BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G17190.1
Length=2181
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg480601 jgi|Araly1|480601|fgenesh2_kg.3__3302__AT2G17190.1 3005 0.0
Ahg480602 jgi|Araly1|480602|fgenesh2_kg.3__3303__AT2G17200.1 1934 0.0
> Ahg480601 jgi|Araly1|480601|fgenesh2_kg.3__3302__AT2G17190.1
Length=2156
Score = 3005 bits (1627), Expect = 0.0
Identities = 1972/2130 (93%), Gaps = 57/2130 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 20 TCATTTAATTGGCCGTTCGGGG-C--CAAATAA-------CTCTTTAATTTTCTGCAG-- 67
|||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct 1 TCATTTAATTGGCCGTTCGGGGCCAACAAATAAGTCCTTTCTCTTTAATTCGCTGCAGTC 60
Query 68 -TC-TCATTTGTTATTCGACCAAAAATAATTTATATCCCTTTCCTCAAGAAATCT-T-CA 123
|| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| | |
Sbjct 61 TTCTTCATTTTTTATTCGACCAAAATTTTTTTATATCCCTTTCCTCACGAAATCTCTAAA 120
Query 124 GAACCGACTTATTAG-AGCTTCGAGTCTCCTCAAATCTTCTTCTACGATTTTTTCTTCTA 182
||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 121 GAACCGACTTA-GAGCTGGTTCGAGTCTCCTCAAATCTTCTTCTTCGATTTTTT-TTCTA 178
Query 183 GGTTTAGAGCTTTTGATTCTCCGATCAATTTCGCGATTTGTTGAACTAGGATCTGAAATT 242
|| |||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 179 GGGTTAGAGATTTTAAGTCTCCGATCGATTTCGCGATTTGTTGAACTAGGATCTGAAATT 238
Query 243 AGAATGGGTGGTGAAGCAGATTCGAGGCAGCCGCTGACTGCTGAAGGCGTAGCTGTTGCC 302
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 239 AGAATGGGTGGTGAAGCAGATTCGAGTCAGCCGCTGACTGCTGAAGGAGAAGCTGTTGCC 298
Query 303 GTGAACGTCAGATGCTCCAATGGCACGAAATTTAGTGTGACGACGAGCCTCGATTCCACG 362
||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 299 GTGAACGTCCGGTGTTCCAATGGCTCGAAATTTAGTGTGACGACGAGTCTCGATTCGACG 358
Query 363 GTGGAGTCTTTCAAAGAGTTAATTGCGCAGAACAGCGATGTGCCGGCAAATCAGCAGCGT 422
|| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 359 GTCGAGTCTTTCAAAGAGTTGATTGCGCAGAACAGCGATGTGCCAGCTAATCAGCAGCGT 418
Query 423 TTGATTTACAAGGGACGTATCCTCAAAGACGATCAGACTCTCCTCAGCTATGGTTTGCAG 482
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 419 TTGATTTACAAGGGACGTATCCTCAAGGACGATCAGACGCTTCTCAGCTATGGTTTGCAG 478
Query 483 GCTGATCACACCGTTCATATGGTTCGAGGTTTTGTGCCTTCTTCTCCTTCTGCTCCCGCT 542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 479 GCTGATCACACCGTTCATATGGTTCGAGGTTTTGTGCCTTCTTCTCCTTCTGCTCCCGCT 538
Query 543 GCAAATGCTGGAAACCAAACCACTGCTCCTCAAGCGGTTGGTTCAAATGATAGCTCAAAC 602
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||
Sbjct 539 GCAAATGCTGGAAACCAAACCACTGCTCCGCAAGCGGTTAGTTCAAATGATACCTCAAAC 598
Query 603 CTCGGAGGAGGTGAATCTTTGTTCCCTGGCCTTGGATTTAATCCTTTGGGTGGTGGAAAT 662
||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 599 CTCGGAGGAGGGGAGTCTTTGTTCCCTGGGCTTGGATTTAATCCTTTGGGTGGTGGAAAT 658
Query 663 GCTATGGCTGGATTATTTGGATCTGGTCTTCCTGATCTTGAGCAGGCACAGCAACAACTA 722
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 GCTATGGCTGGGTTATTTGGATCTGGTCTTCCTGATCTTGAGCAGGCACAGCAACAACTA 718
Query 723 GCTCAGAACCCTAACATGATTAGAGAGATGATGAATACTCCAGCCATCCAGAATCTTATG 782
||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 GCTCAAAACCCTAACATGATTAGAGATATGATGAATACTCCAGCCATCCAGAATCTTATG 778
Query 783 AACAACCCAGAATTTATGAGGAGTATGATTATGAATAACCCTCAAATGCGTGAGCTTGTA 842
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 779 AACAACCCAGAATTTATGAGGAGTATGATTATGAATAACCCTCAAATGCGTGAGCTTGTG 838
Query 843 GATCGCAATCCTGAGCTTGGTCATGTGCTCAATGACCCAAGCATCCTTCGTCAAACTCTA 902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 GATCGCAATCCTGAGCTTGGTCATGTGCTCAATGACCCAAGCATCCTTCGTCAAACTCTA 898
Query 903 GAAGCGGCGAGAAACCCAGAGCTTATGCGTGAAATGATGAGAAATACTGATAGGGCTATG 962
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||
Sbjct 899 GAAGCGGCAAGAAACCCAGAGCTTATGCGTGAAATGATGCGGAATACCGATAGGGCTATG 958
Query 963 AGTAATATTGAGTCTATGCCTGAGGGATTTAACATGCTTAGGCGTATGTATGAAAATGTC 1022
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 AGTAATATTGAGTCTATGCCTGAGGGATTTAACATGCTTAGGCGTATGTATGAAAATGTT 1018
Query 1023 CAGGAACCGTTAATGAATGCTACCACTATGTCCGAGAATGCTGGAAACAATACGAG-CTC 1081
|| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||
Sbjct 1019 CAAGAACCGTTAATGAATGCTACCACTATGTCCGGGAATGCTGGAAGCAATAC-AGGCTC 1077
Query 1082 TAATCCATTTGCTGCTCTTCTGGGAAACCAGGGGGTTACTACACAAGGAAGCGA--TACT 1139
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||
Sbjct 1078 TAATCCATTTGCTGCTCTTCTGGGAAACCAGGGGGTCACTACACAAGGAAGCGACGT-CT 1136
Query 1140 TCTAATAATATTTCGGCACCGAATGCTGAAACGGGTACACCTAATGCAAATCCACTTCCT 1199
||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1137 -CTAATAATACTTCGACACCGAATGCTGAAACGGGTACACCTAATGCAAATCCACTTCCT 1195
Query 1200 AATCCTTGGGGTGCCACGGCTGGCCAGACAACTGCCCCTGGAAGGACAAATGCTGGACTT 1259
||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1196 AATCCATGGGGTGCTACGGCTGGCCAAACAACTGCCCCTGGAAGGACAAATGCTGG--T- 1252
Query 1260 GGTGGTCTTGGTGGGCTTGGAGGCCTTGGTGGACTCGGTATGCTGGGAGCGGACTCACCT 1319
||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1253 GGTGGACTTGGTGGTCTTGGTGGCCTTGCTGGTCTTGGTATGCTGGGAGCAGACTCACCT 1312
Query 1320 CTTGGTGCGACTCCAGATGCTTCTCAATTGAGCCAAATACTGCAAAACCCCGCTATGTCG 1379
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1313 CTTGGTGCGACTCCAGATGCTTCTCAGTTGAGCCAAATACTGCAAAACCCAGCTATGTCG 1372
Query 1380 CAGATGATGCAAAGCGTACTTTCCAATCCACAGTACATGAATCAGCTTATGAGTCTTAAC 1439
|||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1373 CAGATGATGCAAAGTGTACTTTCCAATCCACAATACATGAATCAGCTTATGAGTCTCAAC 1432
Query 1440 CCACAACTCCGAAGCATGCTAGATATGAATCCTCAGTTGAGGGAAATGATGCAGAACCCT 1499
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1433 CCGCAACTCCGAAGCATGCTAGATATGAATCCTCAGTTGAGGGAAATGATGCAGAACCCT 1492
Query 1500 GATTTCCTTCGCCAGTTTAGCTCTCCCGAGATGATGCAGCAAATGATGTCTCTACAACAA 1559
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1493 GAATTCCTTCGCCAGTTTAGCTCTCCAGAGATGATGCAGCAAATGATGTCTCTACAACAA 1552
Query 1560 TCACTTTTCTCTCAGAATAGGAACACGGCTGGCCAGGATCCTACGCAAACTGGTGCTGCG 1619
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1553 TCACTTTTCTCTCAGAATAGGAACACGGTTGGCCAGGATCCAACGCAAACTGGTGCTGCG 1612
Query 1620 ACAGGGACAGCCAATAACGGAGGACTAGATTTATTGATGAATATGTTTGGCAGCCTTGGT 1679
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1613 ACAGGGACAGCCAATAACGGAGGGCTGGATTTATTGATGAATATGTTTGGCAGTCTTGGT 1672
Query 1680 GCTGGCGGCCTAAGTGGCACAAACCAACCCAATGTTCCTCCTGAAGAGCGATTTGCGACT 1739
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1673 GCTGGCGGCCTGAGTGGCACAAACCAACCCAATGTTCCTCCTGAAGAGCGATATGCGACT 1732
Query 1740 CAGTTGCAACAGTTGCAAGAAATGGGATTCTACGACAGAGCAGAGAACATAAGGGCTTTG 1799
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 1733 CAGTTGCAGCAGTTGCAAGAAATGGGATTCTACGACAGAGCAGAGAACATAAGAGCGTTG 1792
Query 1800 CTTGCAACCAATGGTAACGTTAACGCTGCTGTAGAACGACTCTTGGGGAGTATTGGCCAG 1859
|||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1793 CTTGCAACTAATGGCAATGTTAACGCTGCTGTAGAACGACTCTTGGGGAGTATTGGCCAG 1852
Query 1860 TAACATACAGGATCGCGAACTTGTGGATAGAAAAGCCGCTCATCGATACACTATTTGTTT 1919
|| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||
Sbjct 1853 TAGCATACAGGATCGTGAACTTGTGGATAGAAAAGCTGCGCATGGATACAGTATTTGTTT 1912
Query 1920 TCAATGGTCATCTTCTTTCCTCTTTACCCAATCCCCACAACCTTTTTTACATACTTTGGG 1979
| | ||| |||||||||| | ||| | ||| | || | || |||
Sbjct 1913 TTAGTGGCCATCTTCTTT--T-TTT------T----ACA---T-----AC-T--TT-GGG 1947
Query 1980 TCGTCTGTTATCTTTCAGATTCTATTTGAAGTTGTTACCTCGTACATCTGTAGAAGTTGA 2039
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1948 TCGTCTGTTATCTTTCAGATTCTATTTGAAGTTGTTACAACGTACATCTGTAGAAGTTGA 2007
Query 2040 TTTCGAAATGTGGAATGGTTACATTTACGTTTTCTTATCTCCATTT-TACTTATTAAATA 2098
||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||| |||||
Sbjct 2008 TTTCGAAATGTGGAATGGTTACATTTACGTTATCTTTTCTCCATTTAT-CTTAT-AAATA 2065
Query 2099 TAGCTGTAGTG-ACGTTGATAATTTGTGAT 2127
|||| || || ||||||||||||||||||
Sbjct 2066 TAGCCGTTGTATACGTTGATAATTTGTGAT 2095
> Ahg480602 jgi|Araly1|480602|fgenesh2_kg.3__3303__AT2G17200.1
Length=1947
Score = 1934 bits (1047), Expect = 0.0
Identities = 1497/1707 (88%), Gaps = 59/1707 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 229 TAGGATCTGAAATTAGAATGGGTGGTGA---AGCAGATTCGAGGCAGCCGCTGACTGCTG 285
||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| ||||| |
Sbjct 83 TAGGATCCGAAATTAGAATGGGTGGAGAGGGAGGAGATTCGAGTCAGCCGCAGACTGGAG 142
Query 286 AAGGCGTAGCTGT-TGCCGTGAACGTCAGATGCTCCAATGGCACGAAATTTAGTGTGACG 344
|||| | |||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |
Sbjct 143 AAGGAGAAGCTGTCT-CCGTGAACATCAGGTGCTCAAATGGCACGAAATTTAGTGTGAAG 201
Query 345 ACGAGCCTCGATTCCACGGTGGAGTCTTTCAAAGAGTTAATTGCGCAGAACAGCGATGTG 404
|||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||
Sbjct 202 ACGAGCCTTGATTCGACGGTGGAGTCTTTCAAAGAGTTGGTGGCTCAGAGCAGCGATGTT 261
Query 405 CCGGCAAATCAGCAGCGTTTGATTTACAAGGGACGTATCCTCAAAGACGATCAGACTCTC 464
|| || |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 262 CCAGCCAATCAGCAACGCTTGATTTATAAGGGTCGGATCCTCAAGGACGATCAAACTCTC 321
Query 465 CTCAGCTATGGTTTGCAGGCTGATCACACCGTTCATATGGTTCGAGGTTTTGTGCCTTCT 524
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||
Sbjct 322 CTCAGCTATGGTTTGCAGGCTGATCACACAATTCATATGGTTCGAGGCTCTGCACCTTCT 381
Query 525 T------CTCCTTCTGCTCCCGCTGCAAATGCTGGAAACCAAACCACTG---C------T 569
| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 382 TCAGCACCACCTTCTGCTCCGGCTGCGAATGCTGGAAACCAAACCACTGCACCTAGTGTT 441
Query 570 CCTCAAGCGGTTGGTTCAAATGATAGCTCAAACCTCGGAGGA---GG---T---GAATCT 620
||| || |||||||||| || ||||||| || || |||||| || | ||||||
Sbjct 442 ACTCGAGGGGTTGGTTCAGATAATAGCTCGAATCTAGGAGGAGCGGGTCCTGGGGAATCT 501
Query 621 TTGTTCCCTGGCCTTGGATTTAATCCTTTGGGTGGTGGAAATGCTATGGCTGGATTATTT 680
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 502 TTGTTCCCTGGGCTTGGATTTAATCCTTTGGGTGGTGGAAATGCTATGGCTGGGTTATTT 561
Query 681 GGATCTGGTCTTCCTGATCTTGAGCAGGCACAGCAACAACTAGCTCAGAACCCTAACATG 740
||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 562 GGAGCTGGTCTTCCGGATCTTGAGCAGGCACAGCAACAACTAGCTCAAAACCCTAATATG 621
Query 741 ATTAGAGAGATGATGAATACTCCAGCCATCCAGAATCTTATGAACAACCCAGAATTTATG 800
|||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 622 ATTAGAGATATGATGAATACACCAGCCATCCAGAATCTTATGAATAACCCAGAATTTATG 681
Query 801 AGGAGTATGATTATGAATAACCCTCAAATGCGTGAGCTTGTAGATCGCAATCCTGAGCTT 860
|||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 682 AGGAGTATGATTATGAGTAACCCACAAATGCGTGAGCTTGTAGATCGCAATCCTGAGCTT 741
Query 861 GGTCATGTGCTCAATGACCCAAGCATCCTTCGTCAAACTCTAGAAGCGGCGAGAAACCCA 920
|| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||
Sbjct 742 GGCCATGTGCTCAATGACCCAAGCATCCTTCGGCAAACTTTAGAGGCAGCGAGAAACCCA 801
Query 921 GAGCTTATGCGTGAAATGATGAGAAATACTGATAGGGCTATGAGTAATATTGAGTCTATG 980
||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 802 GAGCTTATGCGTGAAATGATGCGGAATACCGATAGGGCTATGAGTAATATTGAGTCTATG 861
Query 981 CCTGAGGGATTTAACATGCTTAGGCGTATGTATGAAAATGTCCAGGAACCGTTAATGAAT 1040
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 862 CCTGAGGGATTTAACATGCTTAGGCGTATGTATGAAAATGTCCAGGAACCTTTCTTGAAT 921
Query 1041 GCTACCACTATGTCCGAGAATGCTGGAAACAATACGAGCTCTAATCCATTTGCTGCTCTT 1100
||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 922 GCTACTACTATGTCAGGGAATGCTGGAAACAATACGAGCTCCAATCCGTTTGCTGCTCTC 981
Query 1101 CTGGGAAACCAGGGGGTTACTACACAAGGAAGCGATACTTCTAATAA-TATTTCGGCACC 1159
||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| | || | || |
Sbjct 982 CTGGGAAACCAGGGGGTTACTACTCAAGGAAGTGTTGCTTCTAATAACTCTTCCA-CAAC 1040
Query 1160 GAATGCTGAAACGGGTAC-A--CCTAATGCAAATCCACTTCCTAATCCTTGGGGTGCCAC 1216
||| ||| |||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1041 AAATACTGGAACGGGGACTATTCCGAATGCAAATCCACTTCCTAATCCTTGGGGTGCTAC 1100
Query 1217 GGCTGGCCAGACAACTGCCCCTGGAAGGACAAATGCTG--G---A--CTTG--G---TGG 1264
|| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | | | | | |||
Sbjct 1101 GGGTGGCCAGACAACTGTCCCTGGAAGGACCGATGCTGCTGGGGATGCGAGAAGCCCTGG 1160
Query 1265 TCTTGG-----T-GGG---CTTGGAGGCCTTGGTGGACTCGGTATGCTGGGAGCGGACTC 1315
||||| | ||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||
Sbjct 1161 CCTTGGCGGCCTTGGGGGTCTTGGAGGCCTCGGTGGACTTGGTATGCTTGGAGCGGATTC 1220
Query 1316 ACCTCTTGGTGCGACTCCAGATGCTTCTCAATTGAGCCAAATACTGCAAAACCCCGCTAT 1375
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||
Sbjct 1221 ACCTCTTGGTGCCACTCCAGATGCTTCTCAATTGAGCCAGTTATTGCAAAACCCAGCCAT 1280
Query 1376 GTCGCAGATGATGCAAAGCGTACTTTCCAATCCACAGTACATGAATCAGCTTATGAGTCT 1435
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1281 GTCGCAGATGATGCAAAGCGTATTTTCCAATCCACAATACATGAATCAGCTTATGAATCT 1340
Query 1436 TAACCCACAACTCCGAAGCATGCTAGATAT-GAATCCTCAGTTGAGGGAAATGATGCAGA 1494
|||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1341 TAACCCACAACTCCGAAGTATGCTAGAT-TCGAATCCTCAGTTGAGGGAAATGATGCAGA 1399
Query 1495 ACCCTGATTTCCTTCGCCAGTTTAGCTCTCCCGAGATGATGCAGCAAATGATGTCTCTAC 1554
| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1400 ATCCAGATTTCCTTCGTCAGTTTAGTTCTCCGGAGATGATGCAGCAAATGATGACTCTAC 1459
Query 1555 AACAATCACTTTTCTCTCAGAATAGGAACACGGCTGGCCAGGATCCTACGCAAACTGGTG 1614
| ||||||||||| ||||||||||| ||| | || |||||||| | |||||||||||
Sbjct 1460 AGCAATCACTTTTATCTCAGAATAGAAACGCAGCCAGCCAGGATGCGGGGCAAACTGGTG 1519
Query 1615 CTGCGACAGGGAC-AGCCAATAACGGAGGACTAGATTTATTGATGAATATGTTTGGCAGC 1673
|||| |||||||| | | |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1520 CTGCCACAGGGACGAAC-AATAACGGGGGGCTGGATTTATTAATGAATATGTTTGGCAGT 1578
Query 1674 CTTGGTGCTGGCGGCCTAAGTGGCACAAACCAACCCAATGTTCCTCCTGAAGAGCGATTT 1733
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |
Sbjct 1579 CTTGGTGCTGGCGGCCTGAGTGGCACAAACCAACCCAATGTTCCTCCCGAGGAGCGCTAT 1638
Query 1734 GCGACTCAGTTGCAACAGTTGCAAGAAATGGGATTCTACGACAGAGCAGAGAACATAAGG 1793
|| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1639 GCTACTCAGTTGCAACAGTTACAGGAAATGGGATTCTACGACAGAGCAGAGAACATAAGA 1698
Query 1794 GCTTTGCTTGCAACCAATGGTAACGTTAACGCTGCTGTAGAACGACTCTTGGGGAGTATT 1853
|| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1699 GCATTGCTTGCAACCAATGGTAACGTTAATGCTGCTGTAGAACGACTCTTGGGGAGTATC 1758
Query 1854 GGCCAGTAACATACAGGATCGCGAACT 1880
|| ||||| |||||||| | | |||||
Sbjct 1759 GGACAGTAGCATACAGGTTGGTGAACT 1785
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 82084477975
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5