BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT2G27900.1 Length=3852 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg481716 jgi|Araly1|481716|fgenesh2_kg.4__776__AT2G27900.2 5830 0.0 Ahg343860 jgi|Araly1|343860|fgenesh1_pg.C_scaffold_4000202 1134 0.0 Ahg359646 jgi|Araly1|359646|fgenesh1_pg.C_scaffold_580000001 789 0.0 > Ahg481716 jgi|Araly1|481716|fgenesh2_kg.4__776__AT2G27900.2 Length=3705 Score = 5830 bits (3157), Expect = 0.0 Identities = 3456/3598 (96%), Gaps = 30/3598 (1%) Strand=Plus/Plus Query 45 CACACCATTGTCGAAACAAATCAAAAGGCTCAACAAAAGtcttcttcttcttctagatct 104 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | Sbjct 4 CACACCATTGTCGAAACAAATCAAAAGACTCAACAAAAGTC-TC--CTTCTTCTAGA--T 58 Query 105 ctcttcCCGATCCGATTTGTGACTCGCCGGAAAGAAATAACACACAGACAGACATTTTCT 164 |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | | | ||||||||||||| Sbjct 59 CTCTTCCCGATCCGATTTGTGACTCGCCGG--A-AAATAA-A-AAACACAGACATTTTCT 113 Query 165 CCGATCGTGAAATTAGATGGATCAATAATTGATCTTACTGGTATAAAGAAGAGATGAGAG 224 |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 114 CCGATCGTGAAATTGGATGGATCAATTATTGATCTTACTGGTATAAAGAAGAGATGAGAG 173 Query 225 ATGCAGCCTAATCTCTTCTTCCCATTCGGTTCAGTTTTGGGTAATCCATTTCTCTTCAAT 284 |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 174 ATGCAGCC-AA-ATC-TCTTCCCATTCGGTTCAGTTTTGGGTAATCCATTTCTCTTCAAT 230 Query 285 GGCGGTGGAGATCTAAACGAACTTGGTTCTGGTGCTGCTTTCGAGAGCTCTAGGGTTTTC 344 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct 231 GGCGGTGGAGATCTAAACGAACTTGGTTCTGGTGCTGGATTCGAAAGCTCTAGGGTTTTC 290 Query 345 TTCTTACTTCCTTTCTTATTATCCCAAGGCACTGGTGTCATGGATTTATCTAAAGTTGGT 404 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 291 TTCTTACTTCCTTTCTTATTATCCCAAGGCACTGGTGTCATGGATTTATCTAAAGTTGGT 350 Query 405 GAAAAATTCCTCAGCTCTGTTAAATCCGCTACTTCTCTTGGTCTCTTACCTTCTCCTTCT 464 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 351 GAAAAATTCCTCAGCTCTGTAAAATCCGCTACTTCTCTTGGTCTCTTACCTTCACCTTCT 410 Query 465 ATCTCCGATCGTCCTGAGATTCCAGCACGTGCTGCGGCAGCTGCTGCGGTTGCTCGTGCT 524 ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 411 ATCTCTGATCGTCCTGAGATTCCGGCACGTGCTGCGGCAGCTGCTGCGGTTGCTCGTGCT 470 Query 525 TTGGCGGGACTTCCTTCTGATCAGAGATTGAGTATATCTTCTACTGCTACTGAGCTTAAC 584 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 471 TTGGCGGGACTTCCTTCTGATCAGAGGTTGAGTATATCTTCTACTGCTACTGAGCTTAAC 530 Query 585 TCAATTTATGGAAACAGACCTCTTCCTCAACAAGTTGAAGAGCTTGAAGAAGG-TTTCTA 643 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || Sbjct 531 TCAATTTATGGAAATAGACCTCTTCCTCAACAAGTTGAAGAGCTTGAAGAGGGATTT-TA 589 Query 644 TGAAGAGGATTTTGATCCGGTAAGGCATATTTTGGAGAATGTGCCGGATGATGAAAGTGA 703 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 590 TGAAGAGGATTTTGATCCGGTAAGGCATATTTTGGAGAATGTGCCGGAAGATGAAAGTGA 649 Query 704 GTTAGCTTATTTTGAGAAGCAGGCTACCTTGAGGTTGGTACAGCTGGATAAAGTGGCAGA 763 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || Sbjct 650 GTTAGCTTATTTTGAGAAGCAGGCTACCTTGAGGTTGGTACAGCTGGATAGAGTGGCGGA 709 Query 764 AACTCTGTCTCACCATGTTATGGAGCATCATGAAGTAATGGTGAAGGGGATGAATTTGGT 823 || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 710 AAATCTGTCACACCATGTTATGGAGCATCATGAAGTAATGGTGAAGGGGATGAATTTGGT 769 Query 824 AAGAGAATTGGAGAAAGATTTGAAGATTGCAAATGTCATCTGCAAGAATGGAAGACGAAA 883 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 770 AAGAGAATTGGAAAAAGATTTGAAGATTGCAAATGTCATCTGCAAGAATGGAAGACGAAA 829 Query 884 TTTGACTTCTTCTATGAATGAGGCTTCAAGAGATCTTATTGTACACACTCATTCCAAAAA 943 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 830 TTTGACCTCTTCTATGAATGAGGCTTCAAGAGATCTTATTGTACACACTCATTCCAAAAA 889 Query 944 GAAACAAGCTCTTCTGGATATGCTTCCTATACTAACTGACCTCCGCCATGCAAGAGTAAT 1003 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 890 GAAACAAGCTCTTCTGGATATGCTTCCTATACTAACTGACCTCCGCCATGCAAGAGTAAT 949 Query 1004 GCAGTCAAATCTTGAAGACCTTGTTGAAGATGGAAACTATTGCAAGGCATTTCAAGTCCT 1063 |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 950 GCAGTCAACTCTTGAAGACCTTGTTGAAGAAGGAAACTATTGCAAGGCATTTCAAGTTCT 1009 Query 1064 ATCAGAGTATTTGCAGCTGCTTGACAGTCTATCTGAGTTCTCAGCAGCCCAAGAGATGAC 1123 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1010 ATCTGAGTATTTGCAGCTGCTTGACAGTCTATCTGAGTTCTCAGCAGCCCAAGAGATGAC 1069 Query 1124 CCGTGGTGTTGAGGTTTGGTTAGGAAGAACTCTTCATAAGCTGGATTCACTGTTGTTGGG 1183 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1070 CCGTGGTGTTGAGGTTTGGTTAGGAAGAACTCTTCATAAGCTGGATTCACTTTTGTTGGG 1129 Query 1184 CGTTTGCCAGGAATTCAAAGAAGATAGTTATGTAATGGTCCTCGACGCTTATGCACTGAT 1243 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1130 CGTTTGCCAGGAATTCAAAGAAGATAGTTATGTAATGGTCCTCGACGCTTATGCACTGAT 1189 Query 1244 CGGTGATGTCTCTGGTCTCGCAGAAAAGATACAAAGTTTCTTTATGCAAGAAGTTATCTC 1303 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1190 CGGTGATGTCTCTGGTCTCGCAGAAAAGATACAAAGCTTCTTTATGCAGGAAGTTATCTC 1249 Query 1304 AGAAACCCACTCAGTGCTAAAGAGCATTGTTGGGGAGGATAACAGTGCTGCCACCCAATA 1363 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1250 AGAAACCCACTCAGTGCTAAAGAGCATTGTTGGGGAGGATAACAGTGCTGCCACCCAATA 1309 Query 1364 TAGTAGACTTACCTACAGCGATCTATGCCTTCAAACACCAGAATCCAAGTTTAGGCAATG 1423 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1310 TAGTAGACTTACCTACAGCGATCTATGCCTTCAGACACCAGAATCCAAGTTTAGGCAATG 1369 Query 1424 TCTTTTGAGAACACTAGCTGTGCTTTTTCAGTTAATATATTCATACCATGAGATAATGAG 1483 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1370 TCTTTTGAGAACACTAGCTGTGCTCTTTCAGTTAATATATTCATACCATGAGATAATGAG 1429 Query 1484 TTTCACGCCAGAAAAGGAGGCAGAAATTTTGGTCTCACCCAGTCTTGCAACAACTCAAAT 1543 |||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct 1430 TTTCACGCCAGAAAAGAAGGTAGAAAGTTTGATCTCACCAAGTCCTGCAACAACTCAAAA 1489 Query 1544 GGTTGATTCAGTGACCGGAAGTTCATGTGACCCACAGGATGGTGGTCTATTGCCGGGAAG 1603 ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||| Sbjct 1490 GGTTGATTCAGTGACCGAAAGTTCATGCAACCCACAGGATGGTGGTCTCTTTTCAGGAAG 1549 Query 1604 CATACCTCCTTGTACCATTTCCGCTGAAGAGTCGGATGGAAGTGGAACATCCAGTTCAGT 1663 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1550 CATACCTCCTTGTACCATTTCTGCTGAAGAGTCTGATGGAAGTGGAACATCCAGTTCAGT 1609 Query 1664 GCAGC-TGGCGTCTAATATTGCAATAGATGAGTCTAGGAATTCTGAAGATAGAGTATCAA 1722 ||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct 1610 GCAACAT-GCGTCTGATATTGCAATAGATGAGTCTAGGAATTCTGGAGATACAGTATCAA 1668 Query 1723 GTAGCGAGTCACCATGGTACTATTTACGAAAAGAAAGTGCAGCTTTTGTTTCAGAAACTC 1782 |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1669 GTAGCGAGTCGCCATGGTACTATCTACGAAAAGAAAGTGCAGCTTTTGTTTCAGAAACTC 1728 Query 1783 TTCAGAGAGGACGCAGAAATCTTTGGCAACTTACAACAAGCCGTGTGTCAGTTTTGCTCT 1842 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1729 TTCAGAGAGGACGCAGAAATCTTTGGCAACTTACAACAAGTCGTGTGTCAGTTTTGCTCT 1788 Query 1843 CTTCCCCAGGTGCTTCTTCAACAAGTATACATCAGTTCCTAAAAAATTATGAAGACCTGA 1902 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1789 CTTCCCCAGGTGCTTCTTCGACAAGTATACATCAGTTCCTAAAAAATTATGAAGACCTGA 1848 Query 1903 GCATCTTTATCCTTGCTGGGGAAGCGTTCTGTGGATTTGAAGTTGTTGATTTTAGGGAGA 1962 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1849 GCATCTTTATCCTTGCTGGGGAAGCTTTCTGTGGATTTGAAGTTGTTGATTTTAGGGAGA 1908 Query 1963 AGCTAAAGGGTGTATGCGAAAATTATTTCACTGCATTTCATAGGCAAAGCATGCATGCGC 2022 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1909 AGCTAAAGGGTGTATGCGAAAATTATTTCACTGCATTTCATAGGCAAAGCATGCATGCGC 1968 Query 2023 TTAAAATGGTCCTGGAGAAGGAGACATGGACGAAATTGTCACCAGATACTGTGCAAGCTA 2082 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1969 TTAAAATGGTCCTGGAGAAGGAGACATGGACGAAACTGTCACCAGATACTGTGCAAGCTA 2028 Query 2083 TTAATTTTGCTGGTCTTGTGGGGGATGGGGCTCCCCTAATTATTTCTTCCCGCAGTGCCT 2142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2029 TTAATTTTGCTGGTCTTGTGGGGGATGGGGCTCCCCTAATTATTTCTTCCCGCAGTGCCT 2088 Query 2143 CAGGTTCTTCCAGATTCCCTCACTCTGATAAGCCAAGTAACTCAATTGATCCAAGTGGCA 2202 | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| Sbjct 2089 CGGGTTCTTCCAGATTCCCTCACTCTAATAAGTCAAATGACTCAATTGATCCAAGTGGCA 2148 Query 2203 ACAGGAGTGGATTTTCATATTGGCTGAAAAGTGGGAACCCGTTCTCAGCAAAGTTAACTC 2262 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2149 ACAGGAGTGGATTTTCATATTGGCTGAAAAGTGGAAACCCCTTCTCAGCAAAGTTAACTC 2208 Query 2263 ACTATAGAGAAGATCAAGACTACTCCTCGATCAATGGAGAAGATCATGAAGGGAATGATA 2322 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct 2209 ACTATAGAGAAGATCAAGACTACTCCTCGGTCAATGGAGGAGATCATGAAGGTAATGATA 2268 Query 2323 GTATTCATGATGATGTTGTGAATCCCAAGATAAGAGACATAAAA-CGCATCAACGGAGGT 2381 ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| Sbjct 2269 GTATTCACGATGATGTTGTGAATCCCAAGATAACAGACA-AAAACCACATCAACGGAGGT 2327 Query 2382 AGTCCTGTTTCAGAAGATGAAAACGAAGACCTTCTTGCTGACTTTATTGATGAGGATAGC 2441 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2328 AGTCCTGTTTCTGAAGATGAAAACGAAGACCTTCTTGCTGACTTTATTGATGAGGATAGT 2387 Query 2442 CAGCTTCCAAGACGAAGTTTTACACGTAGTCAATCAAGGACTTCTTCTTCACATTTTAGT 2501 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | | Sbjct 2388 CAGCTTCCAAGACGAAGTTTTACACGTAGTCAATCAAGGAGTTCTTCTTCATATTTCAAT 2447 Query 2502 ACTAATGATGATTTGACAGCTCAAACAGGATCATCCCTTTGTCTTCTAAGATCTATGGAT 2561 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2448 ACTAATGATGATTTGACAGCTCAAACAGGATCGTCCCTTTGTCTTCTAAGATCCATGGAT 2507 Query 2562 AAGTACGCGAGGCTTATGCAGAAGCTAGAAATTGTTAATGCTGAATTCTTTAAGGGAATA 2621 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2508 AAGTACGCGAGGCTTATGCAGAAACTAGAAATTGTTAATGTTGAATTCTTTAAGGGAATA 2567 Query 2622 TGCCAATTGTTTGGAGTCTTTTTCTATTTCGTGTTTCAAGTATTTGGTCAAGAAAATACT 2681 |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2568 TGCCAATTGTTTGGGGTCTTTTTCTATTTCGTTTTTCAAGTATTTGGTCAAGAAAATACT 2627 Query 2682 AATTCAGGTGGAAAAGGAGTTTCCGACTCTTTCAATCATCGTTTGAAAAGCTGCTTATCA 2741 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2628 AATTCAGGTGGAAAAGGAGTTGCCGACTCTTTCAATCCTCGTTTGAAAAGCTGCTTATCC 2687 Query 2742 CGGATATCACAAGAGTGTGAGCAATGGATAAAACCTCACGTTTCATCATCACCATCTTCT 2801 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2688 CGGATATCACAAGAGTGTGAGCAATGGATAAAACCTCACCTTTCATCATCACCATCTTCT 2747 Query 2802 TCACTTGCCTTTCCCAACACTGTTCATAGTCTTGCGGATGTGACTCCAGCAAGTCCCTTA 2861 |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2748 TCACTTGCCTTTCCCAACACAG-T--TAGTCTTGCGGATGTGACTCCAGCAAGTCCCTTA 2804 Query 2862 AATACTTCTGGTCACTTATCAGGCGTATCTTTTAGTCTCAAGGAAAGATGTGCTGCTGTG 2921 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2805 AATACTTCTGGTCACTTATCAGGCGTATCTTTTAGTCTCAAGGAAAGATGTGCTGCTGTG 2864 Query 2922 GACACAGTATCTCTTGTGGCTCGGGTATTGCATAAATCAAAGGCTCATCTCCAATCAATG 2981 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2865 GACACAGTATCTCTTGTGGCTCGGGTATTGCATAAATCAAAGGCTCATCTCCAATCAATG 2924 Query 2982 CTTA-TGTCAAGAAATGGGTCTCTGGTTGAAGACTTCTTTGGTCAACTGGTTGGTTCCGT 3040 ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2925 -TTAATGTCAAGAAATGGCTCTCTGGTTGAAGACTTCTTTGATCAACTGGTTGGTTCCGT 2983 Query 3041 ACCTGATCTGACAGAGCACTTACATAGGACAACTGCGAGGATACTGCTGCATGTTAATGG 3100 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2984 ACCTGATCTGACAAAGCACTTACATAGGACAACTGCGAGGATACTGCTGCATGTTAATGG 3043 Query 3101 ATATGTCGATCGGATAGCTAATTCTAAATGGGAAATCAAGGAGCTTGGAATGGAGCATAA 3160 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3044 ATATGTTGACCGGATAGCTAATTCTAAATGGGAAATCAAGGAGCTTGGAATGGAGCATAA 3103 Query 3161 TGGGTATGTTGATTTGATGCTCGGGGAATTCAAACACTACAAAACAAGGCTTGCTCATGG 3220 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3104 TGGGTATGTTGATCTGATGCTCGGGGAATTCAAACACTACAAAACAAGGCTTGCTCATGG 3163 Query 3221 AGGCATTCCACAGGAGGTCCAAAACCTCCTACTTGAA-TATGGAGTTGAAATATTTGCGG 3279 ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 3164 AGGCATTCCACAGAAGGTCCAAAACCGCCTACT-GAAATATGGAGTTGAAATATTTGCGG 3222 Query 3280 AGATGCTGGTTGAAGGCTTATCTCGAATAAAAAGATGTACTGATGAAGGACGTGTTCTCA 3339 |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3223 AGATACTTGTTGAAGGCATATCTCGAATAAAAAGATGTACTGATGAAGGACGTGTTCTCA 3282 Query 3340 TGTCATTAGATCTTCAGGTTCTAATAAATGGGTTACAGCACTTTGTGCCAACAAAAGTGA 3399 |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||| Sbjct 3283 TGTCATTAGATCTTCAGGTTCTAATAAACGGGCTACAGCACTTTGTGCCAACAGATGTGA 3342 Query 3400 AGCCAAAGTTACAGATAGTCGAAACATTTATCAAGGCGTACTATCTGCCAGAGACGGAAT 3459 || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3343 AGGAAAAGTTAAAGATAGTCGTAACATTTATCAAGGCGTACTATCTGCCAGAGACGGAAC 3402 Query 3460 ATGTTCACTGGGCAAGGGCTCATCCGGAATATACAAAAGCACAGGTCGTTGGACTGGTGA 3519 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 3403 ATGTTCACTGGGCAAGGGCTCATCCGGAATATACAAAAGCACAGGTCCTTGGACTGGTGA 3462 Query 3520 ATTTAGTAGCCACCATGAAAGGTTGGAAAAGGAAAACGCGGCTGGAAGTTATCGAGAAGA 3579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3463 ATTTAGTAGCCACCATGAAAGGTTGGAAAAGGAAAACGCGGCTGGAAGTTATCGAGAAGA 3522 Query 3580 TCGAATCAGCGTCTA-TGTAGATCAATCTTAGAAGCTTCTGGCAGCTTCGCGACATCA 3636 |||||||||| || | |||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||| Sbjct 3523 TCGAATCAGCTTC-ACTGTAGATCAA-CT-AGAAGCATCTGGCAGCTTCACGACATCA 3577 > Ahg343860 jgi|Araly1|343860|fgenesh1_pg.C_scaffold_4000202 Length=2760 Score = 1134 bits (614), Expect = 0.0 Identities = 728/782 (93%), Gaps = 11/782 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1777 AAACTCTTCAGAGAGGACGCAGAAATCTTTGGCAACTTACAACAAGCCGTGTGTCAGTTT 1836 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1577 AAATTCTTCAGAGAGGACGCAGAAATCTTTGGCAACTTACAACAAGCCGCGTGTCAGTTT 1636 Query 1837 TGCTCTCTTCCCCAGGTGCTTCTTCAACAAGTATACATCAGTTCCTAAAAAATTATGAAG 1896 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1637 TGCTCTCTTCCCCAGGTGCTTCTTCAACAAGTATACATCAGTTCCTAAAGAATTATGAAG 1696 Query 1897 ACCTGAGCATCTTTATCCTTGCTGGGGAAGCGTTCTGTGGATTTGAAGTTGTTGATTTTA 1956 |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1697 ACCTGAGCGTCTTTATCCTTGCTAGGGAAGCGTTCTGTGGATTTGAAGTTGTTGATTTTA 1756 Query 1957 GGGAGAAGCTAAAGGGTGTATGCGAAAATTATTTCACTGCATTTCATAGGCAAAGCATGC 2016 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1757 GGGAGAAGCTAAAGGGTGTATGCGAAAATTATTTCACTGCATTTCATAGACAAAGCATGC 1816 Query 2017 ATGCGCTTAAAATGGTCCTGGAGAAGGAGACATGGACGAAATTGTCACCAGATACTGTGC 2076 |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||| || |||||||||| Sbjct 1817 ATGCGCTTAAAATGGTTCTGGAGAAGGAAAGATGGACAAAATTGTCTCCTGATACTGTGC 1876 Query 2077 AAGCTATTAATTTTGCTGGTCTTGTGGGGGATGGGGCTCCCCTAATTATTTCTTCCCGCA 2136 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1877 AAGCTATTAATTTTGCTGGTCTTGTGGGGGATGGGGCTCCCCTAATTATTTCTTCCTGCA 1936 Query 2137 GTGCCTCAGGTTCTTCCAGATTCCCTCACTCTGATAAGCCAAGTAACTCAATTGATCCAA 2196 ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| Sbjct 1937 GTGCCACTGGTTCTTCCAGATTCTCTCACTCTAATAAGTCAAATAACTCAATTGATGCAA 1996 Query 2197 GTGGCAACAGGAGTGGATTTTCATATTGGCTGAAAAGTGGGAACCCGTTCTCAGCAAAGT 2256 || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| Sbjct 1997 GTTGTAACAGGAGTGGATTTTCATATTGGCTGAAAGGTGGTAACCCCTTCTCAGCAAAGT 2056 Query 2257 TAACTCACTATAGAGAAGATCAAGACTACTCCTCGATCAATGGAGA-A-----G-A--TC 2307 ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | | | | Sbjct 2057 TAACTCACTATAGAGAAGATCAAGACTACTCCTTGGTCAATGGAGATATCTCTGGAGATT 2116 Query 2308 ATGAAGGGAATGATAGTATTCATGATGATGTTGTGAATCCCAAGATAAGAGACATAAAAC 2367 ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| Sbjct 2117 ATGAAGGGAATGACAGTATTCACGATGATGTTGTGAATTCCAAGATAAGAGAGAAAAAAC 2176 Query 2368 GCA-TCAACGGAGGTAGTCCTGTTTCAGAAGATGAAAACGAAGACCTTCTTGCTGACTTT 2426 ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2177 GCACT-AACGGGGGTAGTCCTGTTTCAGAAGATGAAAAGGAAGACCTTCTTGCTGACTTT 2235 Query 2427 ATTGATGAGGATAGCCAGCTTCCAAGACGAAGTTTTACACGTAGTCAATCAAGGACTTCT 2486 |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2236 ATTGATGAGGATAGTCAGCTTCCAAGACGAAGTTTCACACGTAGTCATTCAAGGACTTCT 2295 Query 2487 TCTTCACATTTTAGTACTAATGATGATTTGACAGCTCAAACAGGATCATCCCTTTGTCTT 2546 |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct 2296 TCTTCATATCTCAGTACTAATGATGATTTGACAGCTCAAACGGGATCGTCCCTTTGTCTT 2355 Query 2547 CT 2548 || Sbjct 2356 CT 2357 Score = 560 bits (303), Expect = 2e-158 Identities = 344/364 (95%), Gaps = 2/364 (1%) Strand=Plus/Plus Query 2668 GTCAAGAAAATACTAATTCAGGTGGAAAAGGAGTTTCCGACTCTTTCAATCATCGTTTGA 2727 ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||| Sbjct 2360 GTCAAGAAAATACTAATTCAGGTGGAAAAGGAGGTGCTGACTCTTTCAACCATCGTTTGA 2419 Query 2728 AAAGCTGCTTATCAC-GGATATCACAAGAGTGTGAGCAATGGATAAAACCTCACGTTTCA 2786 ||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2420 AAAGCAGCTTATC-CGGGATATCACAAGAATGTGAGCAATGGATAAAACCTCACGTTTCA 2478 Query 2787 TCATCACCATCTTCTTCACTTGCCTTTCCCAACACTGTTCATAGTCTTGCGGATGTGACT 2846 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2479 TCATCACCATCTTCTTCACTTGCCTTTCCCAACACAGTTCATAGTCTTGCGGACGTGACT 2538 Query 2847 CCAGCAAGTCCCTTAAATACTTCTGGTCACTTATCAGGCGTATCTTTTAGTCTCAAGGAA 2906 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2539 CCAGCAAGTCCCTTAAATACTTCTGGTCACTTATCAGGCGTATCCTTTAGTCTCAAGGAA 2598 Query 2907 AGATGTGCTGCTGTGGACACAGTATCTCTTGTGGCTCGGGTATTGCATAAATCAAAGGCT 2966 ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| Sbjct 2599 AGATGTGCTGCAGTGGACACTGTTTCTCTTGTGGCTAGGATATTACATAAATCAAAGGCT 2658 Query 2967 CATCTCCAATCAATGCTTATGTCAAGAAATGGGTCTCTGGTTGAAGACTTCTTTGGTCAA 3026 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | Sbjct 2659 CATCTCCAATCAATGCTTATGTCAAGAAATGGCTCTCTAGTTGAAGACTTCTTTGGTCTA 2718 Query 3027 CTGG 3030 |||| Sbjct 2719 CTGG 2722 Score = 531 bits (287), Expect = 2e-149 Identities = 321/338 (95%), Gaps = 0/338 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1007 GTCAAATCTTGAAGACCTTGTTGAAGATGGAAACTATTGCAAGGCATTTCAAGTCCTATC 1066 ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 798 GTCAACTCTTGAAGACCTTGTTGAAGAAGGAAAGTATTGCAAGGCATTTCAAGTTCTATC 857 Query 1067 AGAGTATTTGCAGCTGCTTGACAGTCTATCTGAGTTCTCAGCAGCCCAAGAGATGACCCG 1126 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 858 TGAGTATTTGCAGCTGCTTGACAGTCTATCTGAGTTCTCAGCAGCCCAAGAGATGACCCG 917 Query 1127 TGGTGTTGAGGTTTGGTTAGGAAGAACTCTTCATAAGCTGGATTCACTGTTGTTGGGCGT 1186 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 918 TAGTGTTGAGGTTTGGTTAGGAAGAACTCTTCATAAGCTGGATTCACTTTTGTTGGGCGT 977 Query 1187 TTGCCAGGAATTCAAAGAAGATAGTTATGTAATGGTCCTCGACGCTTATGCACTGATCGG 1246 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct 978 TTGCCAGGAGTTCAAAGAAGATAGATATGTAATGGTCCTTGACGCCTATGCACTGATCGG 1037 Query 1247 TGATGTCTCTGGTCTCGCAGAAAAGATACAAAGTTTCTTTATGCAAGAAGTTATCTCAGA 1306 ||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1038 TGATGTCTCTGGTCTTGCCGAAAAGATACAGAGCTTCTTTATGCAGGAAGTTATCTCAGA 1097 Query 1307 AACCCACTCAGTGCTAAAGAGCATTGTTGGGGAGGATA 1344 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1098 AACCCACTCAGTGCTAAAGACCATTGTTGGGGAGGATA 1135 Score = 496 bits (268), Expect = 7e-139 Identities = 357/398 (90%), Gaps = 14/398 (4%) Strand=Plus/Plus Query 1341 GATAACAGTGCTGCCACCCAATATAGTAGACTTACCTACAGCGATCTATGCCTTCAAACA 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1180 GATAACAGTGCTGCCACCCAATATAGTAGACTTACCTACAGCGATCTATGCCTTCAGACA 1239 Query 1401 CCAGAATCCAAGTTTAGGCAATGTCTTTTGAGAACACTAGCTGTGCTTTTTCAGTTAATA 1460 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1240 CCAGAATCCAAGTTTAGGCAATGTCTTTTGAGAACACTAGCTGTGCTGTTTCAGTTAATA 1299 Query 1461 TATTCATACCATGAGATAATGAGTTTCACGCCAGAAAAGGAGGCAGAAATTTTGGTCTCA 1520 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| ||||| Sbjct 1300 TATTCATACCATGAGATAATGAGTTTCACGCCCGAAAAGAAGATAGAAAGTTTGATCTCA 1359 Query 1521 CCCAGTCTTGCAACAACTCAAATGGTTGATTCAGTGACCGGAAGTTCATGTGACCCACAG 1580 || |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| || | Sbjct 1360 CCAAGTCCTGCAACAACTCAAAAGGTTGATTTAGTGACCGGAAGTTCATGCGACCTACTG 1419 Query 1581 GATGGTGGTCTAT-TGC--C---G-G---G--AAGCATACCTCCTTGTACCATTTCCGCT 1628 ||||||||||| | | | | | | | |||||||||||||||||| ||||| || Sbjct 1420 GATGGTGGTCTCTCTTCTACCATGAGTTCGGGAAGCATACCTCCTTGTACAATTTCTGCC 1479 Query 1629 GAAGAGTCGGATGGAAGTGGAACATCCAGTTCAGTGCAGC-TGGCGTCTAATATTGCAAT 1687 |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| Sbjct 1480 GAAGAGTCTGATGTAAGTGGAACATCCAGTTCCGTGCAGCATGT-GTCTAATATTGCAAT 1538 Query 1688 AGATGAGTCTAGGAATTCTGAAGATAGAGTATCAAGTA 1725 |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| Sbjct 1539 AGATGAGTCTAGGAATTCTGGAGATACAGTATCCAGTA 1576 Score = 453 bits (245), Expect = 4e-126 Identities = 325/362 (90%), Gaps = 12/362 (3%) Strand=Plus/Plus Query 443 TGGTCTCTTACCTTCTCCTTCTATCTCCGATCGTCCTGAGATTCCAGCACGTGCTGCGGC 502 ||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || Sbjct 207 TGGTCTCTTACCTTCACCCTCTTTCTCTGATCGCCCTGAGATTCCGGCACGTGCTGCAGC 266 Query 503 AGCTGCTGCGGTTGCTCGTGCTTTGGCGGGACTTCCTTCTGATCAGAGATTGAGTATATC 562 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 267 TGCTGCTGCGGTTGCTCGTGCTTTGGCGGGACTTCCTTCTGATCAGAGATTGAGTATATC 326 Query 563 TTCTACTGCTACTGAGCTTAACTCAATTTATGGAAACAGACCTCTTCCTCAACAAGTTGA 622 |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct 327 TTCTACTGCTACTGAGCTTAGTTCTATATATGGTAATAGACCTCTTCCTCAACAAGTTGA 386 Query 623 AGAGCTTGAAGAAGGTTTCTATGAAGAGGATTTTGATCCGGTAAGGCATATTTTGGAGAA 682 ||||||||||| || | | || |||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 387 GGAGCTTGAAGA-GG-----A-G--GA---TTTTGATCCGGTAAGGCATATTTTAGAGAA 434 Query 683 TGTGCCGGATGATGAAAGTGAGTTAGCTTATTTTGAGAAGCAGGCTACCTTGAGGTTGGT 742 |||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | Sbjct 435 TGTGCCAGATGATCAGAGTGAGCTAGCTTATTTTGAGAAGCAGGCCACCTTGAGGTTGTT 494 Query 743 ACAGCTGGATAAAGTGGCAGAAACTCTGTCTCACCATGTTATGGAGCATCATGAAGTAAT 802 |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 495 ACAGTTGGATAGAGTGGCAGAAAATCTGTCTCACCATGTTATGGAGCATCATGAAGTAAT 554 Query 803 GG 804 || Sbjct 555 GG 556 Score = 222 bits (120), Expect = 1e-56 Identities = 143/154 (93%), Gaps = 2/154 (1%) Strand=Plus/Plus Query 807 AAGGGGATGAATTTGGTAAGAGAATTGGAGAAAGATTTGAAGATTGCAAATGTCATCTGC 866 ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct 646 AAGGGGATGAATTTGGTTAGAGAACTGGAAAAAGATTTGAAGATTGCAAATGTTAGCTGC 705 Query 867 AAGAATGGAAGACGAAATTTGACTTCTTCTATGAATGAGGCTTCAAGAGATCTTATTGTA 926 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||| Sbjct 706 AAGAATGGAAGACGAAATTTGACTTCATCTATGAATGAAGCTTCAGGGGATCTTATTGTA 765 Query 927 CACACTCATTCCAAAAAGAAACAAGC-TCTTCTG 959 |||||||||||||||||||||||||| | ||||| Sbjct 766 CACACTCATTCCAAAAAGAAACAAGCAT-TTCTG 798 > Ahg359646 jgi|Araly1|359646|fgenesh1_pg.C_scaffold_580000001 Length=609 Score = 789 bits (427), Expect = 0.0 Identities = 477/501 (95%), Gaps = 4/501 (1%) Strand=Plus/Plus Query 371 AGGCACTGGTGTCATGGATTTATCTAAAGTTGGTGAAAAATTCCT-CAGCTCTGTTAAAT 429 |||||| || | |||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct 111 AGGCACGGGGGGCATGGATTTATCGAAGGTTGGTGAAAAATTCCTCCA-CTCTGTTAAAT 169 Query 430 CCGCTACTTCTCTTGGTCTCTTACCTTCTCCTTCTATCTCCGATCGTCCTGAGATTCCAG 489 ||||||||| ||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| | Sbjct 170 CCGCTACTTTTCTTGGTCTCTTACCATCACCATCGATCTCGGATCGTCCTGAGATTCCGG 229 Query 490 CACGTGCTGCGGCAGCTGCTGCGGTTGCTCGTGCTTTGGCGGGACTTCCTTCTGATCAGA 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 230 CACGTGCTGCGGCAGCTGCTGCGGTTGCTCGTGCTTTGGCGGGACTTCCTTCTGATCAGA 289 Query 550 GATTGAGTATATCTTCTACTGCTACTGAGCTTAACTCAATTTATGGAAACAGACCTCTTC 609 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 290 GGTTGAGTATATCTTCTACTGCTACTGAGCTTAACTCAATTTATGGAAATAGACCTCTTC 349 Query 610 CTCAACAAGTTGAAGAGCTTGAAGAAGG-TTTCTATGAAGAGGATTTTGATCCGGTAAGG 668 ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 350 CTCAACAAGTTGAAGAGCTTGAAGAGGGATTT-TATGAAGAGGATTTTGATCCGGTAAGG 408 Query 669 CATATTTTGGAGAATGTGCCGGATGATGAAAGTGAGTTAGCTTATTTTGAGAAGCAGGCT 728 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 409 CATATTTTGGAGAATGTGCCGGATGATGAAAGTGAGTTAGCTTATTTTGAGAAGCAGGCT 468 Query 729 ACCTTGAGGTTGGTACAGCTGGATAAAGTGGCAGAAACTCTGTCTCACCATGTTATGGAG 788 ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||| Sbjct 469 ACCTTGAGGTTGGTACAGCTGGATAGAGTGGCGGAAAATCTGTCACACCATGTTATGGAG 528 Query 789 CATCATGAAGTAATGGTGAAGGGGATGAATTTGGTAAGAGAATTGGAGAAAGATTTGAAG 848 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 529 CATCATGAAGTAATGGTGAAGGGGATGAATTTGGTAAGAGAATTGGAAAAAGATTTGAAG 588 Query 849 ATTGCAAATGTCATCTGCAAG 869 ||||||||||||||||||||| Sbjct 589 ATTGCAAATGTCATCTGCAAG 609 Score = 158 bits (85), Expect = 4e-37 Identities = 106/115 (92%), Gaps = 6/115 (5%) Strand=Plus/Plus Query 225 ATGCAGCCTAATCTCTTCTTCCCATTCGGTTCAGTTTTGGGTAATCCATTTCTCTTCAAT 284 |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGCAGCC-AA-ATC-TCTTCCCATTCGGTTCAGTTTTGGGTAATCCATTTCTCTTCAAT 57 Query 285 GGCGGTGGAGATCTAAACGAACTTGGTTCTGGTGCTGCT-TTCGAGAGCTCTAGG 338 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| Sbjct 58 GGCGGTGGAGATCTAAACGAACTTGGTTCTGGTGCTGGGATTC-A-AGCTCTAGG 110 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 145570216725 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5