BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT2G27210.1 Length=3816 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg481616 jgi|Araly1|481616|fgenesh2_kg.4__676__AT2G27210.1 5084 0.0 Ahg919586 jgi|Araly1|919586|scaffold_100867.1 3458 0.0 Ahg472815 jgi|Araly1|472815|fgenesh2_kg.1__2769__AT1G25540.1 58.4 4e-07 Ahg358332 jgi|Araly1|358332|fgenesh1_pg.C_scaffold_8002119 52.8 2e-05 > Ahg481616 jgi|Araly1|481616|fgenesh2_kg.4__676__AT2G27210.1 Length=3670 Score = 5084 bits (2753), Expect = 0.0 Identities = 3055/3195 (96%), Gaps = 44/3195 (1%) Strand=Plus/Plus Query 111 TTTTTCCGGGAAGATCTCACCGGAGAAAAGCT-AGCTAGGGTTTCTCCACCGTGAAGATT 169 ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| Sbjct 89 TTTTTCCGGTAGGATCTCACCGGAGAAAAGCTAAGCTAGGGTTTCTCTATCGTGAAGATT 148 Query 170 CTAGAAGCGAGAA-TTTGGAATTTGCTAATTAAGAAGATGTGTTACGATCTTTCTTAATT 228 | ||||||| || ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||||| Sbjct 149 TTCGAAGCGACAACTTT-GAATTTGCTAATTAAGAAGA--TG-T--G----TTCTTAATT 198 Query 229 AAAAAAGCATTGAAATTGACGAATTTAGGGTTGTGAAAAATATGGATTTGGATTCTTCAA 288 || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | Sbjct 199 --AAGAGCTTTGAAATTGACG-ATTTAGGGTTGTGAAAAA-ATGGATTTGGATTCATCTA 254 Query 289 TGGTACCAGAGAATGATCAAGATCCTATTGCTACGTCTGAGAAT---CAATCTCCTATGG 345 ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct 255 TGGTACCAGAGAATGATGAAGATCCTGTTGCTACGCCTGAGAATCACCAATCTCCTATGG 314 Query 346 AG-GAGAA-AG-AAGAAGC-GTCTGA-GCAACAAACCGGATCCGAATCCGAATCGGCGTC 400 || |||| | || ||| || | | || |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 315 AGAAAGAAGCGTCAG-AGCAATC-AACGGAAGAAACTGGATCCGAATCCGAATCGGCGTC 372 Query 401 TTTGACTCCTTCTCTTCCTCCTCCTTCGCAGCAACAACAACAACAGCAGCAACAGCCGCA 460 ||||||||| || ||| ||||||| |||||| ||||| | | | | || || Sbjct 373 TTTGACTCC-TC-CTT-CTCCTCCGTCGCAG---------CAACA--A-C-A-A-CCTCA 414 Query 461 GGTAACGGCGGTGGTTGGTCCGAGATGTGCGCCAACGTATTCGGTTGTGAATGCTATAAT 520 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 415 GGTAACGACGGTGGTTGGTCCGAGATGTGCGCCAACGTATTCGGTTGTGAATGCTATAAT 474 Query 521 CGAGAAGAAAGAAGATGGTCCTGGTCCTAGATGTGGACATACGCTGACGGCGGTTCCTGC 580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || Sbjct 475 AGAGAAGAAAGAAGATGGTCCTGGTCCTAGATGTGGACATACGTTGACGGCGGTTCCGGC 534 Query 581 TGTTGGTGAAGAAGGGACGTCTTCTTATATTGGCCCGAGACTGATCTTGTTTGGTGGTGC 640 |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 535 GGTTGGTGAGGAAGGGACGTCTGGTTATATTGGACCGAGACTGATTTTGTTTGGTGGTGC 594 Query 641 TACTGCTCTTGAGGGTAATTCTGGAGGAACGGGAACACCTACTTCAGCTGGAAGTGCTGG 700 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 595 TACTGCTCTTGAGGGTAATTCTGGAGGAACAGGAACACCTACTTCAGCTGGAAGTGCCGG 654 Query 701 CATTCGGTTAGCTGGTGCAACCGCTGATGTTCATTGTTATGATGTTCTTTCTAATAAGTG 760 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 655 CATTCGACTAGCTGGTGCAACGGCTGATGTTCATTGTTATGATGTTCTTACTAATAAGTG 714 Query 761 GTCGAGGCTTACACCTTATGGAGAACCACCTAGTCCAAGAGCTGCTCATGTTGCTACTGC 820 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 715 GTCGAGGCTTACACCATATGGAGAACCACCTAGTCCAAGAGCTGCTCATGTTGCTACTGC 774 Query 821 TGTTGGGACCATGGTAGTAATTCAGGGGGGAATAGGTCCTGCTGGTTTATCAGCTGAGGA 880 ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 775 TGTTGGGACTATGGTAGTCATTCAGGGTGGAATAGGTCCTGCTGGTTTATCAGCTGAGGA 834 Query 881 TCTTCACGTTCTTGATCTCACACAGCAACGGCCACGATGGCACAGGGTTGTTGTTCAGGG 940 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 835 TCTTCACGTTCTTGATCTCACTCAGCAACGGCCACGATGGCACAGGGTTGTTGTTCAGGG 894 Query 941 TCCTGGACCAGGACCACGTTATGGACATGTCATGGCACTGGTAGGACAGAGGTATCTCAT 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 895 TCCTGGACCAGGACCACGTTATGGACATGTCATGGCACTGGTAGGACAGAGGTATCTCAT 954 Query 1001 GGCAATTGGTGGAAATGATGGGAAACGTCCATTAGCTGATGTATGGGCTTTGGACACTGC 1060 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 955 GGCAATTGGTGGAAATGATGGAAAACGTCCATTAGCTGATGTATGGGCTTTGGACACTGC 1014 Query 1061 TGCCAAACCTTATGAATGGCGTAAGCTGGAACCGGAAGGGGAAGGTCCACCACCATGCAT 1120 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1015 TGCCAAACCTTATGAATGGCGTAAGCTGGAACCGGAAGGGGAAGGTCCACCTCCATGCAT 1074 Query 1121 GTATGCAACTGCAAGTGCGCGATCTGATGGCCTTCTTCTTCTCTGTGGTGGAAGAGATGC 1180 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1075 GTATGCAACTGCAAGTGCGCGGTCTGATGGCCTTCTTCTTCTCTGTGGTGGAAGAGATGC 1134 Query 1181 GAATAGTGTGCCCCTAGCAAGTGCATATGGACTTGCCAAGCACAGAGATGGACGTTGGGA 1240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1135 GAATAGTGTGCCCCTAGCAAGTGCATATGGACTTGCCAAGCACAGAGATGGACGTTGGGA 1194 Query 1241 ATGGGCCATAGCCCCAGGTGTCTCCCCTTCTGCCAGATACCAGCATGCTGCAGTCTTTGT 1300 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1195 ATGGGCCATTGCCCCTGGTGTCTCCCCTTCTGCCAGATACCAGCATGCTGCAGTCTTTGT 1254 Query 1301 AAATGCAAGACTCCATGTCTCTGGTGGGGCACTTGGTGGTGGACGCATGGTAGAAGACTC 1360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1255 AAATGCAAGACTCCATGTCTCTGGTGGGGCACTTGGTGGTGGACGCATGGTAGAAGACTC 1314 Query 1361 GTCCAGTGTTGCAGTGTTGGATACTGCAGCAGGTGTTTGGTGTGATACAAAATCGGTTGT 1420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1315 GTCCAGTGTTGCAGTGTTGGATACTGCAGCAGGTGTTTGGTGTGATACAAAATCGGTTGT 1374 Query 1421 TACTAGTCCTAGAACTGGTAGGTATAGTGCTGACGCAGCTGGTGGTGATGCTTCTGTTGA 1480 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1375 TACTAGTCCTAGAACTGGTAGGTATAGCGCTGACGCAGCTGGTGGTGATGCTTCTGTTGA 1434 Query 1481 GCTGACTAGGCGATGCAGGCATGCTGCTGCTGCAGTGGGTGATTTGATATTCATCTATGG 1540 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1435 GCTGACTAGGCGTTGCAGGCATGCTGCTGCTGCAGTGGGTGATTTGATATTCATCTATGG 1494 Query 1541 TGGGTTGCGTGGAGGAGTTTTACTTGATGACCTATTGGTTGCTGAAGATCTTGCTGCAGC 1600 ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1495 TGGTTTGCGTGGAGGAGTGTTACTTGATGACCTATTGGTTGCTGAAGATCTTGCTGCGGC 1554 Query 1601 GGAAACAACATCTGCTGCCTCTCATGCTGCTGCTGCAGCAGCAGCAACAAACACGCCACC 1660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| Sbjct 1555 GGAAACAACATCTGCTGCCTCTCATGCTGCTGCTGCAGCAGCAGCAACAAACTCACCACC 1614 Query 1661 TGGCCGTTCACCTGGAAGATATGGATTTTCTGATGAAAGGACAGGGGAGCTACCAGAATC 1720 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1615 TGGCCGTTCACCTGGAAGATATGGATTTTCTGATGAAAGAACAGGGGAGCTACCAGAATC 1674 Query 1721 AGCTCCTGACGCTGTGGTGCTGGGAAGCCCTGTTGCACCCCCTGTAAATGGTGATATGTA 1780 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1675 AGCTCCTGACTCTGTGGTGCTGGGAAGCCCTGTTGCACCCCCTGTAAATGGTGATATGTA 1734 Query 1781 TACTGATATTAGCACTGAAAATGCAATGGTTCCAGGAATTCGGAGAACAAGCAAGGGTGT 1840 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1735 TACTGATATAAGCACTGAAAATGCAATGGTTCCAGGAACTCGGAGAACAAGCAAGGGTGT 1794 Query 1841 GGAGTATCTTGTTGAAGCATCTGCTGCGGAAGCCGAGGCTATCAGTGCAACATTAGCTGC 1900 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1795 GGAGTATCTCGTTGAAGCATCTGCTGCGGAAGCCGAGGCTATCAGTGCAACATTAGCTGC 1854 Query 1901 TGCGAAGGCACGACAGGTCAATGGGGAAGTTGAACTTCCAGATAGGGATCGTGGTGCTGA 1960 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1855 TGCGAAGGCACGACAGGTCAACGGTGAAGTTGAACTCCCAGATAGGGATCGTGGTGCTGA 1914 Query 1961 GGCTACGCCCAGTGGAAAACCTTCATTATCATTGATTAAGCCTGATTCTGCAGTACCAAA 2020 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1915 GGCTACACCCAGTGGAAAACCTTCATTATCATTGATTAAGCCTGATTCTGCAGTACCGAA 1974 Query 2021 TAGTGTTATTCCTGCAGGGGTTCGACTTCATCATAGAGCTGTGGTGGTTGCTGCAGAAAC 2080 ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1975 CAGTGTTATTCCTGCAGGCGTTCGACTGCATCATAGAGCTGTGGTGGTTGCCGCAGAAAC 2034 Query 2081 AGGTGGAGCCTTAGGTGGAATGGTTAGACAGTTATCCATTGATCAATTTGAAAATGAGGG 2140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2035 AGGTGGAGCCTTAGGTGGAATGGTTAGACAGTTATCCATTGATCAATTTGAAAATGAGGG 2094 Query 2141 ACGCCGTGTTAGTTATGGGACACCCGAAAGTGCAACAGCAGCTAGGAAATTATTAGATCG 2200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2095 ACGCCGTGTTAGTTATGGGACACCCGAAAGTGCAACAGCAGCAAGGAAATTATTAGATCG 2154 Query 2201 TCAGATGTCAATCAATAGTGTTCCGAAAAAGGTTGTAGCTCATCTTTTGAAGCCTCGGGG 2260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2155 TCAGATGTCAATCAATAGTGTTCCGAAAAAGGTTGTAGCTCATCTTTTGAAGCCTCGGGG 2214 Query 2261 GTGGAAGCCTCCAGTTCGTCGCCAGTTTTTCTTGGATTGCAATGAAATAGCTGATCTTTG 2320 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2215 GTGGAAGCCTCCAGTTCGACGCCAGTTTTTCTTGGATTGCAATGAAATAGCTGATCTTTG 2274 Query 2321 CGACAGTGCAGAACGTATCTTCTCAAGCGAACCTACTGTGTTACAGCTTAAAGCTCCTAT 2380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2275 CGACAGTGCAGAACGTATCTTCTCAAGCGAACCTACTGTGTTACAGCTTAAAGCTCCTAT 2334 Query 2381 TAAGATATTTGGTGATTTGCATGGCCAGTTTGGGGATCTCATGCGCCTTTTTGATGAATA 2440 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2335 TAAGATATTTGGTGATTTGCATGGTCAGTTTGGGGATCTCATGCGCCTTTTTGATGAATA 2394 Query 2441 TGGTTCACCATCAACAGCTGGAGACATATCATACATCGATTACCTCTTCTTAGGAGACTA 2500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2395 TGGTTCACCATCAACAGCTGGAGACATATCATACATCGATTACCTCTTCTTAGGGGACTA 2454 Query 2501 TGTTGATCGGGGTCAACACAGCCTAGAGACAATTACACTTCTGCTTGCTTTAAAGGTTGA 2560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2455 TGTTGATCGGGGTCAACACAGCCTAGAGACAATTACACTTCTGCTTGCGTTAAAGGTTGA 2514 Query 2561 ATACCAACATAACGTACACCTGATTCGTGGAAATCATGAAGCTGCCGACATTAATGCACT 2620 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct 2515 ATACCAACATAACGTACACCTGATTCGTGGAAATCATGAAGCTGCTGACATTAATGCCCT 2574 Query 2621 TTTTGGTTTCCGGATAGAGTGTATTGAGCGAATGGGTGAACGTGATGGGATCTGGGTGTG 2680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2575 TTTTGGTTTCCGGATAGAGTGTATTGAGCGAATGGGTGAACGTGATGGGATCTGGGTGTG 2634 Query 2681 GCATCGAATAAACCGTTTATTCAATTGGCTACCTCTGGCTGCACTGATTGAGAAGAAAAT 2740 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2635 GCACCGAATAAACCGTTTATTCAATTGGCTACCTCTGGCTGCACTGATTGAGAAGAAAAT 2694 Query 2741 CATCTGTATGCATGGGGGAATTGGTCGGTCGATAAATCATGTGGAGCAGATAGAAAATAT 2800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 2695 TATCTGTATGCATGGGGGAATTGGTCGGTCGATAAATCATGTGGAACAGATAGAAAATAT 2754 Query 2801 CCAACGTCCAATTACGATGGAAGCAGGCTCAATTGTACTTATGGATTTATTATGGTCGGA 2860 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2755 CCAACGTCCAATTACGATGGAAGCTGGCTCAATTGTACTTATGGATTTACTATGGTCGGA 2814 Query 2861 TCCAACTGAAAATGACAGTGTCGAAGGTTTAAGGCCCAATGCTAGAGGCCCTGGGTTGGT 2920 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2815 TCCAACTGAAAATGACAGTGTTGAAGGTTTAAGACCCAATGCTAGAGGCCCTGGGTTGGT 2874 Query 2921 TACTTTTGGGCCTGACCGTGTCATGGAGTTTTGCAACAACAATGATCTGCAATTGATTGT 2980 ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2875 TACCTTCGGGCCTGACCGTGTCATGGAGTTTTGCAACAACAATGATCTTCAATTGATTGT 2934 Query 2981 ACGTGCGCATGAATGCGTGATGGACGGATTTGAGCGTTTTGCCCAAGGTCATTTGATAAC 3040 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2935 ACGTGCGCATGAATGCGTGATGGACGGATTTGAGCGTTTCGCCCAAGGTCATTTGATAAC 2994 Query 3041 GCTCTTTTCGGCAACAAATTATTGTGGTACCGCAAACAATGCCGGGGCTATCTTGGTGTT 3100 |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2995 GCTCTTTTCGGCAACAAACTATTGTGGTACTGCAAACAATGCCGGGGCTATCTTGGTGTT 3054 Query 3101 GGGGAGAGATCTTGTGGTGGTTCCTAAGCTTATCCATCCATTGCCTCCAGCGATAACCTC 3160 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| Sbjct 3055 GGGGAGAGATCTTGTGGTGGTTCCTAAGCTTATCCATCCATTGCCTCCAGCAATTACCTC 3114 Query 3161 ACCTGAAACTTCACCAGAAAGACATATAGAGGATACATGGATGCAGGAGTTAAACGTAAA 3220 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 3115 ACCTGAAACTTCACCAGAAAGACATATAGAGGATACATGGATGCAGGAGTTAAACGCAAA 3174 Query 3221 TAGACCACCAACACCAACAAGAGGACGCCCACAAAATCCAAATGACCGCGGCTCTCTTGC 3280 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 3175 TAGACCACCAACACCAACAAGAGGACGCCCACAAAATCCAAATGACCGTGGCTCTCTTGC 3234 Query 3281 TTGGATATAAACCCT 3295 |||||||||| |||| Sbjct 3235 TTGGATATAACCCCT 3249 Score = 357 bits (193), Expect = 3e-97 Identities = 345/410 (84%), Gaps = 43/410 (10%) Strand=Plus/Plus Query 3338 TCCTGACAGCCGCCTCTAGGTGATCCTCATGTTGTGTACAGAACCAACCAAACCATTCAA 3397 ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct 3249 TCCCGACAGCCGCCTCTTGGTGATCCTCATGTTGTGTACAGATCCAACCAAACCGTTCAA 3308 Query 3398 TTATCGATTGCTATTTACCAACGAGATGGATCA-ATGAGGGTTTTGAGTTATCGAAGAAT 3456 ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||| ||| Sbjct 3309 TTATCGATTGCTATTTACCAACGAGATGGATCACACGAGGGTTCTGAGATATCGG-GAAA 3367 Query 3457 T-TCACAGGTTAAGTTCATTCAAGTCAGATGATGAAAGGGTAAAGAATTTG----T---- 3507 | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| | Sbjct 3368 TATCACAGGTTAAGTTCA---A-GTCAGATGATGAAAGGGTAAAAAATTTGGAGGTGGTG 3423 Query 3508 AGTA---G--TAGTGAGGAGGAAGAGTAtttgttttgtaaaaggggttttctcattttta 3562 |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| Sbjct 3424 AGTAACTGAGTAGTGAGGAGGAAGAGTATTTGTTGGGTAAAAGGGTTTTTGTCATTTTTA 3483 Query 3563 ttcatatatttgattttcttcactttgctttt--tt--tcTT-AGTA-TTGA-TTATATA 3615 ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | || | || |||| ||||||| Sbjct 3484 TTCATATATTTGATTTTCTTCACTTTGTTTTTGCTTAGTATTGATTAATTGAATTATATA 3543 Query 3616 TGTGGTATTGGACTTTTGGTGAGGGACACAAA-CAGGAGAGTGAGTAGGAGGAGGATTTT 3674 ||||||||||| |||||||||||||||||||| | || | | |||| | || | Sbjct 3544 TGTGGTATTGGGCTTTTGGTGAGGGACACAAAACGGGCG-G-GAGT-G-AG-----T--- 3591 Query 3675 AGAGGTTGTTTTAGTTTTGGGGTATTTATGTATCATAGAGAGGTGTGTTT 3724 || | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 3592 AG-G-T-GTATTAGTTTTGGGGTATTTATGTATCATAGAGAGGTGTTTTT 3638 Score = 91.6 bits (49), Expect = 4e-17 Identities = 54/56 (96%), Gaps = 2/56 (4%) Strand=Plus/Plus Query 36 aaaaaaaaaaaaaCTGGGAAGAAGAA-A-GAACAAACTCATTTTCAAATTCTCCGA 89 |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 32 AAAAAAAAAAAAACTGGGAAGAAGAAGAAGAACAAACTCATTTTCAAATTCTCCGA 87 > Ahg919586 jgi|Araly1|919586|scaffold_100867.1 Length=3095 Score = 3458 bits (1872), Expect = 0.0 Identities = 2515/2829 (89%), Gaps = 29/2829 (1%) Strand=Plus/Plus Query 474 GTTGGTCCGAGATGTGCGCCAACGTATTCGGTTGT-GAATGCTATAATCGAGAAGAAAGA 532 ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || | ||||||| || || || ||||| Sbjct 255 GTTGGTCCGAGGTGTGCACCTACGTATTCGGTGGTCG-ATGCTATGATGGATAAAAAAGA 313 Query 533 AGATGGTCCTGGTCCTAGATGTGGACATACGCTGACGGCGGTTCCTGCTGTTGGTGAAGA 592 ||||| ||||| ||||| ||||| || ||| ||||||| || |||||||||||||| || Sbjct 314 GGATGGCCCTGGCCCTAGGTGTGGTCACACGTTGACGGCTGTGCCTGCTGTTGGTGATGA 373 Query 593 AGGGACGTCTTCTTATATTGGCCCGAGAC-TGATCTTGTTTGGTGGTGCTACTGCTCTTG 651 ||| ||| || ||| ||||| || | | || | |||||||||||||| || ||||||| Sbjct 374 AGGAACGCCTGGTTACATTGGTCCTCGTCTTG-TATTGTTTGGTGGTGCGACGGCTCTTG 432 Query 652 AGGGTAATTCTGGAGGAACGGGAACACCTACTTCAGCTGGAAGTGCTGGCATTCGGTTAG 711 ||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||| Sbjct 433 AGGGTAATTCTGGTGGCACCGGAACTCCAACTTCAGCTGGAAGTGCCGGCATTCGGCTAG 492 Query 712 CTGGTGCAACCGCTGATGTTCATTGTTATGATGTTCTTTCTAATAAGTGGTCGAGGCTTA 771 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| Sbjct 493 CTGGTGCAACTGCTGATGTTCATTGTTATGATGTACTTTCTAATAAGTGGACTAGGCTTA 552 Query 772 CA-CCTTATGGAGAACCACCTAGTCCAAGAGCTGCTCATGTTGCTACTGCTGTTGGGACC 830 || |||| |||||||||||| | || || || || |||||||| ||||| || |||||| Sbjct 553 CACCCTT-TGGAGAACCACCAACCCCGAGGGCCGCACATGTTGCCACTGCAGTCGGGACC 611 Query 831 ATGGTAGTAATTCAGGGGGGAATAGGTCCTGCTGGTTTATCAGCTGAGGATCTTCACGTT 890 |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| Sbjct 612 ATGGTAGTTATTCAGGGTGGAATTGGTCCTGCTGGTTTATCGGCTGAAGACCTTCATGTT 671 Query 891 CTTGATCTCACACAGCAACGGCCACGATGGCACAGGGTTGTTGTTCAGGGTCCTGGACCA 950 ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 672 CTTGATCTCACTCAACAACGGCCACGATGGCACAGGGTTGTTGTTCAGGGTCCTGGACCA 731 Query 951 GGACCACGTTATGGACATGTCATGGCACTGGTAGGACAGAGGTATCTCATGGCAATTGGT 1010 ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 732 GGACCGCGTTATGGACATGTCATGGCACTCGTGGGACAAAGGTATCTCATGGCAATTGGT 791 Query 1011 GGAAATGATGGGAAACGTCCATTAGCTGATGTATGGGCTTTGGACACTGCTGCCAAACCT 1070 |||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| Sbjct 792 GGAAATGACGGAAAACGTCCACTCGCTGATGTATGGGCCTTGGATACTGCCGCCAAGCCT 851 Query 1071 TATGAATGGCGTAAGCTGGAACCGGAAGGGGAAGGTCCACCACCATGCATGTATGCAACT 1130 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct 852 TATGAATGGCGTAAGCTGGAACCAGAAGGGGAAGGTCCACCTCCCTGCATGTATGCAACT 911 Query 1131 GCAAGTGCGCGATCTGATGGCCTTCTTCTTCTCTGTGGTGGAAGAGATGCGAATAGTGTG 1190 ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| Sbjct 912 GCAAGTGCGCGTTCCGATGGTCTTCTTCTCCTCTGTGGTGGAAGGGATGCAAACAGTGTG 971 Query 1191 CCCCTAGCAAGTGCATATGGACTTGCCAAGCACAGAGATGGACGTTGGGAATGGGCCATA 1250 || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 972 CCTCTGGCCAGTGCATATGGACTTGCGAAGCATAGAGATGGACGTTGGGAATGGGCCATA 1031 Query 1251 GCCCCAGGTGTCTCCCCTTCTGCCAGATACCAGCATGCTGCAGTCTTTGTAAATGCAAGA 1310 ||||| |||||||| || ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1032 GCCCCTGGTGTCTCACCATCTTCCAGATATCAGCATGCAGCAGTCTTTGTAAATGCAAGA 1091 Query 1311 CTCCATGTCTCTGGTGGGGCACTTGGTGGTGGACGCATGGTAGAAGACTCGTCCAGTGTT 1370 || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct 1092 CTTCATGTGTCCGGTGGGGCACTTGGTGGTGGACGCATGGTTGAAGACTCATCCAGTGTT 1151 Query 1371 GCAGTGTTGGATACTGCAGCAGGTGTTTGGTGTGATACAAAATCGGTTGTTACTAGTCCT 1430 ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct 1152 GCAGTATTGGATACTGCAGCAGGTGTATGGTGTGATACGAAATCAGTTGTTACTAGTCCT 1211 Query 1431 AGAACTGGTAGGTATAGTGCTGACGCAGCTGGTGGTGATGCTTCTGTTGAGCTGACTAGG 1490 ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1212 AGAACCGGCAGGTATAGTGCCGATGCAGCTGGTGGTGATGCTTCGGTTGAGCTGACTAGG 1271 Query 1491 CGATGCAGGCATGCTGCTGCTGCAGTGGGTGATTTGATATTCATCTATGGTGGGTTGCGT 1550 || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||| Sbjct 1272 CGTTGTAGGCATGCTGCTGCTGCAGTCGGTGATTTGATATTTATCTACGGCGGTTTACGT 1331 Query 1551 GGAGGAGTTTTACTTGATGACCTATTGGTTGCTGAAGATCTTGCTGCAGCGGAAACAACA 1610 ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1332 GGAGGGGTGTTACTCGATGACTTATTGGTTGCTGAAGATCTTGCTGCTGCGGAAACAACA 1391 Query 1611 TCTGCTGCCTCTCATGCTGCTGCTGCAGCAGCAGCAACAAACACGCCACCTGGCCG-TTC 1669 | |||||| ||||||||||| | ||||| || |||||||| | ||||| || || || Sbjct 1392 TATGCTGCTTCTCATGCTGC--C-GCAGCTGCGGCAACAAATTCCCCACCAGGTCGATT- 1447 Query 1670 ACCTGGAAGATATGGATTTTCTGATGAAAGG-ACAGGGGAGCTACCAGAATCAGCTC-CT 1727 ||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||| || | |||||||| | || Sbjct 1448 ACCTGGAAGGTATGGTTTTTCAGATGAAAGGAACA-GGGAGTTATCTGAATCAGC-CGCT 1505 Query 1728 GA---CGCTGTGGTGCTGGGAAGCCCTGTTGCACCCCCTGTAAATGGTGATATGTATACT 1784 || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1506 GATGGCGCTGTTGTGCTGGGAAGCCCTGTTGCACCCCCTGTAAATGGTGATATGCATACT 1565 Query 1785 GATATTAGCACTGAAAATGCAATGGTTCCAGGAATTCGGAGAAC-AAGCAAGGGTGTGGA 1843 ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| Sbjct 1566 GATATTAGCCCTGAAAATGCATTACTTCCAGGAACTCGGAGAACGAA-TAAGGGTGTGGA 1624 Query 1844 GTATCTTGTTGAAGCATCTGCTGCGGAAGCCGAGGCTATCAGTGCAACATTAGCTGCTGC 1903 |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| Sbjct 1625 GTATCTTGTTGAAGCATCAGCAGCGGAAGCTGAGGCGATCAGTGCTACGTTGGCTGCTGC 1684 Query 1904 GAAGGCACGACAGGTCAATGGGGAAGTTGAACTTCCAGATAGGGATCGTGGTGCTGAGGC 1963 ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| Sbjct 1685 CAAGGCACGACAAGTCAATGGTGAAGTTGAACTCCCAGATAGGGATTGTGGTGCAGAGGC 1744 Query 1964 TACGCCCAGTGGAAAACCTTCATTATCATTGATTAAGCCTGATTCTGCAGTACCAAAT-A 2022 ||| || ||||| |||||| |||| || | || ||||| |||||| | | | ||| | Sbjct 1745 TACACCTAGTGGGAAACCTACATTTTCGCTAATCAAGCCAGATTCTATGGGATC-AATGA 1803 Query 2023 GTGTTATTCCTGCAGGGGTTCGACTTCATCATAGAGCTGTGGTGGTTGCTGCAGAAACAG 2082 |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | Sbjct 1804 GTGTTACTCCTGCAGGGATTCGTCTTCATCATAGAGCCGTGGTGGTTGCTGCAGAAACTG 1863 Query 2083 GTGGAGCCTTAGGTGGAATGGTTAGACAGTTATCCATTGATCAATTTGAAAATGAGGGAC 2142 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1864 GTGGCGCCTTAGGTGGAATGGTTAGACAGTTATCTATTGATCAATTTGAAAATGAGGGAC 1923 Query 2143 GCCGTGTTAGTTATGGGACACCCGAAAGTGCAACAGCAGCTAGGAAATTATTAGATCGTC 2202 | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | Sbjct 1924 GGCGTGTCAGTTATGGGACACCAGAAAGTGCAACAGCAGCAAGGAAACTATTAGATCGAC 1983 Query 2203 AGATGTCAATCAATAGTGTTCCGAAA-AAGGTTGTAGCTCATCTTTTGAAGCCTCGGGGG 2261 |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1984 AGATGTCAATCAATAGTGTTCC-AAAGAAGGTTATAGCTCATCTTTTGAAGCCTCGTGGG 2042 Query 2262 TGGAAGCCTCCAGTTCGTCGCCAGTTTTTCTTGGATTGCAATGAAATAGCTGATCTTTGC 2321 ||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2043 TGGAAGCCTCCTGTTCGACGCCAGTTTTTCCTAGATTGCAATGAAATAGCTGATCTTTGT 2102 Query 2322 GACAGTGCAGAACGTATCTTCTCAAGCGAACCTACTGTGTTACAGCTTAAAGCTCCTATT 2381 || |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2103 GATAGTGCAGAACGTATCTTCGCAAGTGAACCAACTGTATTACAGCTTAAAGCTCCTATC 2162 Query 2382 AAGATATTTGGTGATTTGCATGGCCAGTTTGGGGATCTCATGCGCCTTTTTGATGAATAT 2441 || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2163 AAAATATTTGGTGATCTGCATGGGCAGTTTGGGGATCTTATGCGCCTTTTTGATGAATAT 2222 Query 2442 GGTTCACCATCAACAGCTGGAGACATATCATACATCGATTACCTCTTCTTAGGAGACTAT 2501 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2223 GGTTCACCATCTACAGCTGGAGACATATCATACATCGATTACCTCTTCTTAGGGGACTAT 2282 Query 2502 GTTGATCGGGGTCAACACAGCCTAGAGACAATTACACTTCTGCTTGCTTTAAAGGTTGAA 2561 |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| || Sbjct 2283 GTTGATCGGGGTCAACACAGTCTAGAAACAATTTCCCTTCTACTTGCATTAAAGGTGGAG 2342 Query 2562 TACCAACATAACGTACACCTGATTCGTGGAAATCATGAAGCTGCCGACATTAATGCACTT 2621 ||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||| Sbjct 2343 TACCAGCATAACGTACACTTAATTCGGGGAAACCATGAAGCTGCGGATATTAATGCCCTT 2402 Query 2622 TTTGGTTTCCGGATAGAGTGTATTGAGCGAATGGGTGAACGTGATGGGATCTGGGTGTGG 2681 ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct 2403 TTTGGCTTCCGAATAGAGTGTATTGAGCGAATGGGTGAACGCGATGGAATCTGGGTGTGG 2462 Query 2682 CATCGAATAAACCGTTTATTCAATTGGCTACCTCTGGCTGCACT-GATTGAGAAGAAAAT 2740 || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| Sbjct 2463 CACCGAATAAATCGTTTATTCAATTGGCTACCTCTTGCCGCA-TCAATTGAGAAGAAAAT 2521 Query 2741 CATCTGTATGCATGGGGGAATTGGTCGGTCGATAAATCATGTGGAGCAGATAGAAAATAT 2800 || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2522 TATATGTATGCATGGGGGTATTGGTCGTTCTATAAATCATGTGGAGCAGATAGAAAATAT 2581 Query 2801 CCAACGTCCAATTACGATGGAAGCAGGCTCAATTGTACTTATGGATTTATTATGGTCGGA 2860 |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2582 TCAACGTCCAATTACAATGGAAGCTGGCTCCATTGTGCTTATGGATTTATTATGGTCGGA 2641 Query 2861 TCCAACTGAAAATGACAGTGTCGAAGGTTTAAGGCCCAATGCTAGAGGCCCTGGGTTGGT 2920 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 2642 TCCAACTGAAAATGACAGTGTCGAAGGTTTAAGGCCCAATGCTAGAGGTCCTGGATTGGT 2701 Query 2921 TACTTTTGGGCCTGACCGTGTCATGGAGTTTTGCAACAACAATGATCTGCAATTGATTGT 2980 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| Sbjct 2702 TACTTTTGGGCCTGACCGTGTCATGGAGTTCTGCAACAACAATGATCTTCAGTTGATTGT 2761 Query 2981 ACGTGCGCATGAATGCGTGATGGACGGATTTGAGCGTTTTGCCCAAGGTCATTTGATAAC 3040 ||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct 2762 ACGAGCACACGAATGCGTAATGGATGGATTTGAGCGTTTTGCTCAAGGACATTTGATAAC 2821 Query 3041 GCTCTTTTCGGCAACAAATTATTGTGGTACCGCAAACAATGCCGGGGCTATCTTGGTGTT 3100 ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || Sbjct 2822 GCTCTTTTCTGCTACAAACTATTGTGGTACTGCAAACAACGCTGGGGCTATCTTGGTATT 2881 Query 3101 GGGGAGAGATCTTGTGGTGGTTCCTAAGCTTATCCATCCATTGCCTCCAGCGATAACCTC 3160 |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||| | | || Sbjct 2882 AGGGAGAGATCTTGTAGTGGTTCCTAAGCTCATTCATCCGTTACCTCCAGCTCTTTCATC 2941 Query 3161 ACCTGAAACTTCACCAGAAAGACATATAGAGGATACATGGATGCAGGAGTTAAACGTAAA 3220 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || | || Sbjct 2942 GCCTGAAACTTCACCAGAAAGACATATAGAAGACACATGGATGCAGGAGCTGAATGCGAA 3001 Query 3221 TAGACCACCAACACCAACAAGAGGACGCCCACAAAATCCAAATGACCGCGGC--T-CTCT 3277 ||| ||| | || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || | |||| Sbjct 3002 TAGGCCAGCGACGCCAACCAGAGGACGCCCACAAAATTCAAATGACCGAGGAGGTTCTCT 3061 Query 3278 TGCTTGGAT 3286 |||||||| Sbjct 3062 GGCTTGGAT 3070 > Ahg472815 jgi|Araly1|472815|fgenesh2_kg.1__2769__AT1G25540.1 Length=2932 Score = 58.4 bits (31), Expect = 4e-07 Identities = 33/34 (97%), Gaps = 0/34 (0%) Strand=Plus/Plus Query 428 GCAGCAACAACAACAACAGCAGCAACAGCCGCAG 461 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2349 GCAGCAACAACAACAACAGCAGCAACAGCAGCAG 2382 > Ahg358332 jgi|Araly1|358332|fgenesh1_pg.C_scaffold_8002119 Length=1221 Score = 52.8 bits (28), Expect = 2e-05 Identities = 28/28 (100%), Gaps = 0/28 (0%) Strand=Plus/Plus Query 428 GCAGCAACAACAACAACAGCAGCAACAG 455 |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 888 GCAGCAACAACAACAACAGCAGCAACAG 915 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 144200144097 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5