BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G23740.2
Length=4540
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg481235 jgi|Araly1|481235|fgenesh2_kg.4__295__AT2G23740.1 6756 0.0
> Ahg481235 jgi|Araly1|481235|fgenesh2_kg.4__295__AT2G23740.1
Length=4535
Score = 6756 bits (3658), Expect = 0.0
Identities = 4257/4535 (94%), Gaps = 85/4535 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 21 tttttttttttCGTTGGTTCTTCTTCCGTGACCTAGCCTTTGATTCCGCCATGTCTGTTT 80
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TTTTTTTTTTTTGTTGGTTCTTCTTCCGTGACCTAGCCTTTGATTCCGCCATGTCTGTTT 60
Query 81 CCATATCCTAAGTCCTAACAAGTTATTGTGTTACCTGACCTTCTCTCATAGTTATTAAAA 140
|||| | | | |||||||||||||||||||||||||| | | ||
Sbjct 61 CCATGT-GT-A-TCCTAACAAGTTATTGTGTTACCTGA------C-C-------TT---- 99
Query 141 ACCCAAATGTTAAA-GTT-TTTGTTTTGTGGCAGCATTTTAACA-TTTTTGGTCACCTCC 197
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 100 ACCCAAATGTTAAACTTTCTTTGTTTTGTGGCAGCATTTTAACATTTTTTGGTCACCTCC 159
Query 198 ACCTGGGTTTGTTGATTGGTCATGTTATTGATCTTCAATTTGAATTGTGTG-TTTGTATC 256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||
Sbjct 160 ACCTGGGTTTGTTGATTGGTCATGTTATTGATCTTCAATTTGAATTGTGTGATTT-TATC 218
Query 257 AAATCCTGGGTTTAAAGAAGTGAAATATCTTCTAAGTGGTGATTTATGGAAGTTAAAATG 316
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 219 AAATCCTGGGTTTAAAGAAGTGAAGTATCTTCTAAGTGGTGATTTATGGAAGTTGTAATG 278
Query 317 GATGAGTTGGTTCTTGACGTGGATGTTGAGGAAGCAACAGGTAGTGAGTTGTTGGTGAAA 376
||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 279 GATGAATTGGTTCTTGACGTGGATGTTGAGGAGGCAACTGGTAGTGAATTGTTGGTGAAA 338
Query 377 TCTGAGCC-GGAGGCTGATTTAAATGCGGTGAAGTC-TAGTACCGATTTAGTCACGG--- 431
||||||| || | |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||
Sbjct 339 CCTGAGCCTGG-TGATGATTTCAATGCGGTGAAG-CGTAGTACCGATTTAGTTACGGTAA 396
Query 432 TTACCGGACCTATTGGTAAAAATGGCGAAGGCGAGTCGTCACCTTCTGAGCCTAAATGGC 491
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||
Sbjct 397 TTACCGGACCTATTGGTAATAATGGCGAAGGCGAGTCCTCTCCTTCTGAGCCCAAATGGC 456
Query 492 TGCAACAAGATGAACCAATAGCTTTGTGGGTGAAGTGGAGAGGTAAATGGCAAGCTGGAA 551
||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 457 TGCAAGAAGATGAACCTATAGCTTTGTGGGTGAAGTGGAGAGGTAAATGGCAGGCTGGAA 516
Query 552 TAAGATGTGCGAAAGCGGACTGGCCATTGACGACTTTAAGAGGCAAACCAACTCATGATA 611
| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 517 TCAGATGTGCGAAAGCGGACTGGCCATTGACAACTTTGAGAGGGAAACCAACTCATGATA 576
Query 612 GGAAGAAGTATTGTGTGAttttttttCCGCATACGAAAAATTACTCGTGGGCGGATATGC 671
|||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 577 GGAAAAAGTATTGTGTGATTTTTTTCCCGCATACGAAAAACTACTCGTGGGCGGATATGC 636
Query 672 AGCTTGTTCGATCCATCAATGAGTTTCCTGATCCTATTGCTTATAAGTCTCACAAGATTG 731
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||
Sbjct 637 AGCTTGTTCGATCCATCAATGAGTTTCCTGATCCTATTGCATATAAGTCACACAAAATTG 696
Query 732 GACTTAAGTTAGTTAAAGATTTAACTGCTGCTAGACGCTATATTATGCGGAAGCTTACAG 791
||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |
Sbjct 697 GACTTAAATTGGTTAAAGATTTAACTGCTGCTCGACGCTACATTATGAGGAAGCTTACTG 756
Query 792 TTGGGATGTTCAATATAGTTGACCAGTTCCCTTCAGAGGTTGTTTCTGAAGCAGCTAGGG 851
||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 757 TTGGGATTTTCAATATAGTTGACCAATTCCCCTCAGAGGTTGTTTCTGAAGCAGCTAGGG 816
Query 852 ATATTATAATCTGGAAAGAATTTGCAATGGAAGCTACTAGAAGCACAAGTTATCATGATC 911
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 817 ATATTATAATCTGGAAAGAATTTGCAATGGAGGCTACTAGAAGCACAAGTTATCATGATC 876
Query 912 TTGGGATAATGCTTGTGAAGCTTCATAGCATGATTTTGCAACGATACATGGATCCAATCT 971
||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 877 TTGGGATAATGCTTGTGAAGCTTCACAGTATGATTTTGCAACGATACATGGATCCGATCT 936
Query 972 GGCTTGAGAACTCGTTTCCTTTGTGGGTACAAAAATGTAACAATGCAGTGAATGCAGAGA 1031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 937 GGCTTGAGAACTCGTTTCCTTTGTGGGTACAAAAATGTAACAATGCAGTGAATGCCGAGA 996
Query 1032 GTATTGAATTGCTGAATGAGGAATTTGACAATTGTATCAAGTGGAATGAAGTCAAATCAC 1091
|||||||||| |||||||| | || | | | ||||||||||||||
Sbjct 997 GTATTGAATTACTGAATGA-G----TG------G-----A---G--TGAAGTCAAATCAC 1035
Query 1092 TTTCTGAGTCTCCAATGCAACCAATGTTGTTGTCAGAATGGAAAACGTGGAAGCATGACA 1151
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 TTTCTGAGTCTCCAATGCAACCGATGTTGTTGTCAGAATGGAAAACGTGGAAGCATGACA 1095
Query 1152 TTGCAAAATGGTTCTCTATATCTCGCCGTGGTGTTGGCGAAATAGCACAGCCGGATAGTA 1211
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1096 TTGCGAAATGGTTCTCGATATCTCGCCGTGGTGTTGGCGAAATAGCACAGCCGAATAGTA 1155
Query 1212 AAAGTGTGTTTAACTCAGATGTCCAGGCTAGTCGTAAAAGACCAAAACTTGAGATTCGAC 1271
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1156 AAAGTGTGTTTAACTCAGATGTCCAGGCTAGCCGTAAAAGACCAAAACTTGAGATTCGAC 1215
Query 1272 GTGCAGAGACAACAAATGCAACACATATGGAGTCTGATACTTCGCCACAAGGATT-ATCT 1330
| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||| | ||
Sbjct 1216 GAGCAGAGACGACAAATGCATCACAGATGGAGTCTGATACGTCACCACAAGGATTGA-CT 1274
Query 1331 GCAATTGACTCAGAGTT-TTTCAGTTCTCGAGGCAACACAAATTCTCCTGAGACGATGAA 1389
||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||
Sbjct 1275 GCAATTGACTCGGAATTCTTT-AGTTCTCGAGGCAACACTAATACTCCTGAGGCGGTGAA 1333
Query 1390 AGAAGAAAATCCTG-TAATGAATACACCAGAGAATGGTTTGGATCTATGGGATGGCATTG 1448
||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1334 AGATGAAAA-CCCGATAATGAATACACCGGAGAATGGTTTGGATCTATGGGATGGCATTG 1392
Query 1449 TTGTTGAAGCAGGTGGTTCACAGTTCATGAAGACAAAAGAAACTAATGGACTGTCTCACC 1508
||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |
Sbjct 1393 TTGTTGAAGCAGGTGGTTCACAGATCATGAAAACAAAAGAAACTAATGGATTGTCTCA-C 1451
Query 1509 CGCAAGACCAACATATAAATGAATCAGTTCTGAAGAAACCATTTGGTTCGGGAAATAAGA 1568
| | | | |||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1452 C-C---A-C-ACAT-T-AACGAATCAGTTTTGAAGAAACCATTTGGTTCAGGAAATAAGA 1503
Query 1569 GTCAGCAATGCATAGCTTTCATTGAATCGAAAGGAAGGCAATGTGTGAGGTGGGCGAATG 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1504 GTCAGCAATGCATAGCTTTCATTGAATCGAAAGGAAGGCAATGTGTGAGGTGGGCGAATG 1563
Query 1629 AAGGTGATGTTTATTGTTGCGTGCATTTAGCTTCTCGTTTCACCACAAAATCTATGAAGA 1688
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||
Sbjct 1564 AAGGTGATGTTTATTGTTGTGTGCATTTAGCTTCTCGTTTCACCACCAAATCTGCAAAGA 1623
Query 1689 ACGAGGGCTCTCCTGCTGTTGAAGCACCTATGTGCGGAGGGGTTACTGTTCTTGGTACCA 1748
|||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1624 ACGAGGGCTCTCCTGCAGTTGAAGCACCAATGTGCGGAGGAGTTACTGTTCTTGGTACCA 1683
Query 1749 AATGCAAGCACCGATCTCTACCCGGGTTTTTGTACTGCAAGAAACACCGTCCTCATACAG 1808
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 1684 AATGCAAGCACCGATCTCTACCCGGGTTTTTGTACTGCAAGAAACACCGCCCTCATTCAG 1743
Query 1809 GGATGGTGAAACCTGATGATTCTTCATCTTTTCTGGTGAAGAGAAAGGTATCGGAAATTA 1868
||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1744 AGATGGAGAAACCTGATGATTCTTCATCTCTTCTGGTGAAGAGAAAGGTAGCGGAAATTA 1803
Query 1869 TGTCAACATTAGAAACAAATCAATGTCAAGATTTGGTGCCGTTTGGAGAACCAGAAGGTC 1928
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1804 TGTCAACCTTAGAAACAAATCAATGTCAAGATTTGGTGCCGTTTGGAGAACCAGAAGGTC 1863
Query 1929 CATCTTTTGAGAAACAGGAGCCCCATGGAGCCACGAGCTTCACGGAGATGTTTGAACATT 1988
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1864 TATCTTTCGAGAAACAGGAGCCCCATGGAGCCACGAGCTTCACTGAGATGTTTGAACATT 1923
Query 1989 GTAGCCAAGAGGATAACTTGTGTATAGGTTCTTGCTCAGAAAACAGCTATATTTCTTGCA 2048
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1924 GTAGCCAAGAGGATAACTTGTGTATAGGTTCTTGCTCAGAAAACAGCTATATTCCTTGCA 1983
Query 2049 GTGAGTTCTCGACAAAGCACTCGTTATACTGTGAACAGCACCTTCCTAACTGGCTTAAGC 2108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1984 GTGAGTTCTCGACAAAGCACTCGTTATACTGTGAACAGCACCTTCCTAACTGGCTTAAGC 2043
Query 2109 GTGCAAGGAATGGTAAGAGTCGAATAATATCGAAGGAAGTGTTTGTAGATCTCTTAAGGG 2168
|||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2044 GTGCGAGGAATGGTAAGAGTCGAATAATATCAAAGGAAGTCTTTGTAGATCTCTTAAGGG 2103
Query 2169 GTTGTTTATCGCGTGAGGAAAAGTTGGCTCTACATCAAGCTTGTGATATTTTCTACAAGC 2228
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2104 GTTGTTTATCGCGTGAGGAAAAATTAGCTCTACATCAAGCTTGTGATATTTTCTACAAGC 2163
Query 2229 TCTTCAAAAGTGTCTTATCGTTAAGAAACTCTGTCCCAATGGAAGTACAGATCGACTGGG 2288
||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||
Sbjct 2164 TCTTCAAAAGTGTCTTATCTTTAAGAAACTCTGTGCCAATGGAGGTACAGATTGATTGGG 2223
Query 2289 CGAAAACAGAAGCTTCAAGAAACGCTGACGCTGGAGTTGGAGAATTCTTGATGAAGTTGG 2348
||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2224 CGAAAGCAGAAGCTTCAAGAAACGCGGACGTTGGAGTTGGGGAATTCTTGATGAAGTTGA 2283
Query 2349 TATCCAATGAAAGAGAGAGATTAACTAGGATATGGGGTTTCGCTACTGGTGCTGATGAAG 2408
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2284 TATCCAATGAAAGGGAGAGATTAACTAGGATATGGGGTTTCCCTACTGGTGCTGATGAAG 2343
Query 2409 AAGATGTATCATTATCAGAATATCCTAATCGACTACTTGCCATCACCAATACCTGTGATG 2468
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |
Sbjct 2344 AAGATGTATCATTATCAGAATATCCTAATCGACTGCTTGCCATCACCAATGCCTGGGCGG 2403
Query 2469 ATGATGATGATAAAGAGAAATGGTCGTTTAGTGGATTTGCTTGTGCTATTTGCTTAGATT 2528
||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2404 ATGATGAAGACAAAGAGAAATGGTCTTTTAGTGGATTTGCTTGTGCTATTTGCTTAGATT 2463
Query 2529 CTTTTGTG-AGAAGAAAGCTTTTGGAAATTCATGTGGAGGAGCGACATCACGTGCAGTTT 2587
|||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 2464 CTTTTGTGAAG-AGAAAGCTTTTGGAAATTCATGTGGAGGAGAGGCATCACGTGCAGTTT 2522
Query 2588 GCGGAAAAGTGTATGCTTCTTCAGTGTATTCCTTGTGGCAGCCATTTTGGAGATAAAGAA 2647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2523 GCGGAAAAGTGTATGCTTCTTCAGTGTATTCCTTGTGGCAGTCATTTTGGAGATAAAGAA 2582
Query 2648 CAGTTGCTGGTACATGTGCAAGCTGTGCATCCTTCTGAGTGCAAATCGCTAACCGTTGCT 2707
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2583 CAGTTGCTGTTACATGTGCAAGCTGTGCATCCTTCTGAGTGCAAATCGCTAACGGTTGCT 2642
Query 2708 TCTGAATGCAATTTGACTAATGGTGAGTTTTCTCAGAAACCTGAAGCAGGCAGTTCACAA 2767
||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2643 TCTGAGTGCAATTTGACTAATGGTGAGTCTTCTCAGAAACCTGAAGCAGGCAGTTCACAA 2702
Query 2768 ATTGTTGTGAGCCAAAACAACGAGAATACAAGCGGCGTACATAAATTTGTTTGCAAGTTC 2827
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2703 ATTGTTGTGAGCCAAAACAACGAGAATACAAGCGGCGTACATAAATTTGTTTGCAAGTTC 2762
Query 2828 TGTGGGCTGAAATTCAATTTATTACCTGACCTTGGCCGTCACCATCAAGCTGAACACATG 2887
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2763 TGTGGGCTGAAATTCAATTTATTACCTGACCTAGGCCGTCACCATCAAGCTGAACACATG 2822
Query 2888 GGACCGAGTCTAGTTGGCTCTCGTGGTCCGAAGAAAGGAATAAGGTTTAATACATATAGG 2947
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2823 GGATCGAGTCTAGTTGGCTCTCGTGGTCCGAAGAAAGGAATAAGGTTTAATACATACAGG 2882
Query 2948 ATGAAATCTGGTAGGCTTAGTCGTCCAAATAAATTCaaaaaaaGTCTTGGAGCTGTCTCA 3007
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 2883 ATGAAATCTGGTAGGCTTAGTCGTCCGAATAAATTCAAGAAAAGTCTTGGAGCAGTCTCA 2942
Query 3008 TATAGGATTAGAAATAGGGCTGGTGTAAATATGAAGAGGAGGATGCAAGGTTCTAAATCG 3067
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2943 TATAGGATTAGAAACCGGGCTGGTGTAAATATGAAGAGGAGGATGCAAGGTTCTAAACCG 3002
Query 3068 CTCGGCACAGAAGGAAACACTGAAGCTGGAGTATC-GCCGCCTCTGGATGATAGTAGAAA 3126
||| |||| ||||||||||||| || | | | | |||||||| || ||||||||||||
Sbjct 3003 CTCAGCACGGAAGGAAACACTGGAG-T--A-TCGCCGCCGCCTCCGGGTGATAGTAGAAA 3058
Query 3127 CTTTGATGGCGTAACAGATGCTCATTGCTCTGTGGTTTCGGATATATTGTTGTCAAAGGT 3186
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3059 CTTTGATGG--TA-CAGATGCTCATTGCTCTGTGGTTTCGAATATATTGTTGTCAAAGGT 3115
Query 3187 TCAGAAAGCAAAACATCGCCCCAATAACCTCGATATCCTGTCTGCTGCTCGATCAGCTTG 3246
||||||||| || |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3116 TCAGAAAGCGAAGCATCGCCCTAATAACTTTGATATCCTGTCTGCTGCTCGATCGGCTTG 3175
Query 3247 CTGTAGGGTGAGCGTTGAGACCTCTTTGGAGGCTAAATTCGGTGATTTGCCTGACCGGAT 3306
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3176 CTGTAGGGTGAGCCTTGAGACCTCTTTGGAGGCTAAATTCGGGGATTTGCCTGACCGGAT 3235
Query 3307 ATATCTCAAGGCAGCAAAACTTTGCGGTGAGCAAGGTGTACAAGTGCAATGGCATCAGGA 3366
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3236 ATATCTCAAGGCAGCAAAACTTTGCGGTGAGCAAGGTGTACAAGTGCAATGGCATCAGGA 3295
Query 3367 AGGATACATATGCTCTAACGGATGTAAGCCTGTTAAAGACCCAAATCTTCTACATCCCTT 3426
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3296 AGGATACATATGCTCTAACAGATGTAAGCCTGTTAAAGACCCAAATCTTCTACGTCCCTT 3355
Query 3427 GATCCCGCGACAAGAGAATGATCGATTCGGGATAGCTGTGGACGCTGGACAACATTCTAA 3486
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3356 GATCCCTCGACAAGAGAATGATCGATTCGGGATATCTATGGACCCTGGACAACATTCTAA 3415
Query 3487 TATTGAGTTGGAAGTTGATGAGTGCCATTGTATCATGGAGGCTCATCATTTTAGTAAGAG 3546
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3416 TATCGAGTTGGAAGTTGATGAGTGCCATTGTATCATGGAGGCTCATCATTTTAGTAAGAG 3475
Query 3547 ACCGTTTGGAAACACTGCGGTTTTGTGCAAGGACATCAGCTTTGGTAAGGAATCAGTTCC 3606
||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3476 ACCATTTGGAAACACCGCGGTTTTGTGCAAGGACATAAGCTTTGGTAAGGAATCAGTTCC 3535
Query 3607 AATTTGTGTCGTCGATGATGATCTTTGGAATTCTGAAAAACCGTATGAGATGCCTTGGGA 3666
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | | |||||| |||||||||
Sbjct 3536 AATTTGTGTCGTCGATGATGATCTTTTGAATTCTGGAAAGCAGCATGAGAGGCCTTGGGA 3595
Query 3667 ATGCTTTACTTATGTTACAAACTCAATTCTTCATCCGTCAATGGATCTTGTAAAGGAGAA 3726
| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3596 AAGCTTTACTTATATTACAAACTCAATACTTCATCCGTCAATGGAACTTGTAAAGGAGAA 3655
Query 3727 TCTGCAACTCAGGTGTAGCTGTCGCAGTTCAGTGTGCTCGCCTGTAACTTGTGATCACGT 3786
|||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3656 TCTGCAACTCAGATGTGGCTGTCGCAGTTCAGTGTGCTCGCCTGTAACTTGTGATCACGT 3715
Query 3787 ATACCTTTTCGGTAACGATTTTGAGGACGCTAGAGACATATATGGAAAATCCATGAGGTG 3846
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3716 ATACCTTTTTGGTAACGATTTTGAGGACGCTAGAGACATATATGGAAAATCCATGAGGTT 3775
Query 3847 TAGATTCCCATATGATGGCAAACAACGTATCATCTTGGAGGAGGGTTATCCTGTTTATGA 3906
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3776 TAGATTCCCATATGATGGCAAACAACGGATCATCTTGGAGGAGGGTTATCCTGTTTATGA 3835
Query 3907 ATGCAATAAGTTCTGTGGATGCTCTAGAACATGTCAGAATCGGGTTTTGCAGAATGGAAT 3966
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3836 ATGCAATAAGTTCTGTGGATGCTCTAGAACATGTCAGAATCGGGTTTTGCAGAATGGAAT 3895
Query 3967 TCGCGCGAAACTAGAAGTTTTTAGAACTGAAAGCAAGGGATGGGGATTGCGAGCTTGTGA 4026
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3896 TCGCGTGAAACTAGAAGTTTTTAGAACTGAAAGCAAGGGATGGGGATTGCGAGCTTGTGA 3955
Query 4027 ACATATACTGCGTGGCACATTTGTTTGCGAATACATCGGGGAGGTTCTTGATCAGCAAGA 4086
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3956 ACATATACTGCGTGGCACATTTGTTTGCGAATACATTGGGGAGGTTCTTGATCAGCAAGA 4015
Query 4087 AGCAAACAAGAGGCGAAACCAGTATGGAAATGGAGATTGCAGCTACATACTGGACATTGA 4146
|||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4016 AGCAAACAAGAGGCGAAACCAGTATGGAAAAGAAGGTTGCAGCTACTTACTGGACATTGA 4075
Query 4147 CGCTAATATCAACGACATAGGTAGATTGATGGAAGAAGAGCTCGATTATGCTATTGATGC 4206
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4076 TGCTAATATCAACGACATCGGTAGATTGATGGAAGAAGAGCCCGATTATGCTATTGATGC 4135
Query 4207 TACTACTCATGGCAACATCTCTCGATTCATCAATCACAGCTGCTCACCAAATCTCGTTAA 4266
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4136 TACTACTCATGGCAACATCTCTCGATACATCAATCACAGCTGCTCACCAAATCTCGTTAA 4195
Query 4267 TCACCAAGTTATTGTGGAAAGCATGGAGTCCCCGCTCGCTCATATCGGTCTATACGCCAG 4326
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4196 TCACCAAGTTATTGTGGAAAGCATGGAGTCCCCGCTCGCTCATATCGGTCTATACGCCAG 4255
Query 4327 TATGGATATAGCTGCAGGAGAAGAGATCACCCGAGACTATGGACGCAGACCGGTACCATC 4386
||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 4256 TATGGATGTTGCTGCAGGAGAAGAGATCACCCGAGACTATGGATGCAGACCGGTACCAAC 4315
Query 4387 TGAACAAGAAAATGAGCATCCATGCCATTGTAAAGCAACTAATTGCAGAGGTCTCTTAAG 4446
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4316 TGGACAAGAAAATGAGCATCCATGCCATTGTAAAGCAACTAATTGCAGAGGTCTCTTAAG 4375
Query 4447 TTAGATTTTGGTTCTTAGGAACATTCTTTGCAGATCTGTTTTGATAATTTTCCTTCAAGA 4506
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 4376 TTAGATTTTGGTTCCTAGGAACATTCTTTGCAGATTTGTTTTAATAATTTTCCTTCA-GA 4434
Query 4507 Cttttt---ttttttGCCCTTGAATCTTTTAGACA 4538
|||||| |||||| ||||||||||||| |||||
Sbjct 4435 CTTTTTACCTTTTTT-CCCTTGAATCTTT-AGACA 4467
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 171753826949
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5