BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G05120.1
Length=4018
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg480129 jgi|Araly1|480129|fgenesh2_kg.3__2830__AT2G05120.1 4440 0.0
> Ahg480129 jgi|Araly1|480129|fgenesh2_kg.3__2830__AT2G05120.1
Length=3786
Score = 4440 bits (2404), Expect = 0.0
Identities = 2622/2728 (96%), Gaps = 12/2728 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 49 AAAACTCCACGCAATCGAGTCCCTCCGCCGGATTCTCCAGTAACTCCGGCAACTCAAAAT 108
||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 32 AAAGCT-CACGCAATCGAGTCGCTCCACCGGATTCTCCAGTAACTCCGGCAACTCAAAAT 90
Query 109 CGGAACAATTTCATCTCAGATCGTCCCGCCACTGGAACTCCTGCTCCTTGGGCTCCTCGT 168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 91 CGGAACAATTTCATCTCAGATCGTCCCGCCACTGGAACTCCTGCTCCTTGGGCTCCTCGT 150
Query 169 TTATCGGTTCTAGCTAGAGTTTCTCCTGGAAACAATGGTGACAA-AGGAGTTGATTCAGA 227
||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||
Sbjct 151 TTATCTGTTCTCGCTAGAGTTTCTCCTGGGAACAATGGTGA-AAGAGGAGATGATTCAGA 209
Query 228 TCAATTAAAGCCTGTATTCGTTGGAGAGTTTCCTCAATTGTTGCGCGATGAACAAAGTTA 287
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 210 TCAATTAAAGCCTGTATTCGTTGGAGAGTTTCCTCAATTGTTGCGAGATGAACAAAGTTA 269
Query 288 TCCTGGTGATGCTTGTGTATCCGGTGGAATGGATAAAGAGACCTGTCTTTCTTGGTTTAT 347
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |
Sbjct 270 TCCTGGTGATGCTTGTGTATCTGGTGGAATGGATAAAGAAACGTGTCTTTCTTGGTTTGT 329
Query 348 TACTGGAAGTAAAGTTTTTGTATGGAGTCATTTGACGACTTTACCGTCGAGAAAATGTGT 407
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 330 TACTGGAAGTAAACTTTTTGTATGGAGTCATTTGACGACGTTACCGTCGAGAAAATGTGT 389
Query 408 TGTTCTTGAACTTCCTGTTGTTGTTTTGGTTAATGAAGAGTCTGGTAGTGGTTTACAAGA 467
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 390 TGTTCTTGAACTTCCTGTTGGTGTTTTGGTTAATGAAGAGTCTGGTAGTGGTTTACAAGA 449
Query 468 TGGGAAAAGTTGGTTGGTTAATGTTGTATCTTGGGATACTTCTGCTGGTGCAGCTACGAG 527
|||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 450 TGGGAAAAGTTGGTTGATTAGTGTTGTGTCTTGGGATACTTCTGCTGGTGCAGCTACGAG 509
Query 528 GGCTTCTCGGTCTCGTAGTCCTGTTGGTGTTGTTATGTGTAATAGAAAAACTCGAGCTGT 587
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 510 AGCTGCTCGGTCTCGTAGTCCTGTTGGTGTTGTTATGTGTAATAGAAAAACTCGAGCTGT 569
Query 588 TGTGTATTGGTCAGACATATTTTCTGGTCAGGAAGCTGCACCT-GCAGAAAAGGCTC-GT 645
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||| |
Sbjct 570 TGTGTATTGGTCAGACATCTTTTCTGGTCAGGAAGCTGCCCCTGGTAGAAAAAGCTCAG- 628
Query 646 CATTTAATTAAGCGACAAAGCAATGGGATTAGAAGCAGTAGAGCTGAAAATAGCGATCTC 705
|||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 629 CATTCAA-CAAGCGACAAAGCAATGGGATTAGAAGCAGTAGAGCTGAATATAGCAATCTC 687
Query 706 AATTCTTTGATTACTACTGCAGTAGCTGCAGCTGAGCGTCTTTGTATTGCTATTGCTTGC 765
||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 688 AATTCTTTGATTACTACTGCAGTTGCTACGGCTGAGCGCCTTTGTATTGCTATTGCTTGC 747
Query 766 AGTTCTAACGGTGAGCTATGGCAATTTACCTGTAGCCCTACAGGCGTTAAAAGTAATCAA 825
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 748 AGTTCTAATGGTGAGCTATGGCAATTTACCTGTAGCCCCACAGGCGTTAAAAGTAATCAA 807
Query 826 GTACAGTTGAACATTAGCTCTTCCTCTGTAAGTGAGGGGTATCCAAGGTCCTTGATTTGG 885
|||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 808 GTACAGGTGAACATCAGCTCTTCCTCTGTAAGTGAGGGGTATCCAAGGTCCTTGATCTGG 867
Query 886 CGGTTTTCGCAAGGATTGGCAAGAGAGTCGTGTTGGGAATTTCTTATGTTGACAGACTGT 945
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||
Sbjct 868 CGGTTTTCGCAAGGATTGGCAAGAGAGTCGTGTTGGGAATTTTTTATGCTGACAGATTGT 927
Query 946 GACATACATTGTTTTACTATTGAGCCTTATCCTGATCTGACTGTTTCAGAAGTCTGGCAA 1005
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 928 GACATACATTGTTTTACTATTGAACCTTATCCTGATCTGACTGTTTCAAAAGTCTGGCAA 987
Query 1006 CATGAGATTGTTGGCACTGATGGTGATTCTGGTATCAAGAAAGATATAGCTAGTCAAAAG 1065
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 988 CATGAGATTGTTGGCACTGATGGTGATTCTGGTATCAAGAAAGATATAGCAAGTCAAAAG 1047
Query 1066 CAGATTTGGCCTCTAGATTTGCAGGTAGATGATCAGGGTAAAGTGATTACAGTTCTTGTT 1125
|| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1048 CAAATTTGGCCTCTAGATTTGCAGGT--A-GATCAGGGTAAAGTGATTACAGTTCTTGTT 1104
Query 1126 GCCACTATCTGCATGGACCGCGCCAGCAGTTCTAGCTATACACAATATTCGCTTTTAACC 1185
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105 GCCACTATCTGCATGGACCGCGCCAGCAGTTCTAGCTATACACAATATTCGCTTTTAACC 1164
Query 1186 CTACAACATAAATCTGAGATGAGATTTGCAGATGGGAGAGAGGAAAAGGTTCTGGAGAAA 1245
| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1165 TTGCAACATAAATCTGAGATGAGATTTGCTGATGGGAGAGAGGAAAAGGTTCTGGAGAAA 1224
Query 1246 CAAGGTCCAATCCAAGTCATAATCCCAAAAGCAAGAGTAGAGGATAAAGACTTCTTATTC 1305
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 1225 CAAGCTCCAATCCAAGTCATAATCCCAAAAGCAAGAGTGGAAGATAAAGACTTCTTATTC 1284
Query 1306 TCTATGAGACTCAGAGTTGGTGGTAGACCCCCAGGGTCAGCTATAATTCTTTCAGGTGAT 1365
||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1285 TCTATGAAACTTAGAGTTGGTGGTAGGCCCCCAGGGTCAGCTATAATTCTTTCAGGTGAT 1344
Query 1366 GGAACAGCCACAGTTTGCTACTGTCATGGAAGTTCTACCCGGCTCTATAAGTTTGATTTA 1425
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1345 GGAACAGCCACAGTTTGCTACTGTCATGAAAGTTCTACCCGGCTCTATAAGTTTGATTTA 1404
Query 1426 CCTTATGATGCTGGCAAGGTTTTGGATGCTTCAGTTCTTTCCTCCACTGATGAACATGAA 1485
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405 CCTTATGATGCTGGCAAGGTCTTGGATGCTTCAGTTCTTTCCTCCACTGATGAACATGAA 1464
Query 1486 TATGGTGCATGGACTGTACTAACTGAGAAAGCAGGAGTGTGGGCAATACCAGAGAAAGCA 1545
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 1465 TATGGTGCATGGACTGTGCTAACTGAGAAAGCAGGAGTATGGGCAATACCAGAGAATGCA 1524
Query 1546 GTTGTGCTTGGTGGAGTCGAACCTCCAGAGAGAAGTCTGTCACGCAAAAATAGCTCCAAT 1605
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1525 GTTGTGCTTGGTGGAGTCGAACCTCCAGAGAGAAGTTTGTCTCGCAAAAATAGCTCCAAT 1584
Query 1606 GAGAGGTCTACACGAGATGAGACAAGGGTAACACCATATGGTGTTGATAGAACTGCC-GG 1664
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 1585 GAGAGGTCTACAGGAGATGAGACAAGGATAACACCATATGGCATTGATAGAACTGCCGGG 1644
Query 1665 AAGGGAGAATTCTGACATACAGAATATTGAAGACAAAGGAAACCCTAAAATGGGTTTTAC 1724
|| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 1645 AA-GGAGAATTCTGACGTACAGAATAGTGGAGACAAAGGAAATCCTAAAATGGGATTTAC 1703
Query 1725 TCGTCAAACAGCCCGTGATGAGGAATCAGAAGCTTTGCTTGGCCAGCTCTTTGAGGGGTT 1784
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1704 TCGTCAAACAGCCCGTGAGGAGGAATCAGAAGCTTTGCTTGGCCAGCTCTTTGAGGGTTT 1763
Query 1785 TCTGTTATCTGGGAAAGTTGATGGATCCTTGGAGAAGCTTAGTCAGTCTGGTGCATTTGA 1844
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1764 TCTATTATCTGGGAAAGTTGATGGATCCTTGGAGAAGCTTAGTCAATCTGGTGCATTTGA 1823
Query 1845 TAGAGATGGAGAGGCCAATGTTTTTGCTCGCAAAAGCAAATCTATAGTTGACACATTAGC 1904
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1824 TAGAGATGGAGAAACCAATGTTTTTGCTCGCAAAAGCAAATCTATAGTTGACACATTAGC 1883
Query 1905 TAAGCATTGGACAACAACTAGAGGGGCTGAGATAGTAGCTATGACTGTTATATCTTCACA 1964
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1884 TAAGCATTGGACAACAACTAGAGGGGCTGAGATAGTAGCTATGACTGTTATATCTTCACA 1943
Query 1965 ATTGGTTGAGAAACAACAGAAGCATGAGAATTTTCTACACTTTCTTGCTCTATCCAAATG 2024
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1944 ATTGGTTGAGAAACAACAGAAGCATGAGAATTTTCTACACTTTCTTGCTCTATCCAAATG 2003
Query 2025 CCATGAGGAGCTGTGTTCTAAACAGAGACATTCTTTGCAAATAATTCTGGAAAATGGTGA 2084
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2004 CCATGAGGAGCTGTGTTCTAAACAGAGACATTCTTTGCAAATAATTCTGGAAAATGGTGA 2063
Query 2085 AAAACTTGCTGCCATGATTCAACTCCGGGAACTGCAGAATATGATTAACCAAAACCGCTC 2144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2064 AAAACTTGCTGCCATGATTCAACTCCGGGAACTGCAGAATATGATTAACCAGAACCGCTC 2123
Query 2145 AGCTAGATTTGGCTCGCCGCAAGCTGGCTCAGAGGATCAAGTTTCATGTGCCCTTTGGGA 2204
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2124 AGCTAGATTTGGCTCGCCGCAGGCTGGCTCAGAGGATCAAGTTTCATGTGCCCTTTGGGA 2183
Query 2205 TCTTATTCAATTTGTAGGGGAGAGAGCCCGGAGAAATACAGTTCTTTTGATGGACAGAGA 2264
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2184 TCTTATTCAATTTGTAGGGGAGAGAACCCGGCGAAATACAGTTCTTTTGATGGACAGAGA 2243
Query 2265 TAATGCTGAAGTTTTCTACAGCAAGGTATCTGAACTTGAGGAAGTGTTTTACTGTCTGAA 2324
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 2244 TAATGCTGAAGTTTTCTACAGCAAGGTATCTGAACTTGAGGAAGTATTTTATTGTCTGAA 2303
Query 2325 CAGGCAACTAGAATACATAATCAGAGCTGACCAACCACTAGGAACTCAACTGCAGAGAGC 2384
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||
Sbjct 2304 CAGACAACTAGAATACATAATCAGAGCTGACCAACCACTGGGAACTCAAGTGCAGAGAGC 2363
Query 2385 CTGCGAACTCTCAAATGCATGTGTTACAATTCTTCAGACTGCCTTAGATTACAAAAACGA 2444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2364 CTGCGAACTCTCAAATGCATGTGTTACAATTCTTCAGACTGCCTTAGATTACAAAAATGA 2423
Query 2445 GCATCAAATGTGGTATCCACCACTTGAAGGTTTAATACCTTGGCACTCTCAGACTGTTGT 2504
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||
Sbjct 2424 GCATCAAATGTGGTATCCACCACTTGAAGGTTTAATACCTTGGCACTGTCAGCCTGTTGT 2483
Query 2505 ATGTAATGGACTGTGGTGCATTGCGTCCTTTATGCTTCATCTGTTAACTGAGGCATCTAG 2564
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2484 ATGTAATGGACTGTGGTGCATTGCGTCCTTTATGCTTCATCTGTTAACTGAGGCATCTAG 2543
Query 2565 GATTGATATCTCTGCTAAATCAGACATATACACGCATCTCGAAGTGCTTACTGAAGTTTT 2624
|||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2544 GATTGACATCTCTGCTAAATCAGATATATACATGCATCTCGAAGTGCTTACTGAAGTTTT 2603
Query 2625 ACTTGAGGCTTGTGCCGGTTCTACCTTTGCAAAATTGGAGAGGGAAGAGGAGAACAAAGG 2684
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2604 ACTTGAGGCCTGTGCCGGTTCTACCTTTGCAAAATTGGAGAGGGAAGAGGAGAACAAAGG 2663
Query 2685 TTTGCTTAATGAATACTGGACTCGGCGGGATACTATTTTTGACTCTCTTTATCGACAAGC 2744
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2664 TTTGCTTAATGAGTACTGGACTCGGCGGGATACTATTTTTGACTCTCTTTATCAACAAGC 2723
Query 2745 GAAAGAGTTTATGGAAGCAGAAATCCAG 2772
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2724 CAAAGAGTTTATGGAAGCAGAAATCCAG 2751
Score = 1509 bits (817), Expect = 0.0
Identities = 935/992 (94%), Gaps = 7/992 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2925 GCACGAGGGTGTGGGACCACAAGGAGGGTTCAGTTACTTTGTTTTCCAGCAACTCTATGA 2984
|||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2751 GCACGAAGGTGTGGGACCGCAAGGAGGGTTCAGCTACTTTGTGTTCCAGCAACTCTATGA 2810
Query 2985 TATGAAACAGTTCTCTAAGCTTCTACGGCTTGGAGAAGAATTCCAGGACGAGCTATTGAT 3044
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2811 TATGAAACAGTTCTCTAAGCTTCTACGGCTTGGGGAAGAATTCCAGGACGAGCTATTGAT 2870
Query 3045 ATTTCTAAAGCGCCATTCTGATCTGGTGTGGCTTCATCAGGTGTTTCTTCATCAATTCTC 3104
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2871 ATTTCTAAAGCGCCATTCTGATCTGCTGTGGCTTCATCAGGTGTTTCTTCATCAGTTCTC 2930
Query 3105 ATCTGCGTCTGACACTCTTCATACATTGGCTCTATCACAAGATGAAGAGTCTATGACAAC 3164
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2931 ATCTGCTTCTGACACTCTTCATACATTGGCTCTAGCACAAGATGAAGAGTCTATGACAAC 2990
Query 3165 TGTTGAAGAAAGAA-CGGGACCAGAACCTGAAGATGTACAACCAACATTCGCAGACCGCA 3223
| |||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2991 TATTGAAGAAAGAACCGTG-CCAGAACCTGAAGATGCACAACCAACATTTGCAGACCGCA 3049
Query 3224 AGCGGTTTCTGAACCTTTCAAAGATAGCCTATGTGGCAGATAAGGATGCTGATTCCGAAT 3283
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3050 AGCGGTTTCTGAACCTTTCAAAGATATCCTATGTGGCAGATAAGGTTGCTGATTCCGAAT 3109
Query 3284 CGAAAGTGAAGCGCATTGAAGCTGATCTCAACTTACTGAAGCTGCAGGAAGAAATAACAA 3343
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3110 CGAAAGTGAAGCGCATTGAAGCTGATCTCAACTTACTGAAGCTGCAGGAAGAAATAACAA 3169
Query 3344 AAGCTTTGCCAAATGGAGAAGCTAGAAACCGGCTCTTCCGACCAGAGGAGCTCATTGAAA 3403
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3170 AAGCTTTGCCAAATGGAGAAGCTAGAAACCGGCTGTTCCGACCAGAGGAGCTCATTGAAA 3229
Query 3404 CCTGTCTCAATATCCAGGGTCGATGGACAGCTATAAAGGCTTTCGAAGTATTTGCATGGA 3463
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 3230 TCTGTCTCAATATCCAGGGTCGATGGACAGCTATAAAGGCTTTCGAGGTGTTTGCATGGA 3289
Query 3464 CGAGCTCTTCGTTCCGTGAGAATCATAGGAGTCTTTTGGAAGAATGCTGGAGAAATGCTG 3523
| |||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3290 CAAGCTGTTCATTCCGTGAGAATCATAAGAGTCTCTTAGAAGAATGCTGGAGAAATGCTG 3349
Query 3524 CGGATCAAGACGACTGGGACAGGCATC-ATCAAGCCTCTACTAATGAAGGTTGGAGCGAG 3582
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3350 CGGATCAAGACGACTGGGACAGGC-TCCATCAAGCCTCTACTAATGAAGGTTGGAGCGAG 3408
Query 3583 GAAGAAACATTACAGAATCTAAGGAACACGGCCCTTTTCCAGGCTTCCAAAAGGTGTTAC 3642
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 3409 AAAGAAACATTACAGAATCTAAGGAACACGGCACTTTTCCAGGCTTCCAAAAGATCTTAT 3468
Query 3643 GGACCAACCCGAGTCAACACTTTTGATGGTGACTTTGCACAAGTCCTTCCTCTGAGAAGA 3702
|||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||| |||||| ||
Sbjct 3469 GGACCAACCCGAGTCAACTCTTTTGATGGAGATTTTGCAAAAGTCCTTCCCCTGAGACGA 3528
Query 3703 GAGAACCCTGAGGATTCAACTTCTTCTGTAGAGGACGTTTTGATGAGTCATAAAGATTTC 3762
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||
Sbjct 3529 GAGAACCCTGAGGATTCAACTCCTTCTGTAGAGGACGTGTTGATGAGCCACAAAGATTTC 3588
Query 3763 GCTGAGGCAGGGAAATTAATGCTAACTGCAATCATGCTTGGTTGTGTAGAAGAAGAGGGT 3822
|||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3589 GCTGAGGCGGGGAAACTGATGCTAACTGCAATCATGCTGGGTTGTGTAGAAGAAGAGGGT 3648
Query 3823 ATTGTAGCAGAAGAGTTCTCATCTCCAATGGAGTAATTAAAATTTCTTTTT-AAGTAACA 3881
| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |
Sbjct 3649 AATGTAGCAGAAGAGTTCGCATCTCCAATGGAGTAGTTAAATTTTCTTTTTTAAGTAAAA 3708
Query 3882 GTGACAATGTAAATGAGTTTT-AGTTGAAGAT 3912
|||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 3709 TTGACAATGTAAATG-GTTTTTAGTTGAAGAT 3739
Score = 82.4 bits (44), Expect = 2e-14
Identities = 44/44 (100%), Gaps = 0/44 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGTTCTCTCCATTGACGAAGAGAGCTAAGCAAAGCTCACGCAA 44
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTTCTCTCCATTGACGAAGAGAGCTAAGCAAAGCTCACGCAA 44
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 151887773843
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5