BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G73460.1
Length=3703
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg476480 jgi|Araly1|476480|fgenesh2_kg.2__1610__AT1G73460.1 5640 0.0
Ahg479256 jgi|Araly1|479256|fgenesh2_kg.3__1957__AT3G17750.1 893 0.0
> Ahg476480 jgi|Araly1|476480|fgenesh2_kg.2__1610__AT1G73460.1
Length=3495
Score = 5640 bits (3054), Expect = 0.0
Identities = 3373/3524 (96%), Gaps = 34/3524 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGACGGACCAGAGCTCTGTTGATGGGATTTTAGAGTTTCTTAGGAATAATCGCTTCTCT 60
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1 ATGACGGACCAAAGCTCTGTTGATGGGATTTTAGAGTTTCTTAGGAATAATCGTTTCTCT 60
Query 61 CAAGCTGAGGAAGCTTTGCGTAATGAGCTTAATAACCGGTCTGACATTAATGGCTTTCTT 120
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CAAGCTGAGGAAGCTTTGCGTAATGAGCTTAGTAACCGGTCTGACATTAATGGCTTTCTT 120
Query 121 CAGAAACTTAAGCTGGAGGATAAAGATTCAAATGAAAAGGCTGCTGGTAATGAACTTCGG 180
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 121 CAGAAACTTAAGCTTGAGGATAAAGATTCAAATGAAAA--------G----GAACTTCGC 168
Query 181 AGGTCAGGTTCTCGAGATAGTGAAGTCTCCAAGGAGCTGATTGTGAAAGAGGTAGACTGT 240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 169 AGGTCAGGTTCTCGAGATAGTGAAGTCTCCAAGGAGCTGATTGTTAAAGAGGTAGACTGT 228
Query 241 GGGACTAGCACCAATGGGTCTGTTATCAAGTGGGAAAATGGTGCGACGGCGGACAATCCG 300
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| |||
Sbjct 229 GGGACTAGCACCAATGGGTCTGTTATCAAGTGGGAAAATGGTCCGGCTGCTGACAAACCG 288
Query 301 AGCAAGAAGGAACCAGTTGTATCAAGTGAGATGAGCTTTACATTCTCCAAGAATTCAGGT 360
|||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 289 AGCAAGAAGGAAGCGGTTGTATCAAGTGAGATGAGCTTCACATTCTCCAAAAATTCAGGT 348
Query 361 GATGCTGCTGCTCCTCCTGATGCCCATTCCTATAAATTTACTTCCAGAAATGGCACCGTG 420
|||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||
Sbjct 349 GATGCTGCTGCT-CT--TGATGCTCATTCCTATAAATTTACTTCCGGAAATGGTACCTTG 405
Query 421 GAGCCTTCTCGAAACATTGATGATAGTAGTAGTAGCAGCTTGGTGGATT-TATATGCATT 479
||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||| | || |||||
Sbjct 406 GAGCCTTATCGAAACATTGATGATA--A-TAGTAGTAGTTTGGTGGATTCT-TACGCATT 461
Query 480 CGAACAGTCGAGGCATGGGAATTTCGCTGATATCGATAAGAAGATAGTGGAAACTGGTGA 539
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 462 CGAACAGTCGAGGCATGGGAATTTAGCTGATATCGATAAGAAGATAGTGGAAACTGGTGA 521
Query 540 AGATATCGTTTTCTTTGGCAATAAGAGTACTTCATGGTCTGGAAATTCTAGTAAAGGGAA 599
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||
Sbjct 522 AGATATCGTTTTCTTTGGCAATAAGAGTACTTTATGGTCTGGAAATTCTACTAAACGGAA 581
Query 600 CTCCGGGTCGAAAATAAAGGA-ACCAAATGAGATTCATCGGCTTGTTGAAAACTCTGGAA 658
|||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 582 TTCCGGGTCCAAAATAATGGAGA-CAAATGAGATTGATCGGCTAGTTGAAAATTCTGGAA 640
Query 659 AGCATGACAGCTATAAGGGTAGCATTCTTTTAAGATCTGAAGATGTCGTAGATACCTCAG 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 641 AGCATGACAGCTATAAGGGTAGCATTCTTTTAAGAACTGAAGATGTCGTAGATACCTCAG 700
Query 719 CGAACTGGAGAGAGTGTTCTGTTAAGACTCTTTTTCAATCTTCGAGAGGGGATGCGTCAA 778
|||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 701 AGAACTGGAAAGAGTGTTCTGTTGATACTCTTTTTCATTCTTCCAGAGGGGATGCATCAA 760
Query 779 ACAGTTACAATCTGGTTAGCAGCTCGGACAAGAGAGAGGGAAAGAAGAAGGCAGACATTA 838
||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 761 CCAGTTACAATCTGGTTAGCAGCTCGAACAAAAGAGAGGGAAAGAAAAAGGCAGACATTA 820
Query 839 GTGATGTGAGGGTGGCAATCAAGGAGCAGGAGAGTGAGGTGGCAAGAGCTTTATTCTTTG 898
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 821 GTGATGTGAGGGTGGCAATCAAGGAGCAGGAGAGCGAGGTGGCAAGAGCTTTATTCTTTG 880
Query 899 GTAAATCTCAATCCACTTTTGATGACAAAAATATCAGCAGCTTAGGTTTTCCACTTGTAT 958
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 881 GTAAATCTCAATCCACTTTTGATGACAAAACCATCAGCAGCTTAGGTTTTCCACTTGTAT 940
Query 959 ATGATACCCGCAAGGAAGAGTTTCCTAGGCTT-CCTCCTGTTAAGCTCAAGTCTGAAGAC 1017
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 941 ATGATACCCGCAAGGAAGAGTTTCCTAGG-TTGCCTCCTGTTAAGCTCAAGTCTGAAGAC 999
Query 1018 AATCCTCTGAGTCTTCACTGTGAAGAAAAATTTGAACGTGATGGTTCAGGTCCAAGGCTA 1077
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1000 AATCCTCTGAGTCTTCACTGTGAAGAAAAATTTGAACGTGATGGTTCAGGTCCAAGGCTA 1059
Query 1078 ATCAATGATGAGGACGCCCTTCTCATAGGCTCATACCTTGATGTTCCCATTGGACAAGAA 1137
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1060 ATCAATGATGAGGAGGCCCTTCTCATAGGCTCATACCTTGATGTTCCCATTGGACAAGAA 1119
Query 1138 ATTAGCTCATCAGGTGGGAAAAAATCTACTGGGGGAAACTGGCTTTCAGTAAGTCAGGGA 1197
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1120 ATTAGCTCATCAGGTGGGAAAAAATCTGCTGGGGGAAACTGGCTTTCAGTAAGTCAGGGA 1179
Query 1198 ATAGCAGAGGACGCATCTGATCTTGTTTCGGGTTTTGCTACTATTGGTGATGGTTTAAGT 1257
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1180 ATAGCAGAGGACGCATCTGATCTTGTTTCCGGTTTTGCTACTATTGGTGATGGTTTAAGT 1239
Query 1258 GAATCTGTTGACTATCGTAATGAATACTGGGACTCTGATGAGTATGAGGATGATGACGAC 1317
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 1240 GAATCTGTTGACTACCGTAATGAATACTGGGACTCTGACGAGTATGAGGACGATGACGAC 1299
Query 1318 ATTGGTTATGTCAGACAACCTATTGAAGATGAACCATGGTTTCTTGCCCATGAAATTGAT 1377
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1300 ATTGGTTATGTCAGACAACCTATTGAAGATGAAACATGGTTTCTTGCCCATGAAATTGAT 1359
Query 1378 TATCCAAGTGATCATGAGAAAGGAACGACCCGTGGAAGTCCTGATCACCATGAAAGAGAT 1437
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1360 TATCCAAGTGATCATGAGAAAGGAACGACCCGCGGAAGTCCTGATCACCATGGAAGAGAT 1419
Query 1438 GCAAACAAAGACGCA-GATGATCAGTCTTATGCCGAGGAGGCTTCTTATATATCTGGAGA 1496
||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1420 GCAAACAAAGACG-AGGATGATCAGTCTTATGCCGAGGAGGCTTCTTATATATCTGGAGA 1478
Query 1497 ACAGTATCTCCAATCAAAAGATGCTGAACCTATTTCTTCAGAAAATGACCGAAGACTTAC 1556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1479 ACAGTATCTCCAATCAAAAGATGCTGAACCTATTTCTTCAGAAAATGACCGAAGACTTAC 1538
Query 1557 AGTCTCAGAAATTTATCCAGCTAGCAAGAAAAATGATTTATTAGCCCAATATGATGGGCA 1616
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1539 GGTCTCAGAAATTTATCCAGCTAGCAAGAAAAATGATTTATTAGCCCAATATGATGGGCA 1598
Query 1617 TTTAATGGATGAGGAATTGCTCAGTTCGATGCGTGATGAGCCTGTTTGGCAGGGGTTTGT 1676
|||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1599 ATTAATGGAGGAGGAATTGCTCAATTCGATGCGTGACGAGCCTGTTTGGCAGGGGTTTGT 1658
Query 1677 AGCTCAGTCAAATGAACTTCTCATGTTAGGTGATAAGAAAGGCATAAATGTCCATCGAAA 1736
||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1659 AGCTCAGTCAAATGAACTTGTCACGTTAGGTGATAAGAAAGGCATAAATGTCCATCGAAA 1718
Query 1737 ATCTCATCGTGATGATGTTTACGTCGAAGATGATCAGCATGATTCGGTCAGGTCAATTGG 1796
|||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1719 ATCTCATCTTGATGATGTTTACCTCGAAGATGATCAGCATGATTCAGTCAGGTCAATTGG 1778
Query 1797 CGTGGGTATTAATAGTGATGCAGCTGATTTTGGCAGTGAAGTACGTGACAGTTTGGCTGG 1856
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1779 TGTGGGGATTAATAGTGATGCAGCTGATTTTGGCAGTGAAGTACGTGACAGTTTGGCTGG 1838
Query 1857 AGGTAGCAGTGAGGGAGATTTTGAGTACTCCCGTGATCATGATCCTGTAGCATCCAGGTT 1916
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1839 AGGTAGCAGTGAGGGAGATTTTGAGTACTCTCGTGATCATGATCCTGTAGCATCCAGGTT 1898
Query 1917 TAAACAACTTTACTCCGAGTCAGATAAGAAACATATTGATGCCCCAAACAAGAATAAACA 1976
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1899 TAAACAGCTTTACTCCGAGTCAGATAAGAAACATATTGATGGCCCAAACAAGAATAAACA 1958
Query 1977 -ACAAGCAAGTAAAAATGATGGTCCAGATTACATTGCAGATAATGATTCAAGCGGAAGTT 2035
| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1959 GA-AAGCAAGTAAAAATGATGGTCCAGATTACATTATAGATAATGATTCAAGCGGAAGTT 2017
Query 2036 TTCATGTGAAGATTCAAACTGATGGTGGTTTTTCGTTTGGTTCGTCCCAAAAAGATGGGC 2095
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2018 TTCATGTGAAGATTCAAACTGATGGTGGTTTTTCGTTTGGTTCGTCACAAAAAGATGGGC 2077
Query 2096 AGTCAATGCATGCGGAATCTAGTAAATCATTATGGTCAGGCAATCACGAAACGGTAACCA 2155
||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||
Sbjct 2078 AGT---T--A-GCAGAATCTAGTAAATCATTATGGTCAGGCAATCGCGAAACAGTAACCA 2131
Query 2156 GAGATAGGAACACCGAACGTTTGAGTGCTTCAACAGCTATGGATGATATGGTTGCAACTT 2215
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2132 GAGATAGGAACGCCGAACGTTTGAGTGCTTCAACAGCTACGGATGATATGGTTGCAACTT 2191
Query 2216 GGAGACGAAAAAGTAGTGATTCATCAAGTTCTCATAGTTCTGTGAAAGATAATAATGCAA 2275
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2192 GGAGACGAAAAAGTAGTGATTCGTCAAGTTCTCATAGTTCTGTGAAAGATAATAAAGCAA 2251
Query 2276 CGTCCATAAAATCTCTAAACTCATCTCCCTCTTCTCTGTCAAATTATGCTTGTGAAGAAA 2335
|||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2252 CGTCTATAAAATCTGTAAACTCATCTCCCTCTTCTCTGTCAAATTATGCTTGCGAAGAAA 2311
Query 2336 GAAAGCATGCTGATAAAGAAGATGATAGAAATGATAGTAGTGAAATAGAGGATGACAATG 2395
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 2312 GAAAGCATGCTGATAAAGAAGATGATAGAAATGATAGTAGTGAAGTAGGGGATGACAATG 2371
Query 2396 CGACAGCACTTGATGATGAAGAGGCAGTGGCTGTCCAAGAGCAAGTTAGACAAATTAAGG 2455
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2372 CGACAGCACTTGATGATGAAGAGGCAGTGGCTGTCCAAGAGCAAGTTAGACAAATTAAGG 2431
Query 2456 CCCAAGAGGAGGAGTTTGAAACCTTTGACCTCAAAATTGTGCATCGAAAAAACAGGACTG 2515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2432 CCCAAGAGGAGGAGTTTGAAACCTTTGACCTCAAAATTGTGCATCGAAAAAACAGGACTG 2491
Query 2516 GTTTCGAAGAGGAAAAGAACTTTAACGTGGTTTTAAATTCGGTCATTGCTGGGCGGTACC 2575
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2492 GTTTTGAAGAGGAAAAGAACTTTAACGTGGTTTTAAATTCGGTCATTGCTGGGCGGTACC 2551
Query 2576 ATGTCACTGAGTACCTTGGATCAGCAGCCTTCAGTAAAGCCATACAAGCGCATGACTTAC 2635
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2552 ATGTCACTGAGTACCTTGGATCAGCAGCCTTCAGTAAAGCCATACAAGCGCATGACTTAC 2611
Query 2636 AGACAGGAATGGATGTCTGTATAAAGATCATAAAGAACAACAAAGACTTTTTTGACCAGA 2695
||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 2612 AGACAGGAATGGACGTCTGTATAAAGATTATAAAGAACAACAAAGACTTCTTTGACCAAA 2671
Query 2696 GTCTTGACGAGATAAAACTTTTGAAGTATGTCAACAAGCATGATCCTGCTGACAAATACC 2755
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2672 GTCTTGACGAGATAAAACTTTTGAAGTATGTCAACAAGCATGATCCTGCTGACAAATACC 2731
Query 2756 ATCTTCTACGGTTGTATGATTACTTTTACTACCGCGAGCACTTGCTAATTGTATGTGAAC 2815
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2732 ATCTTCTAAGGTTGTATGATTACTTTTACTACCGGGAGCACTTGCTCATTGTATGTGAAC 2791
Query 2816 TTCTTAAGGCCAATCTATACGAATTCCACAAATTTAACAGAGAATCAGGTGGTGAAGTTT 2875
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2792 TTCTTAAGGCCAATCTATACGAATTCCACAAATTTAACAGAGAATCAGGTGGTGAAGTTT 2851
Query 2876 ATTTCACGATGCCAAGATTGCAGTCAATCACTATCCAGTGTCTCGAATCACTTCAATTTC 2935
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 2852 ATTTCACGATGCCAAGATTGCAGTCAATCACTATCCAGTGTCTCGAATCTCTTCAGTTTC 2911
Query 2936 TACATGGCCTTGGACTTATACACTGTGATTTGAAGCCTGAGAACATATTGGTTAAAAGTT 2995
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 2912 TACATGGCCTTGGACTTATACACTGTGATTTGAAGCCTGAGAACATATTGGTGAAAAGCT 2971
Query 2996 ATAGCAGATGTGAAATAAAGGTCATTGACCTTGGAAGTAGCTGTTTCGAGACAGACCACC 3055
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2972 ATAGCAGATGTGAAATAAAAGTCATTGACCTTGGAAGTAGCTGTTTCGAGACAGATCACC 3031
Query 3056 TATGCTCCTATGTCCAGTCAAGGTCATATCGAGCACCAGAAGTCATTTTGGGACTTCCTT 3115
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3032 TATGCTCCTATGTCCAGTCAAGGTCATATCGAGCACCAGAAGTCATTTTGGGACTTCCTT 3091
Query 3116 ATGATAAAAAGATAGATGTGTGGTCTCTTGGGTGCATTTTGGCTGAACTGTGTACAGGCA 3175
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3092 ATGATAAAAAGATAGATGTGTGGTCTCTTGGATGCATTTTGGCTGAACTGTGTACAGGCA 3151
Query 3176 ACGTTCTCTTCCAGAATGATTCGCCAGCCAGTTTGCTAGCAAGGGTTATGGGAATCGTAG 3235
||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3152 ACGTTCTTTTCCAAAATGATTCTCCAGCCAGTTTGCTAGCAAGGGTAATGGGAATCGTAG 3211
Query 3236 GATCTTTCGATAATGAAATGCTTACCAAGGGACGTGATTCCCACAAATACTTCACAAAAA 3295
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 3212 GATCTTTCGATAATGAAATGCTTACCAAGGGGCGTGATTCCCACAAATATTTCACCAAAA 3271
Query 3296 ACCGAATGCTCTATGAGCGGAACCAGGAAAGCAACAGATTGGAGTACCTGATACCAAAAA 3355
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||
Sbjct 3272 ACCGAATGCTCTATGAGCGGAACCAGGAAAGCAACAGACTGGAGTACCTGATACCGAAAA 3331
Query 3356 GAACATCGTTGAGACATCGGCTGCCAATGGGAGACCAAGGATTCACAGACTTTGTGGCTC 3415
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3332 GAACATCCTTGAGACATCGGCTGCCAATGGGAGACCAAGGATTCACAGACTTTGTGGCTC 3391
Query 3416 ATCTTCTTGAGATAAACCCAAAGAAGCGTCCTTCTGCAGCAGAGGCTCTGAAGCACCCTT 3475
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3392 ATCTTCTTGAGATAAACCCAAAGAAGCGTCCTTCTGCAGCAGAGGCTCTCAAGCACCCTT 3451
Query 3476 GGCTTTCATATCCATACGAACCAATCTCTGCTTAAACAATTGGT 3519
|||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||
Sbjct 3452 GGCTTTCATACCCATACGAACCGATATCAGCTTAAACAATTGGT 3495
> Ahg479256 jgi|Araly1|479256|fgenesh2_kg.3__1957__AT3G17750.1
Length=3894
Score = 893 bits (483), Expect = 0.0
Identities = 898/1096 (82%), Gaps = 38/1096 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 2428 GTCCAAGAGCAAGTTAGACAAATT-AAGGCCCAAGAGGAGGAGTTTGAAACCTTTGACCT 2486
|||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| |||| ||||| ||||| ||||
Sbjct 2545 GTCCAAGAGCAAGTAAGACAGATTCAA-GCCCAAGAGCAGGATTTTGAGACCTTCAACCT 2603
Query 2487 CAAAATTGTGCATC-GAAAAAACAGGACTGGTTTCGAAGAGGAAAAGAACTTTAACGTGG 2545
|| ||||| || | | ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| | ||||
Sbjct 2604 GAAGATTGTTCA-CAGGAAAAACAGGACTGGTTTTGAGGAGGATAAGAACTTCCATGTGG 2662
Query 2546 TTTTAAATTCGGTCATTGCTGGGCGGTACCATGTCACTGAGTACCTTGGATCAGCAGCCT 2605
|||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||| |
Sbjct 2663 TTTTGAATTCTGTCATTGCTGGTCGTTACCATGTCACTGAGCATCTTGGATCAGCAGCTT 2722
Query 2606 TCAGTAAAGCCATACAAGCGCATGACTTACAGACAGGAATGGATGTCTGTATAAAGATCA 2665
| || ||||| |||||||| |||||| | || || || || ||||||||| |||||||||
Sbjct 2723 TTAGCAAAGCAATACAAGCACATGACCTCCACACCGGCATTGATGTCTGTGTAAAGATCA 2782
Query 2666 TAAAGAACAACAAAGACTTTTTTGACCAGAGTCTTGACGAGATAAAACTTTTGAAGTATG 2725
|||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||| | |||||||
Sbjct 2783 TAAAGAACAACAAAGACTTTTTTGACCAAAGCCTTGATGAAATCAAACTTCTCAAGTATG 2842
Query 2726 TCAACAAGCATGATCCTGCTGACAAATACCATCTTCTACGGTTGTATGATTACTTTTACT 2785
||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||| ||||
Sbjct 2843 TCAACCAGCATGATCCTGCTGACAAATACCATCTCCTTCGACTGTATGACTACTTCTACT 2902
Query 2786 ACCGCGAGCACTTGCTAATTGTATGTGAACTTCTTAAGGCCAATCTA-TACGAATTCCAC 2844
||| |||||| || |||| |||||||||||||| ||||| || || || || |||||
Sbjct 2903 TCCGGGAGCACCTGTTAATAGTATGTGAACTTCTCAAGGCAAA-CTTGTATGAGTTCCA- 2960
Query 2845 AAA-TTTAACAGAGAATCAGGTGGTGAAGTTTATTTCACGATGCCAAGATTGCAGTCAAT 2903
||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 AAAGTTTAATAGGGAATCAGGTGGAGAGGTTTATTTCACTATGCCAAGATTGCAGTCAAT 3020
Query 2904 CACTATCCAGTGTCTCG-AATCACTTCAA-TTTCTACATGGCCTTGGACTTATACACTGT 2961
||||||||||| || | || || || || ||||| ||||| || || |||||||||||
Sbjct 3021 TACTATCCAGTG-CTTGGAAGCA-TTGAACTTTCTTCATGGTCTGGGCCTTATACACTGC 3078
Query 2962 GATTTGAAGCCTGAGAACATATTGGTTAAAAGTTATAGCAGATGTGAAAT-AAAGGTCAT 3020
|| || || ||||| |||||| | | ||||| || |||||||| ||||| |||| | ||
Sbjct 3079 GACTTAAAACCTGAAAACATACTAATCAAAAGCTACAGCAGATGCGAAATCAAAGTT-AT 3137
Query 3021 TGACCTTGGAAGTAGCTGTTTCGAGACAGACCACCTATGCTCCTATGTCCAGTCAAGGTC 3080
||| || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| || ||
Sbjct 3138 TGATCTGGGAAGTAGCTGTTTTGAGACAGATCATCTTTGCTCCTATGTTCAGTCTAGATC 3197
Query 3081 ATATCGAGCACCAGAAGTCATT-TTGGGACTTCCTTATGATAAAAAGATAGATGTGTGGT 3139
|| || || |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||||
Sbjct 3198 CTACCGTGCTCCAGAAGTCATTCTTGGG-CTTCCATATGATAAGAAGATAGATATCTGGT 3256
Query 3140 CTCTTGGGTGCATTTTGGCTGAACTGTGTACAGGCAACGTTCTCTTCCAGAATGATTCGC 3199
| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |
Sbjct 3257 CACTTGGCTGCATTTTGGCTGAACTGTGTACCGGCAATGTTCTTTTCCAAAATGATTCTC 3316
Query 3200 CAGCCAGTTTGCTAGCAAGGGTTATGGGAATCGTAGGATCT-TTCGAT-AATGAAATGCT 3257
| || | |||||| |||||||| || || || | ||||| || || || ||||||||
Sbjct 3317 CGGCAACTTTGCTTGCAAGGGTCATCGGTATAATCGGATCCATT-GACCAA-GAAATGCT 3374
Query 3258 TACCAAGGGACGTGATTCCCACAAATACTTCACAAAAAACCGAATG-CTCTATGAGCGGA 3316
| |||| ||||||||| | ||| |||||||| ||||| | | | || |||||| |||
Sbjct 3375 TGCCAAAGGACGTGATACATGCAAGTACTTCACCAAAAATC-ATTTACTATATGAGAGGA 3433
Query 3317 ACCAGGAAAGCAACAGATT-GGAGTACCTGATACC-AAAAAGAACATCG-TTGAGACATC 3373
||||||| || |||| ||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| || || | |
Sbjct 3434 ACCAGGAGAGTAACA-ATTTGGAGTACCTAATACCGAAAAAGT-CATCGCTTAAG-CGTA 3490
Query 3374 GGCTGCCAATGGGAGACCAAGGATTCACAGACTTTGTGGC-TCATCTT-CTTGA-GATAA 3430
| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| || | | | |
Sbjct 3491 GACTGCCAATGGGTGACCAAGGCTTCATAGACTTTGTGGCAT-A-CTTGCTCCAAGTTGA 3548
Query 3431 ACCCAAAGAAGCGTCCTTCTGCAGCAGAGGCTCTGAAGCACCCTTGGCTTT-CATATCCA 3489
|| |||||| || ||||||||| | || ||||| ||||| |||||| || | |||||
Sbjct 3549 TCC-AAAGAAACGCCCTTCTGCATCTGAAGCTCTTAAGCATCCTTGG-TTGACTTATCCC 3606
Query 3490 TACGAACC-A-ATCTC 3503
|||||||| | |||||
Sbjct 3607 TACGAACCCATATCTC 3622
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 139899638348
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5