BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G27320.1
Length=1273
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg345605 jgi|Araly1|345605|fgenesh1_pg.C_scaffold_4001947 1301 0.0
Ahg345606 jgi|Araly1|345606|fgenesh1_pg.C_scaffold_4001948 1267 0.0
Ahg345604 jgi|Araly1|345604|fgenesh1_pg.C_scaffold_4001946 1212 0.0
Ahg345603 jgi|Araly1|345603|fgenesh1_pg.C_scaffold_4001945 671 0.0
> Ahg345605 jgi|Araly1|345605|fgenesh1_pg.C_scaffold_4001947
Length=1050
Score = 1301 bits (704), Expect = 0.0
Identities = 946/1060 (89%), Gaps = 28/1060 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 17 ATGAGTTTACATCTAGTGCTCTGTCTGTTTTCTTATTTGCTTTTAACACAAGTGGCCGAA 76
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Sbjct 1 ATGAGTTTACATCTAGTTCTCTGTTTATCCTCTTATTTGCTTTTAACGCAAGTGGCCGTT 60
Query 77 GGAAACATTGATTCAATTTTAAAAGATTTCGATTGTGTTGATATATACAAACAACCGGCT 136
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Query 137 TTCCAACATCCATTGTTGAAACACCACAAGATTCAGgaaaaattcagttc-aaatgaaaa 195
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Sbjct 121 TTTCAACATCCATTGTTGAAACACCACAAGATTCAGGAAAAATTTAATTCGAAA-GAAAG 179
Query 196 gcttaaaagaaaagatgaatatcaac---caaatga-aaaatATTGTCCAAAAGGAACTG 251
||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 180 GCTTAGAAGAAAAGATGAATATCATCAAACAAATGATAAAAG-TTGTCCAAAAGGAACTG 238
Query 252 TACCAATTTTAAGACAGAGAAATGGAACTGAGAGCTTTCATC-CTGACACAGTCGAATAT 310
|||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||| | |||||| ||||||||
Sbjct 239 TACCAATTTTAAGACAAACAAATGGAATTGAGAGCGTTCATCTC-GACACACTCGAATAT 297
Query 311 CCTGGCCAACATTTTGCAGTACTCGAAAATATGTTAGATGGGAGCATCTATCGAGGAGCA 370
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Sbjct 298 CCCGGCCAACATTTTGCAGTAATCGAAAATGTTTTAGATGGGAGCATCTATCGAGGAGCA 357
Query 371 G-ACGCTCTGATAAGTCTTCATAATTTAACTCTACTGAATAACCAATACAGTAAAGATCA 429
| | ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||
Sbjct 358 GGA-GCTATGATAAGTATTCATAATTTAACTCTACAAAATAACCAATATAGTAAAAATCA 416
Query 430 AATCTGGTTAGAGAATGGACCTCGTGATCAACTCAATAGCATACAATTTGGTTTGGCGGT 489
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Sbjct 417 AATCTGGTTAGAGAATGGACCTCGTGATCAACTCAACAGCATACAATTTGGTTTGGCGGT 476
Query 490 GCATCCAAGATTATATGGCGACAGTTTAACGCGATTTACAATATACTGGACAGGAGATGG 549
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Sbjct 477 ACATCCAAGATTATATGGCGACACTTTCACGCGGTTTACAATATATTGGACTGCAGATGG 536
Query 550 CTATAAAAGAACTGGATGCTATAATACAAAATGTCCTGGATTCGTTATTGTTTCTCGAGT 609
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Sbjct 537 CTATAAAAGAACTGGATGCTATAATACAAAATGTCCTGGCTTCATTACTGTTTCTCGAGT 596
Query 610 TCCCTTGATTGGAACAATTTTTGCTGATACTTCTGTTTATGGTGGTAACGAAACAGTTTA 669
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Sbjct 597 TCCCTTGATAGGAACAACGTTTAATGATTCTTCTGTTTATGGTGGTAAAGAAACAGTTTT 656
Query 670 TACTAATCCGAAAGTTTTTCAGGATGGTTTCAGCGGAAACTGGATACTAAGAAT-ATTTG 728
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Sbjct 657 TACTAAACCGCAAGTTTTTCAGGATGGTTTCAGTGGAAATTGGGTACTAA-AATTATATG 715
Query 729 ACCGA-GTTGTTGGTTACTGGCCTAAAGAGTTATTTACTCACTTAAACAAAGGAGCTTCT 787
|| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
Sbjct 716 AC-GAAGTTATTGGTTACTGGCCTAAAGAGTTATTTACTCACTTAAATAAAGGAGTTTCT 774
Query 788 TTGGTACGCTTTGGAGGAAATACATTTCCATCTCCGGACGGATTTAGTCCCCCAATGGGA 847
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||
Sbjct 775 TTGGTACGTTTTGGAGGAAATACATTTCCATCTCCGGAGGGAATTAGTCCTCCAATGGGA 834
Query 848 AATGGATATTTTCC-GTCTCA-CGATTTTTATAAAAGTTCACATTTTTCAAAGGTCAAAG 905
||||| ||||||| || | | ||| | | |||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 835 AATGGCCATTTTCCAGT-T-ATCGACTATCATAAAAGTGCACATTTTTCATTTGTCAAAG 892
Query 906 TTAAGAATTCGAACTATGAAACCATTGATTTTGAAAA-ACAGAGAACAAGACGTTATGCA 964
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Sbjct 893 TTAAGAATTCGAACTATCAAAGCATCGATATTGAAGATA-AGAAAACAAGACTTTATGCA 951
Query 965 GATTCTTACCAAT-TTATAGACTAACGTATTGGGGTTATAACCAG-CATAATAGAGTATC 1022
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || | ||| | |||||
Sbjct 952 GATTCTTACCAATGTTATAGACTAACGTATTGGGGTTATAGCAAGTCG-AATGGGGTATC 1010
Query 1023 CTTCTC-TTATGGAGGACCAGGTGGACAAT-GTGGTACTT 1060
|||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 1011 CTTCTCCTT-TGGAGGACCAGGTGGA-AATTGTGGTACTT 1048
> Ahg345606 jgi|Araly1|345606|fgenesh1_pg.C_scaffold_4001948
Length=1050
Score = 1267 bits (686), Expect = 0.0
Identities = 942/1062 (89%), Gaps = 32/1062 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 17 ATGAGTTTACATCTAGTGCTCTGTCTGTTTTCTTATTTGCTTTTAACACAAGTGGCCGAA 76
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Sbjct 1 ATGAGTTCACATCTAGTTCTCTGTTTATCCTCTTATTTGCTTTTAACGCAAGTGGCTGTT 60
Query 77 GGAAACATTGATTCAATTTTAAAAGATTTCGATTGTGTTGATATATACAAACAACCGGCT 136
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Sbjct 61 GGAAGCATTGATCCTATTTTAAAAGATTTCGATTGTGTTGATATATACAAACAACCGGCT 120
Query 137 TTCCAACATCCATTGTTGAAACACCACAAGATTCAGgaaaaattcagttc-aaatgaaaa 195
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Sbjct 121 TTTCAACATCCATTGTTGAAACACCACAAGATCCAGAAAAAATTCAATTCGAAA-GAAAG 179
Query 196 gcttaaaagaaaagatgaatatcaac---caaatga-aaaatATTGTCCAAAAGGAACTG 251
||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 180 GCTTAGAAGAAAAGATGAATATCATCAAACAAATGATAAAAG-TTGTCCAAAAGGAACTG 238
Query 252 TACCAATTTTAAGACAGAGAAATGGAACTGAGAGCTTTCATC-CTGACACAGTCGAATAT 310
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Sbjct 239 TACCAATTTTAAGACAAAGAAATGGAATTGAGAGCGTTCATCTC-GACACACTCGAATAT 297
Query 311 CCTGGCCAACATTTTGCAGT-ACTCGAAAATATGTTAGATGGGAGCATCTATCGAGGAGC 369
|| ||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 298 CCCGGCCAACATTTTGCAGTGA-TCGAAAATGTTTTAGATGGGAGCATCTATCGAGGAGC 356
Query 370 AG-ACGCTCTGATAAGTCTTCATAATTTAACTCTACTGAATAACCAATACAGTAA-AGAT 427
| | ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||
Sbjct 357 GGGA-GCTAAGATAAGTATTCATAATTTAACTCTACAAAATAACCAATATAGTAATA-AT 414
Query 428 CAAATCTGGTTAGAGAATGGACCTCGTGATCAACTCAATAGCATACAATTTGGTTTGGCG 487
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Sbjct 415 CAAATCTGGTTAGAGAATGGACCTCGTGATCAACTCAACAGCATACAATTTGGTTTGGCG 474
Query 488 GTGCATCCAAGATTATATGGCGACAGTTTAACGCGATTTACAATATACTGGACAGGAGAT 547
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Sbjct 475 GTACATCCAAGATTATATGGCGACACTTTCACGCGGTTTACAATATATTGGACTGCAGAT 534
Query 548 GGCTATAAAAGAACTGGATGCTATAATACAAAATGTCCTGGATTCGTTATTGTTTCTCGA 607
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Sbjct 535 GGCTATAAAAGAACTGGATGCTATAATACAAAATGTCCTGGCTTCATTACTGTTTCTCGA 594
Query 608 GTTCCCTTGATTGGAACAATTTTTGCTGATACTTCTGTTTATGGTGGTAACGAAACAGTT 667
||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 595 GTTCCCTTGATAGGAACAACGTTTAATGATTCTTCTGTTTATGGTGGTAAAGAAACAGTT 654
Query 668 TATACTAATCCGAAAGTTTTTCAGGATGGTTTCAGCGGAAACTGGATACTAAGAAT-ATT 726
| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||
Sbjct 655 TTTACTAAACCGCAAGTTTTTCAGGATGGTTTCAGTGGAAATTGGGTACTAA-AATTATA 713
Query 727 TGACCGA-GTTGTTGGTTACTGGCCTAAAGAGTTATTTACTCACTTAAACAAAGGAGCTT 785
|||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 714 TGAC-GAAGTTATTGGTTACTGGCCTAAAGAGTTATTTACTCACTTAAATAAAGGAGTTT 772
Query 786 CTTTGGTACGCTTTGGAGGAAATACATTTCCATCTCCGGACGGATTTAGTCCCCCAATGG 845
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||
Sbjct 773 CTTTGGTACGTTTTGGAGGAAATACATTTCCATCTCCGGAGGGAATTAGTCCTCCAATGG 832
Query 846 GAAATGGATATTTTCC-GTCTCA-CGATTTTTATAAAAGTTCACATTTTTCAAAGGTCAA 903
||||||| ||||||| || | | ||| | | |||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 833 GAAATGGCCATTTTCCAGT-T-ATCGACTATCATAAAAGTGCACATTTTTCATTTGTCAA 890
Query 904 AGTTAAGAATTCGAACTATGAAACCATTGATTTTGAAAA-ACAGAGAACAAGACGTTATG 962
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Sbjct 891 AGTTAAGAATTCGAACTATCAAAGCATCGATATTGAAGATA-AGAAAACAAGACTTTATG 949
Query 963 CAGATTCTTACCAAT-TTATAGACTAACGTATTGGGGTTATAACCAG-CATAATAGAGTA 1020
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Sbjct 950 CAGATTCTTACCAATGTTATAGACTAACGTATTGGGGTTATAGCAAGTCG-AATGGGGTA 1008
Query 1021 TCCTTCTC-TTATGGAGGACCAGGTGGACAAT-GTGGTACTT 1060
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Sbjct 1009 TCCTTCTCCTT-TGGAGGACCAGGTGGA-AATTGTGGTACTT 1048
> Ahg345604 jgi|Araly1|345604|fgenesh1_pg.C_scaffold_4001946
Length=3081
Score = 1212 bits (656), Expect = 0.0
Identities = 876/979 (89%), Gaps = 28/979 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 92 ATTTTAAAAGATTTCGATTGTGTTGATATATACAAACAACCGGCTTTCCAACATCCATTG 151
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Sbjct 532 ATTTTAAAAGATTTCGATTGTGTTGATATATACAAACAACCGGCTTTTCAACATCCATTG 591
Query 152 TTGAAACACCACAAGATTCAGgaaaaattcagttc-aaatgaaaagcttaaaagaaaaga 210
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Sbjct 592 TTGAAACACCACAAGATTCAGGAAAAATTTAATTCGAAA-GAAAGGCTTAGAAGAAAAGA 650
Query 211 tgaatatcaac---caaatga-aaaatATTGTCCAAAAGGAACTGTACCAATTTTAAGAC 266
||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 651 TGAATATCATCAAACAAATGATAAAAG-TTGTCCAAAAGGAACTGTACCAATTTTAAGAC 709
Query 267 AGAGAAATGGAACTGAGAGCTTTCATC-CTGACACAGTCGAATATCCTGGCCAACATTTT 325
| | |||||||| ||||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||
Sbjct 710 AAACAAATGGAATTGAGAGCGTTCATCTC-GACACACTCGAATATCCCGGCCAACATTTT 768
Query 326 GCAGTACTCGAAAATATGTTAGATGGGAGCATCTATCGAGGAGCAG-ACGCTCTGATAAG 384
|||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||
Sbjct 769 GCAGTAATCGAAAATGTTTTAGATGGGAGCATCTATCGAGGAGCAGGA-GCTATGATAAG 827
Query 385 TCTTCATAATTTAACTCTACTGAATAACCAATACAGTAAAGATCAAATCTGGTTAGAGAA 444
| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 828 TATTCATAATTTAACTCTACAAAATAACCAATATAGTAAAAATCAAATCTGGTTAGAGAA 887
Query 445 TGGACCTCGTGATCAACTCAATAGCATACAATTTGGTTTGGCGGTGCATCCAAGATTATA 504
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 888 TGGACCTCGTGATCAACTCAACAGCATACAATTTGGTTTGGCGGTACATCCAAGATTATA 947
Query 505 TGGCGACAGTTTAACGCGATTTACAATATACTGGACAGGAGATGGCTATAAAAGAACTGG 564
|||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 948 TGGCGACACTTTCACGCGGTTTACAATATATTGGACTGCAGATGGCTATAAAAGAACTGG 1007
Query 565 ATGCTATAATACAAAATGTCCTGGATTCGTTATTGTTTCTCGAGTTCCCTTGATTGGAAC 624
|||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1008 ATGCTATAATACAAAATGTCCTGGCTTCATTACTGTTTCTCGAGTTCCCTTGATAGGAAC 1067
Query 625 AATTTTTGCTGATACTTCTGTTTATGGTGGTAACGAAACAGTTTATACTAATCCGAAAGT 684
|| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||
Sbjct 1068 AACGTTTAATGATTCTTCTGTTTATGGTGGTAAAGAAACAGTTTTTACTAAACCGCAAGT 1127
Query 685 TTTTCAGGATGGTTTCAGCGGAAACTGGATACTAAGAAT-ATTTGACCGA-GTTGTTGGT 742
|||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| || |||| || ||| |||||
Sbjct 1128 TTTTCAGGATGGTTTCAGTGGAAATTGGGTACTAA-AATTATATGAC-GAAGTTATTGGT 1185
Query 743 TACTGGCCTAAAGAGTTATTTACTCACTTAAACAAAGGAGCTTCTTTGGTACGCTTTGGA 802
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct 1186 TACTGGCCTAAAGAGTTATTTACTCACTTAAATAAAGGAGTTTCTTTGGTACGTTTTGGA 1245
Query 803 GGAAATACATTTCCATCTCCGGACGGATTTAGTCCCCCAATGGGAAATGGATATTTTCC- 861
||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 1246 GGAAATACATTTCCATCTCCGGAGGGAATTAGTCCTCCAATGGGAAATGGCCATTTTCCA 1305
Query 862 GTCTCA-CGATTTTTATAAAAGTTCACATTTTTCAAAGGTCAAAGTTAAGAATTCGAACT 920
|| | | ||| | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1306 GT-T-ATCGACTATCATAAAAGTGCACATTTTTCATTTGTCAAAGTTAAGAATTCGAACT 1363
Query 921 ATGAAACCATTGATTTTGAAAA-ACAGAGAACAAGACGTTATGCAGATTCTTACCAAT-T 978
|| ||| ||| ||| ||||| | | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 1364 ATCAAAGCATCGATATTGAAGATA-AGAAAACAAGACTTTATGCAGATTCTTACCAATGT 1422
Query 979 TATAGACTAACGTATTGGGGTTATAACCAG-CATAATAGAGTATCCTTCTC-TTATGGAG 1036
||||||||||||||||||||||||| | || | ||| | ||||||||||| || |||||
Sbjct 1423 TATAGACTAACGTATTGGGGTTATAGCAAGTCG-AATGGGGTATCCTTCTCCTT-TGGAG 1480
Query 1037 GACCAGGTGGACAAT-GTG 1054
||||||||||| ||| |||
Sbjct 1481 GACCAGGTGGA-AATTGTG 1498
Score = 1201 bits (650), Expect = 0.0
Identities = 879/986 (89%), Gaps = 30/986 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 92 ATTTTAAAAGATTTCGATTGTGTTGATATATACAAACAACCGGCTTTCCAACATCCATTG 151
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2107 ATTTTAAAAGATTTTGATTGTGTTGATATATATAAACAACCGGCTTTTCAACATCCATTG 2166
Query 152 TTGAAACACCACAAGATTCAGg-aaaaattcagttc-aaatgaaaagcttaaaagaaaag 209
||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||| ||| |||| ||||| ||||||||
Sbjct 2167 TTGAAACACCACAAGATCCAGGAAAAAATT-AATTCGAAA-GAAAGGCTTAGAAGAAAAG 2224
Query 210 atg-a-at-atcaaccaaatgaa-aaatA-TTGTCCAAAAGGAACTGTACCAATTTTAAG 264
||| | || ||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2225 ATGAATATCATCAAACAAAT-AATAAA-AGTTGTCCAAAAGGAACTGTACCAATTTTAAG 2282
Query 265 ACAGAGAAATGGAACTGAGAGCTTTCATCCT-GACACAGTCGAATATCCTGGCCAACATT 323
||| | |||||||| ||||||| ||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||
Sbjct 2283 ACAAACAAATGGAATTGAGAGCGTTCAT-CTCGACACACTCGAATATCCCGGCCAACATT 2341
Query 324 TTGCAGTACTCGAAAATATGTTAGATGGGAGCATCTATCGAGGAGCA-GACGCTCTGATA 382
|||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||
Sbjct 2342 TTGCAGTAATCGAAAATGTTTTAGATGGGAGCATCTATCGAGGAGCAGGA-GCTATGATA 2400
Query 383 AGTCTTCATAATTTAACTCTACTGAATAACCAATACAGTAAAGATCAAATCTGGTTAGAG 442
||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2401 AGTATTCATAATTTAACTCTACAAAATAACCAATATAGTAAAAATCAAATCTGGTTAGAG 2460
Query 443 AATGGACCTCGTGATCAACTCAATAGCATACAATTTGGTTTGGCGGTGCATCCAAGATTA 502
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2461 AATGGACCTCGTGATCAACTCAACAGCATACAATTTGGTTTGGCGGTACATCCAAGATTA 2520
Query 503 TATGGCGACAGTTTAACGCGATTTACAATATACTGGACAGGAGATGGCTATAAAAGAACT 562
|||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 2521 TATGGCGACACTTTCACGCGGTTTACAATATATTGGACTGCAGATGGCTATAAAAGAACT 2580
Query 563 GGATGCTATAATACAAAATGTCCTGGATTCGTTATTGTTTCTCGAGTTCCCTTGATTGGA 622
|||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2581 GGATGCTATAATACAAAATGTCCTGGCTTCATTACTGTTTCTCGAGTTCCCTTGATAGGA 2640
Query 623 ACAATTTTTGCTGATACTTCTGTTTATGGTGGTAACGAAACAGTTTATACTAATCCGAAA 682
|||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||
Sbjct 2641 ACAACGTTTAATGATTCTTCTGTTTATGGTGGTAAAGAAACAGTTTTTACTAAACCGCAA 2700
Query 683 GTTTTTCAGGATGGTTTCAGCGGAAACTGGATACTAAGAAT-ATTTGACCGAGTTGTTGG 741
|||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| | ||||| |||| ||||
Sbjct 2701 GTTTTTCAGGATGGTTTCAGTGGAAATTGGGTACTAA-AATTAAATGACCAAGTTATTGG 2759
Query 742 TTACTGGCCTAAAGAGTTATTTACTCACTTAAACAAAGGAGCTTCTTTGGTACGCTTTGG 801
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||
Sbjct 2760 TTACTGGCCTAAAGAGTTATTTACTCACTTAAATAAAGGAGTTTCTTTGGTACGTTTTGG 2819
Query 802 AGGAAATACATTTCCATCTCCGGACGGATTTAGTCCCCCAATGGGAAATGGATATTTTCC 861
|||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 2820 AGGAAATACATTTCCATCTCCGGAGGGAATTAGTCCTCCAATGGGAAATGGCCATTTTCC 2879
Query 862 -GTCTCA-CGATTTTTATAAAAGTTCACATTTTTCAAAGGTCAAAGTTAAGAATTCGAAC 919
|| | | ||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2880 AGT-T-ATCGACTATCATAAAAGTTCACATTTTTCATTTGTCAAAGTTAAGAATTCGAAC 2937
Query 920 TATGAAACCATTGATTTTGAAAA-ACAGAGAACAAGACGTTATGCAGATTCTTACCAAT- 977
||| ||| ||| ||| ||||| | | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2938 TATCAAAGCATCGATATTGAAGATA-AGAAAACAAGACTTTATGCAGATTCTTACCAATG 2996
Query 978 TTATAGACTAACGTATTGGGGTTATAACCAG-CATAATAGAGTATCCTTCTC-TTATGGA 1035
|||||||||||||||||||||||||| | || | ||| | ||||||||||| || ||||
Sbjct 2997 TTATAGACTAACGTATTGGGGTTATAGCAAGTCG-AATGGGGTATCCTTCTCCTT-TGGA 3054
Query 1036 GGACCAGGTGGACAAT-GTGGTACTT 1060
|||||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 3055 GGACCAGGTGGA-AATTGTGGTACTT 3079
Score = 693 bits (375), Expect = 0.0
Identities = 481/531 (91%), Gaps = 11/531 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 17 ATGAGTTTACATCTAGTGCTCTGTCTGTTTTCTTATTTGCTTTTAACACAAGTGGCCGAA 76
||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||||
Sbjct 1 ATGAGTTTACATCTAGTTCTCTGTTTATCCTCTTATTTGCTTTTAACTCAAGCGGCCGTT 60
Query 77 GGAAACATTGATTCAATTTTAAAAGATTTCGATTGTGTTGATATATACAAACAACCGGCT 136
|||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GGAAGCATTGATCCTATTTTAAAAGATTTCGATTGTGTTGATATATACAAACAACCGGCT 120
Query 137 TTCCAACATCCATTGTTGAAACACCACAAGATTCAGgaaaaattcagttc-aaatgaaaa 195
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||
Sbjct 121 TTTCAACATCCATTGTTGAAACACCACAAGATTCAGGAAAAATTTAATTCGAAA-GAAAG 179
Query 196 gcttaaaagaaaagatgaatatcaac---caaatga-aaaatATTGTCCAAAAGGAACTG 251
||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 180 GCTTAGAAGAAAAGATGAATATCATCAAACAAATGATAAAAG-TTGTCCAAAAGGAACTG 238
Query 252 TACCAATTTTAAGACAGAGAAATGGAACTGAGAGCTTTCATC-CTGACACAGTCGAATAT 310
|||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | |||||| ||||||||
Sbjct 239 TACCAATTTTAAGACAAAGAAATGGAATTGAGAGCGTTCATCTC-GACACACTCGAATAT 297
Query 311 CCTGGCCAACATTTTGCAGTACTCGAAAATATGTTAGATGGGAGCATCTATCGAGGAGCA 370
|| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 298 CCCGGCCAACATTTTGCAGTAATCGAAAATGTTTTAGATGGGAGCATCTATCGAGGAGCA 357
Query 371 G-ACGCTCTGATAAGTCTTCATAATTTAACTCTACTGAATAACCAATACAGTAAAGATCA 429
| | ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||
Sbjct 358 GGA-GCTATGATAAGTATTCATAATTTAACTCTACAAAATAACCAATATAGTAAAAATCA 416
Query 430 AATCTGGTTAGAGAATGGACCTCGTGATCAACTCAATAGCATACAATTTGGTTTGGCGGT 489
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 417 AATCTGGTTAGAGAATGGACCTCGTGATCAACTCAACAGCATACAATTTGGTTTGGCGGT 476
Query 490 GCATCCAAGATTATATGGCGACAGTTTAACGCGATTTACAATATACTGGAC 540
|||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 477 ACATCCAAGATTATATGGCGACACTTTCACGCGGTTTACAATATATTGGAC 527
> Ahg345603 jgi|Araly1|345603|fgenesh1_pg.C_scaffold_4001945
Length=561
Score = 671 bits (363), Expect = 0.0
Identities = 500/565 (88%), Gaps = 14/565 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 504 ATGGC-GACAGTTTAACGCGATTTACAATATACTGGACAGGAGATGGCTATAAAAGAACT 562
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Sbjct 1 ATGGCGGACACTTTCACGCGGTTTACAATATATTGGACTGCAGATGGCTATAAAAGAACT 60
Query 563 GGATGCTATAATACAAAATGTCCTGGATTCGTTATTGTTTCTCGAGTTCCCTTGATTGGA 622
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Sbjct 61 GGATGCTATAATACAAAATGTCCTGGCTTCATTATTGTTTCTCGAGTTCCCTCGATTGGA 120
Query 623 ACAATTTTTGCTGATACTTCTGTTTATGGTGGTAACGAAACAGTTTATACTAATCCGAAA 682
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Sbjct 121 GCAACGTTTGATGATTCTTCTGTTTATGGTGGTAAAGAAACAGTTTTTACTAAACCGCAA 180
Query 683 GTTTTTCAGGATGGTTTCAGCGGAAACTGGATACTAAGAAT-ATTTGACCGAGTTGTTGG 741
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Sbjct 181 GTTTTTCAGGATGGTTTCAGTGGAAATTGGGTACTAA-AATTAAATGACCAAGTTATTGG 239
Query 742 TTACTGGCCTAAAGAGTTATTTACTCACTTAAACAAAGGAGCTTCTTTGGTACGCTTTGG 801
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Sbjct 240 TTACTGGCCTAAAGAGTTATTTACTCACTTAAATAAAGGAGTTTCTTTGGTACGTTTTGG 299
Query 802 AGGAAATACATTTCCATCTCCGGACGGATTTAGTCCCCCAATGGGAAATGGATATTTTCC 861
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Sbjct 300 AGGAAATACATTTCCATCTCCGGAGGGAATTAGTCCTCCAATGGGAAATGGCCATTTTCC 359
Query 862 -GTCTCA-CGATTTTTATAAAAGTTCACATTTTTCAAAGGTCAAAGTTAAGAATTCGAAC 919
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Sbjct 360 AGT-T-ATCGACTTTCATAAAAGTTCACATTTTTCATTTGTCAAAGTTAAGAATTCGAAC 417
Query 920 TATGAAACCATTGATTTTGAAAA-ACAGAGAACAAGACGTTATGCAGATTCTTACCAAT- 977
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Sbjct 418 TATCAAAGCATCGATATTGAAGATA-AGAAAACAAGACTTTATGCAGATTCTTACCAATG 476
Query 978 TTATAGACTAACGTATTGGGGTTATAACCAGCAT-AATAGAGTATCCTTCTCTTATGGAG 1036
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Sbjct 477 TTATAGACTAACGTATTGGGGTTATAGCAAGT-TGAATGGGGTATCCTTCTCTTTTGGAG 535
Query 1037 GACCAGGTGGACAAT-GTGGTACTT 1060
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Sbjct 536 GACCAGGTGGA-AATTGTGGTACTT 559
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
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Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
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Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5