BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G71270.1
Length=2471
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg476259 jgi|Araly1|476259|fgenesh2_kg.2__1389__AT1G71270.1 3856 0.0
Ahg908733 jgi|Araly1|908733|Al_scaffold_0002_1814 2739 0.0
> Ahg476259 jgi|Araly1|476259|fgenesh2_kg.2__1389__AT1G71270.1
Length=2398
Score = 3856 bits (2088), Expect = 0.0
Identities = 2302/2403 (96%), Gaps = 23/2403 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 27 gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaCTCTCTAATGGCGGACTCAAACTGA 86
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 5 GAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA--CTCTAATGGCGGACTCAAACTGA 62
Query 87 TTTC-G-------AGGATTCTGATTTCGTTTTCTAGTTGAAGATCTTTC-AACTCTTAAT 137
|||| | || |||||| ||||||| |||| |||||||| |||| || |||||||
Sbjct 63 TTTCAGACTCAAAAGCATTCTGTTTTCGTTCTCTACTTGAAGATATTTCGAA-TCTTAAT 121
Query 138 CTCATTAGGAAGATGTCCGACATTTCCATTGACGCATTGGGCCAAACTATGGGGGACTTT 197
||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||
Sbjct 122 CTCCTTAGGGAGATGTCAGACATTTCCATTGACGCATTGGGCCAAACTGTGGGCGACTTC 181
Query 198 AGTAATCATGAGAAACTTGGATTTGATTTAGGAGCATTTGTTGGAGACTTGGCTTTTGAA 257
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 182 AGTAATCATGAGAAAATTGGATTTGATTTAGGAGCATTTGTCGGAGACTTGGCTTTTGAA 241
Query 258 GAAGATTCAGGCAGTGAGGATATTTCATTGGAAGGGCTTCAACAAGAACTTGAAGAATGT 317
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 242 GAAGATTCAGGCAGTGAGGATATATCATTGGAAGGGCTTCAACAAGAACTTGAAGAATGT 301
Query 318 GAAAGTGATGAGGTTGTTGCCAATATACTGTCTAGTGGTGACAAACTTAGAGAATATGCA 377
|||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 302 GAAAGTGATGAGGTTGTTTCCAATATACTATCCAGTGGTGCCAAACTTAGAGAATATGCG 361
Query 378 AAAGGGGTTGAAAACAATCTACGCAAGGTTGAATTGGATTCAATCGAGGATTACATAAAG 437
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 362 AAAGGGGTTGAAAACAATCTACGGAAGGTCGAATTGGATTCAATTGAGGATTACATAAAA 421
Query 438 GAAAGTGACAACCTAGTCTCACTTCACGATCAGATTCGTGACTGTGACAGCATCCTGTCA 497
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 422 GAAAGTGACAACCTTGTCTCACTTCACGATCAGATTCGTGACTGTGACAGCATCTTGTCA 481
Query 498 CAAATGGAAACTCTTCTCAGTGGATTTCAGGAAGAGATTGGTTCTATAAGTTCAGACATA 557
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 482 CAAATGGAAACTCTCCTCAGTGGATTTCAGGAAGAGATTGGTTCTATAAGTTCAGACATA 541
Query 558 AAGATTCTTCAAGAAAAGTCAATGGACATGGGTTTGAGATTGAAAAACCGCAGGGTGGCT 617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 542 AAGATTCTTCAAGAAAAGTCAATGGACATGGGTTTGAGATTGAAAAACCGCAGGGTGGCT 601
Query 618 GAATCAAAGCTAGCAAAATTTGTCGAAGACATTATAGTGCCACCAAAGATGATAGATGTA 677
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 602 GAATCAAAGCTAGCAAAATTTGTCGAAGACATTATAGTGCCACCAAAGATGATAGATGTA 661
Query 678 ATTGTTGACGGAGAGGTGAATGAAGAGTATATGAAAACGCTTGAAATTCTGAGTAAGAAG 737
||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 662 ATTGTCGATGGAGAGGTGAATGAGGAGTATATGAAAACGCTTGAAATTCTGAGTAAGAAG 721
Query 738 CTAAAATTTGTAGAAGCAGATCAGGCAGTTAAAAGTTCCAAAGCGTTAAAAGATGTAGAG 797
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 722 CTGAAATTTGTAGAAGCAGATCAAGCAGTTAAAAGTTCCAAAGCGTTAAAAGATGTAGAG 781
Query 798 CCTGAGCTCGAAAAGCTTCGGCAGAAAGCTATTTCCAAGGTGTATGATTTTATTGTCCAG 857
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 782 CCTGAGCTCGAAAAGCTCCGGCAAAAAGCTATTTCCAAGGTGTATGATTTTATTGTCCAG 841
Query 858 AAGCTTATAGCCCTGAGGAAACCCAAAACAAACATTCAGATTCTTCAACAGAGTGTGTTA 917
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 842 AAGCTTATAGCCCTGAGGAAACCCAAAACAAACATTCAGATTCTTCAACAGAGTGTGTTA 901
Query 918 TTAAAGTACAAGTATATTATCTCCTTCCTCAAGGAACATGGAAAAGAAGTGTTTATGGAT 977
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 902 TTAAAGTACAAGTATATTATCTCCTTCCTCAAAGAACATGGAAAAGAAGTGTTTATGGAT 961
Query 978 GTTCGTGCTGCATACATTGATACCATGAACAAGGTGTTAAGTGCACATTTTCGTGCTTAT 1037
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 GTCCGTGCTGCATACATTGATACCATGAACAAGGTGTTAAGTGCACATTTTCGTGCTTAT 1021
Query 1038 ATTCAAGCACTTGAGAAACTACAGTTAGATATAGCCACAGCATATGACTTAATTGGGGTA 1097
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1022 ATTCAAGCACTTGAGAAACTACAGTTAGATATAGCCACCGCATATGACTTAATTGGGGTA 1081
Query 1098 GAGACCAGAACCACCGGCCTCTTCTCAAGAGCTAGGGAGCCACTAAAGAACCGCTCTGCC 1157
||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1082 GAGACTAGAACCACGGGCCTCTTCTCAAGAGCTAGGGAACCACTAAAGAACCGCTCTGCC 1141
Query 1158 GTTTTTGCTTTGGGTGACAGGATAAAAATTATAAAGGATATTGATCAACCTGCTTTGATC 1217
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1142 GTTTTTGCTTTGGGTGAGAGGATAAAAATTATAAAGGAAATTGATCAACCTGCTTTGATC 1201
Query 1218 CCGCACATAGCCGAAGCCAGCTCTCTCAAATATCCTTATGAAGTGCTCTTCAGGAGCCTG 1277
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1202 CCGCACATAGCCGAAGCCAGCTCTCTCAAATATCCTTATGAAGTGCTCTTCAGGAGCTTG 1261
Query 1278 CACAAGCTACTTATGGATACAGCTACTTCTGAGTATATGTTTTGTGATGATTTCTTTGGT 1337
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1262 CACAAGCTACTTATGGATACAGCTACTTCTGAGTATATATTTTGTGATGATTTCTTTGGT 1321
Query 1338 GAAGAGTCCATATTCTATGAAATTTTTGCGGGTCCATTTTCTGTCATCGATGAGCACTTC 1397
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1322 GAAGAGTCCATATTCTATGAAATTTTTGCGGGTCCATTTTCTGTCATCGATGAGCACTTC 1381
Query 1398 AATCCCGTTCTTTCAAACTGTTTTGATGCTATTGGCCTGATGCTTATGATTCGCATAATA 1457
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1382 AATCCCGTTCTTTCAAACTGTTTTGATGCTATCGGCCTGATGCTTATGATTCGCATAATA 1441
Query 1458 CACCACCACCAGCTTATCATGTCTCGCCGGAGAATTCCATGCCTGGACTCATATCTGGAC 1517
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1442 CACCACCACCAGCTTATCATGTCTCGCCGGAGGATTCCATGCCTGGACTCATATCTGGAC 1501
Query 1518 AAGGTTAATATTTCTTTGTGGCCTCGTTTCAAGATGGTGTTTGACTCACACCTTAGCAGT 1577
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1502 AAGGTTAATATTTCTTTGTGGCCTCGTTTCAAGATGGTGTTTGACTCACACCTCAGCAGT 1561
Query 1578 CTGAGAGATGCAAACATTAAGACATTATGGGAAGATGATGTTCATCCTCACTATGTCATG 1637
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1562 CTGCGAGATGCAAACATTAAGACATTATGGGAAGATGATGTTCATCCTCACTATGTCATG 1621
Query 1638 AGGCGTTATGCTGAATTCACGGCTTCGTTTATTCACCTAAACGTTGAATATGGAGATGGG 1697
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 1622 AGACGTTATGCTGAATTCACGGCTTCGTTTATTCACCTGAATGTTGAATATGGAGATGGG 1681
Query 1698 CAGCTTGATATAAATCTGGAGCGGTTAAGAATGGCTGTAGATGGGTTGATTCTCAAGCTT 1757
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1682 CAGCTTGATATAAATCTGGAGCGGTTAAGAATGGCTGTAGATGGCTTGATTCTCAAGCTT 1741
Query 1758 GCAAAGTTGTTCCCAAGGCCAAAGCAGCAAATTGTGTTTCTCATAAATAACTACGATATG 1817
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1742 GCAAAGTTGTTCCCAAGGCCAAAGCAGCAAATTGTGTTTCTCATAAATAACTACGATATG 1801
Query 1818 ACAATCGCTGTACTGAAGGAAGCTGGACCAGAAGGTGGGAAAATTCAAATGCATTTTGAG 1877
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1802 ACAATCGCTGTGTTGAAGGAAGCTGGACCAGAAGGTGGCAAAATTCAAATGCATTTTGAG 1861
Query 1878 GAAATGCTAAAGAGTAACACTTCATTATTTGTGGAAGAACTGCTGGTGGAGCATTTCAGT 1937
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1862 GAATTGCTAAAGAGTAACACTTCATTATTTGTGGAAGAACTGCTGGTGGAGCATTTCAGT 1921
Query 1938 GATTTGATCAAATTCGTGAAAAATCGAGCTTCTGAGGATTCGAGCTT-AAATCCAGAGAG 1996
|||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||||||||||
Sbjct 1922 GATTTGATCAAATTCGTGAAAAGTCGAGCCTCTGAGGATTCAAG-TTCAAATCCAGAGAG 1980
Query 1997 GTCCATTACAATTGCTGAAGTAGAGCCACTGGTGAAGGACTTTGGAAGCAGATGGAAGAC 2056
|||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1981 GTCCATCACAGTTGCGGAAGTAGAGCCACTGGTGAAAGACTTTGGAAGCAGATGGAAGAC 2040
Query 2057 AGCGATTGAGTTGATGGACAAAGACATCATAACTTCCTTCAGTAACTTCTTGTGTGGTAT 2116
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2041 AGCGATTGAGTTGATGGACAAAGATATCATAACTTCCTTCAGTAACTTCTTGTGTGGTAT 2100
Query 2117 GGATATTTTGAGAGCTGCATTGACACAACTATTGCTCTATTACACAAGACTCACAGACTG 2176
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2101 GGATATTTTGAGAGCTGCATTGACACAACTATTGCTCTATTACACAAGGCTCACAGACTG 2160
Query 2177 CATCAAGAAGATAGATGGTGGATCTGCTCTGAATAGGGATCTTGTCTCCATCCAATCTAT 2236
|||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2161 CATCAAGAAGATGGATGGTGGATCTGCTCTGAACAGGGATCTTGTCTCCATTCAATCTAT 2220
Query 2237 CATGTACGAGATCAGGAAATACTCCAAGACTTTCTGAAAGATAGCATATGTGGCTCCTTA 2296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2221 TATGTACGAGATCAGGAAATACTCCAAGACTTTCTGAAAGATAACATATGTGGCTCCTTA 2280
Query 2297 ATGAAGAGTATGTAAGATAAGTCAAAATTTTCAAAGTGAATCTAAAGCCAGTATTATGGG 2356
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || ||||
Sbjct 2281 ATGAAGAGTATGTAAGATAAGTCAAACCTTTCAAAGTGAAACTTAAGCCAGTCTTCTGGG 2340
Query 2357 TCAGTAATGTATCTATCTTTCAAACCAGTAAGA--G--TTCCTCTAATGTCTTTCTTTTG 2412
| || || || |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||
Sbjct 2341 T---TA-TG-ATGTATCTTTCAAACCAGTAAGATAGAGTTCCTCCAATGTCTGTCTTTTG 2395
Query 2413 CTA 2415
|||
Sbjct 2396 CTA 2398
> Ahg908733 jgi|Araly1|908733|Al_scaffold_0002_1814
Length=1908
Score = 2739 bits (1483), Expect = 0.0
Identities = 1754/1886 (93%), Gaps = 14/1886 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 171 GCATTGGGCCAAACTATGGGGGACTTTAGTAATCATG---AGAAACTTGGATTTGATTTA 227
|||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 13 GCATTGGGCCAAGCTATGTGCGACTTCAGTAATCATGATCAGAAAATTGGATTTGATTTA 72
Query 228 GGAGCATTTGTTGGAGACTTGGCTTTTGAAGAAGATTC---AGGCAGTGAGGATATTTCA 284
||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||
Sbjct 73 GGAGCATTTGTCGGAGACTTGGCTTTTGAAGAGGATTCAGGAGGCAGTGAGGATATATCA 132
Query 285 TTGGAAGGGCTTCAACAAGAACTTGAAGAATGTGAAAGTGATGAGGTTGTTGCCAATATA 344
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||
Sbjct 133 TTGGAAGGGCTTCAACAAGAACTTGAAGAATGTGAAACTGATGAGGTTGTCGCCAATATA 192
Query 345 CTGTCTAGTGGTGACAAACTTAGAGAATATGCAAAAGGGGTTGAAAACAATCTACGCAAG 404
|| || | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||
Sbjct 193 CTATCCAATGGTGACAAACTTAGAGAATATGCAAAAGGTGTAGAAAACAATCTACTCAAG 252
Query 405 GTTGAATTGGATTCA-ATCGAGGATTACATAAAGGAAAGTGACAACCTAGTCTCACTTCA 463
||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||
Sbjct 253 GTTGAATTGGATTCAGTTC-AGGATTACATAAAAGAAAGTGACAACCTCGTCTTACTTCA 311
Query 464 CGATCAGATTCGTGACTGTGACAGCATCCTGTCACAAATGGAAACTCTTCTCAGTGGATT 523
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 312 CGATCAGATTCGTGACTGTGACAGCATCTTGTCACAAATGGAAACTCTCCTCGGTGGATT 371
Query 524 TCAGGAAGAGATTGGTTCTATAAGTTCAGACATAAAGATTCTTCAAGAAAAGTCAATGGA 583
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 372 TCAGGAAGAGATTGGTTCTATAAGTTCAGACATAAAGATTCTTCAAGAAAATTCAATGGA 431
Query 584 CATGGGTTTGAGATTGAAAAACCGCAGGGTGGCTGAATCAAAGCTAGCAAAATTTGTCGA 643
||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 432 CATGGGTTTGAGACTGAAAAACCGAAGGGTGGCTGAATCAAAGCTAGCAAAATTTGTCGA 491
Query 644 AGACATTATAGTGCCACCAAAGATGATAGATGTAATTGTTGACGGAGAGGTGAATGAAGA 703
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 492 AGACATTATAGTGCCACCAAAGATGATAGATGTAATTGTTGATGGAGAGGTGAATGAAGA 551
Query 704 GTATATGAAAACGCTTGAAATTCTGAGTAAGAAGCTAAAATTTGTAGAAGCAGATCAGGC 763
|||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 552 GTATATCAAAACACTTGAGATTCTGAGTAAGAAGCTGAAATTTGTAGAAGCAGATCAAGC 611
Query 764 AGTTAAAAGTTCCAAAGCGTTAAAAGATGTAGAGCCTGAGCTCGAAAAGCTTCGGCAGAA 823
|||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||
Sbjct 612 AGTTAAAAGTTCCAAAGCATTAAAAGATGTAAAGCCTGAGCTTGAAAAGCTCCGACAGAA 671
Query 824 AGCTATTTCCAAGGTGTATGATTTTATTGTCCAGAAGCTTATAGCCCTGAGGAAACCCAA 883
||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||
Sbjct 672 AGCTATTTCCAAGATTTATGATTTTATTGTCCAGAAGCTTATAGCCCTGAAGAAACCAAA 731
Query 884 AACAAACATTCAGATTCTTCAACAGAGTGTGTTATTAAAGTACAAGTATATTATCTCCTT 943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 732 AACAAACATTCAGATTCTTCAACAGAGTGTGTTATTAAAGTACAAGTATATTATCTCCTT 791
Query 944 CCTCAAGGAACATGGAAAAGAAGTGTTTATGGATGTTCGTGCTGCATACATTGATACCAT 1003
|||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||
Sbjct 792 CCTCAAAGAACATGGAAAACAAGTGTTTATGGATGTCCGCGCTGCATATATTGATACCAT 851
Query 1004 GAACAAGGTGTTAAGTGCACATTTTCGTGCTTATATTCAAGCACTTGAGAAACTACAGTT 1063
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |
Sbjct 852 GAACAAGGTGTTAAGTGCACATTTTCATGCTTATATTCAAGCATTTGAGAAATTACAGAT 911
Query 1064 AGATATAGCCACAGCATATGACTTAATTGGGGTAGAGACCAGAACCACCGGCCTCTTCTC 1123
||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||| |||| || |||||||||||
Sbjct 912 AGATATAGCCACATCAAATGACTTGATTGGGGTGGAGACTAGAAGCAGTGGCCTCTTCTC 971
Query 1124 AAGAGCTAGGGAGCCACTAAAGAACCGCTCTGCCGTTTTTGCTTTGGGTGACAGGATAAA 1183
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 972 AAGAGCTAGGGAGCCACTAAAGAACCGCTCTGTCGTTTTTGCTTTGGGTGAGAGGATAAA 1031
Query 1184 AATTATAAAGGATATTGATCAACCTGCTTTGATCCCGCACATAGCCGAAGCCAGCTC-TC 1242
|||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 1032 AATTATAAAGGAAATTGATCAACCTGCATTGATCCCGCACATTGCCGAAGCCAGCTCGT- 1090
Query 1243 TCAAATATCCTTATGAAGTGCTCTTCAGGAGCCTGCACAAGCTACTTATGGATACAGCTA 1302
|||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1091 TCAAATATCCTTATGAAGTGCTATTCAGGAGTTTGCACAAGCTACTTATGGATACAGCTA 1150
Query 1303 CTTCTGAGTATATGTTTTGTGATGATTTCTTTGGTGAAGAGTCCATATTCTATGAAATTT 1362
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 1151 CTTCTGAGTATATCTTTTGTGATGATTTCTTTGGTGAAGCGTCTATATTCTATGAAATTT 1210
Query 1363 TTGCGGGTCCATTTTCTGTCATCGATGAGCACTTCAATCCCGTTCTTTCAAACTGTTTTG 1422
||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||
Sbjct 1211 TTGCGGGTCCATTCTCTGTTATCGATGAGCACGTCAATTCCGTCCTCTCAAACTGTTTTG 1270
Query 1423 ATGCTATTGGCCTGATGCTTATGATTCGCATAATACACCACCACCAGCTTATCATGTCTC 1482
||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1271 ATGCTATCGGTCTGATGCTTATGATTCGCATTATACACCACCACCAGCTTATCATGTCTC 1330
Query 1483 GCCGGAGAATTCCATGCCTGGACTCATATCTGGACAAGGTTAATATTTCTTTGTGGCCTC 1542
||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1331 GCCGGAGGATTCCATGCCTGGATTCATATCTGGACAAGGTTAATATTTCTCTGTGGCCTC 1390
Query 1543 GTTTCAAGATGGTGTTTGACTCACACCTTAGCAGTCTGAGAGATGCAAACATTAAGACAT 1602
|||| ||||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||
Sbjct 1391 GTTTTAAGATGGTGTTCGACTTACACATCAGCAGTCTGCGAGATGCAAACATAAATACAT 1450
Query 1603 TATGGGAAGATGATGTTCATCCTCACTATGTCATGAGGCGTTATGCTGAATTCACGGCTT 1662
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1451 TATGGGAAGATGATGTTCATCCTCACTATGTCATGAGGCGTTATGCTGAATTTACGGCTT 1510
Query 1663 CGTTTATTCACCTAAACGTTGAATATGGAGATGGGCAGCTTGATATAAATCTGGAGCGGT 1722
||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
Sbjct 1511 CGTTTATTCACCTGAATGTTGAATATGGAGATGGGCAGCTTGATATAAATTTGGAGCGTT 1570
Query 1723 TAAGAATGGCTGTAGATGGGTTGATTCTCAAGCTTGCAAAGTTGTTCCC-AAGGCCAAAG 1781
|||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||
Sbjct 1571 TAAGAATGGCAGTAGACAGCTTGATTCTTAAGCTTGCAAAGTTTTTCCCGAAG-CCAAAG 1629
Query 1782 CAGCAAATTGTGTTTCTCATAAATAACTACGATATGACAATCGCTGTACTGAAGGAAGCT 1841
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 1630 CAGCAAATTGTGTTTCTCATAAACAACTACGATATGACAATTGCTGTGCTGAAGGAAGCT 1689
Query 1842 GGACCAGAAGGTGGGAAAATTCAAATGCATTTTGAGGAAATGCTAAAGAGTAACACTTCA 1901
| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1690 GAACCAGAAGGTGGGACAATTCAAATGCATTTTGAGGAATTGCTAAAGAGTAACACTTCA 1749
Query 1902 TTATTTGTGGAAGAACTGCTGGTGGAGCATTTCAGTGATTTGATCAAATTCGTGAAAAAT 1961
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |
Sbjct 1750 TTATTTGTGGAAGAACTGCTGGTGGAGCATTTCTTTGATTTGATCAAATTTGTGAAAAGT 1809
Query 1962 CGAGCTTCTGAGGATTCGAGCTT-AAATCCAGAGAGGTCCATTACAATTGCTGAAGTAGA 2020
||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 1810 CGAGCCTCTGAGGATTCTAG-TTCAAATTTAGAGAGGTCCATCACAGTTGCTGAAGTAGA 1868
Query 2021 GCCACTGGTGAAGGACTTTGGAAGCA 2046
||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 1869 GCCGCTGGTGAAAGACTTTGGAAGCA 1894
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 93130649025
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5