BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G29730.1
Length=1645
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg933458 jgi|Araly1|933458|scaffold_401446.1 1995 0.0
Ahg887717 jgi|Araly1|887717|Al_scaffold_0278_2 1805 0.0
Ahg481887 jgi|Araly1|481887|fgenesh2_kg.4__947__AT2G29710.1 1799 0.0
> Ahg933458 jgi|Araly1|933458|scaffold_401446.1
Length=1468
Score = 1995 bits (1080), Expect = 0.0
Identities = 1337/1459 (92%), Gaps = 26/1459 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 96 GCTATCTCTTGTTGTTAGAGATGCGGAATGTAGAGCTCATCTTCATCCCCACACCAACCG 155
||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 1 GCTATCTGTTGTTGTTAGAGATGAGGAATACAGAGCTCATCTTTATCCCAACACCAACCG 60
Query 156 TTGGTCATCTTGTTCCGTTTCTTGAATTTGCTAGGCGTCTCATTGAGCAAGATGATAGGA 215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TTGGTCATCTTGTTCCGTTTCTTGAATTTGCTAGGCGTCTCATTGAGCAAGATGATAGGA 120
Query 216 TCCGTATCACAATCCTCTTGATGAAACTACAAGGTCAGTCTCATCTAGACACTTATGTTA 275
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 121 TCCGTATCACAATCCTCTTGATGAAGCTACAAGGTCAGTCACATCTAGACACTTATGTTA 180
Query 276 AATCAATTGCCTCCTCTCAACCGTTTGTTAGATTCATTGATGTCCCTGAGTTAGAGGAGA 335
|||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 AATCTATTGCCTCTTCTCAGCCCTTTGTTAGATTCATTGATGTCCCTGAGTTAGAGGAGA 240
Query 336 AACCTACACTTGGTAGTACACAATCTGTGGAAGCTTATGTGTATGATGTTATTGAGA-GA 394
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||
Sbjct 241 AACCTACACTTGGTGGTACACAGTCTGTGGAAGCTTATGTATATGATGTTATTGAGAAGA 300
Query 395 AATATCCCTCTTGTGAGGAATATAGTCATGGATATTTTAACTTCTCTTGCATTGGATGGA 454
| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 301 A-TATCCCTCTTGTGAGAAATATAGTCATGGATATTTTATCTTCTCTTGCATTGGATGGA 359
Query 455 GTTAAGGTCAAGGGATTAGTTGTTGACTTTTTCTGTCTCCCTATGATTGACGTTGCTAAA 514
||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 360 GTTAAGGTCAAGGGATTTGTTGCTGATTTTTTCTGTCTCCCCATGATTGACGTTGCAAAA 419
Query 515 GA--TA-TAAGTCTCCCTTTCTATGTGTTCTTGACTACAAATTCCGGGTTCTTAGCTATG 571
|| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 420 GAGGTAATAAGTCTTCCTTTCTATGTGTTCTTGACTACAAATTCCGGGTTCTTAGCGATG 479
Query 572 ATGCAGTATCTAGCAGATCGACATAGTAGAGATACATCGGTTTTTGTAAGAAACTCGGAA 631
||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 480 ATGAAGTATCTAGCAGATCGACATAGTAAAGATACATCGGTTTTTGTAAGAAACTCCGAG 539
Query 632 GAAATGTTGTCGATACCTGGATTTGTAAACCCTGTCCCAGCCAATGTTCTGCCGTCAGCT 691
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 540 GAAATGTTGTCGATTCCTGGCTTTGTAAACCCTGTCCCAGCCAATGTTCTGCCATCAGCT 599
Query 692 CTGTTTGTTGAAGATGGTTATGATGCTTACGTTAAGCTGGCCATATTGTTTACAAAGGCC 751
|||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 600 CTGTTTGTTGAAGACGGTTATGATGCTTACATTAAACTGGCTATATTGTTTACAAAGGCT 659
Query 752 AATGGAATCCTAGTGAATAGCT-CCTTTGATATTGAGCCTTACTCTGTGAATCATTTTCT 810
||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 660 AATGGAATCTTAGTGAATT-CTTCCTTTGATATTGAGCCTTACTCTGTCAATCACTTTCT 718
Query 811 TCAAGAACAGAATTATCCTTCTGTTTATGCTGTTGGCCCCATATTTGACTTGAAAGCCCA 870
| | |||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||
Sbjct 719 TGATGAACGGAGTTACCCTTCTGTTTATGCTGTTGGCCCCGTATTTGACTTGAAGGCCCA 778
Query 871 GCCTCATCCAGAGCAGGACCTAACCCGTCGTGACGAGTTGATGAAATGGCTTGATGATCA 930
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 779 GCCTCATCCAGAGCAGGACCTGGCCCGTCGTGACGAGTTGATGAAATGGCTTGATGATCA 838
Query 931 ACCCGAGGCATCGGTTGTATTCCTTTGTTTTGGGAGTATGG-CAAGGTTAAGAGGTTCTC 989
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||
Sbjct 839 GCCCGATGCATCGGTTGTATTCCTTTGTTTTGGGAGTATGGGCA-GGTTAAGAGGTCCTC 897
Query 990 TAGTGAAGGAAATAGCTCATGGACTTGAGCTATGTCAATATAGATTCCTCTGGTCACTCC 1049
||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |
Sbjct 898 TAGTGAAGGAAATAGCTCATGCACTTGAGCTCTGTCAGTACAGATTCCTCTGGTCACTTC 957
Query 1050 GTAAAGAAGAGGTGACAAAGGATGAT-TTG--CCAGAGGGGTTCCTTGACCGTGTC-GAT 1105
||| ||||| |||| || |||||| || || ||||| ||||||||||||||| | |
Sbjct 958 GTACTGAAGAAATGACGAACGATGATCTTTTTCCCGAGGGATTCCTTGACCGTGTCAG-T 1016
Query 1106 GGACGTGGAATGATATGTGGTTGGTCTCCTCAGGTAGAAATACTGGCCCATAAGGCAGTG 1165
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1017 GGACGTGGAATGATATGCGGTTGGTCTCCTCAGGTGGAAATACTGGCCCATAAAGCAGTT 1076
Query 1166 GGAGGCTTTGTTTCTCACTGTGGATGGAACTCAATAGTAGAGAGTTTGTGGTTTGGCGTG 1225
||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 1077 GGAGGTTTTGTGTCTCATTGTGGATGGAACTCAATAGTAGAGAGTTTATGGTTTGGTGTG 1136
Query 1226 CCAATTGTGACATGGCCAATGTATGCAGAGCAACAACTCAATGCGTTTCTGATGGTGAAG 1285
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1137 CCAATTGTGACATGGCCAATGTATGCAGAGCAACAGCTCAATGCGTTTCTGATGGTTAAG 1196
Query 1286 GAACT-GAAGCTAGCTGTGGAGCTGAAGCTTGATTACAGGGTACATAGTGATGAGATAGT 1344
||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||
Sbjct 1197 GAACTAGA-GCTCGCAGTGGAGCTGAAGCTTGATTACAGGGTATATAGCGATGAAATAGT 1255
Query 1345 AAACGCAAACGAGATAGAGACCGCTATTCGTTATGTAATG-GACACGGATAATAATGTTG 1403
||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||
Sbjct 1256 AAATGCAAACGAGATAGAGACTGCTATTCGTTGTGTAATGAG-CAAGGATAATAATGTTG 1314
Query 1404 TGAGGAA-ACGAGTGATGGATATCTCGCAGATGATC-CAGAGAGCTACGAAG-AATGGTG 1460
||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | | || ||||||| | |||||||
Sbjct 1315 TGAGGAAGA-GAGTGATGGATATCTCGAAGATGG-CGCGGAAAGCTACGT-GTAATGGTG 1371
Query 1461 GATCTTCGTT-TGCCGCAATTGAGAAATTCATATATGACGTGATAGGAATTAAGCCCTAG 1519
||||||||| | | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1372 GATCTTCGTACT-CGGCTATTGAGAAATTCATACATGACGTGATAGGAATTAAGCCCAAG 1430
Query 1520 CCTTTTCTTGTCCAATAAG 1538
|||||||||||||||||||
Sbjct 1431 CCTTTTCTTGTCCAATAAG 1449
> Ahg887717 jgi|Araly1|887717|Al_scaffold_0278_2
Length=1350
Score = 1805 bits (977), Expect = 0.0
Identities = 1227/1346 (91%), Gaps = 24/1346 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 189 GGCGTCTCATTGAGCAAGATGATAGGATCCGTATCACAATCCTCTTGATGAAACTACAAG 248
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 14 GGCGTCTCATTGAGCAAGATGATAGGATCCGTATCACAATCCTCTTGATGAAGCTACAAG 73
Query 249 GTCAGTCTCATCTAGACACTTATGTTAAATCAATTGCCTCCTCTCAACCGTTTGTTAGAT 308
||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||
Sbjct 74 GTCAGTCACATCTAGACACTTATGTTAAATCTATGGCCTCTTCTCAGCCCTTTGTTAGAT 133
Query 309 TCATTGATGTCCCTGAGTTAGAGGAGAAACCTACACTTGGTAGTACACAATCTGTGGAAG 368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||
Sbjct 134 TCATTGATGTCCCTGAGTTAGAGGAGAAACCTACACTTGGTGGTACACAGTCTGTGGAAG 193
Query 369 CTTATGTGTATGATGTTATTGAGA-GAAATATCCCTCTTGTGAGGAATATAGTCATGGAT 427
||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 194 CTTATGTATATGATGTTATTGAGAAGAA-TATCCCTCTTGTGAGAAATATAGTCATGGAT 252
Query 428 ATTTTAACTTCTCTTGCATTGGATGGAGTTAAGGTCAAGGGATTAGTTGTTGACTTTTTC 487
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||
Sbjct 253 ATTTTATCTTCTCTTGCATTGGATGGAGTTAAGGTCAAGGGATTTGTTGCTGATTTTTTC 312
Query 488 TGTCTCCCTATGATTGACGTTGCTAAAGA--TA-TAAGTCTCCCTTTCTATGTGTTCTTG 544
|||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 313 TGTCTCCCCATGATTGACGTTGCAAAAGAGGTAATAAGTCTTCCTTTCTATGTGTTCTTG 372
Query 545 ACTACAAATTCCGGGTTCTTAGCTATGATGCAGTATCTAGCAGATCGACATAGTAGAGAT 604
||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 373 ACTACAAATTCCGGGTTCTTAGCGATGATGAAGTATCTAGCAGATCGACATAGTAAAGAT 432
Query 605 ACATCGGTTTTTGTAAGAAACTCGGAAGAAATGTTGTCGATACCTGGATTTGTAAACCCT 664
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 433 ACATCGGTTTTTGTAAGAAACTCCGAGGAAATGTTGTCGATTCCTGGCTTTGTAAACCCT 492
Query 665 GTCCCAGCCAATGTTCTGCCGTCAGCTCTGTTTGTTGAAGATGGTTATGATGCTTACGTT 724
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||
Sbjct 493 GTCCCAGCCAATGTTCTGCCATCAGCTCTGTTTGTTGAAGACGGTTATGATGCTTACATT 552
Query 725 AAGCTGGCCATATTGTTTACAAAGGCCAATGGAATCCTAGTGAATAGCT-CCTTTGATAT 783
|| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||
Sbjct 553 AAACTGGCTATATTGTTTACAAAGGCTAATGGAATCTTAGTGAATT-CTTCCTTTGATAT 611
Query 784 TGAGCCTTACTCTGTGAATCATTTTCTTCAAGAACAGAATTATCCTTCTGTTTATGCTGT 843
||||||||||||||| ||||| |||||| | |||| || ||| |||||||||||||||||
Sbjct 612 TGAGCCTTACTCTGTCAATCACTTTCTTGATGAACGGAGTTACCCTTCTGTTTATGCTGT 671
Query 844 TGGCCCCATATTTGACTTGAAAGCCCAGCCTCATCCAGAGCAGGACCTAACCCGTCGTGA 903
||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 672 TGGCCCCGTATTTGACTTGAAGGCCCAGCCTCATCCAGAGCAGGACCTGGCCCGTCGTGA 731
Query 904 CGAGTTGATGAAATGGCTTGATGATCAACCCGAGGCATCGGTTGTATTCCTTTGTTTTGG 963
||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 732 CGAGTTGATGAAATGGCTTGATGATCAGCCCGATGCATCGGTTGTATTCCTTTGTTTTGG 791
Query 964 GAGTATGG-CAAGGTTAAGAGGTTCTCTAGTGAAGGAAATAGCTCATGGACTTGAGCTAT 1022
|||||||| || |||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 792 GAGTATGGGCA-GGTTCAGACGTCCTCTAGTGAAGGAAATAGCTCATGCACTTGAGCTCT 850
Query 1023 GTCAATATAGATTCCTCTGGTCACTCCGTAAAGAAGAGGTGACAAAGGATGAT-TTG--C 1079
|||| || ||||||||||||||||| |||| ||||| |||| || |||||| || |
Sbjct 851 GTCAGTACAGATTCCTCTGGTCACTTCGTACTGAAGAAATGACGAACGATGATCTTTTTC 910
Query 1080 CAGAGGGGTTCCTTGACCGTGTC-GATGGACGTGGAATGATATGTGGTTGGTCTCCTCAG 1138
| ||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 911 CCGAGGGATTCCTTGACCGTGTCAG-TGGACGGGGAATGATATGCGGTTGGTCTCCTCAG 969
Query 1139 GTAGAAATACTGGCCCATAAGGCAGTGGGAGGCTTTGTTTCTCACTGTGGATGGAACTCA 1198
|| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 970 GTGGAAATACTGGCCCATAAAGCAGTTGGAGGTTTTGTGTCTCATTGTGGATGGAACTCA 1029
Query 1199 ATAGTAGAGAGTTTGTGGTTTGGCGTGCCAATTGTGACATGGCCAATGTATGCAGAGCAA 1258
|||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030 ATAGTAGAGAGTTTATGGTTTGGTGTGCCAATTGTGACATGGCCAATGTATGCAGAGCAA 1089
Query 1259 CAACTCAATGCGTTTCTGATGGTGAAGGAACT-GAAGCTAGCTGTGGAGCTGAAGCTTGA 1317
|| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| || |||||||||||||||||
Sbjct 1090 CAGCTCAATGCGTTTCTGATGGTTAAGGAACTAGA-GCTCGCAGTGGAGCTGAAGCTTGA 1148
Query 1318 TTACAGGGTACATAGTGATGAGATAGTAAACGCAAACGAGATAGAGACCGCTATTCGTTA 1377
|||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1149 TTACAGGGTATATAGCGATGAAATAGTAAATGCAAACGAGATAGAGACTGCTATTCGTTG 1208
Query 1378 TGTAATG-GACACGGATAATAATGTTGTGAGGAA-ACGAGTGATGGATATCTCGCAGATG 1435
||||||| | || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1209 TGTAATGAG-CAAGGATAATAATGTTGTGAGGAAGA-GAGTGATGGATATCTCGAAGATG 1266
Query 1436 ATC-CAGAGAGCTACGAAGAATGGTGGATCTTCGTT-TGCCGCAATTGAGAAATTCATAT 1493
| | || ||||||| | |||||||||||||||| | | || |||||||||||||||
Sbjct 1267 G-CGCGGAAAGCTACGTATAATGGTGGATCTTCGTACT-CGGCTATTGAGAAATTCATAC 1324
Query 1494 ATGACGTGATAGGAATTAAGCCCTAG 1519
||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1325 ATGACGTGATAGGAATTAAGCTCTAG 1350
> Ahg481887 jgi|Araly1|481887|fgenesh2_kg.4__947__AT2G29710.1
Length=1527
Score = 1799 bits (974), Expect = 0.0
Identities = 1281/1431 (90%), Gaps = 14/1431 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 105 TGTTGTTAGAGATGCGGAATGTAGAGCTCATCTTCATCCCCACACCAACCGTTGGTCATC 164
|||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||
Sbjct 33 TGTTGTTAGAGATGAGGAATGCAGAGCTCATCTTCATCCCTACACCGACTGTTGGTCATC 92
Query 165 TTGTTCCGTTTCTTGAATTTGCTAGGCGTCTCATTGAGCAAGATGATAGGATCCGTATCA 224
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||
Sbjct 93 TTGTTCCGTTTCTTGAATTTGCTAGGCGTCTGATTGACCAGGATGATAGAATCCGTATCA 152
Query 225 CAATCCTCTTGATGAAACTACAAGGTCAGTCTCATCTAGACACTTATGTTAAATCAATTG 284
| |||||| |||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||
Sbjct 153 CCATCCTCAAGATGAAGCAACAAGGTCAGTCTCATCTGGATTCCTATGTTAAATCAATTG 212
Query 285 CCTCCTCTCAACCGTTTGTTAGATTCATTGATGTCCCTGAGTTAGAGGAGAAACCTACAC 344
|||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 213 CCTCTTCTCAGCCCTTTGTTAGATTCATTGATGTTCCTGAGTTAGAGGAGAAACCTACAC 272
Query 345 TTGGTAGTACACAATCTGTGGAAGCTTATGTGTATGATGTTATTGAGAGAAATATCCCTC 404
|||||| |||| ||||| ||||||||||| || ||| ||||||| | |||||| ||||
Sbjct 273 TTGGTA---CACAGTCTGTAGAAGCTTATGTATACGATTTTATTGAAAAAAATATTCCTC 329
Query 405 TTGTGAGGAATATAGTCATGGATATTTTAACTTCTCTTGCATTGGATGGAGTTAAGGTCA 464
||||||| |||||| |||||| ||| ||| |||||| |||||| |||||||||| |||||
Sbjct 330 TTGTGAGAAATATAATCATGGGTATCTTATCTTCTCCTGCATTTGATGGAGTTACGGTCA 389
Query 465 AGGGATTAGTTGTTGACTTTTTCTGTCTCCCTATGATTGACGTTGCTAAAGATATAAGTC 524
||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||
Sbjct 390 AGGGATTCGTTGCTGATTTTTTCTGTCTCCCAATGATTGACGTTGCAAAAGATGTAAGTC 449
Query 525 TCCCTTTCTATGTGTTCTTGACTACAAATTCCGGGTTCTTAGCTATGATGCAGTATCTAG 584
||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
Sbjct 450 TCCCTTTTTATGTGTTCTTGACTACGAATTCGGGGTTCCTAGCTATGATGCAGTATCTGG 509
Query 585 CAGATCGACATA-GTAGAGATACATCGGTTTTTGTAAGAAACTCGGAAGAAATGTTGTCG 643
||| |||||||| | | |||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 510 CAGTTCGACATAAGAA-AGATACCTCAGTTTTTGCAAGAAACTCTGAAGAAATGTTGTCG 568
Query 644 ATACCTGGATTTGTAAACCCTGTCCCAGCCAATGTTCTGCCGTCAGCTCTGTTTGTTGAA 703
|| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 569 ATTCCTGGATTTGAAAACCCTGTCCCAGCCAAAGTTCTGCCGTCAGCTCTGTTTGTTGAA 628
Query 704 GATGGTTATGATGCTTACGTTAAGCTGGCCATATTGTTTACAAAGGCCAATGGAATCCTA 763
||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 629 GATGGTTATGATGCTGACGTTAAACTGGCTACATTGTTTACAAAGGCCAATGGAATCCTA 688
Query 764 GTGAATAGCTCCTTTGATATTGAGCCTTAC-TCTGTGAATCATTTTCTTCAAGAACAGAA 822
||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 689 GTGAATACCTCCTTTGATATTGAGCCT-ACCTCTCTGAATCATTTTCTTGAAGAACAAAA 747
Query 823 TTATCCTTCTGTTTATGCTGTTGGCCCCATATTTGACTTGAAAGCCCAGCCTCATCCAGA 882
||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||
Sbjct 748 TTACCCTTCTATTTATGCTGTTGGCCCCATATTTAACCCGAAGGCCCATCCTCATCCAGA 807
Query 883 GCAGGACCTAACCCGTCGTGACGAGTTGATGAAATGGCTTGATGATCAACCCGAGGCATC 942
|||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 808 TCAGGACCTCGCCCGTTGTGACGAGTCGAAGAAATGGCTTGATGCTCAACCCGAGGCATC 867
Query 943 GGTTGTATTCCTTTGTTTTGGGAGTATGG-CAAGGTTAAGAGGTTCTCTAGTGAAGGAAA 1001
|||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 868 AGTTGTATTCCTTTGTTTTGGGAGTATGGGCA-GCTTAAGAGGTCCTCTAGTGAAGGAAA 926
Query 1002 TAGCTCATGGACTTGAGCTATGTCAATATAGATTCCTCTGGTCACTCCGTAAAGAAGAGG 1061
|||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |
Sbjct 927 TAGCACATGGACTTGAGCTATGTCAGTACAGATTCCTCTGGTCACTCCGCGCAGAAGAAG 986
Query 1062 TGACAAAGGATGAT-TT--GCCAGAGGGGTTCCTTGACCGTGTCGATGGACGTGGAATGA 1118
||||||| |||||| || ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||
Sbjct 987 TGACAAACGATGATCTTTTGCCAGAGGGATTCATTGACCGTGTCGGTGGACGGGGAATGA 1046
Query 1119 TATGTGGTTGGTCTCCTCAGGTAGAAATACTGGCCCATAAGGCAGTGGGAGGCTTTGTTT 1178
|||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |
Sbjct 1047 TATGCAGTTGGTCCCCTCAGGTGGAAATACTGGCCCATAAAGCAGTTGGAGGTTTTGTGT 1106
Query 1179 CTCACTGTGGATGGAACTCAATAGTAGAGAGTTTGTGGTTTGGCGTGCCAATTGTGACAT 1238
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1107 CTCATTGTGGATGGAACTCAATAGTAGAGAGTTTATGGTTTGGTGTGCCAATTGTGACAT 1166
Query 1239 GGCCAATGTATGCAGAGCAACAACTCAATGCGTTTCTGATGGTGAAGGAACTGAAGCTAG 1298
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1167 GGCCAATGTATGCAGAGCAACAGCTCAATGCGTTTCTGATGGTGAAGGAACTGAAGCTCG 1226
Query 1299 CTGTGGAGCTGAAGCTTGATTACAGGGTACATAGTGATGAGATAGTAAACGCAAACGAGA 1358
| |||||| |||| || |||||||| |||||||||| |||| | |||| ||||||||||
Sbjct 1227 CAGTGGAGATGAAACTCGATTACAGTGTACATAGTGGTGAGCTTGTAAGTGCAAACGAGA 1286
Query 1359 TAGAGACCGCTATTCGTTATGTAATGGACACGGATAATAATGTTGTGAGGAA-ACGAGTG 1417
||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | |||||
Sbjct 1287 TAGAGACTGCTATTCGTTGTGTAATGAACAAGGATAATAATGTTGTTAGGAAGA-GAGTG 1345
Query 1418 ATGGATATCTCGCAGATGATCCAGAGAGCTACGAAGAATGGTGGATCTTCGTTTGCCGCA 1477
|||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1346 ATGGGTATCTCTCAGATGGTCCAGAGAGCTACGAAGAATGGCGGATCTTCGTTTGCCGCT 1405
Query 1478 ATTGAGAAATTCATATATGACGTGATAGGAATTAAGCCCTAGCCTTTTCTT 1528
||||||||||||||| || ||||||||||| | | | ||||||||||||
Sbjct 1406 ATTGAGAAATTCATACATTACGTGATAGGAGCCAGGACTTAGCCTTTTCTT 1456
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 61668106655
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5