BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G25660.1
Length=6754
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg932732 jgi|Araly1|932732|scaffold_400720.1 4279 0.0
Ahg932726 jgi|Araly1|932726|scaffold_400714.1 1482 0.0
Ahg932725 jgi|Araly1|932725|scaffold_400713.1 1103 0.0
Ahg932727 jgi|Araly1|932727|scaffold_400715.1 505 2e-141
> Ahg932732 jgi|Araly1|932732|scaffold_400720.1
Length=6445
Score = 4279 bits (2317), Expect = 0.0
Identities = 2563/2683 (96%), Gaps = 11/2683 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3830 TGATCACTGTTGAGAAAACTATTCTGGAACAAAGCAATAGCCGGTATGAGCTTCAAGGTG 3889
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3754 TGATCACAGTTGAGAAAACTATTCTGGAACAAAGCAATAGCCGGTATGAGCTTCAAGGTG 3813
Query 3890 AATATGTATTGCCGGGTTCCCGTGACCGAGACCTTGGTCAGAAGGAAGCTGGCAGTTTTT 3949
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3814 AATATGTATTGCCGGGTTCCCGTGACCGAGATTTTGGTCAGAAGGAAGCTGGCAGTTTCT 3873
Query 3950 TAATGAGAGCCATGACTGGTCATCTAGGAAGTGTTATATCCTCCATGGGAAGATGGAGAA 4009
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3874 TAATGAGAGCCATGACGGGTCATCTAGGAAGTGTTATATCTTCCATGGGAAGATGGAGAA 3933
Query 4010 TGAGACTTGAAGTGCCTAAGGCAGAGGTTGCTGAGATGCTTCCTCTTGCAAGGCTTCTTT 4069
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3934 TGAGACTTGAAGTGCCTAAGGCAGAGGTTGCTGAGATGCTTCCTCTTGCAAGGCTTCTTT 3993
Query 4070 CAAGAAGTACAGATCCAGCTGTTCACTCAAGATCAAAGGATCTTTTCATCCAAAGCGTTC 4129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 3994 CAAGAAGTACAGATCCAGCTGTTCACTCAAGATCAAAGGATCTTTTCATTCAAAGCGTGC 4053
Query 4130 AAAATCTCTGTCTACAAGCTGAAAATCTTCGAGACTTGCTTGAGGAGATACGTGGGTATT 4189
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4054 AAAATCTCTGTCTACAAGCTGAAAATCTTCGAGACTTACTTGAGGAGATACGTGGGTATT 4113
Query 4190 ATACTCCACCAAGTGAAGTCGTTCTTGAAGATCTAAGTCTTCCAGGTTTAGCTGAGCTCA 4249
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4114 ATACTCCACCAAGTGAAGTCGTTCTTGAAGATCCAAGTCTTCCAGGTTTAGCTGAACTCA 4173
Query 4250 AGGGTCATTGGCATGGTTCGCTTGATGCTAGTGGTGGAGGCAATGGAGACACTTTGGCCG 4309
| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4174 AAGGTCATTGGCATGGTTCGCTGGATGCTAGTGGTGGAGGCAATGGAGACACCTTGGCCG 4233
Query 4310 AATTTGACTTCCATGGAGATGATTGGGAGTGGGGGACTTACAAAACACAGCGTGTTCTGG 4369
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4234 AATTTGACTTCCATGGTGATGATTGGGAGTGGGGGACTTACAAAACACAGCGTGTTCTGG 4293
Query 4370 CTACTGGTTCGTATAACAATGATGATGGTTTACGTCTTAAGGAGATGCTCATTCAAAAAG 4429
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4294 CTACTGGTTCATATAGCAATGATGATGGTTTACGTCTTAAGGAGATGCTTATTCAAAAAG 4353
Query 4430 GAAACGCTACACTGCACGCAGATGGGACCTTATTGGGGCCAAAAACAAATCTTCATTTTG 4489
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4354 GAAACGCTACACTGCATGCAGATGGGACCTTATTGGGGCCAAAAACAAATCTTCATTTTG 4413
Query 4490 CTGTTCTGAATTTCCCTGTTAGTTTGATACCTACCTTGGTTGAGGTTGTTGAATCATCAG 4549
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 4414 CTGTTCTAAATTTTCCTGTTAGTTTGATACCTACCCTGATTGAGGTTGTTGAATCATCAG 4473
Query 4550 CTACTGATATTGTTCACTCTTTGAGGAAACTCTTGTCACCAATCAAAGGCATTTTGCACA 4609
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4474 CTTCTGATCTTGTTCACTCTTTGAGGAAACTCTTGTCACCAATCAAAGGCATTTTGCACA 4533
Query 4610 TGGAAGGG-GATCTTAGAGGGAGTCTTGAAAAACCAGAATGTGATGTACAAGTTAGGTTA 4668
|||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4534 TGGA-GGGAGATCTTAGAGGGAGTCTTGAAAAACCAGAATGTGATGTACAAGTTAGATTA 4592
Query 4669 TTGGATGGTGCTGTTGGTGGTATAGACCTTGGACGAGCTGAAGTTTTTGCTTCTCTTACA 4728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4593 TTGGATGGTGCTGTTGGTGGTATAGACCTTGGACGAGCTGAAGTTTTTGCTTCTCTTACA 4652
Query 4729 TCTAACAGTCGTTTTCTTTTCAACTCCAACTTTGAACCATTTGTCCAAAATGGTCATGTC 4788
|| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4653 TCAAACAGTCGCTTTCTTTTCAATTCCAATTTTGAACCATTTGTCCAAAATGGTCATGTG 4712
Query 4789 CATATACAAGGAAGTGTTCCTGTTAGCTTTTCGCAGAAAAATATGTCTGAAGGAGAAGTC 4848
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
Sbjct 4713 CACATACAAGGAAGTGTTCCTGTTAGCTTTTCGCAGAAAAATATCTCTGAGGGAGAAGAC 4772
Query 4849 AGCGAAACAGATAGAGGTGGTGCAGTGAAAA-TCCCGAGTTGGGCAAAAGAGAAGGAAGA 4907
|| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||| ||||||||
Sbjct 4773 AGGGAAACTGATAGAGGTGGTGCAGT-AAAAGTCCCTAGCTGGGCAAAAGAAAAGGAAGA 4831
Query 4908 TGATGAGAAGAGAACCTCAAGGGATAGGAGCGAAGAGAGATGGGACAGCCAACTAGCTGA 4967
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4832 TGATGAGAAGAGAACCTCAAGGGATAGGGGCGAAGAGGGATGGGATAGCCAACTAGCTGA 4891
Query 4968 GAGTCTCAAGGGTTT-ATACTGGAATATTTTAGATGCAGGAGAAGTTAGACTGGAGGCAG 5026
||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||
Sbjct 4892 GAGTCTCAAGGGTTTGA-ACTGGAATATTTTAGATGAAGGAGTAGTTAGATTGGAGGCAG 4950
Query 5027 ACATCAAGGATGGGGGAATGACTTTGTTAACAGCCATATCTCCTTATGCTAATTGGCTCC 5086
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4951 ACATCAAGGATGGGGGAATGACTTTGTTAACAGCCATATCTCCTTATGCTAATTGGCTCC 5010
Query 5087 AAGGAAATGCTGATATCAGGCTTCAGGTCGGAGGTACAGTAGACCATCCAGTGCTTGATG 5146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 5011 AAGGAAATGCTGATATCAGGCTTCAGGTCGGAGGTACAGTAGAGCATCCAGTGCTTGATG 5070
Query 5147 GGTCTGCTTCATTCCACAGGGCGTCTATCTCTTCACCTGTGCTTCGTAAACCGCTCACAA 5206
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 5071 GGTCTGCTTCATTCCACAGGGCGTCTATCTCTTCACCTGTGCTCCGTAAACCTCTCACAA 5130
Query 5207 ACTTTGGTGGAACCTTACATGTTAAATCAAACAGGTTGTGCATCACCTCACTGGAAAGCA 5266
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5131 ACTTTGGTGGAACCTTACATGTTAAATCAAACAGGTTGTGCATCACCTCACTGGAAAGCA 5190
Query 5267 GGGTAAGTAGAA-AGGGAAAGCTGGTTGTTAAAGGAAATCTTCCCCTTAGATCAAATGAA 5325
|||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5191 GGGTAAGTAGAAGAGG-AAAGCTGGTTGTGAAAGGAAATCTTCCCCTTAGATCAAATGAA 5249
Query 5326 GCATCTGCTGGTGATGGAATAGAGCTCAAATGTGAAGTTCTAGAAGTACGAGCAAAGAAT 5385
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 5250 GCATCTACTGGTGATGGAATAGATCTCAAATGTGAAGTTCTTGAAGTACGAGCAAAGAAT 5309
Query 5386 TTTTTAAGTTGTCAGGTTGATACTCAGCTGCAAATTACTGGATCAATGTTGCAGCCAACT 5445
|| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5310 TTCTTAAGTGGTCAGGTTGATACTCAGCTGCAAATTACTGGATCAATGTTGCAGCCAACT 5369
Query 5446 ATATCAGGAAATATTAAATTAAGCCAAGGAGAAGCTTATCTGCCTCATGATAAGGGTGGT 5505
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 5370 ATATCAGGAAATATTAAATTAAGCCAAGGAGAAGCTTATTTGCCTCATGATAAGGGTGGG 5429
Query 5506 GGAGCTGCCCCTTTAAATAGATTGGCAGCCAATCAGTATAGTATTCCAGGTGCTGCTATT 5565
||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 5430 GGAGCTGCCCCACTCAATAGACTGGCAGCCAATCAATATAGGATTCCAGGTGCTGCTATT 5489
Query 5566 AATCAAGCAGTTTCTTCACGATATTTTGCTCGATTTTTTGGCACTGAACGGGCTTCTTCA 5625
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 5490 AATCAAGCAGTTTCTTCACGATATTTTGCTCGATTTTTTGGCACAGAACGGGCTTCTTCA 5549
Query 5626 GGGATGAAATTCTCTCAGTCGACTGGTAAATCAAATTCTGTTGAAAAGGAGATTGAAGAA 5685
||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5550 AGGATGAAATTCTCCCAGTCTTCTGGTGAATCAAATGCTGTTGAAAAGGAGATTGACGAA 5609
Query 5686 GTGAAAATGAAACCAAATATGGATATCCGTCTGAGTGATATGAAACTTGTTTTAGGACCA 5745
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5610 GTGAAAATGAAACCAAATATGGATATCCGTCTGAGTGATATGAAACTTGTTTTAGGACCA 5669
Query 5746 GAGCTGAGGATAATGTACCCTTTAATTCTTAATTTTGCTGTTAGTGGTGAGCTTGAACTT 5805
||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5670 GAGTTGAGGATAGTGTATCCTTTAATTCTTAATTTTGCTGTTAGTGGTGAGCTTGAGCTT 5729
Query 5806 GATGGCATGGCTCATCCAAAATTTATCAAACCAAAGGGTGTCCTAACATTCGAAAACGGA 5865
||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| | ||||| || |||
Sbjct 5730 GATGGCATGGCTCATCCCAAATATATCAAACCAAAGGGTATCCTGATGTTCGAGAATGGA 5789
Query 5866 GATGTCAATCTTGTGGCTACTCAGGTACGTCTGAAGAGGGAGCATCTCAACGTTGCAAAG 5925
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 5790 GATGTCAATCTTGTGGCTACTCAGGTACGTCTGAAGAGGGAGCATCTCAACATTGCAAAG 5849
Query 5926 TTTGAGCCTGAACATGGACTAGATCCTCTGCTAGATTTAGCCTTAGTTGGTTCAGAATGG 5985
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 5850 TTTGAGCCTGAACATGGACTAGATCCTCTGCTAGATTTAGCTTTAGTTGGTTCAGAATGG 5909
Query 5986 CAATTTAGGGTTCAAAGTCGTGCCAGTAATTGGCAGGACAAACTTGTCGTGACTTCAACA 6045
||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 5910 CAATTTAGGGTCCAAAGTCGTGCCAGCAATTGGCAGGAAAAACTTGTGGTGACTTCAACT 5969
Query 6046 CGTTCTGTTGAACAGGATGCTCTCTCACCTTCGGAGGCTGCAAAGGTGTTT-GAGAGCCA 6104
|||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 5970 CGTTCTGTGGAACAGGATGCTCTCTCACCTTCCGAGGCTGCAAAGGT-TTTCGAGAGCCA 6028
Query 6105 ATTAGCAGAATCCATATTAGAAGGAGATGGACAACTTGCTTTCAAAAAACTTGCAACCGC 6164
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6029 ATTAGCAGAATCCATATTAGAAGGAGATGGACAACTTGCTTTCAAAAAACTTGCAACCGC 6088
Query 6165 AACACTTGGAACCATAATGCCAAGGATAGAAGGAAAAGGAGAGTTTGGTCAGGCGAGATG 6224
|||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 6089 AACACTTGAAACCATAATGCCAAGGATAGAAGGGAAAGGAGAGTTTGGTCAAGCAAGATG 6148
Query 6225 GAGGTTGGTGTATGCTCCGCAGATCCCAAGTTTACTCTCTGTTGATCCAACTGTGGATCC 6284
|||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 6149 GAGGTTGGTGTACGCCCCACAGATCCCAAGTTTACTCTCTGTTGATCCAACTGTTGATCC 6208
Query 6285 TCTCAAGTCTCTGGCGAGCAACATATCATTTGGAACGGAAGTTGAAGTGCAGCTCGGAAA 6344
|||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 6209 TCTCAAGTCTCTGGCGAGCAACATCTCGTTTGGAACAGAAGTTGAAGTGCAGCTCGGAAA 6268
Query 6345 ACGTCTTCAGGCCTCTGTGGTAAGACAGATGAAAGATTCTGAGATGGCAATGCAATGGAC 6404
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 6269 ACGTCTTCAGGCCTCTGTGGTAAGACAAATGAAAGACTCTGAGATGGCAATGCAATGGAC 6328
Query 6405 ACTTATTTACCAGCTCACGAGCCGCTTGCGTGTCCTTCTGCAATCTGCACCTTCCAAACG 6464
||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6329 ACTGATCTATCAACTCACGAGCCGCTTGCGTGTCCTTCTGCAATCTGCACCTTCCAAACG 6388
Query 6465 TTTGCTTTTTGAATACTCTGCTACATCACAAGACTAAATCCTT 6507
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 6389 TTTGCTTTTTGAATACTCTGCTACATCACAAGACTAAA-CCTT 6430
Score = 3653 bits (1978), Expect = 0.0
Identities = 2289/2433 (94%), Gaps = 45/2433 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1390 AAAAAGGCTTCCACGTTAGACAAGTTCACAGTATCATGTGATCCATTCCTTATGACTGTT 1449
||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1344 AAAAAGGCTTCAACGTTAGATAAGTTCACTGTATCATGTGATCCATTCCTTATGACTGTT 1403
Query 1450 GATAGACTCTGTGCACTCTTACAAACTAAACG-AAGCCCATCTGTTGAAGATATTGTGAA 1508
|||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1404 GATAGACTCTGTGCACTCTTACAAACTAAA-GAAAGCTCATGTGTTGAAGATATTGTGAA 1462
Query 1509 TTCTTCTGAATCTGAGACTTTAAGCAGTCAGAGAGGGGATATATCTATGAATGTTGTTAA 1568
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||
Sbjct 1463 TTCTACTGAATCTGAGACTTTAAGCAGTAAGAGAGGGGATATATCTA-GAAAG--GTT-G 1518
Query 1569 TCAGAATACTGACGATGTTCCACATGGTAATCGAAGTGGAAATCAGCCTCGTGACTTTAC 1628
| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1519 T--G---GGTGATGATGTTCCACATGGTAATCGAAGTCGAAATCAACCTCGTGACTTCAC 1573
Query 1629 GTTCAAAAAGCATGAGCATCAACCTGTAGCAAACCATTGGCGTCCCAGC-TGGCCACGGA 1687
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||| |||
Sbjct 1574 TTTCAAAAAGCATGAGCATCAACCTGTAGCAAATCATTGGCGTCCTA-CTTGGCCATGGA 1632
Query 1688 ACAAAAAATTAAAAGAAGC-AGTGTTTAATATTTTAACTGGTTCCTCTAAGAAGTTAACA 1746
||| |||||| || ||| | |||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||
Sbjct 1633 ACATAAAATTGAAGGAA-CTGGTGTTTAATATTCTAAGTGGTTCGTCTAAGAAGCTAACA 1691
Query 1747 GGAAGGG-C--A---G-AT-C--C-G--AATGCTCCTCACTTGAGCGATGAACTGGAGAA 1793
|| |||| | | | || | | | ||||||| ||||||||| |||| |||||||||
Sbjct 1692 GG-AGGGTCAGATCTGAATGCTGCTGACAATGCTCTTCACTTGAGTGATGGACTGGAGAA 1750
Query 1794 GCTGCCTGCTGTTTATGTTGAGAAGACACTACCAGTTATGCTTGACTCTGTGCAGTTTAA 1853
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1751 GCTGCCTGCTGTTTATGTTGAGAAGACACTACCAGTTATGCTTGACTCTGTTCAGTTTAA 1810
Query 1854 AGGTGGGACACTTCTTCTATTAGCTTATGGCGATACAGAGCCCAGAGAAATGAGGAACGT 1913
||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1811 AGGTGGGACACTTATTCTATTGGCTTATGGCGATACAGAGCCCAGAGAAATGAGAAACGC 1870
Query 1914 CCATGGACATGTTAAGTTTCAGAATCATTATGGTCGTGTGTACGTGCAACTTGGTGGAAA 1973
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1871 CCATGGACATGTTAAGTTTCAGAATCATTATGGTCGTGTGTACGTGCAACTTGGTGGAAA 1930
Query 1974 CTGTAATATGTGGAGATCAGATGTAACATCTGAAGATGGTGGGCTTTTGTCTGTTGATGT 2033
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1931 CTGTACCATGTGGAGATCAGATGTAACATCTGAAGATGGTGGGCTTTTGTCTGTTGATGT 1990
Query 2034 TTTTGTTGATACCGTCGAGCAGAACTGGCATGCAAATTTAAATGTTGCCAACTTCTTTGT 2093
|||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1991 TTTTGTTGATACTGTGGAGCAGAATTGGCATGCAAATTTAAATGTCGCCAACTTCTTTGT 2050
Query 2094 CCCGATTTTTGAAAGAATTCTAGAGATTCCAATCGAGTGGTCTAAGGGAAGAGCTACTGG 2153
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2051 CCCGATTTTTGAAAGAATTCTAGAGATCCCAATCGAGTGGTCTACGGGAAGAGCTACTGG 2110
Query 2154 TGAGGTTCATCTATGTATGTCTAGAGGAGAAAGT-TTTCCAAACCTACATGGCCAACTTG 2212
|||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 2111 TGAGGTTCATCTGTGTATGTCTAGAGGGGAAA-TATTTCCAAACCTTCATGGCCAGCTTG 2169
Query 2213 ACGTAACAGGACTAGGCTTCCATATAAATGATGCACCTTCTTCGTTTTCTGATGTCTCAG 2272
| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 2170 ATGTCACAGGACTAGGCTTCCAAATATATGATGCACCTTCCTCGTTTTCTGATGTCTC-G 2228
Query 2273 -CCAGCCTTTCTTTCCGCGGCCAGCGCATTTTCCTGCATAACGCTAATGGTTGGTTTGGA 2331
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2229 ACCAGCCTTTCTTTCCGCGGCCAGCGCATTTTCCTGCATAATGCTAATGGTTGGTTTGGA 2288
Query 2332 AAGGTTCCTTTGGAGGCTTCTGGAGATTTCGGTATACATCCAGATGAGGGGGAGTTTCAT 2391
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2289 AAGGTTCCTTTGGAGGCTTCTGGAGATTTCGGTATACATCCAGATGAGGGGGAGTTTCAT 2348
Query 2392 CTGATGTGTCAGGTTCCCTATGTGGAAATTAATGCTTTGATGAAAACTTTCAAGATGAAG 2451
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2349 CTGATGTGTCAGGTTCCCTATGTGGAAATTAATGCTTTGATGAAAACGTTCAAGATGAAG 2408
Query 2452 CCCTTGTTTTTCCCGCTAGCTGGTTCTGTCACAGCTGTATTCAACTGTCAAGGCCCGCTT 2511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2409 CCCTTGTTTTTCCCGCTAGCTGGTTCTGTCACAGCTGTATTCAACTGTCAAGGCCCGCTT 2468
Query 2512 GATGCTCCCGTTTTTGTGGGAAGTTGCATGGTCTCTAGGAAGATAGCTTATCTGTCTCCA 2571
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2469 GATGCTCCCGTTTTTGTGGGAAGTTGCATGGTCTCTAGGAAGATAGCTTATCTGTCTCCA 2528
Query 2572 GATCTCCCTACATCTTTGGCATATGAGGCAATGCTGAAAAACAAGGAAGCTGGTGCAGTT 2631
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2529 GATCTCCCTACATCTTTGGCATATGAGGCAATGCTTAAAAACAAGGAAGCTGGTGCAGTT 2588
Query 2632 GCAGCATTTGACCGTGTTCCATTTTCTTATCTTTCTGCTAATTTCACATTTAACACTGAC 2691
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2589 GCAGCATTTGACCGTGTTCCATTTTCTTATCTTTCTGCTAATTTCACATTTAACACTGAC 2648
Query 2692 AACTGTGTTGCTGATTTATATGGTATTAGAGCTACCCTTGTTGATGGTGGGGAGATTCGA 2751
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2649 AACTGTGTTGCTGATTTATATGGTATTAGAGCTACCCTTGTTGATGGTGGGGAGATTCGA 2708
Query 2752 GGAGCAGGGAATGCTTGGATCTGTCCAGAGGGGGAGGTGGATGATACCGCACTGGATGTG 2811
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2709 GGAGCAGGGAATGCTTGGATCTGTCCAGAGGGGGAGGTAGATGATACCGCACTGGATGTG 2768
Query 2812 AACTTTTCAGGAAATATATCTTTTGATAAGGTTTTGCATCGTTATATGCCTGAATATTTT 2871
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 2769 AACTTTTCAGGAAATATATCTTTTGATAAGGTTTTGGATCGTTATATGCCTGAATATCTA 2828
Query 2872 AA-CATCGGGATG-CTGAAGTTGGGTGATTTAACTGGGGAAACAAAACTTTCTGGGGCCC 2929
|| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2829 AATC-TCGGG-TCACTGAAGTTGGGTGATTTAACTGGGGAAACAAAACTTTCTGGGGCCC 2886
Query 2930 TCTTGAAACCGAGGTTTGACATAAAATGGGCAGCCCCTAAAGCTGATGGCTCCTTGACTG 2989
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 TCTTGAAACCGAGGTTTGACATAAAATGGGCAGCCCCTAAAGCTGATGGCTCCTTGACTG 2946
Query 2990 ATGCTCGGGGAGATATTGTGATATCACATGATAATATCATTGTTAATTCATCCTCTGTTG 3049
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||
Sbjct 2947 ATGCTCGGGGAGATATTGTGATATCACATGATAATATCATCGTTAATTCATCGTCCATTG 3006
Query 3050 CTTTTGATCTATTCACAAAATTAGATACCTCATACC-ATGACCCTTGTTTGTCGCACCAA 3108
|||||||||||| | ||||| |||||||| |||||| | |||| |||||||| |||||
Sbjct 3007 CTTTTGATCTATACTCAAAACTAGATACCACATACCGA-GACCAGTGTTTGTCTAACCAA 3065
Query 3109 GACTTCACTCAAGGGGAGGCCATGCCATTTGTTGTTGAGGGGCTTGATTTGGATTTACGT 3168
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3066 GACTTCACTCAAGGGGAAGCCATGCCATTTGTTGTTGAGGGGCTTGATTTGGATTTACGT 3125
Query 3169 ATGCGTGGTTTTGAGTTTTTCAGCTTGGTCTCTTCCTATCCATTTGATTCACCACGACCT 3228
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 3126 ATGCGTGGTTTTGAGTTTTTCAGCTTGGTGTCTTCCTATCCATTTGATTCCCCAAGACCT 3185
Query 3229 ACACATTTAAAAGCAACAGGAAGGATCAAATTTCTGGGGAAGATAAAACGACACAGCACT 3288
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3186 ACACATTTAAAAGCAACAGGAAGGATCAAATTTCTTGGGAAGATAAAACGACACAGCACT 3245
Query 3289 ACAAAAGATGGAGATGTTGGGTCAGACAAATGTGAAGATGCAGCTGCAATTTCTAGCCTC 3348
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3246 ACAAAAGATGGAGAGGTGGGGTCAGACAAATGTGAAGATGCAGCTGCAATTTCTAGCCTC 3305
Query 3349 GATGGTGATATTTCCATTTCAAGTCTCAAGCTTAATCAGTTGATTTTGGCCCCTCAACTG 3408
|||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3306 GATGGTGAAATTTCCATCTCAAGTCTCAAGCTGAATCAGTTGATTTTGGCCCCTCAACTA 3365
Query 3409 TCTGGAC-GTTTGAGCGTTTCACGTGATCATGTTAAGCTTGATGCCGCGGGCCGACCAGA 3467
||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 3366 TCTGGACTGTT-GAGCGTTTCACGTGATCATGTTAAGCTTGATGCCGTGGGCCGGCCAGA 3424
Query 3468 TGAAAGTCTTACACTAGACTTTATAGGTCCACTACAGCCTAATTCTGACGAAAATGTACA 3527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3425 TGAAAGTCTTACACTAGACTTTATAGGTCCACTACAGCCTAATTCTGACGAAAATGTACA 3484
Query 3528 AAGTGGAAAGTTGCTCTCCTTTTCTCTTCAAAAGGGACAACTAAGAGCTAACGCTTGTTT 3587
|||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3485 AAGTGGAAAGTTGCTCTCATTTTCTCTTCGAAAGGGGCAACTAAGAGCTAACGCATGTTT 3544
Query 3588 TCAGCCACAACAGTCCGCTACTTTGGAGATACGCAATTTTCCACTTGATGAGTTGGAGTT 3647
||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3545 TCAACCACAACAGTCGGCTACTTTGGAGATACGCCATTTTCCACTTGATGAGTTAGAGTT 3604
Query 3648 GGCCTCACTGAGAGG-GTTGATTCAAAAGGCAGAGATTCAACTAAATCTTCAGAAGCGAA 3706
|||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3605 GGCCTCGCTGAGAGGAGT-GATTCAAAGGGCAGAGATTCAACTAAATCTTCAGAAGCGAA 3663
Query 3707 GAGGG-CATGGCCTGTTGTCTGTAATTCGGCCAAAGTTTAGTGGAGTTCTAGGTGAAGCT 3765
| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||
Sbjct 3664 G-GGGACATGGCCTGTTGTCTGTAATTCGGCCAAAATTTAGCGGGGTTCTAGGTGAAGCT 3722
Query 3766 TTAGATGTTGCAGTAAGATGGAGCGGTGACGTG 3798
||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3723 TTAGATGTTGCAGTAAGATGGAGCGGTGATGTG 3755
Score = 1903 bits (1030), Expect = 0.0
Identities = 1217/1307 (93%), Gaps = 13/1307 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAGTTTGAGATTGCAAAACCCTTTCCTTTCTACTCCTCTGCTTCATG-GTTCTTTCAA 59
||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 21 ATGAGCTTGAGATTGCAAAGCCCTTTTCTTTCTACTCCTCTGCTTCA-GAGTTCTTTCAT 79
Query 60 TCGCAGAGAGAAGAGAATCAATG-TAGCTAGAAGGGCGTTTCGTAGCAAGCGTATAT-AT 117
| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| |
Sbjct 80 TAGCAGAGAGAAGAGAATCAATGTTA-CTAGAAGGGCGTTTCGTAGAAAGAGTATATCA- 137
Query 118 TCGGAGAAGAAACAGAATGATTGGTTAGCTAAAGTTGCCAAATTTTCTCAATTTTGTGGG 177
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 138 TCGGAGAAGATACAGAATGATTGGTTAGCTAAAGTTGCCAAATTTTCTCAGTTTTGTGGG 197
Query 178 AAAAATGTGCAATTGCTTAGGAAGTCTCTTGATTCTAGAAGTAGAATGGAAGTTAAATGT 237
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 198 AAAAATGTACAATTGCTTAGGAAGTCTCTTGATTCTAGAAGTAGAATGGAGGTTAAATGT 257
Query 238 TTGAAAGAGCCTTTCGTACGAAGCAA-GGATTTGGTTAGGTCTTTGGCTCCTGTTTGGGA 296
|||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 258 TTGAAAGATCCTTTTTTACGAAGCAAGGGA-TTGGTTAGGGCTTTGGCTCCTGTTTGGGA 316
Query 297 AGAGGGTTTGTTTTTCTTGAGGTGTTCTGTGTTCTTTGCTGTTATCTCTGGGGTTTGTTT 356
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 317 AGAGGGTTTGTTTTTCTTGAGGTGTTCTGTTTTCTTTGCTGTTATCTCTGGGGTTTGCTT 376
Query 357 ATTGGTGTGGTATGGACAGAACAAGGCTCGTGTTTTTGTTGAGACTAAGCTTTTGCCATC 416
||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 377 GTTGGTGTGGTATGGACAAAATAAGGCTCGTGCTTTTGTTGAGACTAAGCTTTTGCCATC 436
Query 417 TGTTTGCTCTGTGCTTAGTGAGACTATTCAGCGTGAGGTTGATTTTGGAAAGGTTAGAAG 476
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 437 AGTTTGCTCTGTGCTTAGTGAGACTATTCAGCGTGAGGTTGATTTTGGAAAGGTTAGAAG 496
Query 477 AGTTTCACCATTGTGCATTACACTTGAAGCAAGCTCCATTGGTCCTCATGGTGAAGAGTT 536
||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 497 AGTTTCACCATTGTGTATAACTCTTGAAGCGAGCTCTATTGGTCCTCATGGTGAAGAGTT 556
Query 537 TTCCTGTGGTGAGGTTCCGACTATGAAAGTTTGTGTCCGTCCTTTTGCTAGTCTTAGGAG 596
||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 557 TTCGTGTGGTGAAGTTCCGACTATGAAACTTTGTGTCCGTCCTTTTGCTAGTCTTAGGAG 616
Query 597 GGGAAAGATTGTGGTTGATGCGATTCTAAGTAATCCAACAGTTTTGGTTGCACAAAAGAA 656
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 617 GGGAAAGATTGTGGTTGATGCGATTTTAAGTAATCCAACAGTTTTGGTTGCACAAAAGAA 676
Query 657 AGATTTTACATGGTTAGGGATACCTCTATCTGACACTACTTTGCCAAGCCATTTGTCATC 716
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 677 AGATTTTACATGGTTAGGGATACCTTTATCTGACACTACTTTGCCAAGCCATTTGTCCTC 736
Query 717 TGAAGAAGGGATTGATTTTCGCACCAAAACTAGGAGAGTTTCAAGGGAGGAAGCAGGGAT 776
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||
Sbjct 737 TGAAGAAGGGATTGATTTTCGCACCAAAACTCGGAGAATTTCAAGGGAGGAAGCTGGGAT 796
Query 777 CCGTTGGGATGAAGAAAGGGATAATGATGCAAGAAAAGCTGCAGAGATAGGCTATATCGT 836
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 797 CCGTTGGGATGAAGAAAGGGATAATGATGCAAGAAAAGCTGCAGAGATGGGCTATATTGT 856
Query 837 TCCTTGTAAGAATTACT-CTCAAGCTAAAGATAATGCGGTGAAGCACGACAGGCGTTTTA 895
|||||||||||||| || |||||| ||||||| || |||||||||| |||| |||||
Sbjct 857 TCCTTGTAAGAATT-CTTCTCAAGTTAAAGATGTTG---TGAAGCACGATAGGCATTTTA 912
Query 896 CGGAAATTGCAAATCCCAACTCCTTTATTTGCATGGATGAAAAGATGCATTCAGCTGAGC 955
| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |
Sbjct 913 CTGAAATAGCAAATCCCAACTCGTTTATTTGCATGGATGAAAAGATGCATTTAGCAGACC 972
Query 956 AACATTGCATGGACCCAGGTGTTGAGTATGATGTGAAGCATGCTGAATTGGAGAAATCAT 1015
||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 973 AACATTGCATGGATCCAGGTGTTGATTATGACGTGAAGCATGCTGAATTGGAGAAACCAT 1032
Query 1016 TTGGCATAAAAATTCCTGGTTCAGGGCTCAAGTTCTTGTCCAAAATGTTAAAAGTCCCGA 1075
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||
Sbjct 1033 TTGGCATAAAAATTCCTGGTTCAGGACTCAAGTTCTTGTCCAAAATTTTAAAGGTTCCGA 1092
Query 1076 GGAAGTACAAATTCAAATGGAATTCAAAATCACATAAGAATTCAATGTCTAATATTAGTG 1135
||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||
Sbjct 1093 GGAAGTACAAATTTAAGTGGAATTCAAAATCACACAATAATTCAATGTCTGATATTAGTG 1152
Query 1136 CAAAGAAGAGAATTCTTGAGCGCAGTGCTTCAGCAGCTCTATCTTATTTCCACAGTCTAT 1195
|||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||
Sbjct 1153 CAAAGAAGCGAATTCTTGATCGCAGTGCTTCAGCAGCTCTATCGTATTTCTACAGCCTAT 1212
Query 1196 CACAACAAAAGCTTGACGAGCCTTCAGTGTTATCAACAAATTATGATGGGTTGAGTTTGG 1255
|||||||||||| ||||||||||||||| | ||| || ||||||||| |||||||||||
Sbjct 1213 CACAACAAAAGCCTGACGAGCCTTCAGTATCATCCGCAGATTATGATGAGTTGAGTTTGG 1272
Query 1256 ATATGCTATTAGTTAAAGGTGATAGAGAAATCAGTAATCAATATGAT 1302
|||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1273 ATATGCTATTAGTTAAAGGTGAGAAAGAAACCAGTAATCAATATGAT 1319
> Ahg932726 jgi|Araly1|932726|scaffold_400714.1
Length=979
Score = 1482 bits (802), Expect = 0.0
Identities = 837/854 (98%), Gaps = 2/854 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4129 CAAAATCTCTGTCTACAAGCTGAAAATCTTCGAGACTTGCTTGAGGAGATACGTGGGTAT 4188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 36 CAAAATCTCTGTCTACAAGCTGAAAATCTTCGAGACTTGCTCGAGGAGATACGTGGGTAT 95
Query 4189 TATACTCCACCAAGTGAAGTCGTTCTTGAAGATCTAAGTCTTCCAGGTTTAGCTGAGCTC 4248
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 96 TATACTCCACCAAGTGAAGTCGTTCCTGAAGATCTAAGTCTTCCAGGTTTAGCTGAGCTC 155
Query 4249 AAGGGTCATTGGCATGGTTCGCTTGATGCTAGTGGTGGAGGCAATGGAGACACTTTGGCC 4308
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 156 AAAGGTCATTGGCATGGTTCGCTTGATGCTAGTGGTGGAGGCAATGGAGACACTTTGGCC 215
Query 4309 GAATTTGACTTCCATGGAGATGATTGGGAGTGGGGGACTTACAAAACACAGCGTGTTCTG 4368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 216 GAATTTGACTTCCATGGAGATGATTGGGAGTGGGGGACTTACAAAACACAGCGTGTTCTG 275
Query 4369 GCTACTGGTTCGTATAACAATGATGATGGTTTACGTCTTAAGGAGATGCTCATTCAAAAA 4428
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 276 GCTACTGGTTCGTATAGCAATGATGATGGTTTACGTCTTAAGGAGATGCTTATTCAAAAA 335
Query 4429 GGAAACGCTACACTGCACGCAGATGGGACCTTATTGGGGCCAAAAACAAATCTTCATTTT 4488
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 336 GGAAACGCTACACTGCATGCAGATGGGACCTTATTGGGGCCAAAAACCAATCTTCATTTT 395
Query 4489 GCTGTTCTGAATTTCCCTGTTAGTTTGATACCTACCTTGGTTGAGGTTGTTGAATCATCA 4548
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 396 GCTGTTCTGAATTTCCCTGTTAGTTTGATACCTACCTTGGTTGAGGTTGTTGAATCATCA 455
Query 4549 GCTACTGATATTGTTCACTCTTTGAGGAAACTCTTGTCACCAATCAAAGGCATTTTGCAC 4608
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 456 GCTACTGATCTTGTTCACTCTTTGAGGAAACTCTTGTCACCAATCAAAGGCATTTTGCAC 515
Query 4609 ATGGAAGGGGATCTTAGAGGGAGTCTTGAAAAACCAGAATGTGATGTACAAGTTAGGTTA 4668
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 516 ATGGAAGGGGATCTTAGAGGGAGTCTTGAAAAACCAGAATGTGATGTACAAGTTAGATTA 575
Query 4669 TTGGATGGTGCTGTTGGTGGTATAGACCTTGGACGAGCTGAAGTTTTTGCTTCTCTTACA 4728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 576 TTGGATGGTGCTGTTGGTGGTATAGACCTTGGACGAGCTGAAGTTTTTGCTTCTCTTACA 635
Query 4729 TCTAACAGTCGTTTTCTTTTCAACTCCAACTTTGAACCATTTGTCCAAAATGGTCATGTC 4788
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 636 TCTAACAGTCGTTTTCTTTTCAACTCCAACTTTGAACCATTTGTCCAAAATGGTCATGTC 695
Query 4789 CATATACAAGGAAGTGTTCCTGTTAGCTTTTCGCAGAAAAATAT-GTCTGAAGGAGAAGT 4847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||
Sbjct 696 CATATACAAGGAAGTGTTCCTGTTAGCTTTTCGCAGAAAAA-ATTGTCTGAGGGAGAAGA 754
Query 4848 CAGCGAAACAGATAGAGGTGGTGCAGTGAAAATCCCGAGTTGGGCAAAAGAGAAGGAAGA 4907
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 755 CAGCGAAACAGATAGAGGTGGTGCAGTGAAAATCCCTAGTTGGGCAAAAGAAAAGGAAGA 814
Query 4908 TGATGAGAAGAGAACCTCAAGGGATAGGAGCGAAGAGAGATGGGACAGCCAACTAGCTGA 4967
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 815 TGATGAGAAGAGAACCTCAAGGGATAGGAGCGAAGAGAGATGGGATAGCCAACTAGCTGA 874
Query 4968 GAGTCTCAAGGGTT 4981
|||||||||| |||
Sbjct 875 GAGTCTCAAGTGTT 888
> Ahg932725 jgi|Araly1|932725|scaffold_400713.1
Length=881
Score = 1103 bits (597), Expect = 0.0
Identities = 647/672 (96%), Gaps = 0/672 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 5683 GAAGTGAAAATGAAACCAAATATGGATATCCGTCTGAGTGATATGAAACTTGTTTTAGGA 5742
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 GAAGTGAAAATAAAACCAAATATGGATATCCGTCTGAGTGATATGAAACTTGTTTTAGGA 60
Query 5743 CCAGAGCTGAGGATAATGTACCCTTTAATTCTTAATTTTGCTGTTAGTGGTGAGCTTGAA 5802
||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 61 CCAGAGCTGAGGATAGTGTATCCTTTAATTCTTAATTTTGCTGTGAGTGGTGAGCTTGAA 120
Query 5803 CTTGATGGCATGGCTCATCCAAAATTTATCAAACCAAAGGGTGTCCTAACATTCGAAAAC 5862
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 121 CTTGATGGCATGGCTCATCCAAAATTTATCAAACCAAAGGGTGTCCTGACATTCGAGAAT 180
Query 5863 GGAGATGTCAATCTTGTGGCTACTCAGGTACGTCTGAAGAGGGAGCATCTCAACGTTGCA 5922
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 181 GGAGATGTCAATCTTGTGGCTACTCAGGTACGCCTGAAGAGGGAGTATCTCAACGTTGCA 240
Query 5923 AAGTTTGAGCCTGAACATGGACTAGATCCTCTGCTAGATTTAGCCTTAGTTGGTTCAGAA 5982
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AAGTTTGAGCCTGAACATGGACTAGACCCTCTGCTAGATTTAGCCTTAGTTGGTTCAGAA 300
Query 5983 TGGCAATTTAGGGTTCAAAGTCGTGCCAGTAATTGGCAGGACAAACTTGTCGTGACTTCA 6042
|||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 301 TGGCAATTTAGGGTCCAAAGTCGTGCCAGCAATTGGCAGGAAAAACTTGTGGTGACTTCA 360
Query 6043 ACACGTTCTGTTGAACAGGATGCTCTCTCACCTTCGGAGGCTGCAAAGGTGTTTGAGAGC 6102
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 ACTCGTTCTGTGGAACAGGATGCTCTCTCACCTTCCGAGGCTGCAAAGGTGTTTGAGAGC 420
Query 6103 CAATTAGCAGAATCCATATTAGAAGGAGATGGACAACTTGCTTTCAAAAAACTTGCAACC 6162
|||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CAATTAGCAGAATCAATACTAGAAGGAGATGGACAACTTGCTTTCAAAAAACTTGCAACC 480
Query 6163 GCAACACTTGGAACCATAATGCCAAGGATAGAAGGAAAAGGAGAGTTTGGTCAGGCGAGA 6222
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GCAACACTTGAAACCATAATGCCAAGGATAGAAGGAAAAGGAGAGTTTGGTCAGGCGAGA 540
Query 6223 TGGAGGTTGGTGTATGCTCCGCAGATCCCAAGTTTACTCTCTGTTGATCCAACTGTGGAT 6282
||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 541 TGGAGGTTGGTGTATGCCCCACAGATCCCAAGTTTACTCTCTGTTGATCCAACTGTTGAT 600
Query 6283 CCTCTCAAGTCTCTGGCGAGCAACATATCATTTGGAACGGAAGTTGAAGTGCAGCTCGGA 6342
|||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 CCTCTCAAGTCTTTGGCAAGCAACATATCATTTGGAACGGAAGTTGAAGTGCAGCTCGGA 660
Query 6343 AAACGTCTTCAG 6354
||||||||||||
Sbjct 661 AAACGTCTTCAG 672
Score = 268 bits (145), Expect = 3e-70
Identities = 165/174 (95%), Gaps = 3/174 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 6348 TCTTCAGGCCTCTGTGGTAAGACAGATGAAAGATTCTGAGATGGCAATGCAATGGACACT 6407
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 708 TCTACAGGCCTCTGTGGTAAGACAGATGAAAGATTCTGAGATGGCGATGCAATGGACACT 767
Query 6408 TATTTACCAGCTCACGAGCCGCTTGCGTGTCCTTCTGCAATCTGCACCTTCCAAACGTTT 6467
||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 768 TATCTATCAGCTCACAAGCCGCTTGCGTGTCCTTCTGCAATCTGCACCTTCCAAACGTTT 827
Query 6468 GCTTTTTGAATACTCTGCTACATCACAAGACTAAAT--CCTTTT-GTCTTCCTC 6518
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||
Sbjct 828 GCTTTTTGAATACTCTGCTACATCACAAGACTAAAAAGCCTTTTTGTCTTCCTC 881
> Ahg932727 jgi|Araly1|932727|scaffold_400715.1
Length=1310
Score = 505 bits (273), Expect = 2e-141
Identities = 277/279 (99%), Gaps = 0/279 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3830 TGATCACTGTTGAGAAAACTATTCTGGAACAAAGCAATAGCCGGTATGAGCTTCAAGGTG 3889
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 992 TGATCACTGTTGAGAAAACTATTCTGGAACAAAGCAATAGCCGGTATGAGCTTCAAGGTG 1051
Query 3890 AATATGTATTGCCGGGTTCCCGTGACCGAGACCTTGGTCAGAAGGAAGCTGGCAGTTTTT 3949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1052 AATATGTATTGCCGGGTTCCCGTGACCGAGACCTTGGTCAGAAGGAAGCTGGCAGTTTTT 1111
Query 3950 TAATGAGAGCCATGACTGGTCATCTAGGAAGTGTTATATCCTCCATGGGAAGATGGAGAA 4009
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1112 TTATGAGAGCCATGACTGGTCATCTAGGAAGTGTTATATCCTCCATGGGTAGATGGAGAA 1171
Query 4010 TGAGACTTGAAGTGCCTAAGGCAGAGGTTGCTGAGATGCTTCCTCTTGCAAGGCTTCTTT 4069
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1172 TGAGACTTGAAGTGCCTAAGGCAGAGGTTGCTGAGATGCTTCCTCTTGCAAGGCTTCTTT 1231
Query 4070 CAAGAAGTACAGATCCAGCTGTTCACTCAAGATCAAAGG 4108
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1232 CAAGAAGTACAGATCCAGCTGTTCACTCAAGATCAAAGG 1270
Score = 211 bits (114), Expect = 5e-53
Identities = 120/123 (98%), Gaps = 0/123 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3676 GCAGAGATTCAACTAAATCTTCAGAAGCGAAGAGGGCATGGCCTGTTGTCTGTAATTCGG 3735
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 871 GCAGAGATTCAACTAAATCTTCAGAAGCGAAGAGGACATGGCCTGTTGTCTGTAATTCGG 930
Query 3736 CCAAAGTTTAGTGGAGTTCTAGGTGAAGCTTTAGATGTTGCAGTAAGATGGAGCGGTGAC 3795
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 931 CCAAAATTTAGTGGAGTTCTAGGTGAAGCTTTAGATGTTGCAGTCAGATGGAGCGGTGAC 990
Query 3796 GTG 3798
|||
Sbjct 991 GTG 993
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 256013293571
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5