BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G13680.1
Length=5925
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg931114 jgi|Araly1|931114|scaffold_303571.1 9779 0.0
Ahg936735 jgi|Araly1|936735|scaffold_500926.1 363 1e-98
Ahg932422 jgi|Araly1|932422|scaffold_400410.1 346 1e-93
Ahg932459 jgi|Araly1|932459|scaffold_400447.1 324 5e-87
Ahg325786 jgi|Araly1|325786|fgenesh1_pm.C_scaffold_6001006 121 8e-26
> Ahg931114 jgi|Araly1|931114|scaffold_303571.1
Length=5813
Score = 9779 bits (5295), Expect = 0.0
Identities = 5619/5780 (97%), Gaps = 4/5780 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 148 GGAGAGATGGCACAGAGTAGTACATCTCATGACTCAGGCCCTCAGGGGCTCATGAGACGG 207
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 15 GGAGAGATGGCACAGAGTAGTACATCTCATGACTCAGGCCCTCAGGGGCTAATGAGGCGG 74
Query 208 CCATCTCGTAGTGCTGCCACAACAGTGTCTATTGAAGTTTTTGATCATGAGGTGGTTCCG 267
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 75 CCATCTCGTAGTGCCGCCACAACAGTGTCTATTGAAGTTTTTGACCATGAGGTGGTTCCG 134
Query 268 GCCTCCCTTGGTACCATTGCTCCTATTCTGCGTGTTGCTGCAGAGATTGAACATGAGCGC 327
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 135 GCCTCCCTTGGTACCATTGCCCCTATTCTGCGTGTTGCTGCAGAGATTGAACATGAGCGC 194
Query 328 CCTCGTGTTGCCTATCTCTGTCGGTTTTATGCATTTGAGAAAGCTCACAGGTTGGATCCA 387
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 195 CCTCGTGTTGCCTATCTTTGTCGATTTTATGCATTCGAGAAAGCTCACAGGTTGGATCCA 254
Query 388 AGCTCTGGTGGTCGAGGTGTGAGGCAGTTTAAGACACTTCTCTTTCAAAGATTAGAAAGG 447
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 255 AGTTCTGGTGGTCGAGGTGTGAGGCAGTTTAAGACACTTCTCTTTCAAAGATTAGAAAGG 314
Query 448 GACAATGCTTCCAGTCTTGCTTCTAGGGTGaaaaaaaCTGATGGACGGGAAGTTGAGAGC 507
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 315 GACAATGCTTCCAGTCTTGCTTCTAGGGTGAAGAAAACTGATGGACGGGAAGTTGAGAGC 374
Query 508 TTCTATCAACAATATTATGAGCACTATGTCAGGGCACTTGATCAAGGAGATCAAGCAGAC 567
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 375 TTCTATCAACAATATTATGAGCACTATGTCAGGGCACTTGATCAAGGAGATCAAGCAGAC 434
Query 568 AGAGCTCAGCTTGGTAAAGCATACCAGACGGCTGGAGTGCTCTTTGAAGTGCTCATGGCA 627
|||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 435 AGAGCTCAACTTGGTAAAGCATACCAGACGGCCGGAGTGCTCTTTGAAGTGCTCATGGCA 494
Query 628 GTTAACAAGAGCGAGAAAGTTGAAGCAGTAGCTCCTGAGATTATTGCAGCTGCTAGAGAT 687
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 495 GTTAACAAGAGCGAGAAAGTTGAAGCAGTAGCTCCTGAGATTATCGCAGCTGCTAGAGAT 554
Query 688 GTCCAAGAAAAGAACGAAATTTATGCACCCTACAACATTCTTCCTTTGGATTCTGCTGGG 747
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 555 GTCCAAGAAAAGAACGAAATTTATGCACCATACAACATTCTTCCATTGGATTCTGCTGGG 614
Query 748 GCCTCGCAGTCTGTTATGCAGCTTGAGGAGGTCAAAGCCGCTGTAGCTGCTTTGGGGAAC 807
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 615 GCCTCGCAGTCGGTAATGCAGCTTGAGGAGGTCAAAGCCGCTGTAGCTGCCTTGGGGAAC 674
Query 808 ACTCGTGGATTGAACTGGCCATCTGGGTTTGAGCAGCACCGAAAGAAAACCGGAAATCTG 867
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 675 ACTCGTGGATTGAACTGGCCATCTGGATTTGAGCAGCACCGAAAGAAAACTGGAAATCTT 734
Query 868 GATCTTCTTGACTGGTTAAGAGCTATGTTCGGATTCCAGAGAGACAATGTCAGAAACCAG 927
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 735 GATCTTCTTGACTGGTTAAGAGCTATGTTCGGATTCCAGAGAGACAATGTCAGAAACCAG 794
Query 928 AGGGAACATCTGGTTTGTTTATTTGCTGATAATCACATAAGATTGACTCCCAAGCCAGAA 987
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 795 AGGGAACATCTGGTTTGTTTACTTGCTGATAATCACATAAGATTGACTCCCAAACCAGAA 854
Query 988 CCTCTGAACAAGCTCGATGACAGAGCCGTTGATACTGTCATGTCAAAGCTCTTTAAGAAC 1047
|||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||
Sbjct 855 CCTCTGAACAAGCTTGATGACAGAGCCGTTGATGCCGTCATGACAAAGCTCTTTAAGAAC 914
Query 1048 TACAAGAATTGGTGCAAATTTTTAGGACGTAAACACAGTTTAAGGCTTCCTCAAGCTGCT 1107
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 915 TACAAGAACTGGTGCAAATTCTTAGGACGTAAACACAGTTTAAGGCTTCCTCAAGCTGCT 974
Query 1108 CAAGATATACAACAGCGGAAGATACTATATATGGGCTTGTATCTTCTCATCTGGGGAGAA 1167
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 975 CAAGATATACAACAGCGGAAGATACTATACATGGGCTTGTATCTTCTTATCTGGGGTGAA 1034
Query 1168 GCTGCAAATATTCGCTTCATGCCAGAATGCTTGTGCTATATTTTCCACAATATGGCTTAT 1227
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1035 GCTGCAAATATTCGCTTCATGCCAGAATGCTTGTGCTACATTTTCCACAATATGGCTTAT 1094
Query 1228 GAACTCCATGGTCTCTTGGCTGGAAATGTCAGCATCGTTACCGGAGAAAATATTAAGCCT 1287
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 1095 GAACTCCATGGTCTCTTGGCTGGAAATGTCAGCATCGTAACTGGAGAAAATATTAAGCCT 1154
Query 1288 TCTTACGGTGGAGATGATGAGGCATTTTTAAGGAAGGTCATTACACCAATCTACCGTGTA 1347
||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1155 TCTTACGGTGGAGATGATGAGGCATTTCTACGGAAGGTCATTACACCAATCTACCGTGTA 1214
Query 1348 GTTCAAACGGAAGCAAACAAGAATGCAAATGGCAAGGCTGCTCACTCAGATTGGTCCAAC 1407
||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1215 GTTCAAAAGGAAGCAAATAAGAATGCGAATGGCAAGGCTGCTCACTCAGATTGGTCCAAC 1274
Query 1408 TATGATGATCTGAACGAATATTTCTGGACTCCTGATTGCTTCTCTCTTGGCTGGCCAATG 1467
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1275 TATGATGATCTGAACGAATATTTCTGGACTCCTGACTGCTTCTCGCTTGGCTGGCCAATG 1334
Query 1468 CGTGATGATGGGGATCTTTTCAAATCAACCCGTGATACGACACA-GGGAAAGAAAGGATC 1526
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||
Sbjct 1335 CGTGATGATGGAGATCTTTTCAAATCAACCCGTGATACGACACAGGGGAAA-AAGGGATC 1393
Query 1527 GTTTAGAAAAGCAGGACGCACAGGCAAATCAAATTTCACCGAAACTCGGACATTTTGGCA 1586
||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1394 GTTAAGAAAACCAGGAAGCACAGGCAAATCAAATTTCACCGAAACTCGAACATTTTGGCA 1453
Query 1587 CATATATCATAGTTTTGACCGACTCTGGACATTCTATCTATTAGCCCTGCAGGCAATGAT 1646
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 1454 CATATATCATAGTTTTGACAGACTCTGGACATTCTATCTATTAGCACTCCAGGCAATGAT 1513
Query 1647 CATTCTAGCATTTGAACGAGTAGAGCTGAGAGAAATCTTACGCAAAGATGTTTTATATGC 1706
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1514 CATTCTTGCATTTGAACGAGTAGAGCTGAGAGAAATATTACGCAAAGATGTTTTATATGC 1573
Query 1707 TCTCTCAAGTATCTTCATCACAGCAGCTTTTCTGCGCTTCCTTCAGAGTGTCCTGGACGT 1766
|||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1574 TCTCTCCAGTATCTTCATTACAGCAGCTTTTCTACGCTTCCTTCAGAGTGTCCTGGACGT 1633
Query 1767 TATCTTAAACTTCCCAGGTTTCCACAGGTGGAAATTTACTGATGTTTTGAGAAATATTCT 1826
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1634 TATCTTAAACTTCCCAGGTTTCCACCGGTGGAAATTCACTGATGTTTTGAGAAATATTCT 1693
Query 1827 CAAGATCGTTGTCAGTCTCGCTTGGTGTGTTGTGTTACCCCTTTGCTATGCCCAGTCTGT 1886
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1694 CAAGATTGTTGTCAGTCTCGCTTGGTGTGTTGTTTTACCCCTTTGCTATGCCCAGTCTGT 1753
Query 1887 CTCTTTTGCTCCTGGGAAGCTGAAACAATGGCTATCATTTCTTCCACAAGTTAAAGGCGT 1946
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1754 CTCTTTTGCTCCTGGGAAGCTGAAACAATGGTTATCATTTCTTCCACAAGTTAAAGGCGT 1813
Query 1947 TCCTCCTCTTTATATCATGGCTGTTGCACTGTACTTGCTTCCAAATGTACTGGCAGCTAT 2006
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1814 TCCTCCGCTTTATATCATGGCTGTAGCACTGTACTTGCTTCCAAATGTACTGGCAGCTAT 1873
Query 2007 CATGTTCATTTTTCCAATGCTTCGACGCTGGATCGAGAATTCAGACTGGCATATATTTAG 2066
||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1874 CATGTTCATTTTTCCAATGTTTCGGCGCTGGATCGAGAATTCAGACTGGCATATATTTAG 1933
Query 2067 ATTGCTTCTGTGGTGGTCACAGCCAAGAATTTATGTTGGAAGAGGGATGCATGAAAGTCA 2126
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1934 ATTGCTTTTGTGGTGGTCACAGCCAAGAATTTATGTTGGAAGAGGGATGCATGAAAGTCA 1993
Query 2127 AATTGCACTCATAAAGTATACGATTTTCTGGCTGTTGCTTTTCTGCTGCAAATTTGCATT 2186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1994 AATTGCACTCATAAAGTATACGATTTTCTGGCTGTTGCTTTTCTGCTGCAAATTTGCATT 2053
Query 2187 CAGCTACTTTCTACAGGTGAAACTTTTGGTGAAGCCAACTAACGCAATTATGAGCATTCG 2246
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2054 CAGCTACTTTCTACAGGTGAGACTTTTGGTGAAGCCAACTAACGCAATTATGAGCATTCG 2113
Query 2247 CCATGTAAAATACAAATGGCATGAGTTTTTCCCCAATGCTGAGCACAACTATGGAGCTGT 2306
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2114 CCATGTAAAATACAAATGGCATGAGTTTTTCCCCAATGCTGAGCACAACTATGGAGCAGT 2173
Query 2307 GGTGTCACTCTGGTTACCAGTAATTCTGGTTTACTTTATGGACACTCAAATTTGGTATGC 2366
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2174 GGTGTCGCTCTGGTTACCAGTAATCCTGGTTTACTTTATGGACACTCAAATTTGGTATGC 2233
Query 2367 TATTTTCTCCACTATATGTGGTGGTGTCATTGGGGCCTTTGATCGTTTGGGAGAGATACG 2426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2234 TATTTTCTCCACTATATGTGGTGGTGTCATTGGGGCCTTTGATCGTTTGGGAGAGATACG 2293
Query 2427 AACGCTTGGAATGCTAAGGTCAAGGTTCCAATCATTACCTGGTGCATTTAATACGTACCT 2486
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2294 AACGCTTGGAATGCTAAGGTCAAGGTTCCAATCACTACCTGGTGCATTTAATACGTACCT 2353
Query 2487 GGTTCCTTCTGATAAAACAAGGAGAAGAGGGTTTTCCTTGTCAAAAAGATTTGCAGAGGT 2546
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2354 GGTTCCTTCTGATAAAACAAGGAGAAGAGGCTTTTCCTTGTCAAAAAGATTTGCAGAGGT 2413
Query 2547 CACTGCAGCAAGAAGAACTGAAGCGGCAAAATTCTCCCAACTCTGGAATGAAATCATTTC 2606
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2414 CACTGCAGCAAGAAGAACTGAAGCGGCAAAATTTTCCCAACTCTGGAATGAAATCATTTC 2473
Query 2607 CAGCTTCCGAGAGGAAGATCTAATCAGTGACAGGGAGATGGATCTGTTGCTTGTTCCTTA 2666
||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2474 CAGCTTCCGAGAGGAAGATCTCATCAGTGACAGAGAGATGGATCTGTTGCTTGTTCCTTA 2533
Query 2667 TACTTCAGACCCTAGTTTGAAACTAATTCAGTGGCCACCATTTTTGCTTGCAAGCAAGAT 2726
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2534 TACTTCGGACCCTAGTTTGAAACTAATTCAGTGGCCACCATTTTTGCTTGCAAGCAAGAT 2593
Query 2727 ACCGATAGCATTGGATATGGCAGCTCAGTTTCGAACAAGAGATTCTGACCTCTGGAAGCG 2786
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2594 ACCGATAGCATTGGATATGGCAGCTCAATTTCGAACAAGAGATTCTGACCTCTGGAAGCG 2653
Query 2787 CATATGCGCAGACGAATATATGAAATGTGCTGTCATTGAATGCTACGAATCTTTCAAACA 2846
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2654 CATATGCGCAGACGAATACATGAAATGCGCTGTCATTGAATGCTACGAATCATTCAAACA 2713
Query 2847 TGTCTTGCACACCTTGGTAATTGGGGAGAATGAGAAAAGGATTATTGGTATTATCATCAA 2906
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2714 TGTTTTGCACACCTTGGTAATTGGGGAGAATGAGAAAAGGATTATTGGTATCATCATCAA 2773
Query 2907 AGAGGTGGAGAGCAACATATCAAAGAATTCCTTCCTTTCGAATTTCAGAATGGCGCCTTT 2966
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2774 AGAGGTGGAGAGCAACATATCAAAGAATTCCTTCCTTTCGAATTTCAGAATGGCGCCTTT 2833
Query 2967 ACCTGCTCTTTGTAGTAAATTTGTCGAGCTTGTTGGAATTTTGAAAAATGCGGACCCAGC 3026
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 2834 ACCTGCTCTTTGTAGTAAATTTGTCGAGCTTGTTGGAATCTTGAAAAATGCGGATCCAGC 2893
Query 3027 GAAAAGAGACACAGTGGTGCTATTGTTGCAAGATATGTTAGAAGTAGTGACTCGAGATAT 3086
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2894 CAAAAGAGACACATTGGTGCTATTGTTGCAAGATATGTTAGAAGTAGTGACTCGAGATAT 2953
Query 3087 GATGCAAAATGAAAACCGTGAATTGGTAGAACTTGGGCATACTAACAAGGAATCCGGAAG 3146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2954 GATGCAAAATGAAAACCGTGAATTGGTAGAACTTGGGCATACTAACAAGGAATCCGGAAG 3013
Query 3147 GCAACTCTTTGCTGGTACTGACGCAAAGCCTGCTATACTGTTTCCTCCAGTGGCAACAGC 3206
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3014 GCAACTCTTTGCTGGTACTGACGCAAAACCTGCTATACTGTTTCCTCCAGTGGCAACAGC 3073
Query 3207 TCAATGGCATGAACAGATAAGTCGCCTTCATTTACTTTTGACGGTAAAAGAATCTGCAAT 3266
||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3074 TCAATGGGATGAACAGATAAGTCGCCTGCATTTACTCTTGACGGTAAAAGAATCTGCAAT 3133
Query 3267 GGATGTTCCAACAAACCTTGAAGCACAAAGAAGGATTGCCTTCTTCACAAATTCACTGTT 3326
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3134 GGATGTTCCGACAAACCTTGAAGCGCAAAGAAGGATTGCTTTCTTCACAAATTCACTGTT 3193
Query 3327 TATGGATATGCCACGAGCTCCTCGTGTCAGAAATATGCTGTCCTTCAGTGTTCTGACTCC 3386
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3194 TATGGATATGCCGCGAGCTCCTCGTGTCAGAAATATGCTGTCCTTCAGTGTTCTGACTCC 3253
Query 3387 GTACTATAGTGAGGAAACCGTCTACTCTAAGAACGACCTGGAAATGGAGAATGAAGATGG 3446
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3254 GTACTATAGTGAGGAAACCGTCTACTCTAAGAACGACCTGGAAATGGAAAATGAAGATGG 3313
Query 3447 TGTATCAGTTGTATACTATTTGCAGAAGATCTTTCCAGATGAGTGGACTAACTTCTTGGA 3506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3314 TGTATCAGTTGTATACTATTTGCAGAAGATCTTTCCAGATGAGTGGACTAACTTCTTGGA 3373
Query 3507 GCGGCTTGATTGTAAAGATGAAACTTCTGTTTTGGAGAGTGAAGAAAATATATTGCAGCT 3566
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3374 GCGGCTTGGTTGTAAAGATGAAACTTCTGTTTTGGAGAGTGAAGAAAATATATTACAGCT 3433
Query 3567 TCGCCATTGGGTTTCTTTGAGGGGACAGACTTTGTTTAGAACAGTTAGAGGAATGATGTA 3626
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3434 TCGCCATTGGGTTTCTTTGAGGGGACAGACTTTGTTTAGAACTGTTAGAGGAATGATGTA 3493
Query 3627 TTACAGGCGGGCATTAAAGCTTCAGGCTTTTCTTGACATGGCTAATGAAACAGAAATATT 3686
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3494 TTACAGGCGGGCACTAAAGCTTCAGGCTTTTCTTGACATGGCTAATGAAACAGAAATATT 3553
Query 3687 AGCAGGGTACAAAGCCATTTCAGAGCCAACTGAGGAGGACAAGAAAAGTCAGAGATCCTT 3746
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3554 AGCAGGGTACAAAGCCATTTCAGAGCCAACTGAGGAGGACAAGAAAAGTCAGAGATCCTT 3613
Query 3747 GTACACTCAGTTAGAGGCAGTGGCAGATCTCAAATTTACTTATGTTGCTACCTGTCAGAA 3806
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3614 GTACGCTCAGTTAGAGGCAGTGGCAGATCTCAAATTTACTTATGTTGCTACCTGTCAGAA 3673
Query 3807 TTATGGAAATCAGAAGCGAAGTGGAGACCGGAGAGCTACTGACATCTTGAACCTGATGGT 3866
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3674 TTATGGAAATCAGAAGCGAAGTGGAGACAGGAGAGCTACTGACATCTTGAACCTAATGGT 3733
Query 3867 TAACAATCCCTCTCTCCGTGTAGCATACATTGATGAGGTTGAGGAACGAGAAGGCGGAAA 3926
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3734 TAACAATCCCTCTCTCCGTGTAGCGTACATTGATGAGGTTGAGGAACGAGAAGGCGGAAA 3793
Query 3927 AGTGCAGAAAGTTTTCTACTCGGTGCTTATCAAGGCTGTTGATAATCTTGATCAGGAAAT 3986
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3794 AGTGCAGAAAGTTTTCTACTCGGTGCTTATCAAGGCTGTTGATAATCTTGATCAGGAAAT 3853
Query 3987 ATATCGGATAAAACTACCTGGACCAGCAAAAATTGGAGAAGGAAAACCCGAAAATCAGAA 4046
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3854 ATATCGGATAAAACTGCCTGGTCCAGCAAAAATTGGAGAAGGAAAACCCGAAAATCAGAA 3913
Query 4047 TCATGCTCTCATTTTTACTAGAGGAGAAGCTCTCCAGGCTATTGACATGAATCAGGACCA 4106
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3914 TCATGCTCTCATTTTTACAAGAGGAGAAGCTCTCCAGGCTATTGACATGAATCAGGACCA 3973
Query 4107 TTACTTGGAAGAAGCACTTAAAATGAGGAATCTGCTGGAAGAGTTCAATGAAGACCATGG 4166
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3974 TTACTTGGAAGAAGCACTTAAAATGAGGAATTTGCTGGAAGAGTTCAATGAAGACCATGG 4033
Query 4167 AGTACGTGCACCCACTATTCTTGGTTTCAGAGAGCATATTTTTACTGGCAGTGTTTCTTC 4226
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4034 AGTACGTGCACCCACTATTCTTGGTTTCAGAGAGCATATTTTTACTGGCAGTGTTTCTTC 4093
Query 4227 TTTAGCCTGGTTTATGTCAAATCAGGAAACAAGTTTTGTGACCATTGGTCAGCGAGTCCT 4286
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4094 TTTAGCCTGGTTTATGTCAAATCAGGAAACAAGTTTTGTGACCATTGGTCAGCGAGTCCT 4153
Query 4287 GGCAAGTCCTTTGAAGGTAAGGTTTCACTATGGACACCCTGATGTCTTCGATAGAATCTT 4346
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4154 GGCAAGTCCTTTGAAGGTAAGGTTTCACTATGGTCACCCTGATGTCTTTGATAGAATCTT 4213
Query 4347 CCACATCACTCGGGGTGGCATCAGCAAAGCTTCACGGGGCATAAATCTTAGCGAGGATAT 4406
|||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4214 CCACATTACTCGGGGTGGCATCAGCAAAGCATCACGGGGCATAAATCTTAGCGAGGATAT 4273
Query 4407 CTTTGCTGGTTTCAACTCAACTCTGAGGCGTGGTAATGTCACCCATCATGAGTACATCCA 4466
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4274 CTTTGCTGGTTTCAACTCAACTCTGAGGCGTGGTAATGTCACTCATCATGAGTACATCCA 4333
Query 4467 AGTAGGGAAAGGAAGAGATGTTGGTTTGAACCAGATATCACTCTTTGAAGCCAAGGTTGC 4526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4334 AGTAGGGAAAGGAAGAGATGTTGGTTTGAACCAGATATCTCTCTTTGAAGCCAAGGTTGC 4393
Query 4527 TTGTGGAAACGGAGAGCAAACATTGAGTAGGGATCTCTACCGACTTGGGCATCGTTTTGA 4586
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 4394 TTGTGGCAACGGAGAGCAAACATTGAGTAGGGATCTCTACCGACTTGGGCATCGCTTCGA 4453
Query 4587 CTTTTTCCGCATGATGTCTTGTTATTTCACAACTGTAGGCTTCTACATCAGCTCGATGAT 4646
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4454 TTTTTTCCGCATGATGTCTTGTTATTTCACAACAGTAGGCTTCTACATCAGCTCGATGAT 4513
Query 4647 TGTTGTCCTCACAGTTTATGCATTCTTGTATGGAAGACTTTACTTGTCATTGAGTGGAGT 4706
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4514 TGTTGTCCTCACAGTTTATGCATTCTTGTATGGAAGACTTTACTTGTCATTGAGTGGAGT 4573
Query 4707 GGAAGAGGCGATAGTAAAGTTTGCAGCAGCGAAAGGAGATAGTTCTCTTAAGGCAGCGAT 4766
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||
Sbjct 4574 GGAAGAGGCGATAGTAAAGTTTGCAGCGGCGAAAGGAGATAGTTCGCTCAAGGCAGCCAT 4633
Query 4767 GGCGTCACAGTCCGTAGTGCAATTGGGTCTGCTGATGACACTACCAATGGTGATGGAGAT 4826
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4634 GGCGTCACAGTCCGTAGTGCAATTGGGTCTGCTGATGACACTACCAATGGTGATGGAGAT 4693
Query 4827 TGGGCTAGAGAGAGGATTCAGAACGGCGTTGTCTGATCTAATCATAATGCAGCTTCAGTT 4886
||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4694 TGGGCTAGAAAGAGGATTCAGAACTGCGTTGTCCGATATAATCATAATGCAGCTTCAGTT 4753
Query 4887 AGCGCCTGTCTTCTTCACCTTCTCACTTGGAACAAAGGTTCATTACTATGGTCGGACCAT 4946
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4754 AGCGCCTGTCTTCTTCACCTTCTCACTTGGAACAAAGGTTCATTACTATGGTCGGACCAT 4813
Query 4947 CCTACATGGGGGATCAAAGTACAGAGCAACAGGGCGTGGGTTTGTGGTGAAGCACGAGAA 5006
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4814 CCTACATGGGGGAGCAAAGTACAGAGCAACAGGGCGTGGGTTTGTGGTGAAGCACGAGAA 4873
Query 5007 GTTTGCAGAGAACTACAGAATGTATTCGAGAAGCCACTTTGTGAAAGGAATGGAGCTGAT 5066
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4874 GTTTGCAGAGAACTACAGAATGTATTCGAGAAGCCACTTTGTGAGAGGAATGGAGCTGAT 4933
Query 5067 GGTGCTGCTGATATGTTACAGGATTTATGGGAAAGCAGCAGAGGACTCGGTGGGTTATGC 5126
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||
Sbjct 4934 GGTGCTGCTGATATGTTACAGGATTTATGGGAAAGCAGCAGAAGACACGGTGGCATATGC 4993
Query 5127 GCTTGTCATGGGCTCAACATGGTTCCTGGTGGGTTCCTGGTTGTTCGCCCCATTCTTTTT 5186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4994 GCTTGTCATGGGCTCAACATGGTTCCTGGTGGGTTCCTGGTTGTTCGCCCCATTCTTTTT 5053
Query 5187 CAATCCCTCGGGATTCGAGTGGCAGAAGATAGTTGATGACTGGGATGATTGGAACAAGTG 5246
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 5054 CAATCCCTCGGGATTCGAGTGGCAGAAGATAGTTGATGACTGGGATGATTGGAATAAGTG 5113
Query 5247 GATAAGCAGCAGAGGAGGTATCGGAGTACCAGCAAACAAAAGCTGGGAATCATGGTGGGA 5306
|||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5114 GATAAGCAGCAGAGGAGGCATCGGAGTGCCAGCACACAAAAGCTGGGAATCATGGTGGGA 5173
Query 5307 AGAGGAACAAGAGCATCTTCTTCACTCTGGGTTTTTCGGAAAGTTCTGGGAGATATTTCT 5366
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 5174 AGAAGAACAAGAGCATCTGCTTCACTCTGGGTTTTTCGGAAAGTTTTGGGAGATATTTCT 5233
Query 5367 CTCACTGCGGTACTTCATTTACCAGTATGGTATTGTGTACCAATTGAACTTGACCAAGGA 5426
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 5234 CTCACTGCGGTACTTCATTTACCAGTACGGTATTGTGTACCATTTGAACTTGACCAAGGA 5293
Query 5427 GAGCCGAATGGGAAAACAGCACAGCATCATTGTGTATGGACTGTCTTGGCTGGTGATCGT 5486
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5294 GAGCCGAATGGGAAAACAGCAGAGCATCATTGTGTATGGACTGTCTTGGCTGGTGATCGT 5353
Query 5487 GGCAGTGATGATAGTCCTCAAGATAGTGTCGATGGGGAGAAAGAAGTTCAGTGCTGATTT 5546
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 5354 GGCAGTGATGATAGTCCTGAAGATAGTGTCGATGGGGAGAAAGAAGTTCAGCGCCGATTT 5413
Query 5547 CCAGCTTATGTTCAGGCTTTTGAAGCTGTTTCTGTTCATAGGATCAGTGGTGATCGTGGG 5606
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5414 CCAGCTTATGTTCAGGCTTTTGAAGCTGTTTCTTTTCATAGGATCAGTGGTGATCGTGGG 5473
Query 5607 GATGCTATTCCACTTCTTGAAGCTGACCGTGGGAGACATAATGCAGTCTCTGTTGGCGTT 5666
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5474 GATGCTATTCCACTTCTTAAAGCTGACGGTGGGAGACATAATGCAGTCTCTGTTGGCGTT 5533
Query 5667 TTTACCCACGGGATGGGCTCTCCTTCAGATATCACAAGTGGCGAGGCCA-TTGATGAAGA 5725
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 5534 TTTACCCACGGGATGGGCTCTGCTTCAGATATCACAAGTGGCGAGGC-AGTTGATGAAGG 5592
Query 5726 CAGTAGGAATGTGGGGATCGGTCAAGGCCTTGGCTAGAGGGTATGAGTACATCATGGGAG 5785
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5593 CAGTAGGAATGTGGGGATCGGTCAAGGCCTTGGCTAGAGGGTATGAGTACATAATGGGAG 5652
Query 5786 TTGTTATCTTCATGCCAGTTACTGTACTCGCGTGGTTCCCTTTCGTCTCTGAGTTCCAGA 5845
||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5653 TTGTTATCTTCATGCCAGTCACCGTACTCGCATGGTTCCCTTTCGTCTCTGAGTTCCAGA 5712
Query 5846 CAAGGCTTCTCTTCAATCAAGCCTTTAGCCGTGGTCTCCAGATCCAACGTATTCTCGCCG 5905
| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5713 CCAGGCTTCTCTTCAACCAGGCCTTTAGCCGTGGTCTCCAGATCCAACGTATTCTCGCCG 5772
Query 5906 GTGGTAAGAAGCAGAAATAA 5925
||||||||||||||||||||
Sbjct 5773 GTGGTAAGAAGCAGAAATAA 5792
> Ahg936735 jgi|Araly1|936735|scaffold_500926.1
Length=283
Score = 363 bits (196), Expect = 1e-98
Identities = 229/245 (93%), Gaps = 2/245 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 5016 GAACTACAGAATGTATTCGAGAAGCCACTTTGTGAAAGGAATGGAGCTGATGGTGCTGCT 5075
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 11 GAACTACAGGATGTATTCGAGAAGCCACTTTGTGAAAGGAATGGAGCTGATGGTGCTGCT 70
Query 5076 GATATGTTACAGGATTTATGGGAAAGCAGCAGAGGACTCGGTGGGTTATGCGCTTGTCAT 5135
||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||
Sbjct 71 GATATGTTACAGGCTGTACGGGAAAGCAACAGAGGACTCAGTGGCATATGCGCTTGTGAT 130
Query 5136 GGGCTCAACATGGTTCCTGGTGGGTTCCTGGTTGTTCGCCCCA-TTCTTTTTCAATCCCT 5194
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||
Sbjct 131 GGGCTCAACCTGGTTCCTGGTGGGTTCCTGGTTGTTTGATC-AGTTCTTTTTCAATCCCT 189
Query 5195 CGGGATTCGAGTGGCAGAAGATAGTTGATGACTGGGATGATTGGAACAAGTGGATAAGCA 5254
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 190 CAGGATTCGAGTGGCAGAAGATAGTTGATGACTGGGATGATTGGAACAAGTGGATAAGCA 249
Query 5255 GCAGA 5259
|||||
Sbjct 250 GCAGA 254
> Ahg932422 jgi|Araly1|932422|scaffold_400410.1
Length=283
Score = 346 bits (187), Expect = 1e-93
Identities = 226/245 (92%), Gaps = 2/245 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 5016 GAACTACAGAATGTATTCGAGAAGCCACTTTGTGAAAGGAATGGAGCTGATGGTGCTGCT 5075
||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 11 GAACTACAGGATGTATTCAAGAAGCCACTTTGTGAAAGGAATGGAGCTGATGGTGCTGCT 70
Query 5076 GATATGTTACAGGATTTATGGGAAAGCAGCAGAGGACTCGGTGGGTTATGCGCTTGTCAT 5135
||||||||||||| | || |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||
Sbjct 71 GATATGTTACAGGCTGTACAGGAAAGCAACAGAGGACTCAGTGGCATATGCGCTTGTGAT 130
Query 5136 GGGCTCAACATGGTTCCTGGTGGGTTCCTGGTTGTTCGCCCCA-TTCTTTTTCAATCCCT 5194
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||
Sbjct 131 GGGCTCAACCTGGTTCCTGGTGGGTTCCTGGTTGTTTG-ATCAGTTCTTTTTCAATCCCT 189
Query 5195 CGGGATTCGAGTGGCAGAAGATAGTTGATGACTGGGATGATTGGAACAAGTGGATAAGCA 5254
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 190 CAAGATTCGAGTGGCAGAAGATAGTTGATGACTGGGATGATTGGAACAAGTGGATAAGCA 249
Query 5255 GCAGA 5259
|||||
Sbjct 250 GCAGA 254
> Ahg932459 jgi|Araly1|932459|scaffold_400447.1
Length=245
Score = 324 bits (175), Expect = 5e-87
Identities = 217/237 (92%), Gaps = 4/237 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 5016 GAACTACA-GAATGTATTCGAGAAGCCACTTTGTGAAAGGAATGGAGCTGATGGTGCTGC 5074
|||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 11 GAACTACATG-ATGTATTCGAGAAGCCACTTTGTGAAAGGAATGGAGCTGATGGTGCTGC 69
Query 5075 TGATATGTTACAGGATTTATGGGAAAGCAGCAGAGGACTCGGTGGGTTATGCGCTTGTCA 5134
|||| ||||||||| | || ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |
Sbjct 70 TGATGTGTTACAGGCTGTACGGGAAAGCAACAGAGGACTCAGTGGCATATGCGCTTGTGA 129
Query 5135 TGGGCTCAACATGGTTCCTGGTGGGTTCCTGGTTGTTCGCCCCA-TTCTTTTTCAATCCC 5193
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | | | |||||||||||||||
Sbjct 130 TGGGCTCAACCTGGTTCCTGGTGGGTTCTTGGTTGTTTGATC-AGTTCTTTTTCAATCCC 188
Query 5194 TCGGGATTCGAGTGGCAGAAGATAGTTGATGACTGGGATGATTGGAACAAGTGGATA 5250
|| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 189 TCAGGATTCGAGTGGCAGAAGATAGTTGATGACTAGGATGATTGGAACAAGTGGATA 245
> Ahg325786 jgi|Araly1|325786|fgenesh1_pm.C_scaffold_6001006
Length=5709
Score = 121 bits (65), Expect = 8e-26
Identities = 118/143 (83%), Gaps = 6/143 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 283 ATTGCTCCTATTCTGCGTGTTGCTGCA-GAGATTGAA-CATGAG-CGCCCTCGTGTTGCC 339
|||||||| ||||| ||||||||| | ||| ||||| | | || |||| | |||||
Sbjct 133 ATTGCTCCCATTCTTCGTGTTGCT-AATGAGGTTGAATC-T-AGTAACCCTAGGGTTGCT 189
Query 340 TATCTCTGTCGGTTTTATGCATTTGAGAAAGCTCACAGGTTGGATCCAAGCTCTGGTGGT 399
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| ||||
Sbjct 190 TATCTCTGTCGGTTTTATGCATTTGAGAAAGCTCATAGATTGGATCCTACCTCCAGTGGA 249
Query 400 CGAGGTGTGAGGCAGTTTAAGAC 422
||||||| |||||||||||||
Sbjct 250 AGAGGTGTTCGGCAGTTTAAGAC 272
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 224463565554
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5