BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G26080.1
Length=3504
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg481465 jgi|Araly1|481465|fgenesh2_kg.4__525__AT2G26080.1 5090 0.0
Ahg491390 jgi|Araly1|491390|fgenesh2_kg.7__823__AT4G33010.1 3145 0.0
> Ahg481465 jgi|Araly1|481465|fgenesh2_kg.4__525__AT2G26080.1
Length=3453
Score = 5090 bits (2756), Expect = 0.0
Identities = 3081/3239 (95%), Gaps = 18/3239 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 5 CTCTCTCAGATTTGCATTTGtttttttttGGTTTGGTTATGGAGCGTGCAAGGAGACTTG 64
|||||||||||||||| | |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CTCTCTCAGATTTGCA--T-TTTTTTCTT-CTTT-GTTATGGAGCGTGCAAGGAGACTTG 55
Query 65 CTTACAGAGGGATCGTGAAACGTCTCGTCAACGAGACAAAACGCCACCGTAACGGCGAAT 124
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 56 CTTACAGAGGGATCGTGAAACGTCTCGTCAACGAGACAAAACGCCACCGTAACGGCCAAT 115
Query 125 CCTC-TCTTCTTCCGACGACGACTGTTACTCCCTCAAGGTATGTCTCCTCCGTCTCCTCC 183
|||| || ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 116 CCTCTTC-TCTCCCGGCGACGACGGTTACTCCCTCAAGGTATGTCTCCTCCGTCTCCTCC 174
Query 184 TTTCTCCATCGCCGTCGTGATGTCTCTGGATCGGCTTTTACCACCTCCGGTAGAAATCAA 243
|||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 175 TTTCTCCATCACCGTCGTGATGTCTCTGGATCGACTTTCACCACCTCCGGTAGAAATCAA 234
Query 244 CACCAGACACGATCGATCTCCGTCGATGCGTTGAAGCCAAGCGACACTTTCCCGCGCCGG 303
|| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 235 CA--A-ACACGATCAATCTCCGTCGATGCGTTAAAGCCAAGCGACACTTTCCCGCGCCGT 291
Query 304 CACAACTCAGCAACACCGGATGAACAAGCTCAGATGGCGAATTACTGCGGATTCGATAAT 363
|||||||| || |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 292 CACAACTCTGCTACACCGGAGGAACAAACACAGATGGCGAATTACTGCGGATTCGATCAT 351
Query 364 CTCAACACGTTGATTGATTCGACTGTTCCGAAATCGATTCGGTTAGATTCGATGAAGTTT 423
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 352 CTCAACACGTTGATTGATTCAACTGTTCCGAAATCGATTCGGTTAGATTCGATGAAGTTC 411
Query 424 TCCGGGATATTTGATGAAGGATTAACGGAGAGTCAAATGATTGAGCATATGAGTGATTTA 483
|| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 412 TCTGGGAAATTTGATGAAGGATTAACAGAGAGTCAGATGATTGAGCATATGAGTGATTTA 471
Query 484 GCTTCGAAGAACAAAGTTTTCAAATCGTTCATTGGTATGGGATACTATAACACTCATGTT 543
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 472 GCTTCGAAGAACAAAGTTTTCAAATCATTCATTGGTATGGGATACTATAACACTCATGTT 531
Query 544 CCTCCTGTGATTTTGCGTAATATAATGGAGAATCCTGCTTGGTATACTCAATATACTCCT 603
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 532 CCTCCTGTGATTTTGCGTAATATTATGGAGAATCCTGCTTGGTATACTCAATATACTCCT 591
Query 604 TATCAAGCTGAGATTTCTCAAGGAAGACTCGAATCTCTGCTCAATTACCAGACGGTTATT 663
|||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 TATCAAGCTGAGATTTCTCAAGGAAGGCTTGAATCTTTGCTCAATTACCAGACGGTTATT 651
Query 664 ACTGATCTCACCGGTCTACCGATGTCGAACGCTTCGTTGCTCGATGAAGGTACGGCGGCG 723
|||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 652 ACTGATCTTACCGGTTTACCGATGTCGAACGCTTCGTTGCTCGATGAAGGTACGGCGGCT 711
Query 724 GCGGAAGCAATGGCGATGTGTAATAATATTC-TAAAGGGGAAGAAGAAGACGTTTGTTAT 782
|||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 712 GCGGAAGCGATGGCTATGTGTAATAATA-TCTTAAAGGGGAAGAAGAAGACGTTTGTTAT 770
Query 783 TGCTAGTAATTGTCATCCTCAGACTATTGATGTTTGCAAGACGAGAGCGGATGGTTTCGA 842
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 771 TGCTAGTAATTGTCATCCTCAGACGATTGATGTTTGCAAGACTAGAGCGGATGGTTTCGA 830
Query 843 TTTGAAAGTTGTGACGGTTGATATTAAGGATGTGGATTATAGCTCTGGTGATGTGTGTGG 902
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 831 TTTGAAAGTTGTGACGGTTGATCTTAAGGATGTGGATTATAGCTCGGGGGATGTGTGTGG 890
Query 903 AGTGTTGGTTCAGTATCCGGGGACTGAAGGGGAGGTGTTGGATTATGGTGAGTTTGTTAA 962
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 891 AGTGTTGGTTCAGTATCCGGGGACTGAAGGTGAAGTGTTGGATTATGGTGAGTTTGTTAA 950
Query 963 GAATGCTCATGCTAATGGTGTTAAGGTTGTTATGGCTACGGATTTGTTGGCTTTGACGAT 1022
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 951 GAATGCTCATGCTAATGGTGTTAAGGTTGTGATGGCTACGGATTTGTTGGCTTTGACAAT 1010
Query 1023 GTTGAAACCGCCGGGTGAGTTTGGGGCGGATATTGTTGTTGGGTCGGGTCAGAGGTTTGG 1082
||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1011 GTTGAAACCGCCGGGGGAGTTTGGGGCTGATATTGTCGTTGGGTCGGGTCAGAGGTTTGG 1070
Query 1083 TGTTCCGATGGGTTATGGTGGTCCTCATGCTGCTTTCTTGGCTACTTCACAAGAGTATAA 1142
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1071 TGTTCCCATGGGTTATGGTGGTCCTCATGCTGCTTTCTTGGCTACTTCACAAGAGTATAA 1130
Query 1143 GAGAATGATGCCTGGGAGGATTATTGGTGTTAGTGTTGATTCTTCCGGGAAGCAAGCTTT 1202
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1131 GAGAATGATGCCTGGGAGAATTATTGGTGTTAGTGTTGATTCTTCCGGGAAGCAAGCTTT 1190
Query 1203 GCGTATGGCTATGCAGACTAGGGAACAGCATATCCGCAGGGATAAAGCTACCAGCAACAT 1262
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1191 GCGTATGGCTATGCAGACTAGGGAACAGCATATCCGTAGGGATAAAGCTACCAGCAACAT 1250
Query 1263 CTGTACCGCTCAGGCCTTGCTTGCAAATATGACTGCTATGTATGCTGTTTACCATGGACC 1322
||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||
Sbjct 1251 CTGTACCGCTCAGGCATTGCTTGCAAACATGACTGCCATGTATGCTGTCTATCATGGACC 1310
Query 1323 AGAAGGCTTAAAATCTATTGCACAACGGGTTCATGGTCTCGCTGGTGTATTTGCCTTAGG 1382
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||
Sbjct 1311 AGAAGGCTTAAAATCTATTGCACAACGGGTTCATGGTCTAGCTGGTGTATTTACTTTAGG 1370
Query 1383 ATTGAAGAAACTGGGAACTGCACAAGTCCAAGATCTTCCCTTCTTTGACACTGTCAAAGT 1442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1371 ATTGAAGAAACTGGGAACTGCACAAGTCCAAGATCTTCCCTTCTTTGACACTGTCAAAGT 1430
Query 1443 TACATG-TTCAGATGCAAC-TGCAATTTTTGATGTGGCAGCCAAGAAGGAGATCAATTTG 1500
||| | ||| ||||| || ||||||| |||||| ||| ||||| || ||||||||||||
Sbjct 1431 TAC-GGTTTCGGATGC-ACATGCAATTGTTGATGCGGCTGCCAAAAAAGAGATCAATTTG 1488
Query 1501 CGTCTTGTGGACTCCAACACTATTACTGTTGC-TTTCGATGAAACAACCACCTTGGATGA 1559
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1489 CGTCTTGTGGACTCCAACACTATTACTGTTGCGTTT-GATGAAACAACCACCTTGGATGA 1547
Query 1560 TGTCGATAAACTTTTTGAAGTTTTTGCTTCGGGCAAGCCCGTTCAATTCACGGCTGAGTC 1619
|||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1548 TGTCGACAAACTTTTTGAAGTTTTTGCTTCCGGCAGGCCGGTTCAATTCACGGCTGAGTC 1607
Query 1620 TCTTGCACCGGAGTTTAACAATGCTATTCCCTCTAGCCTAACAAGAGAGAGCCCTTATCT 1679
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 1608 TCTCGCACCGGAGTTTAACAATGCTATTCCTTCTAGCTTAACAAGACAGAGCCCTTATCT 1667
Query 1680 GACCCATCCAATCTTCAACATGTACCACACGGAGCATGAGTTGCTTAGGTACATCCACAA 1739
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1668 GACCCACCCAATCTTCAACATGTACCACACGGAGCATGAGTTACTTAGGTACATCCACAA 1727
Query 1740 GTTACAAAATAAAGATCTATCATTGTGCCACAGCATGATTCCACTTGGATCTTGTACGAT 1799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||
Sbjct 1728 GTTACAAAATAAAGATCTATCATTGTGCCACAGCATGATTCCACTAGGATCATGTACAAT 1787
Query 1800 GAAATTGAATGCCACCACTGAAATGATGCCAGTCACATGGCCAAGTTTCACCAACATGCA 1859
||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1788 GAAATTGAATGCCACGACCGAAATGATGCCAGTCACATGGCCAAGTTTCACCAACATGCA 1847
Query 1860 CCCTTTTGCTCCTGTTGAACAAGCCCAAGGTTATCAGGAAATGTTTACGAATTTGGGTGA 1919
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 1848 CCCTTTTGCTCCTGTAGAACAAGCCCAAGGTTATCAGGAAATGTTTACAAACTTGGGTGA 1907
Query 1920 GCTCTTATGTACGATCACTGGATTCGACTCTTTCTCATTGCAACCTAATGCCGGTGCTGC 1979
|||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1908 GCTCTTGTGTACTATCACTGGGTTCGACTCTTTCTCATTGCAACCTAATGCCGGTGCTGC 1967
Query 1980 TGGCGAGTACGCCGGGCTCATGGTTATCCGTGCATATCATATGTCAAGAGGCGATCATCA 2039
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1968 TGGCGAGTATGCCGGGCTCATGGTTATTCGTGCATATCATATGTCAAGAGGAGATCATCA 2027
Query 2040 CAGAAATGTGTGCATCATACCTGTTTCTGCACACGGGACAAACCCTGCTAGTGCTGCCAT 2099
| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2028 CCGAAATGTATGCATCATACCTGTTTCTGCACACGGGACAAACCCTGCTAGTGCTGCTAT 2087
Query 2100 GTGCGGAATGAAAATTGTTGCCGTTGGAACTGATGCCAAAGGAAACATTAACATCGAAGA 2159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2088 GTGCGGAATGAAAATTGTTGCCGTTGGAACTGATGCCAAGGGAAACATTAACATCGAAGA 2147
Query 2160 GTTGAGGAACGCCGCCGAAGCCAACAAGGACAACTTGGCTGCTCTTATGGTTACATACCC 2219
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2148 GTTGAGGAAAGCCGCCGAAGCCAACAAGGACAACTTGGCTGCTCTTATGGTTACATACCC 2207
Query 2220 TTCCACCCATGGAGTCTACGAAGAGGGTATCGACGAGATCTGCAACATAATTCATGAAAA 2279
|| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2208 GTCAACCCATGGAGTTTATGAAGAGGGTATCGATGAGATTTGCAACATAATTCATGAAAA 2267
Query 2280 TGGAGGCCAAGTTTATATGGATGGTGCTAATATGAATGCACAGGTGGGTTTGACAAGCCC 2339
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2268 TGGAGGCCAAGTTTATATGGACGGTGCTAATATGAATGCACAGGTGGGGTTGACAAGCCC 2327
Query 2340 TGGTTTTATTGGAGCGGATGTTTGCCATCTCAATCTCCACAAGACCTTCTGTATCCCTCA 2399
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2328 TGGTTTTATTGGAGCGGATGTTTGCCATCTCAATCTCCACAAAACCTTCTGTATCCCTCA 2387
Query 2400 CGGAGGTGGAGGTCCCGGAATGGGCCCTATCGGTGTGAAGCAACATTTGGCTCCATTCCT 2459
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2388 CGGAGGTGGAGGTCCCGGTATGGGCCCTATCGGTGTGAAGCAACATTTGGCTCCATTCCT 2447
Query 2460 ACCTTCTCACCCAGTGATACCTACCGGTGGTATCCCTGAACCCGAGCAGACATCACCGCT 2519
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2448 ACCTTCTCACCCTGTGATACCTACCGGTGGTATCCCTGAACCCGAGCAGACATCACCGTT 2507
Query 2520 GGGAACCATTTCTGCAGCACCATGGGGGTCTGCGCTTATCTTGCCAATCTCGTATACTTA 2579
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||
Sbjct 2508 GGGAACCATTTCTGCAGCACCATGGGGGTCTGCGCTAATCTTGCCCATCTCTTATACATA 2567
Query 2580 CATTGCCATGATGGGATCTGGAGGACTCACCGATGCCTCAAAGATTGCAATTTTGAACGC 2639
||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 2568 CATTGCCATGATGGGATCTGGGGGACTCACAGACGCCTCAAAGATCGCAATTTTGAATGC 2627
Query 2640 TAACTACATGGCAAAGCGTCTGGAGAGCCACTACCCAGTTCTTTTCCGTGGTGTCAATGG 2699
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2628 TAACTACATGGCAAAGCGTCTGGAGAGCCACTACCCAGTTCTATTCCGTGGTGTCAATGG 2687
Query 2700 AACAGTCGCTCACGAATTCATCATTGACTTGAGAGGATTCAAGAACACTGCTGGAATTGA 2759
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2688 AACAGTCGCTCACGAATTCATCATTGACTTGAGAGGATTCAAGAACACTGCTGGAATTGA 2747
Query 2760 ACCAGAGGATGTGGCCAAACGATTGATGGATTATGGTTTCCATGGACCGACAATGTCTTG 2819
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2748 ACCAGAGGATGTGGCCAAACGGCTGATGGATTATGGGTTCCATGGACCGACAATGTCTTG 2807
Query 2820 GCCTGTCCCTGGAACGCTTATGATCGAGCCAACCGAAAGCGAAAGCAAGGCTGAGTTAGA 2879
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2808 GCCTGTCCCTGGAACACTTATGATCGAGCCAACCGAAAGCGAAAGCAAGGCTGAGTTAGA 2867
Query 2880 TAGGTTCTGTGATGCTCTCATCTCGATCAGGGAAGAGATTTCACAGATTGAGAAAGGAAA 2939
||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2868 TAGGTTCTGTGATGCTCTCATCTCGATCAGGGACGAAATTTCCCAGATTGAGAAAGGAAA 2927
Query 2940 CGCAGATCCAAACAACAACGTTCTGAAGGGTGCTCCACATCCTCCGTCATTGCTAATGGC 2999
||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 2928 CGCAGATCCTAACAACAACGTTCTCAAGGGAGCTCCACATCCTCCTTCATTGCTGATGGC 2987
Query 3000 AGATACATGGAAAAAGCCGTATTCACGGGAATACGCAGCCTTCCCCGCTCCATGGCTCCG 3059
||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2988 AGACACATGGAAAAAGCCGTATTCCCGTGAATACGCAGCCTTCCCCGCTCCATGGCTCCG 3047
Query 3060 CTCCTCCAAGTTCTGGCCCACTACAGGGCGAGTGGACAACGTGTATGGAGACCGTAATCT 3119
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3048 CTCCTCCAAGTTCTGGCCCACTACAGGGCGCGTGGACAACGTGTATGGAGACCGTAATCT 3107
Query 3120 GGTGTGCACTCTCCAACCGGCGAACGAAGAACAGGCTGCAGCTGCAGTGTCTGCTTAAAT 3179
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3108 GGTGTGTACTCTCCAACCGGCGAACGAAGAACAGGCTGCAGCCGCAGTGTCTGCTTAAAT 3167
Query 3180 GAAGCCACTATGAAGCGATTCGCACTCGCACCAAAACCCACAATGGGGCGATTCGGACT 3238
|||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||
Sbjct 3168 TAAGCCACTATAAAGCGATTTGCACTCGCACCAGAAGCCACAATGAAGCGATTCGGACT 3226
Score = 327 bits (177), Expect = 2e-88
Identities = 212/229 (93%), Gaps = 1/229 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3272 TTTACTTCTCTTCCCAGCCTCATCATCACTTTCACTTTCACTTCCTGTACAATGTACATA 3331
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3226 TTTACTTCTCTTCCCAGTCTCATCATCACTTTCACTTTCATTTCCTGTACAATGTACATA 3285
Query 3332 CGTAGTCCTAAGTTCTTCCCTCATTTATTTAATAAAATACATTTCTTTATGTTCCACTTT 3391
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 3286 CGTAGTCCTAAGTTCT-CCCTCATTTATCTAATAATTTACATTTCTATATATTCCACTTT 3344
Query 3392 CTTATACGTATAACATTCCATTTGGATGATGTGATCACCATCGTGGTTATATTTATGCCA 3451
||| ||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3345 CTTTTACTTTTAACATTCGATTCGGATGATGTGATCACCATCGTGGTTATATTTATGACA 3404
Query 3452 TATGATCTCTTTGAAAAAAGTTTGAATTCTTAGGATATTTATTGTTTCA 3500
|||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3405 TATGGTCTCTTTGGAAAAAGTTTGAATTCTTAGGATATTTGTTGTTTCA 3453
> Ahg491390 jgi|Araly1|491390|fgenesh2_kg.7__823__AT4G33010.1
Length=3427
Score = 3145 bits (1703), Expect = 0.0
Identities = 2695/3168 (85%), Gaps = 91/3168 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 43 ATGGAGCGTGCAAGGAGACTTGCTTACAGAGGGATCGTGAAACGTCTCGTCAACGAGACA 102
|||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| |||
Sbjct 144 ATGGAGCGCGCAAGGAGACTTGCTTACAGAGGAATCGTCAGACGTCTCGTTAACGACACA 203
Query 103 AAACGCCACCGTAACGGC-G-AA-TCCTC-TCTTCTTCCGACGACGACTGTTACTCCCTC 158
||||| ||||||||| || | || |||| ||| || | | | || | |||| |
Sbjct 204 AAACGACACCGTAAC-GCTGAAACACCTCACCTTGTT-C--C-TC-AC-G---CTCCGGC 253
Query 159 AAGGTATGTCTCCTC-CGTCTCCTCC-TTTCTCCATCG--CCGTCGTGATGTCTC-TGGA 213
|||||||||||||| | | ||| || ||||| | ||| || || || || | | |
Sbjct 254 GAGGTATGTCTCCTCTC-TTTCC-CCTTTTCT-C-TCGACCCATC--GA--TC-CGTCAA 304
Query 214 T-CGGCTTTTACCACCTCCGGTAGAAATCAACACCAGACACGATCGATCTCCGTCGATGC 272
| | || | | | | | || | || || || || || |||||||||||||||||
Sbjct 305 TCCCGC---GGCGGCTTTC-G-AG-AGGCACCAGCAAACGCGTTCGATCTCCGTCGATGC 358
Query 273 GT-TGAAGCCAAGCGACACTTTCCCGCGCCGGCACAACTCAGCAACACCGGATGAACAAG 331
| | || || |||| ||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||
Sbjct 359 -TCTTAAACCCGGCGATACTTTCCCGCGTCGTCATAACTCTGCAACACCAGAAGAACAAT 417
Query 332 CTCAGATGGC-GAATTACTGCGGATTCGATAATCTC-A-ACACGTTGATTGATTCGACTG 388
| || ||||| |||| ||| || || || || || | ||| | || ||| | || |
Sbjct 418 CCCACATGGCTAAATT-CTGTGGCTTTGACCATATCGATTCAC--TCATCGATGCTACGG 474
Query 389 TTCCGAAATCGATTCGGTTAGATTCGATGAAGTTTTCCGGGATATTTGATGAAGGATTAA 448
| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| || | ||| ||||
Sbjct 475 TGCCCAAATCGATTCGATTAGATTCGATGAAGTTCTCC---AAATTCGACGGAGGCTTAA 531
Query 449 CGGAGAGTCAAATGATTGAGCATATGAG-TGATTTAGCTTCGAAGAACAAAGTTTTCAAA 507
| ||||| || |||||||| || ||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 532 CCGAGAGCCAGATGATTGACCACATG-GTTGATTTAGCTTCCAAGAACAAGGTTTTCAAA 590
Query 508 TCGTTCATTGGTATGGGATACTATAACACTCATGTTCCTCCTGTGATTTTGCGTAATATA 567
|| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||| | ||||||||
Sbjct 591 TCCTTTATCGGGATGGGTTACTACAACACGCATGTCCCTACTGTCATTCTCCGTAATATC 650
Query 568 ATGGAGAATCCTGCTTGGTATACTCAATATACTCCTTATCAAGCTGAGATTTCTCAAGGA 627
||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 651 ATGGAGAATCCAGCTTGGTACACTCAATACACTCCTTATCAAGCTGAGATCTCTCAGGGT 710
Query 628 AGACTCGAATCTCTGCTCAATTACCAGACGGTTATTACTGATCTCACCGGTCTACCGATG 687
| |||||||| |||||||||| ||||||||| || || |||||||| || || || |||
Sbjct 711 CGTCTCGAATCGCTGCTCAATTTCCAGACGGTGATCACCGATCTCACGGGGCTTCCTATG 770
Query 688 TCGAACGCTTCG-TTGCTCGATGAAGGTACGGCGGCGGCGGAAGCAATGGCGATGTGTAA 746
||||| || ||| || || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 771 TCGAATGCGTCGCTT-CTGGATGAAGGGACCGCTGCTGCGGAGGCAATGGCCATGTGTAA 829
Query 747 TAATATTCTAAAGGGGAAGAAGAAGACGTTTGTTATTGCTAGTAATTGTCATCCTCAGAC 806
|| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 830 CAACATTCTTAAGGGTAAAAAGAAGACCTTTGTGATTGCTAGTAACTGTCACCCTCAGAC 889
Query 807 TATTGATGTTTGCAAGACGAGAGCGGAT-GGTTTCGATTTGAAAGTTGTGACGGTTGATA 865
|||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||| || | ||||
Sbjct 890 TATTGATGTTTGTAAGACTAGAGCTGATGGGTTT-GATTTGAAAGTTGTTACCGCTGATC 948
Query 866 TTAAGGATGTGGATTATAGCTCTGGTGATGTGTGTGGAG-TGTTGGTTCAGTATCCGGGG 924
|||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| | | || ||||||||||| ||
Sbjct 949 TTAAGGATATAGATTACAGCTCTGGTGATGTTTGTGGGGTTCTT-GTTCAGTATCCTGGT 1007
Query 925 ACTGAAGGGGAGGTGTTGGATTATGGTGAGTTTGTTAAGAATGCTCATGCTAATGGTGTT 984
|||||||| || || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1008 ACTGAAGGTGAAGTCTTGGATTATGCTGAGTTTGTCAAGAATGCTCATGCTAATGGTGTT 1067
Query 985 AAGGTTGTTATGGCTACGGATTTGTTGGCTTTGACGATGTTGAAACCGCC-GGGTGAGTT 1043
|||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| || ||
Sbjct 1068 AAGGTTGTTATGGCTACGGATTTGCTGGCTTTGACCATGTTGAAACCCCCTGGG-GAATT 1126
Query 1044 TGGGGCGGATATTGTTGTTGGGTCGGGTCAGAGGTTTGGTGTTCCGATGGGTTATGGTGG 1103
||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1127 TGGGGCGGATATTGTTGTTGGTTCAGCTCAAAGGTTTGGTGTTCCCATGGGTTATGGAGG 1186
Query 1104 TCCTCATGCTGCTTTCTTGGCTACTTCACAAGAGTATAAGAGAATGATGCCTGGGAGGAT 1163
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1187 CCCTCATGCTGCGTTCTTGGCTACTTCACAAGAGTATAAGAGAATGATGCCTGGGAGGAT 1246
Query 1164 TATTGGTGTTAGTGTTGATTCTTCCGGGAAGCAAGCTTTGCGTATGGCTATGCAGACTAG 1223
||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1247 TATTGGTATTAGTGTTGATTCTTCAGGAAAGCAAGCTCTGCGTATGGCTATGCAGACTAG 1306
Query 1224 GGAACAGCATATCCGCAGGGATAAAGCTACCAGCAACATCTGTACCGCTCAGGCCTTGCT 1283
||| |||||||| | ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||
Sbjct 1307 GGAGCAGCATATTAGGAGGGACAAAGCCACTAGCAACATCTGTACTGCTCAAGCGTTGCT 1366
Query 1284 TGCAAATATGACTGCTATGTATGCTGTTTACCATGGACCAGAAGG-CTTAAAATCTATTG 1342
||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||
Sbjct 1367 TGCCAACATGGCTGCCATGTATGCTGTTTACCATGGACCTGCAGGTCT-AAAATCTATTG 1425
Query 1343 CACAACGGGTTCATGGTCTCGCTGGTGTATTTGCCTTAGGATTGAAGAAACT-GGGAACT 1401
| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| || ||||| || ||| |
Sbjct 1426 CCCAGCGTGTTCATGGTCTTGCTGGCATATTTTCCTTAGGGTTAAAGAAGCTTGGGGTC- 1484
Query 1402 GCACAAGTCCAAGATCTTCCCTTCTTTGACACTGTCAAAGTTACA-TGTTCAGATGCA-A 1459
||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||| |||||| |
Sbjct 1485 GCAGAAGTCCAAGAACTTCCCTTCTTTGACACTGTAAAAATTA-AGTGTTCGGATGCACA 1543
Query 1460 CTGCAATTTTTGATGTGGCAGCCAAGAAG-GAGATCAATTTGCGTCTTGTGGACTCCAAC 1518
||||||| ||||| || |||| ||| || || ||| ||||| |||||||||| |||
Sbjct 1544 -TGCAATTGCTGATGCAGCTTCCAA-AAGTGAAATTAATCTGCGTGTTGTGGACTC-AAC 1600
Query 1519 -ACTATTACTG-TTGCTTTCGATGAAACAACCACCTTGGATGATGTCGATAAACTTTTTG 1576
|||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1601 CACTATTACTGCTTCCTTT-GACGAAACAACCACCTTGGATGATGTCGACAAACTTTTCA 1659
Query 1577 AAGTTTTTGCTTCGGGCAAGCCCGTTCAATTCACGGCTGAGTCTCTTGCACCGGAGTTTA 1636
||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||
Sbjct 1660 AAGTTTTTGCTTCTGGCAAGCCTGTTCCATTTACGGCTGAATCTCTAGCACCCGAGGTTC 1719
Query 1637 ACAATGCTATTCCCTCTAGCCTAACAAGAGAGAGCCCTTATCTGACCCATCCAATCTTCA 1696
| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 1720 AGAATTCCATTCCTTCTAGCCTAACAAGAGAGAGTCCTTATCTTACCCACCCAATCTTCA 1779
Query 1697 ACATGTACCACACGGAGCATGAGTTGCTTAGGTACATCCACAAGTTACAAAATAAAGATC 1756
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||
Sbjct 1780 ACATGTACCACACAGAGCATGAGTTGCTTAGGTACATCCACAAGTTACAGTCTAAGGATC 1839
Query 1757 TATCATTGTGCCACAGCATGATTCCACTTGG-ATCTTGTACGATGAAATTGAATGCCACC 1815
||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||| ||
Sbjct 1840 TATCACTGTGCCACAGCATGATTCCA-TTGGGATCTTGTACGATGAAACTAAATGCGACA 1898
Query 1816 ACTGAAATGATGCCAGTCACATGGCCAAGTTTCACCAACATGCACCCTTTTGCTCCTGTT 1875
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 1899 ACTGAAATGATGCCAGTCACATGGCCAAGTTTCACCGACATTCACCCATTTGCTCCTGTT 1958
Query 1876 GAACAAGCCCAAGGTTATCAGGAAATGTTTACGAA--TTTGGGTGAGCTCTTATGTACGA 1933
|||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| |
Sbjct 1959 GAACAAGCACAAGGTTATCAGGAAATGTT--CGAAAATTTGGGTGACCTCTTGTGTACAA 2016
Query 1934 TCACTGGATTCGACTCTTTCTCATTGCAACCTAATGCCGGTGCTGCTGGCGAGTACGCCG 1993
||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |
Sbjct 2017 TCACTGGGTTTGACTCTTTCTCATTGCAACCTAATGCTGGTGCTGCTGGTGAGTATGCTG 2076
Query 1994 GGCTCATGGTTATCCGTGCATATCATATGTCAAGAGGCGATCATCACAGAAATGTGTGCA 2053
|||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
Sbjct 2077 GGCTTATGGTTATCCGCGCATATCACATGTCAAGAGGAGATCATCACCGAAATGTGTGTA 2136
Query 2054 TCATACCTGTTTCTGCACACGGGACAAACCCTGCTAGTGCTGCCATGTGCGGAATGAAAA 2113
|||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 2137 TCATACCTGTCTCTGCACATGGGACAAACCCTGCAAGTGCTGCTATGTGCGGTATGAAAA 2196
Query 2114 TTGTTGCCGTTGGAACTGATGCCAAAGGAAACATTAACATCGAAGAGTTGAGGAACGCCG 2173
|| || | |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| |||| || || |
Sbjct 2197 TTATTACGGTTGGAACTGATGCTAAGGGAAACATCAACATCGAGGAGGTGAGAAAAGCTG 2256
Query 2174 CCGAAGCCAACAAGGACAACTTGGCTGCTCTTATGGTTACATACCCTTCCACCCATGGAG 2233
| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 2257 CAGAAGCCAACAAAGACAACTTAGCCGCTCTTATGGTTACATACCCTTCAACTCATGGAG 2316
Query 2234 TCTACGAAGAGGGTATCGACGAGATCTGCAACATAATTCATGAAAATGGAGGCCAAGTTT 2293
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |
Sbjct 2317 TCTATGAAGAGGGTATCGACGAGATTTGCAACATAATACATGAAAATGGAGGTCAAGTGT 2376
Query 2294 ATATGGATGGTGCTAATATGAATGCACAGGTGGGTTTGACAAGCCCTGGTTTTATTGGAG 2353
| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2377 ACATGGATGGTGCGAACATGAATGCACAGGTTGGCTTGACGAGCCCTGGTTTTATTGGAG 2436
Query 2354 CGGATGTTTGCCATCTCAATCTCCACAAGACCTTCTGTATCCCTCACGGAGGTGGAGGTC 2413
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||
Sbjct 2437 CGGATGTGTGCCATCTCAATCTCCACAAGACCTTCTGTATTCCTCATGGAGGTGGTGGTC 2496
Query 2414 CCGGAATGGG-CCCTATCGGTGTGAAGCAA-CATTTGGCTCCATTCCTACCTTCTCACCC 2471
| || ||||| ||| || ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||
Sbjct 2497 CTGGTATGGGTCCC-ATTGGTGTGAAG-AATCATTTGGCACCATTTCTTCCTTCTCACCC 2554
Query 2472 AGTGATACCTACCGGTGGTATCCCTG-AACCCGAGCAGACATCACCGCTGGGAACCATTT 2530
||||||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||||| ||||| | || | || |
Sbjct 2555 CGTGATACCTACTGGTGGAATCCC-GCAACCCGAGAAGACAGCACCGTTAGGTGCAATAT 2613
Query 2531 CTGCAGCACCATGGGGGTCTGCGCTTATCTTGCCAATCTCGTATACTTACATTGCCATGA 2590
| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 2614 CCGCTGCACCATGGGGATCTGCGCTTATCTTACCAATATCTTATACTTACATTGCCATGA 2673
Query 2591 TGGGATCTGGAGGACTCACCGATGCCTCAAAGATTGCAATTTTGAACGCTAACTACATGG 2650
|||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||
Sbjct 2674 TGGGATCTGGTGGACTCACTGATGCCTCTAAGATTGCAATTTTGAATGCCAATTACATGG 2733
Query 2651 CAAAGCGTCTGGAGAGCCACTACCCAGTTCTTTTCCGTGGTGTCAATGGAACAGTCGCTC 2710
||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
Sbjct 2734 CAAAGCGCCTAGAGAAACACTACCCAGTTCTTTTCCGTGGTGTTAATGGAACAGTAGCAC 2793
Query 2711 ACGAATTCATCATTGACTTGAGAGGATTCAAGAACACTGCTGGAATTGAACCAGAGGATG 2770
||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2794 ACGAATTCATCATAGACTTAAGAGGCTTCAAGAGCACTGCTGGAATAGAACCAGAGGATG 2853
Query 2771 TGGCCAAACGATTGATGGATTATGGTTTCCATGGACCGACAATGTCTTGGCCTGTCCCTG 2830
|||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2854 TGGCGAAACGGCTAATGGACTATGGATTCCATGGACCCACAATGTCTTGGCCTGTCCCTG 2913
Query 2831 GAACGCTTATGATCGAGCCAACCGAAAGCGAAAGCAAGGCTGAGTTAGATAGGTTCTGTG 2890
|||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||||||| |
Sbjct 2914 GAACTCTTATGATTGAGCCAACCGAGAGTGAAAGCAAGGCGGAGCTAGACAGGTTCTGCG 2973
Query 2891 ATGCTCTCATCTCGATCAGGGAAGAGATTTCACAGATTGAGAAAGGAAACGCAGAT--CC 2948
|||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||| ||
Sbjct 2974 ATGCTCTCATTTCAATCAGGGAAGAAATTGCACAGATTGAAAAAGGAAATGCAGATGTCC 3033
Query 2949 AAACAACAACGTTCTGAAGGGTGCTCCACATCCTCCGTCATTGCTAATGGCAGATACATG 3008
| | | |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||
Sbjct 3034 AGA-A-CAACGTCCTTAAGGGAGCTCCACATCCTCCATCGTTGCTAATGGCAGACACATG 3091
Query 3009 GAAAAAGCCGTATTCACGGGAATACGCAGCCTTCCCCGCTCCATGGCTCCGCTC-CTCCA 3067
||||||||||||||| || || ||||| || ||||| || || |||||||| | ||| |
Sbjct 3092 GAAAAAGCCGTATTCTCGAGAGTACGCTGCTTTCCCTGCCCCGTGGCTCCG-TAACTCAA 3150
Query 3068 AGTTCTGGCCCACTACAGGGCGAGTGGACAACGTGTATGGAGACCGTAATCTGGTGTGCA 3127
||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||| | || ||||||||||
Sbjct 3151 AGTTCTGGCCCACCACAGGGCGTGTGGACAATGTATATGGAGACAGGAAACTGGTGTGCA 3210
Query 3128 CTCTCCAACCGGCGAACGAAGAACAGGCTGCAGCTGCAGTGTCTGCTT 3175
|||||| || | | |||||||| | |||||||||||| |||||||
Sbjct 3211 CTCTCCTCCCAGAG---GAAGAACAAGTTGCAGCTGCAGTATCTGCTT 3255
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 132326181321
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5