BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G07360.2
Length=4065
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg480236 jgi|Araly1|480236|fgenesh2_kg.3__2937__AT2G07360.1 6215 0.0
> Ahg480236 jgi|Araly1|480236|fgenesh2_kg.3__2937__AT2G07360.1
Length=3708
Score = 6215 bits (3365), Expect = 0.0
Identities = 3596/3709 (97%), Gaps = 10/3709 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 32 TTGTCTTGTTGAATCGCCCGTCACTAAAATCCTCTCCGAGAATCCTCCTCCGATCTGCCA 91
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TTGTCTTGTTGAATCGCCCGTCACTAAAATCCTCTCCGAGAATCCTCCTCCGATCTGCCA 60
Query 92 CTAGCTATGGCGGAATCGTCTGGTACCACGCTAATGGATCTGATCTCGGCGGATCCAACC 151
||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CTAACTATGGCGGAATCGTCTGGTACAACGCTAATGGATCTGATCTCGGCGGATCCAACC 120
Query 152 CCGGTTCCTGCACAATCTACTTCTTCGTCCGCATCTTCCACGGCGTCTCAGCCGACTTCT 211
||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 121 CCGGTTCCTGCACAATCAACTTCTTCGTCCGCCTCTTCCACGGCGTCTCAGCCGTCTCCT 180
Query 212 GCTTCCGCATCGTCTTCTTCCCATCTGCACCATCCAATGTCGACGAAGACGACTCTAGGA 271
|||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 181 GCTTCCGCATCGGCGGCTTCGCATCTGAACCATCCAATGTCGACGAAGACGACGCTAGGA 240
Query 272 GAGAAGAAATCGAAGAGAGCCACTTTGATGCAGATCCAAAACGACACTATATCTGTTGCT 331
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GAGAAGAAATCGAAGAGAGCTACTTTGATGCAGATCCAGAACGACACTATATCTGTTGCT 300
Query 332 AAAGCTGCACTGAATCCTGTTAAGGCCAATATCATGCCACAAAGGCAGAGACAGAAAAAG 391
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 AAAGCTGCACTGAATCCTGTGAAGGCCAATATCATGCCACAAAGGCAGAGACAGAAAAAG 360
Query 392 AAGCCGGTTTCCTATTCGCAACTTGCAAGGAGCATTCATGAATTAGCTGCCACTTTGGAT 451
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 361 AAGCCAGTTTCCTATTCGCAACTTGCAAGGAGCATTCATGAATTAGCTGCCACCTTGGAT 420
Query 452 CAGAAAAGTTCTCAGAAACAACTAGTGAATCACGTGTTCCCTAAGCTTGCTGTGTACAAC 511
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CAGAAAAGTTCTCAGAAACAACTAGTGAATCATGTGTTCCCTAAGCTTGCTGTGTACAAC 480
Query 512 TCAGTTGATCCTTCTCTGGCCCCATCTCTTCTTATGCTTAATCAGCAATGTGAAGACAGG 571
|| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 481 TCCGTTGATCCTTCTCTGGCCCCATCTCTACTTATGCTTAATCAGCAATGTGAAGATAGG 540
Query 572 AATGTGCTACGATATGTTTATTATTACCTAGCTAGAATTTTGTCCGATACGGGCATGACT 631
||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 AATGTGCTACGCTATGTCTATTATTACCTAGCTAGAATTTTGTCCGATACGGGCATGACT 600
Query 632 CCAGGGGGTGGTATCCCCACTCCTAACTGGGATGCTCTAGCAGATATTGATGCTGGTGGA 691
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 CCAGGGGGTGGTATCCCCACTCCTAACTGGGATGCTCTAGCAGATATTGATGCTGGTGGA 660
Query 692 GGAGTCACAAGAGCTGATGTTGTTCCTCGGATAGTGAATCAACTTACAAACGAAGCTACA 751
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 661 GGAGTCACAAGAGCTGATGTTGTTCCTCGGATAGTGAATCAACTTACAACCGAAGCTACA 720
Query 752 AATTCTGAATTTGAATTTCATGCTCGACGACTGCAAGCTTTGAAAGCTCTGACATATTCA 811
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 721 AATTCTGAATTTGAATTTCATGCTCGACGACTGCAAGCTTTAAAAGCTCTGACATATTCA 780
Query 812 CCATCAGGCAATTCTGAGCTTTTGTCAAAATTGTATGAGATTGTATTTGGCATTCTTGAA 871
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 CCGTCAGGCAATTCTGAGCTTTTGTCAAAATTGTATGAGATTGTATTTGGCATTCTTGAA 840
Query 872 AAGGTTGGTGATGTTCCGCATAAACGAAAGAAAGGTGTATTTGGGACAAAAGGGGGTGAT 931
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 AAGGTTGGTGATGTTCCGCATAAACGAAAGAAAGGTGTATTTGGGACAAAAGGGGGTGAT 900
Query 932 AAAGAGTCGATTATGCGAAGTAACTTGCAATACGCTGCTATGAGTGCACTGAGAAGACTC 991
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 AAAGAGTCGATTATGCGGAGTAACTTGCAATACGCTGCTATGAGTGCACTGAGAAGACTC 960
Query 992 CCTCTTGATCCAGGAAATCCACTTTTTCTGCACCGTGCAGCTCAGGGTGTTTTCTTTGCT 1051
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 CCTCTTGATCCAGGAAATCCACTTTTTCTGCACCGTGCAGCTCAGGGTGTTTTCTTTGCT 1020
Query 1052 GATCCTGTTGCGGTGAGGCATTCACTGGAAATTCTATCTGAGTTAGCCACAAGAGACCCC 1111
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 GACCCTGTTGCGGTAAGGCATTCACTGGAAATTCTATCTGAGTTAGCCACAAGAGACCCC 1080
Query 1112 TATACAGTAGCAATGACATTAGAAAAGCTTGCGTCTCCAACAGGGGCTTTGCAAGATATC 1171
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct 1081 TATTCAGTAGCAATGACATTAGAAAAGCTTGCGTCTCCAGCAGGGGCCTTGCAAGATATC 1140
Query 1172 CTGCATATGAATGATGTTCTTGCTAGAGTTTCTCT-GGCTAGGTTGTGCCACTCAATATC 1230
|| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1141 CTACATATGAATGATGTTCTTGCTAGAGTTTC-CTTGGCTAGGTTGTGCCACTCGATATC 1199
Query 1231 TAGAGCTCGGGCATTAGATGAGAGGCCTGATATTAGGTCTCAGTTCAACTCAATTCTCTA 1290
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 TAGAGCTCGGGCATTAGATGAGAGGCCTGATATTAGGTCTCAGTTCAACTCAATTCTCTA 1259
Query 1291 TCAGCTACTCCTAGATCCAAGCGAAAGGGTATGCTATGAGGCGATTTTGTGCATTCTGGG 1350
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 TCAGCTACTCCTAGATCCAAGCGAACGGGTATGCTATGAGGCGATTTTGTGCATTCTGGG 1319
Query 1351 AAAACACGATAACACTGAGAGGCATGAGATGGATGAGCGTGCTGCTGGGTGGTATCGCTT 1410
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1320 AAAATACGATAACACTGAGAGGCATGAGATGGATGAGCGTGCTGCTGGGTGGTACCGCTT 1379
Query 1411 GACGAGAGAGATCCTGAAGCTGCCAGAAGCACCATCCTTGTCCTCCAAGGATAAATCTAA 1470
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1380 GACCAGAGAGATCCTGAAGCTGCCAGAAGCACCATCCTTGTCCTCCAAGGATAAATCTCA 1439
Query 1471 TAAAACCAAGCGTCCACAGCCCCTTATTAAGCTTGTAATGAGGAGGTTAGAGAGCTCATT 1530
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 TAAAACCAAGCGTCCACAGCCCCTTATTAAGCTTGTAATGAGGAGGTTAGAGAGCTCATT 1499
Query 1531 TCGCAGTTTCTCAAGACCAGTACTTCATGCAGCAGCAAGGGTTGTGCAAGAGATGGGAAA 1590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 TCGCAGTTTCTCAAGACCAGTACTTCATGCAGCAGCAAGGGTTGTGCAAGAGATGGGAAA 1559
Query 1591 GAGTAGAGCAGCAGCGTTTGCTATGGGATTACAGGACATTGATGAATCCGTTCATGTAAA 1650
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1560 GAGCAGAGCAGCAGCGTTTGCAATGGGATTACAGGACATTGATGAATCCGTTCATGTAAA 1619
Query 1651 TGCATTTTCTGATGCTCTAGATGATGCTGAGACCAATGAAAGTTCTCATCCAGAAGGAAT 1710
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 TGCATTTTCTGATGCTCTAGATGATGCTGAGACCAATGAAAGTTCTCATCCAGAAGGAAT 1679
Query 1711 TCGGAGAACATCATCCATATCTGCAGGGCCTGGTCGCAGTGATACAATTGCAAGTTTGCT 1770
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 ACGGAGAACATCATCCATATCCGCAGGGCCTGGTCGCAATGATACAATTGCAAGTTTGCT 1739
Query 1771 AGCTGCATTAATGGAGGTGGTTCGGACAACAGTAGCATGCGAGTGCGTGTATGTCCGGGC 1830
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1740 AGCTGCATTAATGGAGGTAGTTCGGACAACAGTAGCATGTGAGTGTGTGTATGTCCGGGC 1799
Query 1831 AATGGTTATCAAAGCATTGATATGGATGCAAAGTCCAGATGAATCATTGGATGAGTTAAA 1890
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1800 AATGGTTATCAAAGCATTGATATGGATGCAAAGTCCAGATGAATCGTTGGATGAGTTGAA 1859
Query 1891 ATCAATCATTGCCTCGGAGCTTTCAGATCCTGGTTGGCCTGCAGCTCTAGTCAATGATGT 1950
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 1860 ATCAATCATTGCCTCAGAGCTTTCAGATCCTGGTTGGCCCGCAGCTCTAGTTAATGATGT 1919
Query 1951 TTTGCTTACTTTGCATGCCCGCTTTAAGGCAACTCCAGATATGGCTGTTATTCTTCTCGA 2010
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1920 TTTGCTTACTTTGCATGCTCGCTTTAAGGCAACTCCAGATATGGCTGTTATTCTTCTCGA 1979
Query 2011 AATTGCCAGAATATTTGCCACCAAAGTTCCAGGGAAAATTGACGCTGATGTCTTACAGCT 2070
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1980 AATTGCCAGAATATTTGCCACCAAAGTTCCAGGGAAAATTGACGCTGATGTCTTACAGCT 2039
Query 2071 GCTATGGAAGACATGTCTTGTTGGAGCTGGTCCTGACGGGAAACACACAGCTCTGGAAGC 2130
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2040 ACTCTGGAAGACATGTCTTGTTGGAGCTGGTCCTGACGGGAAACACACAGCTCTGGAAGC 2099
Query 2131 AGTCACGATAGTACTCGATCTACCACCTCCACAACCGGGGTCCATGGCTGGACTGACATC 2190
|||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2100 AGTCACAATAGTACTTGATCTACCACCTCCACAGCCGGGGTCCATGGCTGGACTGACATC 2159
Query 2191 AATTGATAGGGTCTCTGCATCAGATCCTAAGTCAGCTCTGGCGCTGCAGAAATTGGTGCA 2250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2160 AATTGATAGGGTCTCTGCATCAGATCCTAAGTCAGCTCTGGCGCTGCAGAAATTGGTTCA 2219
Query 2251 AGCAGCAGTATGGTTCCTTGGAGAAAATGCAAACTACGCCGCATCAGAATATGCATGGGA 2310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||
Sbjct 2220 AGCAGCAGTATGGTTCCTTGGAGAAAATGCAAACTACGCTGCTTCAGAATACGCATGGGA 2279
Query 2311 ATCTGCAACTCCACCAGGCACAGCACTTATGATGTTGGATGCAGATAAAATGGTTGCTGC 2370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2280 ATCTGCAACTCCACCAGGCACAGCACTTATGATGTTGGATGCAGATAAAATGGTTGCTGC 2339
Query 2371 TGCTAGTTCTCGCAATCCTACTCTAGCTGGTGCATTAACTCGCCTCCAGAGGTGTGCATT 2430
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2340 TGCTAGTTCTCGCAATCCTACCCTAGCTGGTGCATTAACTCGCCTCCAGAGGTGTGCGTT 2399
Query 2431 TAGTGGAAGCTGGGAGGTCAGAATTGTTGCAATTCAAGCTCTTACTACAATAGCCATTAG 2490
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2400 TAGTGGAAGCTGGGAGGTCCGAATTGTTGCAATTCAAGCTCTTACTACGATAGCCATTAG 2459
Query 2491 ATCTGGTGAACCTTTCAGGCTGCAGATATACGAGTTTTTGTACACCTTAGCAGAGGGTGG 2550
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2460 ATCTGGTGAACCTTTTAGGCTGCAGATATACGAGTTTTTGTACACCTTGGCAGAGGGTGG 2519
Query 2551 TGTACAGTCTCAACTTTCTGAAATGCACCTGAGTAATGGGGAAGACCAAGGAGCTAGTGG 2610
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2520 TGTACAGTCTCAACTTTCTGAAATGCACCTGAGTAATGGTGAAGACCAAGGAGCTAGTGG 2579
Query 2611 TACAGGTCTTGGAGTTTTAATAACACCGATGTTAAAAGTTCTTGATGAAATGTATGTTGG 2670
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2580 TACAGGACTTGGAGTTTTAATAACTCCGATGTTAAAAGTTCTTGATGAAATGTATGTTGG 2639
Query 2671 ACAAGACGAATTAATCAAGGATATACGCCATCACGATAATGCAAACAAAGAATGGAAGGA 2730
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2640 ACAAGACGAATTAATCAAGGATATACGCCATCACGATAATGCAAACAAAGAATGGAAGGA 2699
Query 2731 CGAGGAGCTGAAAAAACTCTACGAAAACCATGAGAGGCTGCTGGATTTTGTTTCAATGTT 2790
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2700 TGAGGAGCTGAAAAAACTCTACGAAAACCATGAGAGGCTGCTAGATTTTGTTTCAATGTT 2759
Query 2791 TTGCTTTATTCCTAGAGCCAAGTATTTACCACTGGGCCCGATAAGCGCGAAGCTCATTGA 2850
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2760 TTGCTATATTCCTAGAGCCAAGTATTTACCACTGGGCCCGATAAGCGCAAAGCTCATTGA 2819
Query 2851 CACATACCGTACAAAGCACAATATCACTGCATCTACTGGGTCCACCGATCCAGCTGTTGT 2910
|| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2820 CATATACCGCACAAAACACAATATCACTGCATCTACTGGGTCCACCGATCCAGCTGTCGT 2879
Query 2911 TGCTACTGGGATCTCGGACTTAATCTATGAGTCCACTCAGCCTGCCCCCGCTGCCTCAAA 2970
||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2880 TGCTACTGGAATTTCGGACTTAATTTACGAGTCCACTCAGCCTGCCCCCGCTGCCTCAAA 2939
Query 2971 CTCCAGTGGTCTGGATGATGATTTGGTGAATGCTTGGGCTGCAAACCTTGGTGATGATGG 3030
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2940 CTCCAGTGGTCTGGATGATGATTTGGTGAATGCTTGGGCTGCAAACCTTGGCGATGATGG 2999
Query 3031 TCTTCTTGGAAACAATGCCCCAGCAATGAGTAGGGTCAATGAATTCATTGCTGGAGTCGG 3090
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 3000 TCTTCTTGGAAACAATGCCCCAGCAATGAGTAGGGTCAATGAATTCCTTTCTGGAGTCGG 3059
Query 3091 AACAGATGCACCGGATGTTGAGGAGGAGAATGTCTTCTCTAGACCTTCGGTTGGGTATGA 3150
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 3060 AACAGATGCACCAGATGTTGAGGAGGAGAATGTCTTCTCTAGACCTTCAGTTGGCTATGA 3119
Query 3151 TGACATGTGGGCTAAAACTCTTTTAGAAACTTCAGAATTGGAGGAAGAAGATGCGAGATC 3210
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3120 TGACATGTGGGCTAAGACTCTTTTAGAAACTTCAGAATTGGAGGAAGAAGATGCGAGATC 3179
Query 3211 AGGTTCATCGTCTCCAGATTCTGCTGGATCAGTGGAAAGCTCAATATCCTCTCACTTTGG 3270
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3180 AGGTTCATCGTCTCCAGATTCTACTGGATCAGTGGAAAGCTCTATATCCTCTCACTTTGG 3239
Query 3271 TGGAATGAACTACCCATCATTGTTCAGTTCAAAGCCTTCCTCACAAGCAACGGCAAAATC 3330
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3240 TGGAATGAACTACCCATCATTATTCAGTTCAAAGCCTTCCTCACAAGCAACGGCAAAATC 3299
Query 3331 AGGTGGAAGTAAATACCAGTCCACATATGAAGGCTATGGTTCCCCAATTAGAGAAGAGCC 3390
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3300 GGGTGGAAGCAAATACCAGTCCACATATGAAGGCTATGGTTCCCCGATTAGAGAAGAGCC 3359
Query 3391 TCCTCCGCCTTATTCGTATTCTGAGCCACAAAGTCGTGAATCGTTTGAGAACCCTGTAGC 3450
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3360 TCCTCCGCCTTATTCATATTCTGAGCCACAAAGTCGTGAATCGTTTGAGAACCCTGTAGC 3419
Query 3451 AGGGTCTGGTTCTCGAAGTTATGAATCAGATGATGAAGAACCTAGGAAATCTACTGGTAC 3510
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3420 AGGGTCTGGTTCTCGAAGTTATGAATCAGATGATGAAGAACCTAGGAAATCTACTGGTAC 3479
Query 3511 AAGATTTGGAACAGCGCTCTATGACTTCACAGCAGGAGGAGATGATGAGCTAAACTTGAC 3570
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3480 AAGATTTGGAACAGCGCTCTATGACTTCACTGCAGGAGGAGATGATGAGCTAAACTTGAC 3539
Query 3571 GGCAGAAGAGGAATTGGAGATAGAGTATGAAGTTGATGGCTGGTTTTACGTAAAGAAGAA 3630
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3540 GGCAGAAGAGGAATTGGAGATAGAGTATGAAGTAGATGGCTGGTTTTACGTAAAGAAGAA 3599
Query 3631 GCGGCCTGGAAGAGATGGGAAGATGGCGGGACTTGTTCCTGTTCTATACGTCAATCAATC 3690
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 3600 GCGGCCTGGAAGAGATGGGAAGATGGCGGGACTAGTTCCCGTTCTTTACGTCAATCAATC 3659
Query 3691 TTGAATT---TTTG-----GGGAACGGCTTTAGACGTAGAAGCCAACAC 3731
||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3660 TTGAATTGGATTTTTTTTTGGGAACGGCTTTAGACGTAGAAGCCAACAC 3708
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 153676479774
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5