BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G29200.1
Length=3622
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg481838 jgi|Araly1|481838|fgenesh2_kg.4__898__AT2G29200.1 4913 0.0
Ahg481833 jgi|Araly1|481833|fgenesh2_kg.4__893__AT2G29140.1 4348 0.0
Ahg952160 jgi|Araly1|952160|scaffold_4100004.1 2218 0.0
Ahg928725 jgi|Araly1|928725|scaffold_301182.1 265 2e-69
> Ahg481838 jgi|Araly1|481838|fgenesh2_kg.4__898__AT2G29200.1
Length=3108
Score = 4913 bits (2660), Expect = 0.0
Identities = 2976/3125 (95%), Gaps = 36/3125 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 164 ATGATACCGGAACTAGGG-AGAAGACCGATGCATAGAGGTAACGAAGATTCATCTTTTGG 222
|||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATACCGGAACT-GGGAAGAAGACCGATGCATAGAGGTAACGAAGATTCATCTTTTGG 59
Query 223 GGATGATTATGAGAAAGAGATTGGAGTATTGCTTGGTGAGCAGCAGAGAAGGCAAGTAGA 282
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 60 GGATGATTATGAGAAAGAGATTGGAGTATTACTTGGTGAGCAGCAGAGAAGGCAAGTAGA 119
Query 283 AGCTGATGAGCTTGAGAGAGAGCTTAACTTGTTTAGAAGTGGCTCTGCTCCACCGACTGT 342
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 AGCTGATGAGCTTGAGAGAGAGCTTAACTTGTATAGAAGTGGCTCTGCTCCACCGACTGT 179
Query 343 TGATGGTTCTGTTAGTGCTGCCGGAGGGCTTTTTAGCGGCGGAGGTGGGGCTCCTTTTTT 402
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 TGATGGTTCTGTTAGTGCTGCCGGAGGGCTTTTTAGCGGCGGAGGTGGGGCTCCTTTTTT 239
Query 403 GGAGTTTGGTGGTGTTAATAAGGGTAATGGGTTTGGTGGTGATGATGAGGAGTTTAGGAA 462
||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 240 GGAGTTTGG-CG-G-CAATAAGGGTAATGGGTTTGGTGGTGGTGATGAGGAGTTTAGGAA 296
Query 463 AGATCCGGCTTACTTGTCTTATTACTATGCTAATATGAAGTTGAATCCGAGGTTGCCACC 522
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 297 AGATCCGGCTTACTTGTCTTATTACTATGCTAATATGAAGTTGAACCCGAGGTTGCCACC 356
Query 523 GCCTTTGATGTCTAGGGAGGATTTGAGGGTTGCTCAGAGGCTTAAAGGGAGTAATAATGT 582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 357 GCCTTTGATGTCTAGGGAGGATTTGAGGGTTGCTCAGAGGCTTAAAGGGAGTAGTAATGT 416
Query 583 GTTAGGTGGTGTTGGGGATAGGAGAAAAGTTAATGATAATCGATCTTTGTTCTCTATGCC 642
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 417 TTTAGGTGGTGTTGGGGATAGGAGAAAAGTTAATGATAGTCGATCTTTGTTCTCTATGCC 476
Query 643 ACCGGGTTTTGAAGG-TGAGAAAACTGGTGCTTCTGCTTCTGAATGGGATGCTAATGGAT 701
||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 477 ACCTGGTTTTG-AGGCTGAGAAAACTGGTGCTTCTGCTTCTGAGTGGGATGCTAATGGAT 535
Query 702 TGATTGGTTTACCGGGTTTGGGACTTGGAGGCAAGCAGAAGAGTTTTGCTGATATCTTTC 761
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 536 TGATTGGTTTACCGGGTTTGGGACTTGGAGGCAAGCAGAAGAGTTTTGCTGATATCTTTC 595
Query 762 AGGCTGATATGGGGCATGGACATCCTGTCGCACAACAGCCCTCACGTCCTGCAAGTCGTA 821
|||| |||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 596 AGGCGGATATGGGGCATGGACATCCCGTTGCTCAGCAGCCCTCACGTCCTGCAAGTCGTA 655
Query 822 ATACCTTTGATGAAAATGTTGACTCTAATAATAATCTGTCTCCGTCTGCATCACAAGGCA 881
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 656 ATACCTTTGATGAAAATGTTGACTCTAAAAATAATCTGTCTCCATCTGCATCACAAGGCA 715
Query 882 TTGGTGCACCATCTCCATACAGCTATGCAGCTGTTCTAGGCTCTTCTTTGTCTAGAAATG 941
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 716 TTGGTGCACCATCTCCATACAGCTATGCAGCTGTTCTGGGCTCTTCTTTGTCTAGAAATG 775
Query 942 GAACTCCAGATCCACAGGCCATTGCTAGGGTGCCTAGTCCCTGTCTTACTCCCATTGGGA 1001
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 776 GAACTCCAGATCCACAGGCCATTGCTAGGGTGCCTAGTCCCTGTCTTACTCCCATTGGGA 835
Query 1002 GTGGAAGAATGAGTTCAAATGATAAGAGGAACACAAGTAACCAGAGCCCATTCAATGGTG 1061
|||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||
Sbjct 836 GTGGGAGAGTGAGTTCAAATGATAAGAGGAACACAAGTAACCAAAGCCCGTTCAACGGTG 895
Query 1062 TTACCTCTGGTCTCAACGAGTCTTCTGATCTTGTCAATGCTTTATCTGGCTTGAACCTGT 1121
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 896 TTACATCTGGTCTCAACGAGTCTTCTGATCTTGTCAATGCTTTATCTGGCATGAACCTGT 955
Query 1122 CAT-GCAGTGTTGGGTTAGATGATCG-GAGTCAGGCTGAGCAAGATGTCGAAAAGGTCAG 1179
| | |||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 956 C-TGGCAGTGGCGGGTTAGATGAACGTG-GTCAGGCTGAGCAAGATGTCGAAAAGGTCAG 1013
Query 1180 GAACTATATGTTTGGACTGCAAGGTGGGCATAACGAAGTCAATCAACATGA-GTTCCCAA 1238
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 1014 GAACTATATGTTTGGACTGCAAGGTGGGTATAACGAAGTCAATCAACAT-AGGTTCCCAA 1072
Query 1239 ACAAATCTGATCAAGCCCATAAGGCAACTGGCTCGTTGAGGAATTCACAATTGAGAGGGC 1298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1073 ACAAATCTGATCAAGCCCATAAGGCAACTGGCTCGTTGAGGGATTCACAATTGAGAGGGC 1132
Query 1299 CACACGGATCTGCCTATAATGGTGGAGTTGGATTAGCTAATCCTTACCAGCAACTTGATA 1358
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1133 CACAAGGATCTGCCTATAATGGTGGAGTTGGATTAGCTAATCCTTACCAGCATCTTGATA 1192
Query 1359 GCCCAAATTATTGTCTCAACAATTACGCATTAAATCCAGCTGTAGCCTCTATGATGGCTA 1418
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1193 GCCCAAATTATTGTCTCAACAATTATGCATTAAATCCAGCTGTAGCTTCTATGATGGCTA 1252
Query 1419 ACCAACTTGGGAACAATAACTTTGCTCCAATGTATGATAATG--T-------ATCCGCTT 1469
||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| | ||||||||
Sbjct 1253 ACCAACTTGGGAACAATAATTTTTCTCCAATGTACGATAATGTATCCGCAGCATCCGCTT 1312
Query 1470 TGGGATTTTCTGGAATGGACTCTAGACATCATGGACGAGGCTTTGTATCTTCTGGTCAAA 1529
|||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1313 TGGGATTTTCTGGAATGGACTCCAGACTTCATGGAGGAGGCTTTGTATCTTCTGGTCAAA 1372
Query 1530 ACCTCTCTGAATCACGTAATCTTGGCAGATTCAGTAATCGAATGATGGGAGGAGGTGCTG 1589
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1373 ACCTCTCTGAATCACGTAATCTTGGCAGGTTCAGTAATCGAATGATGGGAGGAGGTACTG 1432
Query 1590 GTCTCCAGTCACATATGGTAGACCCAATGTATAATCAGTATGCTGATTCACTTGATCTTC 1649
|||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1433 GTCTCCAGTCACATATGGCGGACCCAATGTATCATCAGTATGCTGATTCGCTTGATCTTC 1492
Query 1650 TCAATGATCCTTCCATGGATAGGAACTTTATGGGTGGTTCATCATACATGGA-TATGCTT 1708
||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| | |||||||| || |||||||
Sbjct 1493 TCAATGATCCTTCGATGGACATGAACTTTATGGGT-AAT--TCATACAT-GAGTATGCTT 1548
Query 1709 GAACTCCAGAGGGCTTATCTTGGAGCTCAGAAATCACAGTATGGTGTCCCTTACAAATCC 1768
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 1549 GAACTCCAGAGGGCTTTTCTCGGAGCTCAGAAATCACAGTATGGTCTTCCTTACAAATCC 1608
Query 1769 GGGAGCCCTAACAGCCATAGCTATTATGGGAGTCCAACATTTGGGTCTAATATGTCATAT 1828
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 1609 GGGAGCCCTAACAGCCATAGCGATTATGGGAGTCCAACATTTGGGTCTAACATATCATAT 1668
Query 1829 CCTGGCAGCCCATTGGCTCATCATGGTATGCCAAACTCTCTTATGTCACCTTATAGCCCT 1888
|||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| | |||||||
Sbjct 1669 CCTGGCAGCCCATTGGCTCATCATCTTCTGCCAAATTCTCTTGTGTCACCCTGTAGCCCT 1728
Query 1889 ATGAGACG-GGATGAAGTTAATATGCGATTTCCTTCTGCAACAAGAAATTATTCGGGAGG 1947
|||||||| || |||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1729 ATGAGACGAGG-TGAAGTTAGTATGCGATATCCCTCTGCAGCAAGAAATTATTCGGGAGG 1787
Query 1948 -GTTAATGGGTTCTTGGCACATGGATGCTAGTTTTGATGAAGGCTTTGGATCTTCAATGC 2006
| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1788 AG-TAATGGGGTCTTGGCACATGGATGCTAGTTTGGATGAAGGCTTTGGATCTTCAATGC 1846
Query 2007 TTGAAGAGTTCAAAAGTAACAAAACAAGAGGATTTGAACTTTCTGAAATAGCTGGCCATG 2066
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1847 TTGAAGAGTTCAAAAGTAACAAAACAAGAGGATTTGAACTCTCTGAAATAGCTGGCCATG 1906
Query 2067 TTGTGGAGTTCAGTTCGGATCAATATGGAAGCCGCTTTATTCAGCAGAAACTCGAGACAG 2126
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1907 TTGTAGAGTTCAGTTCGGATCAATATGGAAGCCGGTTTATTCAGCAGAAACTCGAGACAG 1966
Query 2127 CAACAACTGATGAGAAAAACATGGTCTATGAGGAGATCATGCCACAAGCTCTTGTCCTGA 2186
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||
Sbjct 1967 CAACAACTGATGAGAAAAACATGGTTTATGAGGAGATCATGCCACATGCTCATGCCCTGA 2026
Query 2187 TGACTGACGTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGAGCATGGACTCCCGCCAC 2246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2027 TGACTGACGTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGAGCATGGACTCCCGCCAC 2086
Query 2247 AGAGGAGAGAATTGGCAGAGAAACTCTTTGACCATGTTTTGCCTCTTAGCTTACAGATGT 2306
|||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2087 AGAGAAGAGAATTGGCAGAGAAACTCTTTGACAATGTTTTGCCTCTTAGCTTACAGATGT 2146
Query 2307 ATGGTTGCCGTGTCATCCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGATCTAGACCAGAAAATTAAAA 2366
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 ATGGTTGTCGTGTCATCCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGATCTAGACCAGAAAATTAAAA 2206
Query 2367 TGGTGAAAGAACTTGATGGACATGTAATGCGATGTGTACGTGATCAGAATGGGAACCATG 2426
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2207 TGGTGAAAGAACTTGATGGACATGTGATGCGATGTGTACGTGATCAGAATGGGAATCATG 2266
Query 2427 TGGTTCAAAAGTGTATTGAATGTGTGCCTGAAGAAAACATCGAGTTTATTATTTCAACTT 2486
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2267 TGGTTCAAAAGTGTATCGAATGTGTGCCTGAAGAAAACATCGAGTTTATTATTTCAACTT 2326
Query 2487 TCTTTGGCCATGTGGTGACCCTCTCCACTCACCCATATGGGTGCCGTGTTATTCAGAGAG 2546
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2327 TCTTTGGTCATGTGGTGACCCTCTCCACTCACCCATACGGGTGCCGTGTAATTCAGAGAG 2386
Query 2547 TATTGGAACACTGCCATGACCCTGATACACAGAGTAAGGTTATGGAAGAAATCCTGTCCA 2606
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2387 TATTGGAACACTGCCATGACCCTGATACTCAGAGTAAGGTTATGGAAGAAATCCTTTCCA 2446
Query 2607 CTGTTAGTATGCTGGCCCAAGATCAGTATGGAAACTATGTTGTTCAGCATGTGCTGGAGC 2666
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2447 CTGTTAGTATGCTGGCCCAAGATCAGTACGGAAACTATGTTGTTCAGCATGTGCTGGAGC 2506
Query 2667 ATGGAAAGCCTGATGAGCGCACTGTGATAATCAAAGAATTGGCGGGGAAGATTGTTCAGA 2726
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2507 ATGGAAAGCCTGATGAGCGCACTGTGATAATCAAAGAGTTGGCGGGGAAGATTGTTCAGA 2566
Query 2727 TGAGCCAGCAGAAGTTCGCATCAAACGTTGTTGAGAAATGTTTGACTTTTGGAGGTCCTG 2786
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2567 TGAGCCAGCAGAAGTTTGCATCAAACGTTGTTGAGAAATGTTTGACTTTTGGAGGTCCTG 2626
Query 2787 AGGAACGAGAATTGCTTGTGAATGAGATGCTGGGAACAACTGATGAAAACGAGCCTCTTC 2846
||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2627 AGGAACGGGAATTTCTGGTGAATGAGATGCTGGGCACAACTGATGAAAACGAGCCTCTTC 2686
Query 2847 AGGCGATGATGAAGGATCAGTTCGCAAACTATGTAGTGCAGAAAGTTTTGGAGACCTGTG 2906
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2687 AGGCGATGATGAAGGATCAGTTTGCAAACTATGTAGTGCAGAAAGTTTTGGAGACATGTG 2746
Query 2907 ATGACCAACAACGTGAGCTGATACTTACTCGCATCAAAGTGCATCTTACTGCTTTAAA-A 2965
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 2747 ATGACCAACAACGTGAGCTGATACTTACTCGCATCAAAGTGCATCTTAATGCTTTAAAGA 2806
Query 2966 AAGTACACTTATGGAAAGCATGTCGTTGCGCGTATTGAAAAACTCGTTGCTGCTGGAGAG 3025
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2807 AA-TACACTTATGGAAAGCATGTCGTTGCGCGTATTGAAAAACTCGTTGCTGCTGGAGAG 2865
Query 3026 AGGAGAATGGCTTTGCAGTCCCTAACCCAGCCCCAGATGGCTTAAGACCTTAAGTAATGT 3085
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||| |||
Sbjct 2866 AGGAGAATGGCTTTGCAGTCCCTAACCCAGCCTCAGATGGCGTAAGGCCGCAAGTGTTGT 2925
Query 3086 ACAGCTTAACTAGGGTGGATGGGGCTGCCGTAGCGTTTTGAGAATTAGGTAAGATCTAAA 3145
|||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2926 ACAGCTTAACTAGGGTGGATGGCTCTGCCATAGCGTTTTGAGAATTAGGTAAGATCTAAA 2985
Query 3146 CCGGAAATAATCTGCGGGGAAATTGTGAAGGAGAGCTTTGTTTTCTCTGCTAA-ATCTGT 3204
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 2986 CCGGAAATAATCTGCGGGAAAATTGTGAAGGAGAGCTTTGTTTTCTCTGC-AAGATCTGT 3044
Query 3205 AAAATTGTGTAGTTTGCTTACGGTTTTTCTATACATAGAACGAAACATCCCTCTTTAGGC 3264
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct 3045 AAAATTGTGTAGTT-GCTTACGGTTTTTCTATACATAGAACCAAACATCCCACTTTAGGC 3103
Query 3265 TGATG 3269
|||||
Sbjct 3104 TGATG 3108
> Ahg481833 jgi|Araly1|481833|fgenesh2_kg.4__893__AT2G29140.1
Length=3260
Score = 4348 bits (2354), Expect = 0.0
Identities = 2921/3185 (92%), Gaps = 77/3185 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 164 ATGATACCGGAACTAGGGAGAAGACCGATGCATAGAGGTAACGAAGATTCATCTTTTGGG 223
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4 ATGATACCGGAACTAGGAAGAAGACCGATGCATAGAGGTAACGAAGATTCATCTTTTGGG 63
Query 224 GATGATTATGAGAAAGAGATTGGAGTATTGCTTGGTGAGCAGCAGAGAAGGCAAGTAGAA 283
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 64 GATGATTATGAGAAAGAGATTGGAGTATTACTTGGTGAGCAGCAGAGAAGGCAAGTAGAA 123
Query 284 GCTGATGAGCTTGAGAGAGAGCTTAACTTGTTTAGAAGTGGCTCTGCTCCACCGACTGTT 343
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 124 GCTGATGAGCTTGAGAGAGAGCTTAACTTGTATAGAAGTGGCTCTGCTCCACCGACTGTT 183
Query 344 GATGGTTCTGTTAGTGCTGCCGGAGGGCTTTTTAGCGGCGGAGGTGGGGCTCCTTTTTTG 403
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 184 GATGGTTCTGTCAGTGCTGCCGGAGGGCTTTTTAGCGGCGGAGGTGGGGCTCCTTTTTTG 243
Query 404 GAGTTTGGTGGTGTTAATAAGGGTAATGGGTTTGGTGGTGATGATGAGGAGTTTAGGAAA 463
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 244 GAGTTTGGTGGAGGCAATAAGGGTAATGGGTTTGGTGGTGGTGATGAGGAGTTTAGGAAA 303
Query 464 GATCCGGCTTACTTGTCTTATTACTATGCTAATATGAAGTTGAATCCGAGGTTGCCACCG 523
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 304 GATCCGGCTTACTTGTCTTATTACTATGCTAATATGAAGTTGAACCCGAGGTTGCCACCG 363
Query 524 CCTTTGATGTCTAGGGAGGATTTGAGGGTTGCTCAGAGGCTTAAAGGGAGTAATAATGTG 583
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 364 CCTTTGATGTCTAGGGAGGATTTGAGGGTTGCTCAGAGGCTTAAAGGGAGTAGTAATGTT 423
Query 584 TTAGGTGGTGTTGGGGATAGGAGAAAAGTTAATGATAATCGATCTTTGTTCTCTATGCCA 643
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 424 TTAGGTGGTGTTGGGGATAGGCGAAAAGTTAATGATAGTCAATCTTTGTTCTCTATGCCA 483
Query 644 CCGGGTTTTGAAGG-TGAGAAAACTGGTGCTTCTGCTTCTGAATGGGATGCTAATGGATT 702
|| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 484 CCTGGTTTTG-AGGCTGAGAAAACTGGTGCTTCTGCTTCTGAGTGGGATGCTAATGGATT 542
Query 703 GATTGGTTTACCGGGTTTGGGACTTGGAGGCAAGCAGAAGAGTTTTGCTGATATCTTTCA 762
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 543 GATTGGTTTACCGGGTTTGGGACTTGGAGGCAAGCAGAAGAGTTTTGCTGATATCTTTCA 602
Query 763 GGCTGATATGGGGCATGGACATCCTGTCGCACAACAGCCCTCACGTCCTGCAAGTCGTAA 822
||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 603 GGCGGATATGGGGCATGGACATCCTGTCGCACAGCAGCCCTCACGTCCTGCAAGTCGTAA 662
Query 823 TACCTTTGATGAAAATGTTGACTCTAATAATAATCTGTCTCCGTCTGCATCACAAGGCAT 882
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 663 TACCTTTGATGAAAATGTTGACTCTAAGAATAATCTGTCTCCGTCTGCATCACAAGGTAT 722
Query 883 TGGTGCACCATCTCCATACAGCTATGCAGCTGTTCTAGGCTCTTCTTTGTCTAGAAATGG 942
||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||
Sbjct 723 TGGAGCGCCATCTCCATACAGCTATGCAGCTGTTCTGGGTTCGTCTTTGTCTAGAAATGG 782
Query 943 AACTCCAGATCCACAGGCCATTGCTAGGGTGCCTAGTCCCTGTCTTACTCCCATTGGGAG 1002
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 783 AACTCCAGATCCACAGGCCGTTGCTAGGGTGCCTAGTCCCTGTCTTACCCCCATTGGGAG 842
Query 1003 TGGAAGAATGAGTTCAAATGATAAGAGGAACACAAGTAACCAGAGCCCATTCAATGGTGT 1062
||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||
Sbjct 843 TGGGAGAGTGAGTTCAAATGATAAGAGGAACACAAGTAATCAAAGCCCGTTTAACGGTGT 902
Query 1063 TACCTCTGGTCTCAACGAGTCTTCTGATCTTGTCAATGCTTTATCTGGCTTGAACCTGTC 1122
||| |||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 903 TACATCTGGTCTGGTTGAGTCTTCTGATCTCGCCGCTGCTTTATCTGGCTTGAACCTGTC 962
Query 1123 ATGC-AGTGTTGGGTTAGATGATCGGAGTCAGGCTGAGCAAGATGTCGAAAAGGTCAGGA 1181
||| | || ||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 963 -TGCAACTGGCGGGTTAGATGAACAGAGTCAAGCTGAGCATGATGTCGAAAAGGTCAGGA 1021
Query 1182 ACTATATGTTTGGACTGCAAGGTGGGCATAACGAAGTCAATCAACATGAGTTCCCAAACA 1241
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1022 ACTATATGTTTGGACTGCAAGGTGGGTATAACGAAGTCAATCAACATGGGTTCCCAAACA 1081
Query 1242 AATCTGATCAAGCCCATAAGGCAACTGGC-TCGTT-GAGGAATTCACAATTGAGAGGGCC 1299
|| |||||||||||| ||||| |||| || || || |||||||||||| |||||||| |
Sbjct 1082 AACCTGATCAAGCCCCTAAGGGAACT-GCTTC-TTGGAGGAATTCACAGCTGAGAGGGTC 1139
Query 1300 ACACGGATCTGCCTATAATGGTGG-AGTTGGATTAGCTAATCCTTACCAGCAACTTGATA 1358
||| ||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1140 ACAAGGATCTGCCTACAATGGTGGAAG-TGGACTAGCTAATCCTTACCAGCATCTTGATA 1198
Query 1359 GCCCAAATTATTGTCTCAACAATTACGCATTAAATCCAGCTGTAGCCTCTATGATGGCTA 1418
|||| || | || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 1199 GCCC-AA--A----CT-----ATTATGCATTAAATCCAGCTGTAGCTTCTATGATGGCCA 1246
Query 1419 ACCAACTTGGGAAC-AATAACTTTGCTCCAATGTATGATAATG----T-----ATCCGCT 1468
|||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| |||| | ||| |||
Sbjct 1247 GTCAACTT-GGAACTAATAACTATCCTCCAATGTATGAAAATGCTTCTGCGGCATCTGCT 1305
Query 1469 TTGGGATTTTCTGGAATGGACTCTAGACATCATGGACGAGGCTTTGTATCTTCTGGTCAA 1528
|||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 1306 ATGGGATTTTCTGGAATGGACTCAAGACTTCATGGTGGAGGTTTTGTTTCTTCTGGTCAA 1365
Query 1529 AACCTCTCTGAATCACGTAATCTTGGCAGATTCAGTAATCGAATGATGGGAGGAGGTGCT 1588
||||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1366 AACCTCTCTGAATCACGAAATATTGGTAGGGTCGGTAATCGAATGATGGGAGGAGGTACT 1425
Query 1589 GGTCTCCAGTCACATATGGTAGACCCAATG--T-AT-A--AT-C-A-G-----T----AT 1630
||||||||||||||||||| |||||||||| | || | || | | | | ||
Sbjct 1426 GGTCTCCAGTCACATATGGCAGACCCAATGTATCATCAGTATGCGAGGTTCTCTGAAAAT 1485
Query 1631 GCTGATTCACTTGATCTTCTCAATGATCCTTCCATGGATAGGAACTTTATGGGTGGTTCA 1690
|||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| || ||||||| |
Sbjct 1486 GCTGATTCGTTTGATCTTCTTAATGACCCTTCAATGGACAGGAGCTATATGGGT-AAT-- 1542
Query 1691 TCATACATGGATATGCTTGAACTCCAGAGGGCTTATCTTGGAGCTCAGAAATCACAGTAT 1750
||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1543 TCATACATGAATATGCTTGAACTTCAGAGGGCTTATCTCGGAGCTCAGAAATCACAGTAT 1602
Query 1751 GGTGTCCCTTACAAATCCGGGAGCCCTAACAGCCATAGCTATTATGGGAGTCCAACATTT 1810
||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1603 GGTCTTCCTTACAAATCAGGGAGTCCTAACAGCCATAGCTATTATGGTAGTCCAACATTT 1662
Query 1811 GGGTCTAATATGTCATATCCTGGCAGCCCATTGGCTCATCATGGTATGCCAAACTCTCTT 1870
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct 1663 GGGTCTAATATGTCATATCCTGGCAGCCCATTGGCTCATCCTGGTATGCCAAATTCTCTT 1722
Query 1871 ATGTCACCTTATAGCCCTATGAGACG-GGATGAAGTTAATATGCGATTTCCTTCTGCAAC 1929
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 1723 ATGTCACCTTATAGCCCTATGAGACGAGG-TGAAGTTAATATGCGATATCCGTCTGCAAC 1781
Query 1930 AAGAAATTATTCGGGAGGGTTAATGGGTTCTTGGCACATGGATGCTAGTTTTGATGAAGG 1989
|||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1782 AAGAAACTATTCCGGAGGGGTAATGGGTTCTTGGCACATGGATGCTAGTTTGGATGAAGG 1841
Query 1990 CTTTGGATCTTCAATGCTTGAAGAGTTCAAAAGTAACAAAACAAGAGGATTTGAACTTTC 2049
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1842 CTTTGGATCTTCAATGCTTGAAGAGTTCAAAAGTAACAAAACAAGAGGATTCGAACTTTC 1901
Query 2050 TGAAATAGCTGGCCATGTTGTGGAGTTCAGTTCGGATCAATATGGAAGCCGCTTTATTCA 2109
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||
Sbjct 1902 TGAAATAGCTGGCCATGTTGTAGAGTTCAGTTCGGATCAATACGGGAGCCGGTTTATTCA 1961
Query 2110 GCAGAAACTCGAGACAGCAACAACTGATGAGAAAAACATGGTCTATGAGGAGATCATGCC 2169
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1962 GCAGAAACTCGAGACAGCAACAACTGATGAGAAAAACATGGTTTATGAGGAGATCATGCC 2021
Query 2170 ACAAGCTCTTGTCCTGATGACTGACGTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGA 2229
||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2022 ACAAGCTCTAGCCCTGATGACTGACGTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGA 2081
Query 2230 GCATGGACTCCCGCCACAGAGGAGAGAATT-GGCAGAGAAACTCTTTGACCATGTTTTGC 2288
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 2082 GCATGGACTCCCACCACAGAGGAGAGAATTGGGC-GAGAAACTCATTGACAATGTTTTGC 2140
Query 2289 CTCTTAGCTTACAGATGTATGGTTGCCGTGTCATCCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGATC 2348
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2141 CTCTTAGCTTACAGATGTATGGTTGTCGTGTCATCCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGATC 2200
Query 2349 TAGACCAGAAAATTAAAATGGTGAAAGAACTTGATGGACATGTAATGCGATGTGTACGTG 2408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2201 TAGACCAGAAAATTAAAATGGTGAAAGAACTTGATGGACATGTGATGCGATGTGTACGTG 2260
Query 2409 ATCAGAATGGGAACCATGTGGTTCAAAAGTGTATTGAATGTGTGCCTGAAGAAAACATCG 2468
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2261 ATCAGAATGGGAACCATGTGGTTCAAAAGTGTATCGAATGTGTGCCTGAGGAAAACATCG 2320
Query 2469 AGTTTATTATTTCAACTTTCTTTGGCCATGTGGTGACCCTCTCCACTCACCCATATGGGT 2528
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2321 AGTTTATTATTTCGACTTTCTTTGGCCATGTGGTGACCCTCTCCACTCACCCATACGGGT 2380
Query 2529 GCCGTGTTATTCAGAGAGTATTGGAACACTGCCATGACCCTGATACACAGAGTAAGGTTA 2588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2381 GCCGTGTTATTCAGAGAGTATTGGAACACTGCCATGACCCTGATACACAGAGTAAGGTTA 2440
Query 2589 TGGAAGAAATCCTG-TCCACTGTTAGTATGCTGGCCCAAGATCAGTATGGAAACTATGTT 2647
|||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2441 TGGATGAAATCTTGATT-ACTGTTAGTATGCTGGCCCAAGATCAGTATGGAAACTATGTT 2499
Query 2648 GTTCAGCATGTGCTGGAGCATGGAAAGCCTGATGAGCGCACTGTGATAATCAAAGAATTG 2707
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 2500 ATTCAGCATGTGCTGGAGCATGGAAAGCCTGATGAGCGCACCGTGATAATCAAAGAGTTA 2559
Query 2708 GCGGGGAAGATTGTTCAGATGAGCCAGCAGAAGTTCGCATCAAACGTTGTTGAGAAATGT 2767
|| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2560 GCTGGAAAGATTGTTCAGATGAGCCAGCAGAAGTTTGCATCAAACGTTGTTGAGAAATGT 2619
Query 2768 TTGACTTTTGGAGGTCCTGAGGAACGAGAATTGCTTGTGAATGAGATGCTGGGAACAACT 2827
|||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2620 TTGACTTTTGGAGGTCCTGAGGAACGGGAATTTCTGGTGAATGAGATGCTGGGCACAACT 2679
Query 2828 GATGAAAACGAGCCTCTTCAGGCGATGATGAAGGATCAGTTCGCAAACTATGTAGTGCAG 2887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2680 GATGAAAACGAGCCTCTTCAGGCGATGATGAAGGATCAGTTTGCAAACTATGTAGTGCAA 2739
Query 2888 AAAGTT-TTGGAGACCTGTGATGACCAACAACGTGAGCTGATACTTACTCGCATCAAAGT 2946
||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||
Sbjct 2740 AAAGTCCTTG-AGACATGCGATGACCAACAGCGTGAACTGATACTTACTCGTATTAAGGT 2798
Query 2947 GCATCTTACTGCTTTAAAAAAGTACACTTATGGAAAGCATGTCGTTGCGCGTATTGAAAA 3006
|||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||
Sbjct 2799 GCATCTTAATGCTTTGAAGAAGTACACTTATGGAAAGCATATCGTTGCCCGTGTTGAAAA 2858
Query 3007 ACTCGTTGCTGCTGGAGAGAGGAGAATGGCTTTGCAGTCCCTAACCCAGCCCCAGATGGC 3066
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||
Sbjct 2859 ACTCGTTGCTGCTGGAGAGAGGAGAATGGCTTTGCAGTCATTAACCCAGCCTCTGGGGGC 2918
Query 3067 TTAAGACCTTAAGTAATGTACAGCTTAACTAGGGTGGATGGGGCTGCCGTAGCGTTTTGA 3126
|||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||
Sbjct 2919 GTAAGGCCACAAGTCTTGTACAGCTTAACTAGGGTGGATGGCTCTGCCATAACGTTTTGA 2978
Query 3127 GAATTAGGTAAGATCTAAACCGGAAATAATCTGCGGGGAAATTGTGAAGGAGAGCTTTGT 3186
||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| | || |||||||||||
Sbjct 2979 GAATTAGGTAAGATCTAAACC--AAA-AATCTGCGGAGAAATTATAAAAGAGAGCTTTGT 3035
Query 3187 TTTCT-CT--GCTAAATCTGTAAAATTGTGTAGTTTGCTTACGGTTTTT-CTATACATAG 3242
||| | || || ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 3036 TTTGTTCTCCGCAAAATCTGTACA-TTGTGTAGTTT-CTTACCGTTTTGACTATACATAG 3093
Query 3243 AACGAAACATCCCTCTTTAGGCTGATGAGTGAG-A-GAT-AAAAAGGCAGAGAATGGTGT 3299
||| ||| ||||| ||| |||||||||| |||| | | | ||||||||||||||||||||
Sbjct 3094 AACCAAAGATCCCCCTT-AGGCTGATGA-TGAGTAAG-TGAAAAAGGCAGAGAATGGTGT 3150
Query 3300 AAAGA 3304
|||||
Sbjct 3151 AAAGA 3155
> Ahg952160 jgi|Araly1|952160|scaffold_4100004.1
Length=1596
Score = 2218 bits (1201), Expect = 0.0
Identities = 1465/1590 (92%), Gaps = 27/1590 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1563 GTAATCGAATGATGGGAGGAGGTGCTGGTCTCCAGTCACATATGGTAGACCCAATG--T- 1619
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||| ||| |
Sbjct 13 GTAATCGAATGATGGGAGGAGGTACTGGTCTCCAGTCACATCTTGCAGACCCGATGTATC 72
Query 1620 AT-A--AT-C-A-G-----T----ATGCTGATTCACTTGATCTTCTCAATGATCCTTCCA 1664
|| | || | | | | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |
Sbjct 73 ATCAGTATGCAAGGTTCTCTGAAAATGCTGATTCGTTTGATCTTCTTAATGACCCTTCAA 132
Query 1665 TGGATAGGAACTTTATGGGTGGTTCATCATACATGGATATGCTTGAACTCCAGAGGGCTT 1724
|||| |||| || ||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 133 TGGACAGGAGCTATATGGGT-AAT--TCATACATGAATATGCTTGAACTTCAGAGGGCTT 189
Query 1725 ATCTTGGAGCTCAGAAATCACAGTATGGTGTCCCTTACAAATCCGGGAGCCCTAACAGCC 1784
|||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 190 ATCTCGGAGCTCAGAAATCACAGTATGGTCTTCCTTACAAATCAGGGAGTCCTAACAGCC 249
Query 1785 ATAGCTATTATGGGAGTCCAACATTTGGGTCTAATATGTCATATCCTGGCAGCCCATTGG 1844
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 250 ATAGCTATTATGGTAGTCCAACATTTGGGTCTAATATGTCATATCCTGGCAGCCCATTGG 309
Query 1845 CTCATCATGGTATGCCAAACTCTCTTATGTCACCTTATAGCCCTATGAGACG-GGATGAA 1903
|||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 310 CTCATCCTGGTATGCCAAATTCTCTTATGTCACCTTATAGCCCTATGAGACGAGG-TGAA 368
Query 1904 GTTAATATGCGATTTCCTTCTGCAACAAGAAATTATTCGGGAGGGTTAATGGGTTCTTGG 1963
||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 369 GTTAATATGCGATATCCGTCTGCAACAAGAAACTATTCCGGAGGGGTAATGGGTTCTTGG 428
Query 1964 CACATGGATGCTAGTTTTGATGAAGGCTTTGGATCTTCAATGCTTGAAGAGTTCAAAAGT 2023
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 429 CACATGGATGCTAGTTTGGATGAAGGCTTTGGATCTTCAATGCTTGAAGAGTTCAAAAGT 488
Query 2024 AACAAAACAAGAGGATTTGAACTTTCTGAAATAGCTGGCCATGTTGTGGAGTTCAGTTCG 2083
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 489 AACAAAACAAGAGGATTCGAACTTTCTGAAATAGCTGGCCATGTTGTAGAGTTCAGTTCG 548
Query 2084 GATCAATATGGAAGCCGCTTTATTCAGCAGAAACTCGAGACAGCAACAACTGATGAGAAA 2143
|||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 549 GATCAATACGGGAGCCGGTTTATTCAGCAGAAACTCGAGACAGCAACAACTGATGAGAAA 608
Query 2144 AACATGGTCTATGAGGAGATCATGCCACAAGCTCTTGTCCTGATGACTGACGTTTTTGGA 2203
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 609 AACATGGTTTATGAGGAGATCATGCCACAAGCTCTAGCCCTGATGACTGACGTTTTTGGA 668
Query 2204 AACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGAGCATGGACTCCCGCCACAGAGGAGAGAATT-GGC 2262
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 669 AACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGAGCATGGACTCCCACCACAGAGGAGAGAATTGGGC 728
Query 2263 AGAGAAACTCTTTGACCATGTTTTGCCTCTTAGCTTACAGATGTATGGTTGCCGTGTCAT 2322
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 729 -GAGAAACTCATTGACAATGTTTTGCCTCTTAGCTTACAGATGTATGGTTGTCGTGTCAT 787
Query 2323 CCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGATCTAGACCAGAAAATTAAAATGGTGAAAGAACTTGA 2382
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 788 CCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGATCTAGACCAGAAAATTAAAATGGTGAAAGAACTTGA 847
Query 2383 TGGACATGTAATGCGATGTGTACGTGATCAGAATGGGAACCATGTGGTTCAAAAGTGTAT 2442
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 848 TGGACATGTGATGCGATGTGTACGTGATCAGAATGGGAACCATGTGGTTCAAAAGTGTAT 907
Query 2443 TGAATGTGTGCCTGAAGAAAACATCGAGTTTATTATTTCAACTTTCTTTGGCCATGTGGT 2502
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 908 CGAATGTGTGCCTGAAGAAAACATCGAGTTTATTATTTCGACTTTCTTTGGCCATGTTGT 967
Query 2503 GACCCTCTCCACTCACCCATATGGGTGCCGTGTTATTCAGAGAGTATTGGAACACTGCCA 2562
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 968 GACCCTCTCCACTCACCCATACGGTTGCCGTGTTATTCAGAGAGTATTGGAACACTGCCA 1027
Query 2563 TGACCCTGATACACAGAGTAAGGTTATGGAAGAAATCCTGTCCACTGTTAGTATGCTGGC 2622
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct 1028 TGACCCTGATACGCAGAGTAAGGTTATGGAAGAAATCCTGTCTACTGTTAGTATGTTGGC 1087
Query 2623 CCAAGATCAGTATGGAAACTATGTTGTTCAGCATGTGCTGGAGCATGGAAAGCCTGATGA 2682
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1088 CCAAGATCAGTACGGAAACTATGTTGTTCAGCATGTACTGGAGCATGGAAAGCCTGATGA 1147
Query 2683 GCGCACTGTGATAATCAAAGAATTGGCGGGGAAGATTGTTCAGATGAGCCAGCAGAAGTT 2742
|||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1148 GCGCACCGTGATAATCAAAGAGTTAGCTGGAAAGATTGTTCAGATGAGCCAGCAGAAGTT 1207
Query 2743 CGCATCAAACGTTGTTGAGAAATGTTTGACTTTTGGAGGTCCTGAGGAACGAGAATTGCT 2802
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||
Sbjct 1208 TGCATCAAACGTTGTTGAGAAATGTTTGACTTTTGGAGGGCCAGAGGAACGGGAATTGCT 1267
Query 2803 TGTGAATGAGATGCTGGGAACAACTGATGAAAACGAGCCTCTTCAGGCGATGATGAAGGA 2862
|||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1268 CGTGAATGAGATGCTTGGCACAACTGATGAAAATGAGCCTCTTCAGGCGATGATGAAGGA 1327
Query 2863 TCAGTTCGCAAACTATGTAGTGCAGAAAGTT-TTGGAGACCTGTGATGACCAACAACGTG 2921
|||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||
Sbjct 1328 TCAGTTTGCAAACTATGTAGTGCAAAAAGTCCTTG-AGACATGCGATGACCAACAGCGTG 1386
Query 2922 AGCTGATACTTACTCGCATCAAAGTGCATCTTACTGCTTTAAAAAAGTACACTTATGGAA 2981
| |||||||||||||| || || |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 1387 AACTGATACTTACTCGTATTAAGGTGCATCTTAATGCTTTGAAGAAGTACACTTATGGAA 1446
Query 2982 AGCATGTCGTTGCGCGTATTGAAAAACTCGTTGCTGCTGGAGAGAGGAGAATGGCTTTGC 3041
||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1447 AGCATATCGTTGCCCGTGTTGAAAAACTTGTTGCTGCTGGAGAGAGGAGAATGGCTTTGC 1506
Query 3042 AGTCCCTAACCCAGCCCCAGATGGCTTAAGACCTTAAGTAATGTACAGCTTAACTAGGGT 3101
|||| |||||||||| | | ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1507 AGTCATTAACCCAGCCTCTGGTGGCTTAAGGCCACAAGTCTTGTACAGCTTAACTAGGGT 1566
Query 3102 GGATGGGGCTGCCGTAGCGTTTTGAGAATT 3131
|||||| ||||| || |||||||||||||
Sbjct 1567 GGATGGCTCTGCCATAACGTTTTGAGAATT 1596
> Ahg928725 jgi|Araly1|928725|scaffold_301182.1
Length=3063
Score = 265 bits (143), Expect = 2e-69
Identities = 764/1053 (73%), Gaps = 86/1053 (8%)
Strand=Plus/Plus
Query 2024 AACAAAACAAGAGGATTT-GAACTTTCTGAAATAGCTGGCCATGTTG-TGGAGTTCAG-T 2080
||||| ||||| | ||| || ||||| ||||||| ||| |||| || | ||||||||
Sbjct 1991 AACAAGACAAG-GTCTTTGGAGCTTTCAGAAATAGTTGGTCATG-TGATTGAGTTCAGCA 2048
Query 2081 TCGGATCAATATGGAAGCCGCTTT-ATTCAGCAGAAACTCGAGACAGCAACAACTGATGA 2139
| |||||| || ||||| || ||| |||||||||||||| ||||| | |||| |||||
Sbjct 2049 T-GGATCAGTACGGAAGTCG-TTTCATTCAGCAGAAACTTGAGACTG---CAACGGATGA 2103
Query 2140 -GAAAA-ACATGGTCTA-T-GAGGAGATCA-TGCC--ACAAG-CTCTTGTCCTGATGACT 2191
||||| | ||| | || | ||||| | | || || | | | | | |||||
Sbjct 2104 GGAAAAGA-ATGCTATATTCCCTGAGAT-ACTTCCTTAC-GGCCGC-ACT-TTAATGACA 2158
Query 2192 GACGTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGAGCATGGACT-CCCGCCA-CAGA 2249
|| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| | | | | ||||
Sbjct 2159 GATGTCTTTGGAAATTATGTTATTCAAAAGTTTTTTGAGCATGG--TACAAACAAGCAGA 2216
Query 2250 GGAGAGAATTGGCAGAGA-AACTCTTTGACCATGTTTTGCCTCTTAGCT-TACAGATGTA 2307
| | |||| | || || | || | | |||||||||| ||||| || |||| |||||
Sbjct 2217 GAAAAGAACTCGCTGA-ACAAGTAACAGGCCATGTTTTGGCTCTT-TCTCTACAAATGTA 2274
Query 2308 TGGTTGCCGTGTCATCCAGAAGGCAATT-GAGGTGGTTG-ATCTAGACCAGAAAATTAAA 2365
||| ||| | || ||||| ||||| || |||||||||| || | || ||| || | |
Sbjct 2275 TGGCTGCAGGGTTATCCAAAAGGC-GTTAGAGGTGGTTGAAT-TGGAGCAGCAAGCTCGA 2332
Query 2366 ATGGTGAAAGAACTTGAT-GGACATGTAATGCGATGTGTACGTGATCAGAATGGGAACCA 2424
|||||| |||| |||||| || | ||| ||| ||| || | ||| ||||| || || ||
Sbjct 2333 ATGGTGCAAGAGCTTGATGGGTC-TGTCATGAAATGCGTTCATGACCAGAACGGTAATCA 2391
Query 2425 TGTGGTTCAAAAGTGTATTGAATGTGTGCCTGAAGAAAACAT-CGAGTTTATTATTTCAA 2483
|||| | || |||||||| || || | ||| | || || | |||| || |||||
Sbjct 2392 TGTGATCCAGAAGTGTATAGAGCGTCTTCCTCAGGATTGGATAC-AGTTCATCATTTCTT 2450
Query 2484 CTTTCTTTGGCCATGTGGTGA-CCCTCTCCACTCACCCATATGGGTGCCGTGTTATTCAG 2542
| |||| || | || | | | || || || ||||| ||||| |||||||| || |||
Sbjct 2451 CATTCTACGGAAAAGT-TTTAGCTCTTTCAACACACCCTTATGGATGCCGTGTAATCCAG 2509
Query 2543 AGAGTATTGGA--ACACTGCCATGACCCT-GATACACAGA-GTAAGGTTATGGAAGAAAT 2598
|| ||| |||| | | || |||| | | || || || | | | ||||||| |||||
Sbjct 2510 AGGGTACTGGAGCATATTG--ATGA-CATAGAAACCCA-ACGGATCATTATGGAGGAAAT 2565
Query 2599 CCT-G-TCCACTGT-TAGTA-TGCTGGCCCAAGATCAGTATGGAAACTATGTTGTTCAGC 2654
| | | | || || | ||| | || || ||||||||||| || || |||||| ||||||
Sbjct 2566 CATGGATTCA--GTCT-GTACT-CTAGCACAAGATCAGTACGGTAATTATGTTATTCAGC 2621
Query 2655 ATGTGC-TGGAGCATGG-AAAGCCTGATGAGCGCACTGTGATAATCAAAGAA--TTGGCG 2710
|| | | | | || || ||| ||| |||| || | | || ||| || || || ||
Sbjct 2622 ATAT-CATACAACACGGTAAA-CCTCATGAACGGTCAGAAATTATC-AATAAGCTT-GC- 2676
Query 2711 GGGA-AGATTGTTCAGATGAGCCAGCAGAAGTTCGCATCAAACGTTGTTGAGAAA-TGTT 2768
||| ||||||| ||||||| ||||| ||||| || || || |||||||| ||| || |
Sbjct 2677 TGGACAGATTGTGAAGATGAGTCAGCAAAAGTTTGCTTCTAATGTTGTTGA-AAAGTGCT 2735
Query 2769 TGACTTTTGGAGGTCCTGAGGAACGAGAATTGCTTGTGAATGAGATGC-TGGGAACAACT 2827
| || ||||| ||||| |||||||| | | || ||||||||||||| ||| | |||
Sbjct 2736 TAACATTTGGCGGTCCAGAGGAACGCCAGGTACTAGTGAATGAGATGCTTGGTTA-TACT 2794
Query 2828 GATGAAAACGAGCCTCTTCAGGCGATGATGAAGGATC-AGTTCGCAAACTATGTAGTGCA 2886
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | || | || ||| ||||||||
Sbjct 2795 GATGAGAACGAGCCTCTTCAGGCGATGATGAAGGACCCATTTGGGAA-CTACGTAGTGCA 2853
Query 2887 GAAAGTT-TTGGAGACCTGTGATGACCAACAA-CGTG-AGCTGATACTTACTCGCATCAA 2943
||| ||| ||| | || || ||||| ||| | | || | || || ||| ||||||||||
Sbjct 2854 GAAGGTTCTTGAA-ACATGCGATGATCAA-AGTCTTGCA-CTCATTCTTTCTCGCATCAA 2910
Query 2944 AGTGCATCTT-ACTGCTTTAAAAA-AGTACACTTATGG-AAAGCATGTCGTTGCGCGTAT 3000
||| ||| || | ||| || || | | ||||| ||||| ||| ||| ||||||| || |
Sbjct 2911 AGTACAT-TTGAATGCCTTGAAGAGA-TACACATATGGGAAA-CATATCGTTGCCCGGGT 2967
Query 3001 TGAAAAACTCGTTGCTGCTGGAGAGAGGAGAAT 3033
||| ||||| | || | |||||||| |||||
Sbjct 2968 TGAGAAACTTATCACTACCGGAGAGAGAAGAAT 3000
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 136816974935
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5