BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT1G79920.1 Length=2964 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg927518 jgi|Araly1|927518|scaffold_203079.1 3962 0.0 Ahg477271 jgi|Araly1|477271|fgenesh2_kg.2__2401__AT1G79920.2 3096 0.0 > Ahg927518 jgi|Araly1|927518|scaffold_203079.1 Length=2534 Score = 3962 bits (2145), Expect = 0.0 Identities = 2413/2543 (95%), Gaps = 15/2543 (1%) Strand=Plus/Plus Query 145 TGAAGAACACAAAGCCTAACAATGAGTGTAGTTGGTTTTGATTTTGGAAACGAGAATTGC 204 |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2 TGAATAACAC--AGCCTGACAATGAGTGTAGTTGGGTTTGATTTTGGAAACGAGAACTGC 59 Query 205 CTTGTTGCTGTTGCAAGGCAAAGAGGTATCGACGTCGTGCTTAATGATGAGTCAAATCGC 264 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 60 CTTGTTGCCGTTGCAAGGCAAAGAGGTATCGACGTCGTGCTTAATGATGAGTCCAATCGT 119 Query 265 GAGACTCCGGCTATCGTTTGCTTTGGTGACAAGCAGCGCTTCATCGGTACTGCTGGAGCT 324 |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 120 GAGACTCCCGCTATTGTCTGCTTTGGTGACAAGCAGCGCTTCATCGGCACTGCTGGAGCT 179 Query 325 GCTTCTACCATGATGAACCCCAAAAACTCCATCTCACAAATCAAGCGCTTAATTGGTCGC 384 ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct 180 GCTTCAACCATGATGAACCCCAAAAATTCCATCTCTCAAATCAAACGCTTAATTGGTCGC 239 Query 385 CAGTTTTCCGACCCTGAGCTTCAAAGGGATATCAAATCCCTTCCCTTTTCTGTCACTGAA 444 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct 240 CAGTTTTCCGACCCTGAGCTGCAAAGGGATATCAAATCCCTTCCCTTTTCCGTCACCCAA 299 Query 445 GGCCCTGATGGCTATCCTTTGATCCATGCTAATTATTTGGGAGAGATTAGAGCCTTTACC 504 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 300 GGGCCTGATGGCTATCCTTTGATCCATGCTAATTATTTGGGAGAGAAGAGAGCCTTTACC 359 Query 505 CCGACTCAGGTCATGGGTATGATGTTGTCCAACTTGAAAGGTATTGCTGAGAAGAATTTG 564 |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 360 CCGACTCAAGTCATGGGTATGATGTTGTCTAACTTGAAAGGTATTGCCGAGAAGAATTTG 419 Query 565 AATACAGCTGTGGTCGACTGCTGTATTGGTATTCCTGTTTACTTTACCGACCTCCAGCGT 624 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 420 AATGCAGCTGTGGTCGACTGCTGTATTGGTATTCCTGTTTACTTTACCGACCTCCAGCGA 479 Query 625 AGGGCTGTTCTCGATGCTGCCACAATTGCAGGCTTGCATCCCTTGCACTTGATCCATGAG 684 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| Sbjct 480 AGGGCTGTTCTCGATGCAGCCACAATTGCAGGCTTGCATCCCCTGCGCTTGATCCACGAG 539 Query 685 ACTACAGCTACGGCTTTGGCATACGGAATTTATAAGACAGATCTGCCAGAGAATGACCAG 744 || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| Sbjct 540 ACAACAGCTACAGCTTTGGCATATGGAATTTATAAGACAGATTTGCCAGAGAATGAACAG 599 Query 745 CTCAATGTTGCATTCATTGACATTGGACACGCAAGCATGCAAGTCTGTATTGCAGGCTTC 804 ||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 600 CTCAACGTCGCTTTCATTGACATTGGGCATGCAAGCATGCAAGTCTGTATTGCAGGCTTC 659 Query 805 AAAAAAGGACAGCTCAAAATCTTGTCTCACGCTTTCGATCGCTCCCTTGGGGGAAGGGAT 864 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 660 AAAAAAGGGCAGCTCAAAATCTTGTCTCACGCTTTCGATCGCTCGCTTGGGGGAAGGGAC 719 Query 865 TTTGATGAAGTTCTTTTCAATCATTTTGCTGCTAAGTTCAAGGACGAGTACAAGATTGAC 924 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 720 TTTGATGAAGTTCTTTTCAATCATTTTGCTGCTAAGTTCAAAGACGAGTACAAGATTGAC 779 Query 925 GTCTCCCAGAATGCTAAGGCTTCTCTCAGGCTCCGCGCTACATGCGAGAAACTGAAAAAG 984 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| Sbjct 780 GTCTCCCAGAATGCTAAGGCTTCTCTCAGGCTCCGTGCTGCGTGCGAGAAACTCAAAAAG 839 Query 985 GTTCTAAGCGCTAATCCTATGGCACCATTGAATATCGAGTGTTTGATGG-CTGAGAAAGA 1043 ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| Sbjct 840 GTTCTAAGCGCAAATCCTGTGGCACCATTGAATATCGAGTGTTTGATGGAC-GAGAAAGA 898 Query 1044 TGTTAGGGGTGTCATCAAGAGGGAAGAGTTTGAAGAGATCAGCATCCCGATTTTGGAGCG 1103 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 899 TGTTAGGGGTGTCATCAAGAGGGAAGAGTTTGAAGAGATCAGCATCCCGATTCTGGAGCG 958 Query 1104 TGTTAAGAGGCCTTTAGAGAAAGCTCTCTCTGATGCGGGCCTCACTGTTGAAGATGTACA 1163 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 959 TGTTAAGAGGCCTCTAGAGAAAGCTCTCTCTGATGCGGGCCTCACAGTTGAAGATGTACA 1018 Query 1164 TATGGTCGAGGTTGTCGGCTCTGGCTCTCGTGTCCCTGCTATGATCAAGAT-TCTAACTG 1222 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| Sbjct 1019 TATGGTCGAGGTTATTGGCTCTGGCTCTCGTGTCCCTGCTATGATCAAGATAT-TAACTG 1077 Query 1223 AGTTTTTTGGTAAGGAGCCCAGGCGTACAATGAATGCAAGTGAGTGTGTGTCGAGGGGAT 1282 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1078 AGTTTTTTGGTAAGGAGCCCAGGCGTACAATGAATGCAAGTGAGTGTGTGTCGAGGGGAT 1137 Query 1283 GTGCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGTCCGACCTTTAAAGTTCGCGAATTCCAGGTTCATG 1342 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1138 GTGCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGTCCGACCTTTAAAGTTCGCGAATTCCAGGTTCATG 1197 Query 1343 AGAGCTTCCCTTTCTCAATATCGCTTGCTTGGAAAGGAGCAGCGACTGATGCTCAAAATG 1402 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || Sbjct 1198 AGAGCTTTCCTTTCTCAATATCGCTGGCTTGGAAAGGAGCAGCTTCTGATGCTCAAATTG 1257 Query 1403 GAGGCA-CTGAGAACCAGCAGAGCACTATTGTTTTTCCGAAAGGAAATCCTATTCCTAGT 1461 |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct 1258 GAGG-AGCTGAGAATCAGCAGAGCACCATTGTTTTTCCCAAAGGAAATCCCATTCCTAGT 1316 Query 1462 GTCAAGGCTCTAACATTTTATCGTTCTGGAACATTCTCTATTGATGTGCAGTACAGTGAT 1521 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| Sbjct 1317 GTCAAGGCTCTAACGTTTTATCGTTCTGGAACATTCTCTGTTGATGTGCAGTATGGTGAT 1376 Query 1522 GTGAACGATTTGCAAGCACCTCCTAAAATCAGCACATACACGATTGGTCCCTTCCAGTCA 1581 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1377 GTGAACGATTTGCAAGCACCTCCGAAAATCAGCACATACACGATTGGTACCTTCCAGTCA 1436 Query 1582 TCAAAAGGCGAGAGGGCAAAGCTGAAAGTGAAAGTTAGATTGAACCTGCATGGAATTGTC 1641 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1437 TCAAAAGGCGAGAGGGCAAAGCTTAAAGTGAAAGTGAGATTGAACCTGCATGGAATTGTC 1496 Query 1642 TCTGTTGAATCAGCAACTCTTTTGGAAGAGGAAGAAGTTGAAGTATC-GGTCACAAAAGA 1700 || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct 1497 TCAGTTGAATCGGCAACTCTTTTGGAAGAGGAAGAAGTTGAAGT-TCCGGTCACAAAAGA 1555 Query 1701 TCAATCAGAGGAAACTGCTAAGATGGACACTGACAAAGCTTCTGCCGAGGCAGCTCCTGC 1760 |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1556 TCAATCAGTGGAAACTACTAAGATGGACACTGACAAAGCTTCTGCCGAGGCAGCTCCTGC 1615 Query 1761 TTCTGGTGACTCTGATGTTAACATGCAGGACGCCAAAGATACCAGTGATGCAACTGGTAC 1820 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | Sbjct 1616 TTCTGGTGACTCTGATATTAACATGCAGGACGCCAAGGATACCAGTGATGCAGCTGGTTC 1675 Query 1821 TGACAATGGTGTTCCAGAGTCTGCTGAGAAGCCGGTGCAAATGGAAACTGATTCAAAGGC 1880 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1676 TGACAATGGTGTTGCAGAGTCTGCTGAGAAGCCGGTGCAAATGGAAACTGATTTAAAGGC 1735 Query 1881 AGAGGCTCCAAAGAAGAAGGTGAAGAAAACAAATGTACCACTGTCAGAATTGGTCTATGG 1940 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1736 TGAGGCTCCGAAGAAGAAGGTGAAGAAAACAAATGTACCACTGTCAGAATTGGTCTATGG 1795 Query 1941 TGCCTTGAAAACTGTGGAAGTTGAAAAGGCAGTGGAGAAGGAATTTGAGATGGCTCTGCA 2000 |||||||||| ||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1796 TGCCTTGAAATCTGTGGAGGTCGATAAGGCTGTGGAGAAGGAATTTGAGATGGCTTTGCA 1855 Query 2001 AGACAGAGTTATGGAAGAGACCAAGGACCGGAAGAATGCTGTTGAGTCTTATGTTTATGA 2060 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1856 AGACAGAGTTATGGAAGAGACCAAGGACCGAAAGAATGCTGTTGAGTCTTATGTTTATGA 1915 Query 2061 TATGCGAAACAAACTGAGTGACAAATACCAGGAATATATCACTGACT-CGGAGAGGGAAG 2119 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| Sbjct 1916 TATGCGAAACAAATTGAGTGACAAATACCAGGAATATATCACTGA-TGCTGAGAGGGAAG 1974 Query 2120 CATTCCTGGCGAATCTGCAGGAAGTTGAGGATTGGTTGTATGAAGATGGGGAAGATGAGA 2179 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1975 CATTCCTGGCGAAGCTGCAGGAAGTGGAGGATTGGTTGTATGAAGATGGGGAAGATGAGA 2034 Query 2180 CCAAAGGTGTTTATGTTGCAAAGCTCGAGGAGCTCAAGAAGGTGGGTGACCCTGTTGAAG 2239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2035 CCAAAGGTGTTTATGTTGCAAAGCTCGAGGAGCTCAAGAAGGTGGGTGACCCTGTTGAAG 2094 Query 2240 TGCGTTACAAGGAGTCGTTGGAAAGAGGGTCGGTCATTGATCAGCTTGGCTACTGTATTA 2299 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2095 TACGTTACAAAGAGTCGTTGGAAAGAGGGTCGGTCATTGATCAGCTTGGTTACTGTATTA 2154 Query 2300 ACAGCTACAGAGAGGCAGCTGTGTCTAATGATCCCAAGTTTGATCACATTGAATTGGCAG 2359 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct 2155 ACAGCTACAGAGAGGCAGCTATGTCTAATGATCCCAAGTTTGACCACATTGAATTGGCTG 2214 Query 2360 AGAAGCAAAAGGTTTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGCATGGCTGCGGGAGAAGCAGC 2419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct 2215 AGAAGCAAAAGGTTTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGCATGGTTGCGGGAGAAGAAGA 2274 Query 2420 AGCAGCAGGACACGCTTCCCAAGTATGCCACACCGGCTCTCTTGTCAGCTGACGTAAAAA 2479 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2275 AGCAGCAGGACACGCTTCCCAAGTATGCCACACCGGCTCTCTTGTCAGCTGACGTTAAAA 2334 Query 2480 GCAAGGCAGAGGCATTGGACAAGTTTTGCAGGCCTATAATGACCAAACCAAAGCCGGCGG 2539 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2335 GCAAGGCGGAGGCATTGGACAAGTTTTGCAGGCCTATAATGACCAAACCAAAGCCGGC-- 2392 Query 2540 CTAAAGCAGAGGCACCACAAGCCAAGGGAGGTGAGCAGGCGGATGAGGGCAAGAGTGAGC 2599 ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| Sbjct 2393 -TAAAGCAGAAGCACCACAAGCCAAGGGATGTGAGCCGGCAGATGAGGGCAAGAGTGAGG 2451 Query 2600 CAGAGCAACCAGCTTCTGCCGAAGCAATGGAGACTGAGAATCCCGCGGAAGGTAGTACCT 2659 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| Sbjct 2452 CAGAGCAACCAGCTTCTGCCGAACCAATGGAGACTGAGAATCCCGCCGAAGGTAGTGCCT 2511 Query 2660 AAATGAATGACGAGAGCGAGATG 2682 ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2512 AAATGAATGACGAGAGCGAGATG 2534 > Ahg477271 jgi|Araly1|477271|fgenesh2_kg.2__2401__AT1G79920.2 Length=2694 Score = 3096 bits (1676), Expect = 0.0 Identities = 1851/1937 (96%), Gaps = 6/1937 (0%) Strand=Plus/Plus Query 145 TGAAGAACACAAAGCCTAACAATGAGTGTAGTTGGTTTTGATTTTGGAAACGAGAATTGC 204 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 16 TGAAGAACACAAAGCCTGACAATGAGTGTAGTTGGTTTTGATTTTGGAAACGAGAATTGC 75 Query 205 CTTGTTGCTGTTGCAAGGCAAAGAGGTATCGACGTCGTGCTTAATGATGAGTCAAATCGC 264 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 76 CTTGTTGCTGTTGCAAGGCAAAGAGGTATCGACGTCGTGCTTAATGATGAGTCCAATCGT 135 Query 265 GAGACTCCGGCTATCGTTTGCTTTGGTGACAAGCAGCGCTTCATCGGTACTGCTGGAGCT 324 |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 136 GAGACTCCCGCTATTGTATGCTTTGGTGACAAGCAGCGCTTCATCGGTACTGCTGGAGCT 195 Query 325 GCTTCTACCATGATGAACCCCAAAAACTCCATCTCACAAATCAAGCGCTTAATTGGTCGC 384 ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 196 GCTTCAACCATGATGAACCCCAAAAATTCCATCTCTCAAATCAAGCGCTTAATTGGTCGC 255 Query 385 CAGTTTTCCGACCCTGAGCTTCAAAGGGATATCAAATCCCTTCCCTTTTCTGTCACTGAA 444 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct 256 CAGTTTTCCGACCCTGAGCTGCAAAGGGATATCAAATCCCTTCCCTTTTCCGTCACCCAA 315 Query 445 GGCCCTGATGGCTATCCTTTGATCCATGCTAATTATTTGGGAGAGATTAGAGCCTTTAC- 503 || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 316 GGGCCTGATGGCTATCCTTTGATCCATGCTAGTTATTTGGGAGAGACTAGAGCCTTTACT 375 Query 504 CCCGACTCAGGTCATGGGTATGATGTTGTCCAACTTGAAAGGTATTGCTGAGAAGAATTT 563 ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 376 CCC-ACTCAAGTCATGGGTATGATGTTGTCTAACTTGAAAGGTATTGCCGAGAAGAATTT 434 Query 564 GAATACAGCTGTGGTCGACTGCTGTATTGGTATTCCTGTTTACTTTACCGACCTCCAGCG 623 |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 435 GAATGCTGCAGTGGTCGACTGCTGTATTGGTATTCCTGTTTACTTTACAGACCTCCAGCG 494 Query 624 TAGGGCTGTTCTCGATGCTGCCACAATTGCAGGCTTGCATCCCTTGCACTTGATCCATGA 683 |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 495 AAGGGCTGTTCTCGACGCAGCCACAATTGCAGGCTTGCATCCCTTGCACTTGATCCACGA 554 Query 684 GACTACAGCTACGGCTTTGGCATACGGAATTTATAAGACAGATCTGCCAGAGAATGACCA 743 ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 555 GACTACAGCAACGGCTTTGGCTTATGGAATTTATAAGACAGATCTGCCAGAGAATGACCA 614 Query 744 GCTCAATGTTGCATTCATTGACATTGGACACGCAAGCATGCAAGTCTGTATTGCAGGCTT 803 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 615 GCTCAATGTTGCATTCATTGACATTGGACACGCAAGCATGCAAGTCTGTATTGCAGGCTT 674 Query 804 CAAAAAAGGACAGCTCAAAATCTTGTCTCACGCTTTCGATCGCTCCCTTGGGGGAAGGGA 863 ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct 675 CAAAAAAGGGCAGCTCAAAATCTTGTCTCACGGTTTCGATCCCTCCCTTGGAGGAAGGGA 734 Query 864 TTTTGATGAAGTTCTTTTCAATCATTTTGCTGCTAAGTTCAAGGACGAGTACAAGATTGA 923 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 735 CTTTGATGAAGTTCTTTTCAATCATTTTGCTGCTAAGTTCAAAGACGAGTACAAGATTGA 794 Query 924 CGTCTCCCAGAATGCTAAGGCTTCTCTCAGGCTCCGCGCTACATGCGAGAAACTGAAAAA 983 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| Sbjct 795 CGTCTCCCAGAATGCTAAGGCTTCTCTCAGGCTCCGTGCTGCGTGCGAGAAACTCAAAAA 854 Query 984 GGTTCTAAGCGCTAATCCTATGGCACCATTGAATATCGAGTGTTTGATGGCTGAGAAAGA 1043 |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 855 GGTTCTAAGCGCAAATCCTGTCGCACCATTGAATATCGAGTGTTTGATGGATGAGAAAGA 914 Query 1044 TGTTAGGGGTGTCATCAAGAGGGAAGAGTTTGAAGAGATCAGCATCCCGATTTTGGAGCG 1103 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| Sbjct 915 TGTTAGGGGTGTCATCAAGAGGGAAGAGTTTGAAGAGATCAGCATCCCTATTCTGGAGCG 974 Query 1104 TGTTAAGAGGCCTTTAGAGAAAGCTCTCTCTGATGCGGGCCTCACTGTTGAAGATGTACA 1163 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 975 TGTTAAGAGGCCTCTAGAGAAAGCTCTCTCTGATGCGGGCCTCACAGTTGAAGATGTACA 1034 Query 1164 TATGGTCGAGGTTGTCGGCTCTGGCTCTCGTGTCCCTGCTATGATCAAGATTCTAACTGA 1223 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1035 TATGGTCGAGGTTGTCGGCTCTGGCTCTCGTGTCCCTGCTATGATCAAGATTCTAACTGA 1094 Query 1224 GTTTTTTGGTAAGGAGCCCAGGCGTACAATGAATGCAAGTGAGTGTGTGTCGAGGGGATG 1283 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1095 GTTTTTTGGTAAGGAGCCCAGGCGTACAATGAATGCAAGTGAGTGTGTGTCGAGGGGATG 1154 Query 1284 TGCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGTCCGACCTTTAAAGTTCGCGAATTCCAGGTTCATGA 1343 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1155 TGCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGTCCGACCTTTAAAGTTCGCGAATTCCAGGTTCATGA 1214 Query 1344 GAGCTTCCCTTTCTCAATATCGCTTGCTTGGAAAGGAGCAGCGACTGATGCTCAAAATGG 1403 |||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| | |||||||||||||| Sbjct 1215 GAGCTTCCCTTTCTCAATTTCGCTGGCGTGGACAGGAGCAGCTTCCGATGCTCAAAATGG 1274 Query 1404 AGGCA-CTGAGAACCAGCAGAGCACTATTGTTTTTCCGAAAGGAAATCCTATTCCTAGTG 1462 ||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct 1275 AGG-AGCTGAGAATCAGCAGAGCACTGTTGTTTTTCCCAAAGGAAATCCCATTCCTAGTG 1333 Query 1463 TCAAGGCTCTAACATTTTATCGTTCTGGAACATTCTCTATTGATGTGCAGTACAGTGATG 1522 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1334 TCAAGGCTCTAACATTTTATCGTTCTGGAACATTCTCTATTGATGTGCAGTACAGTGATG 1393 Query 1523 TGAACGATTTGCAAGCACCTCCTAAAATCAGCACATACACGATTGGTCCCTTCCAGTCAT 1582 |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1394 TGAATGATTTGCAAGCACCTCCAAAAATCAGCACATACACGATTGGTCCCTTCCAGTCAT 1453 Query 1583 CAAAAGGCGAGAGGGCAAAGCTGAAAGTGAAAGTTAGATTGAACCTGCATGGAATTGTCT 1642 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1454 CAAAAGGCGAGAGGGCAAAGCTTAAAGTGAAAGTGAGATTGAACCTGCATGGAATTGTCT 1513 Query 1643 CTGTTGAATCAGCAACTCTTTTGGAAGAGGAAGAAGTTGAAGTATC-GGTCACAAAAGAT 1701 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct 1514 CAGTTGAATCGGCAACTCTTTTGGAAGAGGAAGAAGTTGAAGT-TCCGGTCACAAAAGAT 1572 Query 1702 CAATCAGAGGAAACTGCTAAGATGGACACTGACAAAGCTTCTGCCGAGGCAGCTCCTGCT 1761 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1573 CAATCAGAGGAAACTACTAAGATGGACACTGACAAAGCTTCTGCCGAGGCAGCTCCTGCT 1632 Query 1762 TCTGGTGACTCTGATGTTAACATGCAGGACGCCAAAGATACCAGTGATGCAACTGGTACT 1821 | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || Sbjct 1633 TTTGGTGACTCTGATGTTAACATGCAGGACGCCAAGGATACCAGTGATGCAGCTGGTTCT 1692 Query 1822 GACAATGGTGTTCCAGAGTCTGCTGAGAAGCCGGTGCAAATGGAAACTGATTCAAAGGCA 1881 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1693 GACAATGGTGTTCCAGAGTCTGCTGAGAAGCCGGTGCAAATGGAAACTGATTTAAAGGCT 1752 Query 1882 GAGGCTCCAAAGAAGAAGGTGAAGAAAACAAATGTACCACTGTCAGAATTGGTCTATGGT 1941 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1753 GAGGCTCCGAAGAAGAAGGTGAAGAAAACAAATGTACCACTGTCAGAATTGGTCTATGGT 1812 Query 1942 GCCTTGAAAACTGTGGAAGTTGAAAAGGCAGTGGAGAAGGAATTTGAGATGGCTCTGCAA 2001 ||||||||| ||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1813 GCCTTGAAATCTGTGGAGGTCGATAAGGCTGTGGAGAAGGAATTTGAGATGGCTTTGCAA 1872 Query 2002 GACAGAGTTATGGAAGAGACCAAGGACCGGAAGAATGCTGTTGAGTCTTATGTTTATGAT 2061 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1873 GACAGAGTTATGGAAGAGACCAAGGACCGAAAGAATGCTGTTGAGTCTTATGTTTATGAT 1932 Query 2062 ATGCGAAACAAACTGAG 2078 ||||||||||||||||| Sbjct 1933 ATGCGAAACAAACTGAG 1949 Score = 1005 bits (544), Expect = 0.0 Identities = 638/680 (94%), Gaps = 19/680 (3%) Strand=Plus/Plus Query 2160 TGAAGATGGGGAAGATGAGACCAAAGGTGTTTATGTTGCAAAGCTCGAGGAGCTCAAGAA 2219 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2030 TGAAGATGGGGAAGATGAGACCAAAGGTGTTTATGTTGCAAAGCTCGAGGAGCTCAAGAA 2089 Query 2220 GGTGGGTGACCCTGTTGAAGTGCGTTACAAGGAGTCGTTGGAAAGAGGGTCGGTCATTGA 2279 |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2090 GGTGGGAGACCCTGTGGAAGTGCGTTACAAGGAGTCGTTGGAAAGAGGGTCGGTCATTGA 2149 Query 2280 TCAGCTTGGCTACTGTATTAACAGCTACAGAGAGGCAGCTGTGTCTAATGATCCCAAGTT 2339 ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2150 TCAGCTTGGTTACTGTATTAAGAGCTACAGAGAGGCAGCTATGTCTAATGATCCCAAGTT 2209 Query 2340 TGATCACATTGAATTGGCAGAGAAGCAAAAGGTTTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGC 2399 ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2210 TGACCACATTGAATTGGCAGATAAGCAAAAGGTTTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGC 2269 Query 2400 ATGGCTGCGGGAGAAGCAGCAGCAGCAGGACACGCTTCCCAAGTATGCCACACCGGCTCT 2459 |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2270 ATGGCTACGGGAGAAGCAGCAGCAGCAGGACACACTTCCCAAGTATGCCACTCCGGCTCT 2329 Query 2460 CTTGTCAGCTGACGTAAAAAGCAAGGCAGAGGCATTGGACAAGTTTTGCAGGCCTATAAT 2519 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2330 CTTGTCAGCTGACGTAAAAAGCAAGGCGGAGGCATTGGACAAGTTTTGCAGGCCTATAAT 2389 Query 2520 GACCAAACCAAAGCCGGCGGCTAAAGCAGAGGCACCACAAGCCAAGGGAGGTGAGCAGGC 2579 |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2390 GACCAAACCAAAACCGGC---TAAAGCAGAGGCACCACAAGCCAAGGGAGGTGAGCCGGC 2446 Query 2580 GGATGAGGGCAAGAGTGAGCCAGAGCAACCAGCTTCTGCCGAAGCAATGGAGACTGAGAA 2639 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2447 GGATGAGGGCAAGAGTGAGCCAGAGCAACCAGCTTCTGCCGAACCAATGGAGACTGAGAA 2506 Query 2640 TCCCGCGGAAGGTAGTACCTAAATGAATGACGAGAGCGAGATGGTGTTGTTGTATCGATT 2699 |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2507 TCCCGCTGAAGGGAGTACCTAAATGAATGACGAGAGCGAGATGGTGTTGT---ATCGATT 2563 Query 2700 TTGTTTTAATTTACCTAGTGGAACCACTTTTTGTAGTTTCGCTATTATCCCCC-AAACGA 2758 |||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||| || Sbjct 2564 TTGTTTTAATTTACGTAGTGGAACCTCTTATTCTAGTTTCGCTATTATCCCCCGAAA-GA 2622 Query 2759 TTCTATATTTAGTTCTTCCTTTCGACAT---TTTTTAGGAGGTATATTTTTTATTGTCTG 2815 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | Sbjct 2623 TTCTATCTTTAGTTCTTCCTTTCGACAACAGTTTTTAGGAGGTATATT----ATTGT-T- 2676 Query 2816 TTCCTTGTGGTTTCATTTTA 2835 |||||||||||||| ||| Sbjct 2677 --CCTTGTGGTTTCATATTA 2694 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 111909139810 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5