BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: halleri_transcript_ahg.fa
           32,672 sequences; 38,939,717 total letters



Query= AT1G79920.1

Length=2964
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  Ahg927518 jgi|Araly1|927518|scaffold_203079.1                       3962    0.0  
  Ahg477271 jgi|Araly1|477271|fgenesh2_kg.2__2401__AT1G79920.2        3096    0.0  


> Ahg927518 jgi|Araly1|927518|scaffold_203079.1
Length=2534

 Score = 3962 bits (2145),  Expect = 0.0
 Identities = 2413/2543 (95%), Gaps = 15/2543 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  145   TGAAGAACACAAAGCCTAACAATGAGTGTAGTTGGTTTTGATTTTGGAAACGAGAATTGC  204
             |||| |||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct  2     TGAATAACAC--AGCCTGACAATGAGTGTAGTTGGGTTTGATTTTGGAAACGAGAACTGC  59

Query  205   CTTGTTGCTGTTGCAAGGCAAAGAGGTATCGACGTCGTGCTTAATGATGAGTCAAATCGC  264
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| 
Sbjct  60    CTTGTTGCCGTTGCAAGGCAAAGAGGTATCGACGTCGTGCTTAATGATGAGTCCAATCGT  119

Query  265   GAGACTCCGGCTATCGTTTGCTTTGGTGACAAGCAGCGCTTCATCGGTACTGCTGGAGCT  324
             |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  120   GAGACTCCCGCTATTGTCTGCTTTGGTGACAAGCAGCGCTTCATCGGCACTGCTGGAGCT  179

Query  325   GCTTCTACCATGATGAACCCCAAAAACTCCATCTCACAAATCAAGCGCTTAATTGGTCGC  384
             ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct  180   GCTTCAACCATGATGAACCCCAAAAATTCCATCTCTCAAATCAAACGCTTAATTGGTCGC  239

Query  385   CAGTTTTCCGACCCTGAGCTTCAAAGGGATATCAAATCCCTTCCCTTTTCTGTCACTGAA  444
             |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||
Sbjct  240   CAGTTTTCCGACCCTGAGCTGCAAAGGGATATCAAATCCCTTCCCTTTTCCGTCACCCAA  299

Query  445   GGCCCTGATGGCTATCCTTTGATCCATGCTAATTATTTGGGAGAGATTAGAGCCTTTACC  504
             || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||
Sbjct  300   GGGCCTGATGGCTATCCTTTGATCCATGCTAATTATTTGGGAGAGAAGAGAGCCTTTACC  359

Query  505   CCGACTCAGGTCATGGGTATGATGTTGTCCAACTTGAAAGGTATTGCTGAGAAGAATTTG  564
             |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  360   CCGACTCAAGTCATGGGTATGATGTTGTCTAACTTGAAAGGTATTGCCGAGAAGAATTTG  419

Query  565   AATACAGCTGTGGTCGACTGCTGTATTGGTATTCCTGTTTACTTTACCGACCTCCAGCGT  624
             ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  420   AATGCAGCTGTGGTCGACTGCTGTATTGGTATTCCTGTTTACTTTACCGACCTCCAGCGA  479

Query  625   AGGGCTGTTCTCGATGCTGCCACAATTGCAGGCTTGCATCCCTTGCACTTGATCCATGAG  684
             ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||
Sbjct  480   AGGGCTGTTCTCGATGCAGCCACAATTGCAGGCTTGCATCCCCTGCGCTTGATCCACGAG  539

Query  685   ACTACAGCTACGGCTTTGGCATACGGAATTTATAAGACAGATCTGCCAGAGAATGACCAG  744
             || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||
Sbjct  540   ACAACAGCTACAGCTTTGGCATATGGAATTTATAAGACAGATTTGCCAGAGAATGAACAG  599

Query  745   CTCAATGTTGCATTCATTGACATTGGACACGCAAGCATGCAAGTCTGTATTGCAGGCTTC  804
             ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  600   CTCAACGTCGCTTTCATTGACATTGGGCATGCAAGCATGCAAGTCTGTATTGCAGGCTTC  659

Query  805   AAAAAAGGACAGCTCAAAATCTTGTCTCACGCTTTCGATCGCTCCCTTGGGGGAAGGGAT  864
             |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| 
Sbjct  660   AAAAAAGGGCAGCTCAAAATCTTGTCTCACGCTTTCGATCGCTCGCTTGGGGGAAGGGAC  719

Query  865   TTTGATGAAGTTCTTTTCAATCATTTTGCTGCTAAGTTCAAGGACGAGTACAAGATTGAC  924
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  720   TTTGATGAAGTTCTTTTCAATCATTTTGCTGCTAAGTTCAAAGACGAGTACAAGATTGAC  779

Query  925   GTCTCCCAGAATGCTAAGGCTTCTCTCAGGCTCCGCGCTACATGCGAGAAACTGAAAAAG  984
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||
Sbjct  780   GTCTCCCAGAATGCTAAGGCTTCTCTCAGGCTCCGTGCTGCGTGCGAGAAACTCAAAAAG  839

Query  985   GTTCTAAGCGCTAATCCTATGGCACCATTGAATATCGAGTGTTTGATGG-CTGAGAAAGA  1043
             ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct  840   GTTCTAAGCGCAAATCCTGTGGCACCATTGAATATCGAGTGTTTGATGGAC-GAGAAAGA  898

Query  1044  TGTTAGGGGTGTCATCAAGAGGGAAGAGTTTGAAGAGATCAGCATCCCGATTTTGGAGCG  1103
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  899   TGTTAGGGGTGTCATCAAGAGGGAAGAGTTTGAAGAGATCAGCATCCCGATTCTGGAGCG  958

Query  1104  TGTTAAGAGGCCTTTAGAGAAAGCTCTCTCTGATGCGGGCCTCACTGTTGAAGATGTACA  1163
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  959   TGTTAAGAGGCCTCTAGAGAAAGCTCTCTCTGATGCGGGCCTCACAGTTGAAGATGTACA  1018

Query  1164  TATGGTCGAGGTTGTCGGCTCTGGCTCTCGTGTCCCTGCTATGATCAAGAT-TCTAACTG  1222
             ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||
Sbjct  1019  TATGGTCGAGGTTATTGGCTCTGGCTCTCGTGTCCCTGCTATGATCAAGATAT-TAACTG  1077

Query  1223  AGTTTTTTGGTAAGGAGCCCAGGCGTACAATGAATGCAAGTGAGTGTGTGTCGAGGGGAT  1282
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1078  AGTTTTTTGGTAAGGAGCCCAGGCGTACAATGAATGCAAGTGAGTGTGTGTCGAGGGGAT  1137

Query  1283  GTGCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGTCCGACCTTTAAAGTTCGCGAATTCCAGGTTCATG  1342
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1138  GTGCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGTCCGACCTTTAAAGTTCGCGAATTCCAGGTTCATG  1197

Query  1343  AGAGCTTCCCTTTCTCAATATCGCTTGCTTGGAAAGGAGCAGCGACTGATGCTCAAAATG  1402
             ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||
Sbjct  1198  AGAGCTTTCCTTTCTCAATATCGCTGGCTTGGAAAGGAGCAGCTTCTGATGCTCAAATTG  1257

Query  1403  GAGGCA-CTGAGAACCAGCAGAGCACTATTGTTTTTCCGAAAGGAAATCCTATTCCTAGT  1461
             |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct  1258  GAGG-AGCTGAGAATCAGCAGAGCACCATTGTTTTTCCCAAAGGAAATCCCATTCCTAGT  1316

Query  1462  GTCAAGGCTCTAACATTTTATCGTTCTGGAACATTCTCTATTGATGTGCAGTACAGTGAT  1521
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||
Sbjct  1317  GTCAAGGCTCTAACGTTTTATCGTTCTGGAACATTCTCTGTTGATGTGCAGTATGGTGAT  1376

Query  1522  GTGAACGATTTGCAAGCACCTCCTAAAATCAGCACATACACGATTGGTCCCTTCCAGTCA  1581
             ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  1377  GTGAACGATTTGCAAGCACCTCCGAAAATCAGCACATACACGATTGGTACCTTCCAGTCA  1436

Query  1582  TCAAAAGGCGAGAGGGCAAAGCTGAAAGTGAAAGTTAGATTGAACCTGCATGGAATTGTC  1641
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1437  TCAAAAGGCGAGAGGGCAAAGCTTAAAGTGAAAGTGAGATTGAACCTGCATGGAATTGTC  1496

Query  1642  TCTGTTGAATCAGCAACTCTTTTGGAAGAGGAAGAAGTTGAAGTATC-GGTCACAAAAGA  1700
             || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct  1497  TCAGTTGAATCGGCAACTCTTTTGGAAGAGGAAGAAGTTGAAGT-TCCGGTCACAAAAGA  1555

Query  1701  TCAATCAGAGGAAACTGCTAAGATGGACACTGACAAAGCTTCTGCCGAGGCAGCTCCTGC  1760
             |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1556  TCAATCAGTGGAAACTACTAAGATGGACACTGACAAAGCTTCTGCCGAGGCAGCTCCTGC  1615

Query  1761  TTCTGGTGACTCTGATGTTAACATGCAGGACGCCAAAGATACCAGTGATGCAACTGGTAC  1820
             |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |
Sbjct  1616  TTCTGGTGACTCTGATATTAACATGCAGGACGCCAAGGATACCAGTGATGCAGCTGGTTC  1675

Query  1821  TGACAATGGTGTTCCAGAGTCTGCTGAGAAGCCGGTGCAAATGGAAACTGATTCAAAGGC  1880
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  1676  TGACAATGGTGTTGCAGAGTCTGCTGAGAAGCCGGTGCAAATGGAAACTGATTTAAAGGC  1735

Query  1881  AGAGGCTCCAAAGAAGAAGGTGAAGAAAACAAATGTACCACTGTCAGAATTGGTCTATGG  1940
              |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1736  TGAGGCTCCGAAGAAGAAGGTGAAGAAAACAAATGTACCACTGTCAGAATTGGTCTATGG  1795

Query  1941  TGCCTTGAAAACTGTGGAAGTTGAAAAGGCAGTGGAGAAGGAATTTGAGATGGCTCTGCA  2000
             |||||||||| ||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  1796  TGCCTTGAAATCTGTGGAGGTCGATAAGGCTGTGGAGAAGGAATTTGAGATGGCTTTGCA  1855

Query  2001  AGACAGAGTTATGGAAGAGACCAAGGACCGGAAGAATGCTGTTGAGTCTTATGTTTATGA  2060
             |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1856  AGACAGAGTTATGGAAGAGACCAAGGACCGAAAGAATGCTGTTGAGTCTTATGTTTATGA  1915

Query  2061  TATGCGAAACAAACTGAGTGACAAATACCAGGAATATATCACTGACT-CGGAGAGGGAAG  2119
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||
Sbjct  1916  TATGCGAAACAAATTGAGTGACAAATACCAGGAATATATCACTGA-TGCTGAGAGGGAAG  1974

Query  2120  CATTCCTGGCGAATCTGCAGGAAGTTGAGGATTGGTTGTATGAAGATGGGGAAGATGAGA  2179
             ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1975  CATTCCTGGCGAAGCTGCAGGAAGTGGAGGATTGGTTGTATGAAGATGGGGAAGATGAGA  2034

Query  2180  CCAAAGGTGTTTATGTTGCAAAGCTCGAGGAGCTCAAGAAGGTGGGTGACCCTGTTGAAG  2239
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2035  CCAAAGGTGTTTATGTTGCAAAGCTCGAGGAGCTCAAGAAGGTGGGTGACCCTGTTGAAG  2094

Query  2240  TGCGTTACAAGGAGTCGTTGGAAAGAGGGTCGGTCATTGATCAGCTTGGCTACTGTATTA  2299
             | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  2095  TACGTTACAAAGAGTCGTTGGAAAGAGGGTCGGTCATTGATCAGCTTGGTTACTGTATTA  2154

Query  2300  ACAGCTACAGAGAGGCAGCTGTGTCTAATGATCCCAAGTTTGATCACATTGAATTGGCAG  2359
             |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct  2155  ACAGCTACAGAGAGGCAGCTATGTCTAATGATCCCAAGTTTGACCACATTGAATTGGCTG  2214

Query  2360  AGAAGCAAAAGGTTTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGCATGGCTGCGGGAGAAGCAGC  2419
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || 
Sbjct  2215  AGAAGCAAAAGGTTTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGCATGGTTGCGGGAGAAGAAGA  2274

Query  2420  AGCAGCAGGACACGCTTCCCAAGTATGCCACACCGGCTCTCTTGTCAGCTGACGTAAAAA  2479
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  2275  AGCAGCAGGACACGCTTCCCAAGTATGCCACACCGGCTCTCTTGTCAGCTGACGTTAAAA  2334

Query  2480  GCAAGGCAGAGGCATTGGACAAGTTTTGCAGGCCTATAATGACCAAACCAAAGCCGGCGG  2539
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct  2335  GCAAGGCGGAGGCATTGGACAAGTTTTGCAGGCCTATAATGACCAAACCAAAGCCGGC--  2392

Query  2540  CTAAAGCAGAGGCACCACAAGCCAAGGGAGGTGAGCAGGCGGATGAGGGCAAGAGTGAGC  2599
              ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| 
Sbjct  2393  -TAAAGCAGAAGCACCACAAGCCAAGGGATGTGAGCCGGCAGATGAGGGCAAGAGTGAGG  2451

Query  2600  CAGAGCAACCAGCTTCTGCCGAAGCAATGGAGACTGAGAATCCCGCGGAAGGTAGTACCT  2659
             ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||
Sbjct  2452  CAGAGCAACCAGCTTCTGCCGAACCAATGGAGACTGAGAATCCCGCCGAAGGTAGTGCCT  2511

Query  2660  AAATGAATGACGAGAGCGAGATG  2682
             |||||||||||||||||||||||
Sbjct  2512  AAATGAATGACGAGAGCGAGATG  2534


> Ahg477271 jgi|Araly1|477271|fgenesh2_kg.2__2401__AT1G79920.2
Length=2694

 Score = 3096 bits (1676),  Expect = 0.0
 Identities = 1851/1937 (96%), Gaps = 6/1937 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  145   TGAAGAACACAAAGCCTAACAATGAGTGTAGTTGGTTTTGATTTTGGAAACGAGAATTGC  204
             ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  16    TGAAGAACACAAAGCCTGACAATGAGTGTAGTTGGTTTTGATTTTGGAAACGAGAATTGC  75

Query  205   CTTGTTGCTGTTGCAAGGCAAAGAGGTATCGACGTCGTGCTTAATGATGAGTCAAATCGC  264
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| 
Sbjct  76    CTTGTTGCTGTTGCAAGGCAAAGAGGTATCGACGTCGTGCTTAATGATGAGTCCAATCGT  135

Query  265   GAGACTCCGGCTATCGTTTGCTTTGGTGACAAGCAGCGCTTCATCGGTACTGCTGGAGCT  324
             |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  136   GAGACTCCCGCTATTGTATGCTTTGGTGACAAGCAGCGCTTCATCGGTACTGCTGGAGCT  195

Query  325   GCTTCTACCATGATGAACCCCAAAAACTCCATCTCACAAATCAAGCGCTTAATTGGTCGC  384
             ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  196   GCTTCAACCATGATGAACCCCAAAAATTCCATCTCTCAAATCAAGCGCTTAATTGGTCGC  255

Query  385   CAGTTTTCCGACCCTGAGCTTCAAAGGGATATCAAATCCCTTCCCTTTTCTGTCACTGAA  444
             |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||
Sbjct  256   CAGTTTTCCGACCCTGAGCTGCAAAGGGATATCAAATCCCTTCCCTTTTCCGTCACCCAA  315

Query  445   GGCCCTGATGGCTATCCTTTGATCCATGCTAATTATTTGGGAGAGATTAGAGCCTTTAC-  503
             || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| 
Sbjct  316   GGGCCTGATGGCTATCCTTTGATCCATGCTAGTTATTTGGGAGAGACTAGAGCCTTTACT  375

Query  504   CCCGACTCAGGTCATGGGTATGATGTTGTCCAACTTGAAAGGTATTGCTGAGAAGAATTT  563
             ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  376   CCC-ACTCAAGTCATGGGTATGATGTTGTCTAACTTGAAAGGTATTGCCGAGAAGAATTT  434

Query  564   GAATACAGCTGTGGTCGACTGCTGTATTGGTATTCCTGTTTACTTTACCGACCTCCAGCG  623
             |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  435   GAATGCTGCAGTGGTCGACTGCTGTATTGGTATTCCTGTTTACTTTACAGACCTCCAGCG  494

Query  624   TAGGGCTGTTCTCGATGCTGCCACAATTGCAGGCTTGCATCCCTTGCACTTGATCCATGA  683
              |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  495   AAGGGCTGTTCTCGACGCAGCCACAATTGCAGGCTTGCATCCCTTGCACTTGATCCACGA  554

Query  684   GACTACAGCTACGGCTTTGGCATACGGAATTTATAAGACAGATCTGCCAGAGAATGACCA  743
             ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  555   GACTACAGCAACGGCTTTGGCTTATGGAATTTATAAGACAGATCTGCCAGAGAATGACCA  614

Query  744   GCTCAATGTTGCATTCATTGACATTGGACACGCAAGCATGCAAGTCTGTATTGCAGGCTT  803
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  615   GCTCAATGTTGCATTCATTGACATTGGACACGCAAGCATGCAAGTCTGTATTGCAGGCTT  674

Query  804   CAAAAAAGGACAGCTCAAAATCTTGTCTCACGCTTTCGATCGCTCCCTTGGGGGAAGGGA  863
             ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct  675   CAAAAAAGGGCAGCTCAAAATCTTGTCTCACGGTTTCGATCCCTCCCTTGGAGGAAGGGA  734

Query  864   TTTTGATGAAGTTCTTTTCAATCATTTTGCTGCTAAGTTCAAGGACGAGTACAAGATTGA  923
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  735   CTTTGATGAAGTTCTTTTCAATCATTTTGCTGCTAAGTTCAAAGACGAGTACAAGATTGA  794

Query  924   CGTCTCCCAGAATGCTAAGGCTTCTCTCAGGCTCCGCGCTACATGCGAGAAACTGAAAAA  983
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||
Sbjct  795   CGTCTCCCAGAATGCTAAGGCTTCTCTCAGGCTCCGTGCTGCGTGCGAGAAACTCAAAAA  854

Query  984   GGTTCTAAGCGCTAATCCTATGGCACCATTGAATATCGAGTGTTTGATGGCTGAGAAAGA  1043
             |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  855   GGTTCTAAGCGCAAATCCTGTCGCACCATTGAATATCGAGTGTTTGATGGATGAGAAAGA  914

Query  1044  TGTTAGGGGTGTCATCAAGAGGGAAGAGTTTGAAGAGATCAGCATCCCGATTTTGGAGCG  1103
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct  915   TGTTAGGGGTGTCATCAAGAGGGAAGAGTTTGAAGAGATCAGCATCCCTATTCTGGAGCG  974

Query  1104  TGTTAAGAGGCCTTTAGAGAAAGCTCTCTCTGATGCGGGCCTCACTGTTGAAGATGTACA  1163
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  975   TGTTAAGAGGCCTCTAGAGAAAGCTCTCTCTGATGCGGGCCTCACAGTTGAAGATGTACA  1034

Query  1164  TATGGTCGAGGTTGTCGGCTCTGGCTCTCGTGTCCCTGCTATGATCAAGATTCTAACTGA  1223
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1035  TATGGTCGAGGTTGTCGGCTCTGGCTCTCGTGTCCCTGCTATGATCAAGATTCTAACTGA  1094

Query  1224  GTTTTTTGGTAAGGAGCCCAGGCGTACAATGAATGCAAGTGAGTGTGTGTCGAGGGGATG  1283
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1095  GTTTTTTGGTAAGGAGCCCAGGCGTACAATGAATGCAAGTGAGTGTGTGTCGAGGGGATG  1154

Query  1284  TGCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGTCCGACCTTTAAAGTTCGCGAATTCCAGGTTCATGA  1343
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1155  TGCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGTCCGACCTTTAAAGTTCGCGAATTCCAGGTTCATGA  1214

Query  1344  GAGCTTCCCTTTCTCAATATCGCTTGCTTGGAAAGGAGCAGCGACTGATGCTCAAAATGG  1403
             |||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||  | ||||||||||||||
Sbjct  1215  GAGCTTCCCTTTCTCAATTTCGCTGGCGTGGACAGGAGCAGCTTCCGATGCTCAAAATGG  1274

Query  1404  AGGCA-CTGAGAACCAGCAGAGCACTATTGTTTTTCCGAAAGGAAATCCTATTCCTAGTG  1462
             ||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct  1275  AGG-AGCTGAGAATCAGCAGAGCACTGTTGTTTTTCCCAAAGGAAATCCCATTCCTAGTG  1333

Query  1463  TCAAGGCTCTAACATTTTATCGTTCTGGAACATTCTCTATTGATGTGCAGTACAGTGATG  1522
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1334  TCAAGGCTCTAACATTTTATCGTTCTGGAACATTCTCTATTGATGTGCAGTACAGTGATG  1393

Query  1523  TGAACGATTTGCAAGCACCTCCTAAAATCAGCACATACACGATTGGTCCCTTCCAGTCAT  1582
             |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1394  TGAATGATTTGCAAGCACCTCCAAAAATCAGCACATACACGATTGGTCCCTTCCAGTCAT  1453

Query  1583  CAAAAGGCGAGAGGGCAAAGCTGAAAGTGAAAGTTAGATTGAACCTGCATGGAATTGTCT  1642
             |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1454  CAAAAGGCGAGAGGGCAAAGCTTAAAGTGAAAGTGAGATTGAACCTGCATGGAATTGTCT  1513

Query  1643  CTGTTGAATCAGCAACTCTTTTGGAAGAGGAAGAAGTTGAAGTATC-GGTCACAAAAGAT  1701
             | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct  1514  CAGTTGAATCGGCAACTCTTTTGGAAGAGGAAGAAGTTGAAGT-TCCGGTCACAAAAGAT  1572

Query  1702  CAATCAGAGGAAACTGCTAAGATGGACACTGACAAAGCTTCTGCCGAGGCAGCTCCTGCT  1761
             ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1573  CAATCAGAGGAAACTACTAAGATGGACACTGACAAAGCTTCTGCCGAGGCAGCTCCTGCT  1632

Query  1762  TCTGGTGACTCTGATGTTAACATGCAGGACGCCAAAGATACCAGTGATGCAACTGGTACT  1821
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct  1633  TTTGGTGACTCTGATGTTAACATGCAGGACGCCAAGGATACCAGTGATGCAGCTGGTTCT  1692

Query  1822  GACAATGGTGTTCCAGAGTCTGCTGAGAAGCCGGTGCAAATGGAAACTGATTCAAAGGCA  1881
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| 
Sbjct  1693  GACAATGGTGTTCCAGAGTCTGCTGAGAAGCCGGTGCAAATGGAAACTGATTTAAAGGCT  1752

Query  1882  GAGGCTCCAAAGAAGAAGGTGAAGAAAACAAATGTACCACTGTCAGAATTGGTCTATGGT  1941
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1753  GAGGCTCCGAAGAAGAAGGTGAAGAAAACAAATGTACCACTGTCAGAATTGGTCTATGGT  1812

Query  1942  GCCTTGAAAACTGTGGAAGTTGAAAAGGCAGTGGAGAAGGAATTTGAGATGGCTCTGCAA  2001
             ||||||||| ||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  1813  GCCTTGAAATCTGTGGAGGTCGATAAGGCTGTGGAGAAGGAATTTGAGATGGCTTTGCAA  1872

Query  2002  GACAGAGTTATGGAAGAGACCAAGGACCGGAAGAATGCTGTTGAGTCTTATGTTTATGAT  2061
             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1873  GACAGAGTTATGGAAGAGACCAAGGACCGAAAGAATGCTGTTGAGTCTTATGTTTATGAT  1932

Query  2062  ATGCGAAACAAACTGAG  2078
             |||||||||||||||||
Sbjct  1933  ATGCGAAACAAACTGAG  1949


 Score = 1005 bits (544),  Expect = 0.0
 Identities = 638/680 (94%), Gaps = 19/680 (3%)
 Strand=Plus/Plus

Query  2160  TGAAGATGGGGAAGATGAGACCAAAGGTGTTTATGTTGCAAAGCTCGAGGAGCTCAAGAA  2219
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2030  TGAAGATGGGGAAGATGAGACCAAAGGTGTTTATGTTGCAAAGCTCGAGGAGCTCAAGAA  2089

Query  2220  GGTGGGTGACCCTGTTGAAGTGCGTTACAAGGAGTCGTTGGAAAGAGGGTCGGTCATTGA  2279
             |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2090  GGTGGGAGACCCTGTGGAAGTGCGTTACAAGGAGTCGTTGGAAAGAGGGTCGGTCATTGA  2149

Query  2280  TCAGCTTGGCTACTGTATTAACAGCTACAGAGAGGCAGCTGTGTCTAATGATCCCAAGTT  2339
             ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  2150  TCAGCTTGGTTACTGTATTAAGAGCTACAGAGAGGCAGCTATGTCTAATGATCCCAAGTT  2209

Query  2340  TGATCACATTGAATTGGCAGAGAAGCAAAAGGTTTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGC  2399
             ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2210  TGACCACATTGAATTGGCAGATAAGCAAAAGGTTTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGC  2269

Query  2400  ATGGCTGCGGGAGAAGCAGCAGCAGCAGGACACGCTTCCCAAGTATGCCACACCGGCTCT  2459
             |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  2270  ATGGCTACGGGAGAAGCAGCAGCAGCAGGACACACTTCCCAAGTATGCCACTCCGGCTCT  2329

Query  2460  CTTGTCAGCTGACGTAAAAAGCAAGGCAGAGGCATTGGACAAGTTTTGCAGGCCTATAAT  2519
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2330  CTTGTCAGCTGACGTAAAAAGCAAGGCGGAGGCATTGGACAAGTTTTGCAGGCCTATAAT  2389

Query  2520  GACCAAACCAAAGCCGGCGGCTAAAGCAGAGGCACCACAAGCCAAGGGAGGTGAGCAGGC  2579
             |||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  2390  GACCAAACCAAAACCGGC---TAAAGCAGAGGCACCACAAGCCAAGGGAGGTGAGCCGGC  2446

Query  2580  GGATGAGGGCAAGAGTGAGCCAGAGCAACCAGCTTCTGCCGAAGCAATGGAGACTGAGAA  2639
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  2447  GGATGAGGGCAAGAGTGAGCCAGAGCAACCAGCTTCTGCCGAACCAATGGAGACTGAGAA  2506

Query  2640  TCCCGCGGAAGGTAGTACCTAAATGAATGACGAGAGCGAGATGGTGTTGTTGTATCGATT  2699
             |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||
Sbjct  2507  TCCCGCTGAAGGGAGTACCTAAATGAATGACGAGAGCGAGATGGTGTTGT---ATCGATT  2563

Query  2700  TTGTTTTAATTTACCTAGTGGAACCACTTTTTGTAGTTTCGCTATTATCCCCC-AAACGA  2758
             |||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||| ||
Sbjct  2564  TTGTTTTAATTTACGTAGTGGAACCTCTTATTCTAGTTTCGCTATTATCCCCCGAAA-GA  2622

Query  2759  TTCTATATTTAGTTCTTCCTTTCGACAT---TTTTTAGGAGGTATATTTTTTATTGTCTG  2815
             |||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    ||||| | 
Sbjct  2623  TTCTATCTTTAGTTCTTCCTTTCGACAACAGTTTTTAGGAGGTATATT----ATTGT-T-  2676

Query  2816  TTCCTTGTGGTTTCATTTTA  2835
               |||||||||||||| |||
Sbjct  2677  --CCTTGTGGTTTCATATTA  2694



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 111909139810


  Database: halleri_transcript_ahg.fa
    Posted date:  Sep 25, 2014  2:02 AM
  Number of letters in database: 38,939,717
  Number of sequences in database:  32,672



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5