BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G20190.1
Length=4791
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg931357 jgi|Araly1|931357|scaffold_303814.1 7278 0.0
> Ahg931357 jgi|Araly1|931357|scaffold_303814.1
Length=4363
Score = 7278 bits (3941), Expect = 0.0
Identities = 4227/4367 (97%), Gaps = 12/4367 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 179 TCCGTCGGTGGTTT-GGTaaaaaaaaaaaTGGAGGAAGCTTTAGAAATGGCGAGAGCCAA 237
|||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TCCGTCGGTGGTTTCGGT-----AAAAAATGGAGGAAGCTTTAGAAATGGCGAGAGCCAA 55
Query 238 GGATACAAAAGAGCGCATGGCTGCTGTTGAAAGGCTGCATCAACTTCTCGAAGCTTCTAG 297
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 56 GGATACAAAAGAGCGCATGGCGGCTGTTGAAAGGCTACATCAACTTCTCGAAGCTTCTAG 115
Query 298 GAAGAGTTTGAGTCC-TGCGGAAGTGACGTCACTTGTTGATTCTTGTTTGGATCTCCTTA 356
||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 116 GAAGAGTTTGAGTCCAT-CGGAAGTGACGTCACTTGTTGATTCTTGTTTGGATCTCCTTA 174
Query 357 AGGATAGTAATTTTAGAGTCTCTCAAGGTGCTCTTCAAGCTCTTGCTTCTGCTGCTGTCC 416
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 175 AGGATAGTAATTTTAGAGTCTCTCAAGGTGCGCTTCAAGCTCTTGCTTCTGCTGCTGTTC 234
Query 417 TCGCTGGTGAGCATTTGAAGCTTCATTTGAATGCTCTTGTTCCTGCTGTTGTCGAGCGGC 476
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 235 TTGCTGGTGAGCATTTGAAGCTTCATTTGAATGCTCTTGTTCCTGCTGTTGTCGAGCGGC 294
Query 477 TTGGTGATAGTAAGCAACCTGTTAGAGATGCTGCGAGGCGTCTGTTGACGACTCTCATGG 536
| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||
Sbjct 295 TCGGTGATAGCAAGCAACCTGTTAGGGATGCTGCGAGACGTTTGTTGACGACTCTAATGG 354
Query 537 AGGTTTCATCTCCGACGATTATAGTGGAGAGAGCTGGTTCGTATGCTTGGATGCATAAGA 596
||||||||||| | || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 355 AGGTTTCATCTTCAACTATTATAGTTGAAAGAGCGGGTTCTTATGCTTGGATGCATAAGA 414
Query 597 GTTGGAGAGTTAGGGAAGAGTTTGCGCGTACTGTTACATCGGCGATTGGTCTTTTCGCAT 656
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 415 GTTGGAGAGTTAGGGAAGAGTTTGCGCGTACTGTTACATCGGCTATTGGTCTTTTTGCAT 474
Query 657 CTACGGAACTTCCTCTTCAGCGTGTTATACTTGCTCCGATACTTCAGATGTTAAATGA-C 715
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 475 CTACGGAACTTCCTCTTCAGCGGGTTATACTTGCTCCGATACTTCAGATGTTAAATGATC 534
Query 716 CCTAATCAAGCAGTTAGGGAAGCTGCTATTTTGTGCATTGAGGAGATGTATATGCAAGGT 775
|| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 535 CC-AATCAAGCAGTTAGGGAAGCTGCAATTTTGTGCATTGAGGAGATGTACATGCAGGGT 593
Query 776 GGGTCTCAATTTCGAGAAGAGCTTCAACGTCACCATCTTCCATCGTATATGGTGAAGGAC 835
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 594 GGGTCTCAATTTCGAGAAGAGCTTCAACGCCACCATCTTCCATCATATATGGTGAAGGAT 653
Query 836 ATTAATGCTAGACTAGAACGTATTGAGCCACAACTGCGTTCTACAGATGGCCGTAGTGCC 895
|||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 654 ATTAATGCTAGACTGGAACGTATTGAGCCACAGCAGCGTTCTACAGATGGCCGTAGTGGT 713
Query 896 CACCATGTTGTTAATGAGGTGAAGGCATCAAGTGTCAATCCCAAAAAGAGCAGTCCCAGG 955
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 714 CACCATGTTGTTAATGAGGTTAAGGCATCAAGTGTCAATCCCAAAAAGAGTAGTCCCAGG 773
Query 956 GCAAAGGCTCCTACGAGGGAGAACTCTTTATTTGGGGGAGATGCCGACATCACTGAAAAA 1015
||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 774 GCAAAGGCTCCCACGCGAGAGAACTCTTTATTTGGGGGAGATGCCGACATCACTGAAAAA 833
Query 1016 CCCATTGAGCCAATCAAAGTGTACTCAGAGAAGGAGTTAATACGAGAATTTGAGAAAATT 1075
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||
Sbjct 834 CCCATTGAGCCAATCAAAGTGTACTCAGAGAAGGAGCTGATACGAGAATTTGAGAAAGTT 893
Query 1076 GCTGCAACACTCGTCCCAGAGAAAGACTGGTCAATGCGTATTTCAGCTATGCGGAGGGTT 1135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 894 GCTGCAACACTCGTCCCAGAGAAAGACTGGTCAATGCGTATTTCAGCTATGCGGAGGGTT 953
Query 1136 GAAGGACTTGTTGCAGGAGGTGCGACTGATTACTCCTGCTTTCGAGGTCTCCTGAAGCAA 1195
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 954 GAGGGACTTGTTGCAGGAGGTGCGACTGATTACTCTTGCTTTCGAGGTCTCCTGAAGCAA 1013
Query 1196 CTTGTTGGTCCTTTAAGTACTCAATTAGCTGACCGGAGATCTACCATTGTTAAGCAGGCC 1255
|||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1014 CTTGTTGGCCCCTTAAGTACACAATTAGCTGACCGGAGATCTACCATTGTTAAGCAGGCC 1073
Query 1256 TGTCATCTCTTGTGTCTCTTATCAAAAGAGCTACTGGGAGATTTTGAGGCATGCGCTGAG 1315
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1074 TGTCATCTATTGTGTCTCTTATCAAAAGAACTACTGGGAGATTTTGAAGCATGCGCTGAG 1133
Query 1316 ACGTTTATTCCAGTGCTTTTCAAGCTGGTTGTGATTACTGTGCTTGTAATTGCAGAATCT 1375
| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1134 ATGTTTATTCCAGTGCTTTTCAAGCTGGTTGTGATCACTGTGCTTGTAATTGCAGAATCT 1193
Query 1376 GCTGATAACTGCATAAAAACGATGCTGCGTAACTGCAAAGCTGCCCGTGTACTTCCTCGC 1435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1194 GCTGATAACTGCATAAAAACGATGCTGCGTAACTGCAAAGCTGCCCGTGTACTTCCTCGC 1253
Query 1436 ATAGCTGAATCAGCAAAACATGACCGTAATGCAATTCTGCGAGCAAGATGTTGTGAATAT 1495
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254 ATAGCTGAATCAGCAAAACATGACCGTAATGCAATTCTGCGAGCAAGATGTTGTGAATAT 1313
Query 1496 GCATTGTTAACACTTGAACATTGGCCTGATGCTCCAGAAATTCAACGATCAGTTGATTTA 1555
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1314 GCATTGTTAACACTCGAACATTGGCCTGATGCTCCAGAAATTCAACGATCAGTTGATTTA 1373
Query 1556 TATGAAGATCTGATTAGATGCTGTGTTGCAGATGCTATGAGTGAGGTGCGGGCAACTGCT 1615
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1374 TATGAGGATCTGATTAGATGCTGTGTTGCAGATGCTATGAGTGAGGTACGGGCAACTGCT 1433
Query 1616 AGAATGTGCTACAGAATGTTTGCAAAAACTTGGCCGGATCGTTCTCGCCGGTTGTTTTCG 1675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1434 AGAATGTGCTACAGAATGTTTGCAAAAACTTGGCCGGATCGTTCTCGTCGGTTGTTTTCC 1493
Query 1676 TCCTTTGACCCTGTCATTCAAAGGCTAATAAATGAAGAAGATGGTGGAATTCATAGGAGA 1735
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1494 TCCTTTGACCCTGTCATTCAAAGGCTAATAAATGAAGAAGATGGTGGAATTCATAGGAGA 1553
Query 1736 CACGCCTCACCATCTGTCCGTGAGAGACATTCCCAGCCTTCATTTTCTCAGACGTCTGCT 1795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 1554 CACGCCTCACCATCTGTCCGTGAGAGACATTCCCAGCCTTCATATGCTCAGACGTCTGCT 1613
Query 1796 CCTTCTAACCTACCTGGCTATGGAACATCAGCTATAGTCGCTATGGATAGAAGTTCAAAT 1855
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1614 CCTTCTAATCTACCTGGCTATGGAACATCAGCTATAGTCGCTATGGATAGAAGCTCAAAT 1673
Query 1856 TTATCATCTGGAGGATCTCTTTCTTCTGGGTTACTCCTTTCGCAATCAAAGGATGTCAAT 1915
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1674 TTATCATCTGGAGGATCACTTTCTTCTGGGTTACTCCTTTCGCAATCAAAGGATGTCAAT 1733
Query 1916 AAAGGTTCTGAACGTAGTCTGGAAAGTGTGTTACAATCAAGCAAGCAGAAGGTCAGTGCA 1975
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1734 AAAGGTTCTGAACGTAGTCTGGAAAGTGTGTTACAATCAAGCAAGCAGAAGGTCAGTGCA 1793
Query 1976 ATTGAAAGTATGCTCCGAGGACTGCATATATCTGATAGACAAAATCCTGCAGCCCTTCGT 2035
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 1794 ATTGAAAGTATGCTCCGAGGACTGCATATATCTGATAGACAAAACCCTGCAGCTCTTCGT 1853
Query 2036 TCAAGTAGTTTGGATCTAGGAGTTGACCCTCCATCGTCTCGTGATCCTCCTTTCCATGCT 2095
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1854 TCAAGTAGTTTGGATCTAGGAGTTGACCCTCCATCGTCTCGTGATCCTCCTTTCCATGCT 1913
Query 2096 GTTGCTCCAGCATCCAATAGTCACACAAGTAGCGCAGCTGCTGAATCAACACATAGTATC 2155
| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1914 GCTGTTCCAGCATCCAATAATCACACAAGTAGTGCAGCTGCTGAATCAACACATAGTATC 1973
Query 2156 AACAAAGGCAGTAATCGCAATGGTGGCCTTGGTTTGTCAGATATCATCACCCAAATTCAA 2215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1974 AACAAAGGCAGTAATCGCAATGGTGGCCTTGGTTTGTCAGATATCATCACCCAAATTCAA 2033
Query 2216 GCTTCAAAGGACTCAGGAAGATCATCTTACCGTGGCAATCTGTTGTCCGAGTCTCATCCT 2275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2034 GCTTCAAAGGACTCAGGAAGATCATCTTACCGTGGCAATCTGTTGTCCGAGTCTCATCCT 2093
Query 2276 ACTTTTTCATCCTTGACCGCTAAACGGGGCTCAGAGAGAAATGAGAGAAGTTCTCTTGAG 2335
|| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2094 ACCTTTTCATCCTTGACAGCTAAACGGGTCTCCGAGAGAAATGAGAGAAGTTCTCTTGAG 2153
Query 2336 GAAAGCAATGATGCCAGAGAGGTGAGGCGGTTTATGGCTGGTCATTTTGACCGACAGCAG 2395
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||
Sbjct 2154 GAAAGCAATGATGCCAGAGAGGCGAGGCGGTTTATGGCAGGGCATTTTGACAGACAGCAG 2213
Query 2396 ATGGATACTGCTTATAGAGATTTGACTTTCAGGGAATCAAACGCTAGCCATGTTCCCAAT 2455
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2214 ATGGATACCGCTTATAGAGATTTGACTTTCAGGGAATCAAACGCTAGCCATGTTCCCAAT 2273
Query 2456 TTCCAGAGGCCACTTTTGAGGAAGAATGTAGGGGGAAGAATGTCTGCAGGCCGGAGGAGG 2515
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||
Sbjct 2274 TTCCAGAGGCCACTTTTGAGGAAGAATGTTGGGGGAAGAATGTCCGCAGGCAGGAGGAGG 2333
Query 2516 AGTTTTGATGATAGCCAACTGCAAATTGGTGACATATCAAATTTTGTTGATGGTCCAGCT 2575
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2334 AGTTTTGATGATAGCCAACTGCAAATTGGTGACATATCAAATTATGTTGATGGTCCAGCT 2393
Query 2576 TCCCTGAACGAGGCCCTTAACGACGGACTGAACTCAAGTTCTGATTGGTGTGCCAGAGTT 2635
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2394 TCCCTGAACGAGGCCCTTAACGACGGACTGAACTCAAGTTCTGATTGGTGTGCCAGAGTT 2453
Query 2636 GCAGCTTTTAATTTTCTCCAAACTCTGCTGCAGCAAGGCCCAAAAGGTGCTCAAGAAGTA 2695
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2454 GCAGCTTTTAATTTTCTCCAAACTCTGCTGCAGCAAGGCCCAAAAGGTGCTCAAGAAGTA 2513
Query 2696 ATTCAAAGTTTTGAGAAAGTAATGAAACTATTTCTCCGGCATTTGGATGATCCTCACCAC 2755
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2514 ATTCAAAGTTTCGAGAAAGTAATGAAACTATTTCTCCGGCATTTGGATGATCCTCACCAC 2573
Query 2756 AAGGTCGCACAAGCAGCACTGTCGACACTTGCAGATCTTATACCATCTTGCCGAAAGCCT 2815
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2574 AAGGTCGCACAAGCAGCACTGTCGACACTCGCAGATCTTATACCATCTTGCCGAAAGCCT 2633
Query 2816 TTTGAGAGCTACATGGAAAGAGTCCTACCCCATGTGTTTTCACGGCTAATTGACCCTAAA 2875
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||
Sbjct 2634 TTTGAGAGCTACATGGAAAGAGTCCTACCCCATGTCTTTTCACGGCTAATCGATCCTAAA 2693
Query 2876 GAAGTAGTTAGACAACCTTGCTCCTCAACCTTGGAAATTGTCAGCAAAACCTACAGTGTG 2935
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2694 GAGGTAGTTAGACAACCTTGCTCCTCAACCTTGGAAATTGTCAGCAAAACCTACAGTGTG 2753
Query 2936 GATTCCCTTTTACCTGCATTGCTTCGTTCACTGGATGAACAGAGATCACCAAAGGCTAAA 2995
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2754 GATTCCCTTTTGCCTGCATTGCTTCGTTCACTGGATGAGCAGAGATCACCAAAGGCTAAA 2813
Query 2996 TTAGCTGTGATTGAATTTGCCATCAACTCCTTCAACAGGTACGCTGGTAACCCTGAAATT 3055
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2814 TTAGCTGTGATTGAATTTGCCATCAACTCCTTCAACAGGTACGCTGGTAACCCTGAAATT 2873
Query 3056 TCGGGTAATAGTGGCATCTTAAAGTTGTGGCTGGCAAAGTTGACGCCATTAACCCGCGAC 3115
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2874 TCGGGTAATAGTGGCATCTTAAAGTTGTGGCTGGCAAAGTTGACGCCATTAACCCGCGAC 2933
Query 3116 AAAAATACCAAGTTGAAAGAAGCTTCCATTACTTGCATCATATCTGTTTACAATCATTAT 3175
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2934 AAAAATACCAAGTTGAAAGAAGCTTCCATTACTTGCATCATATCTGTTTACAATCATTAT 2993
Query 3176 GATTCTGCGGGACTGCTAAATTACATTCTTAGTTTGTCGGTTGAGGAGCAAAACTCTCTG 3235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2994 GATTCTGCGGGACTGCTAAATTACATTCTTAGTTTGTCGGTTGAGGAGCAAAACTCTCTG 3053
Query 3236 AGAAGAGCCCTCAAACAATATACTCCCCGCATCGAGGTGGACCTGTTAAACTATATGCAG 3295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3054 AGAAGAGCCCTCAAACAATATACTCCCCGCATCGAGGTGGACCTGTTAAACTATATGCAG 3113
Query 3296 AGTAAAAAGGAAAAACAGAGAATTAAGTCTTATGACCCATCTGATGCCATTGGGACATCA 3355
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3114 AGTAAAAAGGAAAAACAGAGAATAAAGTCTTATGACCCGTCTGATGCCATTGGGACATCA 3173
Query 3356 TCTGAGGAAGGATATGCTGGTGCCTCCAAGAAGAATATATTCCTTGGCCGGTATTCTGGG 3415
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3174 TCTGAGGAAGGATATGCTGGTGCCCCCAAGAAGAATATATTCCTTGGCCGGTATTCTGGG 3233
Query 3416 GGTTCTATTGACAGTGATAGTGGCAGGAAGTGGAGTTCTTCCCAGGAGCCAACAATGATC 3475
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3234 GGTTCTGTTGACAGTGATAGTGGCAGGAAGTGGAGTTCTTCCCAGGAGCCAACAATGACC 3293
Query 3476 ACTGGTGGTGTTGGTCAAAATGTTTCCAGTGGAACCCAGGAAAAGCTGTATCAGAACGTT 3535
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3294 ACTGGTGGTGTTGGTCAAAGTGTTTCCAGTGGAACCCAGGAAAAGCTGTATCAGAACCTC 3353
Query 3536 AGAACTGGGATCAGTTCAGCTAGTGATCTGTTGAACCCCAAGGATTCTGATTACACATTT 3595
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3354 AGAACTGGGATCAGTTCAGCTAGTGATCTGTTGAACCCCAAGGATTCTGATTACACATTT 3413
Query 3596 GCTTCAGCTGGTCAGAATTCGATATCAAGAACTAGCCCCAATGGAAGCTCAGAAAACATC 3655
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 3414 GCTTCAGCTGGTCAGAATTTGATATCAAGAACTAGCCCTAATGGAAGCTCAGACAACATC 3473
Query 3656 GAAATCTTGGATGACTTATCTCCACCACATTTGGAGAAAAATGGTCTAAATCTGACAAGC 3715
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3474 GAAATCTTGGATGACTTATCTCCACCACATTTGGAGAAAAATGGTCTGAATCTGACAAGC 3533
Query 3716 GTTGATTCCTTGGAAGGAAGACATGAAAATGAGGTCTCCCGCGAATTAGATTTAGGTCAC 3775
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3534 GCTGATTCCTTGGAAGGAAGACATGAAAATGAGGTCTCCCGCGAATTAGATTTAGGTAAC 3593
Query 3776 TACATGCTCACATCTATTAAGGTCAA-CACAACACCGGAATCTGGACCTAGCATTCCTCA 3834
|||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3594 TACATGCTTGCATCTATAAAGGTCAATC-CAACACCGGAATCTGGACCTAGCATTCCTCA 3652
Query 3835 GATTCTACATATGATCAACGGGAGTGATGGAAGCCCTTCTTCTAGCAAGAAATCTGGACT 3894
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 3653 GATTCTACATATGATCAACGGGAGTGATGGAAGCCCTTCTTCCAGCAAAAAATCTGGACT 3712
Query 3895 CCAGCAATTAATTGAAGCCTCTGTAGCTAACGAGGAATCAGTTTGGACCAAGTACTTCAA 3954
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3713 CCAGCAATTGATTGAAGCCTCTGTAGCTAACGAGGAATCAGTTTGGACCAAGTACTTCAA 3772
Query 3955 TCAAATTTTGACGGTTGTTCTTGAAGTGCTCGATGACGAAGATTTTTCAATCAAAGAGCT 4014
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3773 TCAAATTTTGACTGTGGTTCTTGAAGTGCTCGATGACGAAGATTTTTCAATCAGAGAGCT 3832
Query 4015 TGCTCTTTCATTGATTTCTGAAATGCTAAAGAGCCAGAAAGATGCCATGGAAGACTCTGT 4074
|||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3833 TGCTCTTTCACTGATTTCTGAAATGCTAAAGATCCAGAAAGATGCCATGGAAGATTCTGT 3892
Query 4075 TGAAATAGTGATCGAAAAGCTGCTTCATGTCTCAAAGGACACCGTTCCAAAAGTTTCCAC 4134
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3893 TGAAATAGTGATCGAAAAGCTGCTTCATGTCTCAAAGGACACTGTTCCAAAAGTTTCCAC 3952
Query 4135 TGAAGCTGAGCAATGTTTGACCACAGTCTTGTCCCAATACGATCCTTTCAGATGCTTAAG 4194
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3953 TGAAGCTGAGCAATGTTTGACCACGGTCTTGTCCCAATACGATCCTTTCAGATGCTTAAG 4012
Query 4195 CGTTATTGTCCCATTATTGGTGACGGAAGATGAGAAAACTCTTGTCGCTTGCATAAATTG 4254
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4013 TGTTATTGTCCCATTATTGGTGACGGAAGATGAGAAAACTCTTGTCGCTTGCATAAATTG 4072
Query 4255 TTTAACGAAGCTTGTGGGTAGGCTCTCGCAAGAGGAATTAATGGATCAATTGTCGTCTTT 4314
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4073 TTTAACGAAGCTTGTGGGTAGGCTCTCGCAAGAGGAATTAATGGATCAGTTGTCGTCTTT 4132
Query 4315 TTTGCCTGCGGTTTTTGAAGCATTTGGGAGCCAAAGCGCGGATGTCCGCAAGACAGTGGT 4374
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4133 TTTGCCGGCGGTTTTTGAAGCATTTGGGAGCCAAAGCGCAGATGTCCGCAAGACAGTGGT 4192
Query 4375 GTTCTGTCTAGTAGACATATATATAATGCTTGGGAAAGCATTTTTGCCGTATTTGGAAGG 4434
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4193 GTTCTGTCTGGTAGACATATATATAATGCTTGGGAAAGCATTTTTGCCGTATTTGGAAGG 4252
Query 4435 TCTAAACAGCACGCAGGTTCGTCTAGTGACCATCTATGCAAACCGGATCTCGCAGGCTAG 4494
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4253 TCTAAACAGCACGCAGGTTCGTCTAGTGACCATCTACGCAAACCGGATCTCGCAGGCTAG 4312
Query 4495 AAACGGTGCCCCTATCGACGCAGACACCTGACGAGCCGCTTGTACTT 4541
|| |||||| |||||||| ||| ||||||||||| | || |||||||
Sbjct 4313 AACCGGTGCTCCTATCGATGCAAACACCTGACGAACGGCGTGTACTT 4359
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 181306277772
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5