BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G79930.1
Length=2997
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg927518 jgi|Araly1|927518|scaffold_203079.1 4006 0.0
Ahg477271 jgi|Araly1|477271|fgenesh2_kg.2__2401__AT1G79920.2 3009 0.0
> Ahg927518 jgi|Araly1|927518|scaffold_203079.1
Length=2534
Score = 4006 bits (2169), Expect = 0.0
Identities = 2419/2541 (95%), Gaps = 11/2541 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 179 TTGAATAACACAGCCTGACAATGAGTGTAGTCGGGTTTGATTTTGGAAACGAGAATTGCC 238
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1 TTGAATAACACAGCCTGACAATGAGTGTAGTTGGGTTTGATTTTGGAAACGAGAACTGCC 60
Query 239 TTGTTGCCGTTGCGAGGCAAAGAGGTATCGACGTCGTGCTTAATGATGAGTCCAATCGTG 298
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TTGTTGCCGTTGCAAGGCAAAGAGGTATCGACGTCGTGCTTAATGATGAGTCCAATCGTG 120
Query 299 AGACTCCTGCTATTGTCTGCTTCGGTGACAAGCAGCGCTTCATCGGCACTGCTGGAGCTG 358
||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 AGACTCCCGCTATTGTCTGCTTTGGTGACAAGCAGCGCTTCATCGGCACTGCTGGAGCTG 180
Query 359 CTTCTACCATGATGAACCCTAAAAACTCCATCTCTCAAATTAAGCGCTTAATTGGTCGCC 418
|||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 181 CTTCAACCATGATGAACCCCAAAAATTCCATCTCTCAAATCAAACGCTTAATTGGTCGCC 240
Query 419 AGTTTTCCGACCCTGAGCTTCAAAGGGATATCAAATCCCTTCCCTTTTCTGTCACCGAAG 478
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 241 AGTTTTCCGACCCTGAGCTGCAAAGGGATATCAAATCCCTTCCCTTTTCCGTCACCCAAG 300
Query 479 GCCCTGATGGCTATCCTTTGATACATGCTAATTATTTGGGAGAGAAGCGAGCCTTTACCC 538
| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 301 GGCCTGATGGCTATCCTTTGATCCATGCTAATTATTTGGGAGAGAAGAGAGCCTTTACCC 360
Query 539 CGACTCAAGTCATGGGCATGATGTTGTCTAACCTGAAAGGTATTGCCGAGAAGAATTTGA 598
|||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CGACTCAAGTCATGGGTATGATGTTGTCTAACTTGAAAGGTATTGCCGAGAAGAATTTGA 420
Query 599 ATACAGCTGTTGTCGACTGCTGTATTGGTATTCCTGTTTACTTTACCGACCTCCAGCGTA 658
|| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 421 ATGCAGCTGTGGTCGACTGCTGTATTGGTATTCCTGTTTACTTTACCGACCTCCAGCGAA 480
Query 659 GGGCTGTTCTCGATGCTGCCACTATTGCTGGCTTGCATCCCTTGCGCTTGATCCACGAGA 718
|||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 481 GGGCTGTTCTCGATGCAGCCACAATTGCAGGCTTGCATCCCCTGCGCTTGATCCACGAGA 540
Query 719 CTACAGCTACGGCTTTGGCATATGGTATTTATAAGACAGATTTGCCAGAGAGTGACCAGC 778
| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||
Sbjct 541 CAACAGCTACAGCTTTGGCATATGGAATTTATAAGACAGATTTGCCAGAGAATGAACAGC 600
Query 779 TCAATGTTGCATTCATTGACATTGGACACGCAAGCATGCAAGTCTGTATTGCAGGCTTTA 838
|||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 601 TCAACGTCGCTTTCATTGACATTGGGCATGCAAGCATGCAAGTCTGTATTGCAGGCTTCA 660
Query 839 AAAAAGGACAGCTCAAAATCTTGTCTCACGCTTTCGATCGCTCCCTTGGGGGAAGGGACT 898
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 661 AAAAAGGGCAGCTCAAAATCTTGTCTCACGCTTTCGATCGCTCGCTTGGGGGAAGGGACT 720
Query 899 TTGATGAAGTTCTTTTCAATCATTTTGCTGCTAAGTTCAAGGACGAGTACAAGATTGACG 958
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 721 TTGATGAAGTTCTTTTCAATCATTTTGCTGCTAAGTTCAAAGACGAGTACAAGATTGACG 780
Query 959 TCTCCCAGAATGCTAAGGCTTCTCTCAGGCTCCGTGCTACATGCGAGAAACTGAAAAAGG 1018
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||
Sbjct 781 TCTCCCAGAATGCTAAGGCTTCTCTCAGGCTCCGTGCTGCGTGCGAGAAACTCAAAAAGG 840
Query 1019 TTCTAAGCGCTAATCCTCTGGCACCGTTGAATATCGAGTGTTTGATGGATGAGAAAGATG 1078
|||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 841 TTCTAAGCGCAAATCCTGTGGCACCATTGAATATCGAGTGTTTGATGGACGAGAAAGATG 900
Query 1079 TTAGGGGTGTCATCAAGAGGGAAGAGTTTGAAGAGATCAGCATCCCGATTTTGGAGCGTG 1138
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 901 TTAGGGGTGTCATCAAGAGGGAAGAGTTTGAAGAGATCAGCATCCCGATTCTGGAGCGTG 960
Query 1139 TAAAGAGGCCTCTAGAGAAAGCTCTCTCTGATGCAGGCCTCACTGTTGAAGATGTACATA 1198
| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 961 TTAAGAGGCCTCTAGAGAAAGCTCTCTCTGATGCGGGCCTCACAGTTGAAGATGTACATA 1020
Query 1199 TGGTTGAGGTTATTGGCTCTGGCTCTCGTGTCCCTGCTATGATCAAGAT-TCTAACTGAG 1257
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 1021 TGGTCGAGGTTATTGGCTCTGGCTCTCGTGTCCCTGCTATGATCAAGATAT-TAACTGAG 1079
Query 1258 TTTTTTGGTAAGGAGCCCAGGCGGACAATGAATGCAAGTGAGTGTGTGTCAAGGGGATGT 1317
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1080 TTTTTTGGTAAGGAGCCCAGGCGTACAATGAATGCAAGTGAGTGTGTGTCGAGGGGATGT 1139
Query 1318 GCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGTCCGACCTTTAAAGTTCGCGAATTCCAGGTTCATGAG 1377
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 GCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGTCCGACCTTTAAAGTTCGCGAATTCCAGGTTCATGAG 1199
Query 1378 AGCTTCCCTTTCTCAATTTCTCTCGCTTGGAAAGGAGCAGCTTCTGAAGCTCAAAATGGA 1437
||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
Sbjct 1200 AGCTTTCCTTTCTCAATATCGCTGGCTTGGAAAGGAGCAGCTTCTGATGCTCAAATTGGA 1259
Query 1438 GGAGCTGAGAATCAGCAGAGCACCATTGTTTTTCCCAAAGGAAATCCCATTCCTAGTGTC 1497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 GGAGCTGAGAATCAGCAGAGCACCATTGTTTTTCCCAAAGGAAATCCCATTCCTAGTGTC 1319
Query 1498 AAGGCTCTAACGTTTTATCGTTCTGGAACATTCTCTGTTGATGTGCAGTACAGTGATGTG 1557
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1320 AAGGCTCTAACGTTTTATCGTTCTGGAACATTCTCTGTTGATGTGCAGTATGGTGATGTG 1379
Query 1558 AACGATTTGCAAGCACCTCCAAAAATCAGCACATACACGATTGGT-CCGTTCCAGTCATC 1616
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 1380 AACGATTTGCAAGCACCTCCGAAAATCAGCACATACACGATTGGTACC-TTCCAGTCATC 1438
Query 1617 AAAAGGCGAGAGGGCAAAGCTTAAAGTGAAAGTGAGATTGAACCTTCATGGAATCGTCTC 1676
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 1439 AAAAGGCGAGAGGGCAAAGCTTAAAGTGAAAGTGAGATTGAACCTGCATGGAATTGTCTC 1498
Query 1677 AGTTGAATCTGCAACTCTTTTGGAAGAGGAAGAAGTTGAAGTTCCGGTCACAAAAGAACA 1736
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1499 AGTTGAATCGGCAACTCTTTTGGAAGAGGAAGAAGTTGAAGTTCCGGTCACAAAAGATCA 1558
Query 1737 TTCAGAGGAAACTACTAAGATGGACTCTGACAAAGCTTCTGCTGAGGCAGCTCCTGCTTC 1796
|||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1559 ATCAGTGGAAACTACTAAGATGGACACTGACAAAGCTTCTGCCGAGGCAGCTCCTGCTTC 1618
Query 1797 TGGAGACTGTGATGTAAACATGCAGGACGCCAAAGACACCAGTGATGCAACTGGTACTGA 1856
||| |||| |||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 1619 TGGTGACTCTGATATTAACATGCAGGACGCCAAGGATACCAGTGATGCAGCTGGTTCTGA 1678
Query 1857 CAATGGTGTTCCAGAGTCTGCTGAGAAGCCGGTGCAAATGGAAACTGATTCAAAGGCTGA 1916
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1679 CAATGGTGTTGCAGAGTCTGCTGAGAAGCCGGTGCAAATGGAAACTGATTTAAAGGCTGA 1738
Query 1917 GGCTCCAAAGAAGAAGGTGAAGAAAACAAATGTACCACTGTCTGAATTGGTCTATGGTGC 1976
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1739 GGCTCCGAAGAAGAAGGTGAAGAAAACAAATGTACCACTGTCAGAATTGGTCTATGGTGC 1798
Query 1977 CTTGAAAACTGTGGAGGTCGAAAAGGCAGTGGAGAAGGAATTTGAGATGGCTTTGCAAGA 2036
||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1799 CTTGAAATCTGTGGAGGTCGATAAGGCTGTGGAGAAGGAATTTGAGATGGCTTTGCAAGA 1858
Query 2037 CAGAGTTATGGAAGAGACCAAGGACCGGAAGAATGCTGTTGAGTCTTATGTTTATGATAT 2096
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1859 CAGAGTTATGGAAGAGACCAAGGACCGAAAGAATGCTGTTGAGTCTTATGTTTATGATAT 1918
Query 2097 GCGGAACAAACTGAGTGACAAATACCAGGAATATATCACTGACT-CGGAGAGGGAAGCAT 2155
||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||
Sbjct 1919 GCGAAACAAATTGAGTGACAAATACCAGGAATATATCACTGA-TGCTGAGAGGGAAGCAT 1977
Query 2156 TCCTGGCGAATCTGCAGGAAGTTGAGGATTGGTTGTATGAAGATGGGGAAGATGAGACCA 2215
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1978 TCCTGGCGAAGCTGCAGGAAGTGGAGGATTGGTTGTATGAAGATGGGGAAGATGAGACCA 2037
Query 2216 AAGGTGTTTATGTTGCGAAGCTCGAGGAGCTCAAGAAGGTGGGTGACCCTGTTGAAGTGC 2275
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2038 AAGGTGTTTATGTTGCAAAGCTCGAGGAGCTCAAGAAGGTGGGTGACCCTGTTGAAGTAC 2097
Query 2276 GTTACAAGGAGTCATTGGAAAGAGGGTCGGTCATTGATCAGCTTGGTTACTGTATTAACA 2335
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2098 GTTACAAAGAGTCGTTGGAAAGAGGGTCGGTCATTGATCAGCTTGGTTACTGTATTAACA 2157
Query 2336 GCTACAGAGAGGCAGCTATGTCTACTGATCCCAAGTTTGATCACATTGAATTGGCAGAGA 2395
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 2158 GCTACAGAGAGGCAGCTATGTCTAATGATCCCAAGTTTGACCACATTGAATTGGCTGAGA 2217
Query 2396 AGCAAAAGGTTTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGCATGGCTGCGGG-GAAAGCAGCAG 2454
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | || ||
Sbjct 2218 AGCAAAAGGTTTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGCATGGTTGCGGGAGAA-GAAGAAG 2276
Query 2455 CAGCAGGACACACTTCCCAAGTATGCCACACCGGCTCTCTTGTCAGCTGACGTTAAAAGC 2514
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2277 CAGCAGGACACGCTTCCCAAGTATGCCACACCGGCTCTCTTGTCAGCTGACGTTAAAAGC 2336
Query 2515 AAGGCAGAGGCATTGGACAAGTTTTGCAGGCCTATAATGACCAAACCAAAGCCGGTGGCT 2574
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2337 AAGGCGGAGGCATTGGACAAGTTTTGCAGGCCTATAATGACCAAACCAAAGCCGG---CT 2393
Query 2575 AAAGCAGAGGCACCACAAGCCAAGGGAGGTGAGCAGGCGGATGAGGGCAAGAGTGAGCCA 2634
|||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||
Sbjct 2394 AAAGCAGAAGCACCACAAGCCAAGGGATGTGAGCCGGCAGATGAGGGCAAGAGTGAGGCA 2453
Query 2635 GAGCAACCAGCTTCTGCCGAACCAATGGAGACTGAGAATCCCGCGGAAGGTAGTACCTAA 2694
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 2454 GAGCAACCAGCTTCTGCCGAACCAATGGAGACTGAGAATCCCGCCGAAGGTAGTGCCTAA 2513
Query 2695 ATGAATGACGAGAGAGAGATG 2715
|||||||||||||| ||||||
Sbjct 2514 ATGAATGACGAGAGCGAGATG 2534
> Ahg477271 jgi|Araly1|477271|fgenesh2_kg.2__2401__AT1G79920.2
Length=2694
Score = 3009 bits (1629), Expect = 0.0
Identities = 1835/1937 (95%), Gaps = 4/1937 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 178 ATTGAATAACAC--AGCCTGACAATGAGTGTAGTCGGGTTTGATTTTGGAAACGAGAATT 235
|||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 14 ATTGAAGAACACAAAGCCTGACAATGAGTGTAGTTGGTTTTGATTTTGGAAACGAGAATT 73
Query 236 GCCTTGTTGCCGTTGCGAGGCAAAGAGGTATCGACGTCGTGCTTAATGATGAGTCCAATC 295
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 74 GCCTTGTTGCTGTTGCAAGGCAAAGAGGTATCGACGTCGTGCTTAATGATGAGTCCAATC 133
Query 296 GTGAGACTCCTGCTATTGTCTGCTTCGGTGACAAGCAGCGCTTCATCGGCACTGCTGGAG 355
|||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 134 GTGAGACTCCCGCTATTGTATGCTTTGGTGACAAGCAGCGCTTCATCGGTACTGCTGGAG 193
Query 356 CTGCTTCTACCATGATGAACCCTAAAAACTCCATCTCTCAAATTAAGCGCTTAATTGGTC 415
||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 194 CTGCTTCAACCATGATGAACCCCAAAAATTCCATCTCTCAAATCAAGCGCTTAATTGGTC 253
Query 416 GCCAGTTTTCCGACCCTGAGCTTCAAAGGGATATCAAATCCCTTCCCTTTTCTGTCACCG 475
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 254 GCCAGTTTTCCGACCCTGAGCTGCAAAGGGATATCAAATCCCTTCCCTTTTCCGTCACCC 313
Query 476 AAGGCCCTGATGGCTATCCTTTGATACATGCTAATTATTTGGGAGAGAAGCGAGCCTTTA 535
|||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 314 AAGGGCCTGATGGCTATCCTTTGATCCATGCTAGTTATTTGGGAGAGACTAGAGCCTTTA 373
Query 536 C-CCCGACTCAAGTCATGGGCATGATGTTGTCTAACCTGAAAGGTATTGCCGAGAAGAAT 594
| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 374 CTCCC-ACTCAAGTCATGGGTATGATGTTGTCTAACTTGAAAGGTATTGCCGAGAAGAAT 432
Query 595 TTGAATACAGCTGTTGTCGACTGCTGTATTGGTATTCCTGTTTACTTTACCGACCTCCAG 654
|||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 433 TTGAATGCTGCAGTGGTCGACTGCTGTATTGGTATTCCTGTTTACTTTACAGACCTCCAG 492
Query 655 CGTAGGGCTGTTCTCGATGCTGCCACTATTGCTGGCTTGCATCCCTTGCGCTTGATCCAC 714
|| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 493 CGAAGGGCTGTTCTCGACGCAGCCACAATTGCAGGCTTGCATCCCTTGCACTTGATCCAC 552
Query 715 GAGACTACAGCTACGGCTTTGGCATATGGTATTTATAAGACAGATTTGCCAGAGAGTGAC 774
||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||
Sbjct 553 GAGACTACAGCAACGGCTTTGGCTTATGGAATTTATAAGACAGATCTGCCAGAGAATGAC 612
Query 775 CAGCTCAATGTTGCATTCATTGACATTGGACACGCAAGCATGCAAGTCTGTATTGCAGGC 834
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 613 CAGCTCAATGTTGCATTCATTGACATTGGACACGCAAGCATGCAAGTCTGTATTGCAGGC 672
Query 835 TTTAAAAAAGGACAGCTCAAAATCTTGTCTCACGCTTTCGATCGCTCCCTTGGGGGAAGG 894
|| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 673 TTCAAAAAAGGGCAGCTCAAAATCTTGTCTCACGGTTTCGATCCCTCCCTTGGAGGAAGG 732
Query 895 GACTTTGATGAAGTTCTTTTCAATCATTTTGCTGCTAAGTTCAAGGACGAGTACAAGATT 954
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 733 GACTTTGATGAAGTTCTTTTCAATCATTTTGCTGCTAAGTTCAAAGACGAGTACAAGATT 792
Query 955 GACGTCTCCCAGAATGCTAAGGCTTCTCTCAGGCTCCGTGCTACATGCGAGAAACTGAAA 1014
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||
Sbjct 793 GACGTCTCCCAGAATGCTAAGGCTTCTCTCAGGCTCCGTGCTGCGTGCGAGAAACTCAAA 852
Query 1015 AAGGTTCTAAGCGCTAATCCTCTGGCACCGTTGAATATCGAGTGTTTGATGGATGAGAAA 1074
|||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 853 AAGGTTCTAAGCGCAAATCCTGTCGCACCATTGAATATCGAGTGTTTGATGGATGAGAAA 912
Query 1075 GATGTTAGGGGTGTCATCAAGAGGGAAGAGTTTGAAGAGATCAGCATCCCGATTTTGGAG 1134
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 913 GATGTTAGGGGTGTCATCAAGAGGGAAGAGTTTGAAGAGATCAGCATCCCTATTCTGGAG 972
Query 1135 CGTGTAAAGAGGCCTCTAGAGAAAGCTCTCTCTGATGCAGGCCTCACTGTTGAAGATGTA 1194
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 973 CGTGTTAAGAGGCCTCTAGAGAAAGCTCTCTCTGATGCGGGCCTCACAGTTGAAGATGTA 1032
Query 1195 CATATGGTTGAGGTTATTGGCTCTGGCTCTCGTGTCCCTGCTATGATCAAGATTCTAACT 1254
|||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033 CATATGGTCGAGGTTGTCGGCTCTGGCTCTCGTGTCCCTGCTATGATCAAGATTCTAACT 1092
Query 1255 GAGTTTTTTGGTAAGGAGCCCAGGCGGACAATGAATGCAAGTGAGTGTGTGTCAAGGGGA 1314
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1093 GAGTTTTTTGGTAAGGAGCCCAGGCGTACAATGAATGCAAGTGAGTGTGTGTCGAGGGGA 1152
Query 1315 TGTGCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGTCCGACCTTTAAAGTTCGCGAATTCCAGGTTCAT 1374
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1153 TGTGCCTTGCAGTGTGCCATTCTCAGTCCGACCTTTAAAGTTCGCGAATTCCAGGTTCAT 1212
Query 1375 GAGAGCTTCCCTTTCTCAATTTCTCTCGCTTGGAAAGGAGCAGCTTCTGAAGCTCAAAAT 1434
||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||| || |||||||||
Sbjct 1213 GAGAGCTTCCCTTTCTCAATTTCGCTGGCGTGGACAGGAGCAGCTTCCGATGCTCAAAAT 1272
Query 1435 GGAGGAGCTGAGAATCAGCAGAGCACCATTGTTTTTCCCAAAGGAAATCCCATTCCTAGT 1494
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1273 GGAGGAGCTGAGAATCAGCAGAGCACTGTTGTTTTTCCCAAAGGAAATCCCATTCCTAGT 1332
Query 1495 GTCAAGGCTCTAACGTTTTATCGTTCTGGAACATTCTCTGTTGATGTGCAGTACAGTGAT 1554
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GTCAAGGCTCTAACATTTTATCGTTCTGGAACATTCTCTATTGATGTGCAGTACAGTGAT 1392
Query 1555 GTGAACGATTTGCAAGCACCTCCAAAAATCAGCACATACACGATTGGTCCGTTCCAGTCA 1614
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1393 GTGAATGATTTGCAAGCACCTCCAAAAATCAGCACATACACGATTGGTCCCTTCCAGTCA 1452
Query 1615 TCAAAAGGCGAGAGGGCAAAGCTTAAAGTGAAAGTGAGATTGAACCTTCATGGAATCGTC 1674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 1453 TCAAAAGGCGAGAGGGCAAAGCTTAAAGTGAAAGTGAGATTGAACCTGCATGGAATTGTC 1512
Query 1675 TCAGTTGAATCTGCAACTCTTTTGGAAGAGGAAGAAGTTGAAGTTCCGGTCACAAAAGAA 1734
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1513 TCAGTTGAATCGGCAACTCTTTTGGAAGAGGAAGAAGTTGAAGTTCCGGTCACAAAAGAT 1572
Query 1735 CATTCAGAGGAAACTACTAAGATGGACTCTGACAAAGCTTCTGCTGAGGCAGCTCCTGCT 1794
|| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1573 CAATCAGAGGAAACTACTAAGATGGACACTGACAAAGCTTCTGCCGAGGCAGCTCCTGCT 1632
Query 1795 TCTGGAGACTGTGATGTAAACATGCAGGACGCCAAAGACACCAGTGATGCAACTGGTACT 1854
| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||
Sbjct 1633 TTTGGTGACTCTGATGTTAACATGCAGGACGCCAAGGATACCAGTGATGCAGCTGGTTCT 1692
Query 1855 GACAATGGTGTTCCAGAGTCTGCTGAGAAGCCGGTGCAAATGGAAACTGATTCAAAGGCT 1914
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1693 GACAATGGTGTTCCAGAGTCTGCTGAGAAGCCGGTGCAAATGGAAACTGATTTAAAGGCT 1752
Query 1915 GAGGCTCCAAAGAAGAAGGTGAAGAAAACAAATGTACCACTGTCTGAATTGGTCTATGGT 1974
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1753 GAGGCTCCGAAGAAGAAGGTGAAGAAAACAAATGTACCACTGTCAGAATTGGTCTATGGT 1812
Query 1975 GCCTTGAAAACTGTGGAGGTCGAAAAGGCAGTGGAGAAGGAATTTGAGATGGCTTTGCAA 2034
||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1813 GCCTTGAAATCTGTGGAGGTCGATAAGGCTGTGGAGAAGGAATTTGAGATGGCTTTGCAA 1872
Query 2035 GACAGAGTTATGGAAGAGACCAAGGACCGGAAGAATGCTGTTGAGTCTTATGTTTATGAT 2094
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1873 GACAGAGTTATGGAAGAGACCAAGGACCGAAAGAATGCTGTTGAGTCTTATGTTTATGAT 1932
Query 2095 ATGCGGAACAAACTGAG 2111
||||| |||||||||||
Sbjct 1933 ATGCGAAACAAACTGAG 1949
Score = 924 bits (500), Expect = 0.0
Identities = 604/651 (93%), Gaps = 19/651 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 2193 TGAAGATGGGGAAGATGAGACCAAAGGTGTTTATGTTGCGAAGCTCGAGGAGCTCAAGAA 2252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2030 TGAAGATGGGGAAGATGAGACCAAAGGTGTTTATGTTGCAAAGCTCGAGGAGCTCAAGAA 2089
Query 2253 GGTGGGTGACCCTGTTGAAGTGCGTTACAAGGAGTCATTGGAAAGAGGGTCGGTCATTGA 2312
|||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2090 GGTGGGAGACCCTGTGGAAGTGCGTTACAAGGAGTCGTTGGAAAGAGGGTCGGTCATTGA 2149
Query 2313 TCAGCTTGGTTACTGTATTAACAGCTACAGAGAGGCAGCTATGTCTACTGATCCCAAGTT 2372
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2150 TCAGCTTGGTTACTGTATTAAGAGCTACAGAGAGGCAGCTATGTCTAATGATCCCAAGTT 2209
Query 2373 TGATCACATTGAATTGGCAGAGAAGCAAAAGGTTTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGC 2432
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2210 TGACCACATTGAATTGGCAGATAAGCAAAAGGTTTTGAACGAGTGTGTGGAAGCAGAAGC 2269
Query 2433 ATGGCTGCGGGGA-AAGCAGCAGCAGCAGGACACACTTCCCAAGTATGCCACACCGGCTC 2491
|||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2270 ATGGCTAC-GGGAGAAGCAGCAGCAGCAGGACACACTTCCCAAGTATGCCACTCCGGCTC 2328
Query 2492 TCTTGTCAGCTGACGTTAAAAGCAAGGCAGAGGCATTGGACAAGTTTTGCAGGCCTATAA 2551
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2329 TCTTGTCAGCTGACGTAAAAAGCAAGGCGGAGGCATTGGACAAGTTTTGCAGGCCTATAA 2388
Query 2552 TGACCAAACCAAAGCCGGTGGCTAAAGCAGAGGCACCACAAGCCAAGGGAGGTGAGCAGG 2611
||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2389 TGACCAAACCAAAACC---GGCTAAAGCAGAGGCACCACAAGCCAAGGGAGGTGAGCCGG 2445
Query 2612 CGGATGAGGGCAAGAGTGAGCCAGAGCAACCAGCTTCTGCCGAACCAATGGAGACTGAGA 2671
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2446 CGGATGAGGGCAAGAGTGAGCCAGAGCAACCAGCTTCTGCCGAACCAATGGAGACTGAGA 2505
Query 2672 ATCCCGCGGAAGGTAGTACCTAAATGAATGACGAGAGAGAGATGGTGTTGTATCGATTTT 2731
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2506 ATCCCGCTGAAGGGAGTACCTAAATGAATGACGAGAGCGAGATGGTGTTGTATCGATTTT 2565
Query 2732 GTTCTTAACTCTTTTTGATTTACCTAGTGGAACCTCTTTTTCTGGTTTCGCTATTATTCC 2791
||| |||| | || | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||
Sbjct 2566 GTT-TTAA-T-TT----A----CGTAGTGGAACCTCTTATTCTAGTTTCGCTATTATCCC 2614
Query 2792 CGGAAAAAATCTATATTGTTAATTCTTCCTTTTCGAAAACAATTTTTAGGA 2842
| |||| | ||||| || | | |||||||||| ||| |||| |||||||||
Sbjct 2615 CCGAAAGATTCTATCTT-T-AGTTCTTCCTTT-CGACAACAGTTTTTAGGA 2662
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 113166117895
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5