BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G22010.2
Length=5143
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg481065 jgi|Araly1|481065|fgenesh2_kg.4__125__AT2G22010.1 6804 0.0
Ahg481064 jgi|Araly1|481064|fgenesh2_kg.4__124__AT2G22000.1 143 1e-32
> Ahg481065 jgi|Araly1|481065|fgenesh2_kg.4__125__AT2G22010.1
Length=4298
Score = 6804 bits (3684), Expect = 0.0
Identities = 4156/4372 (95%), Gaps = 79/4372 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 165 tctctctctctctctctctTCGAGGAAGAAGAAGaaaaaaaaaGAAGCGAAAAGTCTTCT 224
||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1 TCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCGAGG-AG--GAAG---AAAAAA-AAGCGAAAAGTCTTCT 53
Query 225 CC-TGTTTAATTTATTTGAAAAACCCTAGCACAAGTCCGCCGTCTTTGGTTTGAAGAATC 283
|| | ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 54 CCTTTTTTTATTTATTTGAAAAACCCTAACACGAGTCCGCCGTCTTTGGTCTGAAGAATC 113
Query 284 TGGGTATTGATTGATTTTGGCTTCTGGGTTAATCGCTTTTCATGTCAATTTCTCCGCTTT 343
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||
Sbjct 114 TGGGTATTGATTGATTTTGGCTTCTGGGTTAATCG-TTTTGATGTCAATTTCTCCGCTTT 172
Query 344 TCTGAATCATTTTCGAATTGTCTCTGATGAGGTCTCGTTGAATAGATACAGACTTTGGTT 403
|||||||||||||||||| || ||||||||| ||| | || | |||| ||||||||||||
Sbjct 173 TCTGAATCATTTTCGAATCGTGTCTGATGAGTTCTTGATG-A-AGATTCAGACTTTGGTT 230
Query 404 CTCTTGTAATTGGTTGTGTTGAAAGCGCGTTTGGTTCACAATCAATGCCATATGGCTGAA 463
|||||||||||| | | || | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 231 CTCTTGTAATTGATCAT-TT---A-CGTGTTTGATTCACAATCAATGCCATATGGCTGAA 285
Query 464 GACAGCCTACGGGTTGGTATGATTTCATCTGGTTTGGCTGTTTTACTGAATGGTGAAGAT 523
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 286 GACAGCCTACGGGTTGGTATGATTTCATCTGGTTTGGCTGTTTTACTGAATGGTGAAGAT 345
Query 524 GCTAAAGAAAATTCCTCGAAAGCTCGTATTGTTCCACATTTTGATTATTCTGGTCACCGG 583
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 346 GCTAAAGAGAATTCGTCGAAAGCTCGTATTGTTCCACATTTTGATTATTCTGGTCACCGG 405
Query 584 CCTTTAGAACGGACTATCGAATTCATATTTGGTTTAGCAGAAAAGTCGGTTGGTCCATTG 643
||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 406 CCTTTAGAACGGACTATCGAATTTATATTTGGTCTAGCAGAAAAGTCGGTTGGTCCATTG 465
Query 644 GATGGTCAAGTAGACAGTAGCTTGATTAGAGCTGTGATTAAGAATCAGTTCTCGAAGCTT 703
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 466 GATGGTCAAGTAGACAGTAGCTTGATTAGAGCCGTGATTAAGAATCAGTTTTCGAAGCTT 525
Query 704 CATGGTGATTTGGATGTTTCAGTTAGTCAGAGAGAAGGAATCAGTGTAGTTCATCATGGT 763
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 526 CATGGTGAATTGGATGTTTCAGTTAGTCAGAGAGAAGGAATCAGTGTAGTTCATCATGGT 585
Query 764 GTTGGACCTCCTATTGTTGGCCTTGAAGAGTTTAGCATATGTGGTGATATCAGGATTGTG 823
|||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 586 GTTGGACCTCCTGTTGTTGGCCTTGAAGAGTATAGCTTATGTGGTGATATCAGGATTGTG 645
Query 824 AAGCCACCTCTTGTATTGGAGAGCTTAGCACTTTTCAGTAGCGCCAGGGCTAATGCTTGT 883
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 646 AAGCCACCTCTTGTGTTGGAGAGCTTAGCACTATTCAGTAGCGCCAGGGCTAATGCTTGT 705
Query 884 ATTTGGAAAGGAAAATGGATGTATGAAGTCGCTTTAGAGACCTCGGGAATTCAACAACTT 943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 706 ATTTGGAAAGGAAAATGGATGTATGAAGTCGCTTTAGAGACCTCGGGAATTCAACAACTT 765
Query 944 GGATGGGCAACACTTGCTTGCCCTTTCACTGACCAGAAAGGTGTGGGTGATGCTGATGAT 1003
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 766 GGATGGGCAACACTTGCTTGTCCTTTCACTGACCAGAAAGGTGTGGGTGATGCTGATGAT 825
Query 1004 TCATATGCTTTTGATGGTCGAAGGGTAAGCAAATGGAACAAGGAAGCTGAACCTTATGGT 1063
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 826 TCATATGCTTTTGATGGTCGAAGGGTAAGCAAATGGAACAAGGAGGCTGAACCTTATGGT 885
Query 1064 CAATCATGGGTTGCTGGGGATGTCATCGGTTGCTGCATAGATTTGAACTGTGATGAGATT 1123
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 886 CAATCATGGGTAGCTGGGGATGTCATCGGTTGCTGCATAGATTTGAACTGTGATGAGATA 945
Query 1124 TACTTCTACAGGAATGGTGTCTCCCTCGGGGCTGCATTTACTGGTATTAGAAAACTTGGA 1183
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 946 TACTTCTACAGGAATGGTGTCTCCCTCGGTGCTGCATTTACTGGTATTAGAAAACTTGGA 1005
Query 1184 CCTGGATTTGGGTATTACCCTGCTATATCTCTCTCCCAAGGTGAGAGATGCGAGTTAAAT 1243
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1006 CCTGGATTTGGGTATTACCCTGCTATATCTCTCTCCCAAGGTGAGAGATGCGAGTTAAAT 1065
Query 1244 TTCGGCGCTTACCCGTTTAAGTACCCTGTTGACGGTTTCCAACCTCTTCAAGAAGCTCCA 1303
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1066 TTCGGCGCTTACCCGTTTAAGTACCCTGTTGAAGGCTTCCAACCTCTTCAAGAAGCTCCA 1125
Query 1304 ACTCGATTTTCATTTGCAACAGAGCTACTACGATGCTTCTCAAGACTGCTGGATAGGCCA 1363
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1126 CCTCGATTTTCTTTTGCAACAGAGCTACTACGATGCTTCTCAAGACTGCTGGATAGGCCA 1185
Query 1364 GACCGCTCATTGGCTGATACATTAAGTCGACTGAGGAGATTTGCCTCAGTCGAAGAACTC 1423
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 1186 GACCGCTCGTTGGCTGATACATTAAGTCGACTGAGGAGATTTGCCTCGGTTGAAGAACTC 1245
Query 1424 TTTTGCCCTGTTTCGTCTGCCATATGTGATGAGTTCTTTTATATACTTGAGCAAGACCCT 1483
|||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 1246 TTTTCCCCTGTTTCCTCTGCCATATGTGATGAGTTCTTTTACATACTTGAACAAGACCCT 1305
Query 1484 TTGTTGGCGGAGTACTTAGGACGGGGTGCATTTCTGTCATTCCTCTTGGAGACTTTCAGA 1543
|||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1306 TTGTTGCCTGAGTACTTGGGACGGGGTGCATTTCTGTCATTCCTCTTGGAGATTTTCAGA 1365
Query 1544 ACTCAAGCACCGCATGATTCGTCAAGTTTAGACAAAGTTCTTGATGTGTTTCTTGAGTTC 1603
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1366 TCCCAAGCACCGCATGATTCGTCAAGTTTAGACAAAGTTCTTGATGTGCTTCTTGAGTTC 1425
Query 1604 CCACAATCTCATTTGATCTTTGAGCATGTAGTAAACGCTCTGGCTTGTGGCTGCAAAACA 1663
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1426 CCACAATCTCATTTGATCTTTGAGCATGTAGTAAACGCTCTGGCTTGTGGCTGCAAAACA 1485
Query 1664 GCGACACTGATTTTAACCGAGTGTCCATACTCCGGACCTTATCCCTATCTGGCGCTGGCT 1723
|||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1486 GCGACACTGATTCTAACCGAATGTCCATACTCCGGACCTTATCCCTATCTTGCGCTGGCT 1545
Query 1724 TGTCATTTGTTTAAACGGGAAGAATTGATGGTACAATGGTGGAGATCTTTGCATTTCGAG 1783
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546 TGTCATTTGTTAAAACGGGAAGAATTGATGGTACAATGGTGGAGATCTTTGCATTTCGAG 1605
Query 1784 TTTTTGTTTGAAGGTTTCTTGTCATGCAGGAGTTCCAACAAGCATGACTTACAGCACTTA 1843
||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1606 TTTTTGTTTGAAGCTTTCTTGTCATGTAGGAGTTCCAACAAGCATGACTTACAGCAGTTA 1665
Query 1844 ATGCCTGTTGTTTGGTGGCCTGGATCCTCTGAAGATATATCCTACGAGAGTAGCATGGGA 1903
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1666 ATGCCTGTTGTTTGGTGGCCTGGATCCTCTGAAGATATATCCCACGAGAGTAGCATGGGA 1725
Query 1904 TTTACGATCTCCGCTCTCTCTGAAGCCATTAACAAGATTGAGGAGAAGCAGAGGAACCTC 1963
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1726 TTTACGATCTCCGCTCTCTCTGAAGCCATTAACAAGATTGAGGAGAAGCAGAGGAACCTC 1785
Query 1964 TGTCTCTTGGTCATACAATTCATACCACCTGTATCACCTCCCCAGCTTCCTGGTTCAGCT 2023
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1786 TGTCTCTTGGTCATACAATTCATACCACCTGTAACACCTCCCCAGCTTCCTGGTTCAGCG 1845
Query 2024 TTCAGGGGATTCCTACAGAACCTTTTATTGAAGAACAGAGGCGCAGATAGGACTCTGGCC 2083
||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1846 TTCCGCGGATTCCTACAGAACCTTTTATTGAAGAACAGAGGCGCAGATAGGACTCTGGCC 1905
Query 2084 CCTTCTGGAGTTACACGCAATTCGGTTCTTGTCTCTTTGTTCTCAGTTATACTCCACTTC 2143
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1906 CCTTCTGGAGTTACACGCAATTCAGTTCTTGTCTCTCTGTTCTCAGTTATACTCCATTTT 1965
Query 2144 TTGTCAGAAGGTTTTGCAATGCTGAAGAGTAGTGAAGCCGTCCATCACAATGTTGGTTTT 2203
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1966 TTGTCAGAAGGTTTCGCAATGCTGAAGAGTAGTGAAGCCGTCCATCACAATGTTGGTTTT 2025
Query 2204 CTTCACAGAGGTGGTCAGCAGAAGTTTCCATTGAGTTTGTTTCTTAAAAATGATCCACAT 2263
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2026 CTTCACAGAGGTGGACAGCAGAAGTTTCCATTGAGTTTGTTTCTTAAAAATGATCCACAT 2085
Query 2264 CGCGCTGATATTACTAGGCTTGGCGGGCTATTTAGTCATATATCGAAGTCCTACCCCACA 2323
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2086 CGAGCTGATATCACTAGGCTTGGCGGGCTATTTAGTCATATATCGAAGTCCTACCCCACA 2145
Query 2324 GATGATCAAGAAGAAGAAATAATGCGGTGGGAAGAAGGTTGTATGGATGATGAACAGAAT 2383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2146 GATGATCAAGAAGAAGAAATAATGCGGTGGGAAGAAGGTTGTATGGATGATGAACAGAAT 2205
Query 2384 AGAGTAACTCACGCGACTGAGCAAAAGCCATGCTGTTGCTTAGCTTATGATACCGATCTT 2443
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2206 AGAGTAACTCACGCGACTGATCAGAAGCCATGCTGTTGCTTAGCTTATGATACCGATCTT 2265
Query 2444 ACTAAATCCTTGAAGGATCGAGGAAAAAATACTGCTCAAAGTTCTCGTGGTCGATGCAGT 2503
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2266 ACTAAATCCTTGAAGGATCGAGGAAAAAATACTGCTCAAAGTTCTCGTGGTCGATGCAGT 2325
Query 2504 TCCATTCCTGAGAGATCCTCTCATGTTGCTGCAGAATGTAGTGCTGGAAGTTTCAGTGAA 2563
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2326 TCCATTCCTGAGAGATCCTCTCAAGTTGCTGCAGAATGTAGTGCTGGAAGTTTCAGTGAA 2385
Query 2564 GAAATAGACGACAAACCTAGCACAAGTAATCAGTCTGACCCTGACTTTGGTTATCGTCCA 2623
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2386 GAAATAGAGGACAAACCTAGCACAAGTAATCAGTCTGACCCTGACTTTGGTTATCGTCCA 2445
Query 2624 GTAAGATTTATGCGGACTGCACTTCAAGAGAGTAGAATCTCATCTGCTATACTAAGCGAA 2683
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2446 GTAAGATTTATGCGGACTGCACTTCAAGAGAGTAGAATCTCATCTGCTATACTAAGCGAA 2505
Query 2684 GAAGAACTATTGGATGCTCTATTGCTATTATACCATATTGCTGTTGCTCCAAATTTTAAG 2743
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2506 GAAGAACTATTGGATGCTCTATTGCTATTATACCATATTGCTGTTGCTCCAAATTTTAAG 2565
Query 2744 CAGGCATCATATTACATGTCTCACCAATCGCAATCAATATCACTTCTTGAAGAAACTGAT 2803
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2566 CAGGCATCATATTACATGTCTCACCAAACGCAATCAATATCACTTCTTGAAGAAACTGAT 2625
Query 2804 AAACAGATAAGAGAACGGGCTTCTTGTGACCAAATAAAGCGCTTGAAGGAAGCTCGCAAC 2863
|||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2626 AAACAGATAAGAGAGCGGGCTTCTAGTGACCAATTAAAGCGCTTGAAGGAAGCTCGCAAC 2685
Query 2864 AACTACAAAGAAGACGTGATGGACTGTGTTAGACATTCCGCATGGTTCCGCATCTCATTG 2923
|||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2686 AACTACAAGGAAGACGTGATGGAGTGTGTTAGACATTCCGCATGGTTCCGCATCTCATTG 2745
Query 2924 TTCTCTCGATGGAAGCAAAGGGGAATGTATGCATTGTGCATGTGGGTTGTACAGCTACTT 2983
||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2746 CTCTCTCGATGGAAGCAAAGAGGAATGTACGCATTGTGCATGTGGGTTGTACAGCTACTT 2805
Query 2984 CTGGTTCTCAGCAAAATGGATTCTGTGTTTGTTTATATTCCAGAGTTCTACCTTGAATCT 3043
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2806 CTGGTTCTCAGCAAAATGGATTCTGTGTTTGTTTATATTCCAGAGTTCTACGTTGAATCT 2865
Query 3044 TTGGTAGACTGTTTCCATGTGCTTCGCAAGAGCGATCCTCCGTTTGTCCCATCAACAACA 3103
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2866 TTGGTAGACTGTTTCCATGTGCTCCGCAAGAGCGATCCTCCGTTTGTCCCCTCAACAACA 2925
Query 3104 TTCATCAAACAAGGACTTTCATCATTTATCACTTTCGTAGTTACACACTTCAACGATTCA 3163
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2926 TTTATCAAACAAGGACTTTCATCATTTATCACTTTCGTAGTTACACACTTCAATGATTCA 2985
Query 3164 AGGATATCGAATACAGATCTTAAAGATCTACTTCTCCAGTCAATATCCGTCCTGGTACAG 3223
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2986 AGGATATCGAATACAGATCTTAAAGATTTACTTCTCCAGTCAATATCCGTCCTGGTACAG 3045
Query 3224 TACAAAGAGTACTTGGAAGCTTTCGAGAACAATGAGGCAGCTACTCGACACATGCCTGCA 3283
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3046 TACAAAGAGTACTTGGAAGCTTTCGAGAACAATGAGGCAGCTACTAAACACATGCCTGCA 3105
Query 3284 GCACTACTGGCAGCGTTTGACAACAGATCTTGGATCCCTGTCACAAATATATTTCTTCGT 3343
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3106 GCACTACTGGCAGCGTTTGACAACAGATCTTGGATCCCTGTCACAAATATATTTCTTCGT 3165
Query 3344 CTTTGCAAAGGTTCTGGGTTTAGTTCTTTAAAGAACGGAGAGTCTTCGTTTTCGTCTACT 3403
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||
Sbjct 3166 CTTTGCAAAGGTTCTGGCTTTAGTTCTTTAAAGAACGGGGAGTCTTCGGTTTCATCTACT 3225
Query 3404 GTTTTCCAGGCGCTTCTACGAGATGCTTGTATCAATGATGGTGAATTACTTTCTACTTTT 3463
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3226 GTTTTCCAGGTGCTTCTACGAGATGCTTGTATCAATGATGGTGAATTACTGTCTACTTTT 3285
Query 3464 CTTAACCGTCTATTCAACACACTGAGCTGGACCATCACTGAATTTTCTGTCTCGGTGCGA 3523
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3286 CTTAACCGGCTATTCAACACACTGAGCTGGACCATTACTGAATTTTCTGTCTCGGTGCGA 3345
Query 3524 GAAATGCAAGAAAAGTATCAGGTAATGGAGTTTCAGCAAAGGAAATGTTGTGTGATATTT 3583
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3346 GAAATGCAAGAAAAGTATCAGGTAATGGAGTTTCAACAAAGGAAATGTTGTGTGATATTT 3405
Query 3584 GAGCTTTCAAGCAATCTCGCAAGGGTCTTAGAATTCTGCACTTACGCAATGCCACAAGCA 3643
||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3406 GAGCTTTCAAGCAATCTCGCAAGAGTCTTAGAGTTCTGCACTTACGCAATACCACAAGCA 3465
Query 3644 TTTCTTGCTGGGACTGACACGAATCTTCGTAGGCTCACTGAGTTGATTCTTTTCATCTTG 3703
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3466 TTTCTTGCTGGGACTGACACGAATCTTCGTAGGCTCACTGAGTTGATTCTTTTTATCTTG 3525
Query 3704 AATCACATGACCTCAGCAGTAGATGACGAGTTCTTTGATCTATCTGTCAGGTCACTTAGA 3763
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||
Sbjct 3526 AATCACATGACCTCAGCAGTAGATGACGAGTTCTTTGATCT----GTCA---C--TTAGA 3576
Query 3764 CGGCAGGGACAACCTTCAGAGAAAGTTAGCCGAGGGATCTTATTAGCTCCTTTGGTTGGT 3823
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3577 CGGCAAGGACAACCTTCAGAGAAAGTTAGCCGAGGGGTCTTATTAGCTCCTTTGGTGGGT 3636
Query 3824 ATAATCTTGAATCTCTTGGAGGCTAGTGAAGACTCAAAACCAAAGCAACAACATGATGTA 3883
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 3637 ATAATCTTGAATCTTTTGGAGGCTAGTGAAGACTCAAAACCGAAGCAACA---TGATGTA 3693
Query 3884 ATTGGTCTTTTCGCAAGCATGGACTGTCCCGATACAGTCTATTACGGGTTTCAGTATCTC 3943
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 3694 ATTGGTCTTTTTGCAAGCATGGACTGTCCCGATACAGTGTATTACGGGTTTCAATATCTC 3753
Query 3944 TTGGAATATAATTGGGACGGTTGTGTAAGCGGGGATGATGCCTATGTAAAGAAACTTGGA 4003
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3754 TTGGAATATAATTGGGACGGTTGTGTAAGCGGGGATGATGCGTATGTAAAGAAACTTGGA 3813
Query 4004 CAGCTTGAGAACTTCTTGAGCCATCTCATAAACCGGGCTTCATCGCAAGAACCCGAAAGA 4063
|| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||
Sbjct 3814 CAACTTGAGAACTTCTTGAACAATCTCATAAACCGGGCGTCATCGCAAGAACCCGAAGGA 3873
Query 4064 AAAGAAGAG-TCATTCAACAAAGACACGACAGATATAGAAGACAACACTTGCTGTATCTG 4122
||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3874 AAAGAAGAGCTG-TTCAACAAAGACATGACGGATATAGAAGACAACACTTGCTGTATCTG 3932
Query 4123 CTACGCGGGGGAGGCTAATGCAATGATTGCTCCGTGTTCACATCGATCATGTTATGGCTG 4182
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3933 CTACGCGGGGGAGGCTAATGCAATGATTGCTCCATGTTCACATCGATCATGTTATGGCTG 3992
Query 4183 CATAACTAGACATCTTCTCAACTGTCAGAGATGTTTTTTCTGCAATGCTACGGTGATAGA 4242
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3993 CATAACTAGACATCTTCTCAATTGTCAGAGATGTTTTTTCTGCAATGCTACGGTGATAGA 4052
Query 4243 TGTTATAAGAGATAaagaagaagaagaagaagaagaCGATGATGGTCACAAAAGAAGCAC 4302
||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4053 CGTTATAAGAGACAAAGAAGTAGAAGA---------CGATGATGATCACAAAAGAAGCAC 4103
Query 4303 ATGAAGCTCGGGTTAGTTGCGGTTACAGGTTGTTGATGTAGTAGACACAGAAGGAAAGAT 4362
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 4104 CTGAAGCTCGGGTTAGTTGCGGTTACA------------------CA--GAAGGAAAGAT 4143
Query 4363 CTTTAGGATGGG-AGCAAAGGAAGAAGGATTATATAGATTTATAGGATAAATAAGAAA-A 4420
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |
Sbjct 4144 CTTTAGGATGGGGAGCAAAGGAAGAAGGATTATAGATTTTTATAGGATAAATAAGAAACA 4203
Query 4421 AACACAAACAAACAAAGGTCTGTGATAATTTTGTAG-ACCTGGTCTTGTGATCTCTAGGC 4479
|| | ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |
Sbjct 4204 AAAAGAAA-AA-CAAAGGTCTGTGATAATTTTGTAGGACCTGGTCTTGTG-T-T-T---- 4254
Query 4480 CTCTCTTTTTTCTTGTATATATGAGAATGAAATGGAAATTATTTAAAGGCTC 4531
| | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 4255 -T-T-T-----CTTGTATATATGAGAATGAAATGGAAATGAATTAAAGGCTC 4298
> Ahg481064 jgi|Araly1|481064|fgenesh2_kg.4__124__AT2G22000.1
Length=596
Score = 143 bits (77), Expect = 1e-32
Identities = 90/96 (94%), Gaps = 2/96 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 5049 AGAAGGTAAACATGAAAACTATTTTACAAAAGAGTCTTACCAATTTTGTCTTATTTCAGA 5108
||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 596 AGAAGGTAAACATGAAATCTATGTTACAAAAGAGTCTTACCAATTTTGTCTTATTTCAGA 537
Query 5109 TAAATTAAGAAGaaaaaaaaaGCAAA-CCGCTCACA 5143
||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 536 TAAATAAAGAA-AAAAAAAAAGCAAAACCGCTGACA 502
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 194702543468
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5