BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G16485.1
Length=5647
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg319845 jgi|Araly1|319845|fgenesh1_pm.C_scaffold_3002861 2250 0.0
Ahg319846 jgi|Araly1|319846|fgenesh1_pm.C_scaffold_3002862 1991 0.0
Ahg480812 jgi|Araly1|480812|fgenesh2_kg.3__3513__AT2G16485.1 1936 0.0
> Ahg319845 jgi|Araly1|319845|fgenesh1_pm.C_scaffold_3002861
Length=2019
Score = 2250 bits (1218), Expect = 0.0
Identities = 1335/1393 (96%), Gaps = 2/1393 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3343 ATGCTTACGCTGCGAGAATGTGTTGAGAAACTGCAACTGTTAAAATCTCCAGAGGAACGG 3402
||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTTTACGCTACGAGAATGTGTTGAGAAACTGCAACTGTTAAAATCTCCAGAGGAACGG 60
Query 3403 CAGCGCAGGCTAGAAGAAATTCCAGAAATACATGCTGATCCCAAAATGGATCCAGATTGT 3462
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CAGCGCAGGCTAGAAGAAATTCCAGAAATACATGCTGATCCCAAAATGGATCCAGATTGT 120
Query 3463 GAATCGgaagatgaagatgaaaaagaagaaaaggaaaaagagaaaCAACTGAGGCCGCGA 3522
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GAATCAGAAGATGAAGATGAAAAAGAAGAAAAGGAAAAAGAGAAACAACTGAGGCCGCGA 180
Query 3523 AGCAGTAGCTTTAACAGAAGAGGAAGAGATCCAATATCTCCACGAAAAGGAGGATTTAGT 3582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||
Sbjct 181 AGCAGTAGCTTTAACAGAAGAGGAAGAGATCCAATATCTCCACGAAAGGGAGTATTTAGT 240
Query 3583 TCCAATGAATCATGGACTGGCACAAGTAACTACTCAAATACAAGTGCAAATCGTGAGTTA 3642
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 241 TCCAATGAATCATGGACTGGCACAAGTAACTACTCGAATACAAGTGCAAATCGTGAATTA 300
Query 3643 AGCAGAAGTTATTCTGGTAGAGGTTCTACTGGGAGAGGGGATTATCTTGGTAGTTCTGAC 3702
| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ACCAGAAGTTATTCGGGTAGAGGTTCTACTGGTAGAGGGGATTATCTTGGTAGTTCTGAC 360
Query 3703 GACAAGGTTAGTGATAGTATGTGGACTTCAGCTAGAGAAAGAGAAGTGCAACCATCTTTA 3762
||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GACAAAGTTAGTGAAAGTATGTGGACTTCAGCTAGAGAAAGAGAAGTGCAACCATCTTTA 420
Query 3763 GGCTCTGAGAAGCCAAGATCTGTTTCAATTCCTGAAACTCCTGCCAGAAGTTCTCGTGCT 3822
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 421 GGCCCTGAGAAGCCAAGATCTGTTTCAATTCCTGAAACTACTCCCAGAAGTTCTCGTGCT 480
Query 3823 ATTGCACCACCAGAATTATCTCCTAGGATTGCCTCTGAAATTTCAATGGCACCTCCTGCT 3882
|||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 481 GTTGCGCCACCACAATTATCTCCTAGGATTGCCTCTGAAATTTCAACGGCACCTCCTGCT 540
Query 3883 GTTGTTTCGCAGCCTGTTCCCAAGTCAAATGATTCAGAGAAAATATGGCATTACAAGGAC 3942
|||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GTTGTTCCGCAGCCTGTTCCCAAGGCAAATGAGTCAGAGAAAATATGGCATTACAAGGAC 600
Query 3943 CCATCTGGTAAAGTTCAAGGACCTTTTTCGATGGCGCAGCTCCGTAAATGGAACAACACT 4002
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 CCATCTGGTAAAGTTCAAGGACCTTTTTCGATGGCGCAGCTCCGTAAATGGAACAACACT 660
Query 4003 GGGTACTTCCCTGCTAAGTTGGAAATCTGGAAAGC-AAATGAGTCACCGTTGGACTCTGT 4061
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||
Sbjct 661 GGGTACTTCCCTGCTAAGTTGGAAATCTGGAAAGCTAAA-GAGTCAGCGTTGGACTCTGT 719
Query 4062 TCTACTGACTGATGCATTGGCTGGACTATTTCAGAAGCAAACCCAGGCGGTGGATAATAG 4121
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 TCTCCTGACTGATGCATTGGCTGGACTATTTCAGAAGCAAACCCAGGCGGTGGATAATAG 779
Query 4122 CTATATGAAAGCTCAGGTAGCAGCTTTTTCTGGTCAATCAAGCCAATCTGAACCCAATTT 4181
||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 CTATACGAAAGCTCAGGTAGCAGCTTATTCTGGTCAATCAAGCCAATCTGAACCCAATTT 839
Query 4182 AGGTTTTGCTGCTAGGATTGCTCCAACAACCATTGAGATTCCTAGGAATTCCCAAGATAC 4241
||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 AGGTTCTACTGCTAGGACTGCTCCATCAACCATTGAGATTCCTAGGAATTCCCAAGATAC 899
Query 4242 TTGGAGTCAAGGTGGTAGTCTTCCATCCCCTACTCCAAATCAAATCACAACTCCAACAGC 4301
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 900 TTGGAGTCAAGGTGGGAGTCTTCCATCCCCTACTCCAAATCAAATCACTACTCCAACAGC 959
Query 4302 AAAAAGGCGAAATTTTGAGAGCAGATGGTCTCCAACCAAGCCATCTCCACAGTCAGCTAA 4361
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 AAAAAGGCGAAATTTTGAGAGCAGATGGTCTCCAACCAAGCCATCTCCACAGTCAGCTAA 1019
Query 4362 TCAGTCGATGAATTATTCAGTAGCACAATCTGGACAGAGTCAAACTTCTAGGATAGATAT 4421
||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1020 TCAGTCGATGAATTACTCAGTAGCACAATCTGTACAGAGTCAAGCTTCTAGGATAGATAT 1079
Query 4422 CCCTGTGGTTGTAAATTCTGCTGGTGCTCTACAGCCTCAAACTTACCCTATTCCAACACC 4481
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||
Sbjct 1080 CCCTGTGGTTGTAAATTCTGCTGGTACTCTACAGCCTCAAGCCTACTCTATTCCAACACC 1139
Query 4482 AGATCCGATCAACGTTTCTGTTAATCACTCTGCGACTCTTCATTCTCCAACACCAGCAGG 4541
|||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 AGATTTGATTAACGTTTCTGTTAATCACTCTGCGACTCTTCATTCTCCAACACCAGCAGG 1199
Query 4542 TGGAAAGCAAAGCTGGGGGAGCATGCAGACAGATCATGGAGGAAGCAACACTCCCTCTTC 4601
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||
Sbjct 1200 TGGGAAGCAAAGCTGGGGGAGCATGCAGACAGATCATGGAGGAAGTAATGCTCCTTCTTC 1259
Query 4602 TCAGAATAACTCTACGTCTTATGGCACCCCATCTCCTAGTGTTCTCCCCTCACAGAGTCA 4661
|||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1260 TCAGAATAGCTCTACATCTTATGGCACCCCATCTCCTAGTGTTCTACCCTCACAGAGTCA 1319
Query 4662 ACCAGGATTTCCTCCATCTGATTCTTGGAAGGTTGCAGTTCCAAGCCAACCGAATGCTCA 4721
|||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||
Sbjct 1320 ACCAGGCTTTCCTCCATCTGATACTTGGAAGGTTGCAGTCCCAAGCCAACCAAATGTTCA 1379
Query 4722 GGCTCAGGCCCAG 4734
||||||||| |||
Sbjct 1380 GGCTCAGGCTCAG 1392
Score = 900 bits (487), Expect = 0.0
Identities = 574/614 (93%), Gaps = 13/614 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 4717 GCTCAGGCTCAGGCCCAGTGGGGTATGAACATGGTGAACAACAACCAAAACTCAGCACAA 4776
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1411 GCTCAGGCTCAGGCTCAGTGGGGTATGAACATGGTGAACAACAACCAAAACTCAGGACAA 1470
Query 4777 CCTCAGGCT----C-C-AGCAAACCAGAACAGCAGCTGGGGTCAAGGGACTGTAAATCCA 4830
||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1471 CCTCAGGCTCAGGCTCTAGCAAACCAGAACAGCAGCTGGGGTCAAGGGACTGTAAATCCA 1530
Query 4831 AACATGGGATGGGTTGGTCCTGCTCAAACTGGAGTGAATGTAAATTGGGGTGGATCTTCT 4890
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1531 AACATGGGATGGGTTGGTCCTGCTCAAGCTGGAGTGAATGTAAACTGGGGTGGATCTTCT 1590
Query 4891 GTTCCCTCAACT-GTGCAAGGAATCACTCATTCTGGCTGGGTCGCGCCTGTCCAAGGACA 4949
|||||||||||| || || |||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 1591 GTTCCCTCAACTGGT-CAGGGAATCCCTAATTCTGGCTGGGGCGGGCCTGTCCAAGGACA 1649
Query 4950 AACACAAGCTTATCCAAATCCAGGATGGGGCCCAACAGGCCACCCTCAATCTCAATCCC- 5008
|||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 1650 AACACAAGCTTATCCAAACCCAGGGTGGGGCGCAACAGGCCACCCTCAAGCTCAACCCCA 1709
Query 5009 AGTCTCAAGTTCAAGCTCAAGCGGGTACTACGGGCTCGGGATGGATGCAACCAGGTCAAG 5068
|| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1710 AG-CTCAAGTTCAAGCTCAAGCGGGTACCACAAGCGCGGGATGGATGCAACCAGGTCAAG 1768
Query 5069 GGATTCAGTCTGGAAACAGTAATCAAAATTGGGGAACTCAAAATCAGACAGCGATCCCAA 5128
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1769 GGATTCAGTCTGGAAACGGTAATCAAAATTGGGGAACTCAAAATCAGACAGCGATCCCAA 1828
Query 5129 GCGGAGGGTCAGGAGGGAACCAAGCCGGTTACTGGGGAAACCAACAACAGAGCCAGAATG 5188
| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1829 GTGGTGGGTCAGGAGGGAACCAAGCCGGTTACTGGGGAAACCAACAACAGAGCCAGAATG 1888
Query 5189 GAGATTCTGGGTATGGTTGGAACAGGCAGTCAGGTGGGCAGCAGAACAACTTCAAGGGAC 5248
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||| |
Sbjct 1889 GAGATTCTGGGTATGGTTGGAACAGGCAGTCAAGTGGGCAG-A-A-CAACTTCAAGGGGC 1945
Query 5249 AAAGAGTATGCAAGTTCTTCCGCGAAAATGGACATTGTCGGAAAGGAGCATCCTGCAATT 5308
|||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1946 AAAGAGTATGCAAGTTCTTCCGCGAAGATGGGTATTGTAGGAAAGGAGCATCCTGCAATT 2005
Query 5309 ACCTCCACAACTAA 5322
||||||||||||||
Sbjct 2006 ACCTCCACAACTAA 2019
> Ahg319846 jgi|Araly1|319846|fgenesh1_pm.C_scaffold_3002862
Length=1152
Score = 1991 bits (1078), Expect = 0.0
Identities = 1121/1142 (98%), Gaps = 1/1142 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1987 ATGTTTTCATTATGCAAGGGATGTGCCAAGGATGCTGTCTTCTTTTGCATCAGAGGTAAT 2046
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTTTTCATTATGCAAGGGCTGCGCCAAGGATGCTGTCTTCTTTTGCATCAGAGGTAAT 60
Query 2047 AAGGGTTTGTGTGAGACATGCATGGAGACAGTCAAGTTGATAGAAAGAAAACAGCAGGAA 2106
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 61 AAGGGTTTGTGTGAGACATGCATGGAGACAGTCAAGTTGATAGAAAGAAAAGAGCAGGAA 120
Query 2107 AAGGAGCCGGCGCAGTTGGATTTTAATGACAAGACCAGCTGGGAATATCTCTTTAAGGAT 2166
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 121 AAGGAGCCGGCGCAGTTGGATTTTGATGACAAGACCAGCTGGGAATATCTTTTTAAGGAT 180
Query 2167 TACTGGATTGATTTGAAAACCCAGCTATCTTTAAGTCCAGAGGAACTTGATCAGGCTAAG 2226
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TACTGGATTGATTTGAAAACCCAGCTATCTTTAAGTCCAGAGGAACTTGATCAGGCTAAG 240
Query 2227 AGGCCACTGAAAGGACATGAGACCAATGCTAGCAAACAGGGAACAGCCAGTGAGACTGAC 2286
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AGGCCACTGAAAGGACATGAGACCAATGCTAGCAAACAGGGAACAGCCAGTGAGACTGAC 300
Query 2287 TATGTTACTGATGGAGGATCAGATTCAGATAGTTCTCCAAAAAAGAGGAAGACCAGGAGT 2346
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TATGTTACTGATGGAGGATCAGATTCAGATAGTTCTCCAAAAAAGAGGAAGACCAGGAGT 360
Query 2347 CGATCAAAGTCTGGTTCTGCTGAGAAAATCCTATCATCAGGCGATAAGAATTTGTCAGAT 2406
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 361 CGATCAAAGTCTGGTTCTGCTGAGAAAATCCTATCACCAGCCGATAAGAATTTGTCAGGT 420
Query 2407 GAAACTATGGAGTGGGCTTCCAAGGAACTTTTGGATCTGGTCGTGCACATGAGACGTGGT 2466
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 421 GAAACTATGGAGTGGGCTTCCAAGGAACTTTTGGATCTGGTCGTCCACATGAGACGTGGT 480
Query 2467 GACAGATCTTTCTTACCTATGTTAGAAGTACAGACTCTCCTACTGGCTTATATAAAAAGA 2526
||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GACAGATCTTTCTTACCTATGACAGAAGTACAAACTCTCCTACTGGCTTATATAAAAAGA 540
Query 2527 TACAATCTTCGTGATCCCCGTCGTAAAAGCCAGGTTATCTGCGACTCCAGGCTTCAGAAT 2586
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TACAATCTTCGTGATCCCCGTCGTAAAAGCCAGGTTATCTGCGACTCCAGGCTTCAGAAT 600
Query 2587 TTGTTCGGCAAATCACATGTTGGACACTTTGAGATGTTAAATCTTCTTGACTCTCATTTT 2646
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 601 TTGTTCGGAAAATCACATGTTGGACACTTTGAGATGTTAAATCTCCTTGACTCTCATTTT 660
Query 2647 CTGAAAAAAGAGCAAAATCAGGCAGATGATATTCAAGGTGACATAGTTGATACAGAAGAA 2706
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 CTTAAAAAGGAGCAAAATCAGGCAGATGATATTCAAGGTGACATAGTTGATACAGAAGAA 720
Query 2707 CCTAATCATGTGGATGTTGATGAAAACTTGGACCATCCAGTCAAAAGTGGGAAGGATAAG 2766
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 721 CCTAATCATGTGGATGTTGATGAAAACTTGGACCATCCAATGAAAAGTGGGAAGGATAAG 780
Query 2767 AAACGTAAAACACGCaaaaaaaaTGTCAGGAAAGGACGTCAATCTAATCTTGATGATTTT 2826
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 781 AAACGTAAAACACGCAAAAAAAATGTCAGGAAAGGACGCCAATCTAATCTTGATGATTTT 840
Query 2827 GCTGCTGTTGATATGCACAACATTAATTTGATATACTTAAGGCGGAGCTTGGTGGAAGAT 2886
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 841 GCTGCTGTTGATATGCACAACATTAATTTGATATACTTAAGGCGGAGCTTAGTGGAAGAT 900
Query 2887 CTACTTGAAGATTCTACAGCATTCGAAGAAAAAGTTGCTAGTGCATTTGTTAGGTTAAGG 2946
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 CTACTTGAAGATTCTACAGCATTCGAAGAAAAAGTTGCTAGTGCATTTGTTAGGTTAAGG 960
Query 2947 ATATCTGGAAATCAAAAGCAAGATTTATATCGACTGGTTCAAGTTGTTGGCACAAGCAAA 3006
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 ATATCTGGAAATCAAAAGCAAGATTTATATCGACTGGTTCAAGTTGTTGGCACAAGCAAA 1020
Query 3007 GCTCCTGAACCTTATAAAGTTGGCaaaaaaaCAACAGACTATGTACTTGAGATATTGAAC 3066
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 GCTCCTGAACCTTATAAAGTTGGCAAAAAAACAACAGACTATGTACTTGAGATATTGAAC 1080
Query 3067 TTGGACAAAACGGAAGTGATATCCATTGACATTATATCAAATCAAGATTTCACTGAGGAT 3126
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1081 TTGGACAAAACGGAAGTGATATCCATTGACATTATATCAAATCAAGATTTCACTGAGG-T 1139
Query 3127 GA 3128
||
Sbjct 1140 GA 1141
> Ahg480812 jgi|Araly1|480812|fgenesh2_kg.3__3513__AT2G16485.1
Length=1863
Score = 1936 bits (1048), Expect = 0.0
Identities = 1659/1928 (86%), Gaps = 145/1928 (8%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGATTCTGATTCTGAGAGAGCTTCTCTGGAGTCGATTAAAGATAATTCTGAATGTGTT 60
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1 ATGGATTCTGATTCTGAGAGAGCTTCTCTCGAGTCGATTAAAGATGATTCTGAATGTCTT 60
Query 61 CATGTTTCCAACGAACCTAATCTCACGGCAACATGCGTTGATTCGTCTGTT--------- 111
|||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||
Sbjct 61 CATGTTTCGAACGAACCTAGTCTCACGGGAACATGCGGTGATTCGTTTGTTGGAGAGGAA 120
Query 112 ---GGA-GAGGA----A-GGAGTTACGGATGTAAATTCGTCCGCCGCTGTGTCGGAGCTC 162
||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 121 GAAGGAGGAGGAGGCGACGGAGTTACGGATGTGAATTCGTCCGCCGCGGTGTCAGAGCTC 180
Query 163 GTGCCGCCGGAGCAAGGAGAAGGTGCGCTTTTGAATTCCGTCCCTGAGATC----A---- 214
| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 181 GCGCCTCCGGAGCAAGGAGAAGGTGCGGTTTTGAATTCCGTCTCTGAGATCAGTGATGTG 240
Query 215 G-TGAAAGGGGGATTCCTGTTGATGTCGTTTCCTCGGTAGATGGAGGAGGAGAAGAAAAT 273
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 241 GTTGAAAGGGGGATTCCTGTTGATGTCGTTTCCTCGGTAGGTGGAGGAGGAGAAGAAAAT 300
Query 274 GCAGCTTTTAATATTCAGGAGATTGATTCTGTTGGCGGTGACGCTGCGGCGGTGGAGGAG 333
|||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |
Sbjct 301 GCAGCTTTTAATGTTCAGGAGATGGATTCGGTTGGTGGTGACGCTGCGGCGGTGGAGGTG 360
Query 334 GTTCCTCTGAAATCGTCTTCGGTGGTTGGGGAAGGAAGAGAAGAGGAAGCTGGGGCTTCA 393
|||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |
Sbjct 361 GTTCCTCTGAAACCGTCTTCGGTGGTTGGGGAAGGGGGAGAAGAGGAAGGTGCGGCTTTA 420
Query 394 ATCGTCAAAGAAGAGGATTTTGTAGCTGAAGCTAATTTGTCAGGAGATAGGCTTGAGGAA 453
|| | | || || || | | ||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 421 AT--T---GGCAG-TGA--TT-CA-C--AAGCTAATTCGTCAGGAGATAGGCTTGAGGGA 468
Query 454 AACAAAGAAGTTTCCATGGAAGAAGAACCTTCATCACATGAGCTCTCGGTTTGTGAGGTA 513
||| || | | | || ||||| |||||||||| | | ||
Sbjct 469 AAC----AA------A--G-A-AA-AACCTCCATCACATGA---C-C-----------TA 498
Query 514 AACGGAGTTGATTCTTTGAATGAT-GAGGAAAATAGAGAGGTAGGTGAACA-GATAGTTT 571
||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| | ||||| ||| | ||||||
Sbjct 499 AACGGAGTTGATTCTCTGAATG-TCGAGGAAAAGAGAGATGAAGGTGGACATG-TAGTTT 556
Query 572 GTGGAAGTATGGGTGGTGAGGAGATAGAGAGTGATTT------------AGAGTCTAAAA 619
|||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct 557 GTGGAAGTATGGCTGTTGAGGAGATAGAGAATGATTTAGGGCAGAACACAGAGTCTAAAA 616
Query 620 AGGAAAAGGTAGATGTGATAGAGGAGGAAACCACAGCGCAAGCTGCTTCCTTGGTTAATG 679
|||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 617 TGGAAAAGGTAGATGTGATGGAGGAGGAAACTACAGCGCAAGCTGCTTCCTTGGTTAATG 676
Query 680 CA-ATTGAAATTCCTGATGATAAAGAGGTAGCTTGCGTGGCTGGGTTTACGGAAATTTCC 738
| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||
Sbjct 677 -ACATTGAAATTCCTGATGATAAAGAGGTAGCTTGTGTGGCTGGGTTTACAGAAATTCCC 735
Query 739 TCTCAAGATAAAGGGTTAGACGAATCA--G-G-AAAT--GG-A-T---TTT-TAGATGAA 786
|||||||||||||| ||||||| ||| | | || | || | | ||| |||| |||
Sbjct 736 ACTCAAGATAAAGGGGTAGACGATTCAGTGCGTAACTCAGGAAGTGAATTTGTAGAAGAA 795
Query 787 GAGCCAGTGAAAGAGTTGCAAATAGGTGAAGGAGCTAAAGATCTGACAGATGGAGATGCA 846
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 796 GAGCCAGTGAAAGAGTTGCAAATAGGTGAAGGAGCTAAAGATCTGACAGATGGAGATGCA 855
Query 847 AAAGAAGGTGTGGATGTTACAGAAGATGAAATGGATATACAGGTATTGAAGAAATCTA-A 905
||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 856 AAAGATGGTGTCGATGTTACAGAAGATGCAATGGATATACAGGTATTGAAGAAATC-AGA 914
Query 906 GGAGGAAGAAAAGGTTGATAGTACTACTGAATTAGAGATAGAAACTATGCGCCTAGAGGT 965
|||||||||||| | | | || | | | | | | ||| || || ||||||
Sbjct 915 GGAGGAAGAAAA----G---G---T--TG-A-T-G-G-T-G---CTAAGCCCCAAGAGGT 953
Query 966 -GCATGACGTGGCTACTGAGATGTCCGAC-AAA---A-----C--T-GTTATATCATCAG 1012
| |||| |||||||||||||| |||||| ||| | | | | |||||||||||
Sbjct 954 AG-ATGATGTGGCTACTGAGATCTCCGACAAAATTGAGGTTTCAGTGGATATATCATCAG 1012
Query 1013 CTGTTGTTACTCAGTTTACTGGGGAAACAAGTAATGATAAGGAAACTGTTATGGATGATG 1072
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1013 CTGTTGTTACTCAGTTTGCTGGGGAAACAAGTAATGATAAGGAAACTGTTATGGATGATG 1072
Query 1073 TCAAAGAAGATGTTGACAAGGATTCAGAAGCTGGTAAATCACTGGACATACATGTACCAG 1132
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1073 GCAAAGAAGATGTTGAGAAGGATTCAGAAGCTGGTAAATCACTGGACATACATGTACCAG 1132
Query 1133 AGGCTACAGAAGAAGTAGACACAGATGTTAATTACGGTGTTGGGATAGAGAAAGAAGGCG 1192
||||| |||||||||||| |||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1133 AGGCTGTAGAAGAAGTAGAGTCAGACGTTAAGTATAGTGCTGGGATAGAGAAAGAAGGCG 1192
Query 1193 ATGGGGTGGGTGGTGCGGAAGAAGCAGGGCAGACAGTTGATTTGGAGGAAATTCGAGAAG 1252
||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1193 ATGGGATGGGTGGTGCGGGAGAAGTACGGCAGACAGTGGATATGGAGGAAATTCGAGAAG 1252
Query 1253 AAAACCAAGAACTGTCTAAGGAACTGGCTCAAGTAGATGAAACCAAGATTTCTGAAATGT 1312
||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||
Sbjct 1253 AAACCCAAGAACTATCTGAGGAACTGGCTAAAGTAGATGAGACAAAGATTTCTGAAGTGT 1312
Query 1313 CGGAAGTAACGGAGACAATGATCAAAGATGAGGATCAGGAGAAAGATGACAATATGACTG 1372
| |||| ||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||
Sbjct 1313 CAGAAGAAACGGTGACAACAATCAGGGGTGAGGATCAGGAGAAAGATGATGACATGACTG 1372
Query 1373 ATTTGGCGGAGGATGTGGAAAACCATAGAGATTCCTCAGTAGCTGATATTGAGGAGGGAA 1432
||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1373 ATTTGGCGGAGGATGTGGAAACCCATGGAGACTCCCCAGTAGCTGGTATTGAGGAGGGAA 1432
Query 1433 GGGAAGATCATGAAGATATGGGAGTGACAGAGACACAGAAGGAGACTGTTTTGGGTAAAG 1492
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 1433 GGGAAGATCATGAAGATATGGGAGTGACAGAGACACAGGAGGAGACTGTTATGGGTAAAG 1492
Query 1493 TAGACAGAACAAAAATTGCTGAAGTGTCAGAAGAAACAGACACAAGGATTGAAGATGAGG 1552
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1493 TAGACGGAACAAAAATTGCTGAAGTGTCAGAAGAAACAGAGACAAGGATTGAAGATGAGG 1552
Query 1553 ATCAGGAGAAAGATGATGAGATGACTGATGTTGCGGAAGATGTGAAAACGCATGGAGACT 1612
||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553 ATCAGGAAAAAGATGATGAGATGACTGATGGGGCGGAGGATGTGAAAACGCATGGAGACT 1612
Query 1613 CCTCAGTAGCTGATATTGAAGAGGGAAGGGAAAGTCAAGAAGAGATGACAGAGACACAGG 1672
| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1613 CTTCAGTAGCTGATATTGAAGAGGGGAGGGAAAATCATGAAGAGATGACAGAGACACAGG 1672
Query 1673 AGGACAGTGTTATGGCTGA--TG----A--A-GAGCCTGAGGAAGTTGAGGAAGAAAATA 1723
|||| |||||||||||||| || | | ||| |||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1673 AGGAGAGTGTTATGGCTGAGATGGGTGATGAAGAGACTGATGAAGTTGAGGAAGAAAATA 1732
Query 1724 AGAGTGCTGGAGGAAAGAGGAAACGGGGGAGAAATACAAAGACAGTCAAAGGGACAGGAA 1783
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||
Sbjct 1733 AGAGTGCTGGAGGAAAGAGGAAACGGGGGAGAAATTCAAAGACAGTGAAAGGAACGGGAA 1792
Query 1784 AGAAGAAAGAGGAAGATGTTTGTTTTATGTGCTTTGATGGGGGTGATCTTGTCCTTTGTG 1843
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1793 AGAAGAAAGAGGAAGACGTTTGTTTCATGTGCTTTGATGGGGGTGATCTTGTCCTTTGTG 1852
Query 1844 ACCGCAGG 1851
||||||||
Sbjct 1853 ACCGCAGG 1860
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 213883560260
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5