BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT1G74750.1 Length=2568 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg476612 jgi|Araly1|476612|fgenesh2_kg.2__1742__AT1G74750.1 3884 0.0 Ahg920834 jgi|Araly1|920834|scaffold_102115.1 1744 0.0 > Ahg476612 jgi|Araly1|476612|fgenesh2_kg.2__1742__AT1G74750.1 Length=2538 Score = 3884 bits (2103), Expect = 0.0 Identities = 2426/2576 (94%), Gaps = 46/2576 (2%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGATTCGTGCAAAGCACATTAGTAATCTTTCTAGCTCAGCAAGATCATTTTTTCTTAGT 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct 1 ATGATTCGTGCAAAGCACATTAGTAATCTTTCTAGCTCAGCCAGATCCTTTTTTCTTAGT 60 Query 61 GGATCGAGACCGAGTGCTGCTGATGGAAATTCTTGTACATGTGCTGAGGATGAAAGTGGC 120 ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || Sbjct 61 GGAACGAGACCTAGTGCTGGTGATGGAAATTCTTGTACATGCGCTGAGGATGAAAGTTGC 120 Query 121 GTCTCGAAACGCCAGCAAATTAGGACTGAAGTTGTACAGACTGGTAAA-AGAGCATCTAA 179 ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || |||||| Sbjct 121 GTCTCAAAACGCCAACAAATTAGGACTGAAGTTGTACAAACTGG-AAAGAAAGTATCTAA 179 Query 180 TTTAGCAGCTGGACTAGCTGGAAGTATATTACCAGTAGAGGCTGGTAAACCGCTGGTGGT 239 | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||| Sbjct 180 TCTAGCAGCTGGACTAGCTGGAAATATATTACCAGTAGAGTCTTGTAAACCGCCGGTGGT 239 Query 240 CCCAAAGACGGTTGAGCATTTCACCCGGCCATCGCTTCTTCCGCAACATGTTTCCTCTCC 299 ||| ||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct 240 CCCGAAGTCGGTTGAGCATTTCACTCGACCATTGCTTCTTCCGCAGCATGTATCCTCTCC 299 Query 300 TGCTTTGCCAGGGAAAGCAGATTCTGTAAATCATGCTTCTGCTATTATTAAAGAAGACGT 359 ||||||||| || | || ||| || | |||||||||||||||||| || || Sbjct 300 TGCTTTGCC--GG---G--GA------AAA-CA-GATTCTGCTATTATTAAAGATGATGT 344 Query 360 GGGGGTACCTATTGGTGATCAGATATTCAAGGC------TGGTATTGGAAATGTAAATTT 413 ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct 345 GGGGGCACCTATTGGTGATCAGATATTCAAGGCTGGTAATGGTATTGGAACTGTAAATTT 404 Query 414 ATTGTCAGATATAGCAAACTATAAGATCCCTTTATCAGATGGAACTGAAGTTGTTGGTTT 473 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 405 ATTGTCAGATGTAGCAAACTATAAGATCCCTTTATCAGATGGAACTGAAGTTGTCGGTTT 464 Query 474 GCCTAAAAGCTGTATGGTTGATCCTACTCGGCCTATTTCAG-GTGTAAAGTCTTCAAATG 532 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct 465 GCCTAAAAGCTGTTTGGTTGATCCTACTCGGCCTATTTC-GAGTGTAAAGTCTTCAAATG 523 Query 533 TGAAAGTCATCAGAAGAGAGCACCTTGCTAAAGTCTATCCTAGGTCCGCTGACCGAGTTC 592 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct 524 TGAAAGTCATCAGAAGAGAGCACCTTGCTAAAGTCTACCCTAGGTCCGCAGACCGAGTTG 583 Query 593 CTATAAACAGCTCTCCAGGTACTAAGCAAGCTTCAAATGACGTTGCTGGGAAGTCGTTTG 652 ||||||||||||||||| ||| | || | | || | || | | | |||| Sbjct 584 CTATAAACAGCTCTCCAAGTA-T---TAA-C--C-AA-G-CG-T-C-----A----TTTG 622 Query 653 AAGCTCATGATTTACTCTCTAACAATGTCTCTGGAAAGAGGAAAATCATGCCACAAAGAC 712 ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 623 AAGCTCATGATTTACTCTCAAACACTGCCTCTGGAAAGAGGAAAAGCATGCCACAAAGAA 682 Query 713 CCTATACTGATTCAACCAGGTATGCGTCGGGTGGTTGTGACTATAGTGTGCATTCTTCGG 772 |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 683 CCTATATTGATTCAACCAGGTATGCATCTGGTGGTTGTGACTATAATGTGCATTCTTCGG 742 Query 773 ATGACAGGACGATAATATCTTCTGTTGAAGGTTTTGGTAAACCCTCAAGGGAAATGATGA 832 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 743 ATGACAGAACGATAATATCCTCTGTTGAAGGTTTCGGTAAACCCTCAAGGGAAATGATGA 802 Query 833 AAGTGACTCCAAGGACTGCTCCAACACCTAGGCAGCATTGTAACCCTGGATATGTTGTAG 892 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| Sbjct 803 GAGTGACTCCAGGGACTGCTCCAACACCTAGGCAGTATTGTAACCCTGGATACGTTGTAG 862 Query 893 AAAATGTTTCTAGTATATTGCGGAGATTCAAGTGGGGACATGCTGCCGAAGAGGCCCTTC 952 ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 863 AAAATGTTTCTGGTATATTGCGGAGATTCAAATGGGGACATGCTGCTGAAGAGGCCCTTC 922 Query 953 ACAATTTTGGTTTCAGGATGGATGCATACCAAGCTAATCAAGTTCTTAAGCAGATGGATA 1012 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 923 ACAATTTCGGTTTCAGGATGGATGCATACCAAGCTAATCAAGTTCTTAAGCAGATGGATA 982 Query 1013 ATTATGCGAATGCGCTTGGTTTCTTCTATTGGCTGAAAAGGCAACCTGGGTTCAAGCATG 1072 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 983 ATTATGCGAATGCGCTTGGTTTCTTCTATTGGCTGAAAAGGCAACCTGGGTTTAAGCATG 1042 Query 1073 ATGGGCATACGTATACCACTATGGTAGGTAATCTTGGTCGTGCAAAGCAATTCGGTGAGA 1132 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1043 ACGGGCATACTTATACCACTATGGTAGGTAATCTTGGTCGTGCAAAGCAATTCGGTGCGA 1102 Query 1133 TAAACAAGCTTCTTGATGAGATGGTTAGGGATGGGTGTAAGCCAAATACTGTTACATATA 1192 |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1103 TAAACAGGCTTCTTGATGAGATGGTTAAAGATGGATGTAAGCCAAATACTGTTACATATA 1162 Query 1193 ACCGACTCATCCATAGCTACGGGCGTGCAAATTACCTCAAAGAAGCGATGAATGTTTTTA 1252 |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| Sbjct 1163 ACCGGCTCATCCATAGCTACGGCCGTGCAAATTACCTCAATGAAGCTATGAATGTTTTTA 1222 Query 1253 ATCAGATGCAAGAGGCTGGTTGTGAGCCTGACCGTGTAACTTACTGTACCCTGATAGATA 1312 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1223 AGCAGATGCAAGAGGCTGGTTGTGAGCCTGACCGTGTAACTTACTGTACCCTGATAGACA 1282 Query 1313 TCCATGCTAAAGCTGGATTTCTTGACATTGCCATGGATATGTACCAAAGAATGCAAGAAG 1372 |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || Sbjct 1283 TCCATGCTAAAGCTGGATTTCTGGACATTGCCTTGGACATGTACCAAAGAATGCAAGCAG 1342 Query 1373 CAGGGCTTTCTCCTGATACCTTCACCTACAGTGTTATAATAAACTGTCTTGGAAAAGCGG 1432 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1343 CAGGGCTTTCTCCTGATACTTTCACCTACAGTGTTATAATAAATTGTCTTGGAAAAGCGG 1402 Query 1433 GCCATTTACCTGCTGCCCATAGGCTCTTTTGTGAAATGGTTGGTCAAGGTTGTACTCCTA 1492 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1403 GCCACTTACCTGCTGCCCATAGGCTCTTTTGTGAAATGGTTGGTCAAGGTTGTACCCCTA 1462 Query 1493 ATTTGGTCACATTCAACATCATGATAGCTTTGCATGCCAAGGCGCGGAATTATGAGACTG 1552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1463 ATTTGGTCACATTCAACATCATGATAGCTTTGCATGCCAAGGCGCGGAATTATGAGACTG 1522 Query 1553 CGTTGAAGCTCTACAGAGACATGCAAAATGCCGGGTTTCAACCTGACAAAGTGACCTACA 1612 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1523 CGTTGAAGCTCTACAGAGACATGCAAAATGCCGGGTTTCAACCTGACAAAGTGACATACA 1582 Query 1613 GTATTGTTATGGAGGTACTTGGACACTGTGGATTTCTCGAGGAAGCAGAGGGTGTTTTCG 1672 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1583 GTATTGTTATGGAGGTACTTGGACACTGTGGATTTCTCGAGGAAGCAGAGGGTGTTTTTG 1642 Query 1673 CTGAGATGCAACGTAAGAACTGGGTTCCTGATGAACCGGTTTACGGTCTTTTGGTGGACT 1732 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1643 CTGAGATGCAATGTAAGAACTGGGTTCCTGATGAACCGGTTTACGGTCTTTTGGTGGACT 1702 Query 1733 TGTGGGGAAAAGCTGGCAATGTAGATAAAGCTTGGCAGTGGTATCAAGCAATGCTTCAAG 1792 |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1703 TGTGGGGAAAAGCTGGCAATGTGGAAAAAGCTTGGCAGTGGTATCAAGCAATGCTTCACG 1762 Query 1793 CCGGTCTGCGACCTAATGTTCCCACCTGCAATTCCCTTCTCAGCACTTTCCTTAGGGTCC 1852 ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | Sbjct 1763 CCGGTCTGCAACCTAATGTTCCCACATGCAATTCCCTTCTCAGCACACTCCTTAGGGTTC 1822 Query 1853 ACAGGATGTCTGAAGCCTATAACTTATTACAAAGCATGCTGGCGCTTGGTCTACATCCTT 1912 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1823 ACAGGATGTCTGAAGCCTATAACTTATTACAAAGCATGCTGGCGCTTGGTCTACATCCTT 1882 Query 1913 CTTTGCAGACATACACATTGCTATTGAGTTGTTGCACAGATGCTCGTTCAAACTTTGACA 1972 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1883 CTTTGCAGACATACACATTGCTATTGAGTTGTTGCACAGATGCTCGTTCAAACTTTGACA 1942 Query 1973 TGGGCTTTTGTGGCCAGCTAATGGCAGTCTCAGGTCATCCGGCTCACATGTTTCTGCTCA 2032 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1943 TGGGCTTTTGTGGCCAGCTAATGGCAGTCTCAGGCCATCCGGCTCACATGTTTCTCCTCA 2002 Query 2033 AAATGCCACCTGCAGGTCCTGATGGCCAAAAAGTGCGTGATCATGTCAGCAACTTCCTTG 2092 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2003 AAATGCCACCTGCAGGTCCTGATGGCCAAAAAGTGCGTGATCATGTCAGCAACTTCCTTG 2062 Query 2093 ATTTTATGCACAGTGAGGACAGAGAGAGCAAGCGAGGACTCATGGACGCAGTAGTGGATT 2152 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2063 ATTTTATGCACAGTGAGGATAGAGAGAGCAAGCGAGGACTCATGGACGCAGTAGTGGATT 2122 Query 2153 TTCTCCACAAGTCAGGTCTAAAAGAAGAGGCTGGCTCGGTATGGGAAGTGGCTGCAGGTA 2212 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct 2123 TTCTCCACAAGTCAGGTCTAAAAGAAGAGGCTGGTTCGGTATGGGAAGTGGCTGCAGTTA 2182 Query 2213 AGAATGTGTATCCAGATGCATTGAGGGAGAAAAGCTACAGCTATTGGCTTATAAATCTCC 2272 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| Sbjct 2183 AGAATGTGTATCCAGATGCATTGAGGGAGAAAAGCTGCAGCTACTGGCTTATAAATCTCC 2242 Query 2273 ATGTAATGTCGGAAGGAACTGCAGTCATCGCACTTTCCAGGACACTTGCATGGTTCCGTA 2332 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2243 ATGTAATGTCGGAAGGAACTGCAGTCATCGCACTTTCTAGGACACTTGCATGGTTCCGTA 2302 Query 2333 AGCAGATGTTGGTTTCAGGAGACTGTCCTTCACGGATTGATATAGTAACTGGTTGGGGAA 2392 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2303 AGCAGATGTTGGTTTCAGGAGAATGTCCTTCACGGATTGATATAGTAACTGGTTGGGGAA 2362 Query 2393 GACGAAGTAGAGTCACAGGCACGTCGATGGTTAGACAAGCAGTTGAGGAATTGCTCAACA 2452 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2363 GACGAAGTAGAGTCACAGGCACGTCGATGGTTAGACAAGCAGTTGAGGAATTGCTCAACA 2422 Query 2453 TATTCAACTTCCCGTTTTTCACTGAGAACGGGAACTCAGGCTGTTTTGTAGGAAGCGGAG 2512 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| Sbjct 2423 TATTCAACTTCCCGTTTTTCACGGAGAACGGGAACTCGGGCTGTTTTGTAGGATGCGGAG 2482 Query 2513 AGCCTCTCAAGAATTGGTTGCTTGAATCATATGTTGAGAGGATGCATTTGCTTTAG 2568 ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2483 AGCCTCTCAAGAAGTGGTTGCTTGAATCATATGTCGAGAGGATGCATTTGCTTTAG 2538 > Ahg920834 jgi|Araly1|920834|scaffold_102115.1 Length=2625 Score = 1744 bits (944), Expect = 0.0 Identities = 1496/1764 (85%), Gaps = 32/1764 (2%) Strand=Plus/Plus Query 817 TCAAGGGAAATGATGAAAGTGACTCCAAGGACTGCTCCAACACCTAGGCAGCATTGTAA- 875 |||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||| | |||||| |||| || Sbjct 853 TCAATGGAAATGGTGAAAGGGCCTCCAGGGACTGCTCTGACATCAAGGCAGTATTGCAAT 912 Query 876 CCCTGGATATGTTGTAGAAAATGTTTCTAGTATATTGCGGAGATTCAAG-TGGGGACATG 934 || ||||| | || ||||||||||| || | ||||| |||||| || ||||| | || Sbjct 913 TCC-GGATACATAGTGGAAAATGTTTCCAGCGTTTTGCGAAGATTC-AGATGGGGCCCTG 970 Query 935 CTGCCGAAGAGGCCCTTCACAATTTTGGTTTCAGGATGGATGCATACCAAGCTAATCAAG 994 ||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || |||| Sbjct 971 CTGCCGAAGAGGCCCTTCAAAATCTCGGTTTGAGGATCGATGCATACCAAGCAAACCAAG 1030 Query 995 TTCTTAAGCAGATGGATAATTATGCG-AATGCGCTTGGTTTCTTCTATTGGCTGAAAAGG 1053 ||||||| |||||| || | |||| | ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| Sbjct 1031 TTCTTAAACAGATGAATGACTATG-GAAATGCTCTTGGTTTCTTCTACTGGTTAAAAAGG 1089 Query 1054 CAACCTGGGTTCAAGCATGATGGGCATACGTATACCACTATGGTAGGTAATCTTGGTCGT 1113 ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct 1090 CAACCTGGGTTTAAGCATGATGGGCATACTTATACCACTATGGTGGGTAATCTCGGTCGT 1149 Query 1114 GCAAAGCAATTCGGTG-AGATAAACAAGCTTCTTGATGAGATGGTTAGGGATGGGTGTAA 1172 || |||||||| |||| | ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||| | Sbjct 1150 GCTAAGCAATTTGGTGCA-ATAAACAAGCTCCTCGATGAGATGGTCAGAGACGGATGTCA 1208 Query 1173 GCCAAATACTGTTACATATAACCGACTCATCCATAGCTACGGGCGTGCAAATTACCTCAA 1232 |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||| || Sbjct 1209 GCCAAACACAGTTACATATAATCGACTTATCCATAGCTATGGCCGCGCCAATTACCTGAA 1268 Query 1233 AGAAGCGATGAATGTTTTTAATCAGATGCAAGAGGCTGGTTGTGAGCCTGACCGTGTAAC 1292 ||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||| Sbjct 1269 CGAAGCTATGAACGTGTTCAATCAAATGCAAGAGGCTGGATGCAAACCTGACCGTGTAAC 1328 Query 1293 TTACTGTACCCTGATAGATATCCATGCTAAAGCTGGATTTCTTGACATTGCCATGGATAT 1352 |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct 1329 TTACTGTACCCTTATAGACATTCATGCTAAAGCTGGATTTCTAGATATTGCCATGGATAT 1388 Query 1353 GTACCAAAGAATGCAAGAAGCAGGGCTTTCTCCTGATACCTTCACCTACAGTGTTATAAT 1412 |||||| |||||||||| || ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| Sbjct 1389 GTACCAGAGAATGCAAGCAGGAGGTCTTTCTCCGGATACTTTCACTTACAGTGTCATAAT 1448 Query 1413 AAACTGTCTTGGAAAAGCGGGCCATTTACCTGCTGCCCATAGGCTCTTTTGTGAAATGGT 1472 |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||| Sbjct 1449 AAACTGTCTTGGAAAAGCTGGACATTTACCCGCTGCACACAAGCTCTTTTGTGAGATGGT 1508 Query 1473 TGGTCAAGGTTGTACTCCTAATTTGGTCACATTCAACATCATGATAG-CTTTGCATGCCA 1531 || ||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| | | |||||||||| Sbjct 1509 TGATCAGGGTTGTACCCCTAACTTGGTCACATACAACATCATGATGGAC-TTGCATGCCA 1567 Query 1532 AGGCGCGGAATTATGAGACTGCGTTGAAGCTCTACAGAGACATGCAAAATGCCGGGTTTC 1591 | ||| | || ||| ||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||| Sbjct 1568 AAGCGAGAAACTATCAGAGTGCGTTGAAGCTTTACCGTGACATGCAAAATGCTGGGTTTG 1627 Query 1592 AACCTGACAAAGTGACCTACAGTATTGTTATGGAGGTACTTGGACACTGTGGATTTCTCG 1651 | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| Sbjct 1628 AGCCTGACAAAGTGACATACAGCATTGTGATGGAGGTGCTTGGACACTGTGGATATCTCG 1687 Query 1652 AGGAAGCAGAGGGTGTTTTCGCTGAGATGCAAC-GTAAGAACTGGGTTCCTGATGAACCG 1710 |||||||||||| ||||||| | |||||||| | | ||||||||| |||||||||| || Sbjct 1688 AGGAAGCAGAGGCTGTTTTCACCGAGATGCAGCAG-AAGAACTGGATTCCTGATGAGCCA 1746 Query 1711 GTTTACGGTCTTTTGGTGGACTTGTGGGGAAAAGCTGGCAATGTAGATAAA-GCTTGGCA 1769 ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||| || ||||| Sbjct 1747 GTTTATGGTCTTTTGGTGGATTTGTGGGGAAAAGCAGGTAATGTGGA-AAAGGCGTGGCA 1805 Query 1770 GTGGTATCAAGCAATGCTTCAAGCCGGTCTGCGACCTAATGTTCCCACCTGCAATTCCCT 1829 |||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| Sbjct 1806 ATGGTATCAGGCAATGCTTCATGCTGGTCTGCTACCTAATGTTCCTACATGCAATTCCCT 1865 Query 1830 TCTCAGCACTTTCCTTAGGGTCCACAGGAT-GTCTGAAGCCTATAACTTATTACAAAGCA 1888 || || || ||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||| | |||||||||| || Sbjct 1866 CCTTAGTACCTTCCTTAGGGTTAACAAGATAG-CTGAAGCTTATGAGTTATTACAAAACA 1924 Query 1889 TGCTGGCGCTTGGTCTACATCCTTCTTTGCAGACATACACATTGCTATTGAGTTGTTGCA 1948 ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||| Sbjct 1925 TGCTGGCACTTGGTCTACGCCCCTCTTTGCAGACATACACGTTACTCTTGAGCTGTTGCA 1984 Query 1949 CAGATGCTCGTTC-AAACTTTGACATGGGCTTTTGTGGCCAGCTAATGGC-AGTCTCAGG 2006 |||||| ||| || |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || | |||| Sbjct 1985 CAGATGGTCGATCAAAAC-TTGACATGGGTTTTTGTGGCCAGCTGATGGCAAG-CACAGG 2042 Query 2007 TCATCCGGCTCACATGTTTCTGCTCAAAATGCCACCTGCAGGTCCTGATGGCCAAAAAGT 2066 |||||| || ||||||||||| ||||| |||||| | || ||||| ||||| |||| || Sbjct 2043 TCATCCAGCACACATGTTTCTCCTCAAGATGCCAGCAGCGGGTCCAAATGGCGAAAACGT 2102 Query 2067 GCGTGATCATGTC-AGCAACTTCCTTGATTTTATGCACAGTGAGGACAGAGAGAGCAAGC 2125 ||| | |||| | | ||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct 2103 GCGCAACCATG-CGAACAACTTCCTGGATCTTATGCACAGCGAGGACAGGGAGAGCAAGC 2161 Query 2126 GAGGACTCATGGACGCAGTAGTGGATTTTCTCCACAAGTCAGGTCTAAAAGAAGAGGCTG 2185 |||||||| |||| || || || || ||||| |||||||| || | |||||||||||| | Sbjct 2162 GAGGACTCGTGGATGCGGTGGTTGACTTTCTACACAAGTCCGGGCAAAAAGAAGAGGCGG 2221 Query 2186 GCTCGGTATGGGAAGTGGCTGCAGGTAAGAATGTGTATCCAGATGCATTGAGGGAGAAAA 2245 | || || |||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||| || |||||||||| Sbjct 2222 GATCTGTTTGGGAAGTTGCTGCACAAAAGAATGTGTTTCCTGATGCGTTAAGGGAGAAAA 2281 Query 2246 GCTACAGCTATTGGCTTATAAATCTCCATGTAATGTCGGAAGGAACTGCAGTCATCGCAC 2305 ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| | Sbjct 2282 GCTGCAGCTACTGGCTTATCAATCTCCATGTAATGTCAGAGGGAACTGCAGTCACCGCGC 2341 Query 2306 TTTCCAGGACACTTGCATGGTTCCGTAAGCAGATGTTGGTTTCAGGAGACTGT-CCTTCA 2364 | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||| | ||||| Sbjct 2342 TGTCTAGGACTCTTGCTTGGTTCCGTAAGCAGATGTTAGTCTCAGGA-ACTTTCCCTTCT 2400 Query 2365 CGGATTGATATAGTAACTGGTTGGGGAAGACGAAGTAGAGTCACAGGCACGTCGATGGTT 2424 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| Sbjct 2401 CGGATTGATATAGTAACTGGTTGGGGAAGACGTAGTAGAGTCACCGGCACATCAATGGTG 2460 Query 2425 AGACAAGCAGTTGAGGAA-TTGCTCAACATATTCAACTTC-CCGTTTTTCACTGAGAACG 2482 |||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||||||||||| |||| | Sbjct 2461 AGACAAGCAGTTGAAGAGCTT-CTCAACATCTTTGG-TTCACCGTTTTTCACGGAGAGTG 2518 Query 2483 GGAACTCAGGCTGTTTTGTAGGAAGCGGAGAGCCTCTCAAGAATTGGTTGCTTGAA-TCA 2541 | ||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||| || |||||||| | | || Sbjct 2519 GAAACTCGGGTTGTTTCGTTGGATGCGGAGAGCCTCTCAACAAATGGTTGCT-GCAGTC- 2576 Query 2542 T-ATGTTGAGAGGATGCATTTGCT 2564 | |||||||||||||||||||||| Sbjct 2577 TCATGTTGAGAGGATGCATTTGCT 2600 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 96825402790 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5