BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G16640.1
Length=3975
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg480549 jgi|Araly1|480549|fgenesh2_kg.3__3250__AT2G16640.1 4750 0.0
Ahg479127 jgi|Araly1|479127|fgenesh2_kg.3__1828__AT3G16620.1 3234 0.0
> Ahg480549 jgi|Araly1|480549|fgenesh2_kg.3__3250__AT2G16640.1
Length=3873
Score = 4750 bits (2572), Expect = 0.0
Identities = 2987/3177 (94%), Gaps = 70/3177 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 847 GACAGAAGAAGAGGTTGTA-GAAGGTGAAGGAACAAGTAAGAATCTATTTGA-GAAACAG 904
||||||| |||| |||| | || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||| |
Sbjct 719 GACAGAACAAGATGTTG-AGGATGGTGAAGGAACAACTAAAAATCTGTTTGAGGAAA-GG 776
Query 905 ACAGAACAAGATGTTGTGGAA-GGTGAAGGAACAAGTAAGGATCTATTTGAGAA------ 957
|||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 777 ACAGAAGAAGAAGTTGT-GAATGGTGCAGGAACAGGTAAGAATCTATTTGAGAATGGTTC 835
Query 958 TGGTTCAGTATGTATGGACAGTGAGTCCGAGGCAGAAAGAAATGGTGAGACTGGTGCCGC 1017
||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||
Sbjct 836 TGGTTCAGTATGTATAGACAATGAGTCCGAGGCAAAAACAAACGGTGAGACTGGTGCCGC 895
Query 1018 CTACACAAGTAATATCGTTACTAATGCTTCAGGTGAC-AA----TGAA-G-TA-T-C--A 1066
|||||||||| |||| | |||||||||||||||||| || |||| | || | | |
Sbjct 896 CTACACAAGTGATATTGAAACTAATGCTTCAGGTGACAAATCTGTGAATGATAGTACTGA 955
Query 1067 AGT-GC---TG-T--GACTTCATCTCCATTGGAGGAATCTAGTTCCGGGGAAAAGGGAGA 1119
||| || || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 956 AGTAGCAAGTGCTGAGACTTCATCTCCATTGGATAAATCTAGTTCCGGGGAAAAGGGAGA 1015
Query 1120 GACTGAAGGGGACAGTACTTGTTTAAAACCAGAGCAACACTTGGCTTCTTCGCCGCACTC 1179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||
Sbjct 1016 GACTGAAGGGGACAGTACTTGTTTAAAACCAGAGCAACAATTGGCTTCTTCGCTGAACTC 1075
Query 1180 ATATCCTGAGTCAACTGAAGTTC-ACAGCAATAGTGGCTCCCCTGGGGTAACTAGTAGAG 1238
| |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1076 AAATCCTGAGTCTACTGAAATTCGA-AGCAATAGTGGCTCCCCTGGGGTAACTTCTAGAG 1134
Query 1239 AACAC-AAACCAGTTCA-AAGTGCTAATGGAGGACATGATGT---TCAGAGTCCTCAACC 1293
|| || | | ||||| | || | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 1135 AAAACGAGA-CAGTT-AGAAATTCTAATGGAGGACATGATGTCCAACAGAGGCCTCAACC 1192
Query 1294 AAATAAGGAGCTTGAGAAGCAGCAAAGCAGCAGAGTACATGTAGATCCAGAGATTACA-G 1352
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |
Sbjct 1193 TAATAAGGAACTTGAGAAGCAGCAAAGCAGCAGAGTAAATGTAGATCCAGAGATTA-AGG 1251
Query 1353 AAAATTCACATGTGGAAACAGAACCTGAGGTAGTAAGTTCTGTTTCACCAACAGAGTCTA 1412
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252 AAAATTCACATGTGGAAACAGAAGCTGAGGTAGTAAGTTCTGTTTCACCAACAGAGTCTA 1311
Query 1413 GAAGTAATCCTGCGGCATTACCACCTGCTCGTCCAGCAGGTCTTGGTCGTGCTTCTCCTC 1472
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1312 GAAGTAATCCTGCAGCATTACCACCTGCTCGTCCAGCAGGTCTTGGTCGTGCTTCTCCTC 1371
Query 1473 TTTTGGAACCTGCATCACGTGCTCCTCAACAGTCTCGCGTCAATGGGAATGGGTCTCACA 1532
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1372 TTTTGGAACCTGCATCACGTGCTCCTCAACAGTCTCATGTCAATGGGAATGGGTCTCACA 1431
Query 1533 ATCAGTTTCAGCAAGCTGAAGACTCTACCACTACAGAGGCTGATGAGCATGATGAGACCC 1592
|||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
Sbjct 1432 ATCAGTCTCAGCAAGCTGAGGACTCTACCACTGTAGAGACTGATGAGCATGATGAGACTC 1491
Query 1593 GCGAGAAGCTCCAGTTGATCAGGGTAAAATTTTTGAGGCTTGCACATAGACTAGGGCAAA 1652
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1492 GTGAGAAGCTCCAGTTGATCAGGGTAAAATTTTTGAGGCTTGCACATAGACTAGGGCAAA 1551
Query 1653 CCCCGCATAATGTTGTTGTTGCTCAGGTTTTATACAGGCTTGGATTGGCTGAGCAGTTGA 1712
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552 CCCCGCATAATGTTGTTGTTGCTCAGGTTTTATACAGGCTTGGATTGGCTGAGCAGTTGA 1611
Query 1713 GGGGCAGAAATGGAAGCCGTGTTGGTGCTTTTAGTTTTGATCGCGCTAGTGCCATGGCAG 1772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 1612 GGGGCAGAAATGGAAGCCGTGTTGGTGCTTTTAGTTTTGATCGTGCCAGTGCCATGGCAG 1671
Query 1773 AACAGCTTGAGGCTGCTGGACAGGATCCACTTGATTTTTCTTGTACGATTATGGTTCTCG 1832
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1672 AACAGCTTGAGGCTGCTGGACAGGATCCACTTGATTTTTCTTGTACGATTATGGTTCTTG 1731
Query 1833 GAAAAAGTGGGGTTGGTAAAAGTGCAACGATCAATTCTATATTTGATGAAGTGAAATTTT 1892
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1732 GTAAAAGTGGGGTTGGTAAAAGTGCAACGATCAATTCTATATTTGATGAAGTGAAATCTT 1791
Query 1893 GTACTGATGCATTCCAGATGGGGACAAAGAGGGTTCAAGATGTTGAGGGTTTGGTTCAGG 1952
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1792 GTACTGATGCATTCCAGATGGGTACAAAGAGGGTTCAAGATGTTGAGGGTTTGGTTCAGG 1851
Query 1953 GAATTAAGGTACGGGTGATTGACACTCCCGGTCTCTTACCTTCCTGGTCTGATCAAGCCA 2012
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1852 GAATTAAGGTACGGGTGATTGACACTCCCGGTCTCTTACCTTCCTGGTCTGATCAAGCCA 1911
Query 2013 AGAATGAGAAGATCCTGAATTCTGTTAAGGCTTTCATCAAGAAGAATCCACCTGACATTG 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1912 AGAATGAGAAGATCCTGAATTCTGTTAAGGCTTTCATCAAGAAGAATCCACCTGACATTG 1971
Query 2073 TACTATATCTTGATAGGTTGGATATGCAAAGCAGAGATTCTGGTGACATGCCTCTCCTGC 2132
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1972 TACTATATCTTGATAGGTTGGATATGCAAAGCAGAGATTCTGGTGACATGCCTCTCCTGC 2031
Query 2133 GCACCATAAGTGATGTTTTTGGTCCTTCGATATGGTTTAATGCCATTGTGGGTTTGACTC 2192
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2032 GCACCATAAGTGATGTTTTTGGTCCATCGATTTGGTTTAATGCCATTGTGGGTTTGACTC 2091
Query 2193 ATGCCGCTTCTGTTCCACCAGATGGCCCAAATGGCACTGCTTCTAGCTATGATATGTTTG 2252
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2092 ATGCCGCTTCTGTTCCACCAGATGGCCCAAATGGCACTGCTTCTAGCTATGACATGTTTG 2151
Query 2253 TTACACAACGTTCTCATGTCATCCAGCAGGCCATTCGCCAAGCAGCTGGAGATATGAGGC 2312
| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2152 TAACACAACGCTCTCACGTCATCCAGCAGGCTATTCGCCAAGCAGCTGGAGATATGAGGC 2211
Query 2313 TCATGAACCCTGTTTCTTTAGTTGAGAATCACTCAGCTTGCAGGACTAATCGGGCAGGCC 2372
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2212 TCATGAACCCTGTTTCTTTAGTTGAGAATCACTCAGCTTGCAGGACTAATCGGGCAGGCC 2271
Query 2373 AGAGAGTATTACCGAATGGCCAAGTGTGGAAGCCACATTTGTTGCTACTCTCATTTGCAT 2432
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2272 AGAGAGTATTACCAAATGGCCAAGTGTGGAAGCCACATTTGTTGTTACTCTCATTTGCAT 2331
Query 2433 CTAAGATTCTAGCAGAAGCAAATGCTCTTTTGAAGTTGCAAGATAATATTCCAGGGAGAC 2492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2332 CTAAGATTCTAGCAGAAGCAAATGCTCTTTTGAAGTTACAAGATAATATTCCAGGGAGAC 2391
Query 2493 CATTTGCAGCTCGGTCCAAGGCTCCGCCATTACCATTTCTCCTTTCATCGCTTCTGCAAT 2552
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2392 CATTTGCAGCTCGTTCCAAGGCTCCGCCATTACCATTTCTCCTATCATCGCTTCTGCAAT 2451
Query 2553 CAAGACCACAACCTAAGCTTCCTGAACAGCAGTATGGTGATGAAGAAGATGAAGATGATT 2612
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2452 CAAGACCACAACCTAAGCTTCCTGAACAACAGTATGGTGATGAAGAAGATGAAGATGATT 2511
Query 2613 TAGAAGAATCATCAGATTCAGACGAAGAATCAGAGTATGATCAGCTTCCTCCGTTTAAGA 2672
| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2512 TGGACGAATCATCAGATTCAGACGAAGAATCAGAGTATGATCAGCTTCCTCCCTTTAAGA 2571
Query 2673 GTTTGACTAAAGCTCAGATGGCTACGCTTAGTAAATCTCAGAAGAAGCAGTATCTCGATG 2732
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2572 GTTTGACTAAAGCTCAAATGGCTACACTTAGTAAATCTCAGAAGAAGCAGTATCTCGATG 2631
Query 2733 AAATGGAGTACCGAGAGAAACTTTTAATGAAGAAGCAAATGAAAGAGGAAAGAAAGAGAC 2792
||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2632 AAATGGAGTACCGGGAGAAACTATTAATGAAGAAGCAAATGAAAGAGGAAAGAAAGCGAC 2691
Query 2793 GTAAGATGTTTAAGAAATTTGCTGCAGAGATTAAAGATTTGCCTGATGGGTATAGTGAAA 2852
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2692 GTAAGATGTTTAAGAAATTTGCTGCAGAGATTAAAGATTTGCCTGATGGGTTTAGTGAAA 2751
Query 2853 ATGTGGAAGAGGAGAGTGGTGGACCTGCATCAGTTCCAGTTCCTATGCCAGATTTATCTC 2912
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2752 ATGTGGAAGAGGAGAGTGGTGGACCTGCATCAGTTCCAGTTCCCATGCCAGATTTATCTC 2811
Query 2913 TACCTGCGTCTTTTGACTCTGATAACCCTACTCACCGCTACCGGTACCTTGATTCCTCCA 2972
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2812 TACCTGCGTCTTTTGACTCTGATAACCCTACTCACCGCTACCGCTACCTTGATTCCTCCA 2871
Query 2973 ATCAGTGGCTTGTTAGGCCAGTCCTGGAAACTCATGGGTGGGATCATGATATTGGTTATG 3032
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2872 ATCAGTGGCTTGTTAGGCCCGTTCTGGAAACTCATGGGTGGGATCATGATATTGGTTATG 2931
Query 3033 AAGGTGTGAATGCAGAACGGCTCTTTGTTGTAAAAGAAAAAATACCAATATCTGTCTCAG 3092
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2932 AAGGTGTGAATGCAGAACGGCTCTTTGTTGTAAAAGACAAAATACCAATATCTGTCTCAG 2991
Query 3093 GTCAAGTGACAAAAGACAAGAAGGATGCAAATGTGCAGCTAGAAATGGCCAGCTCGGTTA 3152
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2992 GTCAAGTGACAAAGGACAAGAAGGATGCAAATGTGCAGCTGGAAATGGCCAGCTCGGTTA 3051
Query 3153 AACATGGAGAGGGTAAATCAACTTCCCTAGGTTTCGACATGCAAACTGTTGGAAAGGAAT 3212
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3052 AACATGGAGAGGGTAAATCAACTTCCCTAGGTTTTGACATGCAAACTGTTGGAAAGGAAT 3111
Query 3213 TGGCTTATACTCTTCGAAGCGAAACGAGATTTAACAATTTCAGGAGAAACAAGGCTGCAG 3272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 3112 TGGCTTATACTCTTCGAAGCGAAACGAGATTTAACAACTTCAGGAGAAACAAAGCTGCAG 3171
Query 3273 CTGGTCTTTCTGTAACACACTTGGGTGATTCGGTTTCTGCGGGGTTGAAAGTCGAAGATA 3332
|||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||
Sbjct 3172 CTGGTCTTTCTGTAACACTCTTGGGTGATTCAGTTTCTGCGGGGCTGAAAGTTGAAGATA 3231
Query 3333 AGTTTATTGCTAGTAAATGGTTCAGAATCGTAATGTCTGGTGGAGCTATGACTAGTCGGG 3392
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3232 AGTTGATTGCTAGTAAATGGTTCAGAATGGTAATGTCTGGTGGAGCTATGACTAGTCGGG 3291
Query 3393 GAGATTTTGCTTATGGTGGTACTTTGGAAGCTCAGTTGAGAGATAAAGATTATCCGCTTG 3452
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3292 GAGATTTTGCTTATGGTGGTACTTTAGAAGCTCAGTTGAGAGATAAAGATTATCCGCTTG 3351
Query 3453 GTCGGTTTTTGACTACTCTTGGACTTTCTGTAATGGATTGGCACGGTGATCTTGCTATTG 3512
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3352 GCCGGTTTTTGACTACTCTTGGACTTTCTGTAATGGATTGGCACGGTGATCTTGCTATCG 3411
Query 3513 GAGGGAACATACAGTCTCAGGTTCCCATTGGACGTTCCTCTAATTTAATTGCTCGTGCTA 3572
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3412 GAGGGAACATACAGTCTCAGGTTCCCATTGGACGTTCCTCTAATTTAATTGCTCGTGCTA 3471
Query 3573 ATCTGAACAATAGAGGAGCAGGGCAAGTAAGTGTTCGTGTTAACAGCTCCGAGCAGCTCC 3632
||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3472 ATCTGAATAATAGAGGAGCAGGGCAAGTAAGTGTCCGTGTAAACAGCTCCGAGCAGCTCC 3531
Query 3633 AACTTGCTATGGTTGCGATTGTTCCTCTCTTCAAGAAGCTACTTAGTTATTATTACCCGC 3692
||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3532 AACTTGCTATGGTGGCAATTGTTCCTCTCTTCAAGAAGCTACTTAGTTATTGTTACCCGC 3591
Query 3693 AAACGCAATATGGACAATGATTAAGAAACATTTAGGCTGATTTCACTTCCATCCCTTTGC 3752
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3592 AAACGCAATATGGACAATGATGAAGAAACATTTAGGCTGATTTCACTTCCATCCCTTTGC 3651
Query 3753 ACTGGAGTATTAGGAA-TCGATTAGTCACAAGAACATGTTAGAGTGAGTT-----G--A- 3803
| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |
Sbjct 3652 AATGGAGTATTAGGAAAT-GATTAGTCAAAAGAACACGTTAGAGTGAGTTTATAAGGTAC 3710
Query 3804 AAA-GGATCTGTCTGGTAGCAAGAGACCAATTGTTGGAGGAAAGTTTGTGTCTTGAAATA 3862
||| ||| ||||||| ||| || |||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||
Sbjct 3711 AAAAGGAGCTGTCTGCTAGTAAAAGACCAATTGATGGACCAAAGCCTGTGTTTTGAAATA 3770
Query 3863 GCCAGAA-CATAACA---CGTTCCTTGTCTGATATATAATAGCTCAGTGGTTTGTTTTTC 3918
||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | | || |
Sbjct 3771 GCCAGAAACATAACAGGACGTTCCTTGTCTGATATATAATA--T---T--TT-------C 3816
Query 3919 TTCTATTTCTAAGACCTTGTGATCTCCCTTATGAATGAAGCATATCTACTTTTGTTC 3975
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3817 TTCTATTTCTAAGACCTTGTGATCTCTCTTATGAATGAAGCATATCTATTTTTGTTC 3873
Score = 854 bits (462), Expect = 0.0
Identities = 668/763 (88%), Gaps = 31/763 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 152 GATAGAATTAGTGATGAGCAAGTAGTGAAGAATGAGTTGGTGAGATCTGATGAAGTAAGG 211
||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||| |
Sbjct 84 GATAGAATTAGCGATGAGCAAGTAGCGAAGAATGAGTTGTTGGGATCTGTTGAAGTAAAG 143
Query 212 GATGATAACGAGGACGAGGTTTTTGAGGAAGCGATTGGTTCAGAGAATGATGAGCAGGAG 271
||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 144 GATGAGAAAGAAGATGAGGTTTTTGAGGAAGCGATTGGTTCAGAGAATGATGAGC----- 198
Query 272 GAGGAGGAGGATCCAAAACGTGAATTGTTTGAATCTGATGATTTGCCTTTAGTGGAAACT 331
|||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||| |||||||
Sbjct 199 -AGGAGGAGGATCCAAAACGTGAATTGTTGGAGCCCGATGAATTACCTTTAGAGGAAACT 257
Query 332 CTTAAAAGTTCTATGGTTGAGCATGAAGTGGAGGATTTTGAAGAGGCAGTGGGTGATTTG 391
| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 258 CGTCAAAGTTCTATGGTTGAGAATGAAGTGGATGATTTTGAAGAGGCAGTGGGTGATTTG 317
Query 392 GATGAAACGAGTAGCAATGAAGGGGGTGTT-AA-A---G-A--TT--TTA--CGGCTGTT 439
|||||||| ||||| ||||||||||||||| || | | | || ||| ||| ||||
Sbjct 318 GATGAAACAAGTAGTAATGAAGGGGGTGTTAAAGATTTGAATGTTGATTATTCGGTTGTT 377
Query 440 GGAGAGAGCCATGGTGCGGGAGAGGCTGAATTTGATGTTTTGGCTACTAAAATGAATGGT 499
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || || | ||||||||||||
Sbjct 378 GGAGAGAGCCATGGTGCGGGAGAGGCTGGATTTGATGCTGTGACTCCGAAAATGAATGGT 437
Query 500 GATAAGGGGGAAGGAGGTGGAGGTGGTTCTTATGATAAAGTTGAATCGAGCTTGGATGTT 559
|||| ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 438 GATACGGGGGAAGGTGGTGCAGGTGATTCTTGTGGTAAAGTTGAATCGAGGTTGGATGTT 497
Query 560 GTTGATACCACTGAGAATGCTACATCAACTAATACTAATGGTTCCAATTTAGCAGCTGAG 619
||||| | ||||||||| | | ||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 498 GTTGAGAACACTGAGAA-G--------GGTGATACTAATGGTTCGAATTTAGCGGCTGAG 548
Query 620 CATGTGGGTATTGAAAACGGAAAGACTCATTCTTTTTTGGGAAATGGAATCGCCTCTCCT 679
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 549 GATGTGAGTATTGAAAACGGAAAGACTCATTCTTTTTTGGGAAATGGAATCGTCTCTCCT 608
Query 680 AAAAATAAAGAAGTGGTGGCTGAAGTTATCCCTAAAGATGATGGGATTGAGGAACCATGG 739
|| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 609 AAGAATATAGAAGTGGTGGCTGAAGTTATTTCAAAAGATGATGGGATTGAGGAACCATGG 668
Query 740 AATGATGGCATTGAAGTCGATAATTGGGAGGAAAGAGTTGATGGCATACAGACAGAACAA 799
||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 669 AATGATGGCGTTGAAGTTGAAAATTGGGAGGAAAGAGTTGATGGCGTACAGACAGAACAA 728
Query 800 GAGGTTGAGGAAGGTGAAGGAACAACTGAAAATCAATTTGAG-AAACGGACAGAAGAAGA 858
|| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 729 GATGTTGAGGATGGTGAAGGAACAACTAAAAATCTGTTTGAGGAAA-GGACAGAAGAAGA 787
Query 859 GGTTGTAGAA-GGTGAAGGAACAAGTAAGAATCTATTTGAGAA 900
||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 788 AGTTGT-GAATGGTGCAGGAACAGGTAAGAATCTATTTGAGAA 829
> Ahg479127 jgi|Araly1|479127|fgenesh2_kg.3__1828__AT3G16620.1
Length=3377
Score = 3234 bits (1751), Expect = 0.0
Identities = 2290/2551 (90%), Gaps = 33/2551 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1195 TGAAGTTCACAGCAATAGTGGC-TCCCCTGGGGTAACTAGTAGAGAACACAAAC-CAGTT 1252
||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| || | |||
Sbjct 690 TGAAGGTCACAGCAGTAGTGGCAT-CCCTGGGGTAACTTTTAGAGAACA-GGACACTGTT 747
Query 1253 CAAAGT-GCTAATGGAGGACATGATGTT---CAGAGTCCTCAACCAAATAAGGAGCTTGA 1308
|||| | | |||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| ||||
Sbjct 748 CAAAATAG-TAATGGAGGACATGATATTCAACAGAGTCCTCAATCTAATAAGGAAATTGA 806
Query 1309 GAAGCAGCAAAG-CAGCAGAG-TACATGTAGATCCAGAGATTACAGAAAATTC-ACATGT 1365
||||||| ||| |||||| | || || ||| ||||||||||| || ||| | ||||||
Sbjct 807 AAAGCAGC-AAGACAGCAGCGTTA-ATATAGGTCCAGAGATTA-AGGAAAGCCTACATGT 863
Query 1366 GGAAACAGAACCTGAGGTAGTAAGTTCTGTTTCACCAACAGAGTCTAGAAGTAATCCTGC 1425
||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||
Sbjct 864 GGAAAGAGAATCTGAGGTATTAAGTTCTGTCTCACCAACAGAGTCTAGAATTAATACTGC 923
Query 1426 GGCATTACCACCTGCTCGTCCAGCAGGTCTTGGTCGTGCTTCTCCTCTTTTGGAACCTGC 1485
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||
Sbjct 924 AGCATTACCACCTGCTCGCCCAGCAGGTCTTGGTCGTGCTGCTCCACTTTTGGAACCGGC 983
Query 1486 ATCACGTGCTCCTCAACAGTCTCGCGTCAATGGGAATGGGTCTCACAATCAGTTTCAGCA 1545
| |||| | ||| |||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||
Sbjct 984 ACCACGCGTTCCACAACAGCCTCGTGTCAATGGCAATGTGTCTCACAATCAGCCTCAGCA 1043
Query 1546 AGCTGAAGACTCTACCACTACAGAGGCTGATGAGCATGATGAGACCCGCGAGAAGCTCCA 1605
||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1044 AGCTGAAGACTCTACCACTGGAGAGACTGATGAGCATGATGAGACCCGTGAGAAGCTCCA 1103
Query 1606 GTTGATCAGGGTAAAATTTTTGAGGCTTGCACATAGACTAGGGCAAACCCCGCATAATGT 1665
||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||
Sbjct 1104 GTTCATAAGGGTCAAATTTTTGAGGCTTTCACATAGATTAGGGCAAACTCCACATAATGT 1163
Query 1666 TGTTGTTGCTCAGGTTTTATACAGGCTTGGATTGGCTGAGCAGTTGAGGGGCAGAAATGG 1725
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||
Sbjct 1164 TGTTGTTGCTCAGGTTTTGTACAGGCTTGGATTGGCTGAACAGTTGAGGGGTAGAAACGG 1223
Query 1726 AAGCCGTGTTGGTGCTTTTAGTTTTGATCGCGCTAGTGCCATGGCAGAACAGCTTGAGGC 1785
||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1224 AAGCCGTGTTGGTGCCTTTAGTTTTGATCGTGCCAGTGCCATGGCAGAACAGCTTGAGGC 1283
Query 1786 TGCTGGACAGGATCCACTTGATTTTTCTTGTACGATTATGGTTCTCGGAAAAAGTGGGGT 1845
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 1284 AGCTGGACAGGATCCCCTTGATTTTTCTTGTACGATTATGGTGCTCGGCAAAAGTGGGGT 1343
Query 1846 TGGTAAAAGTGCAACGATCAATTCTATATTT-GATGAAGTGAAATTTTGTACTGATGCAT 1904
||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||| || | ||||||||||
Sbjct 1344 TGGTAAAAGTGCAACTATCAATTCTAT-TTTCGATGAACTGAAAATTAGGACTGATGCAT 1402
Query 1905 TCCAGATGGGGACAAAGAGGGTTCAAGATGTTGAGGGTTTGGTTCAGGGAATTAAGGTAC 1964
||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 1403 TCCAGATGGGGACAAAGAGGGTTCAGGATATTGAGGGTTTTGTTCAGGGAATCAAGGTAC 1462
Query 1965 GGGTGATTGACACTCCCGGTCTCTTACCTTCCTGGTCTGATCAAGC-CAAGAATGAGAAG 2023
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||
Sbjct 1463 GGGTAATTGACACTCCCGGTCTCTTACCATCCTGGTCAGATCAA-CACAAGAATGAGAAG 1521
Query 2024 ATCCTGAATTCTGTTAAGGCTTTCATCAAGAAGAATCCACCTGACATTGTACTATATCTT 2083
|||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||
Sbjct 1522 ATCCTGAAGTCTGTTAGGGCATTCATCAAGAAAAATCCGCCTGACATTGTATTATATCTT 1581
Query 2084 GATAGGTTGGATATGCAAAGCAGAGATTCTGGTGACATGCCTCTCCTGCGCACCATAAGT 2143
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |
Sbjct 1582 GATAGGTTAGATATGCAAAGCAGAGATTCTGGTGACATGCCTCTCTTGCGCACCATTACT 1641
Query 2144 GATGTTTTTGGTCCTTCGATATGGTTTAATGCCATTGTGGGTTTGACTCATGCCGCTTCT 2203
||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1642 GATGTTTTTGGACCATCGATTTGGTTTAATGCCATTGTGGGTTTGACTCATGCCGCTTCG 1701
Query 2204 GTTCCACCAGATGGCCCAAATGGCACTGCTTCTAGCTATGATATGTTTGTTACACAACGT 2263
| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 1702 GCTCCACCAGATGGCCCAAATGGGACTGCTTCTAGCTATGACATGTTTGTAACACAACGT 1761
Query 2264 TCTCATGTCATCCAGCAGGCCATTCGCCAAGCAGCTGGAGATATGAGGCTCATGAACCCT 2323
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1762 TCTCATGTCATCCAGCAAGCCATTCGCCAAGCAGCGGGAGATATGAGGCTCATGAACCCA 1821
Query 2324 GTTTCTTTAGTTGAGAATCACTCAGCTTGCAGGACTAATCGGGCAGGCCAGAGAGTATTA 2383
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1822 GTTTCTTTAGTTGAGAACCACTCTGCTTGCAGGACAAATCGGGCAGGACAGAGAGTATTA 1881
Query 2384 CCGAATGGCCAAGTGTGGAAGCCACATTTGTTGCTACTCTCATTTGCATCTAAGATTCTA 2443
|| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1882 CCTAATGGCCAAGTGTGGAAGCCTCATTTGCTATTACTCTCATTTGCATCCAAGATTCTA 1941
Query 2444 GCAGAAGCAAATGCTCTTTTGAAGTTGCAAGATAATATTCCA-GGGAGACCATTTGCAGC 2502
|| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||| || |||||||||
Sbjct 1942 GCCGAAGCAAATGCTCTTCTGAAATTACAAGATAATATTCCAGGGGA-ACAATTTGCAGC 2000
Query 2503 TCGGTCCAAGGCTCCGCCATTACCATTTCTCCTTTCATCGCTTCTGCAATCAAGACCACA 2562
||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2001 TCGGTCCAAGGCTCCGCCATTACCATTGCTCCTCTCATCGCTTCTGCAATCAAGACCACA 2060
Query 2563 ACCTAAGCTTCCTGAACAGCAGTATGGTGATGAAGAAGATGAAGATGATTTAGAAGAATC 2622
| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 2061 AGCTAAGCTTCCTGAGCAGCAGTACGATGATGAAGAAGATGAAGATGATTTGGACGAATC 2120
Query 2623 ATCAGATTCAGACGAAGAATCAGAGTATGATCAGCTTCCTCCGTTTAAGAGTTTGACTAA 2682
|||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||
Sbjct 2121 ATCAGATTTTGACGAAGAATCAGAGTATGATGAGCTTCCTCCCTTTAAGCGGTTGACTAA 2180
Query 2683 AGCTC-AGATGGCTACGCTTAGTAAATCTCAGAAGAAGCAGTATCTCGATGAAATGGAGT 2741
||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||
Sbjct 2181 AGC-CGAGATGGCTAAGCTTAGTAAATCTCAGAAGAAGGAATATCTCGATGAGATGGAGT 2239
Query 2742 ACCGAGAGAAACT-TTTAATGAAGAAGCAAATGAAAGAGGAAAGAAAGAGACGTAAGATG 2800
| || |||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2240 ATCGGGAGAAACTATTT-ATGAAGAGGCAGATGAAAGAGGAAAGAAAGAGACGTAAGTTG 2298
Query 2801 TTTAAGAAATTTGCTGCAGAGATTAAAGATTTGCCTGATGGGTATAGTGAAAATGTGGAA 2860
|| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 2299 TTGAAGAAATTTGCTGCTGAGATTAAAGATATGCCTAACGGGTATAGTGAAAATGTGGAA 2358
Query 2861 GAGGAGAGTGGTGGACCTGCATCAGTTCCAGTTCCTATGCCAGATTTATCTCTACCTGCG 2920
|||||||| ||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2359 GAGGAGAGAAGTGAACCTGCAGCTGTTCCAGTTCCCATGCCAGATTTATCTCTACCTGCA 2418
Query 2921 TCTTTTGACTCTGATAACCCTACTCACCGCTACCGGTACCTTGATTCCTCCAATCAGTGG 2980
|||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2419 TCTTTTGACTCTGACAACCCTACTCACCGGTTCCGGTACCTTGATTCCTCCAATCAATGG 2478
Query 2981 CTTGTTAGGCCAGTCCTGGAAACTCATGGGTGGGATCATGATATTGGTTATGAAGGTGTG 3040
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2479 CTTGTTAGGCCAGTGCTGGAAACTCATGGGTGGGATCATGATATTGGTTATGAAGGTGTG 2538
Query 3041 AATGCAGAACGGCTCTTTGTTGTAAAAGAAAAAATACCAATATCTGTCTCAGGTCAAGTG 3100
||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||| || ||||||
Sbjct 2539 AATGCGGAACGACTGTTTGTTGTTAAAGACAAGATACCGGTATCTTTCTCTGGCCAAGTG 2598
Query 3101 ACAAAAGACAAGAAGGATGCAAATGTGCAGCTAGAAATGGCCAGCTCGGTTAAACATGGA 3160
||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2599 ACAAAAGACAAAAAGGATGCAAATGTACAGCTGGAATTGGCCAGCTCGGTTAAACATGGA 2658
Query 3161 GAGGGTAAATCAACTTCCCTAGGTTTCGACATGCAAACTGTTGGAAAGGAATTGGCTTAT 3220
|| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||| ||||| ||
Sbjct 2659 GATGGTAGATCAACTTCCCTAGGTTTTGACATGCAAAATGCTGGGAAGGAGTTGGCGTAC 2718
Query 3221 ACTCTTCGAAGCGAAACGAGATTTAACAATTTCAGGAGAAACAAGGCTGCAGCTGGTCTT 3280
||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||
Sbjct 2719 ACTGTTCGAAGTGAAACAAGATTTAACAATTTTAGGAAAAACAAAGCAGCAGCTGGTCTC 2778
Query 3281 TCTGTAACACACTTGGGTGATTCGGTTTCTGCGGGGTTGAAAGTCGAAGATAAGTTTATT 3340
|||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 2779 TCTGTAACACTCTTGGGTGATTCAGTGTCTGCGGGACTGAAAGTGGAAGATAAGTTGATT 2838
Query 3341 GCTAGTAAATGGTTCAGAATCGTAATGTCTGGTGGAGCTATGACTAGTCGGGGAGATTTT 3400
|||| |||| |||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||
Sbjct 2839 GCTAATAAACGGTTCAGAATGGTTATGTCAGGTGGAGCAATGACTAGTCGAGGAGATGTT 2898
Query 3401 GCTTATGGTGGTACTTTGGAAGCTCAGTTGAGAGATAAAGATTATCCGCTTGGTCGGTTT 3460
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2899 GCTTATGGTGGTACTTTAGAAGCTCAGTTTCGAGATAAAGATTATCCGCTAGGTCGGTTT 2958
Query 3461 TTGACTACTCTTGGACTTTCTGTAATGGATTGGCACGGTGATCTTGCTATTGGAGGGAAC 3520
||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||
Sbjct 2959 TTGTCAACTCTTGGACTTTCTGTGATGGATTGGCATGGCGATCTTGCTATCGGAGGGAAT 3018
Query 3521 ATACAGTCTCAGGTTCCCATTGGACGTTCCTCTAATTTAATTGCTCGTGCTAATCTGAAC 3580
||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3019 ATACAGTCTCAAGTACCCATTGGACGTTCCTCTAATCTAATTGCTCGTGCTAATCTGAAT 3078
Query 3581 AATAGAGGAGCAGGGCAAGTAAGTGTTCGTGTTAACAGCTCCGAGCAGCTCCAACTTGCT 3640
|| |||||||||||||||||||| | || || |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3079 AACAGAGGAGCAGGGCAAGTAAGCATCCGCGTAAACAGCTCTGAGCAGCTCCAACTTGCT 3138
Query 3641 ATGGTTGCGA-TTGTTCCTCTCTTCAAGAAGCTACTTAGTTATTATTA--CCC--G--CA 3693
| ||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||
Sbjct 3139 GTTGTTGC-ACTTGTTCCTCTGTTCAAGAAGCTTCTTAGTTATTATTATTCCCCAGAGCA 3197
Query 3694 AACGCAATATGGACAATGATTAAGAAACATT 3724
|| |||||||||||| |||| || |||||||
Sbjct 3198 AATGCAATATGGACACTGATGAATAAACATT 3228
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 150251298204
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5