BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G72390.1
Length=4528
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg316204 jgi|Araly1|316204|fgenesh1_pm.C_scaffold_2001237 3690 0.0
> Ahg316204 jgi|Araly1|316204|fgenesh1_pm.C_scaffold_2001237
Length=3933
Score = 3690 bits (1998), Expect = 0.0
Identities = 2250/2371 (95%), Gaps = 20/2371 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 193 ATGGGTGTCTCGTTTAAGATATCGAAGGTTGGTAGAAAGTTTCGACCTAAGATTTCTACT 252
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGTGTCTCGTTTAAGATTTCCAAGGTTGGTAGAAAGTTTCGGCCTAAGATTTCTACT 60
Query 253 GAATTGGCTACTCCTGATTCCCCAAAAGCAATCGTTCTATCTGGGAAACCAAAGGCCACT 312
||||||| |||||||||||| ||| || | | | | || | |||| ||||||| |||
Sbjct 61 GAATTGGTTACTCCTGATTCTCCAGAA-C-A--GCTGAAT-T-CGAAAGCAAAGGCTACT 114
Query 313 GATGATAGCAATATTGGCGATGTTTCCGGGTTTTCGAAGCCATCTTTACCCGATATATCT 372
||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 115 GATGAAAGCAATGTTGGTGATGTTTCCGGGTTTTCGAAGCCATCTTTGCCCGATATATCT 174
Query 373 CCAGATCATGAAGTTTCCTTCATATTGAGCCTCTATCCAAATGGGTACTCTATAGGAAAA 432
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 175 CCAGATCATGAAGTTTCCTTCGTATTGAGCCTCTATCCAAATGGGTACTCTATAGGAAAA 234
Query 433 ACCTCTGAGGCTATGCAACAGATATCGTTTCGAGATGTTCCAAAGGTCTTACATCCGTAT 492
|||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 235 ACCTCTGAGGCTCTGCAACAGACATCCTTTCGAGATGTTCCAAAGGTCTTACATCCGTAT 294
Query 493 GATAGGGCAGCAGAGGGTCTCCTTTCGGCTATTGAGGCTGGCAGGCTTCCTGGGGACATT 552
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 295 GATAGGGCAGCAGAGGGTCTACTTTCGGCTATTGAGGCTGGCAGGCTTCCCGGGGAAATT 354
Query 553 TTGGAAGATATACCTTGCAAATTTGTGGATGGGGTGGTTATATGTGAGGTGCATGACTAT 612
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 355 TTGGAAGATATACCTTGCAAATTTGAGGATGGGGTGGTTATATGTGAGGTGCATGACTAT 414
Query 613 CGGAAACATACCTCATCTCAAGTCTCTCCTGTGATAAATAAATTGCGCCTTAAGATGTCA 672
|||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 415 CGGAAACACACCCCAGCTCAAGTCTCTCCTATGATAAATAAATTGCGCCTTAAGATGTCA 474
Query 673 CTCGAGAATGTGGTAAAAGATATTCCATCAATGTCAGACAACTCATGGACGTACGGTGAT 732
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 475 CTTGAGAATGTGGTAAAAGATATTCCATCAATGTCAGACAACTCATGGACTTACGGTGAT 534
Query 733 CTCATGGAAGTGGAGTCCAGGATATTAAAAGCCTTACAACCTGAACTCTGTCTGGATCCT 792
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 535 CTCTTGGAAGTGGAGTCCAGGATATTAAAAGCCTTACAACCTGAACTCTGTCTGGATCCT 594
Query 793 TTACCCAGACTTGATAGGCTGAGTAAAAATCCTTTGACTGCTAAGCTCGATTTGTCGCTT 852
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 595 GTACCCAGACTTGATAGGCTGAGTAAAAACCCTTTGTCTGCTAAGCTCGATTTGTCGCTT 654
Query 853 TCTACTTTGCGGAGAAAGAGATTAAGGCAAATGGCAGAAGTGACAGTCATGTCTCAGAAT 912
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 655 TCTACTTTACGGAGAAAGAGATTAAGGCAAATGGCAGAAGTGACAGTCATGTCTCAGAAT 714
Query 913 AAGATTCAGGGGAAAAAGGTGTGCATTGATCGGCTTCCTGAAAGTTCAGAGCGAGGAAAT 972
|||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||
Sbjct 715 AAGATTCATGGGAAAAAGGTTTGCATTGATCGGGTTCCGGAAAGTTCAGATCGGGGAAAT 774
Query 973 TTGCCAGGGCATTTGATAATGCAGCAAACCAATAACAACCAGGCTATTCAAAACCTTGGT 1032
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 775 ATGCCAGGGCATTTGATAATGCAGCAAACCCATAACAACCAGGCTATTCAGAACCTTGGT 834
Query 1033 ACTAATATGCTGGCGGGATTAAGAAGTCAGCCGTTGCAAGATGCACCAAATTCCTCTCTG 1092
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 835 ACTAATATGCTGGTGGGATTAAGAAGTCAGCCGTTGCAAGATGCACCAAATTCCTCTCTA 894
Query 1093 GCCTTGGTACCACCTCAGCAACAAAGGTACATGGGAATTGGAAGTACAAGAAACACGCAG 1152
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||
Sbjct 895 GCCTTGGTACCACCTCAGCAACAAAGGTACCTGGGAACTGGAAATATAAGAAACATGCAG 954
Query 1153 GATCAAGGATCAAATTCTGTCAGTGTCTCTGGCGCTTCGCCTGGTGGACTAGATGCGATG 1212
||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 GATCAAGGATCAAATTCTGTCAGCGTTTCTTGCGCTTCGCCTGGTGGACTAGATGCGATG 1014
Query 1213 CTGCCTTATGGCTCTGATAGTATGAACCCTGGTACATCTTTTCATAGAAAGAGAGAAAGT 1272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1015 CTGCCTTATGGCTCTGATAGTATGAACCCTGGTACATCTTTTCATAGAAAGAGGGAAAGT 1074
Query 1273 CAAGAAGGACAAATGTCTTCTATGCCTGGCTTGAATAAGCGAACAAGGGTTTCACATATG 1332
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1075 CAAGAAGGACAAATGTCTTCTATGCCTGGTTTGAATAAGCGAACCAGGGTTTCACATATG 1134
Query 1333 GGTCCTGATGGGGTTCCGCAGCAACAGTTAGGGCAACGTATGGATGGCCTTCATGGATCC 1392
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||
Sbjct 1135 GGTCCTGATGGGGTTCCGCAGCAACAGTTAGGGCAACGCATGGATGGCCTTCATGGAACC 1194
Query 1393 GATACAAATTGGAAAAATACGCTTCTACAACACCAAGACATGCTAGGCAGAAGTATTCAG 1452
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1195 GATACAAATTGGAAAAATACGCTTCTACAACAGCAAGACATGCTAGGCAGAAGTATTCAG 1254
Query 1453 TATCCAAATACAAGTATTCAGAGGTTTTCACCACACCAAATGGAAGGGGTTATGAATCAG 1512
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255 TATCCAAATACAAGTACACAGAGGTTTTCACCACACCAAATGGAAGGGGTTATGAATCAG 1314
Query 1513 GAAGGTGGTCCCATGCAATTTCCAGCTTCACAACAGGGGGGAATGAAATACACTTCAAAA 1572
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||
Sbjct 1315 GAAGGTGGTCCCATGCAATTTCCAGCTTCACAACAGGGGGCACCGAGATACACTTCGAAA 1374
Query 1573 GAGGAGCCATTTGAGACTGGTAAAATTGATGGCGGCACCAGAAACAATATTCCGGGGGTG 1632
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 1375 GAGGAGCCATTTGAGACTGGTAAAATTGATGGTGGCACCAGAAACAATATTCC--GGG-G 1431
Query 1633 GGAAGTGATGCAAATGATTTAGATCCACGTATTCAGTCAAGGATGCCCCATAATGCATTC 1692
|||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1432 GGAAGTGACACAAATGATTTGGATCCGCGTATTCAGTCAAGGATGCCCCATAATGCATAC 1491
Query 1693 ATTAGATCAAATTTCCCTCAAACATCCTGGAATGTTAATCCTGGCCAGCAGATTGAAAAA 1752
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1492 ATTAGATCAAATTTCCCTCAAACATCCTGGAATGTTAATCCTGGCCAGCAGATCGAAAAA 1551
Query 1753 GAGCCGAAA-AAAGAAGAACAATTTAGTCGTAGGATATCGGCTCAAAGTCCTCGTTTGTC 1811
||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552 GAGCC-AAAGAAAGAAGAACAATTTAGTCGTAGGATATCGGCTCAAAGTCCTCGTTTGTC 1610
Query 1812 GGCAGGTGGTCCACCGCAGTCCCCACTTTCATCGAAGTCTGGTGAGTTTTCTGGTGGTTC 1871
|||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1611 GGCAGGTGCTCCACCACAGTCCCCACATTCATCGAAGTCTGGTGAGTTTTCTGGTGGTTC 1670
Query 1872 AATGGGGACCCACTATGGAGCAGTTGCAGCAGCTCAGAAGGACAAGGCTGTTACTTCTAT 1931
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1671 AATGGGGACCCACTATGGAGCAGTTGCAGCAGCTCAGAAGGACAAGGCTGTTACTTCTAT 1730
Query 1932 TCCTGCTATTGGTGCTACTCAGTCAGTGGGTTCTAGTGCTAATGAAGCTATGCAGCAAAG 1991
|||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1731 ACCTGCTATTGGTGCCACTCAGTCAGTGTGTTCTAGTGCTAATGATGCTATGCAGCAAAG 1790
Query 1992 GCAACACCAAGCCCAAATGGCTGCAAAACGGAGAACAAATTCTCTTCCTAAGACGCAAGT 2051
|||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1791 GCAACACCAAGCCCAAAT-G--GCAAAACGGAGGACAAATTCTCTTCCTAAGACGCAAGT 1847
Query 2052 TATTAGCACTGTTGGTTCTCCTGTTAGTGTCAATACTATTAGTGTCCCAGTTAATGCAAG 2111
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848 TATCAGCACTGTTGGTTCTCCTGTTAGTGTCAATACTATTAGTGTCCCAGTTAATGCAAG 1907
Query 2112 GAGCCCTTCAGTGGGACCCCAAACTTTGGGCGATCACGCAAT-CTTGGACAGATTTTCAA 2170
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 1908 GAGCCCTTCAGTGGGACCCCAAACTTTGGGCGATCACGCAATAC-TGGACAGATTTTCAA 1966
Query 2171 AGATTGAACGAGTTGCTGCTAGGTACCAACTAAACTGCAAAAAGCATAAGGTGGATGAGT 2230
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1967 AGATTGAACGAGTTGCTGCTAGGTACCAACTAAACTGCAAAAAGCATAAGGTGGATGAGT 2026
Query 2231 ACTCTCGAAGACCTCGCGTGTATGCTAAACAGCCCCTTACTGTTTGTTTATCAAACCTGT 2290
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 2027 ACTCTCGAAGACCTCGCGTGTATGCTAAACAGTCCCTGACTGTTTGTTTATCGAACCTGT 2086
Query 2291 CTAACGAAGAGGTCTTCAAAGACGAGGACGAAGCATTATCAAAATCTATAT-TTGGTGGC 2349
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 2087 CTAACGAAGAGGTCTTCAAAGACGAGGACAAAGCATTATCAAAATCTAT-TCTTGGTGGC 2145
Query 2350 AGTATGAATACATACAAGACCAGAGTCATTCACTTTGGTCAGATGGAACGTGTAATGCAA 2409
||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2146 AGTATGAATACATGCAAGACTAGAGTCACAAACTTTTTTCATATGGAACGTGTAATGCAA 2205
Query 2410 GGTTCGGTCCCTTCCTTCATCCCTAGAA-ACCGAACAAGACTGGTGATGTCAGAGAAGGC 2468
||| | |||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2206 GGTACCGTCCCTTCCTTCGTCCCTAGAATAC-GAACAAAACTGGTGATGTCAGAGAAGGC 2264
Query 2469 CGTCGATGGGACAGTAGCATGGTATCAAGGGGACGTAGATGAAGGGGATGTTTTTCAGGC 2528
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2265 CGTCGATGGGACCGTAGCATGGTATCAAGGGGACGTAGATGAAGGGGATGTTTCTCAGGC 2324
Query 2529 TGAAGATTTTCTCTTAGCGTTGCCCAATACA 2559
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2325 TGAAGATTTTCTCTTAGCGTTGCCCAATACA 2355
Score = 2477 bits (1341), Expect = 0.0
Identities = 1510/1588 (95%), Gaps = 26/1588 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 2599 ATGGCCCGTGAAGGATACATGATTGAAGAACATATTATGGCAAAGCCAAACCGTGGGGAT 2658
||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2356 ATGACCCGTGAAGGATACATGATCGAAGAACATATTCTGGCAAAGCCAAACCGTGGGGAT 2415
Query 2659 ACTGGCCCAATCAGCAGCCATCCAAATTCTGCGGGTGGTTATCCAAGAGGTTATTCTGCA 2718
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2416 ACTGGCCCAATCAGCAACCAACCAAATTCTGCGGGTGGTTATCCAAGAGGTTACTCTGCA 2475
Query 2719 AACGATATGCAACAGTATGGAGATGCAGTTGCAGGGCAAGCGTCTGGTGAGGCATCAAAA 2778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2476 AACGATATGCAACAGTATGGAGATGCAGTTGCAGGGCAAGCGTCTGGCGAGGCATCAAAA 2535
Query 2779 CATGGGAATACTGGAAATACGCCGAATAACTCAACCCAGAATATTCTTGCAAATGCAAGG 2838
|| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2536 CAGGGGAATACTGGAAATGTGCCTAATACCTCAACCCAGAATATTCTTGCAAATGCAAGG 2595
Query 2839 ATGGTTCCTCCAACAAATTCTCAAGCCTTGCAAATGTCTCAAGGACTGCTGTCTGGTGTC 2898
||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2596 ATGCTTCCTCCAGCAAATTCTCAAGCCTTGCAATTGTCTCAAGGACTGCTGTCTGGTGTC 2655
Query 2899 TCCATGCCTATGCAACCACAACAGCTTGACCCACAACAGTCAGCGCTACTGTCATCACAT 2958
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2656 TCCATGCCTATGCAACCACAACAGCCTGACCCACAACAGTCAGCGCTACTGTCATCACAT 2715
Query 2959 TCACAGCAGAAAAATCAACAGTCAATGTTTACACAGCAACAGCATCCACAAATGCAGAGA 3018
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2716 TCACAGCAGAAAAATCAACAGTCCATGTTTACACAGCAACAGCATCCACAAATGCAGAGA 2775
Query 3019 CCTTCCATGATACTGCCTACAAATCCACTATCAGCCATCAACTCGATGAGCCAGAGCTCT 3078
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2776 CCATCCATGATACTGCCTACAAATCCACTATCAGCCATCAACTCGATTAGCCAGAGCTCT 2835
Query 3079 GGTATGCAGCCGGGTGGTCAGATGGCCAACAAGTATTCGCCTCTCCAACTGCAGATGTTA 3138
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2836 GGTATGCAGCCGGGTGGTCAGATGGCCAACAAGTATTCGCCTCTTCAACTGCAGATGTTA 2895
Query 3139 CAGCAGCAGCAGCAGGCGGCAGTGCAGAAGAAGATAATGATGGGGCTAGGATCAGGTGTA 3198
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2896 CAGCAGCAGCAGCAGGCGGCAATGCAGAAGAAGATAATGATGGGGCTAGGATCAGGTGTA 2955
Query 3199 GGCatgggtatgggtatgggcatgggtatgggtatgggaagcatgggAAATAGTATTGCT 3258
| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2956 GCCATGGGTATGGGTATGGGCATGGGCATGGGTATGGGGAGCATGGGAAATAGTATTGCT 3015
Query 3259 GGGCTTGGAGCTTTAGGCAACCAATTGAATATGGCAGGAAGAGGTATGGGGGGAACCGGA 3318
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 3016 GGGCTTGGAGCTTTAGGCAACCAATTGAATATGGCAGGAAGAGGGATTGGGGGAACCGGA 3075
Query 3319 ATCTCATCGTCAATGTCTGTTCCTGGCATCGGTAATATGGGCCAGAACCCAATGAATCTG 3378
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3076 ATCTCATCATCAATGTCTGTTCCTGGCATCGGTAATATGGGCCAGAACCCAATGAATTTG 3135
Query 3379 AATCCAGCATCAAATTTGAATGCTATAAGCCAGCAACTCCGATCTGGTGCATTAACACCA 3438
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 3136 AATCCAGCATCAAATTTGAATGCTATAAGCCAGCAACTCCGATCCGGTGCGTTAACACCA 3195
Query 3439 CAACAAAACGCTCTGTTTACACAGATTAGGATGGGCATGGCAAACCGAGGAGGTGTAATG 3498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3196 CAACAAAACGCTCTGTTTACACAGATTAGGATGGGCATGGCAAACCGAGGAGGTGTAATG 3255
Query 3499 GGTGCTCCTCAAACCGGGATAAGTGGCGTGTCAGGTACTAGGCAGATGCACCCCAGCTCA 3558
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3256 GGTGCTCCTCAAGGCGGGATAAGTGGCGTGTCAGGTACGAGGCAGATGCACCCCAGCTCA 3315
Query 3559 GCTGGTCTTTCCATGTTGGATCAGAA--CA-------GAGCTAATCTGCAGCGAGCTGCT 3609
|||||| | ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3316 GCTGGTATATCCATGTTGGATCAGAATTCATTAAACCGAGCTAACCTGCAGCGAGCTGCT 3375
Query 3610 GCTATGGGTAACATGGGCCCACCCAAGCTGATGCCTGGAATGATGAATCTTTACATGAAT 3669
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||
Sbjct 3376 GCTATGGGTAACATGGGCCCACCTAAGCTGATGCCTGGAATGA--A-TCTCTACATGAAT 3432
Query 3670 caacaacaacagcagcagcaac---tccagcagcaaccccaacaacaacagttgcagcat 3726
||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3433 CAACAGCAGCAGCAGCAACAACAACTCCAGCAGCAACCCCAACAACAACAGTTGCAGCAT 3492
Query 3727 cagcaacagttacagcagcctatgtctcagccatctcagcagctagctcagtctccgcag 3786
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3493 CAGCAACAGTTACAGCAGCCTATGTCTCAGCCATCTCAGCAGCTAGCTCAGTCTCCGCAG 3552
Query 3787 cagcagcagcagcta-ca---acaacatgaacagcctcaacaagcacagcagcagcagca 3842
||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 3553 CAGCAGCAGCAGC-AGCAGCTACAACATGAACAGCCTCAACAA--ACA-CAGCAGCAG-- 3606
Query 3843 ggcaacagcaTCCCCTCTTCAGTCTGTACTATCACCACCCCAAGTAGGGTCACCATCAGC 3902
| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||
Sbjct 3607 G-CAACAGCATCCCCTCTTCAGTCTGTGCTATCACCAGCCCAAGTAGGTTCGCCATCAGC 3665
Query 3903 TGGAATTACCCAACAGCAGCTACAACAGTCCAGTCCCCAGCAAATGAGTCAGAGAACTCC 3962
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3666 TGGAATTACCCAGCAGCAGCTACAACAGTCCAGTCCCCAGCAAATGAGTCAGAGAACTCC 3725
Query 3963 AATGAGTCCCCAGCAAGTGAACCAAAGAACTCCTATGAGTCCTCAGATAAGCTCGGGTGC 4022
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3726 AATGAGTCCCCAGCAAATGAACCAAAGAACTCCTATGAGTCCTCAGATAAGCTCGGGTAC 3785
Query 4023 AATGCATCCCATGAGCACAAGCAACCTCGAGGGTTGTCCAGCGAGTCCACAGCTTAGCTC 4082
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3786 AATGCATCCCATGAGCACAAGCAACCTCGAGGGTTGTCCAGCGAGTCCACAGCTTAGTTC 3845
Query 4083 TCAGACAATGGGTTCTGTTGGTAGCATCACTAATTCTCCAATGGAGCTTCAAGGTCCCAA 4142
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3846 TCAGACAATGGGATCTGTTGGTAGCATCACCAATTCTCCAATGGAGCTTCAAGGTCCCAA 3905
Query 4143 AAACAACTCTGCTGGTAATAATTCTTGA 4170
|||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3906 AAACAACTCTGCTGGTAATAATTCCTGA 3933
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 171297136073
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5