BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G27040.1
Length=3170
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg481584 jgi|Araly1|481584|fgenesh2_kg.4__644__AT2G27040.1 4924 0.0
Ahg326484 jgi|Araly1|326484|fgenesh1_pm.C_scaffold_6001704 150 5e-35
> Ahg481584 jgi|Araly1|481584|fgenesh2_kg.4__644__AT2G27040.1
Length=3118
Score = 4924 bits (2666), Expect = 0.0
Identities = 2980/3130 (95%), Gaps = 28/3130 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 33 taaaaaagcaaaagagagaaattgaaaaaaaaagaaagaaaaaTAATCCTCTCTTGTTTC 92
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1 TAAAAAAGCAAAAGAGAGAAATTGAAAAAAAAGGAAAGAAAAAAAATCCTCTCTTGTTTC 60
Query 93 GGCTAGGGTTTCGTTTTTGTTTCATCGATAAACTCAAAGGAGATGGATTCAACAAATGGT 152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GGCTAGGGTTTCGTTTTTGTTTCATCGATAAACTCAAAGGAGATGGATTCAACAAATGGT 120
Query 153 AACGGAGCTGATCTTGAATCAGCAAATGGGGCAAACGGGAGT--GG-GGTTACTGAGGCA 209
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||
Sbjct 121 AACGGAGCTGATCTTGAATCAGCAAATGGAGCAAACGGGAGTGGGGTGGTTACTGATGCA 180
Query 210 TTACCACCTCCTCCACCAGTTATACCTCCAAATGTGGAACCAGTTCGTGTTAAAACTGAA 269
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TTGCCACCTCCTCCACCAGTTATACCTCCAAATGTGGAACCAGTTCGTGTTAAAACTGAA 240
Query 270 CTTGCTGAGAAGAAGGGGCCAGTT-CGAGTTCCTATGGCTCGAAAAGGATTTGGAACAAG 328
|||||||||||||| | | || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||
Sbjct 241 CTTGCTGAGAAGAA---G-AACTTGCGAGTTCCTATGGCTAGAAAAGGCTTTGGAACAAG 296
Query 329 GGGCCAAAAGATCCCCTTGTTAACAAATCATTTCAAAGTCGATGTGGCTAATCTTCAGGG 388
||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGGACAAAAGATTCCATTGTTGACTAATCATTTCAAAGTCGATGTGGCTAATCTTCAGGG 356
Query 389 TCATTTCTTCCACTACAGTGTGGCTCTATTCTATGATGATGGTCGTCCTGTTGAA-CAAA 447
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 357 CCATTTCTTCCACTACAGTGTTGCGCTATTCTATGATGATGGTCGTCCTGTTGAAGC-AA 415
Query 448 AGGGTGTTGGAAGAAAAATCCTTGACAAGGTGCATCAGACTTACCATTCTGATCTGGATG 507
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 416 AGGGTGTTGGAAGAAAAATCCTTGACAAGGTGCATGAGACTTACCATTCTGATCTAGATG 475
Query 508 GTAAAGAGTTTGCTTATGACGGTGAGAAGACGTTGTTTACATATGGAGCTTTGCCTAG-T 566
||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 476 GTAAAGAGTTTGCTTATGATGGTGAGAAGACGCTGTTTACATATGGAGCTTTGCCT-GAT 534
Query 567 AACAAGATGGATTTTTCTGTGGTGCTTGAGGAAGTATCTGCTACAAGGGCTAATGGAAAC 626
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 535 AACAAGATGGATTTTTCTGTGGTGCTTGAGGAAGTATCTGCTGCAAGGACTAATGGAAAC 594
Query 627 GGAAGCCCCAATGGGAATGAAAGTCCAAGTGATGGTGATAGGAAAAGACTGCGTAGGCCT 686
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 595 GGAAGCCCCAATGGGAATGAAAGTCCAAGTGATGGTGATAGGAAAAGACTGCGTAGGCCT 654
Query 687 AACCGGTCCAAAAACTTTAGAGTGGAGATCAGCTATGCGGCCAAAATTCCTCTTCAAGCT 746
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 655 AACCGGTCCAAAAACTTTAGAGTGGAGATCAGCTATGCGGCCAAAATTCCTCTACAAGCT 714
Query 747 CTTGCTAATGCAATGCGGGGACAAGAATCAGAGAATTCCCAGGAGGCAATACGGGTTCTT 806
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 715 CTTGCTAATGCAATGCGGGGACAAGAATCAGAGAACTCCCAGGAGGCAATACGGGTTCTT 774
Query 807 GATATCATATTGAGGCAACATGCTGCTAGACAAGGTTGCTTGCTTGTTCGACAGTCTTTT 866
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 775 GATATCATATTGAGGCAACATGCTGCTAGACAAGGTTGCTTGCTTGTTCGACAGTCTTTT 834
Query 867 TTCCACAATGATCCAACCAACTGTGAACCAGTTGGTGGTAACATCTTAGGATGTAGGGGA 926
|||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 835 TTCCACAATGATCCAAGTAACTGTGAACAAGTTGGTGGTAACATCTTAGGATGTAGGGGA 894
Query 927 TTTCACTCCAGTTTCAGAACAACGCAGGGTGGCATGTCACTTAATATGGATGTTACAACC 986
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 895 TTTCACTCCAGTTTCAGAACAACGCAGGGTGGCATGTCACTTAATATGGATGTTACAACC 954
Query 987 ACCATGATCATCAAGCCTGGTCCAGTGGTTGATTTCCTAATTGCTAACCAAAATGCTAGG 1046
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 955 ACCATGATCATCAAGCCTGGTCCAGTGGTTGATTTCCTAATTGCTAACCAAAATGCGAGG 1014
Query 1047 GACCCTTATTCGATTGACTGGTCTAAGGCTAAACGAACCCTTAAGAACCTAAGGGT-AAA 1105
|| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1015 GATCCTTATTCGATTGACTGGTCTAAGGCTAAAAGGACCCTTAAGAACCTAAGGGTTAAA 1074
Query 1106 GGTCAGCCCCTCAGGCCAAGAATTCAAGATAACCGGATTGAGTGACAAGCCTTGCAGGGA 1165
| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1075 G-TCAGCCCCTCAAACCAAGAATTCAGGATCACCGGATTGAGTGACAAGCCTTGCAGGGA 1133
Query 1166 ACAAACGTTTGAATTGAAGAAAAGGAACCCAAATGAAAATGGAGAGTTCGAAACTACTGA 1225
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1134 ACAAACGTTTGAATTGAAGAAAAGGAACCCAAATGAAAATGGAGAGTTCGAAACTACTGA 1193
Query 1226 AGTTACAGTTGCTGACTACTTCCGCGATACAAGGCATATTGATTTGCAATATTCTGCGGA 1285
||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1194 AGTGACAGTTGCTGACTACTTCCGTGAAACAAGGCATATTGATTTGCAATATTCTGCGGA 1253
Query 1286 T-TTGCCTTGCATCAATGTTGGGAAGCCAAAGCGACCCACTTACATTCCTCTCGAGCTCT 1344
| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1254 TCTT-CCGTGCATCAATGTTGGGAAGCCAAAGCGACCCACTTACATTCCTCTTGAGCTCT 1312
Query 1345 GCGCGTTGGTTCCACTTCAGAGGTACACAAAAGCACTTACCACGTTCCAAAGATCTGCCC 1404
|||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 1313 GCGCCTTGATTCCACTTCAGAGGTACACAAAAGCGCTTAACACATTCCAAAGATCTGCCC 1372
Query 1405 TTGTTGAGAAATCCAGACAGAAACCCCAAGAGAGGATGACTGTTCTGTCCAAAGCTCTGA 1464
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1373 TTGTTGAGAAATCCAGACAGAAACCCCAAGAGAGGATGACTGTTCTGTCCAAAGCTCTTA 1432
Query 1465 AAGTTAGCAACTATGATGCGGAACCACTCCTGCGATCCTGTGGCATTTCGATCAGCTCCA 1524
||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1433 AAGTTAGCAACTATGATGCTGAACCACTCCTGCGTTCCTGTGGCATTTCGATCAGCTCCA 1492
Query 1525 ACTTTACTCAGGTGGAGGGTCGTGTTCTACCAGCTCCCAAGCTGAAAATGGGATGTGGAT 1584
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1493 ACTTTACTCAGGTGGAGGGTCGTGTTCTACCAGCTCCCAAGCTGAAAATGGGATGTGGAT 1552
Query 1585 CTGAAACCTTTCCCAGAAATGGTCGCTGGAACTTCAACAACAAGGAATTTGTTGAGCCCA 1644
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1553 CTGAAACCTTTCCCAGAAATGGTCGCTGGAATTTCAACAACAAGCAATTTGTTGAGCCCA 1612
Query 1645 CCAAAATTCAACGATGGGTTGTTGTCAATTTCTCTGCTCGCTGTAATGTACGTCAAGTTG 1704
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1613 CCAAAATTGAACGATGGGTTGTTGTCAATTTCTCCGCTCGCTGTAATGTACGCCAAGTTG 1672
Query 1705 TTGATGATCTGATAAAAATTGGAGGATCAAAAGGAATTGAAATTGCTTCTCCCTTTCAAG 1764
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1673 TTGATGATCTGATCAAAATTGGGGGATCAAAAGGAATTGAAATTGCTCCTCCCTTTCAAG 1732
Query 1765 TGTTTGAGGAGGGTAATCAATTCCGCCGTGCTCCTCCTATGATTCGTGTTGAGAACATGT 1824
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1733 TGTTTGAGGAGGGTAATCAATTCCGCCGCGCTCCTCCTATGAATCGTGTTGAGAACATGT 1792
Query 1825 TTAAGGACATCCAATCGAAACTCCCTGGTGTCCCACAATTCATACTATGTGTGCTCCCTG 1884
||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1793 TTAAGGACATCCAGTCTAAACTCCCTGGTGTCCCACAATTCATACTATGTGTGCTCCCAG 1852
Query 1885 ACAAAAAGAACAGTGATCTCTATGGTCCATGGAAGaaaaaaaaCTTAACTGAATTTGGCA 1944
| ||||||||| |||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1853 AGAAAAAGAACTGTGATCTCTACGGGCCCTGGAAGAAGAAAAACTTAACTGAATTCGGCA 1912
Query 1945 TTGTTACTCAATGCATGGCTCCAACGCGGCAACCTAATGATCAGTATCTTACTAACTTAC 2004
||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1913 TTGTTACTCAATGCATGGCCCCGACGCGGCAACCTAATGATCAGTATCTTACAAACTTAC 1972
Query 2005 TTCTGAAGATTAATGCAAAGCTTGGAGGCCTGAACTCAATGTTAAGTGTAGAGCGTACAC 2064
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1973 TTTTGAAGATTAATGCAAAGCTTGGAGGCCTGAACTCAATGTTAAGTGTAGAGCGTACAC 2032
Query 2065 CTGCGTTCACTGTGATTTCTAAGGTTCCAACCATTATCCTTGGGATGGATGTTTCACATG 2124
|||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2033 CTGCCTTCACTGTGATTTCCAAGGTTCCAACCATTATCCTTGGGATGGATGTTTCACATG 2092
Query 2125 GATCTCCTGGACAGTCTGATGTCCCGTCCATCGCTGCTGTGGTGAGTTCTAGGGAGTGGC 2184
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2093 GATCTCCTGGACAGTCTGATGTCCCGTCCATTGCTGCTGTGGTGAGTTCGAGGGAGTGGC 2152
Query 2185 CACTGATATCCAAATATAGAGCATCTGTTCGGACACAGCCTTCTAAGGCTGAGATGATTG 2244
|||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2153 CACTAATCTCCAAATATAGAGCATCTGTTCGGACACAGCCTTCTAAGGCTGAGATGATTG 2212
Query 2245 AGTCCCTTGTCAAGAAAAATGGAACTGAAGACGATGGCATTATCAAGGAGTTGCTGGTAG 2304
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 2213 AGTCCCTTTTCAAGAAAAATGGAACTGAAGACGATGGCATCATCAAGGAGTTGCTGGTTG 2272
Query 2305 ATTTCTACACCAGCTCGAATAAGAGAAAACCAGAGCATATCATAATTTTCAGGGATGGTG 2364
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2273 ATTTCTACACCAGCTCGAATAAGAGAAAGCCAGAGCATATCATAATTTTCAGGGATGGTG 2332
Query 2365 TGAGTGAATCTCAATTCAATCAGGTTCTGAATATTGAACTTGATCAGATCATCGAGGCTT 2424
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2333 TGAGTGAATCTCAATTCAATCAGGTTCTGAATATCGAACTCGATCAGATCATCGAGGCTT 2392
Query 2425 GCAAGCTC-TTAGACGCAAATTGGAACCC-AAAGTTCCTTTTGTTGGTGGCTCAAAAGAA 2482
|||||||| || || || |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2393 GCAAGCTCCTT-GATGCGAATTGGAATCCGAAA-TTCCTCTTGTTGGTGGCTCAAAAGAA 2450
Query 2483 TCATCATACCAAGTTCTTCCAGCCAACGTCTCCTGAAAATGTTCCTCCAGGGACAATCAT 2542
||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2451 TCATCATACAAAGTTCTTCCAGACATCGTCTCCTGATAATGTTCCCCCAGGGACAATCAT 2510
Query 2543 TGACAACAAAATATGTCACCCAAAGAACAATGATTTCTACCTCTGTGCTCACGCTGGAAT 2602
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2511 TGACAACAAAATATGTCACCCAAAGAACAATGATTTCTACCTCTGTGCGCACGCTGGAAT 2570
Query 2603 GATTGGAACTACCCGCCCAACTCACTACCACGTCCTGTATGATGAGATTGGTTTTTCAGC 2662
||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2571 GATTGGAACTACCCGTCCAACTCACTACCATGTCCTGTATGATGAGATTGGTTTTTCACC 2630
Query 2663 TGACGAACTTCAGGAACTTGTCCACTCGCTCTCCTATGTGTACCAAAGAAGCACCAGTGC 2722
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2631 TGATGAACTTCAGGAACTTGTCCACTCGCTCTCCTATGTGTACCAAAGAAGCACCAGTGC 2690
Query 2723 CATTTCTGTTGTTGCGCCGATCTGCTATGCTCACTTGGCAGCTGCTCAGCTTGGGACGTT 2782
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2691 CATTTCTGTTGTTGCGCCGATCTGCTATGCTCACTTAGCAGCTGCTCAGCTTGGGACGTT 2750
Query 2783 CATGAAGTTTGAAGATCAGTCTGAGACATCATCAAGCCATGGTGGTATCACAGCTCCAGG 2842
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||
Sbjct 2751 CATGAAGTTTGAAGATCAGTCGGAGACATCATCAAGCCATGGTGGCATTACAGCTCCTGG 2810
Query 2843 ACCAATCTCTGTTGCACAGCTCCCAAGACTCAAAGACAACGTCGCCAACTCCATGTTCTT 2902
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2811 ACCAATCTCTGTTGCACAGCTCCCAAAACTCAAAGACAACGTCGCCAACTCCATGTTCTT 2870
Query 2903 CTGTTAAATGAGCAGCCCTACTTGGCTCAGTAAGTAAGTAGTAGTTCAATAGGCTATCTG 2962
||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||
Sbjct 2871 CTGTTAAATGAGCAGTCATACTTGGCTCAGTAAGTA-GTAGTAGTTAAATCGGCTTTCTG 2929
Query 2963 ACTTTCAGCTTAGGATCTCTCTCGGCCTTGAAGCC---A-GGCATCGA-CACTAAGGCTT 3017
||||| | |||||||||||||||||| || |||| | |||||| | |||||||||||
Sbjct 2930 ACTTTTATCTTAGGATCTCTCTCGGCTTTTAAGCGTTTAAGGCATCAAACACTAAGGCTT 2989
Query 3018 GGAATGTTTTTTGTGACTATTATCGCCAGCCTTGTTTGCCTGTTGGGGTTTGAATATGCT 3077
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2990 GGTATGTTTTTTGTGACTATTATCGCCAGCCTTGTTTGCCTGTTGGGGTTTGAATATGCT 3049
Query 3078 TTTGTCCCCCTT-AACAATTCGGTTGTTTAATTAAAGACTTATTGTAGTGAATATCTAAG 3136
|||| |||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3050 TTTG-CCCCTTTTAACTATTCGGTTGTTTGGTTAAAGACTTATTGTAGTGAATATCTAAG 3108
Query 3137 TTCAGGAAGT 3146
||| ||||||
Sbjct 3109 TTCTGGAAGT 3118
> Ahg326484 jgi|Araly1|326484|fgenesh1_pm.C_scaffold_6001704
Length=2547
Score = 150 bits (81), Expect = 5e-35
Identities = 388/533 (73%), Gaps = 34/533 (6%)
Strand=Plus/Plus
Query 1898 TGATCTCTATGGTCCATGGAAGaaa-aaaaa-CTTAACTGAATTTGGCATTGTTACTCAA 1955
|||| | |||||||| ||||| ||| ||||| ||| | || |||| ||||| | |||
Sbjct 1593 TGATGTTTATGGTCCTTGGAA-AAAGAAAAATCTT-GTTCAAGTTGGAATTGTGAATCAG 1650
Query 1956 TGCATGGCTCCAACGCGGCAAC-CTAATGATCAGTATCTTACTAACT-TACTTCTGAAGA 2013
|| || ||||| | | ||| ||||||||| ||||| || || | | || || ||||
Sbjct 1651 TGTATTGCTCCTCCTC-AAAACGTTAATGATCATTATCTCAC-AAATGTTCTCCTCAAGA 1708
Query 2014 TTAATGCAAAGCTTGGAGGCCTGAACTCAATGTTAAG-TGTAGAGC-GTACACCTGC-GT 2070
| ||||| |||||||| || |||| ||| |||| | | | |||| || ||| || |
Sbjct 1709 TAAATGCCAAGCTTGGTGGATTGAATTCAGTGTT-GGATATGGAGCGGT-CACGGGCAAT 1766
Query 2071 TCACTGTGATTTCT-AAGGTTCCAACCATTATCCTTGGGATGGATGTTTCACATGGATCT 2129
| || || | | || ||||| ||||| || ||||||||||||| || ||||| |||
Sbjct 1767 GC-CTTTG-GTAATGAAAGTTCCTACCATCATTATTGGGATGGATGTATCTCATGGTTCT 1824
Query 2130 CCTGGACAGTCTGATGTCCCGTCCATCGCTGCTGTGGTGAGTTCTAGGGAGTGGCCACTG 2189
||||||||||||||||| || ||||| || || || ||||| || || || |||||||||
Sbjct 1825 CCTGGACAGTCTGATGTACCATCCATTGCCGCGGTTGTGAGCTCCAGAGAATGGCCACTG 1884
Query 2190 ATATCCAAATATAGAGCATCTGTTCGGACACAGCCTTC-TAAGGCTGAGATGATTGAGT- 2247
|| || ||||| || || | ||| || |||||| | | ||| | ||| ||||| || |
Sbjct 1885 ATCTCAAAATACAGGGCTTGTGTGCGTACACAGTC-GCGTAAAGTTGAAATGATCGA-TA 1942
Query 2248 -CC-CTTGTCAAGAAAAAT-GGA-ACTGAAGACGATGGCATTATCAAGGAGTTGC-TGGT 2302
|| ||| | || | | || | || || || || || || | |||| | | || |
Sbjct 1943 ACCTCTT-TAAACCAGTCTCTGACAAAGATGATGAAGGTATCATGAGGGAGCT-CTTGCT 2000
Query 2303 AGA-TTTCTACACCAGCTCGAAT-AAGAGAAAACCAGAGCATATCATAATTTTCAGGGAT 2360
|| ||| ||| | || || | || ||| ||| | || || || ||||||||||||
Sbjct 2001 TGACTTT-TACTCAAGTTC---TGCAGTCAAACCCA-ATCACATTATTATTTTCAGGGAT 2055
Query 2361 GGTGTGAGTGAATCTCAATTCAATCAGGTTCTGAATATTGAACTTGATCAGAT 2413
||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 2056 GGTGTGAGTGAATCTCAGTTTAACCAAGTTCTTAATATTGAACTGGATCAGAT 2108
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 119755730280
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5