BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G07680.1
Length=4244
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg480238 jgi|Araly1|480238|fgenesh2_kg.3__2939__AT2G07680.1 5624 0.0
Ahg930978 jgi|Araly1|930978|scaffold_303435.1 340 4e-92
> Ahg480238 jgi|Araly1|480238|fgenesh2_kg.3__2939__AT2G07680.1
Length=3582
Score = 5624 bits (3045), Expect = 0.0
Identities = 3404/3581 (95%), Gaps = 9/3581 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 660 ATGAAACATGGCTCGGTGAAGCAGCTAGAATTGGAAAATCTACTTACACTACCACCTGAA 719
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAACATGGCTCAGTGAAGCAGCTAGAATTTGAAAATCTGCTTCCACTACCACCTGAT 60
Query 720 ATGGATCCTTTTACATGTTGTGAGAATTTATTGAGATGTTGGCAACTTCAAGAGTGTAAT 779
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 61 ATGGATCCTTTTACATGTTGTGAGAATTTACTGAGATGCTGGCAACTTCAAGAGTGCAAT 120
Query 780 AATTACTCAACTCCATCACTAATTTGGTCAATATATGGTGTATATGGATGGCCATATTTT 839
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 AATTACTCAACTCCATCACTAATTTGGTCAATATCTGGTGTATATGGATGGCCATATTTT 180
Query 840 CGTCTTGGACTGTTAAAGGTGTTCAATGATTGCATTGGATTTGCTGGACCCTTACTTCTC 899
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||
Sbjct 181 CGTCTTGGACTGTTAAAGGTGTTCAATGATTGCATTGGCTTTGCAGGCCCCTTATTTCTC 240
Query 900 AACAGACTTATCAAGTCTTTTCTTGATACACAATACACGTTTCGTCTTTCAAAGCTGAAA 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||
Sbjct 241 AACAGACTTATCAAGTCTTTTCTTGATACACAATACACGTTTCGTCTGTCAAAGTTTAAA 300
Query 960 CTCAAGCTACGGTCTAGTATAATGAGTGTCATCTACAGGAAGTGTTTGTGGGTGAACACA 1019
| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TTAAAGCTCCGATCTAGTATAATGAGTGTCATCTACAGGAAGTGTTTGTGGGTGAACACA 360
Query 1020 GCAAACCGGTCAGGATTTTCTGAAGGCGAGATTCAAACATTTATGTCGGTAGATGCTGAC 1079
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GCAAACCGGTCAGGATTTTCTGAGGGCGAGATTCAAACATTTATGTCGGTAGATGCTGAC 420
Query 1080 CGCATTGTTAACTTGTGCAACAGTTTGCATGACTTGTGGAGCCTGCCTTTGCAAATTGGG 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CGCATTGTTAACTTGTGCAACAGTTTGCATGACATGTGGAGCCTGCCTTTGCAAATTGGG 480
Query 1140 ATAGCTTTGTATCTTTTGTATACTCAAGTCAAGTTTGCTTTTCTTTCTGGACTTGCAATC 1199
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 481 ATAGCTTTGTATCTTTTGTATACTCAAGTCAAGTTTGCTTTTCTGTCTGGACTTGCAATC 540
Query 1200 ACCATCTTGCTGATACCAGTGAATAAATGGATATCGGTGCTGATTGCATCTGCAACAGAG 1259
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 541 ACCATCTTGCTGATACCAGTCAATAAATGGATATCTGTGCTTATTGCATCTGCAACAGAG 600
Query 1260 AAAATGATGAAGCTTAAAGATGAGAGGATTAGAAAAACAGGAGAGCTTTTAACAAACATA 1319
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 AAAATGATGAAGCTAAAAGATGAGAGGATTAGAAAAACAGGAGAGCTTTTAACAAACATA 660
Query 1320 CGCACACTTAAAATGTATGGATGGGATAACTGGTTTGCTGATTGGTTGAAGGAAACAAGA 1379
|||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 CGCACACTCAAAATGTATGGGTGGGACAACTGGTTTGCTGATTGGTTGAAGGAAACAAGG 720
Query 1380 GCCACCGAAGTGACTCACTTAGCGACTCGGAAGTATTTAGATGCTTGGTGTGttttcttt 1439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GCCACCGAAGTGACTCACTTAGCGACTCGGAAGTATTTAGATGCTTGGTGTGTTTTCTTT 780
Query 1440 tgggcaacaacaccaactcttttttctctttgcacttttggtctctttgctctGATGGGT 1499
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 TGGGCAACAACACCAACTCTTTTTTCCCTTTGCACTTTTGGTCTCTTTGCTCTGATGGGT 840
Query 1500 CATCAACTTGATGCAGCAACGGTGTTTACTTGTCTTGCTTTGTTTAATAGCTTAATCTCT 1559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 CATCAACTTGATGCAGCAACGGTGTTTACTTGTCTTGCTTTGTTTAATAGCTTAATCTCT 900
Query 1560 CCATTAAACTCGTTTCCATGGGTCATCAACGGTCTCATTGATGCCTTTATATCCACCAGG 1619
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 CCATTAAACTCGTTTCCATGGGTCATCAATGGTCTCATTGATGCCTTTATATCCACCAGG 960
Query 1620 CGTGTGAGCAAGTTCTTGTGTTGTTTGGAGCATAGTAGAGATTTTTCTATAGATTCTGGA 1679
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||
Sbjct 961 CGTGTGAGCAAGTTCTTGTGTTGTTTGGAACATAGTAGAGATTCTTCTTTAGATTCTGG- 1019
Query 1680 TTT-ACATCTGAAGACTTAGCTGTATGTGTGGAAGATGCATCTTGTACTTGGTCAAGTAA 1738
||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1020 TTTAACCTCTGAAGACTTAGCTGTGTTTGTGGAAGATGCATCTTCTACTTGGTCAAGTAA 1079
Query 1739 CGTAGAAGAGGATTATAACTTGACAATAAAACAAGTAAGCCTAAGAGTGCCAAAGGGATC 1798
| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 CCTAGAAGAGGATTATAACTTGACAATAAAACATGTAAGCCTAAGAGTGCCAAAGGGATC 1139
Query 1799 TTTTGTTGCAGTTATCGGGGAGGTTGGTTCAGGTAAAACATCGTTGTTGAATTCACTTTT 1858
||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 1140 CTTTGTTGTAGTTATCGGTGAGGTTGGTTCAGGTAAAACATCTTTGTTGAATTCACTATT 1199
Query 1859 AGGCGAAATGCGGTGTGTTCATGGATCTATACTATTAAATGGCTCTGTGGCATATGTACC 1918
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1200 AGGCGAAATGCGGTGTGTTCATGGATCAATACTATTAAATGGGTCTGTGGCATATGTACC 1259
Query 1919 ACAGGTCCCATGGCTTTTGTCTGGAACTGTACGTGAAAACATTTTATTCGGGAAGCCTTT 1978
||||||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 1260 ACAGGTCCCGTGGATTTTATCTGGAACTATACGCGAAAATATCTTATTCGGGAAGCCTTT 1319
Query 1979 TGACTCCAAAAGGTATTTCGAGACATTGAGTGCTTGTGCACTAGATGTGGATATTTCACT 2038
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 TGACTCCAAAAGCTATTTCGAGACATTGAGTGCTTGTGCACTAGATGTGGATATTTCACT 1379
Query 2039 TATGGTCGGAGGAGACATGGCGTGTATAGGTGATAAAGGACTAAACTTATCCGGAGGACA 2098
||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1380 TATGGCCGGAGGAGACATGGCGTGTATAGGCGATAAAGGAGTAAACTTATCCGGAGGACA 1439
Query 2099 GAGAGCTCGGTTTGCTTTGGCCAGGGCTGTTTATCATGGTTCAGACATGTACCTTCTTGA 2158
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 AAGAGCTCGGCTTGCTTTGGCCAGGGCTGTTTATCATGGTTCAGACATGTACCTTCTTGA 1499
Query 2159 TGATGTACTGAGTGCAGTGGATTCACAAGTAGGATGTTGGATATTGCAAAGAGCACTTCT 2218
||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 TGATGTACTGAGTGCAGTGGATTCACAAGTAGGCTGCTGGATATTGCAAAGAGCACTTCT 1559
Query 2219 GGGTCCTCTGTTGAACAAAAAGACTCGTGTTATGTGCACTCACAACATTCAGGCGATATC 2278
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1560 GGGTCCTCTGTTGAACAAAAAGACTCGCGTTATGTGCACTCACAACATTCAGGTGATATC 1619
Query 2279 TTGTGCAGATATGATTGTTGTGATGGACAAAGGAAAAGTGAATTGGTCAGGAAGTGTTAC 2338
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct 1620 TTGTGCAGATATGATTGTTGTGATGGACAAAGGAAAAGTGAAATGGTCAGGAACTGTTAC 1679
Query 2339 TGATATGCCCAAATCCATTTCTCCAACATTTTCTTTAACCAATGAATTTGATATGTCATC 2398
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1680 TGATATGCCTAAATCCATTTCCCCAACATTTTCTTTATCCAATGACTTTGATATGTCATC 1739
Query 2399 ACCAAATCACTTGACCAAAAGAAAAGAGA-CTCTATCTATCAAGGAAGATGGTGTAGATG 2457
||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| | | ||||||
Sbjct 1740 ACCAAATCACTTGACCAAAAGAAAAGA-ACCTCTATCTATCAAGAAAGACGATTTAGATG 1798
Query 2458 AAATTAGTGAAGCTGCGGCGGATATCGTCAAATTAGAGGAACGAAAAGAGGGTCGAGTTG 2517
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1799 AAATTAGTGAAGCT---GCGGATATCGTCAAATTGGAGGAACGAAAAGAGGGTCGAGTTG 1855
Query 2518 AAATGATGGTTTATAGGAACTATGCTGTGTTTTCTGGTTGGTTCATTACTATTGTAATAT 2577
|| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1856 AAGTAACGGTTTATAGGAACTATGCTGCATTTTCTGGTTGGTTCATTGCTATTGTAATAT 1915
Query 2578 TGGTTTCAGCGGTTTTAATGCAAGGGTCTCGTAATGGAAATGATTTGTGGCTATCATATT 2637
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1916 TGGTTTCAGCGGTTTTAATGCAAGCTTCCCGTAATGGAAATGATTTGTGGCTATCATATT 1975
Query 2638 GGGTTGACAAGACAGGAAAAGGAGTATCGCATTACTCAACCTCGTTTTATTTGATGGTTC 2697
|||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1976 GGGTTGACAAGACAGGAAGAGGAGTATCACATTACTCAACCTCGTTTTATTTGATGGTTC 2035
Query 2698 TCTGTATCTTTTGCATCATTAACTCAATAT-TAACCTTGGTGAGGGCATTCTCATTTGCA 2756
|||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 2036 TCTGTATCTTTTGCATCATTAACTCAAT-TCTAACCTTGGTGAGAGCATTCTCGTTTGCA 2094
Query 2757 TTTGGAGGATTAAAAGCAGCAGTGCATGTTCATAATGCATTAATCAGTAAGCTTATAAAT 2816
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2095 TTTGGAGGATTAAAAGCAGCAGTGCATGTTCATAGTGCATTGATCAGTAAGCTTATAAAT 2154
Query 2817 GCACCTACACAGTTCTTTGATCAGACACCAAGTGGAAGAATACTTAATAGGTTTTCCTCT 2876
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2155 GCACCTACACAGTTCTTTGATCAGACACCATGTGGAAGAATACTTAACAGGTTTTCCTCT 2214
Query 2877 GATCTATATACCATCGACGACTCTCTCCCGTTTATTCTCAACATTCTTCTAGCAAATTTT 2936
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2215 GATCTATATACCATCGATGACTCTCTCCCGTTTATTCTCAACATTCTTCTAGCAAATTTT 2274
Query 2937 GTTGGCTTGTTAGGGATTATTGTAGTATTGTCTTATGTTCAGGTTCTATTCCTGCTTCTG 2996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2275 GTTGGCTTGTTAGGGATTATTGTAGTATTGTCTTATGTTCAGGTTCTATTCCTGCTTCTG 2334
Query 2997 CTTCTGCCATTTTGGTACATATACAGCAAGCTTCAGGTCTTCTACAGGTCTACTTCAAGG 3056
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||
Sbjct 2335 CTTCTGCCATTTTGGTACATATACAGCAAGCTTCAGTTCTTCTACAGGTCAACGTCAAGG 2394
Query 3057 GAACTACGAAGGTTGGACAGTGTTTCACGATCACCGATATATGCATCGTTCACGGAGACA 3116
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2395 GAACTACGAAGGTTGGACAGTGTTTCAAGATCACCGATCTATGCATCGTTCACGGAGACA 2454
Query 3117 CTTGATGGGTCATCAACTATCAGGGCTTTTAAGTCTGAGGAGCATTTTGTAGGTAGATTT 3176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||
Sbjct 2455 CTTGATGGGTCATCAACTATCAGGGCTTTTAAGTCTGAGGAGCATTTCGTAGCTAGGTTT 2514
Query 3177 ATTGAGCATTTGACGCTATACCAGCGGACTTCTTACTCAGAGATAATCGCAAGCTTGTGG 3236
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2515 ATTGAGCATTTGACGTTATACCAGCGGACTTCTTACTCAGAGATAATTGCAAGCTTGTGG 2574
Query 3237 CTCTCCTTGCGTCTTCAGTTGTTAGGATCAATGATTGTCTTATTTGTCGCTGTAATGGCT 3296
||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2575 CTCTCCTTGCGTCTTCAGTTGTTAGGAGCCATGATTGTCTTATTTGTCGCGGTAATGGCT 2634
Query 3297 GTCCTCGGCTCCGGGGGGAACTTTCCAATCAGTTTTGGTACACCTGGACTGGTGGGATTA 3356
|| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2635 GTTTTCGGCTCCCGTGGGAACTTTCCAATCAGTTTTGGTACGCCTGGACTGGTGGGATTA 2694
Query 3357 GCGCTCTCATATGCAGCTCCATTGGTTTCTCTGTTAGGAAGCTTGTTAACAAGTTTTACT 3416
|| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2695 GCTCTCTCATATGCAGCTCCACTGGTTTCTCTGTTAGGAAGCTTCTTAACAAGTTTTACT 2754
Query 3417 GAAACAGAAAAAGAAATGGTTTCTGTTGAAAGGGTTCTCCAGTACATGGATGTGCCTCAA 3476
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2755 GAAACAGAAAAGGAAATGGTTTCTGTTGAAAGGGTTCTCCAGTACATGGATGTGCCTCAA 2814
Query 3477 GAAGAAGTTTCAGGTCCTCAATCTCTCAGCGATAAGTGGCCTGTTCACGGATTAGTTGAG 3536
||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 2815 GAAGAAGTTTCCGGTCGTCAATCTCTCAGCGGTAAGTGGCCGGTTCAAGGATTAGTTGAG 2874
Query 3537 TTTCACAATGTGACAATGAGATACATCTCAACTCTGCCTCCGGCCCTCACCCAAATTTCT 3596
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||
Sbjct 2875 TTTCAGAATGTGACAATGAGATACATCTCAACTCTGCCTCCAGCGCTCAACCACATTTCT 2934
Query 3597 TTTACAATCCAAGGAGGAATGCATGTAGGAGTAATTGGAAGAACTGGTGCCGGGAAGTCC 3656
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2935 TTTACAATCCAAGGAGGAATGCATGTAGGAGTAATTGGAAGAACTGGTGCCGGGAAATCT 2994
Query 3657 TCGATCTTGAATGCGCTTTTCCGGCTTACTCCTGTTTGTAGTGGAGAGATATTGGTGGAT 3716
|||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||
Sbjct 2995 TCGATCTTGAATGCCCTTTTCCGGCTTAATCCTGTTTGTAATGGAGAGATATTGGTTGAT 3054
Query 3717 GGAAAAAACATAAGCCATCTTCCGATAAGAGAACTCCGTTCTTGCCTCGCTGTTGTTCCT 3776
|||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3055 GGAATTAACATAAACCATCTTCTAATTAGAGAGCTCCGTTCTCGCCTCGCTGTTGTTCCT 3114
Query 3777 CAGAGCCCTTTTCTGTTTCAAGGATCACTGAGGGATAACCTTGATCCTCTTGGGTTGAGT 3836
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3115 CAGAGCCCTTTTCTGTTTCAAGGATCAATGAGGGATAACCTTGATCCTCTTGGGTTGAGT 3174
Query 3837 GAGGATTGGAGAATCTGGGAGATCCTAGACAAGTGTAAAGTTAAGGCAGCGGTAGAAAGT 3896
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3175 GAGGATTGGAGAATCTGGGAGATCCTAGAGAAATGTAAAGTTAAGGCAGAGGTAGAAAGT 3234
Query 3897 GTAGGAGGGTTAGATTCATATGTAAAGGAATCTGGTTGTTCCTTTTCTGTTGGACAGAGA 3956
| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3235 GCAGGAGGGTTAGATTCAAATGTAAAGGAATCTGGATGTTCCTTTTCTGTTGGGCAGAGA 3294
Query 3957 CAGCTTTTGTGCCTTGCTCGTGCTTTGCTCAAGTCATCTAAGATCCTATGCCTTGATGAA 4016
||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3295 CAGCTCCTGTGTCTTGCCCGTGCTCTACTCAAGTCATCTAAGATCCTATGCCTTGATGAA 3354
Query 4017 TGCACCGCCAACATCGATGTTCACACAGCTTCCCTACTCCACAACACGATATCGAGTGAA 4076
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||
Sbjct 3355 TGCACCGCCAACATCGATGTTCACACAGCTTCACTACTGCACAACACAATATCGAGGGAA 3414
Query 4077 TGCAAAGGCGTAACCGTCATTACCATTGCTCACCGCATTTCTACGGTTGTTGATTTAGAC 4136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||
Sbjct 3415 TGCAAAGGCGTAACCGTCATTACCATTGCTCACCGCATTTCAACGGTTCTTGATTTGGAC 3474
Query 4137 AGCATCCTAATTCTTGATCGTGGAATTCTTGTTGAACAAGGAAAACCACAACATCTTTTG 4196
| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3475 AACATCCTTATTCTTGATCACGGAATTCTTGTTGAACAAGGAAAACCGCAACATCTTTTG 3534
Query 4197 CAAGATGACTCCTCAACTTTTTCAAGCTTTGTCAGAGCTTC 4237
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3535 CAAGATGACTCCTCAACTTTCTCAAGCTTTGTCAGAGCTTC 3575
> Ahg930978 jgi|Araly1|930978|scaffold_303435.1
Length=412
Score = 340 bits (184), Expect = 4e-92
Identities = 249/279 (89%), Gaps = 9/279 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 186 AAAAGCTACATTGAGAAGTGTTTGTTGTATGTAACACCTGCACTTGGAGCTTGTTTGTCA 245
||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||
Sbjct 48 AAAAGCTACATTGAGAAGTGTGTGTTGTATGTAATATCTGCACTTGGAGCATGTTTGTCA 107
Query 246 TGTGTGGACTTGGTGTTACTTGTGAGAACAAACCGTAGGAGAGAAGTCATTCTCTGTTTT 305
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||
Sbjct 108 TGTGTGGACTTGGTGTTGCTTGTGAGAACAAACCGTAGGAGAGAAGTCATG-T-T-TCTT 164
Query 306 GTCCCCTTGTCTGGTTTCGTAATGTGGATTGCCGTCATCCTCTCATTGAAGTTTGCTTGT 365
|| |||||| |||||| |||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct 165 --CCG-TTGTCTCGTTTCGCAATGTGGATTTCCATCATGCTCTCATCGAAGTTTGCTTGT 221
Query 366 TGTGCGTGCCACGTTTTCACTAGCCAGATTCTATGTTTCTGGTGGATCTTTAGATTCCTA 425
| ||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 222 -G--CGTGCTGCGTTTTCGCTAGACGGATTCTATGTTTCTGGTGGATCTTTAGATTCCTA 278
Query 426 ACAGATGCCCTTCATCTTAACATGATTTTCACATTACAG 464
||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 279 ACAGACGCCCTTCATCTTAACATGATTTTCACTTTACAG 317
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 160488785341
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5