BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT1G79350.1 Length=4283 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg477100 jgi|Araly1|477100|fgenesh2_kg.2__2230__AT1G79350.1 6831 0.0 > Ahg477100 jgi|Araly1|477100|fgenesh2_kg.2__2230__AT1G79350.1 Length=4281 Score = 6831 bits (3699), Expect = 0.0 Identities = 4133/4326 (96%), Gaps = 96/4326 (2%) Strand=Plus/Plus Query 9 AAAAAGGGAAGAAAATCTGAAACCaaaaaaaaCGAGAAGGGAGTCGAAGAAGAACCTTTC 68 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1 AAAAAGGGAAGAAAATCTGAAACCAAAAAAAACGAGAAGGGAGTC---GAAGAACCTTTC 57 Query 69 GCGCTCTGACGAAATTCATTACTTACACTGGATTTATACtttttttGTCTT-C-CTCTCT 126 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||| Sbjct 58 GCGCTCTGGCGAAATTCATTACTTACACT-GATTTATAC---TTTTGTCTTCCTCTCTCT 113 Query 127 CAATTATCTCCTTC-AACGCCACAAGATCC-TAAGGCCTCTCACGGATCTCTCTTAAGAT 184 ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||| Sbjct 114 CAATTATCTCC-TCAAACGCCACAAGATCCTTAAGGCCTCGCACGGATCTCTC-TACGAT 171 Query 185 CAATCGCCGCGGCTCATGACGCAGTCGCCTGTTCAACCGCCTCCGCCGCTCCCAGCTCAG 244 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | Sbjct 172 CAATCGCCGCGGCTCATGACGCAGTCGCCTGTTCAACCGCCTCCGCCGCTCCCCGCTCCG 231 Query 245 CCGCATTCCGCCGCCGGAGGTGTAATAAGAGGC-GATGTACAGGTTAGGTGCGCAGGCTG 303 ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 232 CCGCATTCCGCCGGCGGTGGTGTAATAAGA-GCAGATGTACAGGTTAGGTGCGCAGGCTG 290 Query 304 TCGCGTGATTCTGAGGGTGAAAACCGGCGTTGTGGAGTTCTCGTGTCCGACTTGTCAACT 363 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 291 TCGCGTGATTCTGAGGGTGAAGACCGGCGTTGTGGAGTTCTCGTGTCCGACTTGTCAACT 350 Query 364 TCCCCAAATGTTGCCGCCGGAGCTTCTTTCTAGGGCACGGCCGCAGTTTCCGCAGTCTC- 422 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 351 TCCCCAAATGTTGCCGCCGGAGCTTCTTTCTAGGGCACGGCCGCAGTTTCCGCAGTCTCA 410 Query 423 -C-ACAA-CA--A----C-C-ACCACAGCCAATTCAGACGCTTCCGCCACCGATTCAACA 471 | |||| || | | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 411 ACAACAACCACCACCGCCTCAACCGCAGCCGATTCAGACGCTTCCGCCACCGATTCAACA 470 Query 472 GCAGCTTAAGCCTCTTAATCTACCTAGGCCTCCGGTTCCGGCACATGGAATCGATCCGAC 531 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 471 GCAGCTTAAGCCTCTTAATTTACCTAGGCCTCCGGTTCCGGCACATGGAATCGATCCGAC 530 Query 532 GAAGATGCAATTGCCTTGCGCTAACTGTCAGGCTATCCTCAATGTGCCTCATGGACTCAC 591 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 531 GAAGATGCAATTGCCTTGCGCTAACTGTCAAGCTATCCTTAATGTGCCTCATGGACTCAC 590 Query 592 TCGGTTCTCGTGTCCTCAGTGCCATGTCGAGCTCGCTGTTGATGTCTCCAAGCTTAATCG 651 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 591 TCGGTTCTCGTGTCCTCAGTGCCATGTCGAGCTCGCTGTTGATGTCTCCAAGCTTAATCG 650 Query 652 GTCTTTAACTGCTTCTCAATCTCATTCTAATCCTCCTACTCCTGCTGCTCCCACAGTCCC 711 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | || |||| | | || Sbjct 651 GTCTTTAACTGCTCCTCAATCTCATCCTAATCCTCCTACT-C--CTACTCCTGC--T-CC 704 Query 712 GCCTCCGCCTCCTCCCGAAGAAGTCAATGAGGAAGCTATTGAAGTGGAGAGAGAAGAAGA 771 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 705 GCCTCCGCCTCCTCCCGAAGAAGTCAATGAGGAAGCTATTGAAGTGGAGAGAGAAGAAGA 764 Query 772 TGAAGGTGGAACGGCTGGAGAAACGTTTATGGATTATCGTCCCCCAAAACTTTCGATCGG 831 |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct 765 TGAAGGTGGAACCGCAGGAGAAACTTTTATGGATTATCGTCCCCCAAAACTTTCAATTGG 824 Query 832 ACCTCCTCATCCTGATCCAATTGTGGAAACATCATCTCTATCTGCAGTGCAACCCCCAGA 891 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 825 ACCTCCTCATCCTGATCCAATTGTGGAAACATCATCTCTATCTGCAGTGCAACCCCCAGA 884 Query 892 GCCTACTTATGATCTCAAAATCAAGGAAGAGCTTGAAAGGTCAAAGGCTTTATCGTGTTT 951 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 885 GCCCACTTATGATCTCAAAATCAAGGAAGAGCTCGAAAGGTCAAAGGCTTTATCGTGTTT 944 Query 952 GCAGATTGAGACATTAGTTTACGCTTGCCAGAGGCATCTCCAGCACCTTGCTGATGGTAC 1011 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 945 GCAGATTGAGACATTAGTTTACGCTTGTCAGAGGCATCTCCAGCACCTTGCTGATGGTAC 1004 Query 1012 CAGAGCAGGCTTTTTTGTTGGAGATGGTGCTGGTGTGGGCAAAGGGCGAACAATTGCCGG 1071 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1005 CAGAGCAGGCTTTTTTGTTGGAGATGGTGCTGGTGTGGGGAAAGGGCGAACAATTGCCGG 1064 Query 1072 GTTGATTTGGGAAAATTGGAAACATGGAAGGAGGAAAGCTTTGTGGATTTCTATTGGCTC 1131 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1065 GTTGATTTGGGAAAATTGGAAACATGGAAGGAGGAAAGCTTTGTGGATATCTATTGGCTC 1124 Query 1132 AGACTTGAAATATGATGCAAGAAGGGACTTGGATGATGTGGGTGCTACATGCGTTGGAGT 1191 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1125 AGACTTGAAGTATGATGCAAGAAGGGACTTGGATGATGTGGGTGCCACATGCGTTGGAGT 1184 Query 1192 GAATCCTTTGAACAAGCTACCCTATTCTAAGCTTGACTCGAAAAATGTTGGTATTAAAGA 1251 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct 1185 GAATCCTTTGAACAAGCTACCCTATTCTAAGCTTGACTCAAAAAATGTGGGTATTAAAGA 1244 Query 1252 AGGAGTGGTATTCTTGACATACAATAGCCTCATTGCTTCCTCTGAGAAGGGCCGTTCTCG 1311 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1245 AGGAGTGGTATTCTTGACATACAATAGCCTCATTGCTTCCTCTGAGAAGGGCCGTTCTCG 1304 Query 1312 TTTACAGCAGCTTGTTCAATGGTGTGGACCAGAATTTGATGGTCTCTTGATCTTTGATGA 1371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1305 TTTACAGCAGCTTGTTCAATGGTGTGGACCAGAATTTGATGGTCTCTTGATCTTTGATGA 1364 Query 1372 GTGCCATAAAGCGAAAAATTTGGTACCTGAAGCTGGGAGTCAGCCGACACGCATCGGACA 1431 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1365 GTGCCATAAAGCGAAAAATTTGGTACCTGAAGCTGGGAGTCAGCCGACACGCATCGGGCA 1424 Query 1432 GGCAGTTGTTGACATTCAGGATAAGATCCCCCAAGCACGTGTTATTTATTGCTCGGCTAC 1491 ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1425 GGCAGTTGTGGATATTCAGGATAAGATCCCCCAAGCACGTGTTCTTTATTGCTCGGCTAC 1484 Query 1492 TGGGGCATCAGAACCACGAAACATGGGTTATATGGTCAGGCTTGGTCTTTGGGGAGCTGG 1551 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1485 TGGTGCATCAGAACCACGAAACATGGGTTATATGGTCAGGCTTGGTCTTTGGGGAGCTGG 1544 Query 1552 AACAAGTTTTAGTGATTTTAACAAATTCCTAGGTGCCCTTGATAAAGGTGGGACAGGAGC 1611 ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1545 AACAAGTTTCAATGATTTTAACAAATTTCTAGGTGCCCTTGATAAAGGTGGGACAGGAGC 1604 Query 1612 GTTGGAATTGGTTGCCATGGATATGAAAGCGAGGGGGATGTATGTATGCCGAACCCTGAG 1671 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1605 GTTGGAATTGGTTGCCATGGACATGAAAGCGAGGGGGATGTATGTATGCCGAACCCTGAG 1664 Query 1672 TTACAAAGGGGCTGAGTTTGAGATTGTTGAAGCTCGTTTAGAAGCAGGAATGGAGGCAAT 1731 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1665 TTACAAAGGGGCTGAGTTTGAGATTGTTGAAGCTCGTTTAGAAGCAGGAATGGAGGCAAT 1724 Query 1732 GTACAATAAGTCTGCAGAATTTTGGGCAGAGCTACGGATAGAGTTGTTGTCAGCAAGTGC 1791 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1725 GTACAATAAGTCTGCAGAATTTTGGGCAGAGCTACGGATAGAGTTGTTGTCAGCAAGTGC 1784 Query 1792 TTTTCTCCCTAACGAGAAACCAAATTCTAGTCAGTTGTGGAGATTATACTGGTCAAGCCA 1851 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1785 TTTTCTCCCTAACGAGAAACCAAATTCTAGTCAGTTGTGGAGATTATACTGGTCAAGCCA 1844 Query 1852 CCAGCGTTTCTTTAGACACCTGTGTATGTCAGCTAAAGTCCCTGTAACTGTGAGGTTAGC 1911 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1845 CCAGCGTTTCTTTAGACACCTGTGTATGTCAGCTAAAGTCCCTGTAACTGTGAGGTTAGC 1904 Query 1912 TAAGAAAGCCTTGTCAACAAACAAGTGTGTAGTTATTGGCCTTCAGAGTACTGGAGAGGC 1971 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1905 GAAGAAAGCCTTGTCAACAAACAAGTGTGTGGTTATTGGCCTTCAGAGTACTGGAGAGGC 1964 Query 1972 TCGAACCGAAGAGGCTGTAAATAAATATGGTCTTGAGCTTGATGATTTTGTCTCGGGACC 2031 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1965 TCGAACCGAAGAGGCTGTAAATAAATATGGTCTTGAGCTTGATGATTTTGTCTCGGGACC 2024 Query 2032 TCGAGAGCTCTTGTTGAAATTTGTGGAAGAGAATTATCCCTTACCCGAGCAGCCTGAACC 2091 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2025 TCGAGAGCTCTTGTTGAAATTTGTGGAAGAGAATTATCCCTTACCCGAGCAGCCTGAACC 2084 Query 2092 TCTGTCAGAGGATGATAGTGTTAAAGAACTTCAGAGGAAGAGGCATTCAGCTTCACCTGG 2151 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2085 TCTGTCAGAGGATGATAGTGTTAAAGAACTTCAGAGGAAGAGGCATTCAGCTTCACCTGG 2144 Query 2152 TGTTTCAATTAGAGGGAGAGTAAGAAAGATGGCAAAGTGGAAACCAGATAGTGATAATGA 2211 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2145 TGTTTCAATTAGAGGGAGGGTAAGAAAGATGGCAAAGTGGAAACCAGATAGTGATAATGA 2204 Query 2212 AAGTGATTTGGAGTCTGAAG--------C-T-G--A---C-T--CTGCTGAC-GA-T-T- 2249 |||||||||||||||||||| | | | | | | || ||| | || | | Sbjct 2205 AAGTGATTTGGAGTCTGAAGGTTGGTTTCCTAGTGAAAACATGTCTTCTG-CTGACTCTG 2263 Query 2250 CTAATGATTCT---GAT---GATGA-G--TTCCAGATATGTCAGATATGCAGTGGGGAAG 2300 || | |||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2264 CTGACGATTCTAATGATTCTGATGATGAGTTCCAGATATGTCAGATATGCAGTGGGGAAG 2323 Query 2301 ATGAAAGGAAGAAGTTGCTCCATTGTTCTGAATGTGACAAGCTTTTTCATCCGGACTGTG 2360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2324 ATGAAAGGAAGAAGTTGCTCCATTGTTCTGAATGTGACAAGCTTTTTCATCCGGACTGTG 2383 Query 2361 TGGTTCCTCCAGTTATAGACTTACCATCTGAAGCGTGGATTTGCTTTTCTTGTAAGGAAA 2420 ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| Sbjct 2384 TGGTTCCTCCAGTAATAGACTTACCATCGGAAGCGTGGATTTGCTATTCTTGCAAGGAAA 2443 Query 2421 AGACAGAGGAGTACATTCAAGCAAGACGTCTTTACATTGCCGAATTGCAGAAAAGGTATG 2480 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2444 AGACAGAGGAATACATTCAAGCAAGACGTCTTTACATTGCAGAATTGCAGAAAAGGTATG 2503 Query 2481 AAGCAGCGCTTG-AACGAAAATCAAAGATCATAGAGATCATCCGTTCTCTGAATCTTCCA 2539 |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2504 AAGCAGCG-TTGGAACGAAAATCAAAGATCATAGAGATCATCCGTTCTCTGAATCTTCCA 2562 Query 2540 AACAATCCTTTGGATGACATCGTCGATCAGCTTGGAGGCCCTGAAAAAGTTGCAGAAATG 2599 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 2563 AACAATCCTTTGGATGACATTGTCGATCAGCTTGGAGGCCCTGACAAAGTTGCAGAAATA 2622 Query 2600 ACGGGCAGGCGAGGTATGCTTGTAAGAGCATCGAATGGGAAAGGTGTTACATATCAAGCA 2659 || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2623 ACAGGCAGGCGAGGTATGCTTGTAAGAGCATCTAATGGGAAAGGTGTTACATATCAAGCA 2682 Query 2660 AGAAACACAAAGGATATTACCATGGAAATGGTCAACATGCACGAGAAGCAACTATTTATG 2719 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2683 AGAAACACAAAGGATATTACAATGGAAATGGTCAACATGCACGAGAAGCAACTATTTATG 2742 Query 2720 GATGGTAAAAAGTTGGTTGCCATTATTTCTGAAGCTGGGTCAGCTGGTGTTTCGTTGCAA 2779 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2743 GATGGTAAAAAGTTGGTTGCCATTATTTCTGAGGCTGGGTCAGCTGGTGTTTCGTTGCAA 2802 Query 2780 GCAGATAGAAGGGCAGTAAATCAGAAAAGAAGGGTTCACTTGACTTTAGAGCTTCCCTGG 2839 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2803 GCAGATAGAAGGGCAGTAAATCAGAAAAGAAGGGTTCACTTGACTTTAGAGCTTCCCTGG 2862 Query 2840 AGTGCTGATCGTGCAATTCAGCAATTTGGAAGAACTCACCGGTCAAATCAGACATCTGCA 2899 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct 2863 AGTGCTGATCGTGCAATTCAGCAATTTGGAAGAACTCACCGGTCGAACCAGACATCTGCA 2922 Query 2900 CCTGAATATAGACTACTCTTCACTAATCTCGGTGGGGAACGCCGCTTTGCCTCTATTGTT 2959 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2923 CCTGAATATAGACTACTCTTCACAAATCTCGGTGGGGAACGCCGCTTTGCCTCTATTGTT 2982 Query 2960 GCAAAGAGACTAGAAACACTTGGTGCTTTAACACAGGGAGACCGCAGGGCTGGGCCCTCC 3019 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | Sbjct 2983 GCAAAGAGACTAGAAACACTTGGTGCTTTAACACAGGGAGACCGCAGGAAAGT-CA-TGC 3040 Query 3020 GGGCCTTCTTTGAGTGCGTATAA-TTATGATAGTAACTTTGGTAAAAAATCCTTGATGGT 3078 |||| | | | |||| || || |||| |||| ||||||||||| Sbjct 3041 A--CCTT-TCT---T----ATAACTT-TG---GTAA-------AAAA--TCCTTGATGGT 3077 Query 3079 GATGTATCGAGGCATAATGGAGCAGGAGAAACTACCTGTTCTTCCTCCTGGATGCTCGAT 3138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 3078 GATGTATCGAGGCATAATGGAGCAGGAGAAACTACCTGTTGTTCCTCCTGGATGCTCGAT 3137 Query 3139 TGATGAACCCGAAACAGTTAAAGAGTTTTTGACCAAGGCAAGGGCTGCTCTTGTTGCGGT 3198 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3138 TGATGAACCCGAAACAGTTAAAGAGTTTTTGACCAAGGCAAGGGCTGCTCTTGTTGCGGT 3197 Query 3199 TGGAATTGTTAGGGACAGTGTTCTGGCCAATGGGAAAGATGTTGGAAGGTTTTCAGGACG 3258 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct 3198 TGGAATTGTTAGGGACAGTGTTCTGGCCAATGGGAAAGATGCTGGAAAGTTTTCAGGACG 3257 Query 3259 TATTATTGATTCTGACATGCATGATGTTGGACGATTTTTGAATCGCCTCTTAGGATTGCC 3318 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct 3258 TATTATTGATTCTGACATGCATGATGTTGGACGATTTTTGAATCGGCTCTTGGGATTGCC 3317 Query 3319 ACCTGATATCCAGAATAGGCTGTTTGAATTGTTTACTAGTATATTAGACGTTCTTGTACA 3378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3318 ACCTGATATCCAGAATAGGCTGTTTGAATTGTTTACTAGTATATTAGACGTTCTTGTACA 3377 Query 3379 TAATGCTCGGATAGAAGGAAGTTTTGACTCAGGAATTGTGGATATGAAAGCTAATAGTGT 3438 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3378 TAATGCTCGGATCGAAGGAAGTTTTGACTCAGGAATTGTGGATATGAAAGCTAATAGTGT 3437 Query 3439 TGAGCTACTGAGCACTCCAAAGACCGTCCATGTTGATCAAATGTCTGGTGCCTCAACTAT 3498 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3438 TGAGCTGCTGAGCACTCCAAAGACCGTCCATGTTGATCAAATGTCTGGTGCCTCAACTAT 3497 Query 3499 GCTCTTTACTTTTACTCTAGATCGTGGTGTAACATGGGAGTCTGCGAGTTCAATGCTAGA 3558 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3498 GCTCTTTACTTTTACTTTGGATCGTGGTGTAACATGGGAGTCTGCGAGTTCAATGCTAGA 3557 Query 3559 GGGAAAGAGAAGGGACGGGCTTGGTTCAGCTAATGATGGCTTTTTTGAATCTAAAAGGGA 3618 |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3558 GGGAAAGAGAAGGGACAGCCTTGGTTCAGCTAATGATGGCTTTTTTGAATCTAAAAGGGA 3617 Query 3619 ATGGTTAGGAAGACGGCACTTCATATTAGCATTTGAGAGTGCCGCTTCTGGGTTGTTTAA 3678 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 3618 ATGGTTAGGAAGACGGCACTTCATATTAGCATTTGAGAGTGCGGCTTCTGGGTTGTTTAA 3677 Query 3679 GATTGTACGTCCTGCTGTAGGAGAGTCGATCAGGGAGATGTCTCTTTCAGAGTTGAAAAC 3738 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3678 GATTGTCCGTCCTGCTGTAGGAGAGTCGATCAGGGAGATGTCTCTTTCAGAGTTGAAAAC 3737 Query 3739 TAAATACCGAAAACTATCTTCTCTGGAGAAGGCTCGTACTGGTTGGGAGGACGAGTACGA 3798 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3738 TAAATACCGAAAACTCTCTTCTCTGGAGAAGGCTCGTACTGGTTGGGAGGACGAGTACGA 3797 Query 3799 AGTTTCATCAAAACAGTGTATGCATGGACCCAAGTGTAAGCTTGGGGAGTATTGCACGGT 3858 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct 3798 AGTTTCATCAAAACAGTGTATGCATGGACCCAAGTGTAAGCTAGGCGAGTATTGCACGGT 3857 Query 3859 TGGACGTAGGATACAGGAAGTAAACGTTGTGGGTGGCCTTATTCTTCCCATCTGGGGAAC 3918 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct 3858 TGGACGTAGAATACAGGAAGTAAACGTTGTGGGTGGCCTCATTCTTCCCATTTGGGGAAC 3917 Query 3919 CATCGAGAAAGCTCTCTCCAAACAAGCCCGTCACAGCCACAAGAGAATTCGAGTTATACG 3978 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3918 CATTGAGAAAGCTCTCTCCAAACAAGCCCGTCACAGCCACAAGAGAATTCGAGTTATACG 3977 Query 3979 CATAGAGACTACGACGGATAATCAGCGGATAGTGGGCCTCTCCATCCCAAATGCAGCTGT 4038 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3978 CATAGAGACTACGACGGATAATCAGCGGATAGTGGGCCTCTCCATCCCAAATGCAGCTGT 4037 Query 4039 AGAAACTGTTTTACAAGATTTAGCATGGGTTCAAGAGATTGATGATTAAGACAACGAGTA 4098 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || Sbjct 4038 AGAAACTGTTTTACAAGATTTAGCATGGGTTCAAGAGATCGATGATTAAGACAACGATTA 4097 Query 4099 TTTATAAGAAGCATACACCCTCAAAGCTCCACAATCAAGTTCCCATGCCTATTTTGTATT 4158 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 4098 TTTATAAGAAGCATACACCCTCAAAGCTCCAGAACCAAGTTCCCATGCCTATTT-GTATT 4156 Query 4159 TT-CTTTATTTAAGAAAAAGAGGAAAAAGACACTTGACTTTCATTTTTGTGTATATCACA 4217 || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4157 TTTCTTTATTTAA-AAAAAGAGGAAAAAGACACTTGACTTTCATTTTTGTGTATATCACA 4215 Query 4218 TGACAAATTGGCAAGATGATACATAGATGTAATATTATTTATCTAACAAGATTCATTCTT 4277 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4216 TGACAAATTGGCAAGAAGATACATAGATGTAATATTATTTATCTAACAAGATTCATTCTT 4275 Query 4278 ATGTTC 4283 | |||| Sbjct 4276 ACGTTC 4281 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 161973030688 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5