BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G22125.1
Length=6941
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg932155 jgi|Araly1|932155|scaffold_400143.1 1.127e+04 0.0
> Ahg932155 jgi|Araly1|932155|scaffold_400143.1
Length=6617
Score = 1.127e+04 bits (6102), Expect = 0.0
Identities = 6448/6617 (97%), Gaps = 15/6617 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 176 TTTAAGTGAAGTGAAGATATGACAAGTGCTCTTGGATGGAGATTTCCTTCCACTAATGGA 235
||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3 TTTAAGTGAAGTGAAGATATGGCAAGTGCACTTGGATGGAGATTTTCTTCCACTAATGGA 62
Query 236 AATGGCCTTGCCCCAAGTGACACGGAGAGAAATGGGGATATGAAGATGCATGATTCAGAG 295
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 63 AATGGCCTTGCCCCAAGCGACACGGAGAGAAATGGTGATATGAAGATGCAAGATTCAGAG 122
Query 296 CCCCCAACTCCACATTCAACCACAAAGATGAGTTTGAGAGACCGGACAACCAGCATGGAA 355
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 123 CCCCCAACTCCACATTCAAGCACAAAGATGAGTTTGAGAGACCGGACAACCAGCATGGAA 182
Query 356 GATCCAGATGGGACATTAGCAAGTGTTGCCCAATGCATTGAGCAGCTGCGCCAAGGTTCA 415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 183 GATCCAGATGGGACATTAGCAAGTGTTGCCCAATGCATTGAGCAGCTGCGCCAAGGTTCA 242
Query 416 TCATCTGCACAAGAAAGAGAATATTGTCTGAAGCAGTTACTGGACCTTATAGAAATGCGT 475
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 243 TCATCTGCACAAGAAAGAGAATATTGCCTGAAGCAGTTACTGGACCTTATAGAAATGCGT 302
Query 476 GAGAATGCATTCAGTGCTGTCGGATCACACTCCCAAGCTGTGCCAGTACTTGTCTCTCTT 535
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 303 GAAAATGCATTCAGCGCTGTCGGATCACACTCCCAAGCTGTGCCAGTACTTGTCTCTCTT 362
Query 536 CTCCGATC-GGGATCAGTTGGAGTGAAGATACAAGCTGCAACCGTCTTGGGTTCACTCTG 594
|||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 363 CTCCGATCAGGG-TCAGTTGGAGTGAAGATACAAGCTGCAACCGTCTTGGGTTCACTCTG 421
Query 595 CAAGGAGAACGAACTTAGAGTTAAGGTGTTACTTGGGGGATGCATTCCTCCATTGCTTGG 654
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 422 CAAGGAGAACGAACTTAGAGTTAAGGTGTTACTTGGGGGATGCATTCCCCCACTGCTTGG 481
Query 655 TCTTCTCAAGTCCAGTTCAGTCGAAGGGCAGATCGCTGCAGCAAAGACAATCTATGCTGT 714
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 482 TCTTCTCAAGTCCAGTTCAGTCGAAGGGCAGATCGCTGCAGCAAAGACAATCTATGCTGT 541
Query 715 TTCTGAAGGTGGGGTTAAAGACCATGTTGGATCAAAAATATTTTCCACTGAGGGAGTTGT 774
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 542 TTCTGAAGGCGGGGTGAAAGACCATGTTGGATCAAAAATATTTTCCACTGAGGGAGTTGT 601
Query 775 ACCGGTTCTGTGGGACCAATTGCGCAGTGGAAATAAAAAAGGAGAGGTTGATGGTTTGTT 834
||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 602 ACCAGTTCTGTGGGACCAATTGCGTAGTGGAAATAAGAAAGGAGAGGTTGATGGTTTGTT 661
Query 835 AACTGGTGCACTTAAGAACCTTTCTAGTACCACAGAGGGATTTTGGTCTGAGACAATTCG 894
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 662 AACTGGTGCACTTAAGAACCTTTCTAGTACCACTGAGGGATTTTGGTCTGAGACAATTCG 721
Query 895 AGCTGGGGGAGTGGATGTACTTGTGAAGCTGCTCACAAGCGGGCAGTCAAGTACACTATC 954
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 722 AGCTGGGGGAGTGGATGTACTTGTGAAGCTGCTTACAAGCGGGCAGTCAAGTACACTATC 781
Query 955 TAATGTCTGCTTCCTTCTTGCGTGTATGATGATGGAAGACGCCTCTGTTTGTTCCAGTGT 1014
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 782 TAATGTCTGCTTCCTTCTTGCATGTATGATGATGGAAGACGCCTCTGTTTGTTCCAGTGT 841
Query 1015 ATTGACTGCAGACATTACAAAACAGCTTCTCAAATTATTAGGATCGGGTAATGAAGCCCC 1074
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 842 ATTGACTGCAGACATTACAAAACAGCTTCTCAAGTTATTAGGATCGGGTAATGAAGCCCC 901
Query 1075 AGTGAGGGCAGAGGCTGCTGCTGCTCTCAAGTCGCTTTCTGCTCAATCTAAGGAAGCAAA 1134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 902 AGTGAGGGCAGAGGCTGCTGCTGCTCTCAAGTCGCTTTCTGCTCAATCTAAGGAAGCAAA 961
Query 1135 GCGGGAAATCGCTAATTCTAATGGTATTCCTGTTTTAATAAATGCAACAATAGCTCCATC 1194
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 GCGAGAAATCGCTAATTCGAATGGTATTCCTGTTTTAATAAATGCAACAATAGCTCCATC 1021
Query 1195 TAAAGAATTCATGCAAGGTGAATATGCGCAAGCATTACAAGAAAATGCAATGTGTGCCCT 1254
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1022 TAAAGAATTTATGCAAGGTGAATATGCGCAAGCATTACAAGAAAATGCAATGTGTGCCCT 1081
Query 1255 TGCTAATATTTCCGGTGGTTTGTCATATGTCATATCAAGCCTTGGTCAGAGCCTTGAATC 1314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1082 TGCTAATATTTCCGGTGGTTTGTCATATGTCATATCAAGCCTTGGTCAGAGCCTTGAATC 1141
Query 1315 TTGCTCTTCGCCTGCTCAGACTGCCGACACCCTTGGGGCTTTAGCTTCAGCATTGATGAT 1374
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1142 TTGCTCTTCGCCTGCTCAGACTGCCGACACCCTTGGGGCTTTAGCTTCAGCATTGATGAT 1201
Query 1375 ATATGATGGCAAGGCAGAAACTACAAGAGCATCAGATCCATTGGTCGTTGAACAGACTCT 1434
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1202 ATATGATGGCAAGGCAGAAACTACAAGAGCATCAGATCCATTGGTCGTTGAGCAGACTCT 1261
Query 1435 GCTGAAGCAGTTTAAGCCTCGTCTACCATTCTTGGTGCAAGAACGTACAATTGAAGCACT 1494
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1262 GCTGAAGCAGTTTAAGCCTCGTCTACCATTCCTGGTGCAAGAACGTACAATTGAAGCACT 1321
Query 1495 TGCAAGTTTGTATGGGAATTCCATACTCTCTGTCAAACTTTCCAACTCGGATGCAAAACG 1554
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1322 TGCAAGTTTGTATGGGAACTCCATACTCTCTGTCAAACTTTCCAACTCGGATGCAAAACG 1381
Query 1555 TTTGCTTGTTGGTCTAATAACGATGGCGGTGAATGAGGTTCAAGATGAGCTTGTAAAGGC 1614
|||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1382 TTTGCTTGTTGGTCAAATAACAATGGCGGTGAATGAGGTTCAAGATGAGCTTGTAAAGGC 1441
Query 1615 TCTTCTGATGCTGTGTAACCATGAAGGTAGCCTGTGGCAAGCACTACAGGGCCGTGAAGG 1674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1442 TCTTCTGATGCTGTGTAACCATGAAGGTAGCCTGTGGCAAGCACTACAGGGCCGTGAAGG 1501
Query 1675 GATCCAATTGCTAATATCTCTTTTGGGTCTTTCATCCGAACAGCAGCAAGAATGTGCTGT 1734
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1502 GATCCAATTGCTAATATCTCTTCTGGGTCTTTCATCCGAACAGCAGCAAGAATGTGCTGT 1561
Query 1735 TGCACTTCTTTGCCTTTTGTCTAACGAAAATGATGAAAGCAAGTGGGCCATCACTGCTGC 1794
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1562 TGCACTTCTTTGCCTCTTGTCTAACGAAAATGATGAAAGCAAGTGGGCCATCACTGCTGC 1621
Query 1795 TGGAGGTATACCTCCACTTGTTCAAATTCTAGAGACTGGGTCGGCCAAAGCCAGGGAAGA 1854
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1622 TGGAGGTATACCTCCACTTGTTCAAATTCTAGAGACTGGGTCGGCCAAAGCCAGGGAAGA 1681
Query 1855 CTCTGCAACTATCCTTAGGAACTTGTGCAATCATAGCGAAGATATACGTGCTTGTGTTGA 1914
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1682 CTCTGCAACCATCCTTAGGAACTTGTGCAATCATAGCGAAGATATACGTGCTTGTGTTGA 1741
Query 1915 AAGTGCGGATGCTGTCCCTGCTCTCTTATGGCTACTAAAGAATGGTAGTCCAAATGGTAA 1974
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1742 AAGTGCTGATGCTGTCCCTGCTCTCTTATGGCTACTGAAGAATGGTAGTCCAAATGGTAA 1801
Query 1975 AGAAATTGCCGCCAAGACATTGAATCATTTGATTCATAAATCAGATACTGCAACTATCAG 2034
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1802 AGAAATTGCCGCCAAGACATTGAATCATTTGATTCATAAATCAGATACTGCAACAATCAG 1861
Query 2035 TCAGCTTACTGCTTTGCTGACCAGTGATCTACCTGAGTCTAAAATTTACGTTTTGGATGC 2094
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1862 TCAGCTTACTGCTTTGCTGACCAGTGATCTACCTGAGTCTAAAATTTACGTTTTGGATGC 1921
Query 2095 ATTGAAGAGTATGCTTTCTGTGGTCCCATTCAATGACATGCTACGTGAAGGCAGTGCTTC 2154
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1922 ATTGAAGAGTATGCTTTCTGTGGTCCCATTCAATGACATGTTACGTGAAGGCAGTGCTTC 1981
Query 2155 CAATGATGCTATTGAGACAATGATCAAGTTGATGAGCTCTGGTAAAGAAGAAACTCAAGC 2214
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1982 GAATGATGCTATTGAGACCATGATCAAGTTGATGAGCTCTGCTAAAGAAGAAACTCAAGC 2041
Query 2215 AAATTCAGCATCAGCTCTTGCAGCTATCTTCCAGAGCAGAAAGGATTTGCGTGAGAGTGC 2274
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2042 AAATTCAGCCTCAGCTCTTGCAGCTATCTTCCAGAGCAGAAAGGATTTGCGTGAGAGCGC 2101
Query 2275 TCTAGCCCTCAAAACTCTCTTGTCGGCCATAAAACTGTTAAATGTGGATTCGGAGAGGAT 2334
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2102 TCTAGCCCTCAAAACTCTCTTGTCGGCCATAAAACTGTTAAATGTGGATTCGGAGAAGAT 2161
Query 2335 CCTTGTTGAGTCTTGCCGCTGCCTGGCTGCAATTTTACTTTCAATTAAGGAGAATCGCGA 2394
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2162 CCTTGTTGAGTCTTGCCGCTGTGTGGCTGCAATTTTACTTTCGATTAAGGAGAATCGCGA 2221
Query 2395 TGTGGCCATTTCTGCCAGAGAAGCATTGCCTACCATAGTATCTCTAGCCAACTCTTCTGT 2454
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||
Sbjct 2222 TGTGGCCATTTCTGCCAGAGAAGCATTGCCTACCATTGTTTCTCTAGCCAACTCTTCCGT 2281
Query 2455 TCTAGAAGTTGCTGAGCAAGGAATGTGCGCTTTGGCTAATCTTATATTGGACAGTGAAGT 2514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2282 TCTAGAAGTTGCTGAGCAAGGAATGTGCGCTTTGGCTAATCTTATATTGGACAGTGAAGT 2341
Query 2515 GTCAGAGAAGGTCATTGTCGAAGATATCATCTTGTCCGCCACTAGAATCTTACGTGAAGG 2574
||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2342 GTCAGAGAAGGTCATTGTCGAAGATATTATTTTGTCAGCCACTAGAATCTTACGTGAAGG 2401
Query 2575 TACAGTGTCTGGGAAGACACTTGCTGCTGCGGCAATTGCCCGCCTCCTTAGTCGTCGCCG 2634
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2402 TACAGTGTCTGGGAAGACTCTTGCTGCTGCGGCAATTGCCCGCCTGCTTAGTCGTCGCCG 2461
Query 2635 AATTGATTCTGCATTGACAGATTCTGTGAACCGAGCTGGAACAGTGCTTACCTTAGTGTC 2694
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2462 AATTGATTCTGCATTGACAGATTCTGTGAACCGTGCTGGAACAGTGCTTGCCTTAGTGTC 2521
Query 2695 TCTTCTAGAATCTGCCGATGGAAGATCTGATGCAATATCAGAGGCCCTAGATGCGCTTGC 2754
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2522 TCTTCTAGAATCTGCCGACGGAAGATCTGATGCAATATCAGAGGCCCTCGATGCGCTTGC 2581
Query 2755 TATATTCTCAAGGTCAGGAGCTAATGGAAATGTAAAACCAGCTTGGGCTGTTTTGGCTGA 2814
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2582 TATATTCTCAAGGTCAGGAGTTAATGGAAATGTAAAACCAGCTTGGGTTGTTTTGGCTGA 2641
Query 2815 ATCTCCCAACAGTATGGCCCCAATAGTCTCATCTATAGTGAGTGTTGCTAATCCTTCACT 2874
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2642 ATCTCCTAACAGTATGGCCCCAATAGTCTCATCTATAGTGAGTGTTGCTAATCCTTCACT 2701
Query 2875 ACAGGACAAAGCTATTGAAGTTTTGTCAAGACTTTGCCGAGATCAGCCTATTGTTTTGGG 2934
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2702 ACAGGACAAAGCTATTGAAGTATTGTCAAGACTTTGCCGAGATCAGCCTATGGTTTTGGG 2761
Query 2935 AAACATGGTCAACAATGCCAGAGATTGCGTGTCATCTATAGCTAAAAGGGTGATAAATAC 2994
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2762 AAACATGGTCAACAATGCCAGAGATTGTGTGTCATCTATAGCTAAAAGGGTGATAAGTAC 2821
Query 2995 CAGGGACCCGAAAATAAAAATTGGTGGAGCTGCTATTATTATCTGTGCTGCCAAAGTTGA 3054
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2822 CAGGGACCCGAAAATAAAAATTGGTGGAGCTGCTATTATTATCTGTGCTGCCAAAGTTAA 2881
Query 3055 CGACCAGAAGATGATAGAAAATCTGAATGAGACACAATTGTGTGCCAAATTCGTTCAAGC 3114
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2882 CGACCAGAAGATGATAGAAAATCTGAATGAGACACAATTGTGTGCCAAATTTGTTCAAGC 2941
Query 3115 ACTTGTG-GG------GA-TC--CT-AGA-TTCTGTGCAAGATCAGGAAAAGGATGAGAA 3162
||||||| || || || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2942 ACTTGTGCGGATTCTAGATTCATCTCAGATTTCTGTGCAAGATCAGGAAAAGGATGAGAA 3001
Query 3163 AGATAAAATCTGCATATGCATTCATCCCAaagaaaaggaagaagatgaagaagaagaGGC 3222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3002 AGATAAAATCTGCATATGCATTCATCCCAAAGAAAAGGAAGAAGATGAAGAAGAAGAGGC 3061
Query 3223 AACAGAAAATAGGGAGGGTTCCACGGGGGCAACAGTTATTTCTGGAGACAATTTAGCCAT 3282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3062 AACAGAAAATAGGGAGGGTTCCACGGGGGCAACAGTTATTTCTGGTGACAATTTAGCCAT 3121
Query 3283 CTGGTTGCTCTCGGTTCTTTCTTGTCATGATGAAAAGAGCAGAGCAGTAATATTGGAGTC 3342
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3122 CTGGTTGCTCTCGGTTCTTTCTTGTCATGATGAAAAGAGCAGAGCAGTTATATTGGAGTC 3181
Query 3343 AGAAGGCATTGAGTTGATTACTGACAGAATAGGCAACCGTTTTCTCCAGGCTGATAATGG 3402
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3182 AGAAGGCATCGAGTTGATTACTGACAGAATAGGCAACCGTTTTCTCCAGGCTGATAATGG 3241
Query 3403 AGAAGATGCCAACATTTGGGTTTGTGCTTTATTGCTGGCCATACTTTTCCAAGACAGAGA 3462
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3242 AGAAGACGCCAACATTTGGGTTTGTGCTTTATTGCTAGCCATACTTTTCCAGGACAGAGA 3301
Query 3463 AATCACTCGCGCACATGCAACAATGAAGGCTGTTCCAGTGCTCTCAAATCTTGTGAAGTC 3522
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3302 AATCACTCGCGCACATGCAACAATGAAGGCTGTTCCAGTGCTCTCAAATCTTGTGAAGTC 3361
Query 3523 AGAGGAATACGCAGACAGATATTTTGCAGCACAAGCTCTAGCTAGTCTTGTCTGTAACGG 3582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3362 AGAGGAATACGCAGACAGATATTTTGCAGCACAAGCTCTAGCTAGTCTTGTCTGTAACGG 3421
Query 3583 TAGTCGCGGAACTCTTCTATCTGTTGCAAACTCCGGTGCTGCGGCTGGGTTTATATCATT 3642
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3422 TAGTCGGGGAACTCTTCTATCTGTTGCAAACTCCGGTGCTGCGGCTGGGTTTATATCATT 3481
Query 3643 GCTTGGTTGTTCTGATGATGACATAAAAGAACTTCTGCAGCTGTCGCAGGAGTTCACTTT 3702
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3482 GCTTGGTTGTTCTGATGATGACATAAAAGAACTTCTGCAGCTGTCGCAGGAGTTTGCTTT 3541
Query 3703 AGTGCGGTACCCAGACCAGGTTGCCCTTGAAAGGCTTTTCCGAGTTGAAGATATTAGAGT 3762
|||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3542 AGTGCGATACCCGGACCAGGTTGCCCTTGAAAGGCTTTTCCGTGTTGAAGATATTAGAGT 3601
Query 3763 TGGGGCTACTTCTCGAAAGGCGATTCCCTTACTAGTTGAACTTCTTAAACCAATTCCAGA 3822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3602 TGGGGCTACTTCTCGAAAGGCGATTCCCTTACTAGTTGAACTTCTTAAACCAATTCCAGA 3661
Query 3823 CCGCCCCGGTGCTCCTCTACTTTCACTTAATCTTCTAACTCAGCTTGCTGGGGACTGTCC 3882
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3662 CCGCCCCGGTGCTCCTCTACTTTCACTTAATCTTCTAACTCAGCTTGCTGGAGACTGTCC 3721
Query 3883 ACAAAATATGATTGTCATGGTAGAGTCAGGTGCTCTTGAGGGTCTCTCGAAATATCTTTC 3942
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3722 ACAAAATATGATTGTCATGGTAGAGTCAGGTGCTCTTGAGGGCCTCTCGAAATATCTTTC 3781
Query 3943 CCTTGGACCTCAGGACGAGCAAGAGGAAGCTGCAACAGGTCTTTTAGGCATCTTATTTAG 4002
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3782 CCTTGGACCTCAGGACGAGCAAGAGGAAGCTGCAACTGGTCTTTTAGGCATCTTATTTAG 3841
Query 4003 CAGTGCTGAAATTCGAAGGCATGAGTCAGCATTTGGCGCGGTCAGCCAACTTGTAGCTGT 4062
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 3842 CAGTGCTGAAATTCGAAGGCATGAGTCAGCATTTGGCGCCGTCAGCCAACTTGTAGCAGT 3901
Query 4063 TTTGCGTCTAGGTGGAAGGGGGGCAAGGTACAGTGCCGCCAAGGCATTGGATAGTCTCTT 4122
||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3902 TTTGCGTCTTGGTGGAAGAGGAGCAAGGTACAGTGCCGCCAAGGCATTGGATAGTCTCTT 3961
Query 4123 TACTGCTGACCATATAAGAAATGCAGAGTCTTCTAGACAAGCTGTTCAGCCATTGGTAGA 4182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3962 TACTGCTGACCATATAAGAAATGCAGAGTCTTCTAGACAAGCTGTTCAGCCATTGGTAGA 4021
Query 4183 GATTCTCAACACTGGTTCAGAGAGGGAGCAGCATGCTGCTATTGCTGCACTTGTTAGGTT 4242
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4022 GATTCTTAACACTGGTTCAGAGAGGGAGCAGCATGCTGCTATTGCTGCACTTGTTAGGTT 4081
Query 4243 GTTGAGTGATAATCCATCACGGGCTCTGGCAGTTGCAGATGTGGAGATGAATGCGGTGGA 4302
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4082 GTTGAGTGATAATCCATCACGGGCTCTGGCAGTTGCAGATGTGGAGATGAATGCAGTGGA 4141
Query 4303 TGTTCTCTGCAGGATCCTTTCTTCAAACTATACGATGGAACTGAAGGGAGATGCTGCAGA 4362
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4142 TGTTCTCTGCAGGATCCTTTCTTCAAACTATACGATGGAACTGAAGGGGGATGCTGCAGA 4201
Query 4363 GCTGTGTTATGTTCTGTTTGCAAATACAAGGATTAGATCTACAGTTGCTGCAGCGCGTTG 4422
|||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4202 GCTGTGCTATGTTTTGTTTGCAAATACAAGGATTAGGTCTACAGTTGCTGCAGCGCGTTG 4261
Query 4423 TGTTGAGCCACTTGTCTCTCTTCTTGTGACTGAGTTCAGCCCTGCTCAGCATTCAGTTGT 4482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4262 TGTTGAGCCACTTGTCTCTCTTCTTGTGACTGAGTTCAGCCCTGCTCAGCATTCAGTTGT 4321
Query 4483 GCGTGCACTGGACAAGCTTGTCGACGATGAACAACTGGCTGAACTAGTTGCAGCTCATGG 4542
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4322 ACGTGCACTGGACAAGCTTGTCGATGATGAACAACTGGCTGAACTAGTTGCAGCTCATGG 4381
Query 4543 CGCTGTGGTACCTCTTGTTGGCCTTCTCTATGGTAAAAACTATGTGCTTCATGAGGCTAT 4602
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4382 TGCTGTGGTTCCTCTTGTTGGCCTTCTCTATGGTAAAAACTATGTGCTTCATGAGGCTAT 4441
Query 4603 ATCCAGGGCTCTAGTAAAGTTGGGTAAGGACAGGCCTGCTTGTAAACTGGAAATGGTGAA 4662
|||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4442 ATCCAGGGCTTTAGTAAAGTTAGGTAAGGACAGGCCTTCTTGTAAACTGGAAATGGTGAA 4501
Query 4663 AGCTGGAGTTATCGACTGCGTACTTGATATTCTCCACGAAGCTCCAGATTTTCTATGTGC 4722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4502 AGCTGGAGTTATCGACTGCGTACTTGATATTCTCCACAAAGCTCCAGATTTTCTATGTGC 4561
Query 4723 TGCGTTTTCAGAACTGCTTCGAATCCTCACAAATAATGCTACTATTGCCAAGGGACAATC 4782
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4562 TGCGTTTTCAGAACTGCTTCGCATCCTCACAAATAATGCTACTATTGCCAAGGGACAATC 4621
Query 4783 TGCTGCGAAAGTGGTGGAGCCACTTTTCCATTTGCTGACGAGGTTGGAGTTTGGAGCTGA 4842
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4622 TGCTGCGAAAGTGGTGGAGCCACTTTTCCATTTGCTGACGAGATTGGAGTTTGGAGCTGA 4681
Query 4843 TGGACAGCACAGTGCTCTGCAAGTTCTGGTAAATATCTTAGAACATCCACAATGCCGCGC 4902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4682 TGGACAGCACAGTGCTCTGCAAGTTCTGGTAAATATCTTAGAACATCCACAATGCCGTGC 4741
Query 4903 TGATTATACACTTACACCGCACCAAGTAATTGAGCCTTTAATTCCGCTACTGGAATCTCC 4962
||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||| |||||||||||
Sbjct 4742 TGATTATACACTTACACCGCACCAAGTGATTGAACCGCTCATTCCGCTGCTGGAATCTCC 4801
Query 4963 ATCCCCAGCAGTCCAGCAGTTGGCAGCTGAGCTTCTATCTCATCTTCTCTACGAGGAGCA 5022
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4802 ATCCCCAGCAGTACAGCAGTTGGCAGCTGAGCTTCTGTCTCATCTTCTCTACGAGGAACA 4861
Query 5023 TCTGCAGAAAGATCCATTAACGCAACTTGCGATTGGTCCTCTAATCCATGTGCTGGGATC 5082
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4862 TCTGCAGAAAGATCCATTAACGCAACTTGCGATCGGTCCTTTAATCCATGTGCTGGGATC 4921
Query 5083 CGGCATACACCTATTACAGCAGAGAGCTGTGAAAGCTCTCGTCAGCATTGCTCTAACATG 5142
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 4922 CGGCATACACCTATTACAGCAGAGAGCTGTGAAAGCTCTTGTTAGCATTGCTCTAACATG 4981
Query 5143 GCCAAATGAAATAGCTAAAGAAGGTGGTGTGAGTGAGCTGTCAAAGGTGATACTGCAAGC 5202
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4982 GCCAAATGAAATAGCTAAAGAAGGTGGTGTGAGTGAGCTGTCAAAGGTAATACTGCAAGC 5041
Query 5203 TGATCCATCGCTCTCCAATGTGTTATGGGAGTCTGCAGCATCAATTTTGGTTATCATCTT 5262
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5042 TGATCCATCGCTTTCCAATGTGTTATGGGAGTCTGCAGCATCAATTTTGGTTATCATCTT 5101
Query 5263 GCAATTTAGCTCCGAATTTTACCTGGAAGTTCCTGTTGCTGTTCTTGTAAGACTGCTTCG 5322
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 5102 GCAATTTAGCTCCGAATTTTACCTGGAAGTTCCTGTCGCTGTTCTTGTAAGACTGCTTCG 5161
Query 5323 TTCTGCATCTGAAAACACCGTGGTTGGTGCACTTAACGCTCTTCTAGTGTTGGAAAGCGA 5382
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5162 CTCTGCATCTGAAAACACTGTGGTTGGTGCACTTAACGCTCTTCTAGTGTTGGAAAGTGA 5221
Query 5383 TGATGGAACCAGTGCAGAGTCCATGGCTGAAAGTGGTGCCATAGAAGCTCTGCTTGATCT 5442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5222 TGATGGAACCAGTGCAGAGTCCATGGCTGAAAGTGGTGCCATAGAAGCTCTGCTTGATCT 5281
Query 5443 TTTAAGGTCTCATCAGTGTGAGGACACAGCAGCGAGACTGCTCGAGGTACTGCTCAACAA 5502
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5282 TTTAAGGTCTCATCAGTGTGAGGACACAGCAGCGAGACTGCTCGAGGTACTGCTCAACAA 5341
Query 5503 CGTGAAGATTAGAGATTCAAAAGCCACCAAGACTGCAATCTTGCCATTGTCTCAGTACCT 5562
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5342 TGTGAAGATTAGAGATTCAAAAGCCACCAAGACTGCAATCTTGCCATTGTCTCAGTACCT 5401
Query 5563 CTTGGATCCACAAACTCAAGCTCAGCAGGCGCGGTTACTAGCAACTTTGGCCCTTGGTGA 5622
||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5402 CTTGGATCCACAAACTCAAGCCCAGCAGGCACGATTACTAGCAACTTTGGCCCTTGGTGA 5461
Query 5623 TCTTTTCCAGAATGAAGCTCTTGCTAGAAGCACCGATGCAGCTTCTGCTTGCCGTGCTTT 5682
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5462 TCTTTTCCAGAATGAAGCTCTTGCTAGAAGCACTGATGCAGCTTCTGCTTGCCGTGCTTT 5521
Query 5683 AGTCAATGTCCTTGAAGAACAACCCACAGAAGAAATGAAAGTAGTTGCTATATGTGCTCT 5742
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5522 AGTCAATGTCCTTGAAGAACAACCCACAGAAGAAATGAAAGTAGTTGCTATATGTGCTCT 5581
Query 5743 GCAAAATCTCGTCATGTATAGCCGATCTAACAAAAGAGCAGTTGCCGAGGCAGGTGGTGT 5802
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5582 GCAAAACCTCGTCATGTATAGCCGGTCTAACAAAAGAGCAGTTGCCGAGGCAGGTGGTGT 5641
Query 5803 GCAGGTCGTCTTGGATCTGATCAGTTCCAGTGATCCTGAAACGTCTGTTCAGGCTGCAAT 5862
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 5642 GCAGGTTGTCTTGGATCTGATCAGTTCCAGTGATCCTGAAACATCTGTTCAGGCTGCAAT 5701
Query 5863 GTTCGTAAAACTACTCTTCTCTAATCACACCGTTCAAGAGTACGCATCTAGCGAAACCGT 5922
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5702 GTTTGTAAAACTACTCTTCTCTAATCACACTGTTCAAGAGTACGCATCTAGCGAAACCGT 5761
Query 5923 CAGAGCAATAACTGCTGCCATTGAGAAAGACTTATGGGCCACTGGAACCGTGAATGATGA 5982
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5762 CAGAGCAATAACTGCTGCCATTGAGAAAGACCTATGGGCCACTGGAACCGTGAATGATGA 5821
Query 5983 ATACCTAAAAGCCTTAAACTCTTTGTTTAACAACTTCCCGCGTCTAAGAGCTACAGAGCC 6042
||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 5822 ATATCTAAAAGCTTTAAACTCTTTGTTTAACAACTTCCCGCGTCTAAGAGCCACAGAGCC 5881
Query 6043 TGCAACACTAAGTATACCACATCTAGTTACATCCCTCAAGACAGGATCAGAAGCAACACA 6102
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 5882 TGCAACACTAAGTATACCACATCTAGTTACATCCCTCAAGACAGGATCGGAAGCAACTCA 5941
Query 6103 AGAAGCTGCCTTGGATGCATTGTTTCTTCTCAGACAAGCTTGGTCAGCCTGTCCTGCCGA 6162
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5942 AGAAGCTGCCTTGGATGCGTTGTTTCTTCTCAGACAAGCTTGGTCAGCCTGTCCTGCCGA 6001
Query 6163 AGTTTCCAGGGCCCAATCAGTTGCTGCTGCAGACGCCATCCCCCTACTTCAGTACCTAAT 6222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 6002 AGTTTCCAGGGCCCAATCAGTTGCTGCTGCAGACGCCATCCCCTTACTTCAGTACCTAAT 6061
Query 6223 CCAATCAGGTCCACCACGGTTCCAGGAGAAAGCTGAATTCCTCTTGCAGTGTTTGCCAGG 6282
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6062 TCAATCAGGTCCACCGCGGTTCCAGGAGAAAGCTGAATTCCTCTTGCAGTGTTTGCCAGG 6121
Query 6283 TACTCTGGTAGTCACTATCAAACGTGGTAACAACATGAAGCAATCCGTTGGTAACCCGAG 6342
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 6122 TACACTGGTGGTCACTATCAAACGTGGTAACAACATGAAACAATCCGTTGGTAACCCGAG 6181
Query 6343 TGTGTTCTGCAAGATAACACTCGGCAACAATCCTCCTAGACAGACCAAGGTGATATCGAC 6402
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 6182 TGTGTTCTGCAAGATAACACTCGGCAACAATCCTCCTAGACAAACCAAGGTGATATCGAC 6241
Query 6403 AGGTCCTAATCCAGAGTGGGACGAGAGCTTCTCATGGTCATTTGAGAGCCCTCCCAAAGG 6462
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6242 AGGTCCTAATCCAGAGTGGGACGAGAGCTTCTCATGGTCATTTGAGAGCCCTCCCAAAGG 6301
Query 6463 TCAAAAACTCCACATTTCATGCAAGAACAAAAGCAAAATGGGAAAGAGTTCCTTTGGGAA 6522
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6302 TCAAAAACTCCACATTTCATGCAAGAACAAAAGCAAAATGGGAAAGAGTTCCTTTGGGAA 6361
Query 6523 AGTAACGATCCAAATCGATAGGGTGGTGATGCTGGGAGCAGTCGCAGGTGAATATAGTTT 6582
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 6362 AGTAACGATCCAAATCGATAGGGTGGTGATGCTGGGAGCAGTAGCAGGTGAATACAGTTT 6421
Query 6583 GTTACCAGAAAGCAAAAGTGGTCCCAGAAACCTTGAGATAGAATTCCAGTGGTCTAACAA 6642
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 6422 GTTACCAGAAAGCAAAAGTGGCCCCAGAAACCTTGAGATCGAATTCCAGTGGTCTAACAA 6481
Query 6643 GTAAACCACCACTTCAttttttgtttttgtttGAGAGGTTTCTTAAATCGAAACTTCTGC 6702
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6482 GTAAACCACCACTTGATTTTTTGTTTTTGTTTGAGAGGTTTCTTAAATCGAAACTTCTGC 6541
Query 6703 TTCAtttttttGCCAAATTTTTTAAAAATCGTTTGATTTATAATGCTACTGTATATAGTT 6762
||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6542 TTC-TTTTTTTGCCAAATTTTTTTAAAATCGTTTGATTTATAATGCTACTGTATATAGTT 6600
Query 6763 GGTATTGTAATGTAATG 6779
||||||||||||||||
Sbjct 6601 TGTATTGTAATGTAATG 6617
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 263130059722
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5