BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G03380.1
Length=2070
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg896310 jgi|Araly1|896310|Al_scaffold_0005_276 3073 0.0
Ahg896306 jgi|Araly1|896306|Al_scaffold_0005_272 3073 0.0
> Ahg896310 jgi|Araly1|896310|Al_scaffold_0005_276
Length=2127
Score = 3073 bits (1664), Expect = 0.0
Identities = 1903/2021 (94%), Gaps = 6/2021 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 51 GAGATGCGTCTCTTTTACGACTATCAAAGAATTGATTTTGACTGAAGAGAATGATGGGTC 110
||||||| || | |||||||| ||| ||||||||| |||| | ||||| ||||||| |||
Sbjct 87 GAGATGCTTCACATTTACGACAATCCAAGAATTGAATTTGCCCGAAGACAATGATGAGTC 146
Query 111 TTCTCTGCATTACGCCGCTTCGAGCCCGTGCTTTCTCCTTCTAAGTAAGTGCACGAACAT 170
|||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 147 TTCTTTGAATTACGCCGCTTCGAGACCGTGCTTTCTCCTTCTAAGTAAGTGCACGAACAT 206
Query 171 TGATTCTCTAAGGCAATCTCACGGAGTTTTAACGGGAAATGGACTCATGGGTGATATCTC 230
|||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 207 TGATTCTCTAAGGCAAGCTCATGGGGTTTTAACGGGAAATGGACTCATGGGTGATATCTC 266
Query 231 GATTGCCACCAAGCTCGTTAGTCTATATGGTTTC-TTTGGGTATACTAAAGATGCACGCT 289
||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 267 AATTGCCACCAAGCTCGTGAGTCTATACGG-TTCTTTTGGGTATACTAAAGATGCACGCT 325
Query 290 TGGTGTTCGATCAAATTCCTGAACCAGATTTTTATTTATGGAAAGTCATGCTCAGATGTT 349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 326 TGGTGTTCGATCAAATTCCTGAACCAGATTTTTATTTATGGAAAGTCATCCTCAGATGTT 385
Query 350 ATTGCTTGAATAAAGAGAGTGTAGAAGTCGTAAAGTTGTATGATTTATTGATGAAGCATG 409
|||| ||||| || |||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 386 ATTGTTTGAACAACGAGAGTTTTGAAGTCATAAAGTTTTATGATTTATTGATGAAGCATG 445
Query 410 GATTCAGATATGATGATATTGTTTTCTCGAAAGCTTTGAAAGCGTGTACTGAGCTTCAGG 469
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 446 GATTCGGATATGATGATATTGTTTTCTCGAAAGCTTTGAAAGCGTGTACTGAGGTTCAGG 505
Query 470 ATTTAGACAATGGGAAGAAGATACATTGCCAGCTCGTTAAGGTGCCGAGTTTCGATAATG 529
|||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 506 ATTTAGACAATGGGAAGAAGATACATTGCCAGATTGTTAAGGTGCCGAGTTTCGATAATG 565
Query 530 TTGTGTTGACAGGTCTTCTAGATATGTATGCTAAGTGTGGAGAAATCAAGAGTGCTCATA 589
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 566 TTGTGTTGACAGGTCTTTTAGATATGTATGCTAAGTGTGGAGAAATCAAGAGTTCTTATA 625
Query 590 AGGTGTTT-AACGATATTACTTTGAGGAATGTGGTTTGTTGGACTTCGATGATTGCTGGG 648
| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 626 AAGTGTTTGAA-GATATTACTTTGAGGAATGTGGTTTGTTGGACTTCGATGATTGCTGGG 684
Query 649 TATGTTAAGAACGACTTGTGCGAAGAAGGGTTGGTTCTGTTTAATCGGATGAGGGAAAAC 708
|||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 685 TATGTTAAAAACGACTTGTACGAAGAAGGGTTGGTTCTGTTTAATCGGATGAGGGAAAAC 744
Query 709 AATGTTTTGGGTAATGAATATACTTACGGTACTCTAATAATGGCTTGTACAAAGCTTAGT 768
|||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||| ||
Sbjct 745 TCTGTTTTGGGTAATGAATATACTTATGGTACTCTAGTGATGGCTTGCACAAAGCTTCGT 804
Query 769 GCTTTACATCAAGGAAAGTGGTTTCATGGTTGTTTGGTTAAGAGTGGTATAGAGCTCAGC 828
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 805 GCTTTACATCAAGGAAAGTGGTTTCATGGTTGTTTGATTAAGAGTGGTATAGAGCTCAGC 864
Query 829 TCATGTTTGGTGACATCTCTTCTCGATATGTATGTTAAGTGTGGTGACATAAGCAATGCA 888
||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 865 TCATGCTTGGTGACATCTCTTTTAGATATGTATGTTAAGTGTGGTGACATAAGCAATGCA 924
Query 889 CGTCGGGTGTTTAATGAGCATTCTCATGTGGATCTTGTCATGTGGACAGCTATGATTGTG 948
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 925 CGTCGGGTGTTTAATGAGCATTCTCATGTGGATCTCGTCATGTGGACAGCTATGATTGTG 984
Query 949 GGGTATACCCATAACGGAAGTGTGAATGAGGCGCTGAGCTTGTTTCAGAAAATGAAG-GG 1007
|| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 985 GGATACACCCATAACGGAAGTGTGAATGAGGCGCTGAGCTTGTTTCAGAAAATGA-GTGG 1043
Query 1008 GGTTGAAATCAAGCCTAATTGTGTTACCATTGCAAGTGTCTTATCGGGTTGCGGTCTGAT 1067
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |
Sbjct 1044 GGTTGGAATCAAGCCTAATTGTGTTACCATTGCAAGTGTCTTATCGGGGTGCGGTTTGGT 1103
Query 1068 TGAGAATCTTGAACTGGGAAGATCAGTTCATGGCCTCTCCATCAAAGTTGGTATTTGGGA 1127
|| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1104 TGGGAATCTTGAACTGGGAAGATCAATTCATGGCCTCTCCATCAAAGTTGGTATTTGGGA 1163
Query 1128 TACAAATGTTGCAAATGCTCTGGTTCACATGTACGCCAAGTGTTACCAGAATAGAGATGC 1187
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1164 CACAAATGTTGCAAATGCTCTGGTTCACATGTACGCCAAGTGTTACCAGAATAGAGATGC 1223
Query 1188 TAAATATGTGTTTGAAATGGAGTCAGAGAAAGATATAGTTGCTTGGAATTCTATAATTTC 1247
||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1224 TAAGTATGTGTTTGAAATGGAGTCGGAAAAAGATATTGTTGCTTGGAATTCTATAATTTC 1283
Query 1248 CGGGTTTTCACAAAACGGCTCTATCCATGAAGCTTTGTTTCTTTTCCATCGCATGAATTC 1307
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 1284 TGGGTTTTCGCAAAACGGCTCTATCCATGAAGCTTTGTTTCTGTTCCATCGCATGAATAC 1343
Query 1308 AGAATCTGTGACGCCTAATGGTGTAACAGTTGCGAGTCTTTTTTCAGCCTGTGCTTCCCT 1367
|||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 1344 AGAATCCGTGATGCCTAATGGTGTAACAGTTGCGAGTCTCTTCTCAGCCTGTGCTTCCCT 1403
Query 1368 TGGGTCTCTAGCTGTAGGTTCATCACTTCATGCCTATTCCGTGAAATTGGGTTTCCTGGC 1427
|||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1404 TGGGTCTCTAGCCATAGGTTCCTCGCTTCATGCTTATTCCGTGAAATTGGGTTTCTTGGC 1463
Query 1428 ATCATCCAGTGTTCATGTTGGTACTGCACTCCTGGACTTCTATGCCAAATGTGGGGATCC 1487
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1464 ATCATCCAGTGTTCATGTTGGTACTGCACTCCTGGACTTCTATGCCAAATGTGGGGATGC 1523
Query 1488 CCAATCTGCCCGTCTCATCTTCGATACTATAGAGGAGAAAAACACAATCACATGGAGTGC 1547
| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1524 CGAATCTGCTCGTCTCATCTTCGATACCATAGAAGAGAAAAACACAATCACATGGAGTGC 1583
Query 1548 TATGATCGGAGGCTATGGAAAGCAAGGGGATACAATAGGGTCCCTTGAGCTATTTGAGGA 1607
|||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1584 TATGATCGGAGGCTATGGAAAGCAAGGGGACACAAAAGGGTCCCTTGAGCTATTTGAGGA 1643
Query 1608 GATGCTGAAAAAGCAACAAAAACCCAACGAATCAACCTTCACATCTATTTTATCAGCTTG 1667
||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||
Sbjct 1644 GATGCTGAAGAAGCAACAAAAGCCGAATGAATCAACCTTTACATCTGTTTTATCAGCTTG 1703
Query 1668 TGGCCACACAGGGATGGTTAATGAAGGGAAGAAGTACTTCAGCTCAATGTACAAAGATTA 1727
| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1704 TAGTCATACAGGGATGGTTAACGAAGGGAAGAAGTACTTCAGCTCAATGTACAAAGATTA 1763
Query 1728 TAACTTCACGCCTTCAACAAAACACTACACATGTATGGTTGATATGTTAGCTCGAGCAGG 1787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1764 CAACTTCACGCCTTCAACAAAACACTACACATGTATGGTTGATATGCTAGCTCGAGCAGG 1823
Query 1788 TGAGCTTGAGCAAGCCTTAGATATCATCGAAAAGATGCCAATCCAACCAGACGTGAGATG 1847
||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1824 TGAGCTTGAACAAGCATTAGACATCATCGAGAAGATGCCGATCCAGCCAGACGTGAGATG 1883
Query 1848 TTTCGGGGCATTTCTACACGGATGTGGAATGCATTCAAGATTTGATCTTGGGGAGATTGT 1907
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1884 TTTCGGAGCATTTCTCCACGGATGTGGAATGCATTCAAGATTTGATCTTGGAGAGATTGT 1943
Query 1908 GATTAAGAAGATGCTTGATTTACATCCTGATGATGCCTCTTATTATGTTCTCGTCTCTAA 1967
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||
Sbjct 1944 GATTAAGAAGATGCTTGATTTACATCCTGATGATGCCTCTTATTATGTCCTTGTATCTAA 2003
Query 1968 TTTGTATGCATCGGATGGACGGTGGAATCAGGCTAAAGAAGTGAGAAATCTGATGAAGCA 2027
||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2004 TTTGTATGCATCGGATGGACGATGGAGCCAGGCTAAAGAAGTGAGAAATCTGATGAAGCA 2063
Query 2028 AAGAGGTCTGAGCAAGATTGCAGGCCATAGCACAATGGAAT 2068
|||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2064 AAGAGGCCTGAGCAAGATTGCAGGCCATAGCATAATGGAAT 2104
> Ahg896306 jgi|Araly1|896306|Al_scaffold_0005_272
Length=2127
Score = 3073 bits (1664), Expect = 0.0
Identities = 1903/2021 (94%), Gaps = 6/2021 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 51 GAGATGCGTCTCTTTTACGACTATCAAAGAATTGATTTTGACTGAAGAGAATGATGGGTC 110
||||||| || | |||||||| ||| ||||||||| |||| | ||||| ||||||| |||
Sbjct 87 GAGATGCTTCACATTTACGACAATCCAAGAATTGAATTTGCCCGAAGACAATGATGAGTC 146
Query 111 TTCTCTGCATTACGCCGCTTCGAGCCCGTGCTTTCTCCTTCTAAGTAAGTGCACGAACAT 170
|||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 147 TTCTTTGAATTACGCCGCTTCGAGACCGTGCTTTCTCCTTCTAAGTAAGTGCACGAACAT 206
Query 171 TGATTCTCTAAGGCAATCTCACGGAGTTTTAACGGGAAATGGACTCATGGGTGATATCTC 230
|||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 207 TGATTCTCTAAGGCAAGCTCATGGGGTTTTAACGGGAAATGGACTCATGGGTGATATCTC 266
Query 231 GATTGCCACCAAGCTCGTTAGTCTATATGGTTTC-TTTGGGTATACTAAAGATGCACGCT 289
||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 267 AATTGCCACCAAGCTCGTGAGTCTATACGG-TTCTTTTGGGTATACTAAAGATGCACGCT 325
Query 290 TGGTGTTCGATCAAATTCCTGAACCAGATTTTTATTTATGGAAAGTCATGCTCAGATGTT 349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 326 TGGTGTTCGATCAAATTCCTGAACCAGATTTTTATTTATGGAAAGTCATCCTCAGATGTT 385
Query 350 ATTGCTTGAATAAAGAGAGTGTAGAAGTCGTAAAGTTGTATGATTTATTGATGAAGCATG 409
|||| ||||| || |||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 386 ATTGTTTGAACAACGAGAGTTTTGAAGTCATAAAGTTTTATGATTTATTGATGAAGCATG 445
Query 410 GATTCAGATATGATGATATTGTTTTCTCGAAAGCTTTGAAAGCGTGTACTGAGCTTCAGG 469
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 446 GATTCGGATATGATGATATTGTTTTCTCGAAAGCTTTGAAAGCGTGTACTGAGGTTCAGG 505
Query 470 ATTTAGACAATGGGAAGAAGATACATTGCCAGCTCGTTAAGGTGCCGAGTTTCGATAATG 529
|||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 506 ATTTAGACAATGGGAAGAAGATACATTGCCAGATTGTTAAGGTGCCGAGTTTCGATAATG 565
Query 530 TTGTGTTGACAGGTCTTCTAGATATGTATGCTAAGTGTGGAGAAATCAAGAGTGCTCATA 589
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 566 TTGTGTTGACAGGTCTTTTAGATATGTATGCTAAGTGTGGAGAAATCAAGAGTTCTTATA 625
Query 590 AGGTGTTT-AACGATATTACTTTGAGGAATGTGGTTTGTTGGACTTCGATGATTGCTGGG 648
| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 626 AAGTGTTTGAA-GATATTACTTTGAGGAATGTGGTTTGTTGGACTTCGATGATTGCTGGG 684
Query 649 TATGTTAAGAACGACTTGTGCGAAGAAGGGTTGGTTCTGTTTAATCGGATGAGGGAAAAC 708
|||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 685 TATGTTAAAAACGACTTGTACGAAGAAGGGTTGGTTCTGTTTAATCGGATGAGGGAAAAC 744
Query 709 AATGTTTTGGGTAATGAATATACTTACGGTACTCTAATAATGGCTTGTACAAAGCTTAGT 768
|||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||| ||
Sbjct 745 TCTGTTTTGGGTAATGAATATACTTATGGTACTCTAGTGATGGCTTGCACAAAGCTTCGT 804
Query 769 GCTTTACATCAAGGAAAGTGGTTTCATGGTTGTTTGGTTAAGAGTGGTATAGAGCTCAGC 828
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 805 GCTTTACATCAAGGAAAGTGGTTTCATGGTTGTTTGATTAAGAGTGGTATAGAGCTCAGC 864
Query 829 TCATGTTTGGTGACATCTCTTCTCGATATGTATGTTAAGTGTGGTGACATAAGCAATGCA 888
||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 865 TCATGCTTGGTGACATCTCTTTTAGATATGTATGTTAAGTGTGGTGACATAAGCAATGCA 924
Query 889 CGTCGGGTGTTTAATGAGCATTCTCATGTGGATCTTGTCATGTGGACAGCTATGATTGTG 948
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 925 CGTCGGGTGTTTAATGAGCATTCTCATGTGGATCTCGTCATGTGGACAGCTATGATTGTG 984
Query 949 GGGTATACCCATAACGGAAGTGTGAATGAGGCGCTGAGCTTGTTTCAGAAAATGAAG-GG 1007
|| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 985 GGATACACCCATAACGGAAGTGTGAATGAGGCGCTGAGCTTGTTTCAGAAAATGA-GTGG 1043
Query 1008 GGTTGAAATCAAGCCTAATTGTGTTACCATTGCAAGTGTCTTATCGGGTTGCGGTCTGAT 1067
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |
Sbjct 1044 GGTTGGAATCAAGCCTAATTGTGTTACCATTGCAAGTGTCTTATCGGGGTGCGGTTTGGT 1103
Query 1068 TGAGAATCTTGAACTGGGAAGATCAGTTCATGGCCTCTCCATCAAAGTTGGTATTTGGGA 1127
|| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1104 TGGGAATCTTGAACTGGGAAGATCAATTCATGGCCTCTCCATCAAAGTTGGTATTTGGGA 1163
Query 1128 TACAAATGTTGCAAATGCTCTGGTTCACATGTACGCCAAGTGTTACCAGAATAGAGATGC 1187
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1164 CACAAATGTTGCAAATGCTCTGGTTCACATGTACGCCAAGTGTTACCAGAATAGAGATGC 1223
Query 1188 TAAATATGTGTTTGAAATGGAGTCAGAGAAAGATATAGTTGCTTGGAATTCTATAATTTC 1247
||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1224 TAAGTATGTGTTTGAAATGGAGTCGGAAAAAGATATTGTTGCTTGGAATTCTATAATTTC 1283
Query 1248 CGGGTTTTCACAAAACGGCTCTATCCATGAAGCTTTGTTTCTTTTCCATCGCATGAATTC 1307
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 1284 TGGGTTTTCGCAAAACGGCTCTATCCATGAAGCTTTGTTTCTGTTCCATCGCATGAATAC 1343
Query 1308 AGAATCTGTGACGCCTAATGGTGTAACAGTTGCGAGTCTTTTTTCAGCCTGTGCTTCCCT 1367
|||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 1344 AGAATCCGTGATGCCTAATGGTGTAACAGTTGCGAGTCTCTTCTCAGCCTGTGCTTCCCT 1403
Query 1368 TGGGTCTCTAGCTGTAGGTTCATCACTTCATGCCTATTCCGTGAAATTGGGTTTCCTGGC 1427
|||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1404 TGGGTCTCTAGCCATAGGTTCCTCGCTTCATGCTTATTCCGTGAAATTGGGTTTCTTGGC 1463
Query 1428 ATCATCCAGTGTTCATGTTGGTACTGCACTCCTGGACTTCTATGCCAAATGTGGGGATCC 1487
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1464 ATCATCCAGTGTTCATGTTGGTACTGCACTCCTGGACTTCTATGCCAAATGTGGGGATGC 1523
Query 1488 CCAATCTGCCCGTCTCATCTTCGATACTATAGAGGAGAAAAACACAATCACATGGAGTGC 1547
| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1524 CGAATCTGCTCGTCTCATCTTCGATACCATAGAAGAGAAAAACACAATCACATGGAGTGC 1583
Query 1548 TATGATCGGAGGCTATGGAAAGCAAGGGGATACAATAGGGTCCCTTGAGCTATTTGAGGA 1607
|||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1584 TATGATCGGAGGCTATGGAAAGCAAGGGGACACAAAAGGGTCCCTTGAGCTATTTGAGGA 1643
Query 1608 GATGCTGAAAAAGCAACAAAAACCCAACGAATCAACCTTCACATCTATTTTATCAGCTTG 1667
||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||
Sbjct 1644 GATGCTGAAGAAGCAACAAAAGCCGAATGAATCAACCTTTACATCTGTTTTATCAGCTTG 1703
Query 1668 TGGCCACACAGGGATGGTTAATGAAGGGAAGAAGTACTTCAGCTCAATGTACAAAGATTA 1727
| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1704 TAGTCATACAGGGATGGTTAACGAAGGGAAGAAGTACTTCAGCTCAATGTACAAAGATTA 1763
Query 1728 TAACTTCACGCCTTCAACAAAACACTACACATGTATGGTTGATATGTTAGCTCGAGCAGG 1787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1764 CAACTTCACGCCTTCAACAAAACACTACACATGTATGGTTGATATGCTAGCTCGAGCAGG 1823
Query 1788 TGAGCTTGAGCAAGCCTTAGATATCATCGAAAAGATGCCAATCCAACCAGACGTGAGATG 1847
||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1824 TGAGCTTGAACAAGCATTAGACATCATCGAGAAGATGCCGATCCAGCCAGACGTGAGATG 1883
Query 1848 TTTCGGGGCATTTCTACACGGATGTGGAATGCATTCAAGATTTGATCTTGGGGAGATTGT 1907
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1884 TTTCGGAGCATTTCTCCACGGATGTGGAATGCATTCAAGATTTGATCTTGGAGAGATTGT 1943
Query 1908 GATTAAGAAGATGCTTGATTTACATCCTGATGATGCCTCTTATTATGTTCTCGTCTCTAA 1967
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||
Sbjct 1944 GATTAAGAAGATGCTTGATTTACATCCTGATGATGCCTCTTATTATGTCCTTGTATCTAA 2003
Query 1968 TTTGTATGCATCGGATGGACGGTGGAATCAGGCTAAAGAAGTGAGAAATCTGATGAAGCA 2027
||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2004 TTTGTATGCATCGGATGGACGATGGAGCCAGGCTAAAGAAGTGAGAAATCTGATGAAGCA 2063
Query 2028 AAGAGGTCTGAGCAAGATTGCAGGCCATAGCACAATGGAAT 2068
|||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2064 AAGAGGCCTGAGCAAGATTGCAGGCCATAGCATAATGGAAT 2104
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 77856460780
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5