BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G25730.2
Length=8028
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg932741 jgi|Araly1|932741|scaffold_400729.1 5147 0.0
> Ahg932741 jgi|Araly1|932741|scaffold_400729.1
Length=7349
Score = 5147 bits (2787), Expect = 0.0
Identities = 2970/3060 (97%), Gaps = 6/3060 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4619 AGGTAGAAGCCGAATGTAAAGAAGACCCTGAAGGCTTGGCTCTAAGATTGGCTGGGAAAG 4678
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4286 AGGTAGAAGCCGAATGTAAAGAAGACCCTGAAGGCTTGGCTCTAAGATTGGCTGGGAAAG 4345
Query 4679 GAGCTGTTTCCGCTGCGCTAGAAGTGGCTGAAAGTGCAGGATTATCAATAGATCTTAGAA 4738
||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4346 GAGTTGTTTCCGCTGCGCTAGAAGTCGCTGAAAGTGCAGGATTATCAATAGATCTTAGAA 4405
Query 4739 GAGAATTACAAGGACGGCAGCTTGTAAAGCTTCTAACCACTGATCCACTCAATGGTGGTG 4798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4406 GAGAATTACAAGGACGGCAGCTTGTAAAGCTTCTAACCACTGATCCACTCAATGGTGGTG 4465
Query 4799 GTCCGGCGGAAGCATCTCGGTTTTTATCTTCACTTCAAGACTCGGCTGATGCTCTACCAG 4858
|||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4466 GTCCTGCTGAAGCGTCTCGATTTTTATCTTCACTTCAAGACTCGGCTGATGCTCTACCAG 4525
Query 4859 TGGTTATGGGTGCAATGCAATTATTACCTGACCTTCGGTCGAAACAGCTCCTGGTCCATT 4918
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 4526 TGGTTATTGGTGCAATGCAGTTATTACCTGACCTTCGTTCAAAACAGCTCCTGGTCCATT 4585
Query 4919 TCTTTCTCAAGCGAAGAGATAGCAATCTGTCGGATTTGGAAGTCGCCCGGCTTAATTCTT 4978
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |
Sbjct 4586 TCTTTCTCAAGCGAAGAGATAGCAATCTGTCGGATTTGGAAGTCACCAGGCTTAATTCCT 4645
Query 4979 GGGCTTTAGGTCTGAAAGTGTTAGCTGCATTACCACTTCCTTGGCAACAGAGATGCTCTT 5038
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4646 GGGCTTTAGGTCTAAAAGTGTTAGCTGCATTACCACTTCCTTGGCAACAGAGATGCTCTT 4705
Query 5039 CGCTTCATGAGCATCCCAATTTAATATTTGAAGCTCTGCTAATGAGAAAACAATTACAAT 5098
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4706 CGCTTCATGAGCATCCCAATTTAATACTTGAAGCTCTGCTAATGAGAAAACAATTACAAT 4765
Query 5099 ACGCCTCACTGATACTCAAAGAGTTCCCAGCATTAAGAGATAACAATGTTATCATGGCCT 5158
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4766 ACGCCTCACTGATACTCAAAGAGTTCCCAGCATTAGGAGATAACAATGTTATCATGGCCT 4825
Query 5159 ATGCAGCAAAAGCTATTTCTGTGACAATTATCCCACCACCAAGAGAACCTCGAATAACTG 5218
||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4826 ATGCAGCCAAAGCTATTTCTGTTACAATTAGCCCACCACCAAGAGAACCTCGAATAACTG 4885
Query 5219 TGTCTGCGTCAAGGTTAAGACAGAAATCAAGAGCAGGGCCAGCAGTAAAAGCATCCTTCA 5278
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4886 TGTCTGCATCAAGGTTAAGACAGAAGTCAAGAGCAGGGCCAGCAGTAAAAGCATCCTTCA 4945
Query 5279 CTAGTAGCTTAAGCAATTTTCAGAGAGAGGCTCGAAGGGCATTCTCATGGGCTCCACGTA 5338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||
Sbjct 4946 CTAGTAGCTTAAGCAATTTTCAGAGAGAGGCTCGAAGGGCATTTTCATGGACTCCACGTA 5005
Query 5339 ATGCTGAAAACCGGACGACGTCAAAGGATGTTTATCGCAAAAGAAAGAATTCCGGACTGG 5398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 5006 ATGCTGAAAACCGGACGACGTCAAAGGATGTTTATCGTAAAAGAAAGAATTCCGGACTGG 5065
Query 5399 GGGCTTCTGAGAGAGCTGCATGGGAGGCGATGACAGGTATTCAAGAGGACCAGGGATCAT 5458
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 5066 GAGCTTCTGAGAGAGCTGCATGGGAGGCGATGACAGGTATTCCAGAGGACCAGGGATCAT 5125
Query 5459 CTTATTCGGCAGATGGGCAAGATAGGCTACCTTCTGTTTCTATTGCTGAAGAATGGATGC 5518
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5126 CTTATTCGGCAGATGGACAAGATAGGCTACCTTCTGTTTCTATTGCTGAAGAATGGATGC 5185
Query 5519 TAACTGGCGACAAAACCAAAGATGAAGGTGTTCGTGCATCTCACAAGTATGAAAGCACCC 5578
|||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 5186 TAACTGGCGACACAACCAAAGATGAAGCTGTTCGTGCATCTCACAAATATGAAAGCACCC 5245
Query 5579 CCGATATTATTCTCTTTAAGGCTCTACTATCACTTTGTTCAGATGAGCTAGTATCAGCAA 5638
| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5246 CAGATATTATTCTCTTCAAGGCTCTACTATCACTTTGTTCAGATGAGCTAGTATCAGCAA 5305
Query 5639 GAAGTGCCATGGACCTATGCATCAGTCAAATGAAAAACGTATTGAGCTCCAAACAGTTGT 5698
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5306 GAAGTGCCATGGACCTATGCATCAGTCAAATGAAAAACGTATTGAGCTCCAAACAGTTGT 5365
Query 5699 CAGAGGGTGCGTCTGTTGAAACAATTGGCCGAGCATATCATGCAACGGAGGCATTTGTGC 5758
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 5366 CAGAGGGTGTGTCTGTTGAAACAATTGGCCGAGCATATCATGCGACAGAGGCATTTGTGC 5425
Query 5759 AGGGTTTGTCGTATGCAAAATCATTGCTGAGAAAGCTTCTAGGTACCACTGAATCGACCA 5818
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 5426 AGGGTTTGTCATATGCAAAATCTTTGCTGAGAAAGCTTCTAGGTGCCACTGAATCGACCA 5485
Query 5819 ATAACAATGGTGAAAGAAGTAGAGATGTTGATGATATATCTTCTGATGCTGGCAGCTCCA 5878
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5486 ATAACAATGGTGAAAGAAGTAAAGATGTTGATGATATATCTTCTGATGCTGGCAGCTCCA 5545
Query 5879 GTGTTGGCAGTCAGTCAACGGATGAACCATCGGATGTTCTCTCACTTACAGAAATCTGGT 5938
|||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5546 GTGTTGGCAGTCAGTCAATGGATGAACCATCCGAAGTTCTCTCACTTGCAGAAATCTGGT 5605
Query 5939 TGGGGCGCGCAGAGTTGCTGCAGAGCCTCTTAGGGTCTGGAATTTCTACTTCTCTTGATG 5998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5606 TGGGGCGCGCAGAGTTGCTGCAGAGCCTCTTAGGGTCTGGAATTTCTGCTTCTCTTGATG 5665
Query 5999 ACATTGCTGATCAATTGTCATCCGAATGTCTACGAGACAGATTAATATCTGATGAACGAT 6058
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5666 ACATTGCTGATCAATTGTCATCCGAATGTCTACGAGACAGATTAATATCTGAGGAACGAT 5725
Query 6059 ATAGTATGGCGGTGTATATGTGCAAGAAATGCAAGATTGATGTTTTCCCCGTGTGGAAAG 6118
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5726 ATAGTATGGCGGTGTATATGTGCAAAAAATGCAAGATTGATGTTTTCCCCGTATGGAAAG 5785
Query 6119 CATGGGGTCTTGCTTTGTTACGGATGGAGCGCTATGCTCAAGCTCGAGTCAAATTCAAGC 6178
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5786 CATGGGGTCTTGCTTTGTTACGGATGGAGCGCTATGCTCAAGCTCGAGTCAAATTCAAGC 5845
Query 6179 AAGCCTTTCAATTAAAGGGGGAAGACATTCCTGATGTCATTCAGGAGATAATAAATACAA 6238
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5846 AAGCCTTTCAATTAAAAGGGGAAGACATTCCTGATGTCATTCAGGAGATAATCAATACAA 5905
Query 6239 TAGAAGGAGGTCCGCCTGTGGATGTGTCAATTGTACGTTCCATGTATGACCATTTGGCGA 6298
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5906 TAGAAGGAGGTCCGCCTGTGGATGTGTCAATTGTTCGTTCCATGTATGACCATTTGGCGA 5965
Query 6299 AAAGCGCACCTACAATTTTGGACGATTCTTTATCAGCAGACTCATACCTAAATGTTCTGC 6358
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 5966 AAAGCGCGCCAACAATTTTGGACGATTCTTTATCAGCAGACTCATACCTGAATGTTCTGC 6025
Query 6359 ATATGCCATCCACTTTCCCTCGTTCAGAGAGGTCGCGGAGATCTCTGGAATCGGAAAAGA 6418
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||
Sbjct 6026 ATATGCCATCCACTTTCCCTCGTTCAGAGAGGTCGAGGAGATCTCTGGAATCAGAAAAGA 6085
Query 6419 ATAGTTCTGTACCTGGTTCAGACTTTGAAGATGGGCCCCGAAGCAACTTGGATACTACAC 6478
||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6086 ATAATTCTGTACCTGGTTCAGACTTTGAAGATGGCCCCCGAAGCAACTTGGATACTACAC 6145
Query 6479 GCTATTCTGAGTGCACCAACTACTTGCAGGAACATGCTCGCCAAAACCTGCTTGGGTTTA 6538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6146 GCTATTCTGAGTGCACCAACTACTTGCAGGAACATGCTCGCCAAAACCTGCTTGGGTTTA 6205
Query 6539 TGTTCCGCCATGGTCACTTTAAAGATGCATGCATGTTATTCTTTCCGCAAAGTGGTCTTC 6598
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 6206 TGTTCCGCCATGGTCACTATAAAGATGCATGCATGTTATTCTTTCCGCAAAGTGCTCTTC 6265
Query 6599 CCCCTCCTTTGCAAACTTCATCTGTGGGCGCAGTAAGCACATCTTCATCACCTCAACGAA 6658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 6266 CCCCTCCTTTGCAAACTTCATCTGTGGGCGCAGTAAGCATATCTTCATCACCTCAACGAA 6325
Query 6659 CTGATCCCTTGGCAACTGAATATGGGACCATTGAAAGTTTGTGCGAGTTCTGTGTTGGTT 6718
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 6326 CTGATCCCTTGGCAACTGAATATGGGACTATTGAAAGTTTGTGCGAGTTTTGTGTCGGTT 6385
Query 6719 ATGGAGCTATCTCATCCCTTGAGGAAGTAATTACAGAAAGACTTGAATCCGCAAAGAATC 6778
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 6386 ATGGAGCTATCTCATCCCTTGAGGAAGTAATTACAGAAAGACTTGAATCCGCAAAGCATC 6445
Query 6779 AAGATCAAGCCATAAATCAGTACATAGCTGGAGCTCTTACTCGTATCTGTGCTTTCTTTG 6838
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||
Sbjct 6446 AAGATCAAGCCATAAATCAGTACATAGCTGGAGCCCTTACTCGTATCTGTGCATACTTTG 6505
Query 6839 AGATCAACCGGCATTTCAATTACCTATACAAGTTTCTGGTACTCAAGAAGGATTATGTCA 6898
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6506 AGATCAACCGGCATTTCAATTATCTATACAATTTTCTGGTACTCAAGAAGGATTATGTCA 6565
Query 6899 CCTCTGGGTATTGTTGTATTCAGCTTTTTATGAATTCTACAACTCAGGAGGATGCTGTAA 6958
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6566 CCTCTGGGTATTGCTGTATTCAGCTTTTTATGAATTCTACAACTCAGGAGGATGCTGTAA 6625
Query 6959 GGCATCTTGAGCATGCAAAGGCACACTTTGAAGAAGCATTGACAGCGCGTCATAGAGGTT 7018
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 6626 AGCATCTTGAGCATGCAAAGGCACACTTTGAAGAAGCATTGACGGCGCGTCATAGAGGTT 6685
Query 7019 CAGACTC-aaaaaaaCTTGTTACAAAGGGTGTTAGAGGAAAAAGTGCCGCAGAGAAGCTG 7077
||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 6686 CAGACTCGAAAAAAA-TTGTTACAAAGGGTGTTAGAGGAAAAAGTGCCGCGGAGAAGCTG 6744
Query 7078 AGTGAAGAAACTCTTGTTA-AGTTGTCCTCACGGGTGAAAATGCAGATTGATGTGGTGAA 7136
||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6745 AGTGAAGAAACTCTTGTTACA-TTGTCCTCACGGGTGAAAATGCAGATTGATGTGGTGAA 6803
Query 7137 GTCCTTCAGTGACTCTGAAGGAGCACCATGGAAGCATTCCTTGTTTGGAAATCCAAATGA 7196
||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6804 GTCGTTCAGTGACTCTGAAGGACCACCATGGAAGCATTCCTTGTTTGGAAATCCAAATGA 6863
Query 7197 T-TCAGAGACATCCAGGAGAAGATGTGAAATAGTGGAGACTCTTGTTGAGAAAAATTTCG 7255
| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6864 TAT-AGAGACATCCAGGAGAAGATGTGAAATAGTGGAGACTCTTGTTGAGAAAAATTTCG 6922
Query 7256 ACTTAGCTTATTCTGTTATATATGAATTCAAGCTCTCAGCTGTTGATATATATGCTGGTG 7315
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6923 ACTTAGCTTATTCAGTTATATATGAATTCAAGCTCTCAGCTGTTGATATATATGCTGGTG 6982
Query 7316 TTGCTACGTCACTAGCTGATAGGAAGAAAGGCAGTCAGTTGACAGAACTTTTCAAAAACA 7375
|||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6983 TTGCTACGTCACTAGCCAATAGGAAGAAGGGCAGTCAGTTGACAGAACTTTTCAAAAACA 7042
Query 7376 TTAAGGGAACAATCCAGGATGATGACTGGGATCAGGTCCTGGGTGCTGCCATCAATATAT 7435
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 7043 TTAAGGGAACAATCCAGGATGATGACTGGGATCAGGTCCTGGGTGCTGCCATCAATGTAT 7102
Query 7436 ATGCCAACAAGCACAAAGAGCGCCCTGACCGTCTCATCGACATGTTAACAAGCAGCCATC 7495
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 7103 ATGCCAACAAGCACAAAGAGCGTCCTGACCGTCTCATTGACATGTTAACAAGCAGCCATC 7162
Query 7496 GAAAGGTGCTGGCTTGTGTGGTATGTGGCCGCCTGAAAAGCGCATTCCAGATTGCATCTA 7555
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 7163 GAAAGGTGCTGGCTTGTGTGGTATGTGGCCGCCTGAAAAGTGCATTCCAGATTGCATCTA 7222
Query 7556 AAAGCGGAAGCGTGGCTGATGTTCAATATGTAGCTCATCAAGCCTTACATGCCAATTCGC 7615
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7223 AAAGCGGAAGCGTGGCTGATGTTCAATATGTAGCTCATCAAGCCTTACATGCCAATTCGC 7282
Query 7616 ACACAGTACTCGATATGTGCAAGCAATGGCTAGCTAAATACATGTAAAGCCCTGTAATCT 7675
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7283 ACACAGTACTCGATATGTGCAAGCAATGGCTAGCTCAATACATGTAAAGCCCTGTAATCT 7342
Score = 2780 bits (1505), Expect = 0.0
Identities = 1603/1651 (97%), Gaps = 4/1651 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2812 TCTCAAGTTATGTTATCGGAAATTTACCCTGGAGGAGCTCCGAAGGTGGGGTTTACTTAC 2871
||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2539 TCTCAAGTTATGTTATCAGAAATTTACCCTGGAGGATCTCCAAAGGTGGGGTTTACTTAC 2598
Query 2872 TGGGATCAGGTCCACGAAGTTGCAATAATTTCTGTATTGCGAAGGATCTTAAAGCGTCTG 2931
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 2599 TGGGATCAGGTCCACGAAGTTGCAATAATCTCTGTATTGCGAAGGATCCTAAAGCGCCTG 2658
Query 2932 CAGGAATTCCTTGAACAGGATGACCCTCAAATTCTTCAAGCCAGTTTTAGTGGAGATACC 2991
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2659 CAGGAATTCCTTGAACAGGATAACCCTCAAATTCTTCAAGCCAGTTTTAGTGGAGATACC 2718
Query 2992 ATAATTTCATCTTGCACGGAATCTCATAGACAGGGACAAAAAGATCGTGCTCTTGCAATG 3051
|||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2719 ATAATTTCATCTTGTATGGAATCTCATAGACAGGGACAAAAAGATCGTGCTCTTGCGATG 2778
Query 3052 CTACATCAAATGATTGAGGATGCTCATAGGGGCAAGCGTCAGTTCCTGAGTGGTAAGCTT 3111
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2779 CTACATCAAATGATTGAGGATGCTCATAGGGGCAAGCGACAGTTCCTGAGTGGTAAGCTT 2838
Query 3112 CATAACTTAGCGAGAGCACTCGCTGATGAAAAACCAGAAGTTGACGTACTCAAAGGGGAC 3171
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2839 CATAACCTAGCGAGAGCACTCGCTGATGAAAAACCAGAAGTTGACGTACTCAAAGGGGAT 2898
Query 3172 GGATCAGACATGGCCGTTGAGAAGGATGGAGTTCTTGGTCTTGGGCTAAAATATACAAAG 3231
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2899 GGATCAGACATGGCCATTGAGAAGGATGGAGTTCTTGGTCTTGGGCTAAAATATACAAAG 2958
Query 3232 CAAAGTCCTGGTTCAGCAAATAGAGCCGTGGATGGAAATCCTGTTTCACATGAAACAGAA 3291
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||
Sbjct 2959 CAAAGTCCTGGTTCAGCAAATAGAGACGTGGATGGAAATCCTGCTTCCCATGAAACAGAA 3018
Query 3292 GACAAGGGAAAGAAGTCATTTGGCCCATTAAGCAACAAAACCTCTACTTATCTATCTCAG 3351
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3019 GACAAGGAAAAGAAGTCATTTGGCCCATTAAGCAACAAAACCTCTACTTATCTATCTCAG 3078
Query 3352 TTTATCCTCTATACTGCTGCTATTGGTGATATAGTAGATGGAACTGACACAACCCATGAT 3411
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3079 TTTATCCTCTACACTGCTGCTATTGGTGACATAGTAGATGGAACTGATACAACCCATGAT 3138
Query 3412 TTCAACTTTTTCTCTCTTGTTTATGAATGGCCTAAAGACCTATTGACGCGTCTGGTTTTT 3471
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3139 TTCAACTTTTTCTCTCTTGTTTATGAATGGCCTAAAGACCTATTGACGCGTCTGGTTTTT 3198
Query 3472 GATCGAAGTAGCACAGATGCAGCTGCAAAAGTTGCTGAGGTTATGTCTGCTGATTTTGTT 3531
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3199 GATCGAAGTAGCACAGATGCAGCTGCAAAAGTTGCTGAGGTCATGTCTGCTGATTTTGTT 3258
Query 3532 CATGAAGTGATATCAGCATGTGTTCCCCCAGTTTATCCCCCACGTTCTGGTCATGGGTGG 3591
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3259 CATGAAGTGATATCAGCATGTGTTCCTCCAGTTTATCCTCCACGTTCTGGTCATGGGTGG 3318
Query 3592 GCTTGTATTCCCGTCATTCCAACCACTCCATGTTCCCACTCAGAGGGTAAAGTGCTCTCT 3651
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3319 GCTTGTATTCCCGTCATTCCAACCACTCCATGTTCCCACTCAGAGGGTAAAGTGCTCTCT 3378
Query 3652 CCTTCAATAGAGGCTAAACCCAACTGTTATGTCCGTTCCTCAGCAACACCTGGTGTCCCT 3711
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3379 CCTTCAAAAGAGGCTAAACCCAACTGTTATGCCCGTTCCTCAGCAACACCTGGTGTCCCT 3438
Query 3712 CTGTATCCTCTTCAGTTGGATGTTATCAGGCATTTGGTAAAAATTTCACCAGTACGAGCA 3771
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 3439 CTGTATCCTCTTCAGTTGGATGTTATCAGGCATTTGGTAAAAATATCCCCAGTACGAGCA 3498
Query 3772 GTTTTAGCTTGCGTCTTTGGTGGGAGCATATTGTACAATGGCAGTGATTCTATCATATCT 3831
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3499 GTTTTAGCTTGCGTCTTTGGTGGGAGCATATTGTACAATGGCAGTGATTCTATCATATCT 3558
Query 3832 AGCTCCTTGAACGATGAGTTTCCAAGTTCTCCTGATGCAGACAGATTGTTTTATGAATTT 3891
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3559 AGCTCCTTGAACGATGAGTTTCCAAGTTCTCCTGATGCAGACAGATTGTTTTATGAATTT 3618
Query 3892 TCTCTTGATCAGTCTGAGAGGTATCCCACTTTAAACCGATGGATACAGATGCAGACTAAT 3951
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3619 TCTCTTGATCAGTCTGAGAGGTATCCCACTTTAAACCGATGGATACAGATGCAAACTAAT 3678
Query 3952 CTGCATCGAGTTTCGGAATTTGTTGTGACACCGAAGCAAAAACCTGATGACACACGGATT 4011
|| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3679 CTTCATCGAGTTTCAGAATTTGTTGTGACCCCTAAGCAAAAACCTGATGACACACGGATT 3738
Query 4012 AAGCCTGATGAAAGAACTGGGATCAAGAGACTTCTTGAACATGATAGTGACTCAGAGTCA 4071
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3739 AAGCCTGATGAAAGAACTGGGATCAAGAGACTTCTTGAACATGATAGTGACTCAGAGTCG 3798
Query 4072 GATACAGAAGAAACATTTTCTAAAAATAACATTCAACCAGCATTGACAGACGGCAGTGCT 4131
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3799 GATACAGAAGAAATTTTTTCTAAAAATAACATTCAACCAGCATTGACAGACGGCAGT-C- 3856
Query 4132 CGTGATGGTGGATCCTTTGAAAATGGAGTTTGTAGAACTGATCCTACCGTTTTCCTTTCT 4191
||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3857 -GTGATGGTGGATCCTTTGAAACTGGAGTTTGTAAAACTGATCCTACCGTTTTTCTTTCT 3915
Query 4192 TTTGATTGGGAGAATGAAGTACCGTATGAGAAAGCTGTAAATAGACTAATTGATGAAGGA 4251
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3916 TTTGATTGGGAAAATGAAGTACCGTATGAGAAAGCTGTAAATAGATTAATTGATGAAGGA 3975
Query 4252 AAACTAATGGATGCTTTAGCACTTTCGGACCGCTTCTTGCGGAATGGGGCTTCTGATTGG 4311
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3976 AAACTAATGGATGCTTTAGCACTTTCGGACCGCTTCTTGCGGAATGGGGCATCTGATTGG 4035
Query 4312 TTACTTCAGCTCCTAATCAAAAGTAGAGAAGAAAATCCTTCAACATCAGGACGATCTCAG 4371
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4036 TTACTTCAGCTCCTAATCAAAAGTAGAGAAGAAAATCCCTCAACATCAGGACGATCTCAG 4095
Query 4372 GGATATGGAGGCCAGAGCAACAGTTGGCAGTATTGCCTGCGGCTAAAGGACAAACAGCTG 4431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4096 GGATATGGAGGCCAGAGCAACAGTTGGCAGTATTGCCTGCGGCTAAAGGACAAACAGCTG 4155
Query 4432 GCAGCAACACTGGCTCTTAAGTATATGCATA 4462
|||||||||||||||||||||| | ||||||
Sbjct 4156 GCAGCAACACTGGCTCTTAAGTGT-TGCATA 4185
Score = 2244 bits (1215), Expect = 0.0
Identities = 1365/1440 (95%), Gaps = 0/1440 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 178 TGATCGGAATTTGTGACGGCGATGGATAAAGAGACGGAGATTCTCTCCCGTCTCGCGGCG 237
||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TGATCGGAATTCGTGACGGCCATGGATTCAGAAACGGAGATTCTCTCCCGTCTCGCGGCG 60
Query 238 AACCACCTTCATCTGGCTCAATTCGAGCCATTGAAGGCTACGTTACTCGCTCTCAGGGTT 297
|||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 AACCACCTCCATTTGGCTCAATTCGAGCCATTGAAGGCTACGTTACTCGCTCTCAGGGTT 120
Query 298 CGTAACCCTGACCTCGCACTCACCATTCTCCAAACCATCGTCTCCAACGCTGGAAGATTC 357
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 121 CGTAACCCTGACCTCGCACTCACGATTCTCCAAACCATCGTCTCTAACGCTGGAAGATTC 180
Query 358 GATAATGTCCTCTGGTCACGCTCTTGTCCTTCCCCGTCTCTTCTCTCGTTCCTCTCCACG 417
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GATAATGTCCTTTGGTCACGCTCTTGTCCTTCCCCGTCTCTTCTCTCGTTCCTCTCCACG 240
Query 418 ATTGAGCTTCTGAGATTCGAAAATCCTACTTCTCCTTGGGGATTTGATTCAGAAACTCTA 477
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 241 ATTGAACTTCTGAGATTCGAAAATCCTACTTCTCCTTGGGGATTTGATTCGGAGACTCTT 300
Query 478 AGTTTGCGTGCCGATTTCTTGTTGATGGTTCAGGTTTTGATCGATAGAGTTACAGAGAGG 537
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 301 AGTTTGCGAGCGGATTTCTTGTTGATGGTTCAGGTTTTGATCGATAGGGTTACAGAGAGG 360
Query 538 ATTAAGGAAGATGAGGAGAGTGAGGATGAAAATTCTGGATTAGGGAATTGTTTAAGGGTG 597
|||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||
Sbjct 361 ATTAAGGAAGATCAGGAGAGTGAGGATGAAAATGGTGGATTAGGAAATTGTTTACGGGTT 420
Query 598 TTGCAAGGTGTTTTGGAGTTAGGTGTTGAGAGGTTGAAGTTTGTTGTTGATACTAGTAGT 657
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||
Sbjct 421 TTGCAAGGTGTTTTGGAGTTAGGTGTTGAGAGGTTGAAATTTGATGTCGATACTAGTAGT 480
Query 658 AGTGAAGGAAGTAATAAGATTGAGGAAGATGCAGTTGTGTCTTTGAGGAGTATAGTATTG 717
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 481 AGTGAAGGAAGTAATAAGATTGAGGAAGATGCTGTTGTTTCTTTGAGGAGTATTGTATTG 540
Query 718 GATTACTCTGATGTTTTCGATGCTTTATGTTGTAATATTCAGAGGCAACTTGCGGGTTGC 777
|| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||
Sbjct 541 GACTACTCCGATGTTTTCGATGCTTTATGTTGTAATATACAGAGGCAACTTGCGCGTTGC 600
Query 778 GAGAGTTACGGTACATGTTTGGTTGAGGAAGTTCAGGGAGAAGAACAGAGAAAGGAGATG 837
|||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 601 GAGAGTTACGATACATGTTTGGTGGAGGAAGTTCAGGGAGAAGAACAGGGAAAGGGGATA 660
Query 838 AATGAGGCCACATGTATTGGTTCTCCGGAGCTGGATAACATCAATGTGTTTGCTTTGATA 897
|||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 661 AATGAGGCTACATGCATTGGTTCTCCGGAGTTGGATAACATCAACGTGTTTGCTTTGATA 720
Query 898 CAGAGGAATGTTCAGTTAGCACAGTTGGATGCTATGAAAACAAAGTTGGATGAAGGTGAT 957
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 721 CAGAGAAATGTTCAGTTAGCACAGTTGGATGCTATGAAGACAAAGTTGGATGAAGGGGAT 780
Query 958 GAGCGCGGGGCAGCTGATCGCATTCGTTATCTTCACCTTGATTATGGAGTAGAGAAAGAG 1017
| ||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 GTGCGTGGAGCAGCTGATCGCATACGTTATCTCCACCTTGATTATGGAGTAGAGAAAGAG 840
Query 1018 AACTATCATGCTGTTCTAAAAGCTCTCCTTTCAAGAGTTATGGAGAAAAAGGATGAATAT 1077
|| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 AATTATCATGCTGTTCTAAAAGCTCTCCTTTCACGAGGTATGGAGAAAAAGGATGAATAT 900
Query 1078 GGTGATTCCTGGCACATGGTGCGCCAGAACTTGCTGTTTATGTATAAAGAAGCTCTCTCA 1137
||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 901 GGTGACTCCTGGCATATGGTGCGCCAGAACTTGCTGTTTATTTATAAAGAAGCTCTCTCA 960
Query 1138 TCGAATTGTGGAGATCTTGTTCAGATGATCCAGGGTATTCAAGATGATATGCTCCTCCCA 1197
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 961 TCGAATTGCGGAGATCTTGTTCAGATGATCCAGGGTATTCAAGATGAAATTCTCCTCCCA 1020
Query 1198 CATAGCCAACTACATTTATCTCTCGACAATGAACAAATTCCACTCCCTCTTGAATGTTTC 1257
| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 1021 GAGAGCCAGCTACATTTATCTCTCGACAATGAACAAATTCCACTCCCTCTTGAGTATTTC 1080
Query 1258 CGGCGATATCTTGTAGACTTGAAAACTGAGAGAAATATAGAGGACAAAAGTTCTCCTATG 1317
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1081 CAGCGATATCTTGTAGACTTGAAAACTGAGAGAAATATAGAGGACAAAAGTTCCCCTATG 1140
Query 1318 AGCAGGGCAATTAATTCTTGTCTCAGAGATATGTATCATTATGCTCGTATTTCTGGATCA 1377
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 AGGAGGGCGATTAATTCTTGTCTCAGAGATATGTATCATTATGCTCGTATTTCTGGATCA 1200
Query 1378 CATGTTCTTGAGTGTGTGATGTGTGCTGCTTTGTCTTCTGTAAAGAAAGAGAAGCTTCAG 1437
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 CATGTCCTTGAGTGTGTGATGTGTGCTGCTTTGTCGTCTGTAAAGAAAGAGAAGCTTCAG 1260
Query 1438 GAGGCTAATGATGTTCTTACTTTGTTTCCCCGACTTCGCCCTTTAGTAGCCTCCATGGGT 1497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1261 GAGGCTAATGATGTTCTTACTTTGTTTCCCCGACTTCGCCCATTAGTAGCCTCCATGGGG 1320
Query 1498 TGGGATCTATTGCCGGGCAAAACTGCAACCCGTAGAAAATTGATGCGGCTACTTTGGACT 1557
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 TGGGATCTGTTGCCGGGCAAAACTGCAACCCGTAGAAAATTGATGCGGCTACTTTGGACT 1380
Query 1558 AGTGACTCGCAAGCACTTCGGCTAGAAGAATCTTCTCTTTATGGAAACCAGACAGATGAA 1617
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 AGTGACTCGCAAGCAATTCGGTTAGAAGAATCTTCTCTTTATGGAAACCAGACAGATGAA 1440
Score = 1796 bits (972), Expect = 0.0
Identities = 1059/1101 (96%), Gaps = 6/1101 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1660 CTGGAACTTGCATCTTTCGCTGCTTGTGTCAATTCTGGTAAATCATGGACTCCAAAGGCA 1719
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 CTGGAACTTGCATCTTTCGCTGCTTTTGTCAATTCTGGTAAATCATGGACTCCAAAGGCA 1500
Query 1720 TCTTTCTTGATGCATGGTAATGTGTCATCCGCGCATGATGATGCGGAGGTGGATCCTTTT 1779
|||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 TCTTTCTTGATGAAAGGTAATGTGTCACCCGCGAATGATGATGCGGAGGTGGATCCTTTT 1560
Query 1780 GTTGAAAATCTTGTATTGGAAAGGCTTTCAGCGCAAAGTCCACTTCGGGTATTGTTTGAC 1839
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 GTTGAAAATCTTGTATTGGAAAGGCTTTCAGCGCAAAGTCCACTTCGGGTATTGTTTGAT 1620
Query 1840 GTTGTTCCGGGCATAAAATTCCAAGATGCTATTTCACTGATTAGTATGCAACCTATTGCT 1899
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 GTTGTTCCGGGCATAAAATTCCAAGAAGCTATTTCACTGATTAGTATGCAACCTATTGCT 1680
Query 1900 TCAACTGCAGAAGCCTGGAAGAGGATAGAAGATATTGAACTGATGCATATGCGTTATGCT 1959
|||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 TCAACTGCAGAAGCTTGGAAGAGAATGGAAGATATTGAACTGATGCATATGCGTTATGCT 1740
Query 1960 CTGGAGGCAATCGTTTTAGCACTAGGTGCAATGGAAGAGGCTATGAAGGATGAGACAGAT 2019
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || |||
Sbjct 1741 CTGGAGGCAATCGTTTTAGCACTAGGTTCAATGGAAGAGGCTATGAAAGATAATACGGAT 1800
Query 2020 GCTAGTCATCGAGTAGTATTTTACCATTTAAAAGACCTCACTAACCATTTGGAGGCCATT 2079
|||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1801 GCTAGTCATCAAGTAGTTTTTTACCATTTAAAAGACCTCACTAACCATTTGGAGGCCATC 1860
Query 2080 AAAAATGTTCCACGCAAGATAATGATGGTGAACATAGTTATTTCACTCTTACATATTGAT 2139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1861 AAAAATGTTCCACGCAAGATAATGATGGTGAACATAGTTATTTCACTCTTACATATTGAT 1920
Query 2140 GATATCCGTCTCAGTTCTACGCAAAGTGCCTCCTCGGCA-TGTTTTTCTGAAAAAAGTAA 2198
||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 GATATCCATCTCAGTTCAACGCAAAGTGCCTCCTCGG-AGTGTTTTTCTGAAAAAAGTAA 1979
Query 2199 CACACCTGGTTTGGATCCTGGCGATCTTGGTACAGAAGGGGAAAAGGAAATTGTTATTTC 2258
||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1980 CACACCTGGTTTGGATCTTGGCGATCTTGATACAAAAGGGGAAAAGGAAATTGTTATTTC 2039
Query 2259 TTTCACAAAACAGCTACTCGATGTTTTACGCCGCAATCTTCCATCACATCCAATTGAACA 2318
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2040 TTTCACAAAACAGCTACTCGATGTTTTACGCCGCAATCTTCCATCACATCTGATTGAACA 2099
Query 2319 AGAGTGTCAGCTGGATGGTAATTACAGTACTGATGGAAGACAGGCTTTAGAATGGAGAGT 2378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2100 AGAGTGTCAGCTGGATGGTAATTACAGTACTGATGGAAGACAGGCTTTAGAATGGAGAGT 2159
Query 2379 ATC-CATGGCTAAGCGTTTCATTGAAGATTGTGAATGGCGATTATCTGTTATGCAGCATC 2437
||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2160 ATCTC-TGGCTAAGCGTTTCATTGATGATTGTGAATGGCGATTATCTGTTATGCAGCATC 2218
Query 2438 TTCTGCCACTTTCTGAACGCCAGTGGGGTTTAAAGGAGGTTTTGAGTATTCTAAGGGCAG 2497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
Sbjct 2219 TTCTGCCACTTTCTGAACGCCAGTGGGGTTTAAAGGAGGTTTTGAGTGTTCTAAGGGCGG 2278
Query 2498 CCCCTGAAAAACTGCTTAATCTCTGTATGCAAAGAGCTAAGTATGACATTGGAGAAGAGG 2557
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2279 CCCCTGAAAAACTGCTTAATCTCTGTATGCAGAGAGCTAAGTATGACATTGGAGAACAGG 2338
Query 2558 CAGTTAATCGGTTTGCGTTATCAGCAGAGGACAAAGCTACTCTTGAATTAGCTGAATGGG 2617
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2339 CAGTTCATCGGTTTGCGTTATCAGCAGAGGACAAAGCCACTCTTGAATTAGCTGAATGGG 2398
Query 2618 TTGATAATGCGTTCAAAGGAACACTGGTAGAAGATGTAATGTCTCGTACTGCTGAAGGAG 2677
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2399 TTGATAATGCGTTCAAAGGAACACTGGTAGAAGATGTGATGTCTCGTACTGCTGAAGGAG 2458
Query 2678 CAG-CTGCCGTGCAAGATTTAGATTTTCATTCTTTAGGTTCTCAATTGAGTCCATTGGCT 2736
| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2459 C-GTCTACCGTGCAAGATTTAGATTTTCATTCTTTAGGTTCCCAATTGAGTCCATTGGCT 2517
Query 2737 ATGATTCTACTGTGCATAGAT 2757
||||||||||| |||||||||
Sbjct 2518 ATGATTCTACTATGCATAGAT 2538
Score = 97.1 bits (52), Expect = 2e-18
Identities = 61/65 (94%), Gaps = 1/65 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 4536 TCTTGAGGTGTTGCATAGGAGACAAGCTCTGCAGAAGTACAGCCACATACTTTCGGCAGA 4595
|||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4170 TCTT-AAGTGTTGCATAGGAGACGAGCTCTGCAGAAGTACAGCCACATACTTTCTGCAGA 4228
Query 4596 TGATC 4600
|||||
Sbjct 4229 TGATC 4233
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 304199208000
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5