BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G02560.1
Length=4095
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg484168 jgi|Araly1|484168|fgenesh2_kg.5__160__AT2G02560.1 6311 0.0
> Ahg484168 jgi|Araly1|484168|fgenesh2_kg.5__160__AT2G02560.1
Length=3982
Score = 6311 bits (3417), Expect = 0.0
Identities = 3758/3923 (96%), Gaps = 22/3923 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 AGTACGGAAATTTACAGTA--T-CTCCTCCATCtttttttACTTTCCTCAGAGCTCTCTC 60
|||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AGTACGGAAAATTACAGTATCTCCTCCTCCATCTTTTTTAACTTTCCTCAGAGCTCTCTC 60
Query 61 CTCTCCGCAACTTCCACCACCACCAAATCGGAACTCTCGGCGTTC-TACTCCGTCTCCGG 119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 61 CTCTCCGCAACTTCCACCACCACCAAATCGGAACTCTCGGCGTTCTTACTCCGTCTCCGG 120
Query 120 CGTTACCTCCGTCGATTTCATCTTCTCAGTTGGAAGGAGTGAATTGAGAAGGTCGGGCCA 179
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||
Sbjct 121 CGTTGCCTCCGTCGATTTCATCATCTCAGTTGGAAGGAGTGAATTGATAAGGACAGGCCA 180
Query 180 ATATGGCGAACTTACAAGTTTCTGGGATACTCGAAAAGTTTCAGATGACGGGTAAAGATA 239
| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 181 AGATGGCGAACTTACAAGTGTCTGGGATAATCGAAAAGGTTCAGATGACGGGTAAAGATA 240
Query 240 AAGATTACAGATACATGGCAACCTCTGATTTGCTTAATGAGTTGAATAAGGATTCCTTTA 299
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AAGATTATAGATACATGGCAACCTCTGATTTGCTTAATGAGTTGAATAAGGATTCCTTTA 300
Query 300 AAATCGAC-CTGGACTTGGAGGTGAGATTGTCGAGTATCATATTGCAACAGCTCGATGAT 358
|| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 AACTCGACAC-GGACTTGGAGATGAGATTGTCGAGTATCATATTGCAACAGCTCGATGAT 359
Query 359 GTGGCTGGTGATGTTTCTGGATTGGCTGTTAAATGTCTTGCTCCATTGGTGAAGAAGGTT 418
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 GTGGCTGGTGATGTTTCTGGATTGGCTGTTAAATGTCTTGCTCCATTGGTGAAGAAGGTT 419
Query 419 GGAGAAGAACGAATTGTTGAAATGACCAACAAGTTATGTGATAAACTGCTGCATGGGAAA 478
|||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 420 GGAGAAGAGCGAATTGTCGAAATGACCAACAAATTATGTGATAAACTGTTGCATGGGAAA 479
Query 479 GACCAGCATCGTGATACCGCAAGCATAGCTCTCAGGACTGTTGTCGCTCAAATTGCTCC- 537
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||
Sbjct 480 GACCAGCACCGTGATACCGCAAGCATAGCTCTCAGGACTGTTGTCGCCCAAGTTACTCCG 539
Query 538 TACGCTTGCTCCATCTATTCTTGTTACTCTAACACCACAAATGATAGGAGGAATAAGTGG 597
| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 540 T-CGCTTGCTCCATCTATTCTTGTTACTCTAACCCCACAAATGATAGGAGGGATAAGTGG 598
Query 598 CCAGGGAATGAGCTCAGGGATCAAGTGTGAATGTCTTGAGATCATGTGTGATGTTGTTCA 657
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 599 CCAGGGAATGAGCTCAGGGATTAAGTGTGAATGTCTTGAGATCATGTGTGATGTTGTTCA 658
Query 658 AAAATATGGAAGTTTAATGACGGATGATCACGAGAAGCTATTGAATACATTGTTATTGCA 717
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||
Sbjct 659 AAAATATGGAAGTTTAATGACGGATGATCACGAGAAGCTATTGAACACATTGCTATTGCA 718
Query 718 ATTGGGCTGTAACCAAGCCACAGTCAGGAAGAAGACTGTTACATGCATTGCTTCTCTTGC 777
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 719 ATTGGGCTGTAACCAAGCCACAGTCAGGAAGAAGACTGTTACATGCATTGCATCTCTTGC 778
Query 778 TTCCAGTCTGTCTGATGATTTGCTCGCGAAGGCGACTGTTGAAGTTGTGAAAAATCTAAG 837
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 779 CTCCAGTCTGTCTGATGATTTGCTCGCAAAGGCGACAGTTGAAGTTGTGAAAAATCTAAG 838
Query 838 TAACAGGAATGCAAAATCGGAGATTACACGTACCAATATTCAAATGATTGGAGCTTTATG 897
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 TAACAGGAATGCAAAATCTGAGATTACACGTACCAATATTCAAATGATTGGAGCTTTATG 898
Query 898 CCGTGCTGTTGGTTACCGGTTTGGCACTCATCTAGGTAACACTGTGCCAGTATTAATCAA 957
|||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 899 CCGTGCTGTTGGGTATCGATTTGGGACTCATCTAGGTAACACAGTGCCAGTATTAATCAA 958
Query 958 TTACTGCACTAGCGCTTCAGAAAATGACGAGGAGCTTCGCGAGTATAGCTTACAGGCACT 1017
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 TTACTGCACCAGCGCTTCAGAAAATGACGAGGAGCTTCGCGAGTATAGCTTACAGGCACT 1018
Query 1018 TGAAAGTTTCTTGCTACGATGTCCCAGGGACATCTCACCATATTGTGATGAAATTTTAAA 1077
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019 TGAAAGTTTCTTGCTACGATGTCCCAGGGATATCTCACCATATTGTGATGAAATTTTAAA 1078
Query 1078 TCTTACTTTAGAATATATTAGTTATGACCCGAATTTTACGGACAATATGGAGGAAGATAC 1137
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1079 TCTCACTTTGGAATATATTAGTTATGACCCGAATTTTACGGACAACATGGAGGAAGATAC 1138
Query 1138 TGATAATGAGACTCTTGAAGATGAAGAAGATGACGAGAGTGCAAATGAGTACACAGATGA 1197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139 TGATAATGAGACTCTTGAAGATGAAGAAGATGACGAGAGTGCAAATGAGTACACAGATGA 1198
Query 1198 TGAAGATGCCAGCTGGAAAGTTAGGAGAGCAGCGGCCAAATGCCTAGCAGGATTAATCGT 1257
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199 TGAGGATGCCAGCTGGAAAGTTAGGAGAGCAGCGGCGAAATGCCTAGCAGGATTAATCGT 1258
Query 1258 TTCGCGTTCTGAGATGCTCACTAAAGTATATCAAGAGGCCTGCCCGAAACTAATTGATAG 1317
||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TTCTCGTTCTGAGATGCTCGCTAAAGTATATCAAGAGGCCTGCCCGAAACTAATTGATAG 1318
Query 1318 ATTTAAGGAAAGGGAGGAAAATGTGAAGATGGATGTATTCAACACATTCATTGATCTGTT 1377
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1319 ATTTAAGGAAAGGGAGGAAAATGTGAAGATGGATGTATTCAACACATTCATTGATTTGTT 1378
Query 1378 GCGGCAAACGGGAAATGTTACAAAAGGTCAAACTGACACCGATGAATCAAGTCCAAAATG 1437
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1379 ACGGCAAACAGGAAATGTTACAAAAGGTCAAACTGACACTGATGAATCAAGTCCAAAATG 1438
Query 1438 GCTACTGAAGCAAGAAGTCTCAAAGATTGTGAAATCCATAAATAGGCAACTGCGCGAAAA 1497
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1439 GCTACTGAAGCAAGAAGTCTCAAAGATTGTAAAATCCATAAATAGGCAACTGCGTGAAAA 1498
Query 1498 GTCTGTTAAGACAAAGGTTGGAGCATTCTCTGTTTTGAGAGAACTTGTGGTTGTCCTGCC 1557
|||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||
Sbjct 1499 GTCTGTAAAGACAAAGGTTGGTGCATTCTCCGTTTTGAGAGAACTTGTTGTTGTCTTGCC 1558
Query 1558 TGACTGTCTTGCTGATCATATTGGTTCACTTGTTCCTGGAATTGAAAGGGCGCTAAATGA 1617
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1559 TGACTGCCTTGCTGATCATATTGGTTCACTTGTTCCTGGAATTGAAAGGGCGCTAAATGA 1618
Query 1618 TAAATCTTCTACATCAAACTTGAAAATTGAAGCTCTTGTCTTCACCAAATTAGTCTTGGC 1677
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1619 TAAATCTTCTACTTCAAACTTGAAAATTGAAGCTCTTGTCTTCACCAAATTAGTCTTGGC 1678
Query 1678 ATCACATGCGCCTCCTGTTTTTCACCCTTACATTAAGGCTCTTTCAAGTCCTGTTTTAGC 1737
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1679 ATCACATGCGCCTCCTGTTTTTCATCCGTACATTAAGGCTCTTTCAAGTCCTGTTTTAGC 1738
Query 1738 TGCTGTTGGTGAACGCTATTATAAGGTGACTGCTGAGGCATTAAGGGTTTGTGGGGAACT 1797
||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1739 TGCTGTTGGTGAACGCTATTACAAGGTGACCGCTGAGGCATTAAGGGTTTGTGGGGAACT 1798
Query 1798 TGTCAGAGTAGTACGCCCAAGTACTGCGGGAATGGGCTTTGATTTTAAACCGTTTGTTCA 1857
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1799 TGTCAGAGTAGTACGCCCAAGTACTGCGGGAATGGGCTTTGATTTTAAACCGTTTGTTCA 1858
Query 1858 TCCAATCTACAATGCGATAATGTCCCGCTTGACAAATCAAGATCAGGACCAGGAGGTCAA 1917
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1859 TCCAATCTACAATGCGATAATGTCGCGGTTGACAAATCAAGATCAGGACCAGGAAGTCAA 1918
Query 1918 GGAGTGTGCTATCACCTGCATGGGTCTTGTGATTTCAACATTTGGTGATCAACTGAGGGC 1977
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||
Sbjct 1919 GGAGTGTGCTATCACCTGTATGGGTCTTGTGATTTCAACATTTGGTGATCAGTTGAGAGC 1978
Query 1978 AGAGTTACCTTCATGCCTTCCTGTGCTTGTTGATCGAATGGGAAACGAAATCACTCGCCT 2037
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1979 AGAGTTACCTTCATGCCTTCCTGTGCTTGTTGATCGAATGGGAAACGAAATCACTCGCCT 2038
Query 2038 CACTGCAGTAAAGGCATTTTCTGTCATTGCCACTTCTCCGCTTCACATTAATCTATCATG 2097
||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||
Sbjct 2039 CACTGCAGTAAAGGCATTTGCAGTCATTGCCACTTCTCCCCTTCACATTGATCTATCATG 2098
Query 2098 TGTCTTGGACCATTTGATTGCAGAACTAACAGGATTCTTACGGAAGGCTAATCGGGTTCT 2157
||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2099 TGTCTTGGACCATTTGATTACTGAACTAACGGGATTCTTACGGAAGGCTAATCGGGTTCT 2158
Query 2158 AAGGCAAGCAACACTGATTACTATGAATACCTTGGTAACAGCCTATGGTGATAAAATTGG 2217
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2159 AAGGCAAGCAACACTGATTACTATGAATACCTTGGTAACAGCCTACGGTGATAAAATTGG 2218
Query 2218 TTCAGAAGCTTATGAAGTTATTCTTGTGGAGCTTTCATCTCTGATAAGTGTTTCAGACCT 2277
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2219 CTCAGATGCTTATGAAGTTATTCTTGTGGAGCTTTCATCTCTGATAAGTGTTTCGGACCT 2278
Query 2278 GCACATGACAGCTCTTGCACTCGAACTCTGCTGCACTCTGATGACTGGAAAGAGTTGTAG 2337
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2279 GCACATGACAGCTCTTGCACTCGAACTCTGCTGCACTCTGATGACTGGAAAGAGTTGTAG 2338
Query 2338 TGAAAATATCAGTTTGGCGGTCCGCAACAAAGTTCTTCCGCAGGCACTAACTTTAGTTAA 2397
|||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2339 TGAAAATATCAGTTTGGCAGTTCGCAACAAAGTTCTTCCGCAGGCACTAACTTTAGTTAA 2398
Query 2398 AAGCCCATTGCTCCAGGGTCAAGCACTTTTGGATCTGCAAAAATTCTTTGAAGCTCTGGT 2457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2399 AAGCCCATTGCTCCAGGGTCAAGCACTTTTGGATCTGCAAAAATTCTTTGAAGCTCTGGT 2458
Query 2458 GTATCATGCAAATACGAGTTTCTACACCTTGCTGGAATCATTGCTATCTTGTGCTAAGCC 2517
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2459 GTATCATGCAAATACGAGTTTCTACACCTTGCTGGAATCATTGCTATCTTGTGCTAAGCC 2518
Query 2518 TTCTCCTCAGTCTGGAGGTGTCCCAAAGCAAGCACTATATTCAATTGCACAGTGTGTGGC 2577
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2519 TTCTCCTCAGTCTGGAGGTGTCCCAAAGCAAGCATTATATTCAATTGCACAGTGTGTGGC 2578
Query 2578 GGTTCTTTGTCTCGCAGCGGGTGATAAGAATTGTTCGTCTACAGTTAAAATGCTCATGGA 2637
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 2579 GGTTCTTTGTCTCGCAGCGGGTGATAAGAATTGTTCGTCTACTGTTAAAATGCTTATGGA 2638
Query 2638 AATCCTTAAAGATGACAGCGGCACAAATTCAGCAAAACAACATCTTGCCCTGTTATCTCT 2697
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2639 AATCCTTAAAGATGACAGTGGCACAAATTCAGCAAAACAACATCTTGCCCTGTTATCTCT 2698
Query 2698 TGGTGAGATTGGGAGAAGGAAAGATCTCAGCGCACATGCTGGCATTGAAACAATCGTCAT 2757
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2699 TGGTGAGATTGGGAGAAGGAAAGATCTCAGCGCACATGCTGGCATTGAAACAATCGTCAT 2758
Query 2758 TGAGTCTTTCCAATCTCCTTTTGAAGAAATAAAGTCCGCAGCTTCATATGCTCTTGGAAA 2817
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2759 TGAGTCTTTCCAATCTCCGTTTGAAGAAATAAAGTCTGCAGCTTCTTATGCTCTTGGAAA 2818
Query 2818 CATTGCCGTTGGCAATCTATCCAATTATCTACCGTTTATATTGGACCAGATCGATAATCA 2877
|||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||
Sbjct 2819 CATTGCTGTTGGCAATCTATCCAATTATTTACCTTTTATCTTGAACCAGATTGATAATCA 2878
Query 2878 ACAGAAAAAACAATATATTCTCCTTCATTCACTCAAGGAGGTTATTGTGAGACAGTCTGT 2937
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2879 ACAGAAAAAACAGTATATTCTCCTTCATTCACTCAAGGAGGTTATTGTGAGGCAGTCTGT 2938
Query 2938 TGATAAAGCGGATTTCCAGAATTCCAGCGTTGAGAAAATACTTGCTTTACTGTTCAACCA 2997
||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2939 TGATAAAGCGGATTTTCAGAATTCCAGTGTTGAGAAAATACTTGCTTTACTGTTTAACCA 2998
Query 2998 CTGTGAAAGCGAGGAAGAAGGTGTAAGGAATGTTGTTGCTGAATGCTTGGGAAAAATGGC 3057
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2999 TTGTGAAAGCGAGGAAGAAGGTGTAAGGAATGTTGTTGCTGAATGCTTGGGAAAAATGGC 3058
Query 3058 TTTGATAGAGCCTGAGAAACTTGTTCCAGCACTTCAGGTCAGGACAACGAGCCCAGCTGC 3117
||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||
Sbjct 3059 TTTGATAGAGCCTGAGAAACTGGTTCCTGCTCTTCAGGTAAGGACGACGAGTCCAGCTGC 3118
Query 3118 TTTTACCCGTGCAACTGTTGTTACTGCTGTGAAATATTCAGTAGTGGAACGACCTGAGAA 3177
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3119 TTTTACTCGTGCAACTGTTGTTACCGCTGTGAAATATTCAGTAGTGGAACGACCTGAGAA 3178
Query 3178 ATTAGATGAAATCATCTTCCCTCAGATTTCTTCTTTCCTCATGCTAATCAAAGATGGTGA 3237
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 3179 ATTAGATGAAATCATCTTCCCTCAAATTTCTTCTTTCCTCATGCTGATTAAAGATGGTGA 3238
Query 3238 CCGTCATGTTAGGCGTGCAGCTGTCTCAGCTCTGAGTACTTTTGCTCATTATAAACCAAA 3297
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3239 CCGGCATGTTAGGCGTGCAGCTGTCTCAGCTCTGAGTACTTTTGCTCATTATAAACCAAA 3298
Query 3298 CCTTATTAAAGGACTTCTCCCTGAGTTGTTACCACTTCTTTATGATCAGACCGTTATTAA 3357
|||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3299 CCTTATTAAAGGACTTCTCCCTGAACTGTTACCGCTTCTTTATGATCAGACCGTTATTAA 3358
Query 3358 GAAAGAATTAATCAGGACGGTTGATCTTGGTCCATTCAAGCATGTTGTGGATGACGGGCT 3417
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 3359 GAAAGAATTAATTAGGACGGTTGATCTTGGCCCATTCAAGCATGTCGTTGATGACGGGCT 3418
Query 3418 CGAGCTGAGGAAAGCAGCTTTTGAGTGTGTGTTTACTCTGGTGGACAGCTGCCTTGATCA 3477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||
Sbjct 3419 TGAGCTGAGGAAAGCAGCTTTTGAGTGTGTGTTTACTCTGCTAGATAGCTGTCTTGATCA 3478
Query 3478 AGTTAATCCGTCTTCTTTCATTGTTCCTTTCCTCAAATCCGGATTAGAAGATCATTATGA 3537
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3479 AGTGAATCCGTCTTCTTTCATTGTTCCTTTCCTCAAATCCGGACTAGAAGATCATTATGA 3538
Query 3538 CCTGAAGATGCTTTGTCATCTTATACTCTCCTTACTAGCAGATAAATGCCCATCAGCCGT 3597
| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 3539 CTTGAAGATGCTTTGTCATCTTATACTCTCTTTGCTAGCAGATAAATCCCCCTCAGCCGT 3598
Query 3598 ACTTGCAGTACTGGATTCTCTTGTGGAACCACTGCATAAAACAATAAGCTTCAAGCCAAA 3657
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3599 ACTTGCTGTACTGGATTCTCTTGTGGAACCACTGCATAAAACAATAAGCTTCAAGCCAAA 3658
Query 3658 GCAAGATGCAGTGAAGCAAGAGCATGATCGTAATGAAGATATGATCAGAAGCGCTCTTCG 3717
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3659 GCAAGATGCAGTGAAGCAAGAGCATGATCGTAATGAAGATATGATCAGAAGTGCTCTTCG 3718
Query 3718 TGCTATATCGTCACTGGATCGTATCAATGGGGTGGACTATAGCCACAAGTTCAAGGGCTT 3777
||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3719 TGCTATATCATCACTTGATCGAATCAATGGGGTGGATTATAGCCACAAGTTCAAGGGCTT 3778
Query 3778 AATGGGTGATATGAAGAGGTCTGTACCATTGTGGGAGAAGTTTCAGACAATCCGGAATGA 3837
||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3779 AATGGGTGACATGAAGAGGTCTGTACCGTTGTGGGAAAAGTTTCAGACAATCCGGAACGA 3838
Query 3838 GTAAGTTTTTGTGTATGTTGTCTTCATTAAACAGTGATCGATGATGATTTTCTATTCCAA 3897
||||||||||||||||||||||| || | | || |||||| |||||||||||||
Sbjct 3839 GTAAGTTTTTGTGTATGTTGTCT--AT----C-G--AT-GATGAT--TTTTCTATTCCAA 3886
Query 3898 -AAAAGGGTACAGCGAAAGaaaa 3919
||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3887 GAAAAGGGTACAGCGAAA-AAAA 3908
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 154818206964
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5