BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G69340.1
Length=2101
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg476061 jgi|Araly1|476061|fgenesh2_kg.2__1191__AT1G69340.1 3415 0.0
Ahg339169 jgi|Araly1|339169|fgenesh1_pg.C_scaffold_2001268 2804 0.0
> Ahg476061 jgi|Araly1|476061|fgenesh2_kg.2__1191__AT1G69340.1
Length=2088
Score = 3415 bits (1849), Expect = 0.0
Identities = 2018/2098 (96%), Gaps = 18/2098 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 10 AAACGACAACTCAATTTTTTGTCGTCGTAGCTGGTTTTGATGTT-TCCGATACTTCATCG 68
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||
Sbjct 1 AAACGACAACTCAA-TTTTTGT-GTCGTAGCTGGTTTTGATGTTGT-GGCTACTTCATCG 57
Query 69 ATCCACAGTTGTAGAAAATTCTTC--GACATGAAGTTGAAATTCTGATTAGGGTCTTCCT 126
||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||
Sbjct 58 ATCCACAGTTGTAGAAATTTGTTCTTGACATGAAGTTGAAATTCTGATTAGGCTCTTTCT 117
Query 127 CGATTCGCTTTTGGTGAATCAAATTTCTTTAATTTCAGTGAATACGCTTTTGACAGGAGG 186
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 118 CGATTCGCTTTTGGTGAATCAAATTTCTTTAATTTCAGTGAATAAGCTTTTGACAGGAGC 177
Query 187 ACCATACTAAGTCTTGGGAAAACCCTCTTCATAGTGGGTTTGATCTACAATGATGTATC- 245
| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 178 A-TATACTAAGTCTTGGGCAAACCCTCTTTATAGTGGGTTTGATCTACAATGATGTATCA 236
Query 246 AGACAATTCCCACGGCACCAACCATTCGTGGTGGAACTCCAACAGAGAGTGGTGATTACG 305
|| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 237 AG-CCATTCCCACGGCGGCAACCATTCGTGGTGGAACTCCAACAGAGAGTGGTGATTACG 295
Query 306 TTGTGACTTTGGATCAGATTCCACGGTGGAGTGATGTTGAGCAGAGATCATCTTTGGAGG 365
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 296 TTGTTACTTTGGATCAGATTCCACGGTGGAGTGATGTTGAGCAGAGGTCATCTTTGGAGG 355
Query 366 ATGAGACAGGAGATCCAGAACATTCGAATCCGCGCTACGCAAACCCTTTGGCTTCGTCTT 425
||| ||||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 356 GTGAAACAGGAGATCCTGCACATTCGAATCCACGGTATGCAAACCCTTTGGCTTCGTCTT 415
Query 426 CCGAAGCAGGGAGCAGCGGGAATGGGATGGTATCTAAGTTTCCTGTTGATCACGAGATAA 485
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 416 CTGAAGCAGGGAGCAGCGGGAATGGGATGGTATCTAAGTTTCCTGTTGACCACGAGATAA 475
Query 486 ACTCTAGAATATACCTTTGGAGAGGGGAACCTTGGAACCTTGAGGTTGATGCTGTTGTAA 545
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 476 ACTCTAGAATATACCTGTGGAGAGGGGAACCTTGGAACCTTGAGGTTGATGCTGTTGTGA 535
Query 546 ATTCGACAAATGAGAACTTGGATGAGGCACATAGCAGTCCTGGTCTACATGTGGCTGCTG 605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 536 ATTCGACAAATGAGAACTTGGATGAGGCACATAGCAGTCCTGGTCTACATGTGGCTGCTG 595
Query 606 GACCTGGCCTTGCAGAGCAATGTGCTACATTGGGTGGATGCAGGACAGGGATGGCGAAAG 665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 596 GACCTGGCCTTGCAGAGCAATGTGCTACATTGGGTGGATGCAGGACAGGGATGGCAAAAG 655
Query 666 TAACAAATGCCTATGATCTACCAGCGAGGAGGGTTATCCATACAGTAGGACCCAAGTATG 725
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 656 TAACAAATGCCTATGATCTACCAGCGAGGCGGGTTATCCACACAGTAGGACCCAAGTATG 715
Query 726 CAGTAAAGTATCATACAGCTGCTGAGAATGCTCTAAGTCACTGCTATAGATCTTGTCTGG 785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 716 CAGTAAAGTATCATACAGCTGCTGAGAATGCTCTAAGTCACTGCTATAGATCTTGTCTGG 775
Query 786 AACTTCTCATAGATAGTGGGCTACAAAGTATCGCTCTGGGCTGTATATACACAGAAGCCA 845
| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 776 AGCTTCTCATAGACAGTGGCCTTCAAAGTATCGCTATGGGCTGTATATACACAGAAGCCA 835
Query 846 AAAACTATCCCCGAGAACCAGCTGCTCATGTTGCCATAAGAACTGTTCGCCGCTTTCTAG 905
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 836 AAAACTATCCCCGAGAACCAGCTGCTCATGTTGCCATAAGAACTGTTCGCCGCTTTCTAG 895
Query 906 AGAAGCAAAAGGATAAAATCAGTGCCGTTGTTTTCTGTACCACCACATCCTCTGATACGG 965
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 896 AAAAGCAAAAGGATAAAATCAGTGCCGTTGTTTTCTGTACCACCACATCCTCTGATACAG 955
Query 966 AGATATACAAACGATTACTTCCACTTTACTTTCCTCGAGATGAACATGAGGAAGAGGTTG 1025
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 956 AGATATACAAACGATTACTTCCACTTTACTTTCCTCGAGATGAACATGAGGAAGAGGTTG 1015
Query 1026 CCATATCAAAGCTCCCGGCTGATGTTGGAGATGAAAATGGTGAGACGGTTATAGACGAAC 1085
|||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1016 CCATCTCAAAGCTTCCAGCTGATGTTGGAGATGAAAATGGTGAGACGGTTATAGACGAAC 1075
Query 1086 GTAAAATCAGAATACAGGCGCTGCCAAATAAACCTCCACCCAGATCTTTTCCAACTCCAC 1145
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1076 GTAAAATCAGAATACAGGCGCTGCCAAATAAACCTTCACCCAGATCTTTTCCAACTCCAC 1135
Query 1146 TCGAGCGCCCTTCTACTGATCTTACTTTGTTACGCAGGAACTCGAATCATCTTGATTCGT 1205
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1136 TCGAGCGCCCTTCTACTGATCTTACTTTGTTACGCAGGAACTCGAATCATCTTGATTCGT 1195
Query 1206 ATTTGGATCCTGCCTTCATGTCCTTGATTAAGGATCCAGATGAAAGGCGCAAAGAACAAT 1265
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1196 ATCTGGATCCTGCCTTCATGTCCTTGATTAAGGATCCAGATGAAAGGCGCAAAGAACAAT 1255
Query 1266 GGGAGAAGACTGCACAAGCACAAAGTGGATTCAATTTTGTTAAATTGCTAGGATTTGGTG 1325
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256 GGGAGAAGACTGCACAAGCACAAAGTGGATTCAATTTTGTTAAATTGCTAGGATTTGGTG 1315
Query 1326 ATCTAGGAGGACCCCCTCTCTCTGCTGCAGAGGAATACTCACTTCATTCGCGATACCTAG 1385
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1316 ATCTAGGAGGACCCCCTCTCTCTGCTGCAGAGGAATACTCACTTCATTCGCGATACCTAG 1375
Query 1386 CGAAAGCTAATTCAATCAACCTTTCCGAGATTGCAGAGATGAAAATTGTCTATCGTGGTG 1445
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1376 CGAAAGCTAATTCTCTCAACCTTTCCGAGATTGCAGAGATGAAAATTGTCTACCGTGGTG 1435
Query 1446 GTGTTGACACCGAGGGTCATCCTGTAATGGTTGTTGTAGGAGCTCACTTTTTGCTGCGAT 1505
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1436 GTGTTGACACCGAGGGTCATCCTGTAATGGTTGTTGTAGGAGCTCACTTTTTGCTGCGTT 1495
Query 1506 GTCTTGATCTGGAGCGTTTTGTACTTTATGTTATTAAGGAATTTGAACCTGTGATACAAA 1565
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1496 GTCTTGATCTGGAGCGTTTTGTGCTTTATGTTATAAAGGAATTTGAACCTGTGATACAAA 1555
Query 1566 AGCCTTATTCGATTGTCTACTTTCATTCTGCAGCATCGTTACAAGTCCAACCAGATTTGG 1625
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1556 AGCCTTACTCGATTGTCTATTTTCATTCTGCAGCATCTTTACAAGTCCAACCAGATTTGG 1615
Query 1626 GATGGATGAAAAGATTAGAACAGATACTTGGTCGAAAACACCAGCGTAACCTTCAGGCAA 1685
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1616 GATGGATGAAAAGATTACAACAGATACTTGGTCGAAAACACCAGCGTAACCTTCAGGCAA 1675
Query 1686 TCTATGTTCTTCATCCAACTTTCCACTTGAAGGCTACAATCTTAACGATGCAATTTTTCG 1745
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||
Sbjct 1676 TCTATGTTCTTCATCCAACTTTTCACTTGAAGGCTACAATTTTAACTATGCAATTCTTCG 1735
Query 1746 TGGATAATGTGGTATGGAAGAAAGTTGTATATGCAGACCGACTTCTGCAGCTGTTCAAAT 1805
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1736 TGGATAATGTGGTTTGGAAGAAAGTTGTATATGCAGACCGACTTCTGCAGCTGTTCAAAT 1795
Query 1806 ACGTTCCTCGTGAGCAGCTGACAATCCCAGACTTTGTTTTCCAGCATGATCTTGAAGTTA 1865
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1796 ATGTTCCTCGTGAGCAGCTGACAATCCCAGACTTTGTTTTCCAGCATGATCTTGAAGTTA 1855
Query 1866 ACGGAGGAAAAGGTCTAATCGTTGACCCAAGAACAAAATACGTTTATCAACGGCCATGAA 1925
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1856 ACGGAGGAAAAGGTCTAATCGTTGATCCAAGAACAAAATACGTTTACCAACGGCCATGAA 1915
Query 1926 CCAAAATCAAAGACCGTTACTTTATTCAGTACTTGTATGTTTGCTTGTGAAATATTTCTT 1985
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1916 CCAAAATCAAAGACAGTTACTTTATTCAGTACTTGTATGTTTGCTTGTGCAATATTTCTT 1975
Query 1986 CATTCTTTCATGCTTATCTTCT-C--AAGATGATCCTGGGAGCAAATAAA-GTCTTCTTC 2041
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1976 CATTCTTTCATGCTTATCTTCTTCTCAAGATGATCCTGGGAGCAAATAAAAGTCTTCTTC 2035
Query 2042 TTCTTCTAATGTAATCTAAAGTTTGAATCTTTTTGTTTATAAATCCATTTTCTCAGCA 2099
|||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2036 TTCT---AATGTAATCTAAAGTTTGAATCTTT--GTTTATAAATCCATTTTCTCAGCA 2088
> Ahg339169 jgi|Araly1|339169|fgenesh1_pg.C_scaffold_2001268
Length=4044
Score = 2804 bits (1518), Expect = 0.0
Identities = 1619/1669 (97%), Gaps = 2/1669 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 239 ATGTATC-AGACAATTCCCACGGCACCAACCATTCGTGGTGGAACTCCAACAGAGAGTGG 297
||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTATCAAG-CCATTCCCACGGCGGCAACCATTCGTGGTGGAACTCCAACAGAGAGTGG 59
Query 298 TGATTACGTTGTGACTTTGGATCAGATTCCACGGTGGAGTGATGTTGAGCAGAGATCATC 357
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 60 TGATTACGTTGTTACTTTGGATCAGATTCCACGGTGGAGTGATGTTGAGCAGAGGTCATC 119
Query 358 TTTGGAGGATGAGACAGGAGATCCAGAACATTCGAATCCGCGCTACGCAAACCCTTTGGC 417
|||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||||||||
Sbjct 120 TTTGGAGGGTGAAACAGGAGATCCTGCACATTCGAATCCACGGTATGCAAACCCTTTGGC 179
Query 418 TTCGTCTTCCGAAGCAGGGAGCAGCGGGAATGGGATGGTATCTAAGTTTCCTGTTGATCA 477
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 180 TTCGTCTTCTGAAGCAGGGAGCAGCGGGAATGGGATGGTATCTAAGTTTCCTGTTGACCA 239
Query 478 CGAGATAAACTCTAGAATATACCTTTGGAGAGGGGAACCTTGGAACCTTGAGGTTGATGC 537
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 CGAGATAAACTCTAGAATATACCTGTGGAGAGGGGAACCTTGGAACCTTGAGGTTGATGC 299
Query 538 TGTTGTAAATTCGACAAATGAGAACTTGGATGAGGCACATAGCAGTCCTGGTCTACATGT 597
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 TGTTGTGAATTCGACAAATGAGAACTTGGATGAGGCACATAGCAGTCCTGGTCTACATGT 359
Query 598 GGCTGCTGGACCTGGCCTTGCAGAGCAATGTGCTACATTGGGTGGATGCAGGACAGGGAT 657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 GGCTGCTGGACCTGGCCTTGCAGAGCAATGTGCTACATTGGGTGGATGCAGGACAGGGAT 419
Query 658 GGCGAAAGTAACAAATGCCTATGATCTACCAGCGAGGAGGGTTATCCATACAGTAGGACC 717
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct 420 GGCAAAAGTAACAAATGCCTATGATCTACCAGCGAGGCGGGTTATCCACACAGTAGGACC 479
Query 718 CAAGTATGCAGTAAAGTATCATACAGCTGCTGAGAATGCTCTAAGTCACTGCTATAGATC 777
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 CAAGTATGCAGTAAAGTATCATACAGCTGCTGAGAATGCTCTAAGTCACTGCTATAGATC 539
Query 778 TTGTCTGGAACTTCTCATAGATAGTGGGCTACAAAGTATCGCTCTGGGCTGTATATACAC 837
||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 540 TTGTCTGGAGCTTCTCATAGACAGTGGCCTTCAAAGTATCGCTATGGGCTGTATATACAC 599
Query 838 AGAAGCCAAAAACTATCCCCGAGAACCAGCTGCTCATGTTGCCATAAGAACTGTTCGCCG 897
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 AGAAGCCAAAAACTATCCCCGAGAACCAGCTGCTCATGTTGCCATAAGAACTGTTCGCCG 659
Query 898 CTTTCTAGAGAAGCAAAAGGATAAAATCAGTGCCGTTGTTTTCTGTACCACCACATCCTC 957
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 CTTTCTAGAAAAGCAAAAGGATAAAATCAGTGCCGTTGTTTTCTGTACCACCACATCCTC 719
Query 958 TGATACGGAGATATACAAACGATTACTTCCACTTTACTTTCCTCGAGATGAACATGAGGA 1017
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 TGATACAGAGATATACAAACGATTACTTCCACTTTACTTTCCTCGAGATGAACATGAGGA 779
Query 1018 AGAGGTTGCCATATCAAAGCTCCCGGCTGATGTTGGAGATGAAAATGGTGAGACGGTTAT 1077
|||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 AGAGGTTGCCATCTCAAAGCTTCCAGCTGATGTTGGAGATGAAAATGGTGAGACGGTTAT 839
Query 1078 AGACGAACGTAAAATCAGAATACAGGCGCTGCCAAATAAACCTCCACCCAGATCTTTTCC 1137
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 840 AGACGAACGTAAAATCAGAATACAGGCGCTGCCAAATAAACCTTCACCCAGATCTTTTCC 899
Query 1138 AACTCCACTCGAGCGCCCTTCTACTGATCTTACTTTGTTACGCAGGAACTCGAATCATCT 1197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 AACTCCACTCGAGCGCCCTTCTACTGATCTTACTTTGTTACGCAGGAACTCGAATCATCT 959
Query 1198 TGATTCGTATTTGGATCCTGCCTTCATGTCCTTGATTAAGGATCCAGATGAAAGGCGCAA 1257
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 TGATTCGTATCTGGATCCTGCCTTCATGTCCTTGATTAAGGATCCAGATGAAAGGCGCAA 1019
Query 1258 AGAACAATGGGAGAAGACTGCACAAGCACAAAGTGGATTCAATTTTGTTAAATTGCTAGG 1317
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 AGAACAATGGGAGAAGACTGCACAAGCACAAAGTGGATTCAATTTTGTTAAATTGCTAGG 1079
Query 1318 ATTTGGTGATCTAGGAGGACCCCCTCTCTCTGCTGCAGAGGAATACTCACTTCATTCGCG 1377
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 ATTTGGTGATCTAGGAGGACCCCCTCTCTCTGCTGCAGAGGAATACTCACTTCATTCGCG 1139
Query 1378 ATACCTAGCGAAAGCTAATTCAATCAACCTTTCCGAGATTGCAGAGATGAAAATTGTCTA 1437
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 ATACCTAGCGAAAGCTAATTCTCTCAACCTTTCCGAGATTGCAGAGATGAAAATTGTCTA 1199
Query 1438 TCGTGGTGGTGTTGACACCGAGGGTCATCCTGTAATGGTTGTTGTAGGAGCTCACTTTTT 1497
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 CCGTGGTGGTGTTGACACCGAGGGTCATCCTGTAATGGTTGTTGTAGGAGCTCACTTTTT 1259
Query 1498 GCTGCGATGTCTTGATCTGGAGCGTTTTGTACTTTATGTTATTAAGGAATTTGAACCTGT 1557
|||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1260 GCTGCGTTGTCTTGATCTGGAGCGTTTTGTGCTTTATGTTATAAAGGAATTTGAACCTGT 1319
Query 1558 GATACAAAAGCCTTATTCGATTGTCTACTTTCATTCTGCAGCATCGTTACAAGTCCAACC 1617
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1320 GATACAAAAGCCTTACTCGATTGTCTATTTTCATTCTGCAGCATCTTTACAAGTCCAACC 1379
Query 1618 AGATTTGGGATGGATGAAAAGATTAGAACAGATACTTGGTCGAAAACACCAGCGTAACCT 1677
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 AGATTTGGGATGGATGAAAAGATTACAACAGATACTTGGTCGAAAACACCAGCGTAACCT 1439
Query 1678 TCAGGCAATCTATGTTCTTCATCCAACTTTCCACTTGAAGGCTACAATCTTAACGATGCA 1737
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 1440 TCAGGCAATCTATGTTCTTCATCCAACTTTTCACTTGAAGGCTACAATTTTAACTATGCA 1499
Query 1738 ATTTTTCGTGGATAATGTGGTATGGAAGAAAGTTGTATATGCAGACCGACTTCTGCAGCT 1797
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 ATTCTTCGTGGATAATGTGGTTTGGAAGAAAGTTGTATATGCAGACCGACTTCTGCAGCT 1559
Query 1798 GTTCAAATACGTTCCTCGTGAGCAGCTGACAATCCCAGACTTTGTTTTCCAGCATGATCT 1857
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1560 GTTCAAATATGTTCCTCGTGAGCAGCTGACAATCCCAGACTTTGTTTTCCAGCATGATCT 1619
Query 1858 TGAAGTTAACGGAGGAAAAGGTCTAATCGTTGACCCAAGAACAAAATAC 1906
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1620 TGAAGTTAACGGAGGAAAAGGTCTAATCGTTGATCCAAGAACAAAATAC 1668
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 79037258375
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5