BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G30110.1
Length=3626
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg481921 jgi|Araly1|481921|fgenesh2_kg.4__981__AT2G30110.1 5782 0.0
Ahg359413 jgi|Araly1|359413|fgenesh1_pg.C_scaffold_201000003 1858 0.0
> Ahg481921 jgi|Araly1|481921|fgenesh2_kg.4__981__AT2G30110.1
Length=3632
Score = 5782 bits (3131), Expect = 0.0
Identities = 3478/3640 (96%), Gaps = 45/3640 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 8 GAGATTTCTGCAAAATTCGTCACTTCAATTTCAATTTTCAGATCTCAAAAACTTTTTCTC 67
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1 GAGATTTTTGCAAAATTCGTCACTTCAATTTCAATTTTCAGATCTCAAACTTTTTTTCTC 60
Query 68 TTTTCCGATTCCAATCTTCTCTCGTCTGCTTTCCTCAAAGGTTTTTTCATCACTTTATGC 127
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TTTTCCGATTCCAATCTTCTCTCGTCTGCTTTCCTCAAAGGTTTTTTCATCACTTTATGC 120
Query 128 TTCACAAGCGAGCTAGTGAAGCTAACGATAAGAACGATAATACCATCATCGGTTCCGATT 187
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 121 TTCACAAGCGAGCTAGTGAAGCTAACGATAAGAACGATAATAGCATCATCGGTTCCGATT 180
Query 188 TAGCATCATCTAAGAAACGCCGTATCGATTTCACTGA---ATCTTCGTCTGATAAGT-CT 243
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 181 TAGCATCATCTAAGAAACGCCGTATCGATATCACTGATTCTTCTTCGTCTGATAA-TAAG 239
Query 244 TCTTCGATT-TTAGCTTCT-G--GTAGTAGCAG--G-GGTTTTCACGGCGATAGCGTCGT 296
||||||||| || |||||| | ||||||| || | || |||||||||||||||||||
Sbjct 240 TCTTCGATTGTT-GCTTCTGGTAGTAGTAGTAGTAGCGGATTTCACGGCGATAGCGTCGC 298
Query 297 TCAGCAAATCGACATGGCTTTTGGTAATTCGAACCGTCAGGAGATTGATGAAGATCTGCA 356
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 299 TCACCAAATCGACATGGCTTTTGGTAATTCGAACCGTCAGGAGATTGATGAAGATCTGCA 358
Query 357 CAGTCGCCAGCTCGCCGTCTATGGTCGTGAGACTATGAGGCGTCTCTTTGCTTCCAATGT 416
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 359 TAGTCGGCAGCTCGCCGTCTATGGTCGTGAGACTATGAGGCGTCTCTTTGCTTCGAATGT 418
Query 417 TCTCATCTCGGGGATGCACGGTCTTGGTGCCGAGATTGCCAAGAATCTTATACTTGCTGG 476
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 419 TCTCATCTCGGGGATGCACGGGCTTGGTGCCGAGATTGCCAAGAATCTTATTCTTGCTGG 478
Query 477 TGTGAAGTCTGTGACCTTGCATGATGAAAGAGTTGTAGAGCTATGGGACTTATCAAGCAA 536
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 479 TGTGAAGTCTGTGACCTTGCATGATGAAAGAGTTGTAGAGCTATGGGACTTATCTAGCAA 538
Query 537 CTTTGTTTTCTCGGAGGATGATGTTGGCAAGAATAGAGCAGATGCTTCTGTTCAGAAGTT 596
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 539 CTTTGTTTTCTCGGAGGATGATGTTGGCAAGAATAGAGCGGATGCTTCTGTTCAGAAGTT 598
Query 597 ACAGGATCTTAACAATGCTGTGGTTGTCTCTAGCTTGACCAAAAGCTTAAAC-AAAGAGG 655
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 599 ACAGGATCTTAACAATGCTGTGGTTGTCTCTAGCTTGACCAAAAGCTT-AACTAAAGAGG 657
Query 656 ATCTTTCTGGCTTCCAGGTTGTTGTATTCTCTGACATAAGCATGGAAAGAGCAATCGAAT 715
|||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 ATCTTTCTGGTTTCCAGGTTGTTGTTTTCTCTGACATAAGCATGGAAAGAGCAATCGAAT 717
Query 716 TTGATGACTATTGTCACAGCCATCAGCCTCCTATCGCTTTTGTCAAGGCTGATGTCAGGG 775
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 718 TTGATGACTATTGTCACAGCCATCAGCCTCCTATCGCTTTTGTCAAAGCTGACGTCAGGG 777
Query 776 GTCTTTTCGGCTCTGTCTTTTGTGATTTTGGGCCTGAATTTGCGGTTCTTGATGTTGATG 835
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 778 GTCTTTTCGGCTCTGTCTTTTGTGATTTTGGGCCTGAATTTGCGGTTCTTGATGTTGATG 837
Query 836 GAGAGGAACCCCATACAGGCATCATTGCGTCTATCTCTAATGAGAACCAGGCATTTATTT 895
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 838 GAGAGGAACCCCATACAGGCATCATTGCGTCTATCTCTAATGAGAACCAGGCATTTATTT 897
Query 896 CCTGTGTCGACGATGAGAGGCTTGAGTTTGAAGATGGTGACCTAGTTGTTTTCTCAGAAG 955
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 898 CCTGTGTCGACGATGAGAGGCTTGAATTTGAAGATGGTGACCTAGTTGTTTTCTCAGAAG 957
Query 956 TTGAGGGTATGACAGAATTGAATGATGGGAAACCAAGGAAGATAAAAAGTACACGGCCAT 1015
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 958 TTGAGGGCATGACAGAATTGAATGATGGGAAACCAAGGAAGATAAAAAGTGCACGGCCAT 1017
Query 1016 ATTCATTCACCCTTGATGAGGACACTACTAACTATGGAACATATGTGAAGGGTGGTATTG 1075
||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 ATTCATTCATTCTTGATGAGGACACTTCAAACTATGGAACATATGTGAAGGGTGGTATTG 1077
Query 1076 TCACTCAAGTGAAACAGCCAAAGTTACTGAATTTCAAGCCATTGAGGGAAGCGCTTAAGG 1135
||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
Sbjct 1078 TCACTCAAGTGAAACAGCCTAAGTTGCTGAATTTCAAGCCACTGAGGGAAGCACTTAAAG 1137
Query 1136 ATCCAGGGGATTTTCTATTTAGTGATTTCTCTAAGTTTGATCGGCCTCCACTCCTTCACT 1195
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||
Sbjct 1138 ATCCAGGGGATTTTCTATTTAGTGATTTCTCTAAGTTTGACCGCCCTCCACTTCTTCACT 1197
Query 1196 TAGCATTCCAGGCACTTGATCATTTTAAAGCTGAAGCTGGCAGATTTCCTGTTGCTGGCT 1255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1198 TAGCATTCCAGGCACTTGATCATTTTAAAGCTGAAGCTGGCAGATTTCCTGTTGCTGGCT 1257
Query 1256 CAGAAGAGGACGCTCAGAAGCTTATATCGATTGCCACAGCCATCAATACCGGGCAGGGTG 1315
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 CAGAAGAGGACGCTCAGAAGCTTATATCGATTGCCACAGCCATCAATACCGGGCAGGGTG 1317
Query 1316 ATTTAAAGGTGGAGAATGTTGATCAGAAGCTTCTAAGACACTTTTCCTTTGGAGCCAAGG 1375
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1318 ATTTAAAGGTGGAGAATGTTGACCAGAAGCTTCTACGACACTTTTCCTTTGGAGCCAAGG 1377
Query 1376 CTGTCCTGAATCCTATGGCTGCAATGTTTGGCGGTATTGTTGGACAGGAGGTTGTTAAAG 1435
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1378 CTGTCCTGAATCCCATGGCTGCAATGTTTGGCGGTATTGTTGGACAGGAGGTTGTTAAAG 1437
Query 1436 CTTGCTCTGGAAAATTTCATCCTCTCTTCCAGTTTTTCTACTTTGATTCAGTGGAGTCAC 1495
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1438 CTTGCTCTGGAAAATTTCATCCTCTCTTCCAGTTTTTCTACTTTGATTCAGTGGAGTCAC 1497
Query 1496 TCCCCTCTGAACCTGTGGACTCGAGTGACTTTGCACCAAGAAACAGCCGGTATGATGCCC 1555
| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1498 TACCCACTGAACCTCTGGACTCGAGTGACTTTGCACCAAGAAACAGCCGGTATGATGCCC 1557
Query 1556 AAATATCTGTATTTGGGGCCAAGTTCCAGAAGAAACTTGAAGATGCTAAAGTTTTCACAG 1615
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1558 AAATATCTGTATTTGGGGCCAAGTTCCAGAAGAAACTTGAAGATGCTAAAGTTTTCACAG 1617
Query 1616 TAGGGTCTGGTGCTCTTGGCTGTGAGTTCTTGAAAAATTTGGCTCTGATGGGGGTTTCTT 1675
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1618 TAGGGTCTGGTGCTCTTGGCTGTGAGTTCTTGAAAAATATGGCTCTGATGGGGGTTTCTT 1677
Query 1676 GTGGAAGCCAAGGGAAGCTGACAGTGACAGATGATGATATCATTGAGAAGAGTAACCTCA 1735
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 1678 GTGGAAGCCAAGGGAAGCTGACAGTGACAGATGATGATATAATCGAGAAGAGTAACCTCA 1737
Query 1736 GTCGTCAATTTCTGTTCCGTGACTGGAACATTGGACAGGCTAAATCCACAGTTGCTGCTT 1795
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1738 GTCGTCAATTTCTGTTCCGTGACTGGAACATCGGACAGGCTAAATCCACAGTTGCTGCTT 1797
Query 1796 CGGCTGCTGCTGTTATAAATCCTCGCTTCAACATTGAGGCCCTGCAAAACCGTGTTGGCG 1855
|||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1798 CGGCTGCTGCTGCTATAAATCCCCGCTTCAACATTGAGGCCCTGCAAAACCGTGTTGGCG 1857
Query 1856 CGGAGACTGAGAATGTATTTGACGATGCCTTCTGGGAGAACTTAACTGTTGTCGTCAATG 1915
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1858 CTGAGACTGAGAATGTATTTGACGATGCCTTCTGGGAGAACTTAACTGTTGTCGTCAATG 1917
Query 1916 CACTGGATAATGTTAATGCGAGGCTCTATGTTGATTCGAGGTGCTTGTATTTCCAGAAGC 1975
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1918 CACTGGATAATGTCAATGCGAGGCTCTATGTTGATTCGAGGTGCTTGTATTTCCAGAAGC 1977
Query 1976 CTCTCCTTGAGTCTGGAACTCTTGGTACAAAGTGCAACACACAG-TCGGTTATCCCACAT 2034
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 1978 CTCTCCTTGAGTCTGGAACTCTTGGTGCAAAGTGCAACACACAGAT-GGTTATCCCACAT 2036
Query 2035 CTAACTGAAAATTACGGTGCCTCAAGGGACCCACCAGAGAAACAGGCCCCCATGTGTACA 2094
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2037 CTAACTGAAAATTACGGTGCCTCAAGGGACCCACCAGAGAAACAAGCCCCCATGTGTACA 2096
Query 2095 GTGCATTCCTTCCCGCATAACATTGATCACTGTTTAACTTGGGCTCGCTCTGAGTTTGAG 2154
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2097 GTGCATTCGTTTCCGCATAACATTGATCACTGTTTAACTTGGGCTCGCTCTGAGTTTGAG 2156
Query 2155 GGTCTGCTGGAGAAGACTCCCGCTGAAGTGAATGCATATCTTTCTAGCCCAGTTGAGTAC 2214
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2157 GGTCTGCTGGAGAAGACTCCTGCTGAAGTGAATGCATATCTCTCTAGCCCAGTTGAGTAC 2216
Query 2215 ACTAACTCAATGATGAGTGCTGGTGATGCTCAGGCGAGGGACACATTGGAGAGGATTGTT 2274
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||
Sbjct 2217 ACTAACTCAATGATGAGTGCTGGTGATGCTCAGGCGAGGGAGACATTGGAGAGGATTCTT 2276
Query 2275 GAGTGCCTTGAAAAGGAGAAGTGTGAGACCTTCCAAGACTGCTTAACCTGGGCACGACTG 2334
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2277 GAGTGCCTTGACAAGGAGAAGTGTGAGACCTTCCAAGACTGCTTAACCTGGGCTCGACTG 2336
Query 2335 AGGTTTGAGGATTACTTTGTGAACCGTGTCAAGCAATTGATATACACATTTCCTGAAGAT 2394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2337 AGGTTTGAGGATTACTTTGTGAACCGTGTCAAGCAATTGATATACACATTTCCTGAAGAT 2396
Query 2395 GCTGCGACTAGTACCGGAGCTCCATTCTGGTCTGCTCCAAAAAGATTCCCTCGTCCACTC 2454
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2397 GCTGCGACTAGTACCGGATCTCCATTCTGGTCTGCTCCGAAAAGATTCCCTCGTCCACTC 2456
Query 2455 CAGTACTCGTCGTCCGACCCAAGTCTCCTTAACTTTATCACAGCGACTGCTATTTTACGA 2514
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 2457 CAGTACTCGTCTTCTGACCCAAGTCTCCTTAACTTTATCACAGCAACTGCTATTCTACGA 2516
Query 2515 GCAGAGACATTTGGGATCCCGATACCTGAGTGGACTAAGAACCCAAAGGAAGCAGCAGAA 2574
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2517 GCAGAGACATTTGGGATCCCAATACCTGAGTGGACCAAGAACCCAAAGGAAGCAGCCGAA 2576
Query 2575 GCTGTTGACAGAGTGATAGTCCCAGACTTTGAGCCAAGGCAAGATGCAAAGATTGTGACT 2634
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2577 GCTGTGGACAGAGTGATAGTCCCAGACTTTGAGCCAAGGAAAGATGCAAAGATTGTGACT 2636
Query 2635 GATGAGAAAGCTACCACTTTAACCACTGCTTCGGTGGACGACGCTGCAGTCATCGACGAT 2694
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||
Sbjct 2637 GATGAGAAAGCCACCACTTTAACCACTGCTTCGGTGGACGATGCTGCAGTCATCAACGAT 2696
Query 2695 CTCATTGCTAAGATCGACCAGTGTAGGCATAACTTGTCGCCAGACTTCAGGATGAAACCT 2754
||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2697 CTCATTGCTAAGATCGAGCAGTGTAGGCGTAACTTGTCTCCAGACTTCAGGATGAAACCA 2756
Query 2755 ATTCAGTTCGAAAAGGATGATGATACAAACTATCACATGGATGTGATAGCAGGACTAGCC 2814
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 2757 ATTCAGTTTGAAAAGGATGATGATACAAACTATCACATGGACGTGATAGCGGGACTAGCC 2816
Query 2815 AACATGAGGGCGAGAAATTACAGCATCCCTGAAGTGGACAAGCTGAAAGCAAAGTTCATA 2874
|||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2817 AACATGAGGGCGAGGAATTACACCATTCCTGAAGTCGACAAGCTGAAAGCAAAGTTCATC 2876
Query 2875 GCAGGGAGAATCATCCCAGCCATTGCGACTTCAACAGCCATGGCTACTGGGCTGGTCTGC 2934
||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2877 GCAGGTAGAATCATTCCAGCCATTGCAACTTCAACAGCCATGGCTACTGGGCTGGTCTGC 2936
Query 2935 CTCGAGCTGTACAAGGTCCTTGATGGAGGACATAAAGTGGAAG-CTTACAGAAACACATT 2993
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 2937 CTCGAGCTGTACAAGGTCCTTGATGGAGGACACAAAGTGGAAGACT-ACAGAAACACATT 2995
Query 2994 TGCCAACCTGGCACTTCCACTATTCTCCATGGCTGAACCACTTCCACCAAAGGTGGTGAA 3053
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2996 TGCCAACCTGGCACTTCCACTCTTCTCCATGGCTGAACCAGTTCCACCAAAGGTGGTGAA 3055
Query 3054 GCACCGTGACATGGCTTGGACAGTTTGGGACAGATGGGTTCTCAAGGGAAACCCAACTCT 3113
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3056 GCACCGTGACATGGCTTGGACCGTTTGGGACAGATGGGTTCTCAAGGGAAACCCGACTCT 3115
Query 3114 TCGTGAGGTGTTGCAGTGGCTGGAGGACAAAGGGCTTAGCGCATACAGCATCTCTTGTGG 3173
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3116 TCGTGAGGTGTTACAGTGGCTGGAGGACAAAGGGCTTAGCGCATACAGCATCTCGTGTGG 3175
Query 3174 AAGCTGTCTTCTGTTCAACAGTATGTTCACAAGGCACAAGGAGAGGATGGACAAGAAGGT 3233
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3176 AAGCTGTCTTCTGTTCAACAGTATGTTCCCAAGGCACAAGGAGAGGATGGACAAGAAGGT 3235
Query 3234 TGTGGATCTCGCTCGGGATGTTGCGAAAGTCGAGTTACCGCCTTATCGCAACCATCTTGA 3293
||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||
Sbjct 3236 TGTGGATCTTGCTCGGGATATCGCGAAAGTCGAGTTACCACCTTACCGCCACCATCTTGA 3295
Query 3294 TGTAGTGGTGGCTTGTGAGGATGAAGATGACAATGACGTCGATATTCCTCTCGTCTCTAT 3353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3296 TGTAGTGGTGGCTTGTGAGGATGAAGATGACAATGACGTCGATATTCCTCTCGTCTCTAT 3355
Query 3354 CTACTTCAGGTGAAAAGTTTCGA--GA------GA-A---TGAA-GAAAGATGAAACTCT 3400
||||||||||||| || |||||| || || | |||| ||||||| |||||||
Sbjct 3356 CTACTTCAGGTGAGAATTTTCGAACGAAAAACAGACAGAATGAAAGAAAGATTAAACTCT 3415
Query 3401 TGAGAGCAAATTTGTGTGTTTT-GTCTCTGCATCTGCCCTACGTTATTATCTTTTGGATG 3459
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||
Sbjct 3416 TGAGAGCAAATTTGTGTGTTTTTGTCTCTGCATCTGCCCTACGT-ATTTTCTTT-GGATG 3473
Query 3460 CTTGTGGGTGAGATAACTGATTTTTAC-TTGAGGGGGATAGAGACTCATTTTATC-TCTC 3517
|||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||
Sbjct 3474 CTTGTGGGTGAGATGACTGATTTTTAAATTGCGGGGGATAGAGACCCATTTTATCATCTC 3533
Query 3518 TCGTTCTATTT-TAGTCTTTCTTTCTATGTACAATTGCTGAATGTGTGGTTTACACACCC 3576
||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct 3534 TCGTTCTATTTATAGTCTTTCTTTCTATGTATAATTGCTGA-TGTGTGTTTTACACACCC 3592
Query 3577 GTTACCTTCTA----AACATG-TT-CTATCAAACAAATCT 3610
|||||| |||| |||||| || |||||||||||||||
Sbjct 3593 GTTACCATCTATCTGAACATGCTTTCTATCAAACAAATCT 3632
> Ahg359413 jgi|Araly1|359413|fgenesh1_pg.C_scaffold_201000003
Length=1494
Score = 1858 bits (1006), Expect = 0.0
Identities = 1057/1082 (98%), Gaps = 2/1082 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1258 GAAGAGGACGCTCAGAAGCTTATATCGATTGCCACAGCCATCAATACCGGGCAGGGTGAT 1317
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 385 GAAGAGGACGCTCAGAAGCTTATATCGATTGCCACAGCCATCAATACCGGGCAGGGTGAT 444
Query 1318 TTAAAGGTGGAGAATGTTGATCAGAAGCTTCTAAGACACTTTTCCTTTGGAGCCAAGGCT 1377
|||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTAAAGGTGGAGAATGTTGACCAGAAGCTTCTACGACACTTTTCCTTTGGAGCCAAGGCT 504
Query 1378 GTCCTGAATCCTATGGCTGCAATGTTTGGCGGTATTGTTGGACAGGAGGTTGTTAAAGCT 1437
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 505 GTCCTGAATCCCATGGCTGCAATGTTTGGCGGTATTGTTGGACAGGAGGTTGTTAAAGCT 564
Query 1438 TGCTCTGGAAAATTTCATCCTCTCTTCCAGTTTTTCTACTTTGATTCAGTGGAGTCACTC 1497
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 565 TGCTCTGGAAAATTTCATCCTCTCTTCCAGTTTTTCTACTTTGATTCAGTGGAGTCACTA 624
Query 1498 CCCTCTGAACCTGTGGACTCGAGTGACTTTGCACCAAGAAACAGCCGGTATGATGCCCAA 1557
||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 625 CCCACTGAACCTCTGGACTCGAGTGACTTTGCACCAAGAAACAGCCGGTATGATGCCCAA 684
Query 1558 ATATCTGTATTTGGGGCCAAGTTCCAGAAGAAACTTGAAGATGCTAAAGTTTTCACAGTA 1617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 685 ATATCTGTATTTGGGGCCAAGTTCCAGAAGAAACTTGAAGATGCTAAAGTTTTCACAGTA 744
Query 1618 GGGTCTGGTGCTCTTGGCTGTGAGTTCTTGAAAAATTTGGCTCTGATGGGGGTTTCTTGT 1677
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 745 GGGTCTGGTGCTCTTGGCTGTGAGTTCTTGAAAAATATGGCTCTGATGGGGGTTTCTTGT 804
Query 1678 GGAAGCCAAGGGAAGCTGACAGTGACAGATGATGATATCATTGAGAAGAGTAACCTCAGT 1737
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 805 GGAAGCCAAGGGAAGCTGACAGTGACAGATGATGATATAATTGAGAAGAGTAACCTCAGT 864
Query 1738 CGTCAATTTCTGTTCCGTGACTGGAACATTGGACAGGCTAAATCCACAGTTGCTGCTTCG 1797
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 865 CGTCAATTTCTGTTCCGTGACTGGAACATCGGACAGGCTAAATCCACAGTTGCTGCTTCG 924
Query 1798 GCTGCTGCTGTTATAAATCCTCGCTTCAACATTGAGGCCCTGCAAAACCGTGTTGGCGCG 1857
|||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 925 GCTGCTGCTGCTATAAATCCCCGCTTCAACATTGAGGCCCTGCAAAACCGTGTTGGCGCT 984
Query 1858 GAGACTGAGAATGTATTTGACGATGCCTTCTGGGAGAACTTAACTGTTGTCGTCAATGCA 1917
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 985 GAGACTGAGAATGTATTTGATGATGCCTTCTGGGAGAACTTAACTGTTGTCGTCAATGCA 1044
Query 1918 CTGGATAATGTTAATGCGAGGCTCTATGTTGATTCGAGGTGCTTGTATTTCCAGAAGCCT 1977
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1045 CTGGATAATGTCAATGCGAGGCTCTATGTTGATTCGAGGTGCTTGTATTTCCAGAAGCCT 1104
Query 1978 CTCCTTGAGTCTGGAACTCTTGGTACAAAGTGCAACACACAG-TCGGTTATCCCACATCT 2036
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 1105 CTCCTTGAGTCTGGAACTCTTGGTGCAAAGTGCAACACACAGAT-GGTTATCCCACATCT 1163
Query 2037 AACTGAAAATTACGGTGCCTCAAGGGACCCACCAGAGAAACAGGCCCCCATGTGTACAGT 2096
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1164 AACTGAAAATTACGGTGCCTCAAGGGACCCACCAGAGAAACAAGCCCCCATGTGTACAGT 1223
Query 2097 GCATTCCTTCCCGCATAACATTGATCACTGTTTAACTTGGGCTCGCTCTGAGTTTGAGGG 2156
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1224 GCATTCGTTTCCGCATAACATTGATCACTGTTTAACTTGGGCTCGCTCTGAGTTTGAGGG 1283
Query 2157 TCTGCTGGAGAAGACTCCCGCTGAAGTGAATGCATATCTTTCTAGCCCAGTTGAGTACAC 2216
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1284 TCTGCTGGAGAAGACTCCCGCTGAAGTGAACGCATATCTCTCTAGCCCAGTTGAGTACAC 1343
Query 2217 TAACTCAATGATGAGTGCTGGTGATGCTCAGGCGAGGGACACATTGGAGAGGATTGTTGA 2276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1344 TAACTCAATGATGAGTGCTGGTGATGCTCAGGCGAGGGACACATTGGAGAGGATTGTTGA 1403
Query 2277 GTGCCTTGAAAAGGAGAAGTGTGAGACCTTCCAAGACTGCTTAACCTGGGCACGACTGAG 2336
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||
Sbjct 1404 GTGCCTTGACAAGGAGAAGTGTGAGACCTTCCAAGACTGCTTAACCTGGGCTCGATTGAG 1463
Query 2337 GT 2338
||
Sbjct 1464 GT 1465
Score = 507 bits (274), Expect = 3e-142
Identities = 336/363 (93%), Gaps = 16/363 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 106 AGGTTTTTTCATCACTTTATGCTTCACAAGCGAGCTAGTGAAGCTAACGATAAGAACGAT 165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 25 AGGTTTTTTCATCACTTTATGCTTCACAAGCGAGCTAGTGAAGCTAACGATAAGAACGAT 84
Query 166 AATACCATCATCGGTTCCGATTTAGCATCATCTAAGAAACGCCGTATCGATTTCACTGA- 224
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 85 AATAGCATCATCGGTTCCGATTTAGCATCATCTAAGAAACGCCGTATCGATATCACTGAT 144
Query 225 --ATCTTCGTCTGATAAGT-CTTCTTCGATT-TTAGCTTC---T-G--GTAGTAGCAG-- 272
|||||||||||||| | ||||||||| || ||||| | | ||||||| ||
Sbjct 145 TCTTCTTCGTCTGATAA-TAAGTCTTCGATTGTT-GCTTCTGGTAGTAGTAGTAGTAGTA 202
Query 273 G-GGTTTTCACGGCGATAGCGTCGTTCAGCAAATCGACATGGCTTTTGGTAATTCGAACC 331
| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 203 GCGGATTTCACGGCGATAGCGTCGCTCACCAAATCGACATGGCTTTTGGTAATTCGAACC 262
Query 332 GTCAGGAGATTGATGAAGATCTGCACAGTCGCCAGCTCGCCGTCTATGGTCGTGAGACTA 391
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 263 GTCAGGAGATTGATGAAGATCTGCATAGTCGGCAGCTCGCCGTCTATGGTCGTGAGACTA 322
Query 392 TGAGGCGTCTCTTTGCTTCCAATGTTCTCATCTCGGGGATGCACGGTCTTGGTGCCGAGA 451
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 323 TGAGGCGTCTCTTTGCTTCCAATGTTCTCATCTCGGGGATGCACGGTCTTGGTGCCGAGA 382
Query 452 TTG 454
|||
Sbjct 383 TTG 385
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 136969205227
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5