BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G29140.1
Length=3324
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg481833 jgi|Araly1|481833|fgenesh2_kg.4__893__AT2G29140.1 4948 0.0
Ahg481838 jgi|Araly1|481838|fgenesh2_kg.4__898__AT2G29200.1 4287 0.0
Ahg952160 jgi|Araly1|952160|scaffold_4100004.1 2567 0.0
Ahg928725 jgi|Araly1|928725|scaffold_301182.1 287 4e-76
> Ahg481833 jgi|Araly1|481833|fgenesh2_kg.4__893__AT2G29140.1
Length=3260
Score = 4948 bits (2679), Expect = 0.0
Identities = 3078/3267 (94%), Gaps = 41/3267 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 91 ATGATGATACCGGAACTAGGGAGAAGACCGATGCATAGAGGTAACGAAGATTCATCTTTT 150
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATGATACCGGAACTAGGAAGAAGACCGATGCATAGAGGTAACGAAGATTCATCTTTT 60
Query 151 GGGGATGATTACGAGAAAGAGATTGGAGTATTGCTTGGTGAGCAGCAGAGAAGGCAAGTA 210
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GGGGATGATTATGAGAAAGAGATTGGAGTATTACTTGGTGAGCAGCAGAGAAGGCAAGTA 120
Query 211 GAGGCGGATGAGCTTGAGAGAGAGCTTAACTTGTATAGAAGTGGCTCTGCTCCACCGACT 270
|| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GAAGCTGATGAGCTTGAGAGAGAGCTTAACTTGTATAGAAGTGGCTCTGCTCCACCGACT 180
Query 271 GTTGATGGTTCTCTTAGTGCTGCCGGAGGGCTTTTTAGCGGCGGAGGTGGGGCTTCTTTT 330
|||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 181 GTTGATGGTTCTGTCAGTGCTGCCGGAGGGCTTTTTAGCGGCGGAGGTGGGGCTCCTTTT 240
Query 331 CTGGAATTTGGTGGAGTTAATAAGGGTAATGGGTTTGGTGGTGATGATGAGGAGTTTAGG 390
|||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 241 TTGGAGTTTGGTGGAGGCAATAAGGGTAATGGGTTTGGTGGTGGTGATGAGGAGTTTAGG 300
Query 391 AAAGATCCAGCTTACTTGTCTTATTACTATGCTAATATGAAGTTGAATCCGAGGTTGCCA 450
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 301 AAAGATCCGGCTTACTTGTCTTATTACTATGCTAATATGAAGTTGAACCCGAGGTTGCCA 360
Query 451 CCTCCTTTGATGTCTAGGGAGGATTTGAGGGTTGCTCAGAGGCTTAAAGGGAGTAATAAT 510
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 361 CCGCCTTTGATGTCTAGGGAGGATTTGAGGGTTGCTCAGAGGCTTAAAGGGAGTAGTAAT 420
Query 511 GTGTTAGGTGGTGTTGGGGATAGGAGAAAAGTGAATGACAGTCGGTCTTTGTTCTCTATG 570
|| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 421 GTTTTAGGTGGTGTTGGGGATAGGCGAAAAGTTAATGATAGTCAATCTTTGTTCTCTATG 480
Query 571 CCACCTGGTTTTGAGGCTG-GAAAACCTGGTGCTTCTGCTTCTGAGTGGGATGCTAATGG 629
||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 CCACCTGGTTTTGAGGCTGAGAAAA-CTGGTGCTTCTGCTTCTGAGTGGGATGCTAATGG 539
Query 630 ATTGA-----TT----GGTTTGGGACTTGGAGGCAAGCAGAAGAGTTTTGCTGATATCTT 680
||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 ATTGATTGGTTTACCGGGTTTGGGACTTGGAGGCAAGCAGAAGAGTTTTGCTGATATCTT 599
Query 681 TCAGGCGGATAT--GG---GG-CATCCTGTTGTACAGCAGCCCTCACGTCCTGCTAGTCG 734
|||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 600 TCAGGCGGATATGGGGCATGGACATCCTGTCGCACAGCAGCCCTCACGTCCTGCAAGTCG 659
Query 735 TAATACCTTTGATGAGAATGTTGACTCTAATAATAACCTGTCTCCATCTGCATCACAAGG 794
||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 660 TAATACCTTTGATGAAAATGTTGACTCTAAGAATAATCTGTCTCCGTCTGCATCACAAGG 719
Query 795 CATTGGAGCGCCATCTCCATACTGCTATGCAGCTGTTCTGGGTTCATCTTTGTCTAGAAA 854
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 720 TATTGGAGCGCCATCTCCATACAGCTATGCAGCTGTTCTGGGTTCGTCTTTGTCTAGAAA 779
Query 855 TGGAACTCCAGATCCACAGGGCATTGCTAGGGTGCCTAGTCCTTGCCTTACTCCCATTGG 914
|||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||
Sbjct 780 TGGAACTCCAGATCCACAGGCCGTTGCTAGGGTGCCTAGTCCCTGTCTTACCCCCATTGG 839
Query 915 CAGTGGAAGAGTGAGTTCAAATGATAAGAGGAACACAAGTAATCAAAGCCCGTTCAACGG 974
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 840 GAGTGGGAGAGTGAGTTCAAATGATAAGAGGAACACAAGTAATCAAAGCCCGTTTAACGG 899
Query 975 TGTTACATCTGGTCTCAACGAGTCTTCTGATCTTGTCAATGCTTTATCCGGCTTGAACCT 1034
||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||
Sbjct 900 TGTTACATCTGGTCTGGTTGAGTCTTCTGATCTCGCCGCTGCTTTATCTGGCTTGAACCT 959
Query 1035 GTCAGGC-ACTGGCGGGCTAGATGAACGTG-GTCAGGCTGAGCAAGATGTCGAAAAGGTC 1092
||| || ||||||||| ||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 960 GTC-TGCAACTGGCGGGTTAGATGAAC-AGAGTCAAGCTGAGCATGATGTCGAAAAGGTC 1017
Query 1093 AGGAACTATATGTTTGGACTGCAAGATGGGCATAATGAAGTCAATCCACATGGGTTCCCA 1152
||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1018 AGGAACTATATGTTTGGACTGCAAGGTGGGTATAACGAAGTCAATCAACATGGGTTCCCA 1077
Query 1153 AACAGATCTGATCAAG---CTAGGGGAACTGCTTCGTGCAGGAATTCACAAATGAGAGGG 1209
|||| | ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||
Sbjct 1078 AACAAACCTGATCAAGCCCCTAAGGGAACTGCTTCTTGGAGGAATTCACAGCTGAGAGGG 1137
Query 1210 TCACAAGGATCTGCATATAATAGTGGAAGTGGAGTAGCTAATCCTTACCAGCATCATGAT 1269
|||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1138 TCACAAGGATCTGCCTACAATGGTGGAAGTGGACTAGCTAATCCTTACCAGCATCTTGAT 1197
Query 1270 AGCCCAAACTATTACGCATTAAATCCAGCTGTAGCTTCTATGATGGCTAACCAACTTGGA 1329
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 1198 AGCCCAAACTATTATGCATTAAATCCAGCTGTAGCTTCTATGATGGCCAGTCAACTTGGA 1257
Query 1330 ACTAATAACTATTCTCCAATGTATGAAAATGCTTCTGC--CA-CT--T-TGGGATATTCT 1383
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||
Sbjct 1258 ACTAATAACTATCCTCCAATGTATGAAAATGCTTCTGCGGCATCTGCTATGGGATTTTCT 1317
Query 1384 GCAATGGACTCCAGACTTCATGGTGGAAGTTTTGTTTCTTCTGGTCAAAACCTCTCTGAA 1443
| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1318 GGAATGGACTCAAGACTTCATGGTGGAGGTTTTGTTTCTTCTGGTCAAAACCTCTCTGAA 1377
Query 1444 TCACGAAATATTGGCAGGGTCGGTAATCGAATGATGGAAGGAGGTACGGGTCACCCGTCA 1503
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||
Sbjct 1378 TCACGAAATATTGGTAGGGTCGGTAATCGAATGATGGGAGGAGGTACTGGTCTCCAGTCA 1437
Query 1504 CATCTTGCAGACCCGATGTATCATCAGTATGCAAGGTTCTCTGAAAATGCTGATTCGTTT 1563
||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1438 CATATGGCAGACCCAATGTATCATCAGTATGCGAGGTTCTCTGAAAATGCTGATTCGTTT 1497
Query 1564 GATCTTCTTAATGACCCTTCAATGGACAGGAAC--TAT-GGTAATTCATACATGAATATG 1620
||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1498 GATCTTCTTAATGACCCTTCAATGGACAGGAGCTATATGGGTAATTCATACATGAATATG 1557
Query 1621 CTTGAAATTCAGAGGGCTTATCTCGGATCTCAGAAATCACAGTATGGTCTTCCTTACAAA 1680
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1558 CTTGAACTTCAGAGGGCTTATCTCGGAGCTCAGAAATCACAGTATGGTCTTCCTTACAAA 1617
Query 1681 TCAGGGAGCCCTAACAGCCATAGCTATTATGGCAGTCCAACATTTGGGTCTAATATGTCA 1740
|||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1618 TCAGGGAGTCCTAACAGCCATAGCTATTATGGTAGTCCAACATTTGGGTCTAATATGTCA 1677
Query 1741 TATCCTGGCAGCCCATTGGCTCATCATGGTATGCCAAACTCTCTTATGTCACCTTACAGC 1800
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 1678 TATCCTGGCAGCCCATTGGCTCATCCTGGTATGCCAAATTCTCTTATGTCACCTTATAGC 1737
Query 1801 CCTATGAGACGAGGTGAAGTAAATATGCGATATCCCG-CTGCAACAAGAAACTATACTGG 1859
|||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||
Sbjct 1738 CCTATGAGACGAGGTGAAGTTAATATGCGATAT-CCGTCTGCAACAAGAAACTATTCCGG 1796
Query 1860 AGGGGTAATGGGTTCTTGGCACATGGATGCTAGTTTGGATGAAGGATTTGGATCTTCAAT 1919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1797 AGGGGTAATGGGTTCTTGGCACATGGATGCTAGTTTGGATGAAGGCTTTGGATCTTCAAT 1856
Query 1920 GCTTGAAGAGTTCAAAAGTAACAAAACAAGAGGGTTCGAACTTTCTGAAATAGCTGGCCA 1979
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1857 GCTTGAAGAGTTCAAAAGTAACAAAACAAGAGGATTCGAACTTTCTGAAATAGCTGGCCA 1916
Query 1980 TGTTGTAGAGTTCAGTTCGGATCAGTATGGAAGCCGGTTTATTCAGCAGAAACTCGAGAC 2039
|||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1917 TGTTGTAGAGTTCAGTTCGGATCAATACGGGAGCCGGTTTATTCAGCAGAAACTCGAGAC 1976
Query 2040 AGCAACAACTGATGAGAAAAACATGGTTTATGAGGAGATCATGCCAAAAGCTCTTGCCCT 2099
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||
Sbjct 1977 AGCAACAACTGATGAGAAAAACATGGTTTATGAGGAGATCATGCCACAAGCTCTAGCCCT 2036
Query 2100 GATGACTGACGTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGAGCATGGACTCCCACC 2159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2037 GATGACTGACGTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGAGCATGGACTCCCACC 2096
Query 2160 ACAGAGAAGAGAATTGGGAGAGAAACTCATTGACAATGTTTTGCCTCTTAGCTTACAGAT 2219
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2097 ACAGAGGAGAGAATTGGGCGAGAAACTCATTGACAATGTTTTGCCTCTTAGCTTACAGAT 2156
Query 2220 GTATGGTTGTCGTGTCATCCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGATCTAGACCAGAAAATCCA 2279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2157 GTATGGTTGTCGTGTCATCCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGATCTAGACCAGAAAATTAA 2216
Query 2280 AATGGTCAAAGAACTTGATGGACATGTGATGCGATGTGTACGTGATCAGAATGGGAACCA 2339
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2217 AATGGTGAAAGAACTTGATGGACATGTGATGCGATGTGTACGTGATCAGAATGGGAACCA 2276
Query 2340 TGTGGTTCAAAAGTGTATTGAATGTGTGCCTGAAGAAAACATTGAGTTTATTATTTCAAC 2399
|||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 2277 TGTGGTTCAAAAGTGTATCGAATGTGTGCCTGAGGAAAACATCGAGTTTATTATTTCGAC 2336
Query 2400 TTTCTTTGGCCATGTGGTGACCCTCTCCACTCACCCATACGGGTGCCGTGTTATTCAGAG 2459
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2337 TTTCTTTGGCCATGTGGTGACCCTCTCCACTCACCCATACGGGTGCCGTGTTATTCAGAG 2396
Query 2460 AGTATTGGAACACTGCCATAACCCTGATACACAGAGTAAGGTTATGGAAGAAATCCTG-T 2518
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |
Sbjct 2397 AGTATTGGAACACTGCCATGACCCTGATACACAGAGTAAGGTTATGGATGAAATCTTGAT 2456
Query 2519 CCACTGTTAGTATGCTGACCCAAGATCAGTATGGAAACTATGTTGTTCAGCATGTACTGG 2578
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||
Sbjct 2457 T-ACTGTTAGTATGCTGGCCCAAGATCAGTATGGAAACTATGTTATTCAGCATGTGCTGG 2515
Query 2579 AGCATGGAAAGCCTGATGAGCGCACTGTGATAATCAAAGAGTTAGCGGGGAAGATTGTTC 2638
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 2516 AGCATGGAAAGCCTGATGAGCGCACCGTGATAATCAAAGAGTTAGCTGGAAAGATTGTTC 2575
Query 2639 AGATGAGCCAACAGAAGTTTGCATCAAACGTTGTTGAGAAGTGTTTGACTTTTGGAGGTC 2698
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2576 AGATGAGCCAGCAGAAGTTTGCATCAAACGTTGTTGAGAAATGTTTGACTTTTGGAGGTC 2635
Query 2699 CTGAGGAACGGGAATTGCTGGTGAATGAGATGCTGGGCACAACTGATGAAAACGAGCCTC 2758
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2636 CTGAGGAACGGGAATTTCTGGTGAATGAGATGCTGGGCACAACTGATGAAAACGAGCCTC 2695
Query 2759 TTCAGGCGATGATGAAGGATCAGTTTGCAAACTATGTAGTGCAAAAAGTCCTGGAGACAT 2818
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2696 TTCAGGCGATGATGAAGGATCAGTTTGCAAACTATGTAGTGCAAAAAGTCCTTGAGACAT 2755
Query 2819 GTGATGACCAACAGCGTGAACTGATACTGACTCGTATTAAAGTGCATCTGAATGCTCTAA 2878
| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | |
Sbjct 2756 GCGATGACCAACAGCGTGAACTGATACTTACTCGTATTAAGGTGCATCTTAATGCTTTGA 2815
Query 2879 AGAAATACACTTACGGAAAGCATATCGTTGCCCGTGTTGAAAAACTCGTTGCTGCTGGAG 2938
|||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2816 AGAAGTACACTTATGGAAAGCATATCGTTGCCCGTGTTGAAAAACTCGTTGCTGCTGGAG 2875
Query 2939 AGAGGAGAATGGCTTTGCAGTCATTACCCCAGCCTCTGGTGGCGTAAGGCCGCAAGTGTT 2998
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||
Sbjct 2876 AGAGGAGAATGGCTTTGCAGTCATTAACCCAGCCTCTGGGGGCGTAAGGCCACAAGTCTT 2935
Query 2999 GTACAGCTTAACTAGGGTGGATGGCTCTGCCATAACGTTTTGAGAATTAGGTAAGATCTA 3058
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2936 GTACAGCTTAACTAGGGTGGATGGCTCTGCCATAACGTTTTGAGAATTAGGTAAGATCTA 2995
Query 3059 AACCAAAAATCTGCGGAGAAATAATGAGAGAGAGCTTTGTTTTGTTCTCCGCAAAATCTG 3118
|||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2996 AACCAAAAATCTGCGGAGAAATTATAAAAGAGAGCTTTGTTTTGTTCTCCGCAAAATCTG 3055
Query 3119 TACATTGTGTAGTTTCTTACCGTTTTGACTATACATAGAACCAAAGATCCCCCTTAGGCT 3178
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3056 TACATTGTGTAGTTTCTTACCGTTTTGACTATACATAGAACCAAAGATCCCCCTTAGGCT 3115
Query 3179 GATGAGTGAGTGAGAT-AAAA-GGCAGAGAATGGTGTAAAGAAAAATGGTGAGGATTTTA 3236
||||| ||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3116 GATGA-TGAGTAAG-TGAAAAAGGCAGAGAATGGTGTAAAGAAAAATGGTGAGGATTTTA 3173
Query 3237 GAGTTTTTCCTTTCACATGTACAAAAAGAATGGCTCTTACGCCAATGTGTAGAATGCTTT 3296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3174 GAGTTTTTCCTTTCACATGTACAAAAAGAATGGCTCTTGTGCCAATGTGTAGAATGCTTT 3233
Query 3297 TTAGAACAATCCCAGTTTATTTCACGA 3323
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3234 TTAGAACAATCCCAGTTTATTTCACGA 3260
> Ahg481838 jgi|Araly1|481838|fgenesh2_kg.4__898__AT2G29200.1
Length=3108
Score = 4287 bits (2321), Expect = 0.0
Identities = 2884/3143 (92%), Gaps = 89/3143 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 94 ATGATACCGGAACTAGGG-AGAAGACCGATGCATAGAGGTAACGAAGATTCATCTTTTGG 152
|||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATACCGGAACT-GGGAAGAAGACCGATGCATAGAGGTAACGAAGATTCATCTTTTGG 59
Query 153 GGATGATTACGAGAAAGAGATTGGAGTATTGCTTGGTGAGCAGCAGAGAAGGCAAGTAGA 212
||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 60 GGATGATTATGAGAAAGAGATTGGAGTATTACTTGGTGAGCAGCAGAGAAGGCAAGTAGA 119
Query 213 GGCGGATGAGCTTGAGAGAGAGCTTAACTTGTATAGAAGTGGCTCTGCTCCACCGACTGT 272
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 AGCTGATGAGCTTGAGAGAGAGCTTAACTTGTATAGAAGTGGCTCTGCTCCACCGACTGT 179
Query 273 TGATGGTTCTCTTAGTGCTGCCGGAGGGCTTTTTAGCGGCGGAGGTGGGGCTTCTTTTCT 332
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 180 TGATGGTTCTGTTAGTGCTGCCGGAGGGCTTTTTAGCGGCGGAGGTGGGGCTCCTTTTTT 239
Query 333 GGAATTTGGTGGAGTTAATAAGGGTAATGGGTTTGGTGGTGATGATGAGGAGTTTAGGAA 392
||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 240 GGAGTTTGG-CG-G-CAATAAGGGTAATGGGTTTGGTGGTGGTGATGAGGAGTTTAGGAA 296
Query 393 AGATCCAGCTTACTTGTCTTATTACTATGCTAATATGAAGTTGAATCCGAGGTTGCCACC 452
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 297 AGATCCGGCTTACTTGTCTTATTACTATGCTAATATGAAGTTGAACCCGAGGTTGCCACC 356
Query 453 TCCTTTGATGTCTAGGGAGGATTTGAGGGTTGCTCAGAGGCTTAAAGGGAGTAATAATGT 512
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 357 GCCTTTGATGTCTAGGGAGGATTTGAGGGTTGCTCAGAGGCTTAAAGGGAGTAGTAATGT 416
Query 513 GTTAGGTGGTGTTGGGGATAGGAGAAAAGTGAATGACAGTCGGTCTTTGTTCTCTATGCC 572
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 417 TTTAGGTGGTGTTGGGGATAGGAGAAAAGTTAATGATAGTCGATCTTTGTTCTCTATGCC 476
Query 573 ACCTGGTTTTGAGGCTG-GAAAACCTGGTGCTTCTGCTTCTGAGTGGGATGCTAATGGAT 631
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 477 ACCTGGTTTTGAGGCTGAGAAAA-CTGGTGCTTCTGCTTCTGAGTGGGATGCTAATGGAT 535
Query 632 TGA-----TT----GGTTTGGGACTTGGAGGCAAGCAGAAGAGTTTTGCTGATATCTTTC 682
||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 536 TGATTGGTTTACCGGGTTTGGGACTTGGAGGCAAGCAGAAGAGTTTTGCTGATATCTTTC 595
Query 683 AGGCGGATAT--GG---GG-CATCCTGTTG-TACAGCAGCCCTCACGTCCTGCTAGTCGT 735
|||||||||| || || ||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 596 AGGCGGATATGGGGCATGGACATCCCGTTGCT-CAGCAGCCCTCACGTCCTGCAAGTCGT 654
Query 736 AATACCTTTGATGAGAATGTTGACTCTAATAATAACCTGTCTCCATCTGCATCACAAGGC 795
|||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 655 AATACCTTTGATGAAAATGTTGACTCTAAAAATAATCTGTCTCCATCTGCATCACAAGGC 714
Query 796 ATTGGAGCGCCATCTCCATACTGCTATGCAGCTGTTCTGGGTTCATCTTTGTCTAGAAAT 855
||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 715 ATTGGTGCACCATCTCCATACAGCTATGCAGCTGTTCTGGGCTCTTCTTTGTCTAGAAAT 774
Query 856 GGAACTCCAGATCCACAGGGCATTGCTAGGGTGCCTAGTCCTTGCCTTACTCCCATTGGC 915
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 775 GGAACTCCAGATCCACAGGCCATTGCTAGGGTGCCTAGTCCCTGTCTTACTCCCATTGGG 834
Query 916 AGTGGAAGAGTGAGTTCAAATGATAAGAGGAACACAAGTAATCAAAGCCCGTTCAACGGT 975
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 835 AGTGGGAGAGTGAGTTCAAATGATAAGAGGAACACAAGTAACCAAAGCCCGTTCAACGGT 894
Query 976 GTTACATCTGGTCTCAACGAGTCTTCTGATCTTGTCAATGCTTTATCCGGCTTGAACCTG 1035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 895 GTTACATCTGGTCTCAACGAGTCTTCTGATCTTGTCAATGCTTTATCTGGCATGAACCTG 954
Query 1036 TCAGGCACTGGCGGGCTAGATGAACGTGGTCAGGCTGAGCAAGATGTCGAAAAGGTCAGG 1095
|| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 TCTGGCAGTGGCGGGTTAGATGAACGTGGTCAGGCTGAGCAAGATGTCGAAAAGGTCAGG 1014
Query 1096 AACTATATGTTTGGACTGCAAGATGGGCATAATGAAGTCAATCCACATGGGTTCCCAAAC 1155
|||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 1015 AACTATATGTTTGGACTGCAAGGTGGGTATAACGAAGTCAATCAACATAGGTTCCCAAAC 1074
Query 1156 AGATCTGATCAAG--C-TAGGGGAACT-GCTTCG-TGCAGGAATTCACAAATGAGAGGGT 1210
| ||||||||||| | || || |||| || ||| || ||| |||||||| ||||||||
Sbjct 1075 AAATCTGATCAAGCCCATAAGGCAACTGGC-TCGTTG-AGGGATTCACAATTGAGAGGGC 1132
Query 1211 CACAAGGATCTGCATATAATAGTGGAAG-TGGAGTAGCTAATCCTTACCAGCATCATGAT 1269
||||||||||||| |||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1133 CACAAGGATCTGCCTATAATGGTGG-AGTTGGATTAGCTAATCCTTACCAGCATCTTGAT 1191
Query 1270 AGCCC-AA--A----CT-----ATTACGCATTAAATCCAGCTGTAGCTTCTATGATGGCT 1317
||||| || | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1192 AGCCCAAATTATTGTCTCAACAATTATGCATTAAATCCAGCTGTAGCTTCTATGATGGCT 1251
Query 1318 AACCAACTT-GGAACTAATAACTATTCTCCAATGTATGAAAATGCT-TCTGC--CA---- 1369
||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || |||| | || || ||
Sbjct 1252 AACCAACTTGGGAAC-AATAATTTTTCTCCAATGTACGATAATG-TATCCGCAGCATCCG 1309
Query 1370 CTTTGGGATATTCTGCAATGGACTCCAGACTTCATGGTGGAAGTTTTGTTTCTTCTGGTC 1429
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||
Sbjct 1310 CTTTGGGATTTTCTGGAATGGACTCCAGACTTCATGGAGGAGGCTTTGTATCTTCTGGTC 1369
Query 1430 AAAACCTCTCTGAATCACGAAATATTGGCAGGGTCGGTAATCGAATGATGGAAGGAGGTA 1489
||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1370 AAAACCTCTCTGAATCACGTAATCTTGGCAGGTTCAGTAATCGAATGATGGGAGGAGGTA 1429
Query 1490 CGGGTCACCCGTCACATCTTGCAGACCCGATGTATCATCAGTATGCAAGGTTCTCTGAAA 1549
| |||| || ||||||| | || ||||| ||| | ||| || | | | |
Sbjct 1430 CTGGTCTCCAGTCACATATGGCGGACCCAATG--T-ATC---AT-C-A-G-----T---- 1471
Query 1550 ATGCTGATTCGTTTGATCTTCTTAATGACCCTTCAATGGACAGGAAC--TAT-GGTAATT 1606
||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||| ||| |||||||
Sbjct 1472 ATGCTGATTCGCTTGATCTTCTCAATGATCCTTCGATGGACATGAACTTTATGGGTAATT 1531
Query 1607 CATACATGAATATGCTTGAAATTCAGAGGGCTTATCTCGGATCTCAGAAATCACAGTATG 1666
||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1532 CATACATGAGTATGCTTGAACTCCAGAGGGCTTTTCTCGGAGCTCAGAAATCACAGTATG 1591
Query 1667 GTCTTCCTTACAAATCAGGGAGCCCTAACAGCCATAGCTATTATGGCAGTCCAACATTTG 1726
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct 1592 GTCTTCCTTACAAATCCGGGAGCCCTAACAGCCATAGCGATTATGGGAGTCCAACATTTG 1651
Query 1727 GGTCTAATATGTCATATCCTGGCAGCCCATTGGCTCATCATGGTATGCCAAACTCTCTTA 1786
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||
Sbjct 1652 GGTCTAACATATCATATCCTGGCAGCCCATTGGCTCATCATCTTCTGCCAAATTCTCTTG 1711
Query 1787 TGTCACCTTACAGCCCTATGAGACGAGGTGAAGTAAATATGCGATATCCCGCTGCAACAA 1846
||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 1712 TGTCACCCTGTAGCCCTATGAGACGAGGTGAAGTTAGTATGCGATATCCCTCTGCAGCAA 1771
Query 1847 GAAACTATACTGGAGGGGTAATGGGTTCTTGGCACATGGATGCTAGTTTGGATGAAGGAT 1906
|||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1772 GAAATTATTCGGGAGGAGTAATGGGGTCTTGGCACATGGATGCTAGTTTGGATGAAGGCT 1831
Query 1907 TTGGATCTTCAATGCTTGAAGAGTTCAAAAGTAACAAAACAAGAGGGTTCGAACTTTCTG 1966
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||
Sbjct 1832 TTGGATCTTCAATGCTTGAAGAGTTCAAAAGTAACAAAACAAGAGGATTTGAACTCTCTG 1891
Query 1967 AAATAGCTGGCCATGTTGTAGAGTTCAGTTCGGATCAGTATGGAAGCCGGTTTATTCAGC 2026
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1892 AAATAGCTGGCCATGTTGTAGAGTTCAGTTCGGATCAATATGGAAGCCGGTTTATTCAGC 1951
Query 2027 AGAAACTCGAGACAGCAACAACTGATGAGAAAAACATGGTTTATGAGGAGATCATGCCAA 2086
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1952 AGAAACTCGAGACAGCAACAACTGATGAGAAAAACATGGTTTATGAGGAGATCATGCCAC 2011
Query 2087 AAGCTCTTGCCCTGATGACTGACGTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGAGC 2146
| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2012 ATGCTCATGCCCTGATGACTGACGTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGAGC 2071
Query 2147 ATGGACTCCCACCACAGAGAAGAGAATTGGGAGAGAAACTCATTGACAATGTTTTGCCTC 2206
|||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2072 ATGGACTCCCGCCACAGAGAAGAGAATTGGCAGAGAAACTCTTTGACAATGTTTTGCCTC 2131
Query 2207 TTAGCTTACAGATGTATGGTTGTCGTGTCATCCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGATCTAG 2266
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2132 TTAGCTTACAGATGTATGGTTGTCGTGTCATCCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGATCTAG 2191
Query 2267 ACCAGAAAATCCAAATGGTCAAAGAACTTGATGGACATGTGATGCGATGTGTACGTGATC 2326
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2192 ACCAGAAAATTAAAATGGTGAAAGAACTTGATGGACATGTGATGCGATGTGTACGTGATC 2251
Query 2327 AGAATGGGAACCATGTGGTTCAAAAGTGTATTGAATGTGTGCCTGAAGAAAACATTGAGT 2386
|||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2252 AGAATGGGAATCATGTGGTTCAAAAGTGTATCGAATGTGTGCCTGAAGAAAACATCGAGT 2311
Query 2387 TTATTATTTCAACTTTCTTTGGCCATGTGGTGACCCTCTCCACTCACCCATACGGGTGCC 2446
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2312 TTATTATTTCAACTTTCTTTGGTCATGTGGTGACCCTCTCCACTCACCCATACGGGTGCC 2371
Query 2447 GTGTTATTCAGAGAGTATTGGAACACTGCCATAACCCTGATACACAGAGTAAGGTTATGG 2506
|||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2372 GTGTAATTCAGAGAGTATTGGAACACTGCCATGACCCTGATACTCAGAGTAAGGTTATGG 2431
Query 2507 AAGAAATCCTGTCCACTGTTAGTATGCTGACCCAAGATCAGTATGGAAACTATGTTGTTC 2566
|||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2432 AAGAAATCCTTTCCACTGTTAGTATGCTGGCCCAAGATCAGTACGGAAACTATGTTGTTC 2491
Query 2567 AGCATGTACTGGAGCATGGAAAGCCTGATGAGCGCACTGTGATAATCAAAGAGTTAGCGG 2626
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2492 AGCATGTGCTGGAGCATGGAAAGCCTGATGAGCGCACTGTGATAATCAAAGAGTTGGCGG 2551
Query 2627 GGAAGATTGTTCAGATGAGCCAACAGAAGTTTGCATCAAACGTTGTTGAGAAGTGTTTGA 2686
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2552 GGAAGATTGTTCAGATGAGCCAGCAGAAGTTTGCATCAAACGTTGTTGAGAAATGTTTGA 2611
Query 2687 CTTTTGGAGGTCCTGAGGAACGGGAATTGCTGGTGAATGAGATGCTGGGCACAACTGATG 2746
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2612 CTTTTGGAGGTCCTGAGGAACGGGAATTTCTGGTGAATGAGATGCTGGGCACAACTGATG 2671
Query 2747 AAAACGAGCCTCTTCAGGCGATGATGAAGGATCAGTTTGCAAACTATGTAGTGCAAAAAG 2806
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2672 AAAACGAGCCTCTTCAGGCGATGATGAAGGATCAGTTTGCAAACTATGTAGTGCAGAAAG 2731
Query 2807 TCCTGGAGACATGTGATGACCAACAGCGTGAACTGATACTGACTCGTATTAAAGTGCATC 2866
| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||
Sbjct 2732 TTTTGGAGACATGTGATGACCAACAACGTGAGCTGATACTTACTCGCATCAAAGTGCATC 2791
Query 2867 TGAATGCTCTAAAGAAATACACTTACGGAAAGCATATCGTTGCCCGTGTTGAAAAACTCG 2926
| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||
Sbjct 2792 TTAATGCTTTAAAGAAATACACTTATGGAAAGCATGTCGTTGCGCGTATTGAAAAACTCG 2851
Query 2927 TTGCTGCTGGAGAGAGGAGAATGGCTTTGCAGTCATTACCCCAGCCTCTGGTGGCGTAAG 2986
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||
Sbjct 2852 TTGCTGCTGGAGAGAGGAGAATGGCTTTGCAGTCCCTAACCCAGCCTCAGATGGCGTAAG 2911
Query 2987 GCCGCAAGTGTTGTACAGCTTAACTAGGGTGGATGGCTCTGCCATAACGTTTTGAGAATT 3046
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2912 GCCGCAAGTGTTGTACAGCTTAACTAGGGTGGATGGCTCTGCCATAGCGTTTTGAGAATT 2971
Query 3047 AGGTAAGATCTAAACC--AAA-AATCTGCGGAGAAATAATGAGA-G-AGAGCTTTGTTTT 3101
|||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | || || | |||||||||||||
Sbjct 2972 AGGTAAGATCTAAACCGGAAATAATCTGCGG-GAAA-ATTGTGAAGGAGAGCTTTGTTTT 3029
Query 3102 GTTCTCCGCAAAATCTGTACA-TTGTGTAGTTTCTTACCGTTTTGACTATACATAGAACC 3160
| || |||| ||||||| | |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 3030 CT-CT--GCAAGATCTGTAAAATTGTGTAGTTGCTTACGGTTTTT-CTATACATAGAACC 3085
Query 3161 AAAGATCCCCCTT-AGGCTGATG 3182
||| ||||| ||| |||||||||
Sbjct 3086 AAACATCCCACTTTAGGCTGATG 3108
> Ahg952160 jgi|Araly1|952160|scaffold_4100004.1
Length=1596
Score = 2567 bits (1390), Expect = 0.0
Identities = 1529/1597 (96%), Gaps = 5/1597 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1454 TTGGCAGGGTCGGTAATCGAATGATGGAAGGAGGTACGGGTCACCCGTCACATCTTGCAG 1513
|||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||
Sbjct 1 TTGGTAGGGTCGGTAATCGAATGATGGGAGGAGGTACTGGTCTCCAGTCACATCTTGCAG 60
Query 1514 ACCCGATGTATCATCAGTATGCAAGGTTCTCTGAAAATGCTGATTCGTTTGATCTTCTTA 1573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 ACCCGATGTATCATCAGTATGCAAGGTTCTCTGAAAATGCTGATTCGTTTGATCTTCTTA 120
Query 1574 ATGACCCTTCAATGGACAGGAAC--TAT-GGTAATTCATACATGAATATGCTTGAAATTC 1630
||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 121 ATGACCCTTCAATGGACAGGAGCTATATGGGTAATTCATACATGAATATGCTTGAACTTC 180
Query 1631 AGAGGGCTTATCTCGGATCTCAGAAATCACAGTATGGTCTTCCTTACAAATCAGGGAGCC 1690
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 181 AGAGGGCTTATCTCGGAGCTCAGAAATCACAGTATGGTCTTCCTTACAAATCAGGGAGTC 240
Query 1691 CTAACAGCCATAGCTATTATGGCAGTCCAACATTTGGGTCTAATATGTCATATCCTGGCA 1750
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CTAACAGCCATAGCTATTATGGTAGTCCAACATTTGGGTCTAATATGTCATATCCTGGCA 300
Query 1751 GCCCATTGGCTCATCATGGTATGCCAAACTCTCTTATGTCACCTTACAGCCCTATGAGAC 1810
||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 301 GCCCATTGGCTCATCCTGGTATGCCAAATTCTCTTATGTCACCTTATAGCCCTATGAGAC 360
Query 1811 GAGGTGAAGTAAATATGCGATATCCCG-CTGCAACAAGAAACTATACTGGAGGGGTAATG 1869
|||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 361 GAGGTGAAGTTAATATGCGATAT-CCGTCTGCAACAAGAAACTATTCCGGAGGGGTAATG 419
Query 1870 GGTTCTTGGCACATGGATGCTAGTTTGGATGAAGGATTTGGATCTTCAATGCTTGAAGAG 1929
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 GGTTCTTGGCACATGGATGCTAGTTTGGATGAAGGCTTTGGATCTTCAATGCTTGAAGAG 479
Query 1930 TTCAAAAGTAACAAAACAAGAGGGTTCGAACTTTCTGAAATAGCTGGCCATGTTGTAGAG 1989
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 TTCAAAAGTAACAAAACAAGAGGATTCGAACTTTCTGAAATAGCTGGCCATGTTGTAGAG 539
Query 1990 TTCAGTTCGGATCAGTATGGAAGCCGGTTTATTCAGCAGAAACTCGAGACAGCAACAACT 2049
|||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 TTCAGTTCGGATCAATACGGGAGCCGGTTTATTCAGCAGAAACTCGAGACAGCAACAACT 599
Query 2050 GATGAGAAAAACATGGTTTATGAGGAGATCATGCCAAAAGCTCTTGCCCTGATGACTGAC 2109
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 600 GATGAGAAAAACATGGTTTATGAGGAGATCATGCCACAAGCTCTAGCCCTGATGACTGAC 659
Query 2110 GTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGAGCATGGACTCCCACCACAGAGAAGA 2169
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 660 GTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGAGCATGGACTCCCACCACAGAGGAGA 719
Query 2170 GAATTGGGAGAGAAACTCATTGACAATGTTTTGCCTCTTAGCTTACAGATGTATGGTTGT 2229
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 GAATTGGGCGAGAAACTCATTGACAATGTTTTGCCTCTTAGCTTACAGATGTATGGTTGT 779
Query 2230 CGTGTCATCCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGATCTAGACCAGAAAATCCAAATGGTCAAA 2289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 780 CGTGTCATCCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGATCTAGACCAGAAAATTAAAATGGTGAAA 839
Query 2290 GAACTTGATGGACATGTGATGCGATGTGTACGTGATCAGAATGGGAACCATGTGGTTCAA 2349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 GAACTTGATGGACATGTGATGCGATGTGTACGTGATCAGAATGGGAACCATGTGGTTCAA 899
Query 2350 AAGTGTATTGAATGTGTGCCTGAAGAAAACATTGAGTTTATTATTTCAACTTTCTTTGGC 2409
|||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 900 AAGTGTATCGAATGTGTGCCTGAAGAAAACATCGAGTTTATTATTTCGACTTTCTTTGGC 959
Query 2410 CATGTGGTGACCCTCTCCACTCACCCATACGGGTGCCGTGTTATTCAGAGAGTATTGGAA 2469
||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 CATGTTGTGACCCTCTCCACTCACCCATACGGTTGCCGTGTTATTCAGAGAGTATTGGAA 1019
Query 2470 CACTGCCATAACCCTGATACACAGAGTAAGGTTATGGAAGAAATCCTGTCCACTGTTAGT 2529
||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1020 CACTGCCATGACCCTGATACGCAGAGTAAGGTTATGGAAGAAATCCTGTCTACTGTTAGT 1079
Query 2530 ATGCTGACCCAAGATCAGTATGGAAACTATGTTGTTCAGCATGTACTGGAGCATGGAAAG 2589
||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 ATGTTGGCCCAAGATCAGTACGGAAACTATGTTGTTCAGCATGTACTGGAGCATGGAAAG 1139
Query 2590 CCTGATGAGCGCACTGTGATAATCAAAGAGTTAGCGGGGAAGATTGTTCAGATGAGCCAA 2649
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 CCTGATGAGCGCACCGTGATAATCAAAGAGTTAGCTGGAAAGATTGTTCAGATGAGCCAG 1199
Query 2650 CAGAAGTTTGCATCAAACGTTGTTGAGAAGTGTTTGACTTTTGGAGGTCCTGAGGAACGG 2709
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 1200 CAGAAGTTTGCATCAAACGTTGTTGAGAAATGTTTGACTTTTGGAGGGCCAGAGGAACGG 1259
Query 2710 GAATTGCTGGTGAATGAGATGCTGGGCACAACTGATGAAAACGAGCCTCTTCAGGCGATG 2769
|||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1260 GAATTGCTCGTGAATGAGATGCTTGGCACAACTGATGAAAATGAGCCTCTTCAGGCGATG 1319
Query 2770 ATGAAGGATCAGTTTGCAAACTATGTAGTGCAAAAAGTCCTGGAGACATGTGATGACCAA 2829
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 1320 ATGAAGGATCAGTTTGCAAACTATGTAGTGCAAAAAGTCCTTGAGACATGCGATGACCAA 1379
Query 2830 CAGCGTGAACTGATACTGACTCGTATTAAAGTGCATCTGAATGCTCTAAAGAAATACACT 2889
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||||
Sbjct 1380 CAGCGTGAACTGATACTTACTCGTATTAAGGTGCATCTTAATGCTTTGAAGAAGTACACT 1439
Query 2890 TACGGAAAGCATATCGTTGCCCGTGTTGAAAAACTCGTTGCTGCTGGAGAGAGGAGAATG 2949
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 TATGGAAAGCATATCGTTGCCCGTGTTGAAAAACTTGTTGCTGCTGGAGAGAGGAGAATG 1499
Query 2950 GCTTTGCAGTCATTACCCCAGCCTCTGGTGGCGTAAGGCCGCAAGTGTTGTACAGCTTAA 3009
||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 1500 GCTTTGCAGTCATTAACCCAGCCTCTGGTGGCTTAAGGCCACAAGTCTTGTACAGCTTAA 1559
Query 3010 CTAGGGTGGATGGCTCTGCCATAACGTTTTGAGAATT 3046
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1560 CTAGGGTGGATGGCTCTGCCATAACGTTTTGAGAATT 1596
> Ahg928725 jgi|Araly1|928725|scaffold_301182.1
Length=3063
Score = 287 bits (155), Expect = 4e-76
Identities = 752/1030 (73%), Gaps = 82/1030 (8%)
Strand=Plus/Plus
Query 1960 CTTTCTGAAATAGCTGGCCATGTTG-TAGAGTTCAG-TTCGGATCAGTATGGAAGCCGGT 2017
||||| ||||||| ||| |||| || | |||||||| | ||||||||| ||||| | ||
Sbjct 2012 CTTTCAGAAATAGTTGGTCATG-TGATTGAGTTCAGCAT-GGATCAGTACGGAAGTC-GT 2068
Query 2018 TT-ATTCAGCAGAAACTCGAGACAGCAACAACTGATGA-GAAAA-ACATGGTTTA-T-GA 2072
|| |||||||||||||| ||||| | |||| ||||| ||||| | ||| | || |
Sbjct 2069 TTCATTCAGCAGAAACTTGAGACTG---CAACGGATGAGGAAAAGA-ATGCTATATTCCC 2124
Query 2073 GGAGATCA-TGCC-AAAAGCTCTTGC-C-CTGATGACTGACGTTTTTGGAAACTATGTGA 2128
||||| | | || | || | || | | ||||| || || |||||||| ||||| |
Sbjct 2125 TGAGAT-ACTTCCTTACGGC-C--GCACTTTAATGACAGATGTCTTTGGAAATTATGTTA 2180
Query 2129 TTCAGAAGTTCTTTGAGCATGGACT-CCCACCA-CAGAGAAGAGAATTGGGAGAGA-AAC 2185
|||| ||||| ||||||||||| | | || | ||||||| |||| | | || | ||
Sbjct 2181 TTCAAAAGTTTTTTGAGCATGG--TACAAACAAGCAGAGAAAAGAACTCGCTGA-ACAAG 2237
Query 2186 TCATTGACAATGTTTTGCCTCTTAGCT-TACAGATGTATGGTTGTC-GTGTCATCCAGAA 2243
| | | | |||||||| ||||| || |||| |||||||| || | | || ||||| ||
Sbjct 2238 TAACAGGCCATGTTTTGGCTCTT-TCTCTACAAATGTATGGCTG-CAGGGTTATCCAAAA 2295
Query 2244 GGCAATT-GAGGTGGTTG-ATCTAGACCAGAAAATC-CAAATGGT-CAAAGAACTTGAT- 2298
||| || |||||||||| || | || ||| || | | |||||| | |||| ||||||
Sbjct 2296 GGC-GTTAGAGGTGGTTGAAT-TGGAGCAG-CAAGCTCGAATGGTGC-AAGAGCTTGATG 2351
Query 2299 GGACATGTGATGCGATGTGTACGTGATCAGAATGGGAACCATGTGGTTCAAAAGTGTATT 2358
|| | ||| ||| ||| || | ||| ||||| || || |||||| | || ||||||||
Sbjct 2352 GGTC-TGTCATGAAATGCGTTCATGACCAGAACGGTAATCATGTGATCCAGAAGTGTATA 2410
Query 2359 GAATGTGTGCCTGAAGAAAACATTGAGTTTATTATTTCAACTTTCTTTGGCCATGTGGTG 2418
|| || | ||| | || || |||| || ||||| | |||| || | || |
Sbjct 2411 GAGCGTCTTCCTCAGGATTGGATACAGTTCATCATTTCTTCATTCTACGGAAAAGT-TTT 2469
Query 2419 A-CCCTCTCCACTCACCCATACGGGTGCCGTGTTATTCAGAGAGTATTGGA--ACACTGC 2475
| | || || || ||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| | | ||
Sbjct 2470 AGCTCTTTCAACACACCCTTATGGATGCCGTGTAATCCAGAGGGTACTGGAGCATATTG- 2528
Query 2476 CATAACCCT-GATACACAGA-GTAAGGTTATGGAAGAAATCCT-G-TCCACTGT-TAGTA 2530
|| | | | || || || | | | ||||||| |||||| | | | || || | |||
Sbjct 2529 -ATGA-CATAGAAACCCA-ACGGATCATTATGGAGGAAATCATGGATTCA--GTCT-GTA 2582
Query 2531 -TGCTGA-CCCAAGATCAGTATGGAAACTATGTTGTTCAGCATGTAC-TGGAGCATGG-A 2586
| || | | ||||||||||| || || |||||| |||||||| | | | | || || |
Sbjct 2583 CT-CT-AGCACAAGATCAGTACGGTAATTATGTTATTCAGCATAT-CATACAACACGGTA 2639
Query 2587 AAGCCTGATGAGCGCACTGTGATAATCAA-AGAG-TTAGCGGGGA-AGATTGTTCAGATG 2643
|| ||| |||| || | | || ||||| | || || || ||| ||||||| |||||
Sbjct 2640 AA-CCTCATGAACGGTCAGAAATTATCAATA-AGCTT-GC-TGGACAGATTGTGAAGATG 2695
Query 2644 AGCCAACAGAAGTTTGCATCAAACGTTGTTGAGAAGTGTTTGACTTTTGGAGGTCCTGAG 2703
|| || || |||||||| || || |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||
Sbjct 2696 AGTCAGCAAAAGTTTGCTTCTAATGTTGTTGAAAAGTGCTTAACATTTGGCGGTCCAGAG 2755
Query 2704 GAACGGGAATTGCTGGTGAATGAGATGC-TGGGCACAACTGATGAAAACGAGCCTCTTCA 2762
||||| | | || ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2756 GAACGCCAGGTACTAGTGAATGAGATGCTTGGTTA-TACTGATGAGAACGAGCCTCTTCA 2814
Query 2763 GGCGATGATGAAGGATC-AGTTTGCAAACTATGTAGTGCAAAAAGTCCTGGAGACATGTG 2821
||||||||||||||| | | |||| ||||| |||||||| || || || || ||||| |
Sbjct 2815 GGCGATGATGAAGGACCCA-TTTGGGAACTACGTAGTGCAGAAGGTTCTTGAAACATGCG 2873
Query 2822 ATGACCAACAG-CGTGAACTGATACTGACTCGTATTAAAGTGCATCTGAATGCTCTA-AA 2879
|||| ||| || | || ||| || || |||| || ||||| ||| ||||||| || ||
Sbjct 2874 ATGATCAA-AGTCTTGCACTCATTCTTTCTCGCATCAAAGTACATTTGAATGC-CTTGAA 2931
Query 2880 GAAATACACTTACGG-AAAGCATATCGTTGCCCGTGTTGAAAAACTCGTTGCTGCTGGAG 2938
|| |||||| || || ||| |||||||||||||| ||||| ||||| | || | ||||
Sbjct 2932 GAGATACACATATGGGAAA-CATATCGTTGCCCGGGTTGAGAAACTTATCACTACCGGAG 2990
Query 2939 AGAGGAGAAT 2948
|||| |||||
Sbjct 2991 AGAGAAGAAT 3000
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 125475818181
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5