BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G07682.1
Length=4888
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg480269 jgi|Araly1|480269|fgenesh2_kg.3__2970__AT2G07682.1 8794 0.0
Ahg932769 jgi|Araly1|932769|scaffold_400757.1 65.8 3e-09
> Ahg480269 jgi|Araly1|480269|fgenesh2_kg.3__2970__AT2G07682.1
Length=4888
Score = 8794 bits (4762), Expect = 0.0
Identities = 4857/4899 (99%), Gaps = 22/4899 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTTTGCGGCGTGCTCTCTGGGAGCAGTTGAGTAGCTTGGCATCTATGATATCTGATCCT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ACTTTGCGGCGTGCTCTCTGGGAGCAGTTGAGTAGCTTGGCATCTATGATATCTGATCCT 60
Query 61 TGGCTAATAGGTGGGGGGACTTTCATTCCATTCTGTGTAGTTCAGATAGCCGGGGTGGCT 120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 61 TGGCTAATAGGTGGGGGGACTTTCATTCCATTCTGTGTAGTTCAGAGAGCCGGGGTGGCT 120
Query 121 CAGCTAGTGGTAATCGGCCGTGTCGTTTGAGTTGGTTCCATTCCTCTAGTCTCTATGACA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CAGCTAGTGGTAATCGGCCGTGTCGTTTGAGTTGGTTCCATTCCTCTAGTCTCTATGACA 180
Query 181 TGAAGTTCGTTGGTCCGAAGTTGACTTGGGCTCGCAAGGGTTTGCTGAAGCGTTTAGATA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TGAAGTTCGTTGGTCCGAAGTTGACTTGGGCTCGCAAGGGTTTGCTGAAGCGTTTAGATA 240
Query 241 GAGCTACACTTGAGAGTCTTTCTATTACTTCCTTGCTTACCTGGCTCACTTCGCAACAAA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GAGCTACACTTGAGAGTCTTTCTATTACTTCCTTGCTTACCTGGCTCACTTCGCAACAAA 300
Query 301 GAGAAGTTGTTTATTTGCTTGCTTAGCTAGAAGATGCCAACTTCGTTCACTTACGTCTCT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GAGAAGTTGTTTATTTGCTTGCTTAGCTAGAAGATGCCAACTTCGTTCACTTACGTCTCT 360
Query 361 CGTTTACTTGTTAGCTAGCCCTATTCCTCACCTTTGCTTTGAGGGTATCTAAATaaaaaa 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CGTTTACTTGTTAGCTAGCCCTATTCCTCACCTTTGCTTTGAGGGTATCTAAATAAAAAA 420
Query 421 aaTATACAGTGGTGTGCTCGTTAGAGGATGCTTTTTTAGTTAGCTAAGCGACTACCTTAG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 AATATACAGTGGTGTGCTCGTTAGAGGATGCTTTTTTAGTTAGCTAAGCGACTACCTTAG 480
Query 481 TTGAAGGTGGGAGGAGAGCAGCAAAGTCTCTTATCTTTCCAAAGAAGGCGGAAATCGAGA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TTGAAGGTGGGAGGAGAGCAGCAAAGTCTCTTATCTTTCCAAAGAAGGCGGAAATCGAGA 540
Query 541 TGTGAGAAAAAGAATAGCTATTCACTCTCCAAAGAAGCCCTCAAAATTCTTTCTAGCAAA 600
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 541 TGTGAGAAAAAGAATAGCTATTCACTCTCCAAAGAAGCCCTCAAAATTCTTTCTAGCAGA 600
Query 601 TGTGAAGAGAGGATTGTTGACAATTCAATAACCACTGCAATACCCTCTTACGGAATGATC 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TGTGAAGAGAGGATTGTTGACAATTCAATAACCACTGCAATACCCTCTTACGGAATGATC 660
Query 661 TCGGTGTTCTCGCTATGTCGTCAATCTCAGTATACGGAAATGGTCTGACCAAGAGGCATC 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 TCGGTGTTCTCGCTATGTCGTCAATCTCAGTATACGGAAATGGTCTGACCAAGAGGCATC 720
Query 721 GATCTGGAGTGGGTCTTGCATTGCCGGATGACAGGAGCCCTTTACCTCCACTCTTCAATT 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GATCTGGAGTGGGTCTTGCATTGCCGGATGACAGGAGCCCTTTACCTCCACTCTTCAATT 780
Query 781 ATATCCATACCAGGTGAACACAGATGATCGACCTTCAGTGCCTGGTCAACCATTAAAGAA 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 ATATCCATACCAGGTGAACACAGATGATCGACCTTCAGTGCCTGGTCAACCATTAAAGAA 840
Query 841 GAGAAGAGGAGCGGAACAATGAGAAGGAGTTCGTAGCCCTCCAACCAGAACTAATCAACC 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GAGAAGAGGAGCGGAACAATGAGAAGGAGTTCGTAGCCCTCCAACCAGAACTAATCAACC 900
Query 901 CGCCTCTTCAACATCTCCATTTCCCATTCCATCTCTGGGATCCAATGCTTCTTCACCGGG 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 CGCCTCTTCAACATCTCCATTTCCCATTCCATCTCTGGGATCCAATGCTTCTTCACCGGG 960
Query 961 CCCGCCCGATCCCCAGAACGTAAAATGGAACCATACCGGAAACCGTTTGATCAGGATAGA 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 CCCGCCCGATCCCCAGAACGTAAAATGGAACCATACCGGAAACCGTTTGATCAGGATAGA 1020
Query 1021 AAGAGCAAGGGGCTTTGTTTTCGTTGTGGTGACAAGTGGAATCCTGGTCACAGATGTAAG 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 AAGAGCAAGGGGCTTTGTTTTCGTTGTGGTGACAAGTGGAATCCTGGTCACAGATGTAAG 1080
Query 1081 GGCAGAGAATTAAAGTATATGGCTGTGGATGAAGGAGATGAGTTGGATGAGGCTGATGAA 1140
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 GGCAGAGAATTCAAGTATATGGCTGTGGATGAAGGAGATGAGTTGGATGAGGCTGATGAA 1140
Query 1141 GCTGAAACAGGGAAAAAGATAGAAGAATCAGATGAGGATGAAGTAAAGGAATTACTCTGG 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 GCTGAAACAGGGAAAAAGATAGAAGAATCAGATGAGGATGAAGTAAAGGAATTACTCTGG 1200
Query 1201 TTGTCTTTGCGGTCGATGGCAGGTTTAACAACTGAGAGATCCATGAGGATGAGAGGACAA 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 TTGTCTTTGCGGTCGATGGCAGGTTTAACAACTGAGAGATCCATGAGGATGAGAGGACAA 1260
Query 1261 ATTGCAGGACAAGAAGTCATTGTTTTAATTGATTCAGGGGCTACAAGCAATTTCATAGCA 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 ATTGCAGGACAAGAAGTCATTGTTTTAATTGATTCAGGGGCTACAAGCAATTTCATAGCA 1320
Query 1321 GAGAGTGTAGCACATCGGTGTGGTCTGCAAATCACAGAAACTCGTGGATTTGGGGTTTCT 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 GAGAGTGTAGCACATCGGTGTGGTCTGCAAATCACAGAAACTCGTGGATTTGGGGTTTCT 1380
Query 1381 ATTGGAAATGGTCAAGTCGTTCCAAGTGCCGGGAAATGCAGCGGAGTAGAGCTAACGGTC 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 ATTGGAAATGGTCAAGTCGTTCCAAGTGCCGGGAAATGCAGCGGAGTAGAGCTAACGGTC 1440
Query 1441 CAAGATGTGCAGATACGTGCGGACTTCTTCCTGTAACCATGGATATAGTGCTGGGTTATG 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 CAAGATGTGCAGATACGTGCGGACTTCTTCCTGTAACCACGGATATAGTGCTGGGTTATG 1500
Query 1501 CGTGGTTGGCTACTCTGGGTGACACCAGAATGAATTGGGGAAGACACACCTTGAGTTTCC 1560
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 CGTGGTTGGCCACTCTGGGTGACACCAGAATGAATTGGGGAAGACACACCTTGAGTTTCC 1560
Query 1561 GTAGGGAAGATCAGTGGGTCACCTTAGCAGGCGATCCGTCACTGGTGCGAGCTCAAATCT 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 GTAGGGAAGATCAGTGGGTCACCTTAGCAGGCGATCCGTCACTGGTGCGAGCTCAAATCT 1620
Query 1621 CTCTCAATTC---------GGTAGTCAAAGAGGGAAGGAAGGCTTATTATCTCCTAGAGC 1671
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1621 CTCTCAATTCAATGGAGAGGGTAGTCAAAGAGGGAAGGAAGGC---TTATCTCCTAGAGC 1677
Query 1672 TCACCGCACTGTTTTGCAGGAGGAATTAAGACTCAAAATTTTCCTGAGGATGCTCAAGTG 1731
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1678 TCACCGCACTG-TTTGCAGGAGGAATTAAGACTCAAAATTTTCCTGAGGATGCTCAAGTG 1736
Query 1732 AAACAGTTGTTGGAATGGCATGAAAACGTGTTTGAGATGCCGCAAGGATTACCCCCAAAA 1791
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1737 AAACAGTTGTTGGAATGGCATGAAAACGTGTTTGAGATGCCGCAAGGATTACCCCCAAAA 1796
Query 1792 TGTGGCAGGGAACATGCTATCAACCTTAAGGAAGGAGCAGAACCAGTTAACATCCGTCCT 1851
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1797 CGTGGCAGGGAACATGCTATCAACCTTAAGGAAGGAGCAGAACCAGTTAACATCCGTCCT 1856
Query 1852 TACCGGTATACATATACTCAGAAGGACGAGATTGAAAAATTGGTTAGGGAGATGTTAGAA 1911
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1857 TACCGGTATACATATACTCAGAAGGACGAGATTGAAAAATTGGTTAGGGAGATGTTAGAA 1916
Query 1912 GCACGGATCATCCAGCCGAGCATCAGTCCATATTCAAGTCCAGTTTTGCTCGTCCAAAAG 1971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1917 GCACGGATCATCCAGCCGAGCATCAGTCCATATTCAAGTCCAGTTTTGCTCGTCCAAAAG 1976
Query 1972 AAGGACGGAGGATGGCCTACGGCGCGTGGATTACCGAGCCTTTTACAAGCTCACGGTACC 2031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1977 AAGGACGGAGGATGGCCTACGGCGCGTGGATTACCGAGCCTTTTACAAGCTCACGGTACC 2036
Query 2032 AGACAGGTACCCAATTCCCGTGATCGAGGAACTGTTGGATGAGTTACAAGGAGCTTCTGT 2091
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2037 AGACAGGTACCCAATTCCCGTGATCGAGGAACTGTTGGATGAGTTACAAGGAGCTTCTGT 2096
Query 2092 ATTCTCCAAACTCGATCTCAAATCCGGGTACCACCAAATACGTGTACGAGCCACAGACGT 2151
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2097 ATTCTCCAAACTCGATCTCAAATCCGGGTACCACCAAATACGTGTACGAGCCACAGACGT 2156
Query 2152 GAAGAAAACTGCCTTTCGAACTCACGAAGGGCACTATGAGTTCCTGGTCATGCCATTTGG 2211
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2157 GAAGAAAACTGCCTTTCGAACTCACGAAGGGCACTATGAGTTCCTGGTCATGCCATTTGG 2216
Query 2212 GCTTACCAACGCACCAGCAACATTCCAATCCGTGATGAACGATATTTTCCGTAGGGAAGT 2271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2217 GCTTACCAACGCACCAGCAACATTCCAATCCGTGATGAACGATATTTTCCGCAGGGAAGT 2276
Query 2272 TTGTGTTGGTATTTTTTGATGACATACTAGTCTATAGCAAGGGCACGGAGGAACACATGA 2331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2277 TTGTGTTGGTATTTTTTGATGACATACTAGTCTATAGCAAGGGCACGGAGGAACACATGA 2336
Query 2332 ATCACTTGGGAATGGTGCTCCAGATTTGGGAACAACACCAGTTTTATGCAAACAGAAAGA 2391
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2337 ATCACTTGGGAATGGTGCTCCAGATTTGGGAACAACACCAGTTTTATGCAAACAGAAAGA 2396
Query 2392 AGTGTGCTTTTGGACAACCACAGATTGCATATTTGGGACATAGACATATTATATCGGGCG 2451
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 2397 AGTGTGCTTTTGGACAACCACAGATTGCATATTT-GG-----GACATATTATATCGGGCG 2450
Query 2452 AAGGGGTGTCAGCTGATCCAGCTAAGTTAGAAGCAATGGTGGGTTGGCCAGAACCAAAGA 2511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2451 AAGGGGTGTCAGCTGATCCAGCTAAGTTAGAAGCAATGGTGGGTTGGCCAGAACCAAAGA 2510
Query 2512 ACACAACAGAATTGCGAGGCTTCTTGGGCTTGACGGGGTACTACAGGAGATTCGTTAAGA 2571
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2511 ACACAACAGAATTGCGAGGCTTCTTGGGCTTGACGGGGTACTACAGGAGATTCGTTAAGA 2570
Query 2572 ATTATGGGAAAATTGTGAGACCGTTGACCGAGTTACTCAAAAAGAACAGTTTAAAATGGA 2631
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2571 ATTATGGGAAAATTGTGAGACCGTTGACCGAGTTACTCAAAAAGAACAGTTTAAAATGGA 2630
Query 2632 CAGAAATGGCAGCACTAGCTTTCAAGGCTCTCAAAGGAGCAGTGACGACGCTTCCTGTTC 2691
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2631 CAGAAATGGCAGCACTAGCTTTCAAGGCTCTCAAAGGAGCAGTGACGACGCTTCCTGTTC 2690
Query 2692 TAGCCTTGCCAGATTTGAAGCTACCTTTTGTGACCCGCGTCGGGAAATGGAATTGGAGCT 2751
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2691 TAGCCTTGCCAGATTTGAAGCTACCTTTTGTGACCCGCGTCGGGAAATGGAATTGGAGCT 2750
Query 2752 GTTTTATTACAAGGGAACAGGCCTGTTGCGTATCTCAGCCAAGGGTTTTCTGAAAAGGGG 2811
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2751 GTTTTATTACAAGGGAACAGGCCTGTTGCGTATCTCAGCCAAGGGTTTTCTGAAAAGGGG 2810
Query 2812 AGCTTGAAATCAGTGTACGAACGAGAGCTCTTAGCAATAGTCTTGGCAGTCCAACGTTGG 2871
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2811 AGCTTGAAATCAGTGTACGAACGAGAGCTCTTAGCAATAGTCTTGGCAGTCCAACGTTGG 2870
Query 2872 AGACATCAGGGCAACGTTTCACGATACGCACAGACCAGAAGAGTCTAAAGCACTTGCTGG 2931
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2871 AGACATCAGGGCAACGTTTCACGATACGCACAGACCAGAAGAGTCTAAAGCACTTGCTGG 2930
Query 2932 AACAAAGGTTTGTCACCAAGGAACAACAGAGGATGGGCTACCAAACTGTTAGGCTTCGAT 2991
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2931 AACAAAGGTTTGTCACCAAGGAACAACAGAGGATGGGCTACCAAACTGTTAGGCTTGGAT 2990
Query 2992 TTTCTCATTGAGTATAAGCCGGGAACTAAAAATAAGGCTGCTGATGCGTTGTCAAGACGA 3051
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2991 TTTCTCATTGAGTATAAGCCGGGAACTGAAAATAAGGCTGCTGATGCGTTGTCAAGACGA 3050
Query 3052 GTGCAACCTGAGCGTCTGTTGGAACTTGTATTCGCACCTCCTCCCTCTTTCGATGCAGCA 3111
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3051 GTGCAACCTGAGCGTCTGTTGGAACTTGTATTCGCACCTCCTCCCTCTTTCGATGCAGCA 3110
Query 3112 GAATTACTATCTCAAGTTGAAGCTGATCCGGAGTTAAGAACTGTGTTACAACAAGCCCGA 3171
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3111 GAATTACTATCTCAAGTTGAAGCTGATCCGGAGTTAAGAACTGTGTTACAACAAGCCCGA 3170
Query 3172 TAGGGAAAGAACCTGGAATCTGGTTATACGGAAAAAAGAGGGGCTGCTATGTAAAGATGG 3231
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3171 GATGGAAAGAACCTGGAATCTGGTTATACGGAAAAAAGAGGGGCTGCTATGTAAAGATGG 3230
Query 3232 AAGAGTGGCGTCTCGAATCAGCCAAGCTTTCTCCCAATTTCTTCTATATTTTCATCTCTT 3291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3231 AAGAGTGGCGTCTCGAATCAGCCAAGCTTTCTCCCAATTTCTTCTATATTTTCATCTCTT 3290
Query 3292 TCTCTATTCTACCGAGAAGATCCATCTCGGGTCTTATCAGATGGTATCAGAGCCTTCGGT 3351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3291 TCTCTATTCTACCGAGAAGATCCATCTCGGGTCTTATCAGATGGTATCAGAGCCTTCGGT 3350
Query 3352 CTTCTGACTGTGGGTATCCAACGACGATTTCGACAATGGGTTTGGATAGTAACGATATAG 3411
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3351 CTTCTGACTGTGGGTATCCAACGACGATTTCGACAATGGGTTTGGATAGTAACGATATAG 3410
Query 3412 CGCTGATCAGGCGGATTCTCGCTCGGGTGGAGCAGATGtttttttCCATCGCATGACGAC 3471
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3411 CGCTGATCAGGCGGATTCTCGCTCGGGTGGAGCAGATGTTTTTTTCCATCGCATGACGAC 3470
Query 3472 GATGAAGAGATCCGCCGATCCTGAAGCTGAGGAAGACCCAGATCCGTCGCTTGGGAAATT 3531
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3471 GATGAAGAGATCCGCCGATCCTGAAGCTGAGGAAGACCCAGATCCGTCGCTTGGGAAATT 3530
Query 3532 CATCGAGCAGGTGGTGAGCGGTCCAACTCAGAAGGGATTTCCTGCATCTGGAGCTTTTGC 3591
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3531 CATCGAGCAGGTGGTGAGCGGTCCAACTCAGAAGGGATTTCCTGCATCCGGAGCTTTTGC 3590
Query 3592 GACTCCTCGGGCAAGACGATCTCGCGGTCCGAAAAGGTTTCTTGGCAAGCGCAACTACCG 3651
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3591 GACTCCTCGGGCAAGACGATCTCGCGGTCCGAAAAGGTTTCTTGGCAAGCGCAACTACCG 3650
Query 3652 CAGGGCTCGGGCAAGAAAACCAGGGAAGCGTGACAGAGCTCACTCGTCCAAGGTTAGATC 3711
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3651 CAGGGCTCGGGCAAGAAAACCAGGGAAGCGTGACAGAGCTCACTCGTCCAAGGTTAGATC 3710
Query 3712 TAGCGATGGCTCTACACGACCTTCTGCGAGATATGGTATGCGTTTCCGATCTCCTACTTT 3771
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3711 TAGCGATGGCTCTACACGACCTTCTGCGAGATATGGTATGCGTTTCCGATCTCCTACTTT 3770
Query 3772 GCCCTTGTGTTCTAGACCTCGGACATGGGAATTTCTGCTTGATCTTGGTTACGATAGTAT 3831
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3771 GCCCTTGTGTTCTAGACCTCGGACATGGGAATTTCTGCTTGATCTTGGTTACGATAGTAT 3830
Query 3832 GTCGCTGAAGAGCGCTCGTGTAGCGAGTGAACGACCTTGCGATCCTGGACGAGCTAACCA 3891
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3831 GTCGCTGAAGAGCACTCGTGTAGCGAGTGAACGACCTTGCGATCCTGGACGAGCTAACCA 3890
Query 3892 TGTGTGGGAGCCGGGTGGATTATCGCCTGAACAAGCTCAGTGGGACTGGGTAGGGAAGGT 3951
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3891 TGTGTGGGAGCCGGGTGGATTATCGCCTGAACAAGCTCAGTGGGACTGGGTAGGGAAGGT 3950
Query 3952 TTACAGTCGTGATAGAGTTCTGAAGCTAATGGGAGAGCTTCATGAATTGGGTTTACAGGG 4011
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3951 TTACAGTCGTGATAGAGTTCTGAAGCTAATGGGAGAGCTTCATGAATTGGGTTTACAGGG 4010
Query 4012 AATCAGGAAGACGGTAAGGATCTTAGATTGTCAAGGATCTTCCTCATAAACACGTTTCCG 4071
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4011 AATCAGGAAGACGGTAAGGATCTTAGATTGTCAAGGATCTTCCTCATAAACACGTTTCCG 4070
Query 4072 CTTGCAGCTGAAACAAGCGGAGAAGATGGGACCAACGAGATCAGCCACGAGGAAGTTAAT 4131
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct 4071 CTTGCAGCTGAAACAAGCGGAGAAGATGGGACCAACGGGATCAGCCACCAGGAAGTTAAT 4130
Query 4132 AAGATCTGATTTTTGGCATCCTTTGATCCTGGAAGAACTTGTGCTGAAAAGTGAGTTCGT 4191
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4131 AAGATCTGATTTTTGGCATCCTTTGATCCTGGAGGAACTTGTGCTGAAAAGTGAGTTCGT 4190
Query 4192 CAAAGAGCTCTGGCGAGGCATTAGAGCTGTGAAGGGAAAGAAGGTTAAGAAGAGGAAGAA 4251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4191 CAAAGAGCTCTGGCGAGGCATTAGAGCTGTGAAGGGAAAGAAGGTTAAGAAGAGGAAGAA 4250
Query 4252 ACGGGAACCTAGCCTGCCAGCTTTGGAACCCCAGAATTTTCCCTGTGTTGGGGGGTTGGA 4311
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4251 ACGGGAACCTAGCCTGCCAGCTTTGGAACCCCAGAATTTTCCCTGTGTTGGGGGGTTGGA 4310
Query 4312 GGTATGATTAGTAGGCTTAATTATAAAGTTCTCGTTCAACCAGAACTAGATAAAGCTACA 4371
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4311 GGTATGATTAGTAGGCTTAATTATAAAGTTCTCGTTCAACCAGAACTAGATAAAGCTACA 4370
Query 4372 AGGGCAGTCTCTAGAATTACTTACGGATTGGTTGTTGTTGGTAAAGCTGATGGGTATAGT 4431
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4371 AGGGCAGTCTCTAGAATTACTTACGGATTGGTTGCTGTTGGTAAAGCTGATGGGTATAAT 4430
Query 4432 TTTGAGGTTGTGGATTG--ATCAAGTTAACTCCACTGACGAAGATAAGCTTGTGAGTTTC 4489
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4431 TTTGAGGTTGTGGATTGTGATCAAGTTAACTCCACTGACGAAGATAAGCTTGTGAGTTTC 4490
Query 4490 ATTGGATCTGGTGGGTGTCAAACACACTTTAAGAAGCAGCTAGTAGCAAGGAAGTTAGCA 4549
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4491 ATTGGATCTGGTGGGTGTCAAACACACTTTAAGAAGCAGCTAGTAGCAAGGGAGTTAGCA 4550
Query 4550 TTGTTTAATCCCGAAAAATTCATGAACCTAAGACTACCTCATGACAAGGGAATTCTAGTC 4609
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4551 TTGTTTAATCCCGAAAAAT-CATGAACCTAAGACTACCTCATGACAAGGGAATTCTAGTC 4609
Query 4610 TTTGCTGGTCATAGAATTGCTCAAACCACATTGTGAGATTGATGCCATTTTGATAGAAAT 4669
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4610 TTTGCTGGTCATAGAATTGCTCAAACCACATTGTGAGATTGATGCCATTTTGATAGAAAT 4669
Query 4670 CGTCGGTATATAAAGAGAAAGTTTGCGATGTAAGATGTGCTCTTACGAAGGAAAATAGGA 4729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4670 CGTCGGTATATAAAGAGAAAGTTTGCGATGTAAGATGTGCTCTTACGAAGGAAAATAGGA 4729
Query 4730 TTGCTAACTTTTCCATCTATATAAAATGAAAAGCAAGTTTTTGTATCAGGAAAGAGGCAA 4789
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4730 TTGCTAACTTTTGCATCTATATAAAATGAAAAGCAAGTTTTTGTATCAGGAAAGAGGCAA 4789
Query 4790 GGACAGATCCGCCGAAGAAGGATCGGGGTTAGAACTAGTCTGAAGCTTAAGGCTTTTGCT 4849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4790 GGACAGATCCGCCGAAGAAGGATCGGGGTTAGAACTAGTCTGAAGCTTAAGGCTTTTGCT 4849
Query 4850 ATTCAAGAAGGCTCTCCCTGCTGGCTCCATGTATGCTAT 4888
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4850 ATTCAAGAAGGCTCTCCCTGCTGGCTCCATGTATGCTAT 4888
> Ahg932769 jgi|Araly1|932769|scaffold_400757.1
Length=433
Score = 65.8 bits (35), Expect = 3e-09
Identities = 35/35 (100%), Gaps = 0/35 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4761 AGCAAGTTTTTGTATCAGGAAAGAGGCAAGGACAG 4795
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 365 AGCAAGTTTTTGTATCAGGAAAGAGGCAAGGACAG 399
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 184997862353
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5