BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G27100.1
Length=2501
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg481593 jgi|Araly1|481593|fgenesh2_kg.4__653__AT2G27100.1 3568 0.0
Ahg481599 jgi|Araly1|481599|fgenesh2_kg.4__659__AT2G27100.1 3070 0.0
> Ahg481593 jgi|Araly1|481593|fgenesh2_kg.4__653__AT2G27100.1
Length=2388
Score = 3568 bits (1932), Expect = 0.0
Identities = 2137/2235 (96%), Gaps = 18/2235 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 16 CCGATTTAGGGTTCCGAACGAAATGGCCGATGTTAATCTTCCTCCGTCTGATT---CCGT 72
||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1 CCGATTTAGGGTTCCGATCCAAATGGCCGATATTACTCTTCCTCCGTCTGATTCCGCCGT 60
Query 73 CGATAACCGTCTCCCTGAGAAATCAACCTCTTCCTCACCACCTCCTCCACCGCCTTCTTC 132
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||
Sbjct 61 CGATAACCGTCTCCCTGAGAAATCTACCTCTTCCTCACCACCACCTCCACCGGCTTCTTC 120
Query 133 TTCTCTGCCGCAGCAGGAACAGGAACAAGACCAGCAGCAGCTTCCGCTACGCCGTGAGAG 192
||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 121 CTCTCTACCGCAACAAGAACAGGAACAAGACCAGCAACAGCCTCCGCAACGCCGTGAGAG 180
Query 193 AGATTCACGAGAGCGTCGTGACGAGAGAGACATCGAACGTCCTCCGCCTAATCGCCGTGA 252
|||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 181 AGATTCACGAGA----C----C----GAGACATCGAACGTCCTCCTCCTAATCGCCGTGA 228
Query 253 ACGTGACCGTTCGCCTCTCCCACCGCCTCGTAGGGATTACAAGAGACGTCCTAGCTTGAG 312
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 229 CCGTGACCGTTCGCCTCTCCCACCGCCTCGTAGGGATTATAAGAGACGGCCTAGCTTGAG 288
Query 313 TCCTCCGCCACCGTATAGAGATAGGCGACACTCTCCTCCTCAGCGTCGCTCGCCTCCTCA 372
||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 289 TCCTCCGCCACCGTACAGAGATAGGCGGCACTCTCCTCCTCAGCGTCGTTCGCCTCCTCA 348
Query 373 AAAGCGTTATCGGAGGGATGATAATGGCTATGATGGTCGCCGTGGTAGTCCTCGTGGTGG 432
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 349 TAAGCGTTATCGGAGGGATGATAATGGCTATGATGCTCGCCGTGGCAGTCCTCGTGGTGG 408
Query 433 CTATGGACCACCCGATAGAAGATTTGGGTATGACCATGGTGGAGGATATGACCGTGAAAT 492
|||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 409 CTATGGGCCTCCCGATAGAAGATTTGGATATGACCATGGTGGAGGATATGACCGTGAAAT 468
Query 493 GGGTGGGAGGCCTGGTTATGGTGATGAAAGGCCTCATGGTCGCTTTATGGGTCGCTATCA 552
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 469 GGGTGGGAGGCCTAATTATGGTGATGAAAGGCCTCATGGCCGCTTTATGGGTCGCTATCA 528
Query 553 GGACTGGGAGGGAGGACGTGGAGGTTATGGTGATGCTTCCAACAGTGGAAATCCTCAAAG 612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 529 AGACTGGGAGGGAGGACGTGGAGGTTATGGTGATGCTTCCAACAGTGGAAATACTCAAAG 588
Query 613 GGATGGATTGATGTCATACAAACAATTTATCCAGGAGTTGGAAGATGATATATTGCCATC 672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 589 GGATGGATTGATGTCATACAAACAATTTATCCAGGAGTTGGAAGATGATATATTGCCATC 648
Query 673 TGAAGCTGAACGCAGATATCAAGAATACAAGTCAGAGTATATCACAACACAAAAACGTGC 732
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 649 AGAAGCTGAACGCAGGTATCAAGAATATAAGTCAGAGTATATCACAACACAGAAACGTGC 708
Query 733 CTTTTTTAACACCCACAAAGAGGAAGACTGGTTGAAAAATAAGTATCATCCAACAAACTT 792
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 709 CTTTTTTAACACCCACAAAGAGGAAGACTGGTTAAAAAATAAATATCATCCAACAAACTT 768
Query 793 ACTATCTGTCATAGAAAGGAGGAATGACCTTGCACAGAAGGTGGCAAAGGATTTCTTACT 852
||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 769 ACTCTCTGTCATAGAAAGGAGGAATGAGCTTGCACAGAAGGTGGCAAAGGATTTCTTACT 828
Query 853 TGATTTACAAAGCGGGACACTAGATTTAGGCCCTGCAGTGACAGCATTGAATAAATCCGG 912
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 829 TGATTTACAAAGCGGGACACTAGATTTAGGTCCTGCAGTGACAGCATTGAATAAATCCGG 888
Query 913 CCGGACCAGTGAGCCTAATTCTGAGGATGAAGCCGCTGGTGTTGGTAAAAGAAAAAGGCA 972
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||
Sbjct 889 CCGGACCAGTGAACCAAATTCTGAGGATGAAGCCGCTGGTGGTGGTAAAAGAAAAAGACA 948
Query 973 TGGTATGGGTGGAGCTAAAGAGAATGAACTTCTTTCAGCCGCACCGAAAGCACCCAGTTT 1032
||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 949 TGGTATGGGGGGAGCTAAAGAGACTGAACTTCTTTCAGCCGCACCGAAAGCACCCAGTTT 1008
Query 1033 CACCTCTGATCCAAAGAGAATCCTGACTGACGTTGAACAAACACAAGCCCTTGTGCGTAA 1092
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009 CACCTCTGATCCAAAGAGAATTCTGACTGACGTTGAACAAACACAAGCCCTTGTGCGTAA 1068
Query 1093 GCTAGACTCTGAGaaaaaaaTTGAGGAAAATGTTTTACAAGGTTCAGAAACTGAAAAATC 1152
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1069 GCTAGACTCTGAGAAGAAAATTGAGGAAAATGTTTTACAAGGTTCAGAAACTGAAAAATC 1128
Query 1153 AGGTAGAGAAAAGTTACACAGTGGTTCTACTGGTCCAGTTGTAATCATAAGGGGGTTGAC 1212
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1129 GGGTAGAGAAAAGTTACACAGTGGTTCGACTGGTCCAGTTGTAATCATAAGGGGGTTGAC 1188
Query 1213 ATCTGTGAAAGGCCTTGAGGGTGTTGAATTACTTGACACGCTTGTTACATATCTATGGCG 1272
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1189 ATCTGTGAAAGGCCTTGAGGGTGTTGAATTACTCGACACGCTTGTTACATATCTATGGCG 1248
Query 1273 TGTTCATGGTCTGGACTATTACGGAAAGGTTGAAACAAATGAAGCTAAGGGTTTGCGGCA 1332
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1249 TGTTCATGGTGTGGACTATTACGGAAAGGTTGAAACAAATGAAGCTAAGGGTCTGCGGCA 1308
Query 1333 TGTGAGAGCTGAAGGAAAAGTTTCTGATGCAAAAGGAGATGAGAATGAAAGTAAATTCGA 1392
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||
Sbjct 1309 TGTGAGAGCTGAAGGAAAAGGTTCTGATGCAAAAGGAGATGAGAGTGAAAGTAAATTTGA 1368
Query 1393 CTCTCATTGGCAAGAGAGGTTGAAAGGTCAAGATCCCTTGGAAGTGATGGCTGCCAAAGA 1452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1369 CTCTCATTGGCAAGAGAGGTTGAAAGGTCAAGATCCCTTGGAAGTGATGGCTGCCAAAGA 1428
Query 1453 GAAGATAGATGCTGCCGCTACTGAAGCTTTAGATCCACATGTCCGAAAGATTAGAGATGA 1512
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1429 GAAGATAGATGCTGCCGCTACGGAAGCTTTAGATCCACATGTCCGAAAGATTAGAGATGA 1488
Query 1513 GAAGTATGGTTGGAAATATGGTTGTGGAGCCAAGGGCTGCACGAAGCTGTTTCATGCTGC 1572
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1489 GAAGTATGGTTGGAAATATGGTTGTGGAGCCAAGGGGTGCACGAAGCTGTTTCATGCTGC 1548
Query 1573 TGAATTTGTGTACAAGCATCTCAAGCTGAAACACACTGAGCTTGTCACAGAGCTGACTAC 1632
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1549 TGAATTTGTGTACAAGCATCTCAAGCTGAAACACACTGAGCTTGTCACAGAGCTGACTAC 1608
Query 1633 CAAAGTTCGGGAAGAACTGTATTTTCAGAACTATATGAATGATCCTAATGCTCCAGGAGG 1692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1609 CAAAGTTCGGGAAGAACTGTATTTTCAGAACTATATGAATGATCCTAATGCTCCAGGAGG 1668
Query 1693 ACAACCAGCCACGCAGCAATCTGGCCCGAGAGATAGACCTATAAGACGTAAACCCAGCAT 1752
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1669 ACAACCAGCCACGCAGCAATCTGGCCCGAGAGATAGACCTATAAGACGTAAACCCAGCAT 1728
Query 1753 GGAGAACAGACTGAGGGATGATAGAGGTGGACGCAGAGAGCGTGATGGACGTGCTAATGG 1812
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1729 GGAGAACAGACTGAGGGATGATCGAGGTGGACGCAGGGAGCGTGATGGACGTGCTAATGG 1788
Query 1813 AAATGACAGAAATGATCGGTCAGAAGATCAACAGAGAGGGGATAATGATGGTGGAAATCC 1872
||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1789 AAATGACAGAATTGAACGGTCAGAAGATCAACAGAGAGGGGATAATGATGGTGGAAATCC 1848
Query 1873 TGGGGAAGTTGGGTATGATGCATTTGGTGGACAAGGTGGTGTTCATGTTCCTCCCTTCTT 1932
||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1849 TGGGGAACTTGGGTACGATGCATTTGGTGGACAAGGTGGCGTTCATGTTCCTCCCTTCTT 1908
Query 1933 ATCGGATATAAACCCACCACCAATGCTGATGCCTGTTCCTGGTGCTGGGCCACTGGGACC 1992
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1909 ATCGGATATAAACCCACCACCAATGCTGATGCCTGTTCCCGGTGCCGGGCCACTGGGACC 1968
Query 1993 ATTTGTACCAGCACCACCTGAAGTTGCTATGCAGATGTTCAGGGACCCAAGTGGACCCAA 2052
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1969 ATTTGTACCAGCACCACCTGAGGTTGCTATGCAGATGTTCAGGGACCCAAGTGGACCCAA 2028
Query 2053 C--CC-TCCTTTTGAAGGTAGCGGGAGAGGTGGACCTGCCCCTTTTCTGTTGTCTCCGGC 2109
| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2029 CAACCCTCCTTTTGAAGGTAGCGGGAGAGGTGGACCTGCCCCTTTTCTTTTGTCTCCGGC 2088
Query 2110 CTTTAGACAAGATCCTAGACGGCTGCGCAGCTACCAAGACCTAGATGCTCCAGAGGAAGA 2169
||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2089 CTTTAGACAGGACCCTAGACGGCTACGCAGTTACCAAGACCTAGATGCTCCAGAGGAAGA 2148
Query 2170 AGTGACCGTTATTGATTACAGGAGCTTGTAGACAAGACAGGGCTAGAGAGATCCCGAGTT 2229
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 2149 GGTGACCGTTATTGATTACAGGAGCTTGTAGACAAGAAAGGGCTAGAGAGATGCCGAGTT 2208
Query 2230 TACTGGTTCGGGTTG 2244
||| ||| ||||||
Sbjct 2209 TACCCGTTTGGGTTG 2223
Score = 124 bits (67), Expect = 2e-27
Identities = 150/184 (82%), Gaps = 29/184 (16%)
Strand=Plus/Plus
Query 2312 ATTATGTCTTGTTCCTCCCAATTTTCACTCACTAAAGCGTAAAATACGCACTCCATACAT 2371
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 2233 ATTATTTCTTGTTCCTCCCAATTTTCACTCACTAAAGCGTAAAATACGCACTCCTTA--T 2290
Query 2372 TTCCTTATTGTTTTTCAAAATTTTTCATGTGCTTTCTTACTAATTCTGTTCGACGATGAT 2431
| | | |||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||
Sbjct 2291 --C------G------A---TTTT-CATGTGCTT----ACTAATTCTGTTCGAC-A--AT 2325
Query 2432 TACATAAATAGCATG-AGAATTTCTTGTATTGAATAATGCGTTTTATCCACATTGTTTGT 2490
||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct 2326 TACATAAATGGCATGCA-AATTTCTTGTATTGAATAATCCGTTTTATCAACATTGTTTGT 2384
Query 2491 TATC 2494
||||
Sbjct 2385 TATC 2388
> Ahg481599 jgi|Araly1|481599|fgenesh2_kg.4__659__AT2G27100.1
Length=2319
Score = 3070 bits (1662), Expect = 0.0
Identities = 2045/2226 (92%), Gaps = 42/2226 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 16 CCGATTTAGGGTTCCGAACGAAATGGCCGATGTTAA-TCTTCCTCCGTCTGATTCCGTCG 74
||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1 CCGATTTAGGGTTCCGATCAAAATGGCCGATG-AAACTCTTCCTCCGTCTGAATCCGTCG 59
Query 75 ATAACCGTCTCCCTGAGAAATCAACCTCTTCCTCACCACCTCCTCCACCGCCTTCTTCTT 134
||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 60 ATAACCGTCTCCCTGAGAAATTAACCTCTTCATCACCACCTCCTCCACCGCCTTCTTCCT 119
Query 135 CTCTGCCGCAGCAGGAACAGGAACAAGACCAGCAGCAGCTTCCGCTACGCCGTGAGAGAG 194
|||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 120 CTCTGCCGCAACAGGAGCAGGAACAAGACCAGGAACAGCCTCCGCAACGCCGTGAGAGAG 179
Query 195 ATTCACGAGAGCGTCGTGACGAGAGAGACATCGAACGTCCTCCGCCTAATCGCCGTGAAC 254
|||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |
Sbjct 180 ATTCTCGCGAGCGGCGTGATGAGAGAGACATCGAACG---TCCACCTAATCGCCGCGACC 236
Query 255 GTGACCGTTCGCCTCTCCCACCGCCTCGTAGGGATTACAAGAGACGTCCTAGCTTGAGTC 314
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 237 GTGACCGTTCGCCTCTCCCACCGCCTCGTAGGGATTACAAGAGACGGCCTAGCTTGAGTC 296
Query 315 CTCCGCCACCGTATAGAGATAGGCGACACTCTCCTCCTCAGCGTCGCTCGCCTCCTCAAA 374
||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 297 CTCCGCCACCGTACAGAGATAGACGGCACTCTCCTCCACAGCGTCGCTCGCCTCCTCAGA 356
Query 375 AGCGTTATCGGAGGGATGATAATGGCTATGATGGTCGCCGTGGTAGTCCTCGTGGTGGCT 434
||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || | | |||
Sbjct 357 AGCGTTACCGGAGGGATGATAATGGCTATGATACTCGCCGTGGT-G-GCT-AT-G-GGCC 411
Query 435 A-TGGACCACCCG-AT--A-G-AAGATTTGGGTATGACCATGGTGGAGGATATGACCGTG 488
| ||| || | | | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 412 ACCGGA-CAGAAGTTTGCATGTTAGATTTGGATATGACCATGGTGGAGGATATGACCGTG 470
Query 489 AAATGGGTGGGAGGCCTGGTTATGGTGATGAAAGGCCTCATGGTCGCTTTATGGGTCGCT 548
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 471 AAATGGGTGGGAGGCCTGGTTATGGTGATGAAAGGCCTCATGGCCGCTTTATGGGTCGCT 530
Query 549 ATCAGGACTGGGAGGGAGGACGTGGAGGTTATGGTGATGCTTCCAACAGTGGAAATCCTC 608
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 531 ATCAAGACTGGGAGGGAGGACGTGGAGGTTATGGTGATGCTTCCAACAGTGGAAATACTC 590
Query 609 AAAGGGATGGATTGATGTCATACAAACAATTTATCCAGGAGTTGGAAGATGATATATTGC 668
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 591 AAAGGAATGGATTGATGTCATACAAACAATTTATCCAGGAGTTGGAAGATGATATATTGC 650
Query 669 CATCTGAAGCTGAACGCAGATATCAAGAATACAAGTCAGAGTATATCACAACACAAAAAC 728
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 651 CATCTGAAGCTGAACGCAGATATCAAGAATATAAGTCAGAGTATATTACAACACAGAAAC 710
Query 729 GTGCCTTTTTTAACACCCACAAAGAGGAAGACTGGTTGAAAAATAAGTATCATCCAACAA 788
||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 711 GTGTCTTTTTTAACAGTCACAAAGAGGAAGAATGGTTGAAGAATAAGTATCATCCAACAA 770
Query 789 ACTTACTATCTGTCATAGAAAGGAGGAATGACCTTGCACAGAAGGTGGCAAAGGATTTCT 848
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||
Sbjct 771 ACTTACTCTCTGTCATAGAAAGGAGGAATGAACTTGCACGGAAGGTGGCGAAGGATTTCT 830
Query 849 TACTTGATTTACAAAGCGGGACACTAGATTTAGGCCCTGCAGTGACAGCATTGAATAAAT 908
||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 831 TACTTGATTTACAGAGCGGGGCAATAGATTTAGGTCCTGCAGTGACAGCATTGGATAAAT 890
Query 909 CCGGCCGGACCAGTGAGCCTAATTCTGAGGATGAAGCCGCTGGTGTTGGTAAAAGAAAAA 968
|| || || ||||||||| | ||| || |||||||| ||||||| ||| |||||||| |
Sbjct 891 CCAGCAGGGCCAGTGAGCAGATTTCAGATGATGAAGCAGCTGGTGGTGGCAAAAGAAAGA 950
Query 969 GGCATGGTATG--GGTGGAGCTAAAGAGAATGAACTTCTTTCAGCCGCACCGAAAGCACC 1026
| ||||||| | || | ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |
Sbjct 951 GACATGGTA-GCAGG-GAAGCTAAAGAGACTGAACTTCTGTCAGCCGCTCCGAAAGCATC 1008
Query 1027 CAGTTTCACCTCTGATCCAAAGAGAATCCTGACTGACGTTGAACAAACACAAGCCCTTGT 1086
||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 1009 CAGTTTCACTTCTGATCCAAAGAGAATCTTAACTGACATTGAACAAGCACAAGCCCTTGT 1068
Query 1087 GCGTAAGCTAGACTCTGAGaaaaaaaTTGAGGAAAATGTTTT-ACAAGGTTCAGAAACTG 1145
||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||
Sbjct 1069 GCGTAAGCTAGACTCGGAGAAAGGAATTGAGGAAAACGTTTTGTC-AGGTTCAGAAAATG 1127
Query 1146 AAAAATCAGGTAGAGAAAAGTTACACAGTGGTTCTACTGGTCCAGTTGTAATCATAAGGG 1205
| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1128 ACAAATTGGGTAGAGAAAAGTTACACAGTGGTTCGACTGGTCCAGTTATAATCATAAGGG 1187
Query 1206 GGTTGACATCTGTGAAAGGCCTTGAGGGTGTTGAATTACTTGACACGCTTGTTACATATC 1265
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 1188 GGTTGACATCTGTGAAAGGCCTTGAGGGCGTTGAATTGCTTGACACACTTGTTACATATC 1247
Query 1266 TATGGCGTGTTCATGGTCTGGACTATTACGGAAAGGTTGAAACAAATGAAGCTAAGGGTT 1325
||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1248 TATGGCGTGTTCATGGTGTGGACTATTATGGAAAGGTTGAAACAAATGAAGCTAAGGGTA 1307
Query 1326 TGCGGCATGTGAGAGCTGAAGGAAAAGTTTCTGATGCAAAAGGAGATGAGAATGAAAGTA 1385
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1308 TGCGGCATGTGAGAGCTGAAGGAAAAGGTTCTGATGCAAAAGGAGATGAGAGTGAAAGTA 1367
Query 1386 AATTCGACTCTCATTGGCAAGAGAGGTTGAAAGGTCAAGATCCCTTGGAAGTGATGGCTG 1445
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1368 AATTTGACTCTCATTGGCAAGAGAGGTTGAAAGGTCAAGATCCCTTGGAAGTGATGGCTG 1427
Query 1446 CCAAAGAGAAGATAGATGCTGCCGCTACTGAAGCTTTAGATCCACATGTCCGAAAGATTA 1505
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1428 CCAAAGAGAAGATAGATGCTGCCGCTACTGAAGCTTTAGATCCACATGTCCGAAAGATTA 1487
Query 1506 GAGATGAGAAGTATGGTTGGAAATATGGTTGTGGAGCCAAGGGCTGCACGAAGCTGTTTC 1565
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1488 GAGATGAGAAGTATGGTTGGAAATATGGTTGTGGAGCCAAAGGCTGCACGAAGCTGTTTC 1547
Query 1566 ATGCTGCTGAATTTGTGTACAAGCATCTCAAGCTGAAACACACTGAGCTTGTCACAGAGC 1625
|||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1548 ATGCGGCTGAATTTGTGTACAAGCATCTCAAACTGAAACACACTGAGCTTGTCACAGAGC 1607
Query 1626 TGACTACCAAAGTTCGGGAAGAACTGTATTTTCAGAACTATATGAATGATCCTAATGCTC 1685
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1608 TGACTACCAAAGTTCGGGAAGAACTGTATTTGCAGAACTATATGAATGATCCTAATGCTC 1667
Query 1686 CAGGAGGACAACCAGCCACGCAGCAATCTGGCCCGAGAGATAGACCTATAAGACGTAAAC 1745
|||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 1668 CAGGAGGACAACCAGCTACTCAGCAATCTGGCCTGAGAGATAGACCTATGAGACGTAGAC 1727
Query 1746 CCAG-CATGGAGAACAGACTGAGGGATGATAGAGGTGGACGCAGAGAGCGTGATGGACGT 1804
| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1728 C-AGGCATGGAGAACAGACTGAGGGATGATCGAGGTGGACGCAGAGAGCGTGATGGACGT 1786
Query 1805 GCTAATGGAAATGACAGAAATGATCGGTCAGAAGATCAACAGAGAGGGGATA---ATG-- 1859
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||
Sbjct 1787 GCTAATGGAAATGACAGAAATGATCGGTCAGAGGATCAACAGAGAGGTGATGGTGATGGT 1846
Query 1860 ----ATGGTGGAAATCCTGGGGAAGTTGGGTATGATGCATTTGGTGGACAAGGTGGTGTT 1915
|||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1847 CCTGATGGTGGAAATCCTAGGGAAGTTGGGTACGATGCATTTGGTGGACAAGGTGGTGTT 1906
Query 1916 CATGTTCCTCCCTTCTTATCGGATATAAACCCACCACCAATGCTGATGCCTGTTCCTGGT 1975
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1907 CATGTTCCTCCCTTCTCATCGGATATAAACCCACCACCAATGCTGATGCCTGTTCCTGGT 1966
Query 1976 GCTGGGCCACTGGGACCATTTGTACCAGCACCACCTGAAGTT-GCTATGCAGATGTTCAG 2034
|| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||
Sbjct 1967 GCCGGGCCACTAGGACCATTTGTACCTGCACCACCTGA-GTTTGCAATGCAGATGTTC-- 2023
Query 2035 GGACCCAAGTGGACCCAACCCTCCTTTTGAAGGTAGCGGGAGAGGTGGACCTGCCCCTTT 2094
|| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| || ||
Sbjct 2024 ---CCTG-GTGGACCCAATCCTCCTTTCGAAGGTAACGGCAGAGGTGGACCTGCACCATT 2079
Query 2095 TCTGTTGTCTCCGGCCTTTAGACAAGATCCTAGACGGCTGCGCAGCTACCAAGACCTAGA 2154
||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 2080 TCTTTTGTCTCCGGCCTTTAGACAGGATCCTAGACGGCTACGCAGTTACCAAGACCTAGA 2139
Query 2155 TGCTCCAGAGGAAGAAGTGACCGTTATTGATTACAGGAGCTTGTAGACAAGACAGGGCTA 2214
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||
Sbjct 2140 TGCTCCAGAGGAAGAGGTGACCGTTATTGATTACAGGAGTTTGTAGAAAAGAAAGGGCTA 2199
Query 2215 GAGAGA 2220
||||||
Sbjct 2200 GAGAGA 2205
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 94273356375
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5