BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G74260.1
Length=4536
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg476563 jgi|Araly1|476563|fgenesh2_kg.2__1693__AT1G74260.1 7432 0.0
> Ahg476563 jgi|Araly1|476563|fgenesh2_kg.2__1693__AT1G74260.1
Length=4544
Score = 7432 bits (4024), Expect = 0.0
Identities = 4379/4551 (96%), Gaps = 22/4551 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGAAGAGAGACCAGACAAGAACTCTGTGTCGACTGCCGTACTCTCGGAGTCGGAGCTTC 60
|||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GAGAGGAGAGACCAGACAAGAACTGTGTGTCGACTGCCGTACTCTCGGAGTCGGAGCTTC 60
Query 61 GGTCCCGTTAAGACAGTAACAGAGAAAAACCCTAAACC-CTCTTTTCACTTTGTTTGCTG 119
||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 61 GGTCCCGTTAAGACAGTAAAACAGAAAAACCCTAAACCGCT-TTTTCACTTTGTTTGCTG 119
Query 120 TTCCGGTCATATCTCGCGACGATGAATACCTCCCAAGCAACTCGTGCGGCTCTGTTTCTA 179
|||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 120 TTCCTGTCATCTCTGGCGACGATGAATACCTCCCAAGCAACTCGTGCGGCTCTGTTCCTA 179
Query 180 AACGGTTCCAATAGACAAGCGATGCTTTTGC----A-G-C-G-G-AGCTCAATGAGTCAA 230
|||||||||||||||||||| |||||||||| | | | | | ||||||| ||||||
Sbjct 180 AACGGTTCCAATAGACAAGCAATGCTTTTGCAGAGATGCCAGAGAAGCTCAACAAGTCAA 239
Query 231 TTGTGGGGTTCTGTTAGAATGAGAACTTCACGGCTGTCTCTGAATCGAACAAAAGCTGTT 290
||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |
Sbjct 240 TTGTGGGGTTCTGTTGGAATGAGAACTTCACGGTTGTCTCTGAATCGAACTAAAGCTGCT 299
Query 291 AGCTTGAGATGTTCTGCTCAACCTAATAAACCTAAAGCAGCTGTTTCTACTGGTTCTTTT 350
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 AGCTTGAGATGTTCTGCTCAACCTAATAAGCCGAAAGCAGCTGTTTCTACTGGTTCTTTT 359
Query 351 GTTACTGCTGATGAGCTACCAAGCTTGGTTGAGAAACCTGCTGCTGAGGTTATCCATTTT 410
||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 GTTTCTGCTGATGAGCTACCGAGCTTGGTTGAGAAACCTGCTGCTGAGGTTATCCATTTC 419
Query 411 TATCGCGTGCCTTTGATTCAAGAAAGCGCGAACGCGGAACTCCTCAAGGCTGTTCAAACC 470
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 420 TATCGCGTGCCTTTGATTCAAGAAAGTGCAAACGCGGAACTCCTCAAGGCGGTTCAAACC 479
Query 471 AAAATCAGCAACCAGATTGTCAGTTTGACTACAGAACAGTCTTTCAATATTGGGCTTGAA 530
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 480 AAAATCGGCAACCAGATTGTCTGTTTGACCACAGAACAGTGTTTCAATATCGGGCTTGAA 539
Query 531 TCCAAGTTAAAAGATGAAAAACTTTCTGTTCTAAAGTGGATTCTTCAAGAAACATATGAG 590
|||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 TCCAAGTTAAAAGACGAAAAGCTTTCTGTTCTGAAGTGGATTCTTCAAGAAACATATGAG 599
Query 591 CCAGAGAATTTAGGTACGGATAGTTTTCTTGAGAGGAAGAAGCAAGAAGGACTCCATGCT 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 CCAGAGAATTTAGGTACGGATAGTTTTCTTGAGAGGAAGAAGCAAGAAGGACTCCATGCT 659
Query 651 GTTATTGTTGAAGTTGGCCCCAGATTGTCTTTCACAACAGCATGGTCCACCAATGCGGTT 710
|| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 GTAATTGTTGAAGTTGGTCCCAGATTGTCTTTTACAACAGCATGGTCCACCAATGCGGTT 719
Query 711 TCGATATGTAGAGCATGTGGGTTAGACGAGGTGACTCGCTTGGAAAGGTCAAGGAGGTAC 770
|||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||
Sbjct 720 TCGATATGTAAAGCATGTGGGTTAAACGAGGTGACTCGCTTAGAAAGGTCGAGGAGATAT 779
Query 771 CTTTTGTTCAGCAAGGAGCCACTTTTGGAAAATCAGATAAAAGAATTTGCTGCAATGGTT 830
||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 780 CTTTTGTTCAGCAAGGAGCCACTGTTAGAAAATCAAATAAAGGAATTTGCTGCAATGGTT 839
Query 831 CATGATAGAATGACCGAGTGCGTGTACACTCAAAAGCTGGTTTCATTCGAGACGAATGTG 890
|| || |||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 840 CACGACAGAATGACCGAGTGTGTGTACTCCCAAAGGCTGGTTTCATTTGAGACAAATGTG 899
Query 891 GTTCCAGAAGAAGTGAAGTATGTGCCTGTGATGGAGAAGGGTCGGAAGGCGCTGGAAGAA 950
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 GTTCCAGAGGAAGTAAAGTATGTGCCTGTGATGGAGAAGGGTCGGAAGGCGCTGGAAGAA 959
Query 951 ATCAACCAGGAGATGGGTTTAGCCTTTGATGAGCAAGATTTGCAGTATTATACTAGACTT 1010
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 ATCAACCAGGAGATGGGTTTAGCCTTTGATGAGCAAGATTTGCAGTATTATACTAGACTT 1019
Query 1011 TTCAGAGAGGACATTAAGCGTGATCCTACCAATGTGGAGCTATTTGATATCGCTCAATCC 1070
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1020 TTCAGAGAGGACATTCAGCGTGATCCTACCAATGTGGAGCTATTTGATATCGCCCAATCC 1079
Query 1071 AACAGCGAGCACAGTCGACACTGGTTCTTTGCTGGGAACATGGTTATTGATGGAAAGCCA 1130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 AACAGCGAGCACAGTCGACACTGGTTCTTTGCTGGGAACATGGTTATTGATGGAAAGCCA 1139
Query 1131 ATGGATAAGTCTCTTATGCAGATTGTAAAGAGCACTTGGGAGGCAAATCGAAATAATTCT 1190
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 ATGGATAGGTCTCTTATGCAGATTGTAAAGAGCACTTGGGAGGCAAATCGAAATAATTCT 1199
Query 1191 GTCATTGGGTTTAAGGATAACTCTAGTGCTATTAGAGGCTTTCTGGTGAACCAGCTACGG 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 GTCATTGGGTTTAAGGATAACTCTAGTGCTATTAGAGGCTTTCTGGTGAACCAGCTACGG 1259
Query 1251 CCTCTACTTCCTGGTTCTGTGTGCTTACTTGATGTCAGTGCACGTGATCTCGACATATTG 1310
|||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 CCTCTACTCCCTGGTTCTGTGTGCCTACTTGATGTCAGTGCACGTGATCTCGACATATTG 1319
Query 1311 TTCACTGCTGAAACCCATAATTTCCCTTGTGCTGTGGCTCCTTATCCTGGTGCTGAGACA 1370
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 TTTACTGCTGAGACCCATAATTTCCCTTGTGCTGTGGCTCCTTATCCTGGTGCTGAGACA 1379
Query 1371 GGTGCTGGAGGTCGAATCAGAGATACACATGCAACAGGAAGAGGTTCTTTTGTGGTTGCA 1430
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 GGTGCTGGAGGTCGAATCAGGGATACACATGCAACAGGAAGAGGTTCTTTTGTGGTTGCA 1439
Query 1431 TCCACTTCTGGTTACTGTGTTGGTAACCTTAACATGGAGGGATCTTATGCTCCATGGGAA 1490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 TCCACTTCTGGTTACTGTGTTGGTAACCTTAACATGGAGGGATCTTATGCTCCATGGGAA 1499
Query 1491 GACTCGTCTTTCCAATACCCATCGAACCTAGCATCACCTCTACAGATACTCATCGACGCT 1550
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 GACTCGTCTTTCCAATACCCATCGAACCTAGCGTCACCTCTACAGATACTCATCGACGCT 1559
Query 1551 AGTAATGGTGCATCTGACTATGGTAACAAATTTGGAGAGCCCATGATTCAGGGATATACT 1610
||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1560 AGTAATGGTGCGTCTGACTATGGGAACAAATTCGGAGAGCCCATGATTCAGGGATATACC 1619
Query 1611 AGGACTTTTGGAATGAGACTGCCAAGTGGGGATAGACGAGAATGGTTGAAGCCGATTATG 1670
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 AGGACTTTTGGAATGAGACTTCCAAGTGGGGATAGACGAGAATGGTTGAAGCCGATTATG 1679
Query 1671 TTCAGTGCAGGGATTGGACAGATTGATCATACTCATATAACTAAAGGGGAGCCAGAGGTT 1730
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 TTCAGTGCAGGGATTGGACAGATTGATCATACTCATATAACTAAAGGGGAGCCAGAGGTT 1739
Query 1731 GGGATGCTTGTTGTTAAGATTGGTGGACCTGCTTACCGCATTGGCATGGGAGGAGGAGCA 1790
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1740 GGGATGCTTGTTGTTAAGATTGGTGGACCTGCTTACCGCATTGGCATGGGAGGAGGAGCA 1799
Query 1791 GCTTCGAGTATGGTTAGTGGCCAGAATGATGCAGAGCTTGATTTCAATGCTGTGCAACGT 1850
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1800 GCTTCGAGTATGGTTAGTGGTCAGAATGATGCAGAGCTTGATTTCAATGCTGTGCAACGT 1859
Query 1851 GGAGATGCTGAAATGTCTCAGAAGTTGTACCGTGTTGTTCGTGCTTGTATTGAGATGGGT 1910
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1860 GGAGATGCTGAGATGTCTCAGAAGTTGTACCGTGTTGTCCGTGCTTGTATTGAGATGGGT 1919
Query 1911 GAGAAGAATCCTATTATCAGCATTCATGATCAAGGTGCTGGTGGAAACTGCAATGTTGTC 1970
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1920 GAGAAGAATCCCATTATCAGCATTCATGATCAAGGTGCTGGTGGAAACTGCAATGTTGTC 1979
Query 1971 AAGGAAATTATTTATCCACAGGGTGCAGAGATTGACATAAGAGCGGTTGTTGTGGGTGAT 2030
|| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1980 AAAGAGATTATTTATCCACAGGGTGCAGAGATCGACATAAGAGCGGTTGTTGTGGGTGAT 2039
Query 2031 CATACTATGTCGGTGTTGGAGATATGGGGAGCAGAATATCAAGAGCAAGATGCGATTTTG 2090
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2040 CATACTATGTCGGTGTTGGAGATTTGGGGAGCAGAATATCAAGAGCAAGATGCGATTTTG 2099
Query 2091 GTGAAAGCTGAGAGCCGGGAGATTTTGCAATCAATCTGTAAGAGGGAAAGGCTTTCGATG 2150
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2100 GTGAAAGCTGAGAGTCGGGAGATTTTGCAATCGATCTGTAAGAGGGAAAGGCTTTCGATG 2159
Query 2151 GCTGTGATTGGAACAATTAATGGGGGTGGTCGCTGTACTTTAATTGACAGCACAGCTGCA 2210
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2160 GCTGTGATTGGAACAATTAATGGGGGAGGTCGCTGTACTTTAATTGACAGCACAGCTGCA 2219
Query 2211 GCGAAGTGCAGTAAAGAAGGGCTACCTCCACCTCCACCTGCTGTGGATCTTGAACTCGAG 2270
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 GCGAAGTGCAGTAAAGAAGGGCTACCTCCACCTCCACCTGCTGTGGATCTTGAACTCGAG 2279
Query 2271 AAGGTTCTTGGTGATATGCCTAAGAAGACGTTTAAGTTCAACCGCATTGCTTATGCACGG 2330
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2280 AAGGTTCTTGGTGATATGCCTAAGAAGACGTTTGAGTTCAACCGCATTGCTTATGCACGG 2339
Query 2331 GAGCCACTTGATATTGCTCCTGGAATTACATTGATGGATGCTTTGAAAA-GAGT-TCTCC 2388
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || | | | |
Sbjct 2340 GAGCCACTTGATATTGCTCCTGGTATTACATTGATGGATTCTTTGAAAAGGA-TGT-TGC 2397
Query 2389 GATTACCATCAGTTTCTTC-AAAGCGGTTCTTGACAACCAAAGTGGATAGATGTGTGACA 2447
||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2398 GATTACCATCAGTTTCTTCGAAA-CGGTTCTTGACAACCAAAGTGGATAGATGTGTGACA 2456
Query 2448 GGTCTTGTTGCTCAGCAACAAACAGTTGGGCCATTGCAGATCACGCTTGCTGATGTTGCA 2507
||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2457 GGTCTTGTTGCCCAGCAGCAAACAGTTGGACCATTGCAGATCACACTTGCTGATGTTGCA 2516
Query 2508 GTTATTGCACAGACATTCACAGATCTAACAGGTGGTGCATGTGCCATTGGTGAGCAACCG 2567
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||
Sbjct 2517 GTTATTGCACAGACATTCACAGATATAACAGGTGGTGCGTGTGCTATTGGCGAGCAACCG 2576
Query 2568 ATCAAAGGCTTGCTTGATCCAAAAGCCATGGCTAGGCTAGCTGTTGGAGAGGCTTTGACA 2627
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2577 ATCAAAGGCTTGCTTGATCCAAAAGCCATGGCTAGACTAGCTGTTGGAGAGGCTTTGACA 2636
Query 2628 AATCTGGTTTGGGCAAAGGTCACTGCACTTTCTGATGTTAAAGCTAGTGGTAACTGGATG 2687
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2637 AATCTGGTTTGGGCAAAGGTCACTGCACTTTCTGATGTTAAAGCCAGTGGTAACTGGATG 2696
Query 2688 TATGCTGCCAAGCTTGAAGGAGAAGGATCAGCAATGTATGATGCTGCGATTGCTCTATCT 2747
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2697 TATGCTGCCAAGCTTGAAGGAGAAGGATCAGCGATGTATGATGCTGCGATTGCTCTATCT 2756
Query 2748 GAAGCGATGATTGAACTTGGCATTGCAATTGATGGTGGAAAAGACAGTCTTTCAATGGCA 2807
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2757 GAAGCGATGATTGAACTTGGCATTGCAATTGATGGTGGAAAAGACAGTCTTTCAATGGCA 2816
Query 2808 GCTCATGCGGACGGTGAGGTTGTTAAAGCTCCAGGAAATCTTGTGATTAGTGCCTATGTT 2867
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2817 GCTCATGCAGACGGTGAGGTTGTTAAAGCTCCAGGAAATCTTGTGATTAGTGCCTATGTT 2876
Query 2868 ACCTGTCCAGACATAACAAAGACAGTGACTCCGGATCTAAAGCTCGGAGGTGATGATGGT 2927
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2877 ACATGTCCAGACATAACAAAGACAGTGACTCCGGATCTAAAGCTAGGAGGTGATGATGGT 2936
Query 2928 ATTCTCTTGCATGTTGATTTGGCAAAGGGAAAGAGGAGATTGGGTGGATCTGCACTGGCT 2987
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2937 ATTCTCTTGCATGTTGATTTGGCAAAGGGAAAGCGGAGATTAGGTGGATCTGCACTGGCT 2996
Query 2988 CAGGTTTTTGGTCAGATAGGAAATGACTGTCCTGATCTTGATGATGTTCCATATCTGAAA 3047
|||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2997 CAGGTTTTCGGTCAGATTGGAAACGACTGTCCTGATCTTGATGATGTTCCATATCTGAAA 3056
Query 3048 AACGTTTTCGATGGCGTTCAAGCTCTCATTGCAGAAAACTTGGTATCTGCTGGACACGAC 3107
||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3057 AACGTTTTCGAGGGCATTCAAGCTCTCATTGCAGAAAACTTGGTATCTGCTGGACATGAC 3116
Query 3108 ATCAGTGATGGTGGACTGGTAGTAACAGCTTTGGAAATGGCTTTTGCTGGAAACAAAGGT 3167
||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3117 ATCAGTGATGGTGGACTAGTTGTAACAGCTTTGGAAATGGCTTTTGCGGGAAACAAAGGT 3176
Query 3168 ATAAATCTCGACTTGGCTTCAAATGGAATTAGCCTTTTTGAGACTTTGTTTTCTGAAGAA 3227
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3177 ATAAATCTCGACTTGGCTTCGAATGGAATTAGCCTTTTTGAGACTTTGTTTTCTGAAGAA 3236
Query 3228 CTTGGTCTCGTGCTTGAGATTAGTAAGACAAACCTGGACGCTGTGATGGAAAAACTCCGT 3287
|||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3237 CTTGGTCTCGTGATGGAGATTAGTAAGACAAACTTAGACGCTGTGATGGAAAAACTCTGT 3296
Query 3288 GCTTTCGATGTTACTGCTGAGATCATTGGAAATGTCACTGATTCGCCTCTGATAGAGGTA 3347
| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3297 GGTTTCAATGTTACTGCTGAGATCATTGGAAATGTCACTGATTCGCCTATGATAGAGGTA 3356
Query 3348 AAAGTGGATGGGATTACTCATTTGAGTGAGAAAACTTCATTCCTCAGAGACATGTGGGAA 3407
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3357 AAAGTGGATGGGATTACTCATTTGAGTGAGAAAACTTCATTCCTAAGAGACATGTGGGAA 3416
Query 3408 GACACCAGTTTCCAGTTGGAAAAGCTGCAACGATTGGCATCTTGTGTAGAGATGGAGAAA 3467
||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3417 GACACCAGTTTCCAGCTAGAAAAGCTGCAAAGATTGGCATCTTGTGTAGAGATGGAGAAA 3476
Query 3468 GAAGGTTTGAAGTTTAGGCATGAGCCTAATTGGAAACTCTCATTTATTCCATCCTCGACC 3527
|| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 3477 GACGGTTTGAAGTTTAGGCATGAGCCTACTTGGAAACTCTCATTTACTCCTTCCTCGACC 3536
Query 3528 AACAATAATTATATGTCTCAGGATGTTAAGCCAAAAGTAGCAGTGATCCGAGAAGAAGGC 3587
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3537 AACAATAAATATATGTCTCAAGATGTTAAGCCAAAAGTAGCAGTGATCCGAGAGGAAGGC 3596
Query 3588 AGCAATGGAGACAGAGAAATGTCAGCTGCATTTTACGCTGCCGGTTTTGAACCTTGGGAC 3647
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3597 AGCAATGGAGACAGAGAAATGTCAGCTGCATTTTATGCTGCCGGTTTTGAACCTTGGGAC 3656
Query 3648 GTGACAGTGTCTGATCTTCTAGCTGGAGACATCACCCTTGATCAGTTCCGCGGTATTGTG 3707
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3657 GTGACAGTGTCTGATCTTCTAGCCGGAGATATCACCCTTGACCAGTTCCGCGGTATTGTG 3716
Query 3708 TTTGTGGGAGGGTTCAGTTATGCGGATGTTCTCGACTCAGCCAAAGGATGGGCTGCTTCA 3767
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3717 TTTGTGGGAGGGTTCAGTTATGCAGATGTTCTCGACTCAGCCAAAGGATGGGCTGCTTCA 3776
Query 3768 ATAAGGTTCAACGAGCCTGTGTTGAGTCAATTTCAGGAGTTCTACAAAAGACCAGACACG 3827
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3777 ATAAGGTTCAATGAGCCTGTGTTGAGTCAATTTCAGGAGTTCTACAAAAGACCAGACACG 3836
Query 3828 TTCAGTCTTGGAATCTGCAATGGATGTCAGTTAATGGCTCTGTTAGGATGGGTTCCAGGT 3887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3837 TTCAGTCTTGGAATCTGCAATGGATGTCAGTTAATGGCTCTGTTAGGATGGGTTCCAGGT 3896
Query 3888 CCTCAAGTTGGCGGGTCACTTGACACCTCGCAGCCGAGGTTTGTTCACAACGAATCAGGA 3947
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3897 CCTCAAGTTGGCGGGTCACTTGACACCTCGCAGCCGAGGTTTGTTCACAACGAATCAGGA 3956
Query 3948 AGGTTTGAGTGCAGGTTCACAAGCGTGACCATAAAGGACTCGCCATCGATAATGCTGAAA 4007
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3957 AGGTTTGAGTGCAGGTTCACAAGCGTGACTATAAAGGACTCGCCATCGATAATGCTGAAA 4016
Query 4008 GGAATGGAGGGAAGTACTTTAGGGGTTTGGGCGGCGCACGGAGAAGGACGGGCTTATTTC 4067
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4017 GGAATGGAGGGAAGTACTTTAGGGGTTTGGGCGGCACACGGAGAAGGTCGGGCTTATTTC 4076
Query 4068 CCGGACGAAGGAGTCTTGGACCATATGCTTCACTCAGATTTGGCACCATTGAGATACTGT 4127
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4077 CCAGACGAAGGAGTCTTGGACCATATGCTTCACTCAGATTTGGCACCATTGAGATACTGT 4136
Query 4128 GATGATGATGGGAACGTGACTGAAGCGTACCCTTTTAACCTCAATGGTTCACCGTTGGGA 4187
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4137 GATGATGATGGGAACGTGACTGAAGCGTACCCTTTTAACCTCAATGGTTCACCGTTGGGA 4196
Query 4188 ATAGCGGCTATATGTTCACCTGATGGGAGACATTTGGCGATGATGCCTCATCCTGAACGT 4247
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4197 ATAGCGGCTATATGTTCACCTGATGGGAGACATTTAGCGATGATGCCTCATCCTGAACGT 4256
Query 4248 TGTTTCTTGATGTGGCAGTTTCCATGGTACCCAACAAGCTGGGACGTTGAGAAAGCTGGC 4307
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4257 TGTTTCTTGATGTGGCAGTTTCCATGGTACCCAACAAGCTGGGACGTTGAGAAAGCTGGG 4316
Query 4308 CCGAGCCCGTGGTTGAAGATGTTCCAGAATGCAAGGGACTGGTTAGAGTCGTGTTAAGCG 4367
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4317 CCGAGTCCGTGGTTGAAGATGTTCCAGAATGCAAGGGACTGGTTAGAGTCATGTTAAGCC 4376
Query 4368 TGtttttttAGTATAATTTTTATCTGCATC-ATTTTGTTGTGCATTTGGTGTTTTGCAGA 4426
||||| || | ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4377 TGTTTCTTAA-TATAATTTTTATCTGCA-CGATTTTATTGTGCATTTGGTGTTTTGCAGA 4434
Query 4427 GTCTTTGAAAGTTGTCGACAAATCATGTGCTTTTTAGTGAGACTTGATGTGTGCTTTTTG 4486
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4435 GTCTTTGAAAGTTGTCGACAAATCATGTGCTTTT-AGTGAGACTTGATGAGTGCTTTTTG 4493
Query 4487 TCCTTCACGTTGTATTCAAACTCTGGAAATT-AAGCATGAGTTACTCTCTT 4536
|||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 4494 TCCTTCACGTTGTATTTAAATTCTGGAAATTTAAGTATGAGTTACTCTCTT 4544
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 171601596657
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5