BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT1G73960.1 Length=4314 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg476534 jgi|Araly1|476534|fgenesh2_kg.2__1664__AT1G73960.1 7086 0.0 > Ahg476534 jgi|Araly1|476534|fgenesh2_kg.2__1664__AT1G73960.1 Length=4268 Score = 7086 bits (3837), Expect = 0.0 Identities = 4131/4275 (97%), Gaps = 12/4275 (0%) Strand=Plus/Plus Query 4 AAAAAGGAACATGGCCAAGGCTCGAAAGCCGAAGAACGAGGAAGCTCCTGGCGCGAAGAC 63 ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1 AAAAAGGAACATGGCAAAGGCTCGGAAGCCGAAGAACGAGGAAGCTCCTGGCGCCAAGAC 60 Query 64 TTCAGAGAACACTGGAGCTAAAGTTCTTCACCAGAAACTCTTTCTCTCTATTGACTTCAA 123 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| Sbjct 61 TTCGGAGAACACTGGAGCTAAAGTTCTTCACCAGAAGCTCTTTCTTTCTATCGACTTCAA 120 Query 124 AAAACGCCAAATCTACGGTTACACAGAGTTAGAAGTGAGTGTGCCAGATATTGGTATTGT 183 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 121 AAAACGCCAAATCTACGGTTACACAGAGTTAGAAGTGAGTGTGCCAGATATTGGTATAGT 180 Query 184 GGGACTACACGCAGAGAACTTGGGAATTGAGAGTGTTTTGGTAGATGGGGAACCTACTGT 243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 GGGACTACACGCAGAGAACTTGGGAATTGAGAGTGTTTTGGTAGATGGGGAACCTACTGT 240 Query 244 ATTTGAGTACTATCCGCACCATCAGAACTCTGAAACTGAAAGTAACTGGAACTCGGTCTC 303 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | Sbjct 241 ATTTGAGTACTATCCGCACCATCAGAACTCTGAAACTGAGAGTAATTGGAACTCGGTCAC 300 Query 304 TGACCC-AGCTTCAGCAGCTGATGCTGCGGCCATGGAATATGTCGGGGTTCTTAAGAGAG 362 ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 301 AGACCCTA-CTTCAGCAGCTGATGCCGCGGCCATGGAATATGTTGGGGTTCTTAAGAGAG 359 Query 363 AAGACACTGCAAATTTACTGATCAACTGTTGCAAGCCTTCTAAGGATTTATCTGAACAGC 422 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct 360 AAGACACTGCAAATTTACTGATCAATTGTTGCAAGCCCTCTAAGGATCTATCTGAACAGC 419 Query 423 TGGACAGTGTGACTTTAGAAAACGGTTCCCAATCTTCAGGGGAGGCAAAACAGAATGTTA 482 |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| Sbjct 420 TGGATAATGTGACTTTAGAAAATGGTTCCCAATCTTCCGGGGAGGTAAAACAGAATGTTA 479 Query 483 AATTGATTCGGATTAACTACTGGGTAGAGAAAATAGAGTCAGGAATTCATTTTGATGGGA 542 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 480 AATTGATTCGGATTAACTACTGGGTAGAGAAAATAGAGGCAGGAATTCATTTTGATGGGA 539 Query 543 ACATTGTACATACTGATAACCAGATGAGACGTGCTCGTTGTTGGTTTCCTTGTATTGATG 602 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| Sbjct 540 ACATTGTACATACTGATAACCAGATGAGACGTGCCCGTTGTTGGTTTCCTTGCATAGATG 599 Query 603 ATGAGTACCATCGTTGCAGTTTCGATTTGGAATTCACTGTTCCGCACAACTTTGTGGCTG 662 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 600 ATGAGTACCATCGTTGCAGTTTCGATTTAGAATTTACTGTTCCGCACAACTTTGTGGCTG 659 Query 663 TTAGTGTTGGGAAATTACTCTACCAGGTTATGTGCAAAGAAGATACTACTCAAAAAACGT 722 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 660 TTAGTGTTGGGAAACTACTCTACCAGGTTATGTGCAAAGAAGATACTACTCGTAAAACGT 719 Query 723 ATGTTTATGAACTAGCTATTCCTATTGCACCGCGGTGGGTGTCTTTAGTTGCAGGACCAT 782 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 720 ATGTTTATGAACTAGCTATTCCTATCGCACCGCGGTGGGTGTCTTTAGTCGCAGGACCAT 779 Query 783 TGGAAATCCTTCCAGATCAGACCAACTTTCTCATATCTAACTTGTGTTTGCCGCATGATC 842 ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 780 TGGAAGTCCTTCCAGATCGGACCAACTTTCTCATATCTAACTTGTGTTTACCGCATGATC 839 Query 843 TCTCGAGGCTTCGTAATACAATGGAATTTTTCCATGAAGCTTATAGCTACTATGAGGATT 902 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 840 TCTCGAGGCTTCGTAATACAATGGAATTTTTCCATGAAGCTTATAGCTACTATGAGGATT 899 Query 903 ATTTAAGTGCGAACTTTCCATTTGGATTCTACAAGCAAGTATTTTTACCTCCTGAAATGG 962 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 900 ATTTAAGCGCGAACTTTCCATTTGGATTCTACAAGCAAGTTTTTTTACCTCCTGAAATGG 959 Query 963 TTGTTACTTCGTCGACTTCGGGAGCTTCCTTGAGTATCTTTAGCTCCCACATACTATATG 1022 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 960 TTGTTACCTCGTCGACTTCGGGAGCTTCCTTGAGTATCTTTAGCTCCCACATGCTATATG 1019 Query 1023 ATGAGAGGGTTATTGATCAGACAATAGATACACGCATTAAACTTGCTTCTGCGTTAGCAA 1082 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1020 ACGAGAGGGTTATTGATCAGACAATAGATACACGCATTAAACTTGCTTCTGCGTTAGCAA 1079 Query 1083 AACAGTGGTTTGGAGTTTATATTACTCCTGAATCACCAAATGATGATTGGCTCCTTGATG 1142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1080 AACAGTGGTTTGGAGTTTATATTACTCCTGAATCACCAAATGATGATTGGCTCCTCGATG 1139 Query 1143 GTCTTGCTGGTTTCTTAACGGATATGTTTATCAAGCAGTTTTTGGGAAATAATGAAGCAC 1202 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1140 GTCTTGCTGGTTTCTTAACGGATATGTTTATCAAGCAGTTTTTGGGAAATAATGAAGCAC 1199 Query 1203 GATATCGGAGATACAAGGCAAATTGTGCTGTCTGTAAAGCTGATGATAGTGGTGCAATGT 1262 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1200 GATACCGGAGATACAAGGCAAATTGTGCTGTCTGTAAAGCTGATGATAGTGGTGCAATGT 1259 Query 1263 GCTTGAGCTCATCTCCTTCTTGCAGGGACCTATTTGGAACTCATTCTATTGGAATGCATG 1322 |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1260 GCTTGAGCGCATCTCCTTCTTGCAAGGACCTATTTGGAACTCATTCTATTGGGATGCATG 1319 Query 1323 GGAAGATACGATCATGGAAATCAGGAGCAGTCCTTCAGATGTTGGAGAAGCAAATGGGCT 1382 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1320 GGAAGATACGATCATGGAAATCAGGAGCAGTCCTTCAGATGTTGGAGAAGCAAATGGGCT 1379 Query 1383 CAGACTCGTTTCGTAAAATATTGCAGAAAATTATTTCTCGAGCCAAGGATCCATCTAATT 1442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1380 CAGACTCGTTTCGTAAAATATTGCAGAAAATTATTTCTCGAGCCAAGGATCCATCTAATT 1439 Query 1443 CTATACGGTCTCTTAGCACGAAGGAGTTCCGGCAATTTGCTAATAAGATTGGAAATCTTG 1502 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1440 CTATACGGTCTCTTAGCACGAAGGAGTTCCGGCAATTTGCTAATAAGATTGGAAATCTTG 1499 Query 1503 AGCGTCCATTTCTTAAAGAATTTTTTCAGCGATGGGTTGCATCTTATGGTTGTCCCGTGC 1562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| Sbjct 1500 AGCGTCCATTTCTTAAAGAATTTTTTCAGCGATGGGTTTCATCTTGTGGTTGTCCCGTGC 1559 Query 1563 TAAGGATTGGGTTGTCTTACAACAAAAGGAAAAACAATGTTGAAATGGCTGCTCTGCGAG 1622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1560 TAAGGATTGGGTTGTCTTACAACAAAAGGAAAAACAATGTTGAAATGGCTGCTCTGCGCG 1619 Query 1623 AATGCACGGCTGCACTGGATGCAAGATTATCAGTTATAGGGGCTACTTCTGATTCAGAAA 1682 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1620 AATGCACGGCTGCACTGGATGCAAGGTTATCAGTTATTGGGGCTACTTCTGATTCAGAAA 1679 Query 1683 GCCGGGATGTGGATGCTGGCTGGCCGGGTATTATGAGTATAAGGGTTTATGAACTCGATG 1742 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1680 GCCGGGATGTGGATGCTGGCTGGCCGGGTATTATGAGTATAAGGGTTTATGAACTCGATG 1739 Query 1743 GAATGTCTGATCATCCAAAGTTGCCTATGGCTGGAGATAGATGGCAGCTACTGGAATTAC 1802 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1740 GAATGTCTGATCATCCAAAGTTGCCTATGGCTGGAGATAGATGGCAGCTACTGGAATTAC 1799 Query 1803 CATGTCATTCTAAACTTGCTGCTAAACGCTATCAAAAACCAAAGAAGGGAGGGAAACCTG 1862 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1800 CATGTCATTCTAAACTTGCTGCTAAACGCTATCAAAAACCAAAGAAGGGAGGGAAACCTG 1859 Query 1863 ATGGGGCTGAAGACAATGTTGATGCTATAGCACCGTTAGAAAATAAAACGAGCATTGAAT 1922 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1860 ATGGGGCTGAAGACAATGTTGATGCTATAGCACCGTTAGAAAATAAATCGAGCATTGAAT 1919 Query 1923 CTCCCTTGGCTTGGATTAAAGCTGACCCTGAGATGGAATATATTGCTGAGATTCACCTTC 1982 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1920 CTCCCTTGGCTTGGATTAAAGCTGACCCTGAGATGGAATATATTGCTGAGATTCACCTTC 1979 Query 1983 ATCAGCCCCTACAAATGTGGGTCAATCAACTAGAGAAGGACGGAGATGTTGTTGCTCAGG 2042 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1980 ATCAGCCCCTACAAATGTGGGTCAATCAACTAGAGAAGGATGGAGATGTTGTTGCTCAGG 2039 Query 2043 CACAAGCAATTGCGTCACTTGAAGCCTTAAAACAACACTCCTTTTCCATTGTGAATGCAC 2102 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2040 CACAAGCAATTGCGTCACTTGAAGCCTTAAAACAACACTCCTTTTCCATTGTGAATGCGC 2099 Query 2103 TCAAAAATGTCCTCACTGACTCCAAGGTCTTCTGGAGAATACGTATTGCGGCAGCGTTTG 2162 |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2100 TCAAAAATGTTCTCTCTGACTCCAAGGTCTTCTGGAGAATACGTATTGGGGCAGCGTTTG 2159 Query 2163 CATTGGCTAAAACAGCATCAGAGGAGTCTGACTGGGCGGGTTTGCAACATCTAATAAAGT 2222 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2160 CATTGGCTAAAACAGCATCAGAGGAGACTGACTGGGCGGGTTTGCAACATCTAATAAAGT 2219 Query 2223 TTTATAAGAGTAGAAGATTTGATGCAGAGATTGGACTCCCCAAGCCGAATGACTTCCGCG 2282 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2220 TTTATAAAAGTAGAAGATTTGATGCAGAGATTGGACTCCCCAAGCCGAATGACTTCCACG 2279 Query 2283 ATTTCCCAGAATATTTTGTGCTTGAGGCCATTCCACATGCCATTGCAATAGTTAGGGGTG 2342 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2280 ATTTCCCAGAATATTTTGTGCTTGAGGCCATTCCACATGCCATTGCAACAGTTAGGGGTG 2339 Query 2343 CTGAGGGGAAAAGCCCTAGAGAAGCTGTTGAATTTATCTTACAGCTTCTGAAGTACAATG 2402 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2340 CTGAGGGGAAAAGCCCTCGAGAAGCTGTTGAATTTATCTTACAGCTTCTGAAGTACAATG 2399 Query 2403 ACAACAGTGGGAATTCG-TATTCTGATGTATTCTGGCTTGCTGTGCTTGTTCAGTCAGTT 2461 |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2400 ACAACAGTGGGAAT-CGGTATTCTGATGTATTCTGGCTTGCTGTGCTTGTTCAGTCAGTT 2458 Query 2462 GGTGATCTCGAATTCTGTCAGCAGAGTCTAACGTTTTTGGCCCCTCTTCTGAAGCGCATT 2521 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2459 GGTGATCTCGAATTCTGTCAGCAGAGTCTAACGTTTTTGGCCCCTCTTCTGAAGCGCATT 2518 Query 2522 GACAGACTCTTGCAGTTTGACAGGTTGATGCCAAGCTACAATGGCATCTTGACAATTAGC 2581 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2519 GACAGACTCTTGCAGTTTGACAGGTTGATGCCAAGCTACAATGGCATCTTGACAATTAGC 2578 Query 2582 TGCATCCGAACATTGGCACAGACTGCTCTCAAGCTTTCTGATTCCATCAGTTTCGATCAC 2641 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2579 TGCATCCGAACATTGGCACAGACTGCTCTCAAGCTTTCTGATTCCATCAGTTTCGATCAC 2638 Query 2642 ATCTGTAAACTTATTGAACCTTTCCGGAATTCGGATACAATATTGCAAATTCGTATAGAA 2701 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2639 ATCTGTAAACTTATTGAACCTTTCCGAAATTCGGATACAATATTGCAAATTCGTATAGAA 2698 Query 2702 GGAAGTAGGGCACTTCTTGACATCGAGTACCAATCCAAAGGCATAAGTTCCGCACTTTTG 2761 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2699 GCAAGTAGGGCACTTCTTGACATCGAGTACCAATCCAAAGGCATAAGTTCCACACTTTTG 2758 Query 2762 TTGTTTATGAAATATTTGGTAGAAGAATCATCTTTGAGAGGGCAGGTAAAATTGTGTGTA 2821 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2759 TTGTTTATGAAATATGTGGTAGAAGAATCATCTTTGAGAGGGCAGGTAAAATTGTGTGTA 2818 Query 2822 CACACAATGCGGTTATGTCAAATAGCAGTTGGATGTGACTCAGACGATTGTGTCGACACT 2881 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2819 CACACAATGCGGTTATGTCAAATAGCAGTTGGGTGTGACTCAGACGATTGTGTCGACACT 2878 Query 2882 GTTACTCTTCTGGATTTGCTGCATCTATTCAAGAGCCATGTAGTATTTAACAATGAACTT 2941 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2879 GTTAGTCTTCTGGATTTGCTGCATCTATTCAAGAGCCATGTAGTATTCAACAATGAACTT 2938 Query 2942 CTTCGCTACTACTTGTTCTGCATTTTTCAAATCCTCGCTGGAAGACCCCCAACGTTGTTC 3001 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2939 CTTCGCTACTACTTGTTCTGCATTTTTCAAATTCTCGCGGGAAGACCCCCAACGTTGTTT 2998 Query 3002 GGAGTTCCCAAAGAAAAACCTTTGCAGCTTGTTGATGTGGAGGCCTGCATTGAACCGAAA 3061 || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2999 GGTGTGCCCAAAGAAAAACCTTTGCAGCTTGTTGATGTGGAGGCCTGCATTGAGCCGAAA 3058 Query 3062 AATGTATTTTTGGTTCCCGGAGCAGAGGCAGGGGAGCCTTCACTTTCGGCACTTGGAGAT 3121 |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3059 AATGTATTTTCGGTTCCGGGAACAGAGGCAGGGGAGCCTTCACT---GGCACTTGGAGAT 3115 Query 3122 GCCAAAGGACAATCGCTGGATGTTGCTCCTTATGGTGTTCCAATAATACCACAGGAAATG 3181 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3116 GCCAACGGACAATCGCTGGATGTTGCTCCTTATGGTGTTCCAATAAGACCACAGGAAATG 3175 Query 3182 TTCATGCCTATTGTTCCTGAACTGATGTTGCCAGAACCTGTTGCAGCGTATGATGAGACA 3241 ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3176 TTCATGCCTATTGTTCCTGAACTAAAGTTGCCAGAACCTGTTGCAGCGTATGATGAGACA 3235 Query 3242 CAGCATCTTGAACCTCGCATGGAAAGTCAAAACCAACCTTCACATGAAAATCCCATCGTT 3301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3236 CAGCATCTTGAACCTCGCATGGAAAGTCAAAACCAACCTTCACATGAAAATCCCATCGTT 3295 Query 3302 CATGAGATTCCATCAGATGTTGAAGGTCCAACAGAAGAATTAGCTCATAGGGAAGCAAAC 3361 ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| Sbjct 3296 CATGAGATTCCGTCGGATGGTGAAGGTCCAACAGAAGAATTCGCTAATAGGGAAGCAAAC 3355 Query 3362 CCTCCAACAAAGGAACCTCAAAAAGAACCTGATGTGGTTTCTGTGTCTGTTAGTCATGAG 3421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3356 CCTCCAACAAAGGAACCTCAAAAAGAACCTGATGTGGTTTCTGTGTCTGTTAGTCATGAG 3415 Query 3422 GTGAAGAAGTCTGTTATACGGATCAAGGTCAGACCATCTGGGGCAACCAGCAGAGCGGAA 3481 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct 3416 GTGAAGAAGTCTGTTATACGGATCAAGGTCAGACCATCTGGTGCAACCAGCAGAGCCGAG 3475 Query 3482 GGATCAGCACGAACTATAGAAAGATCTCAAGGGATTGTGGTACGCCATGATATAGACCGA 3541 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 3476 GGATCAGCACGAACCATAGAAAGATCTCAAGGGATTGTGGTACGCCATGATATAGACAGA 3535 Query 3542 GGTCAAACTAGTTCAGCTTCAGTGGACGCCCCACAGAGAATCTCAACTGACGCTGTGAGC 3601 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 3536 GGACAAACTAGTTCAGCTTCAGTGGACGCCCCACAGAGAATCTCAACTGATGCTGTGAGC 3595 Query 3602 ATAAGCAATCAGAATCACGTGGAGGAAGTAAATTCGTGTCACGATGTTGGTTCTCGCATG 3661 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3596 ATAAGCAATCAGAATCACGTGGAGGAAGTAAACTCGTGTCACGATGTTGGTTCTCGCATG 3655 Query 3662 ACTGCAAGCATCGGCAGTGTAAAATTTGCAAGCGAAGGCGATATTTTTGGGAAAGAGTTG 3721 ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 3656 ACTGCGAGTATCGGCAGTGTAAAATTTGCAAGCGAAGGCGATACTTTTGGGAAAGAGTTG 3715 Query 3722 CAATGCACTGCTGAGTCTGGGAAACCTTCGACAAGCCAGAAAGCAGATAATAACAACCGA 3781 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 3716 CAATGCACTGCTGAGTCTGGGAAAACTTCGACAAGCCAGAAAGCAGATAATAACAACCAA 3775 Query 3782 ACTGTACCACCTAGCTTCTTACCACTAGACCACAGTATGGAAAACGAGGCGCAGCAGAAA 3841 || ||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 3776 ACAGTAGCGCCTAGCATCTTACCACTAGACCATAGTATGGAAAACGAGGCACAGCAGAAA 3835 Query 3842 TACGCGAGCCTCCAAACACTTTCGATTGGTaaagaaaaggaaaagaagaaagacaaggaa 3901 ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3836 TACGCGAGCCTTCAAACACTTTCGGTTGGTAAAGAAAAGGAAAAGAAGAAAGACAAGGAA 3895 Query 3902 aagaaagagaagaagaggaaaagagaagatcccgtttatctagagaagaaacggttaaag 3961 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| Sbjct 3896 AAGAAAGAGAAGAAGAGGAAAAGAGAAGACCCCGTTTATCTAGAGAAGAAAAGATTAAAG 3955 Query 3962 aaagagaagaaacgaaaggagaaggaaaTGGCGAAGCTCGTGAGCAGCACTACGGATCCA 4021 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| Sbjct 3956 AAAGAGAAGAAACGAAAGGAGAAGGAAATGGCGAAGCTCGTGAGCAGCTCTTCAGATCCA 4015 Query 4022 GCTAAAAAGAAGATAGAGAGTGTTGCGGAGGTTAAAGAAGAAGAACCAAGTGATGGTGCC 4081 |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| Sbjct 4016 GCTACAAAGAAGATAGAGAGTGTAGCGGAGGCTAAAGCAGAAGAAGCAAGTGATGGTGCC 4075 Query 4082 ATGTTGATTAAGGTTGAACCAAAGACTGAACCATCAACAGCA---GAAGCTAGACCGCTT 4138 |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||| | |||||| Sbjct 4076 ATGTTGATTAAGGTTGAACCAAAGGCTGAGCCATCAGCAGCAACAGAAGCTCGTCCGCTT 4135 Query 4139 CCCAAATTCCGAATCAAACTGAAAAGCAAAGCGTTCAACAACTCATAAGGTTAGATCCGA 4198 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 4136 CCCAAATTCAGAATCAAACTGAAAAGCAAAGCGTTCAACAACTCATAAGGTAAGATCCGA 4195 Query 4199 GCCAGTCCCTCCCCGCCAAAATCTGAGTAGTAACTTTTATTTCCAAAAGCTTTGTTGTTA 4258 ||||||| ||||| || || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 4196 GCCAGTCTCTCCC-GCGAATATCTGAGTAGTA-CTTAGATTTCCAAAAGCTTTGTTGTTG 4253 Query 4259 CAACTTGCAAGGTGT 4273 ||||||||||||||| Sbjct 4254 CAACTTGCAAGGTGT 4268 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 163152815451 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5