BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT1G80490.2
Length=3787
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg927456 jgi|Araly1|927456|scaffold_203017.1 5703 0.0
Ahg471773 jgi|Araly1|471773|fgenesh2_kg.1__1727__AT1G15750.2 2495 0.0
> Ahg927456 jgi|Araly1|927456|scaffold_203017.1
Length=3406
Score = 5703 bits (3088), Expect = 0.0
Identities = 3274/3367 (97%), Gaps = 0/3367 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 231 ATCATGTCTTCTCTGAGCAGAGAGCTCGTCTTCTTGATCTTACAGTTTTTAGATGAAGAG 290
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 21 ATCATGTCTTCTCTGAGCAGAGAGCTCGTGTTCTTGATCTTACAGTTTTTAGACGAAGAG 80
Query 291 AAGTTTAAAGAGACTGTTCATAAGCTTGAACAAGAATCTGGGTTTTTCTTCAATATGAAG 350
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 81 AAGTTCAAAGAGACTGTTCATAAGCTTGAACAAGAATCTGGGTTTTTCTTCAATATGAAG 140
Query 351 TATTTTGAGGATGAGGTGCACAATGGTAACTGGGATGAGGTTGAGAAGTATCTCTCTGGT 410
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 141 TATTTTGAGGATGAGGTGCACAATGGTAACTGGGATGAGGTTGAGAGGTATCTCTCTGGT 200
Query 411 TTTACTAAAGTTGATGATAATCGATACTCCATGAAGATTTTCTTCGAGATTAGGAAGCAG 470
||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 201 TTTACCAAAGTTGATGATAATAGATACTCCATGAAGATTTTCTTCGAGATTAGGAAGCAG 260
Query 471 AAGTATCTCGAGGCCTTGGATAGGCATGATCGTCCCAAGGCTGTCGATATTTTAGTCAAA 530
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||
Sbjct 261 AAGTATCTCGAGGCCTTGGATAAGCATGATCGTCCCAAGGCTGTGGAAATTCTAGTCAAA 320
Query 531 GATTTGAAAGTGTTTTCCACTTTTAATGAGGAGCTTTTCAAGGAAATCACTCAGCTCTTG 590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 321 GATTTGAAAGTGTTTTCCACTTTTAATGAGGAGCTTTTCAAGGAAATCACTCAGCTCTTG 380
Query 591 ACCTTAGAAAACTTCAGGGAGAACGAGCAGTTATCCAAGTATGGGGACACAAAGTCCGCC 650
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 381 ACCTTAGAAAACTTCCGGGAGAACGAGCAGTTATCCAAGTATGGGGACACAAAGTCCGCC 440
Query 651 AGAGCTATCATGTTGGTGGAACTCAAGAAGTTGATTGAAGCTAATCCTTTATTCCGTGAT 710
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 441 CGAGCTATCATGTTGGTGGAACTCAAGAAGTTGATTGAAGCTAATCCATTGTTCCGTGAT 500
Query 711 AAATTGCAGTTTCCTACCCTTAGAACTTCACGCCTCAGGACTCTGATTAATCAGAGCTTA 770
||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 501 AAATTGCAGTTTCCTACCCTTAGAAATTCACGGCTGAGGACTCTCATTAATCAGAGCTTA 560
Query 771 AATTGGCAACACCAGCTTTGTAAGAACCCAAGGCCTAATCCTGATATTAAGACTCTCTTT 830
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 561 AATTGGCAACATCAGCTTTGTAAAAACCCAAGGCCTAATCCTGATATTAAGACTCTCTTT 620
Query 831 GTCGATCATTCCTGCCGCCTACCAAATGATGCACGAGCACCATCCCCTGTCAACAATCCG 890
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 621 GTGGATCATTCCTGCCGCCTACCAAATGATGCACGAGCACCATCCCCTGTCAACAATCCG 680
Query 891 CTTCTTGGATCATTACCAAAAGCCGAGGGATTTCCTCCTCTAGGCGCACACGGGCCTTTT 950
|| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||
Sbjct 681 CTGCTTGGATCATTACCAAAAGCCGGGGGATTTCCTCCTTTAGGCGCACACGGGCCATTT 740
Query 951 CAACCAACACCTTCTCCGGTTCCGACACCTCTTGCTGGTTGGATGTCTAGTCCTTCCTCT 1010
||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAACCAACATCTTCTCCTGTTCCTACACCTCTTGCTGGTTGGATGTCTAGTCCTTCCTCT 800
Query 1011 GTCCCACATCCAGCTGTGTCTGGAGGACCCATTGCTCTTGGTGCTCCATCCATCCAAGCA 1070
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 801 GTCCCACATCCAGCTGTGTCTGGAGGAGCCATTGCTCTTGGTGCTCCATCCATCCAAGCA 860
Query 1071 GCCTTGAAACACCCGAGAACTCCTCCTTCTAATTCCGCTGTAGACTATCCATCAGGTGAC 1130
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 861 GCCTTGAAGCACCCGAGAACTCCTCCAACTAATTCCGCTGTAGACTATCCATCAGGTGAT 920
Query 1131 TCAGACCATGTCTCAAAGCGAACCAGACCTATGGGAATCTCTGACGAGGTGAGTCTAGGT 1190
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 921 TCAGACCATGTCTCAAAGCGAACAAGACCTATGGGAATCTCTGACGAGGTGAGTCTAGGT 980
Query 1191 GTGAACATGTTACCAATGACATTCCCGGGGCAGGCTCATGGTCATAATCAAACCTTCAAA 1250
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 981 GTCAACATGTTACCAATGACATTCCCGGGACAGGCTCATGGTCATAATCAAACCTTCAAA 1040
Query 1251 GCACCTGATGACTTGCCCAAGACAGTTGCACGAACTTTGAGCCAAGGCTCATCTCCCATG 1310
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1041 GCACCTGATGACTTGCCCAAGACAGTAGCACGAACTTTGAGCCAAGGCTCATCTCCCATG 1100
Query 1311 AGCATGGATTTCCATCCTATTAAACAGACTCTGCTACTAGTTGGTACGAATGTAGGGGAT 1370
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101 AGCATGGATTTCCATCCTAGTAAACAGACTCTGCTACTAGTTGGTACGAATGTAGGGGAT 1160
Query 1371 ATTGGGCTCTGGGAAGTCGGTTCTCGAGAACGTCTAGTCCAGAAGACTTTCAAAGTTTGG 1430
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1161 ATTGGGCTCTGGGAAGTCGGTTCTCGAGAACGACTAGTCCAGAAGACTTTCAAAGTTTGG 1220
Query 1431 GACTTGAGTAAATGTTCGATGCCCTTGCAGGCTGCTTTGGTGAAAGAACCTGTCGTTTCT 1490
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1221 GACTTGAGTAAATGTTCAATGCCCTTGCAGGCTGCTTTGGTGAAAGAACCTGTCGTTTCT 1280
Query 1491 GTCAACCGTGTGATTTGGAGCCCGGACGGTTCCCTATTCGGAGTTGCTTATTCGAGACAT 1550
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1281 GTCAACCGTGTGATTTGGAGCCCGGATGGTTCCCTATTCGGAGTTGCTTATTCAAGACAT 1340
Query 1551 ATTGTACAGCTATACTCTTATCACGGTGGTGAAGACATGAGGCAACACCTTGAGATTGAT 1610
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1341 ATTGTACAGCTATACTCTTATCACGGTGGTGAAGATATGAGGCAACACCTCGAGATTGAT 1400
Query 1611 GCTCATGTTGGCGGTGTCAATGACATTGCATTTTCCACTCCGAACAAGCAACTATGTGTT 1670
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1401 GCTCATGTTGGCGGTGTCAATGACATTGCATTCTCCACTCCGAACAAGCAACTATGTGTT 1460
Query 1671 ACTACTTGTGGTGATGACAAAACCATCAAGGTCTGGGATGCTGCAACGGGTGTAAAACGG 1730
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1461 ACTACTTGTGGTGATGACAAAACCATCAAGGTCTGGGATGCTGCAACGGGTGTAAAACGG 1520
Query 1731 TATACTTTTGAAGGCCATGAAGCTCCTGTTTACTCTATCTGCCCTCACTACAAGGAAAAC 1790
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1521 CATACTTTTGAAGGCCATGAAGCTCCTGTTTACTCTATCTGCCCTCACTACAAGGAAAAC 1580
Query 1791 ATTCAGTTTATCTTTTCAACTGCTCTTGACGGAAAAATAAAAGCATGGTTATATGATAAT 1850
|||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1581 ATTCAGTTCATCTTTTCAACTGCGCTTGACGGGAAAATAAAAGCATGGTTATATGATAAT 1640
Query 1851 ATGGGTTCTCGGGTTGACTACGAAGCTCCTGGTCGCTGGTGTACAACGATGGCCTACAGT 1910
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1641 ATGGGTTCTCGGGTTGACTATGAAGCTCCTGGTCGCTGGTGTACAACGATGGCCTACAGT 1700
Query 1911 GCTGATGGAACTAGGCTATTTTCTTGTGGGACGAGTAAAGATGGGGAATCGTTCATAGTT 1970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1701 GCTGATGGAACTAGGCTATTTTCTTGTGGGACGAGTAAAGATGGGGAATCGTTCATAGTT 1760
Query 1971 GAGTGGAATGAAAGCGAAGGAGCTGTGAAGAGAACTTATCAAGGATTCCACAAGCGTTCC 2030
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1761 GAGTGGAATGAAAGCGAAGGAGCAGTTAAGAGAACTTATCAAGGATTCCACAAGCGTTCT 1820
Query 2031 CTTGGTGTTGTCCAGTTTGATACTACTAAAAACCGTTATCTCGCTGCGGGTGACGACTTC 2090
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1821 CTTGGTGTTGTGCAGTTTGATACTACTAAAAACCGTTATCTCGCTGCGGGTGACGACTTC 1880
Query 2091 TCCATTAAGTTCTGGGATATGGACACCATACAGCTTTTGACTGCCATTGATGCTGATGGA 2150
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1881 TCCATTAAGTTCTGGGATATGGACACTATACAGCTTTTGACTGCCATTGATGCTGATGGA 1940
Query 2151 GGTCTCCAGGCAAGTCCACGGATCAGATTTAACAAGGAAGGCTCTCTCTTGGCTGTTTCC 2210
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1941 GGTCTCCAGGCAAGTCCACGGATCAGATTTAACAAGGAAGGCTCTCTCTTGGCCGTTTCT 2000
Query 2211 GCAAATGACAATATGATTAAGGTTATGGCAAACTCAGATGGTCTAAGGCTATTGCACACA 2270
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2001 GCAAATGACAATATGATTAAGGTTATGGCAAACTCAGATGGTCTTAGGCTATTGCACACA 2060
Query 2271 GTCGAGAACTTATCTTCTGAATCCTCCAAGCCTGCAATCAACAGCATTCCGATGGTAGAG 2330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||
Sbjct 2061 GTCGAGAACTTATCTTCTGAATCCTCCAAGCCTGCAATCAACAGCATCCCGGTGGCAGAG 2120
Query 2331 AGACCTGCCTCTGTCGTTTCCATCCCTGGAATGAATGGAGATTCGCGGAATATGGTGGAT 2390
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2121 AGACCTGCCTCTGTCGTTTCCATTCCTGGAATGAATGGAGATTCACGGAATATGGTGGAT 2180
Query 2391 GTGAAGCCAGTGATTACCGAAGAATCAAATGATAAGTCTAAGGTATGGAAGCTTACTGAA 2450
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2181 GTGAAGCCAGTGATCACTGAAGAATCAAATGATAAGTCTAAGGTATGGAAGCTTACTGAA 2240
Query 2451 GTCGGCGAACCCTCTCAGTGCCGTTCATTGAGACTCCCTGAGAATATGAGAGTCACCAAG 2510
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2241 CTCGGCGAACCCTCTCAATGCCGTTCATTGAGACTCCCTGAGAATATGAGAGCCACCAAG 2300
Query 2511 ATATCGAGATTGATTTTCACAAATTCGGGAAATGCAATTTTGGCATTGGCATCAAATGCT 2570
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2301 ATATCGAGATTGATTTTCACAAATTCGGGAAATGCAATTTTGGCATTGGCATCAAATGCT 2360
Query 2571 ATTCATCTGCTATGGAAGTGGCAGCGAAATGACCGTAATGCAACTGGGAAGGCAACGGCT 2630
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2361 ATTCATCTGCTATGGAAGTGGCAGCGAAATGACCGTAATGCAACTGGAAAGGCAACGGCT 2420
Query 2631 TCTTTACCTCCTCAGCAGTGGCAACCAGCGAGCGGGATCTTAATGACAAACGATGTGGCT 2690
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2421 TCTTTACCTCCTCAGCAGTGGCAACCAGCGAGCGGGATCTTAATGACAAACGATGTGGTT 2480
Query 2691 GAAACTAATCCAGAAGAAGCCGTACCCTGTTTTGCTTTATCGAAAAATGATTCCTACGTG 2750
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2481 GAAACTAATCCAGAAGAAGCCGTACCATGTTTTGCTTTATCCAAAAATGATTCCTACGTA 2540
Query 2751 ATGTCAGCATCGGGAGGAAAGATCTCTTTGTTTAATATGATGACGTTTAAGACAATGGCT 2810
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2541 ATGTCAGCATCGGGAGGAAAGATCTCTTTGTTTAATATGATGACGTTTAAGACAATGGCT 2600
Query 2811 ACTTTCATGCCGCCTCCTCCTGCCGCAACGTTTCTTGCTTTTCACCCTCAAGATAACAAT 2870
|||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2601 ACTTTCATGCCGCCGCCCCCTGCTGCAACGTTTCTTGCTTTTCACCCTCAAGATAACAAT 2660
Query 2871 ATCATTGCGATCGGGATGGATGACAGTACAATACAGATTTACAATGTTCGTGTTGATGAG 2930
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2661 ATCATTGCGATCGGGATGGATGATAGTACAATACAGATTTACAATGTTCGTGTTGATGAG 2720
Query 2931 GTTAAGAGCAAGCTTAAAGGACATTCTAAGAGAATAACCGGCCTCGCTTTCTCCAATGTA 2990
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2721 GTTAAGAGCAAGCTTAAAGGACATTCTAAGAGAATAACCGGCCTCGCTTTCTCCAATGTA 2780
Query 2991 TTAAACGTTCTGGTTTCGTCTGGAGCAGACGCTCAGCTTTGCGTATGGAACACGGATGGA 3050
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2781 CTAAACGTTCTGGTTTCGTCTGGAGCAGACGCTCAGCTTTGTGTATGGAACACGGATGGA 2840
Query 3051 TGGGAGAAGCAGAAAAGCAAGGTTCTGCAAATTCCACAGGGAAGATCCACGTCTTCTTTG 3110
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||
Sbjct 2841 TGGGAGAAGCAGAAAAGCAAGGTCCTGCAAATTCCACAGGGAAGATCGACGTCTGCTCTG 2900
Query 3111 TCAGACACGCGTGTTCAGTTTCATCAAGATCAAGTACACTTCCTTGTGGTCCATGAAACT 3170
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2901 TCAGACACGCGTGTTCAGTTTCATCAAGATCAAGTACACTTCCTTGTGGTCCATGAAACT 2960
Query 3171 CAGCTCGCTATATACGAAACAACCAAGCTTGAATGCATGAAACAGTGGCCTGTGCGTGAA 3230
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 CAGCTCGCTATATACGAAACAACCAAGCTTGAATGCATGAAACAGTGGCCTGTGCGTGAA 3020
Query 3231 TCAGCAGCTCCAATAACACATGCCACATTCTCATGTGATAGCCAATTGATATACACAAGT 3290
||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3021 TCATCAGCTCCAATCACACATGCCACATTCTCATGTGATAGCCAACTGATATACACAAGT 3080
Query 3291 TTCATGGACGCTACAATATGCGTCTTCAGCTCTGCAAACCTTCGATTGCGTTGCAGAGTC 3350
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3081 TTCATGGACGCTACGATATGTGTCTTCAGCTCTGCAAACCTTCGATTGCGTTGCAGAGTC 3140
Query 3351 AATCCCTCTGCATATTTGCCAGCTTCTCTCAGCAACTCGAATGTCCATCCACTGGTGATA 3410
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 3141 AATCCCTCTGCATATTTGCCAGCTTCTCTCAGCAACTCGAACGTCCATCCGCTGGTGATA 3200
Query 3411 GCGGCTCATCCGCAAGAATCCAACATGTTTGCAGTGGGTCTGTCAGACGGAGGGGTCCAT 3470
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3201 GCGGCTCATCCGCAAGAATCGAATATGTTTGCAGTGGGTCTGTCAGACGGAGGGGTCCAT 3260
Query 3471 ATATTCGAGCCGCTTGAGTCAGAAGGTAAATGGGGAGTAGCTCCACCGCCTGAAAATGGC 3530
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3261 ATATTCGAGCCGCTTGAGTCAGAAGGTAAATGGGGAGTAGCTCCACCGCCTGAAAATGGC 3320
Query 3531 TCAGCCAGCGCTGTCACGGCTACACCTTCCGTTGGAGCTTCTGCCTCTGACCAGCCTCAG 3590
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3321 TCAGCCAGCGCTGTTACGGCTACACCTTCCGTTGGAGCTTCTGCCTCTGACCAGCCTCAG 3380
Query 3591 AGATGAT 3597
|||||||
Sbjct 3381 AGATGAT 3387
> Ahg471773 jgi|Araly1|471773|fgenesh2_kg.1__1727__AT1G15750.2
Length=3851
Score = 2495 bits (1351), Expect = 0.0
Identities = 1848/2093 (88%), Gaps = 14/2093 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 233 CATGTCTTCTCTGAGCAGAGAGCTCGTCTTCTTGATCTTACAGTTT-TTAGATGAAGAGA 291
|||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 264 CATGTCTTCTCTTAGTAGAGAGCTCGTTTTCTTGATCTTACAGTTTCTT-GATGAAGAGA 322
Query 292 AGTTTAAAGAGACTGTTCATAAGCTTGAACAAGAATCTGGGTTTTTCTTCAATATGAAGT 351
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 323 AGTTTAAAGAGACTGTTCACAAGCTTGAACAAGAATCTGGGTTTTTCTTCAATATGAAGT 382
Query 352 ATTTTGAGGATGAGGTGCACAATGGTAACTGGGATGAGGTTGAGAAGTATCTCTCTGGTT 411
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 383 ATTTTGAGGATGAGGTGCACAATGGTAATTGGGATGAGGTTGAGAAGTATCTCTCTGGTT 442
Query 412 TTACTAAAGTTGATGATAATCGATACTCCATGAAGATTTTCTTCGAGATTAGGAAGCAGA 471
| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||
Sbjct 443 TCACTAAAGTAGATGATAATAGATACTCTATGAAGATATTCTTCGAGATAAGAAAGCAGA 502
Query 472 AGTATCTCGAGGCCTTGGATAGGCATGATCGTCCCAAGGCTGTCGATATTTTAGTCAAAG 531
||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |
Sbjct 503 AGTATCTCGAGGCTTTGGATAAGCATGATCGTCCCAAGGCTGTGGATATACTAGTGAAGG 562
Query 532 ATTTGAAAGTGTTTTCCACTTTTAATGAGGAGCTTTTCAAGGAAATCACTCAGCTCTTGA 591
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 563 ATTTGAAAGTGTTTTCAACTTTTAATGAGGAGCTTTTCAAGGAAATAACGCAGCTCTTGA 622
Query 592 CCTTAGAAAACTTCAGGGAGAACGAGCAGTTATCCAAGTATGGGGACACAAAGTCCGCCA 651
| || || |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |
Sbjct 623 CATTGGAGAACTTCCGGGAGAATGAACAGTTGTCCAAGTATGGGGACACCAAGTCTGCAA 682
Query 652 GAGCTATCATGTTGGTGGAACTCAAGAAGTTGATTGAAGCTAATCCTTTATTCCGTGATA 711
||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| || ||||||||||
Sbjct 683 GAGCTATAATGTTGGTGGAACTCAAAAAGCTGATTGAGGCGAATCCGTTGTTCCGTGATA 742
Query 712 AATTGCAGTTTCCTACCCTTAGAACTTCACGCCTCAGGACTCTGATTAATCAGAGCTTAA 771
|||||||||| ||||| ||||||| |||| | || |||||| |||| || ||||||||||
Sbjct 743 AATTGCAGTTCCCTACTCTTAGAAATTCAAGGCTGAGGACTTTGATCAACCAGAGCTTAA 802
Query 772 ATTGGCAACACCAGCTTTGTAAGAACCCAAGGCCTAATCCTGATATTAAGACTCTCTTTG 831
||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||
Sbjct 803 ATTGGCAGCATCAGCTTTGTAAAAATCCAAGGCCAAATCCAGATATAAAGACTCTTTTTG 862
Query 832 TCGATCATTCCTGCCGCC-TACCAAATGATGCACGAGCACCATCCCCTGTCAACAATCCG 890
| ||||| || || ||| | ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||
Sbjct 863 TGGATCACTCTTGTGGCCCT-CCAAATGGCGCACGGGCTCCATCGCCTGTGAACAATCCT 921
Query 891 CTTCTTGGATCATTACCAAAAGCCG-AGGGATTTCCTCCTCTAGGCGCACACGGGCCTTT 949
|| |||||| | ||||||| || | ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||
Sbjct 922 CTGCTTGGAGGAATACCAAAGGCTGGAGG-ATTTCCTCCTTTAGGCGCACACGGGCCATT 980
Query 950 TCAACCAACACCTTCTCCGGTTCCGACACCTCTTGCTGGTTGGATGTCTAGTCCTTCCTC 1009
||||||||| | || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 981 TCAACCAACGGCATCACCCGTTCCAACGCCTCTTGCTGGTTGGATGTCTAGTCCATCCTC 1040
Query 1010 TGTCCCACATCCAGCTGTGTCTGGAGGACCCATTGCTCTTGGTGCTCCATCCATCCAAGC 1069
|||||||||||||||||| || | |||| ||||||| ||||||| |||||| |||| |||
Sbjct 1041 TGTCCCACATCCAGCTGTCTCAGCAGGAGCCATTGCACTTGGTGGTCCATCAATCCCAGC 1100
Query 1070 AGCCTTGAAACACCCGAGAACTCCTCCTTCTAATTCCGCTGTAGACTATCCATCAGGTGA 1129
|| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| || |||| ||
Sbjct 1101 GGCATTGAAGCACCCGAGAACTCCTCCAACTAATGCTGCTTTAGACTACCCGTCAGCAGA 1160
Query 1130 CTCAGACCATGTCTCAAAGCGAACCAGACCTATGGGAATCTCTGACGAGGTGAGTCTAGG 1189
|| || ||||||||||| |||| || || |||||||| ||||||||||||| ||||||
Sbjct 1161 TTCTGAACATGTCTCAAAAAGAACAAGGCCAATGGGAATTTCTGACGAGGTGAATCTAGG 1220
Query 1190 TGTGAACATGTTACCAATGACATTCCCGGGGCAGGCTCATGGTCATAATCAAACCTTCAA 1249
|||||||||||||| ||| |||| | |||||||| |||||||||| || | |||||
Sbjct 1221 CGTGAACATGTTACCGATGTCATTTTCAGGGCAGGCCCATGGTCATACTCCGGCTTTCAA 1280
Query 1250 AGCACCTGATGACTTGCCCAAGACAGTTGCACGAACTTTGAGCCAAGGCTCATCTCCCAT 1309
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 1281 AGCACCTGATGACTTGCCCAAGACAGTTGCGCGAACTTTGAGTCAGGGCTCATCTCCCAT 1340
Query 1310 GAGCATGGATTTCCATCCTATTAAACAGACTCTGCTACTAGTTGGTACGAATGTAGGGGA 1369
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 1341 GAGCATGGATTTCCATCCAATTAAACAGACTCTGCTTCTAGTTGGTACAAATGTAGGTGA 1400
Query 1370 TATTGGGCTCTGGGAAGTCGGTTCTCGAGAACG-TCTAGTCCAGAAGACTTTCAAAGTTT 1428
||| ||||| |||||||| |||||||| ||| | | |||| |||||||| |||||||| |
Sbjct 1401 TATCGGGCTGTGGGAAGTTGGTTCTCGCGAAAGAT-TAGTACAGAAGACCTTCAAAGTCT 1459
Query 1429 GGGACTTGAGTAAATGTTCGATGCCCTTGCAGGCTGCTTTGGTGAAAGAACCTGTCGTTT 1488
|||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1460 GGGATTTGAGTAAATGTTCAATGCCCTTGCAGGCTGCTCTGGTGAAAGAACCTGTCGTTT 1519
Query 1489 CTGTCAACCGTGTGATTTGGAGCCCGGACGGTTCCCTATTCGGAGTTGCTTATTCGAGAC 1548
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| |||||||
Sbjct 1520 CTGTCAACCGTGTGATATGGAGCCCTGACGGTTCCTTGTTTGGAGTTGCTTACTCGAGAC 1579
Query 1549 ATATTGTACAGCTATACTCTTATCACGGTGGTGAAGACATGAGGCAACACCTTGAGATTG 1608
||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1580 ATATTGTGCAACTATACTCTTATCACGGAGGTGAAGACATGAGGCAACACCTGGAGATTG 1639
Query 1609 ATGCTCATGTTGGCGGTGTCAATGACATTGCATTTTCCACTCCGAACAAGCAACTATGTG 1668
||||||||||||| ||||| || || ||| | || || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1640 ATGCTCATGTTGGTGGTGTGAACGATATTTCCTTCTCGACTCCGAACAAGCAACTATGTG 1699
Query 1669 TTACTA-CTTGTGGTGATGACAAAACCATCAAGGTCTGGGATGCTGCAACGGGTGT-AAA 1726
| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||
Sbjct 1700 TAA-TAACTTGTGGTGATGACAAAACCATCAAGGTTTGGGACGCTGCAACAGGTGTCAAA 1758
Query 1727 ACGGTATACTTTTGAAGGCCATGAAGCTCCTGTTTACTCTATCTGCCCTCACTACAAGGA 1786
| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||||
Sbjct 1759 A-GGCATACTTTTGAAGGCCATGAAGCTCCTGTTTATTCCGTTTGTCCTCATTACAAGGA 1817
Query 1787 AAACATTCAGTTTATCTTTTCAACTGCTCTTGACGGAAAAATAAAAGCATGGTTATATGA 1846
|||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| |||||
Sbjct 1818 AAACATTCAGTTCATATTTTCAACAGCTCTTGATGGGAAAATTAAGGCATGGTTGTATGA 1877
Query 1847 TAATATGGGTTCTCGGGTTGACTACGAAGCTCCTGGTCGCTGGTGTACAACGATGGCCTA 1906
|||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||
Sbjct 1878 TAATATGGGTTCCCGAGTTGACTATGATGCACCTGGTCGCTGGTGTACTACAATGGCTTA 1937
Query 1907 CAGTGCTGATGGAACTAGGCTATTTTCTTGTGGGACGAGTAAAGATGGGGAATCGTTCAT 1966
||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||
Sbjct 1938 TAGTGCCGATGGTACTAGGCTATTCTCTTGTGGGACGAGTAAAGATGGAGAGTCTTTCAT 1997
Query 1967 AGTTGAGTGGAATGAAAGCGAAGGAGCTGTGAAGAGAACTTATCAAGGATTCCACAAGCG 2026
||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1998 TGTTGAGTGGAATGAAAGCGAAGGAGCTGTTAAAAGAACTTATCAAGGATTCCACAAGCG 2057
Query 2027 TTCCCTTGGTGTTGTCCAGTTTGATACTACTAAAAACCGTTATCTCGCTGCGGGTGACGA 2086
||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 2058 TTCTCTAGGTGTTGTGCAGTTTGATACAACTAAAAACCGTTATCTAGCTGCGGGTGATGA 2117
Query 2087 CTTCTCCATTAAGTTCTGGGATATGGACACCATACAGCTTTTGACTGCCATTGATG-CTG 2145
||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |
Sbjct 2118 CTTCTCCATCAAGTTCTGGGATATGGACACTGTACAGCTTTTAACTGCCATTGATGGC-G 2176
Query 2146 ATGGAGGTCTCCAGGCAAGTCCACGGATCAGATTTAACAAGGAAGGCTCTCTCTTGGCTG 2205
||||||| ||||||||||| || || ||| | |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2177 ATGGAGGCCTCCAGGCAAGCCCGCGTATCCGGTTTAACAAGGAAGGCTCTCTCTTGGCCG 2236
Query 2206 TTTCCGCAAATGACAATATGATTAAGGTTATGGCAAACTCAGATGGTCTAAGGCTATTGC 2265
| || | ||| || ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2237 TGTCTGGAAACGAGAATGTGATCAAGATTATGGCAAACTCAGATGGTCTAAGGCTATTGC 2296
Query 2266 ACACAGTCGAGAACTTATCTTCTGAATCCTCCAAGCCTGCAATCAACAGCATT 2318
|||| | |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 2297 ACACTTTTGAGAACATATCATCTGAATCCTCTAAGCCTGCAATAAACAGCATT 2349
Score = 1286 bits (696), Expect = 0.0
Identities = 1086/1274 (85%), Gaps = 27/1274 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 2342 TGTCGTTTCCATCCCTGGAATGAATGGAGATTCGCGGAATATGGTGGATGTGAAGCCAGT 2401
||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2406 TGTAGTTTCCATCCAAGGAATGAATGGAGATTCGCGGAATATGGTGGATGTGAAGCCAGT 2465
Query 2402 GATTACCGAAGAATCAAATGATAAGTCTAAGGTATGGAAGCTTACTGAAGTCGGCGAACC 2461
|||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||
Sbjct 2466 GATTACTGAAGAATCAAATGATAAGTCTAAGATATGGAAGCTTACTGAAGTCAGCGAGCC 2525
Query 2462 CTCTCAGTGCCGTTCATTGAGACTCCCTGAGAATATGAGAGTCACCAAGATATCGAGATT 2521
||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||
Sbjct 2526 TTCTCAATGCAGGTCACTGAGACTCCCTGAGAATCTGAGAGTCGCCAAGATATCAAGATT 2585
Query 2522 GATTTTCACAAATTCGGGAAATGCAATTTTGGCATTGGCATCAAATGCTATTCATCTGCT 2581
||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||
Sbjct 2586 GATTTTCACGAATTCGGGAAACGCTATTTTGGCTTTGGCATCAAACGCCATTCATCTTCT 2645
Query 2582 ATGGAAGTGGCAGCGAAATGACCGTAATGCAACTGGGAAGGCAACGGCTTCTTTACCTCC 2641
|||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||| ||
Sbjct 2646 ATGGAAATGGCAGCGGAATGAGCGCAACGCAACTGGAAAGGCGACAGCTTCTTTACCGCC 2705
Query 2642 TCAGCAGTGGCAACCAGCGAGCGGGAT-CTTAATGACAAACGATGTGGCTGAAACTAATC 2700
|||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||| || |||||||| |||
Sbjct 2706 TCAGCAGTGGCAACCAGCTAGTGGGATACT-AATGACTAACGACGTTGCTGAAACCAATA 2764
Query 2701 C-A--GAAGAAGCCGTACCCTGTTTTGCTTTATCGAAAAATGATTCCTACGTGATGTCAG 2757
| | || ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| || || |||||||
Sbjct 2765 CTACCGAGGAAGCTGTACCTTGTTTTGCTTTATCCAAGAATGATTCATATGTAATGTCAG 2824
Query 2758 CATCGGGAGGAAAGATCTCTTTGTTTAATATGATGACGTTTAAGACAATGGCTACTTTCA 2817
| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 2825 CCTCCGGAGGAAAGATCTCCTTATTTAACATGATGACGTTTAAGACAATGGCGACTTTTA 2884
Query 2818 TGCCGCCTCCTCCTGCCGCAACGTTTCTTGCTTTTCACCCTCAAGATAACAATATCATTG 2877
|||| || || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 2885 TGCCCCCACCGCCGGCTGCAACTTTTCTTGCTTTTCATCCTCAAGACAACAATATCATTG 2944
Query 2878 CGATCGGGATGGATGACAGTACAATACAGATTTACAATGTTCGTGTTGATGAGGTTAAGA 2937
| ||||| |||||||| || || || |||||||| || || |||||||||||||| ||||
Sbjct 2945 CTATCGGAATGGATGATAGCACGATTCAGATTTATAACGTCCGTGTTGATGAGGTGAAGA 3004
Query 2938 GCAAGCTTAAAGGACATTCTAAGAGAATAACCGGCCTCGCTTTCTCCAATGTATTAAACG 2997
| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| |
Sbjct 3005 GTAAGCTTAAAGGTCATTCAAAGAGAATAACTGGTCTTGCCTTCTCCAACGTATTAAATG 3064
Query 2998 T-TCTGGTTTCGTCTGGAGCAGACGCTCAGCTTTGCGTATGGAACACGGATGGATGGGAG 3056
| | ||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||||||
Sbjct 3065 TGT-TGGTTTCGTCTGGAGCAGATGCACAGCTCTGTGTTTGGAACACAGATGGATGGGAA 3123
Query 3057 AAGCAGAAAAGCAAGGTTCTGCAAATTCCACAGGGAAGATCCA--C-GT-CTTCTTTGTC 3112
||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| | || | ||| |
Sbjct 3124 AAGCAGAGAAGCAAGGTTTTGCCACTTCCACAGGGAAGA-CCAAACAGTGCACCTT---C 3179
Query 3113 AGACACGCGTGTTCAGTTTCATCAAGATCAAG-TACACTTCCTTGTGGTCCATGAAACTC 3171
||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| || || || || || |
Sbjct 3180 AGATACGCGTGTTCAGTTCCATCAAGATCAAGCT-CACTTCCTCGTTGTGCACGAGACGC 3238
Query 3172 AGCTCGCTATATACGAAACAACCAAGCTTGAATGCATGAAACAGTGGCCTGTGCGTGAAT 3231
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||
Sbjct 3239 AGCTCGCTATATACGAAACGACCAAGCTCGAATGCATGAAACAGTGGGCTGTACGAGAAT 3298
Query 3232 CAGCAGCTCCAATAACACATGCCACATTCTCATGTGATAGCCAATTGATATACACAAGTT 3291
|| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| | ||||
Sbjct 3299 CATTAGCTCCAATCACTCATGCCACATTCTCATGCGATAGCCAATTGGTCTACGCGAGTT 3358
Query 3292 TCATGGACGCTACAATATGCGTCTTCAGCTCTGCAAACCTTCGATTGCGTTGCAGAGTCA 3351
| ||||| || ||| | || || || ||||||||||| || ||||||||||| | ||||
Sbjct 3359 TTATGGATGCAACAGTTTGTGTATTTAGCTCTGCAAATCTAAGATTGCGTTGCCGGGTCA 3418
Query 3352 ATCCCT-CTGCATATTTGCCAGCTTCTCTCAGCAACTCGAATGTCCATCCACTGGTGATA 3410
| |||| |||| ||| | |||||| ||||||||| || || || |||||||| |||||
Sbjct 3419 A-CCCTTCTGCGTATCTACCAGCTAGTCTCAGCAATTCAAACGTACATCCACTAGTGATT 3477
Query 3411 GCGGCTCATCCGCAAGAATCCAA-CATGTTTGCAGTGGGTCTGTCAGACGGAGGG-GTCC 3468
||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| || |
Sbjct 3478 GCGGCACATCCGCAAGAA-CCAAACATGTTTGCAGTTGGTCTCTCAGACGG-GGGAGTGC 3535
Query 3469 ATATATTCGAGCCGCTTGAGTCAGAAGGTAAATGGGGAGTAGCTCCACC-GCCTGAAAAT 3527
| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||
Sbjct 3536 ACATATTCGAACCGCTCGAGTCTGAAGGTAAATGGGGAGTCGCTCCACCTGC-TGAGAAC 3594
Query 3528 GGCTCAGCCAGCGCTGTCA-CGGCTACACCTTCCGTTGGAGCTTCTGCCTCTGACCAGCC 3586
|| || || |||| | || | || |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||
Sbjct 3595 GGGTCGGCTAGCGGGG-CAGCCACTGCACCTTCCGTTGGAGCCTCTGCATCTGATCAGCC 3653
Query 3587 TCAGAGATGATCTG 3600
||||||||||||||
Sbjct 3654 TCAGAGATGATCTG 3667
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 143096474480
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5