATGTGAACTACTACGTTGATATGCCTTCAGAAATGAAGGCGCAAGGAGTGGAA 2656
||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 2557 TTCAACAATGTGAACTACTACGTGGATATGCCTGCAGAAATGAAGGCTCAAGGAGTTGAA 2616
Query 2657 GGCGATCGTCTTCAATTACTAAGAGACGTTGGTGGAGCTTTCAGGCCAGGCA-TATTGAC 2715
|||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||
Sbjct 2617 GGCGATCGCCTTCAATTACTAAGAGAGGTTGGTGGAGCTTTCAGGCCAGG-AGTATTGAC 2675
Query 2716 AGCATTGGTTGGTGTCAGTGGTGCAGGTAAGACAACATTAATGGATGTCTTAGCCGGTAG 2775
||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||
Sbjct 2676 AGCATTGGTCGGTGTTAGTGGTGCGGGTAAGACTACCTTAATGGATGTCTTGGCGGGTAG 2735
Query 2776 GAAAACTGGAGGGTACATCGAAGGGAGTAT-AAGCATATCTGGTTACCCAAAGAACCAAA 2834
|||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2736 GAAAACAGGAGGCTACATCGAAGGGAGTATTAA-CATATCTGGTTACCCAAAGAACCAAT 2794
Query 2835 CAACATTTGCTAGAGTCAGTGGTTACTGTGAACAAAATGACATCCATTCTCCACATGTTA 2894
||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 2795 CAACATTTGCTCGAGTCACTGGTTACTGTGAACAAAATGATATCCATTCTCCACATGTCA 2854
Query 2895 CCGTTTATGAATCCCTCATCTATTCAGCTTGGCTTCGTCTTTCCACCGATATAGACATCA 2954
||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||
Sbjct 2855 CCGTTTATGAATCCCTCATATATTCAGCATGGCTTCGTCTTTCCGCCGATATAGATACCA 2914
Query 2955 AAACACGAGAGCTGTTTGTTGAAGAAGTAATGGAGTTGGTTGAGCTCAAACCTCTTAGAA 3014
||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||
Sbjct 2915 AAACACGAGAGATGTTTGTTGAAGAAGTGATGGAGTTGGTGGAGCTAAAACCCCTTAGAA 2974
Query 3015 ACTCTATAGTTGGCCTTCCTGGAGTAGATGGTCTTTCAACCGAACAGAGGAAGAGGCTTA 3074
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2975 ACTCTATAGTTGGCCTTCCTGGTGTAGATGGTCTTTCAACAGAACAGAGGAAGAGGCTTA 3034
Query 3075 CTATTGCGGTTGAATTGGTAGCTAACCCATCAATAATCTTCATGGATGAACCAACATCTG 3134
||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 3035 CTATTGCAGTTGAATTGGTAGCTAACCCATCAATTATCTTCATGGACGAGCCAACATCTG 3094
Query 3135 GTCTTGATGCAAGAGCTGCCGCTATTGTTATGCGTACTGTTAGGAATACCGTTGATACAG 3194
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3095 GTCTTGATGCAAGAGCTGCCGCCATTGTTATGCGTACTGTTAGGAATACTGTTGATACAG 3154
Query 3195 GGAGGACTGTTGTCTGTACAATTCACCAGCCTAGCATCGACATTTTCGAATCATTCGATG 3254
|||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3155 GGAGAACTGTCGTTTGTACAATTCACCAGCCTAGCATCGACATTTTCGAATCCTTCGATG 3214
Query 3255 AGCTTT-TGTTGATGAAACGTGGAGGCCAAGTTATATATGCTGGAAGTCTAGGGCATCAC 3313
|| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||
Sbjct 3215 AG-TTGCTGTTGATGAAACGAGGAGGCCAAGTTATATATGCTGGAACTCTAGGACATCAC 3273
Query 3314 TCTCAGAAACTAGTTGAATATTTTGAGGCTGTTGAAGGGGTTCCAAAGATCAATGACGGA 3373
|| || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||
Sbjct 3274 TCACAAAAACTCGTTGAATACTTTGAGGCTATTGAAGGGGTTCCGAAGATTAAGGACGGA 3333
Query 3374 TACAATCCTGCGACGTGGATGCTTGACGTTACTACTCCTTCAATGGAGTCACAAATGAGC 3433
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3334 TACAATCCTGCGACGTGGATGCTTGACGTCACTACTCCTTCAATGGAGTCACAAATGAGC 3393
Query 3434 CTGGACTTTGCTCAAATATTCTCCAACTCCTCTCTTTATCGGAGAAATCAAGAACTCATC 3493
|||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3394 GTGGACTTTGCTCAAATATTCGCTAACTCCTCTCTTTATCGGAGAAATCAGGAACTCATC 3453
Query 3494 AAAGATTTAAGTACTCCACCACCTGG-ATCAAAGGATGTCTACTTCAAAACAAAGTACGC 3552
||||| | ||||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||| || ||||||||
Sbjct 3454 AAAGAACTCAGTACTCCACCAC-TGGGATCGAATGATCTCTACTTCCCGACCAAGTACGC 3512
Query 3553 GCAATCGTTTTCTACTCAAACCAAAGCTTGCTTCTGGAAACA-GTATTGGTCATATTGGA 3611
|||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||
Sbjct 3513 GCAACCATTTGCTACTCAAACCAAAGCTTGCTTCTGGAAA-ATGTATTGGTCAAACTGGA 3571
Query 3612 GACATCCTCAGTACAATGCCATTCGGTTTCTCATGACAGTGGTCATTGGCGTCTTGTTTG 3671
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 3572 GATATCCTCAGTACAATGCCATTCGGTTTCTCATGACAGTAGTCATTGGTGTCTTGTTTG 3631
Query 3672 GTCTAATTTTCTGGCAAATAGGAACAAAAACAGA-AAACGAACAAGACCTGAATAATTTC 3730
|||| |||||||||||| |||||| |||| ||| ||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 3632 GTCTCCTTTTCTGGCAAACAGGAACTAAAATAGAGAAA-GAGCAAGACCTGAATAATTTC 3690
Query 3731 TTTGGAGCCATGTACGCTGCTGTATTGTTCCTCGGTGCCTTAAACGCTGCAACAGTTCAG 3790
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 3691 TTTGGAGCCATGTATGCTGCTGTATTGTTCCTCGGTGCCACCAACGCTGCTACAGTTCAA 3750
Query 3791 CCCGCAATTGCCATTGAGCGAACGGTCTTT-TACCGCGAAAAAGCCGCTGGAATGTACTC 3849
||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3751 CCCGCGGTTGCAATTGAGCGAACGGT-TTTCTACCGCGAAAAAGCAGCTGGAATGTACTC 3809
Query 3850 CGCCATTCCATATGCAATTTCGCAGGTAGCAGTGGAAATCATGTACAACACGATACAAAC 3909
||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3810 CGCCATTCCCTATGCAATTTCTCAGGTAGCAGTAGAAATCATGTACAACATTATACAAAC 3869
Query 3910 CGGAGTTTACACGCTGATTCTATATTCAATGATCGGATGTAACTGGACTATGGCCAAATT 3969
|||||||||||| || || || || || |||||||||| |||||||| ||| ||||||
Sbjct 3870 CGGAGTTTACACACTAATCCTTTACTCGATGATCGGATACGACTGGACTGTGGTCAAATT 3929
Query 3970 CTTGTGGTTCTACTACTACATGTTAACAAGCTTCATCTACTTTACGCTATACGGTATGAT 4029
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3930 CTTCTGGTTCTACTACTACATGTTAACAAGCTTCATCTACTTCACGCTATACGGTATGAT 3989
Query 4030 GCTTATGGCCTTGACACCAAACTATCAGATTGCCGGAATCTGCATGTCCTTCTTCCTCAG 4089
|||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3990 GCTTGTGGCCTTGACACCAAACTATCAAATAGCCGGAATCTGCATGTCCTTCTTCCTCAG 4049
Query 4090 TCTTTGGAACCTCTTCTCCGGTTTCCTCATCCCCAGACCGCAAATACCTATATGGTGGAG 4149
||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4050 TCTTTGGAATCTTTTCTCCGGTTTCCTCATCCCTAGACCGCAAATACCAATATGGTGGAG 4109
Query 4150 ATGGTACTACTGGGCAACACCTGTGGCTTGGACATTGTATGGACTCATCACATCTCAAGT 4209
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||
Sbjct 4110 ATGGTACTACTGGGCATCACCTGTGGCTTGGACATTATACGGAATCATCACATCTCAAGT 4169
Query 4210 AGGAGACAAG-GATTCAATGGTGCACATTAGTGGAATCGGAGACAT-AGATCTCAAAACG 4267
|||||||| | ||||| || |||||||| | ||| | |||||||| || |||||| |||
Sbjct 4170 AGGAGACA-GCGATTCGATAGTGCACATCACTGGTGTTGGAGACATGAG-TCTCAAGACG 4227
Query 4268 TTGCTCAAAGAA-GGATTTGGGTTTGAACATGACTTCTTACCAGTTGTAGCAGTTGTTCA 4326
||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||
Sbjct 4228 TTGCTCAAA-ACTGGATTCGGGTTCGAACATGACTTCTTACCAGTTGTAGCTGCTGTCCA 4286
Query 4327 CATCGCTTGGATCTTACTCTTTCTCTTTGTCTTCGCCTATGGTATCAAGTTTCTCAACTT 4386
|||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4287 CATCGCCTGGATCTTGGTCTTTCTCTTTGTCTTTGCTTATGGTATCAAGTTCCTCAACTT 4346
Query 4387 CCAAAGAAGGTGAAGAGAGAACCTTAATAGAA-AGAGTTT-AAAT-C-TTTATAGAATAG 4442
|||||||||||||| | | ||| ||| ||||| ||| ||| ||| | |||||||| |||
Sbjct 4347 CCAAAGAAGGTGAA-A-A-AACTTTATTAGAAGAGA-TTTCAAAAACCTTTATAGATTAG 4402
Query 4443 TGTT-GAAAGTTTATGAATTCATGTAAAATTTCTTTAGAATGCACTTTTTGTTAATTGTT 4501
|||| ||| | ||||||||||||| |||||| | || ||| || || ||| ||
Sbjct 4403 TGTTTGAA--T----GAATTCATGTAAATTTTCTT--GTATTAACTAATTATTTATT-TT 4453
Query 4502 TTGTCATTT-GATTATTAATAAA 4523
||||| ||| | | |||||||||
Sbjct 4454 TTGTCGTTTCG-T-ATTAATAAA 4474
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 172400805690
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5