BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G74750.1
Length=2568
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg476612 jgi|Araly1|476612|fgenesh2_kg.2__1742__AT1G74750.1 3884 0.0
Ahg920834 jgi|Araly1|920834|scaffold_102115.1 1744 0.0
> Ahg476612 jgi|Araly1|476612|fgenesh2_kg.2__1742__AT1G74750.1
Length=2538
Score = 3884 bits (2103), Expect = 0.0
Identities = 2426/2576 (94%), Gaps = 46/2576 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGATTCGTGCAAAGCACATTAGTAATCTTTCTAGCTCAGCAAGATCATTTTTTCTTAGT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 1 ATGATTCGTGCAAAGCACATTAGTAATCTTTCTAGCTCAGCCAGATCCTTTTTTCTTAGT 60
Query 61 GGATCGAGACCGAGTGCTGCTGATGGAAATTCTTGTACATGTGCTGAGGATGAAAGTGGC 120
||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||
Sbjct 61 GGAACGAGACCTAGTGCTGGTGATGGAAATTCTTGTACATGCGCTGAGGATGAAAGTTGC 120
Query 121 GTCTCGAAACGCCAGCAAATTAGGACTGAAGTTGTACAGACTGGTAAA-AGAGCATCTAA 179
||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || ||||||
Sbjct 121 GTCTCAAAACGCCAACAAATTAGGACTGAAGTTGTACAAACTGG-AAAGAAAGTATCTAA 179
Query 180 TTTAGCAGCTGGACTAGCTGGAAGTATATTACCAGTAGAGGCTGGTAAACCGCTGGTGGT 239
| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||
Sbjct 180 TCTAGCAGCTGGACTAGCTGGAAATATATTACCAGTAGAGTCTTGTAAACCGCCGGTGGT 239
Query 240 CCCAAAGACGGTTGAGCATTTCACCCGGCCATCGCTTCTTCCGCAACATGTTTCCTCTCC 299
||| ||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 240 CCCGAAGTCGGTTGAGCATTTCACTCGACCATTGCTTCTTCCGCAGCATGTATCCTCTCC 299
Query 300 TGCTTTGCCAGGGAAAGCAGATTCTGTAAATCATGCTTCTGCTATTATTAAAGAAGACGT 359
||||||||| || | || ||| || | |||||||||||||||||| || ||
Sbjct 300 TGCTTTGCC--GG---G--GA------AAA-CA-GATTCTGCTATTATTAAAGATGATGT 344
Query 360 GGGGGTACCTATTGGTGATCAGATATTCAAGGC------TGGTATTGGAAATGTAAATTT 413
||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 345 GGGGGCACCTATTGGTGATCAGATATTCAAGGCTGGTAATGGTATTGGAACTGTAAATTT 404
Query 414 ATTGTCAGATATAGCAAACTATAAGATCCCTTTATCAGATGGAACTGAAGTTGTTGGTTT 473
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 405 ATTGTCAGATGTAGCAAACTATAAGATCCCTTTATCAGATGGAACTGAAGTTGTCGGTTT 464
Query 474 GCCTAAAAGCTGTATGGTTGATCCTACTCGGCCTATTTCAG-GTGTAAAGTCTTCAAATG 532
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 465 GCCTAAAAGCTGTTTGGTTGATCCTACTCGGCCTATTTC-GAGTGTAAAGTCTTCAAATG 523
Query 533 TGAAAGTCATCAGAAGAGAGCACCTTGCTAAAGTCTATCCTAGGTCCGCTGACCGAGTTC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 524 TGAAAGTCATCAGAAGAGAGCACCTTGCTAAAGTCTACCCTAGGTCCGCAGACCGAGTTG 583
Query 593 CTATAAACAGCTCTCCAGGTACTAAGCAAGCTTCAAATGACGTTGCTGGGAAGTCGTTTG 652
||||||||||||||||| ||| | || | | || | || | | | ||||
Sbjct 584 CTATAAACAGCTCTCCAAGTA-T---TAA-C--C-AA-G-CG-T-C-----A----TTTG 622
Query 653 AAGCTCATGATTTACTCTCTAACAATGTCTCTGGAAAGAGGAAAATCATGCCACAAAGAC 712
||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 623 AAGCTCATGATTTACTCTCAAACACTGCCTCTGGAAAGAGGAAAAGCATGCCACAAAGAA 682
Query 713 CCTATACTGATTCAACCAGGTATGCGTCGGGTGGTTGTGACTATAGTGTGCATTCTTCGG 772
|||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 683 CCTATATTGATTCAACCAGGTATGCATCTGGTGGTTGTGACTATAATGTGCATTCTTCGG 742
Query 773 ATGACAGGACGATAATATCTTCTGTTGAAGGTTTTGGTAAACCCTCAAGGGAAATGATGA 832
||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 743 ATGACAGAACGATAATATCCTCTGTTGAAGGTTTCGGTAAACCCTCAAGGGAAATGATGA 802
Query 833 AAGTGACTCCAAGGACTGCTCCAACACCTAGGCAGCATTGTAACCCTGGATATGTTGTAG 892
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||
Sbjct 803 GAGTGACTCCAGGGACTGCTCCAACACCTAGGCAGTATTGTAACCCTGGATACGTTGTAG 862
Query 893 AAAATGTTTCTAGTATATTGCGGAGATTCAAGTGGGGACATGCTGCCGAAGAGGCCCTTC 952
||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 863 AAAATGTTTCTGGTATATTGCGGAGATTCAAATGGGGACATGCTGCTGAAGAGGCCCTTC 922
Query 953 ACAATTTTGGTTTCAGGATGGATGCATACCAAGCTAATCAAGTTCTTAAGCAGATGGATA 1012
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 923 ACAATTTCGGTTTCAGGATGGATGCATACCAAGCTAATCAAGTTCTTAAGCAGATGGATA 982
Query 1013 ATTATGCGAATGCGCTTGGTTTCTTCTATTGGCTGAAAAGGCAACCTGGGTTCAAGCATG 1072
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 983 ATTATGCGAATGCGCTTGGTTTCTTCTATTGGCTGAAAAGGCAACCTGGGTTTAAGCATG 1042
Query 1073 ATGGGCATACGTATACCACTATGGTAGGTAATCTTGGTCGTGCAAAGCAATTCGGTGAGA 1132
| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1043 ACGGGCATACTTATACCACTATGGTAGGTAATCTTGGTCGTGCAAAGCAATTCGGTGCGA 1102
Query 1133 TAAACAAGCTTCTTGATGAGATGGTTAGGGATGGGTGTAAGCCAAATACTGTTACATATA 1192
|||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1103 TAAACAGGCTTCTTGATGAGATGGTTAAAGATGGATGTAAGCCAAATACTGTTACATATA 1162
Query 1193 ACCGACTCATCCATAGCTACGGGCGTGCAAATTACCTCAAAGAAGCGATGAATGTTTTTA 1252
|||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 1163 ACCGGCTCATCCATAGCTACGGCCGTGCAAATTACCTCAATGAAGCTATGAATGTTTTTA 1222
Query 1253 ATCAGATGCAAGAGGCTGGTTGTGAGCCTGACCGTGTAACTTACTGTACCCTGATAGATA 1312
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1223 AGCAGATGCAAGAGGCTGGTTGTGAGCCTGACCGTGTAACTTACTGTACCCTGATAGACA 1282
Query 1313 TCCATGCTAAAGCTGGATTTCTTGACATTGCCATGGATATGTACCAAAGAATGCAAGAAG 1372
|||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1283 TCCATGCTAAAGCTGGATTTCTGGACATTGCCTTGGACATGTACCAAAGAATGCAAGCAG 1342
Query 1373 CAGGGCTTTCTCCTGATACCTTCACCTACAGTGTTATAATAAACTGTCTTGGAAAAGCGG 1432
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1343 CAGGGCTTTCTCCTGATACTTTCACCTACAGTGTTATAATAAATTGTCTTGGAAAAGCGG 1402
Query 1433 GCCATTTACCTGCTGCCCATAGGCTCTTTTGTGAAATGGTTGGTCAAGGTTGTACTCCTA 1492
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1403 GCCACTTACCTGCTGCCCATAGGCTCTTTTGTGAAATGGTTGGTCAAGGTTGTACCCCTA 1462
Query 1493 ATTTGGTCACATTCAACATCATGATAGCTTTGCATGCCAAGGCGCGGAATTATGAGACTG 1552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1463 ATTTGGTCACATTCAACATCATGATAGCTTTGCATGCCAAGGCGCGGAATTATGAGACTG 1522
Query 1553 CGTTGAAGCTCTACAGAGACATGCAAAATGCCGGGTTTCAACCTGACAAAGTGACCTACA 1612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1523 CGTTGAAGCTCTACAGAGACATGCAAAATGCCGGGTTTCAACCTGACAAAGTGACATACA 1582
Query 1613 GTATTGTTATGGAGGTACTTGGACACTGTGGATTTCTCGAGGAAGCAGAGGGTGTTTTCG 1672
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1583 GTATTGTTATGGAGGTACTTGGACACTGTGGATTTCTCGAGGAAGCAGAGGGTGTTTTTG 1642
Query 1673 CTGAGATGCAACGTAAGAACTGGGTTCCTGATGAACCGGTTTACGGTCTTTTGGTGGACT 1732
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1643 CTGAGATGCAATGTAAGAACTGGGTTCCTGATGAACCGGTTTACGGTCTTTTGGTGGACT 1702
Query 1733 TGTGGGGAAAAGCTGGCAATGTAGATAAAGCTTGGCAGTGGTATCAAGCAATGCTTCAAG 1792
|||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1703 TGTGGGGAAAAGCTGGCAATGTGGAAAAAGCTTGGCAGTGGTATCAAGCAATGCTTCACG 1762
Query 1793 CCGGTCTGCGACCTAATGTTCCCACCTGCAATTCCCTTCTCAGCACTTTCCTTAGGGTCC 1852
||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |
Sbjct 1763 CCGGTCTGCAACCTAATGTTCCCACATGCAATTCCCTTCTCAGCACACTCCTTAGGGTTC 1822
Query 1853 ACAGGATGTCTGAAGCCTATAACTTATTACAAAGCATGCTGGCGCTTGGTCTACATCCTT 1912
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1823 ACAGGATGTCTGAAGCCTATAACTTATTACAAAGCATGCTGGCGCTTGGTCTACATCCTT 1882
Query 1913 CTTTGCAGACATACACATTGCTATTGAGTTGTTGCACAGATGCTCGTTCAAACTTTGACA 1972
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1883 CTTTGCAGACATACACATTGCTATTGAGTTGTTGCACAGATGCTCGTTCAAACTTTGACA 1942
Query 1973 TGGGCTTTTGTGGCCAGCTAATGGCAGTCTCAGGTCATCCGGCTCACATGTTTCTGCTCA 2032
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1943 TGGGCTTTTGTGGCCAGCTAATGGCAGTCTCAGGCCATCCGGCTCACATGTTTCTCCTCA 2002
Query 2033 AAATGCCACCTGCAGGTCCTGATGGCCAAAAAGTGCGTGATCATGTCAGCAACTTCCTTG 2092
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2003 AAATGCCACCTGCAGGTCCTGATGGCCAAAAAGTGCGTGATCATGTCAGCAACTTCCTTG 2062
Query 2093 ATTTTATGCACAGTGAGGACAGAGAGAGCAAGCGAGGACTCATGGACGCAGTAGTGGATT 2152
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2063 ATTTTATGCACAGTGAGGATAGAGAGAGCAAGCGAGGACTCATGGACGCAGTAGTGGATT 2122
Query 2153 TTCTCCACAAGTCAGGTCTAAAAGAAGAGGCTGGCTCGGTATGGGAAGTGGCTGCAGGTA 2212
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2123 TTCTCCACAAGTCAGGTCTAAAAGAAGAGGCTGGTTCGGTATGGGAAGTGGCTGCAGTTA 2182
Query 2213 AGAATGTGTATCCAGATGCATTGAGGGAGAAAAGCTACAGCTATTGGCTTATAAATCTCC 2272
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2183 AGAATGTGTATCCAGATGCATTGAGGGAGAAAAGCTGCAGCTACTGGCTTATAAATCTCC 2242
Query 2273 ATGTAATGTCGGAAGGAACTGCAGTCATCGCACTTTCCAGGACACTTGCATGGTTCCGTA 2332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2243 ATGTAATGTCGGAAGGAACTGCAGTCATCGCACTTTCTAGGACACTTGCATGGTTCCGTA 2302
Query 2333 AGCAGATGTTGGTTTCAGGAGACTGTCCTTCACGGATTGATATAGTAACTGGTTGGGGAA 2392
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2303 AGCAGATGTTGGTTTCAGGAGAATGTCCTTCACGGATTGATATAGTAACTGGTTGGGGAA 2362
Query 2393 GACGAAGTAGAGTCACAGGCACGTCGATGGTTAGACAAGCAGTTGAGGAATTGCTCAACA 2452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2363 GACGAAGTAGAGTCACAGGCACGTCGATGGTTAGACAAGCAGTTGAGGAATTGCTCAACA 2422
Query 2453 TATTCAACTTCCCGTTTTTCACTGAGAACGGGAACTCAGGCTGTTTTGTAGGAAGCGGAG 2512
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2423 TATTCAACTTCCCGTTTTTCACGGAGAACGGGAACTCGGGCTGTTTTGTAGGATGCGGAG 2482
Query 2513 AGCCTCTCAAGAATTGGTTGCTTGAATCATATGTTGAGAGGATGCATTTGCTTTAG 2568
||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2483 AGCCTCTCAAGAAGTGGTTGCTTGAATCATATGTCGAGAGGATGCATTTGCTTTAG 2538
> Ahg920834 jgi|Araly1|920834|scaffold_102115.1
Length=2625
Score = 1744 bits (944), Expect = 0.0
Identities = 1496/1764 (85%), Gaps = 32/1764 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 817 TCAAGGGAAATGATGAAAGTGACTCCAAGGACTGCTCCAACACCTAGGCAGCATTGTAA- 875
|||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||| | |||||| |||| ||
Sbjct 853 TCAATGGAAATGGTGAAAGGGCCTCCAGGGACTGCTCTGACATCAAGGCAGTATTGCAAT 912
Query 876 CCCTGGATATGTTGTAGAAAATGTTTCTAGTATATTGCGGAGATTCAAG-TGGGGACATG 934
|| ||||| | || ||||||||||| || | ||||| |||||| || ||||| | ||
Sbjct 913 TCC-GGATACATAGTGGAAAATGTTTCCAGCGTTTTGCGAAGATTC-AGATGGGGCCCTG 970
Query 935 CTGCCGAAGAGGCCCTTCACAATTTTGGTTTCAGGATGGATGCATACCAAGCTAATCAAG 994
||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||
Sbjct 971 CTGCCGAAGAGGCCCTTCAAAATCTCGGTTTGAGGATCGATGCATACCAAGCAAACCAAG 1030
Query 995 TTCTTAAGCAGATGGATAATTATGCG-AATGCGCTTGGTTTCTTCTATTGGCTGAAAAGG 1053
||||||| |||||| || | |||| | ||||| |||||||||||||| ||| | ||||||
Sbjct 1031 TTCTTAAACAGATGAATGACTATG-GAAATGCTCTTGGTTTCTTCTACTGGTTAAAAAGG 1089
Query 1054 CAACCTGGGTTCAAGCATGATGGGCATACGTATACCACTATGGTAGGTAATCTTGGTCGT 1113
||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 1090 CAACCTGGGTTTAAGCATGATGGGCATACTTATACCACTATGGTGGGTAATCTCGGTCGT 1149
Query 1114 GCAAAGCAATTCGGTG-AGATAAACAAGCTTCTTGATGAGATGGTTAGGGATGGGTGTAA 1172
|| |||||||| |||| | ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||| |
Sbjct 1150 GCTAAGCAATTTGGTGCA-ATAAACAAGCTCCTCGATGAGATGGTCAGAGACGGATGTCA 1208
Query 1173 GCCAAATACTGTTACATATAACCGACTCATCCATAGCTACGGGCGTGCAAATTACCTCAA 1232
|||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||| ||
Sbjct 1209 GCCAAACACAGTTACATATAATCGACTTATCCATAGCTATGGCCGCGCCAATTACCTGAA 1268
Query 1233 AGAAGCGATGAATGTTTTTAATCAGATGCAAGAGGCTGGTTGTGAGCCTGACCGTGTAAC 1292
||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||
Sbjct 1269 CGAAGCTATGAACGTGTTCAATCAAATGCAAGAGGCTGGATGCAAACCTGACCGTGTAAC 1328
Query 1293 TTACTGTACCCTGATAGATATCCATGCTAAAGCTGGATTTCTTGACATTGCCATGGATAT 1352
|||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 1329 TTACTGTACCCTTATAGACATTCATGCTAAAGCTGGATTTCTAGATATTGCCATGGATAT 1388
Query 1353 GTACCAAAGAATGCAAGAAGCAGGGCTTTCTCCTGATACCTTCACCTACAGTGTTATAAT 1412
|||||| |||||||||| || ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||
Sbjct 1389 GTACCAGAGAATGCAAGCAGGAGGTCTTTCTCCGGATACTTTCACTTACAGTGTCATAAT 1448
Query 1413 AAACTGTCTTGGAAAAGCGGGCCATTTACCTGCTGCCCATAGGCTCTTTTGTGAAATGGT 1472
|||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || | |||||||||||| |||||
Sbjct 1449 AAACTGTCTTGGAAAAGCTGGACATTTACCCGCTGCACACAAGCTCTTTTGTGAGATGGT 1508
Query 1473 TGGTCAAGGTTGTACTCCTAATTTGGTCACATTCAACATCATGATAG-CTTTGCATGCCA 1531
|| ||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||
Sbjct 1509 TGATCAGGGTTGTACCCCTAACTTGGTCACATACAACATCATGATGGAC-TTGCATGCCA 1567
Query 1532 AGGCGCGGAATTATGAGACTGCGTTGAAGCTCTACAGAGACATGCAAAATGCCGGGTTTC 1591
| ||| | || ||| ||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||
Sbjct 1568 AAGCGAGAAACTATCAGAGTGCGTTGAAGCTTTACCGTGACATGCAAAATGCTGGGTTTG 1627
Query 1592 AACCTGACAAAGTGACCTACAGTATTGTTATGGAGGTACTTGGACACTGTGGATTTCTCG 1651
| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||
Sbjct 1628 AGCCTGACAAAGTGACATACAGCATTGTGATGGAGGTGCTTGGACACTGTGGATATCTCG 1687
Query 1652 AGGAAGCAGAGGGTGTTTTCGCTGAGATGCAAC-GTAAGAACTGGGTTCCTGATGAACCG 1710
|||||||||||| ||||||| | |||||||| | | ||||||||| |||||||||| ||
Sbjct 1688 AGGAAGCAGAGGCTGTTTTCACCGAGATGCAGCAG-AAGAACTGGATTCCTGATGAGCCA 1746
Query 1711 GTTTACGGTCTTTTGGTGGACTTGTGGGGAAAAGCTGGCAATGTAGATAAA-GCTTGGCA 1769
||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||| || |||||
Sbjct 1747 GTTTATGGTCTTTTGGTGGATTTGTGGGGAAAAGCAGGTAATGTGGA-AAAGGCGTGGCA 1805
Query 1770 GTGGTATCAAGCAATGCTTCAAGCCGGTCTGCGACCTAATGTTCCCACCTGCAATTCCCT 1829
|||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 1806 ATGGTATCAGGCAATGCTTCATGCTGGTCTGCTACCTAATGTTCCTACATGCAATTCCCT 1865
Query 1830 TCTCAGCACTTTCCTTAGGGTCCACAGGAT-GTCTGAAGCCTATAACTTATTACAAAGCA 1888
|| || || ||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||| | |||||||||| ||
Sbjct 1866 CCTTAGTACCTTCCTTAGGGTTAACAAGATAG-CTGAAGCTTATGAGTTATTACAAAACA 1924
Query 1889 TGCTGGCGCTTGGTCTACATCCTTCTTTGCAGACATACACATTGCTATTGAGTTGTTGCA 1948
||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||
Sbjct 1925 TGCTGGCACTTGGTCTACGCCCCTCTTTGCAGACATACACGTTACTCTTGAGCTGTTGCA 1984
Query 1949 CAGATGCTCGTTC-AAACTTTGACATGGGCTTTTGTGGCCAGCTAATGGC-AGTCTCAGG 2006
|||||| ||| || |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || | ||||
Sbjct 1985 CAGATGGTCGATCAAAAC-TTGACATGGGTTTTTGTGGCCAGCTGATGGCAAG-CACAGG 2042
Query 2007 TCATCCGGCTCACATGTTTCTGCTCAAAATGCCACCTGCAGGTCCTGATGGCCAAAAAGT 2066
|||||| || ||||||||||| ||||| |||||| | || ||||| ||||| |||| ||
Sbjct 2043 TCATCCAGCACACATGTTTCTCCTCAAGATGCCAGCAGCGGGTCCAAATGGCGAAAACGT 2102
Query 2067 GCGTGATCATGTC-AGCAACTTCCTTGATTTTATGCACAGTGAGGACAGAGAGAGCAAGC 2125
||| | |||| | | ||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 2103 GCGCAACCATG-CGAACAACTTCCTGGATCTTATGCACAGCGAGGACAGGGAGAGCAAGC 2161
Query 2126 GAGGACTCATGGACGCAGTAGTGGATTTTCTCCACAAGTCAGGTCTAAAAGAAGAGGCTG 2185
|||||||| |||| || || || || ||||| |||||||| || | |||||||||||| |
Sbjct 2162 GAGGACTCGTGGATGCGGTGGTTGACTTTCTACACAAGTCCGGGCAAAAAGAAGAGGCGG 2221
Query 2186 GCTCGGTATGGGAAGTGGCTGCAGGTAAGAATGTGTATCCAGATGCATTGAGGGAGAAAA 2245
| || || |||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||| || ||||||||||
Sbjct 2222 GATCTGTTTGGGAAGTTGCTGCACAAAAGAATGTGTTTCCTGATGCGTTAAGGGAGAAAA 2281
Query 2246 GCTACAGCTATTGGCTTATAAATCTCCATGTAATGTCGGAAGGAACTGCAGTCATCGCAC 2305
||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |
Sbjct 2282 GCTGCAGCTACTGGCTTATCAATCTCCATGTAATGTCAGAGGGAACTGCAGTCACCGCGC 2341
Query 2306 TTTCCAGGACACTTGCATGGTTCCGTAAGCAGATGTTGGTTTCAGGAGACTGT-CCTTCA 2364
| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||| | |||||
Sbjct 2342 TGTCTAGGACTCTTGCTTGGTTCCGTAAGCAGATGTTAGTCTCAGGA-ACTTTCCCTTCT 2400
Query 2365 CGGATTGATATAGTAACTGGTTGGGGAAGACGAAGTAGAGTCACAGGCACGTCGATGGTT 2424
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||
Sbjct 2401 CGGATTGATATAGTAACTGGTTGGGGAAGACGTAGTAGAGTCACCGGCACATCAATGGTG 2460
Query 2425 AGACAAGCAGTTGAGGAA-TTGCTCAACATATTCAACTTC-CCGTTTTTCACTGAGAACG 2482
|||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||||||||||| |||| |
Sbjct 2461 AGACAAGCAGTTGAAGAGCTT-CTCAACATCTTTGG-TTCACCGTTTTTCACGGAGAGTG 2518
Query 2483 GGAACTCAGGCTGTTTTGTAGGAAGCGGAGAGCCTCTCAAGAATTGGTTGCTTGAA-TCA 2541
| ||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||| || |||||||| | | ||
Sbjct 2519 GAAACTCGGGTTGTTTCGTTGGATGCGGAGAGCCTCTCAACAAATGGTTGCT-GCAGTC- 2576
Query 2542 T-ATGTTGAGAGGATGCATTTGCT 2564
| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2577 TCATGTTGAGAGGATGCATTTGCT 2600
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 96825402790
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5