BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G67500.2
Length=5883
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg926002 jgi|Araly1|926002|scaffold_201563.1 7249 0.0
> Ahg926002 jgi|Araly1|926002|scaffold_201563.1
Length=5741
Score = 7249 bits (3925), Expect = 0.0
Identities = 4569/4869 (94%), Gaps = 87/4869 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1069 GATATTCTCAATCAACAGTTTAAAATGTACAACTCCCTTTCACAAGCCCAGTCTGATACT 1128
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 886 GATATTCTCAATCAACAGTTTAAAATGTACAACTCCCTTTCACAAGCCCAGTCTGATACT 945
Query 1129 AACATGGTTCAGTCGCTTGTGGCAATTTGGGAGGAGGAGTATGAAAGGACTGGTGTGCAT 1188
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 946 AACATGGTTCAGTCGCTTGTGACAATTTGGGAGGAGGAATATGAAAGGACTGGCGTGCAT 1005
Query 1189 GATGCACCTATACCTCCTGATCCTGGTAAACCCTCTGCAGCTGATGTGTTGCAGACTATG 1248
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct 1006 GATGCACCTATACCTCCTGATCCTGGCAAACCATCTGCAGCAGATGTGTTGAAGACTATG 1065
Query 1249 TCAGATTATGTTGGGTTTGGGAATATGCTTAAAGAAATGCTA-AACAAAGTTGAATTGTC 1307
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||
Sbjct 1066 TCAGATTATGTTGGGTTTGAGAATATGCTTAAAGAAATGC-ATAACGAAGTTGACTTGTC 1124
Query 1308 TCCGCCTGGTATGAAGCCTACTGCAGTATCTTCAGCTGGTCCAGATATGCATGCCAAACC 1367
|| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1125 TCAGTCTGATATGAAGCCTACTGCAGTATCTTCAGCCGGTCCAGATAGGCATGCCAAACC 1184
Query 1368 TGAAATTACTGATCTACAGGCTTTGAATCATATGGTTGGTACATGCAGTGAGTTTCCTGC 1427
|||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 1185 TGAAATTAGTGATCTGCAGGTTTTGAATCATATGGTTGGTACAAGCAGTAAGTTTCCTGC 1244
Query 1428 ATCAGAACAGCTTTCTCCACTTGGCGAGAAGAGTGAAGAAGCATCAATGGAAAATGATGA 1487
|||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1245 ATCAGAACAGCTTTCTCCACTTGGTGAGAGGAGTGGAGAAGCATCAATGGAAAATGATGA 1304
Query 1488 ATATATGAAAACACCCACGGACAGAGATACACCTGCTCAAATACAAGATGCTGAAGCCTT 1547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1305 ATATATGAAAACACCCACGGACAGAGATACACCTGCTGAAATACAAGATGCTGAAGCCTT 1364
Query 1548 GGGTCTCTTTAAGTGGTTTGCCTCATCTCAGGCTGCAGAGGACATAAACTCAGATGATGA 1607
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1365 GGGTCTCTTTAAGTGGTTTGCCTCATCCCAGGCTGCAGAGGACATAAACTCTGATGATGA 1424
Query 1608 GATTCTCCGGGAAACTATCCTTAGTCCTCTTTTGCCTTTAGCGTCTATTAACAAGGTTCT 1667
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 1425 AATTCTCCGGGAAACTATCCTTAGTCCTCTTTTGCCTTTAGCTTCCATTAACAAGGTTCT 1484
Query 1668 TGAAATGGCTAGTACAGATTATGTGAGCCAATCCCAAAAGGAATGTCAAGACATTCTTGA 1727
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1485 TGAAATGGCTAGTACAGATTATGTGAGCCAATCCCAAAAGGAATGTCAAGACATTCTTGA 1544
Query 1728 TTCTCAGGAAAATCTTCCAGACTTTGGGAGTTCGACTAAGAGAGCTTTACCTAGTAATCC 1787
|||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1545 TTCTCAGGAAGATCTACCAGACTTCGGGAGTTCGACAAAGAGAGCTTTACCTAGTAATCC 1604
Query 1788 TGATAGCCAGAATCTTAGAACTTCATCCGACAAACAATCTCTTGAAATAGAAGTCGCTAG 1847
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1605 TGATAGCCAGAATCTTATAACTTCATCGGACAAACAATCTCTTGAAACAGAAGTCGCTAG 1664
Query 1848 TGATGTTCCAGATAGCTCCACTTCAAATGGAGCAAGCGAAAATTCATTCCGGAGATACAG 1907
|||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1665 TGATGTTCCAGATATCTCCACTTCAAATGGCGCAAGCGAAAATTCATTCCAGAGATAC-- 1722
Query 1908 AAAGAGTGATTTACATACGAGTGAAGTAATGGAGTATAAGAACAGGAGCTTCTCTAAGAG 1967
| | | | | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1723 ----A--G----A-A-A-GAGTGAAGTAATGGAGAATAAGAACAGGAGCTACTCTAAGAG 1769
Query 1968 CAACAAGCCTAGCAACTCAGTATGGGGACCTTTACCTTTTACACTGACCAAAAATCTTCA 2027
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1770 CAACAAGCCTAGCAACTCAGTATGGGGACCTTTACTTTTTACACTGACCAAAAATCTTCA 1829
Query 2028 GAAGGACTTTGACAGTACAAATGCTAGTGATAAACTTGGTTTAACAAAGATTAGTTC--- 2084
||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1830 GAATGACTTTGACAGTACAAATACTAGTGATAAACTTGGTTTAACAAAGATTAATTCAGA 1889
Query 2085 TTACCCCATGAATGAGATGACAGACAATTATATTGTTCCAGTCAAAGAACATCAAGCAGA 2144
||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1890 CCACCCCATGAATGAGACGACAGACAAATATAATGTTCCAGTCAAAGAACATCAAGCAGA 1949
Query 2145 TGTTTGTAATACAATTGACAGAAACGTTTTGGCTGGATGTTCTCTGCGGGACTTGATGAG 2204
|||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1950 TGTTTGTAATTCGATTGACAGAAACGTTTTGGCTGGATTTTCTCTGCGGGACTTGATGAG 2009
Query 2205 aaaaaaaCGGTTATGCCATGGAGAATCGCCTGTTTCACAGCATATGAAGTCT----AGG- 2259
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | |||
Sbjct 2010 GAAAAAACGGTTATGCCATGGAGACTCGCCTGTTTCACAACATATGAAATTTAGAAAGGT 2069
Query 2260 ---A--A-GGT-TAGAGATTC-CCGACACGGGGaaaaaaaTG-AGTGCACCTTGAGATGT 2310
| | || ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |
Sbjct 2070 CCTACCACAGTCTAGAGATTCACC-ACACGGGGAAAAAAA-GCAGTGCACCTTGAGATCT 2127
Query 2311 GAGGCCAAAAAACAAGGTCCTGCTCTTTCTGCAGAATTTAGCGAATTTGTTTGTGGCGAT 2370
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||| |||
Sbjct 2128 GAGGCCGAAAAACAAGGTCCTGCTCTTTCTGCAGAATTTAGTGAAGTTGATTATGGTGAT 2187
Query 2371 ACT-C--CAAATTTATCTCCTATAGATTCTGGAAATTGCGAGTGTAATATATCCACTGAG 2427
|| | ||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||
Sbjct 2188 GCTCCTTCAACTTTATCTCCTATAGATGATGGAACTTGTGAGTGTAATATATCCACTCAG 2247
Query 2428 -TCATCTGAACTTCATTCTGTTGATAGATGTTCAGCTAAAGAGACAGCAAGTCAAAACAG 2486
| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2248 ATGA-CTGAACTTCATTCTGTTGGTAGATGTTCGGCTAAAGAGACAGCATTTCAAAACAG 2306
Query 2487 TGATGAAGTTTTAAGGAATTTGTCATCTACCACTGTTCCATTTGGTAAGGATCCACAAAC 2546
|||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 2307 TGATGAAGTTGTAAGGAATTTTTCATTTACCACTGTTTCACTTGGTAAGGATCCACAAAC 2366
Query 2547 TGTGGAATCAGGAACACTAGTGTCTAGCAATATACATGTTGGGATTGAAATAGATAG-TG 2605
|||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| | ||
Sbjct 2367 TGTGGAATCAGGAACATTAGTGTCTAGCAATAAACTTCTTGGGATTGAAATAGAT-GATG 2425
Query 2606 TCCAAAAATCGGGGAGGGAGCAAGAGTCAACTGCCAATGAAACTGATGAGACGGGAAGAT 2665
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||
Sbjct 2426 TCCAAAAATCGGGGAGGGAGCAAGAGTCAACTGCCAATGAAATTGTTGAGACAGGAAGAT 2485
Query 2666 TAATATGCCTAACCTTAAGCAAGAAGCCTCCTTCTCTCGATTGCCTAAGTGCTGGACTGC 2725
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||
Sbjct 2486 TAATATGCCTAACCTTAAGCAAGAAGCCTCCTTCTGTGGATTGCCTAAGTTCTGGACTGC 2545
Query 2726 AGGATTCTGCACATTCT--C---A----TG---AA-AT--TCATGCCAGGGAAAAACAGC 2770
| ||||||||||||||| | | || || | ||||||||||||||||||||
Sbjct 2546 ACGATTCTGCACATTCTCACGATATTCTTGCCCAATTTCATCATGCCAGGGAAAAACAGC 2605
Query 2771 ATGATGAATATGAGGGAAATTCCAACGACATCCCGTTTTTTCCCTTGGA-G-----G--A 2822
|||||| || |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| | | |
Sbjct 2606 ATGATGGATGTGAGGGGAATTCCAAGGACATCCCATTTTTTCCCTTGGAGGACACCGAAA 2665
Query 2823 -CAACAAGGA-GGAAAAGAAACACTTTTTCCAAGGAACTTCCCTTGGTATTCCCTTGCAT 2880
||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2666 TCAACAAGGATGG-AAAGAAACACTTATTCCAAGGAGCTTCCCTTGGTATTCCCTTGCAT 2724
Query 2881 CATCTCAATGACGGCTCCAATCTTTACCTACTGACCCCTGCCTTTTCACCCCCTTCTGTG 2940
||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2725 CATCTCAATGACGGCTCAAATCTTTACCTACTGGCCCCTGCCTTGTCACCCCCTTCTGTG 2784
Query 2941 GATTCTGTTTTACAATGGATATC-GAATGACAAAGGAGACTCTAATATTGATTCAGAAAA 2999
||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2785 GATTCTGTTTTACAATGGATAGCAGAA-GACAAAGGAGACTATAATATTGATTCAGAAAA 2843
Query 3000 ACAACCATTACG-AGATAATCATAATGATCGTGGAGCAAGTTTCACTGATCTTGCTTCTG 3058
|||||||||| | |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2844 ACAACCATTA-GAAGATGATCATATTGATCGTGGGGCAAGTTTCACTGATCTTGCTTCTG 2902
Query 3059 CATCTAATGTGGTGTCTGTGTCTGAGCACGTGGAGCAGCATAATAACCTTTTTGTGAATT 3118
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2903 CATCTAATGTGGTGTCTGTGTCTGAGCACGTGCAGCATCATAATAACGTTTTTGTGAATT 2962
Query 3119 CAGAATCAAATGCTTATACAGAGTCGGAGATAGATCTGAAACCCAAAGGAACGTTTCTTA 3178
||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 2963 CAGAATCAAATACTTATACAGAGTCTGAGATAGATCTGAAACGTAGAGGAACGTTTCTTA 3022
Query 3179 ATCTTAACTTGCAGGCCAGTGTTTCCCAAGAGCTGTCTCAGATTTCAGGCCCTGATGGGA 3238
|||||||| | | ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3023 ATCTTAAC-T-C---TCAG-ATTTCCCAAGAGATGTCTCAGATTTCAGGTCCTGATGGGA 3076
Query 3239 AATCTGGGCCCACTCCCTTAAGTCAAATGGGATTCCGAGATCCTGCGAGCATGGGTGCGG 3298
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 3077 AATCAGGGCCCACTCCCTTAAGTCAAATGGGATTCCGAGATCCTGCGAGCATGGGGGCTG 3136
Query 3299 GGCAACAGCTTACAATTCTGAGTATAGAGGTTCATGCAGAGTCTAGAGGGGACCTGCGAC 3358
||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3137 GGCAACAACTTACAGTGCTGAGTATAGAGGTTCATGCAGAGTCTAGAGGGGACCTGCGAC 3196
Query 3359 CTGATCCACGATTTGATTCTGTCAATGTTATAGCTCTCGTCGTGCAGAATGACGATAGTT 3418
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3197 CTGATCCACGATTTGATTCTGTCAATGTCATAGCTCTCGTCGTGCAGAATGACGATAGTT 3256
Query 3419 TTGTAGCTGAAGTATTTGTGCTTTTATTTAGTCCAGATAGCATTGATCAGAGAAATGTTG 3478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 TTGTAGCTGAAGTATTTGTGCTTTTATTTAGTCCAGATAGCATTGATCAGAGAAATGTTG 3316
Query 3479 ATGGCCTATCTGGATGCAAGTTGTCTGTATTCCTTGAAGAGAGGCAACTATTCAGATATT 3538
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3317 ATGGCCTATCTGGATGCAAGTTTTCTGTATTCCTTAAAGAGAGGCAACTATTCAGTTATT 3376
Query 3539 TTATTGAGACTTTATGTAAATGGGATCCAGATGTTCTTCTGGGCTGGGATATACAGGGCG 3598
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 3377 TTATTGAGACTTTATGTAAATGGGATCCAGATATTCTTCTGGGATGGGATATACAGGGTG 3436
Query 3599 GATCCATTGGTTTTCTAGCTGAAAGAGCTGCACAGCTTGGTATAAGATTTCTCAATAATA 3658
||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3437 GATCCATTGGTTTTCTAGCTGAAAGGGCTGCCCAGCTTGGCATAAGATTTCTCAATAATA 3496
Query 3659 TATCTAGGACGCCATCTCCGACCACAACAAACAATTCAGATAATAAGAGAAAACTTGGTA 3718
||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3497 TATCTAGGACGCCATCTCCGACCACGAGAAACGATTCAGATAATAAGAGAAAGCTTGGTA 3556
Query 3719 ATAATCTGCTGCCAGATCCGTTGGTAGCTAATCCTGCTCAAGTAGAAGAAGTGGTAATTG 3778
| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3557 AAAATCTGCTGCCAGATCCTTTGGTAGCTGATCCTGCTCAAGTAGAAGAAGTGGTAATTG 3616
Query 3779 AGGACGAGTGGGGCCGCACACATGCTAGTGGTGTTCATGTTGGAGGTAGAATTGTTCTCA 3838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3617 AGGACGAGTGGGGCCGCACACATGCTAGTGGTGTTCATGTTGGAGGTAGAATTGTTCTCA 3676
Query 3839 ATGCATGGCGTTTGATTCGCGGGGAAGTTAAACTCAACATGTACACGATTGAAGCTGTGT 3898
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3677 ATGCATGGCGTTTGATTCGCGGGGAAGTTAAACTCAACATGTACACAATTGAAGCTGTGT 3736
Query 3899 CAGAGGCTGTTTTGAGGCAGAAGGTTCCATCAATCCCCTATAAGGTATTGACAGAATGGT 3958
| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3737 CGGAGGCTGTTTTGAGGCAGAAGATTCCATCCATCCCCTATAAAGTATTGACAGAATGGT 3796
Query 3959 TTTCAAGTGGTCCTGCGGGTGCAAGATATAGATGCATAGAATATGTGATTCGGCGAGCAA 4018
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||
Sbjct 3797 TTTCAAGTGGTCCTGCGGGGGCAAGATATCGATGCATAGAATATGTGGTTCGCCGAGCAA 3856
Query 4019 ATTTGAACCTTGAGATAATGAGCCAACTTGACATGATAAATCGTACGTCAGAACTTGCTC 4078
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3857 ATTTGAACCTTGAGATAATGAGTCAACTTGACATGATAAATCGTACGTCAGAACTTGCTC 3916
Query 4079 GTGTTTTTGGTATAGACTTTTTCTCAGTTCTCTCCCGAGGTTCACAGTACAGAGTGGAAT 4138
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 3917 GTGTTTTTGGCATAGACTTTTTCTCAGTTCTCTCCCGAGGTTCCCAATACAGAGTGGAAT 3976
Query 4139 CCATGCTTCTGAGATTAGCACATACACAAAATTATCTTGCTATTTCTCCAGGAAACCAAC 4198
| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3977 CTATGCTTTTGAGATTAGCACACACACAAAATTATCTTGCTATATCTCCAGGAAACCAAC 4036
Query 4199 AGGTTGCCTCTCAGCCAGCTATGGAATGTGTACCTCTTGTGATGGAACCAGAATCTGCCT 4258
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4037 AGGTTGCTTCTCAGCCAGCTATGGAATGTGTACCTCTTGTGATGGAACCGGAATCTGCCT 4096
Query 4259 TTTACGATGATCCTGTTATTGTGTTGGATTTTCAATCTCTTTACCCTTCAATGATTATAG 4318
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4097 TCTACGATGATCCTGTTATTGTGTTGGATTTTCAATCTCTTTACCCTTCAATGATTATAG 4156
Query 4319 CATATAATCTGTGCTTTTCTACATGTCTCGGAAAACTTGCACATTTGAAGATGAACACCC 4378
|||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4157 CATATAATCTGTGCTTTTCTACGTGTCTTGGAAAACTTGCACATTTGAAGATGAACACCC 4216
Query 4379 TTGGGGTCAGCTCATACTCTCTAGACCTCGATGTTCTTCAGGATTTAAATCAGATCCTAC 4438
|||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 4217 TTGGGGTCAGCTCATACTCTCTAGACCTTGGTGTTCTTCAGGATTTAAATCAAATCCTGC 4276
Query 4439 AGACCCCAAACAGTGTGATGTACGTGCCACCAGAGGTGCGTAGAGGAATTTTACCTAGGC 4498
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 4277 AGACCCCAAACAGTGTGATGTATGTGCCACCAGAGGTGCGCAGAGGAATTTTACCAAGGC 4336
Query 4499 TGCTAGAGGAGATTCTGTCTACAAGAATAATGGTGAAAAAAGCAATGAAAAAGTTGACTC 4558
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4337 TGCTAGAGGAAATTCTATCTACAAGAATAATGGTGAAAAAAGCAATGAAAAAGTTGACTC 4396
Query 4559 CTTCAGAAGCAGTTCTTCACCGGATATTTAATGCGAGGCAGCTTGCTTTAAAGCTGATAG 4618
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4397 CTTCAGAAGCAGTTCTTCACCGGATATTTAATGCAAGGCAGCTTGCTTTAAAGCTGATAG 4456
Query 4619 CAAATGTGACTTATGGTTATACTGCTGCTGGCTTCAGTGGTCGAATGCCTTGTGCAGAGC 4678
||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4457 CAAATGTTACTTATGGCTATACTGCTGCTGGCTTCAGTGGTCGAATGCCTTGTGCAGAGC 4516
Query 4679 TGGCAGATAGTATTGTCCAGTGTGGTCGTAGCACACTTGAGAAGGCTATTTCATTCGTCA 4738
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 4517 TGGCAGATAGTATTGTCCAGTGTGGTCGTAGCACACTTGAGAAGGCTATTTCGTTTGTCA 4576
Query 4739 ATGCCAATGATAATTGGAACGCTAGAGTTGTATATGGTGACACTGATAGTATGTTTGTCC 4798
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4577 ATGCCAATGATAGTTGGAACGCTAGAGTTGTATATGGTGACACTGATAGTATGTTTGTCC 4636
Query 4799 TCCTAAAAGGACGAACTGTAAAAGAAGCTTTTGTAGTCGGACAAGAGATTGCATCTGCAA 4858
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4637 TCCTCAAAGGACGAACTGTAAAAGAAGCTTTTGTAGTCGGACAAGAGATTGCATCTGCAA 4696
Query 4859 TAACTGAAATGAACCCACACCCAGTCACTTTAAAGATGGAGAAAGTCTATCACCCTTGTT 4918
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4697 TAACTGAAATGAATCCACACCCAGTCACTTTAAAGATGGAGAAAGTCTATCACCCTTGTT 4756
Query 4919 TCCTTCTTACGAAGAAGCGTTATGTTGGGTACAGTTATGAAAGTCCCAATCAGAGA-GAG 4977
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||
Sbjct 4757 TCCTTCTTACGAAGAAGCGCTATGTTGGGTACAGTTATGAAAGTCCCGATCAGA-ACGAG 4815
Query 4978 CCTATATTTGATGCAAAAGGTATTGAAACTGTTCGAAGAGACACTTGTGAAGCTGTTGCG 5037
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4816 CCTATATTTGATGCAAAAGGTATTGAAACTGTTCGAAGAGACACTTGTGAAGCTGTTTCA 4875
Query 5038 AAAACTATGGAGCAATCGTTGAGACTCTTTTTTGA-ACAGAAGAACATCTCTAAGGTTAA 5096
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||
Sbjct 4876 AAAACTATGGAGCAATCGTTGAGACTCTTTTTTGAGA-AGAAGAGCATCTCTAAGGTTAA 4934
Query 5097 GTCGTACTTGTATAGACAGTGGAAGCGGATACTATCAGGGAGAGTGTCTCTTCAAGATTT 5156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4935 GTCGTACTTGTATAGACAGTGGAAGCGGATACTATCAGGGAGAGTGTCTCTACAAGATTT 4994
Query 5157 TATCTTTGCAAAAGAAGTTCGGTTGGGTACTTACAGCACAAGAGACTCTTCACTCCTTCC 5216
| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4995 TGTCTTTGCAAAAGAAGTTCGGTTGGGGACTTATAGCACAAGAGACTCTTCACTCCTTCC 5054
Query 5217 TCCAGCAGCTATTGTGGCAACCAAATCAATGA-AAGCAGACCCTCGGACAGAGCCACGCT 5275
|||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5055 TCCAGCTGCTATTGTGGCAACCAAATCAATGAGAA-CAGACCCTCGGACAGAGCCACGCT 5113
Query 5276 ATGCTGAACGAGTGCCTTATGTTGTGATTCATGGGGAGCCAGGAGCTCGACTTGTTGATA 5335
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5114 ATGCGGAACGAGTGCCTTATGTTGTGATCCATGGGGAGCCAGGAGCTCGACTTGTTGATA 5173
Query 5336 TGGTTGTTGATCCACTGGTTCTTTTGGACGTCGATACACCCTACCGACTGAATGACTTAT 5395
|||| || || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5174 TGGTGGTGGACCCACTGGTTCTTTTGGACATTGATACACCCTACCGATTGAATGACTTAT 5233
Query 5396 ACTACATCAACAAACAAATTATACCAGCTTTGCAAAGGGTATTTGGACTCGTGGGTGCAG 5455
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5234 ACTACATCAACAAACAAATTATACCGGCTTTGCAAAGGGTATTTGGACTCCTGGGTGCAG 5293
Query 5456 ACTTAAACCAGTGGTTTTTGGAGATGCCCCGTCTCACCAGAAGCTCCCTTGGTCAACGTC 5515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5294 ACTTAAACCAGTGGTTTTTGGAGATGCCCCGTCTCACCAGAAGCTCCCTTGGTCAACGTC 5353
Query 5516 CCTTAAACTCTAAAAACTCACACAAAACAAGGATTGATTATTTTTATCTATCGAAACATT 5575
|||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 5354 CCTTAAGCTCTAAAAACTCACACAAAACGAGAATTGATTATTTTTATCTCTCGAAACATT 5413
Query 5576 GCATCTTGTGTGGGGAAGTTGTTCAAGAATCTGCTCAACTATGCAACCGGTGCCTTCAAA 5635
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 5414 GCATCTTGTGTGGGGAAGTTGTTCAAGAATCTGCTCAGCTATGCAACCGGTGCCT-CAAA 5472
Query 5636 A-TAAAAGTGCTGCTGCTGCAACCATTGTTTGGAAGACTTCAAAGTTGGAGAGAGAGATG 5694
| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 5473 AATAAAAGTGCTGCTGATGCAACCATTGTTTGGAAGACTTCAAAATTGGAGAGAGAGATG 5532
Query 5695 CAACACCTAGCCACGATATGCAGACACTGTGGTGGGGGAGACTGGGTGGTGCAAAGCGGA 5754
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 5533 CAACACCTAGCCACGATATGCAGACACTGTGGTGGGGGAGACTGGGTGGTGCAATGCGGA 5592
Query 5755 GTGAAATGCAATTCCCTTGCGTGCTCAGTCTTTTACGAGAGACGGAAAGTTCAGAAAGAG 5814
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5593 GTGAAATGCAATTCCCTTGCTTGCTCAGTCTTTTACGAGAGACGGAAAGTTCAGAAAGAG 5652
Query 5815 CTTCGTGGCCTCTCCTCCATTGCTACTGAGAGTGAGCTTTACCCTAAATGCATGGCTGAG 5874
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5653 CTTCGTGGCCTCTCCTCCATTGCTACTGAGAGTGAGCTTTACCCTAAATGCATGGCTGAG 5712
Query 5875 TGGTTCTAA 5883
|||||||||
Sbjct 5713 TGGTTCTAA 5721
Score = 1338 bits (724), Expect = 0.0
Identities = 836/887 (94%), Gaps = 20/887 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 112 CAAAGTCACGGCGAAACAGCCATGGCTGATTCTCAATCCGGTTCCAATGTTTTCAGTTTA 171
||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CAAAGTCCCGGCGAAGCAGCCATGGCTGATTCTCAGTCCGGTTCCAATGTTTTCAGTTTA 60
Query 172 CGGATAGTTTCAATCGATTATTACATGGCTTCTCCAATCCCTGGTTATAATATTTGCTAC 231
||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||
Sbjct 61 CGGATTGTTTCAATAGATTATTACATGGCTTCTCCTATCCCTGGTTATGATATTTGCTAC 120
Query 232 AGTAGCTTCCAAGGTAGTGAGGTAAATGAAGTCCCTGTTATAAGGATATACGGCTCTACA 291
||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 121 AGTAGCTTCCAAGGTGGTGAGGTAAACGAAGTCCCTGTTATAAGGATATATGGCTCTACA 180
Query 292 CCTGCTGGTCAGAAGACTTGCTTGCACATTCATCGTGCTTTACCATATCTCTATATTCCG 351
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 CCTGCTGGTCAGAAGACTTGCCTGCACATTCATCGTGCTTTACCATATCTCTATATTCCA 240
Query 352 TGCTCAGAAATTCCACTTGAGCATCATAAAGGAG-TGGATGGAAGTACACTTGCTTTATC 410
||||| || ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 TGCTCGGAGATTCCACCTGAGCATCATAAAGGAGCT-GATGGAAGTACACTTGCTTTATC 299
Query 411 CCTTGAGTTAGAGAAGGCTCTAAAGCTTAAGGGAAATGCTGCTTCAAAAAGGCAACATAT 470
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 300 CCTTGAGTTAGAGAAGGCTCTAAAGCTTAAGGGCAATGCTGCTTCAAAAAGGCAACATGT 359
Query 471 CCATGATTGTGAGATTGTAAGAGCAAAGAAGTTTTATGGGTACCACTCAACAGAGGAGGC 530
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 360 CCATGATTGTGAGATTGTTAGAGCAAAGAAGTTTTATGGGTACCACTCAACTGAGGAGGC 419
Query 531 TTTTGTGAAGATTTATCT-TA-----G------CTACCATCCACCCGATGTGGCTCGTGC 578
|||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 TTTTGTGAAGATTTATCTGTATCCTTGTAATAGCTACCATCCACCCGATGTGGCTCGTGC 479
Query 579 TGCCAGTCTTCTTCTGGCAGGTGCTGTTCTTGGTAAAAGTTTGCAGCCTTACGAGTCTCA 638
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 TGCCAGTCTTCTTCTGGCAGGTGCTGTTCTTGGTAAAAGTTTGCAGCCTTACGAGTCTCA 539
Query 639 TATTCCCTTTATTCTCCAGTTTCTGGTTGATTATAATTTGTATGGAATGGGTCATGTGCA 698
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 540 TATTCCTTTTATTCTCCAGTTTCTGGTTGATTATAATTTGTATGGAATGTGTCATGTGCA 599
Query 699 TATATCAAAGATGAAGTTCCGTAGCCCAGTGCCTCACCATTTCCGGCCAAGGAGATTTGA 758
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 600 TATATCAAAGATGAAGTTCCGTAGCCCAGTTCCTCACCATTTCCTTCCAAGGAGATTTGA 659
Query 759 TTTGGATGATTGTCCGGGACAAAGGATTGACGAAGTGGCTATTACAAAGGCAAATTCAAG 818
|||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 660 TTTGGAAGATTGTGCGGGACAAAGGATTGACGAAGTGGCTATAACAAAGGCAAATTCAAG 719
Query 819 TGCTGCTGCAAGCGTCAGTTTTCCTGTTTGGAGCTTGTCAACAATCCCAGGTCAGTGGAT 878
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 720 TGCTGCTGCAAGCGTCAGTTTTCCTGTTTGGAGCTTGTCAACAATCCCAGGTCAATGGAT 779
Query 879 GTGGAATCTCTCTGAAGAATCTGATACACCGTTGAGCCAGAGCCAGCATAGGCACCAACA 938
||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 780 GTGGAATATCTCAGAAGAATCTGATACACCGTTGAGCCAGAGCCAGCATAGGCACTA--- 836
Query 939 CCATTACAGACGTCAGAGTCTCTGTGAACTTGAGGGAGATGCTACTA 985
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 837 ---TTACAGACGTCAGAGTCTCTGTGAACTTGAGGGAGATGCTACTA 880
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 222865147488
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5