BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT2G31020.1 Length=2422 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg482026 jgi|Araly1|482026|fgenesh2_kg.4__1086__AT2G31020.1 3594 0.0 Ahg933629 jgi|Araly1|933629|scaffold_401617.1 1999 0.0 Ahg489733 jgi|Araly1|489733|fgenesh2_kg.6__2867__AT4G08180.3 1107 0.0 > Ahg482026 jgi|Araly1|482026|fgenesh2_kg.4__1086__AT2G31020.1 Length=2385 Score = 3594 bits (1946), Expect = 0.0 Identities = 2176/2288 (95%), Gaps = 11/2288 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGTACGCCGCCACACCCGAAACTCCTTTCGGTTCCGCGAGATCACAACCGGTTATTACC 60 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| Sbjct 1 ATGTACGCCGCCACACCCGGAACTCCTTTCGGTTCCGCGAGGTCCCAACCTGTTATTACT 60 Query 61 CGATCTGTCTCACAACGATATAACCATCCAGGTCAAAGTAATCACCATCATCTCCTCCAC 120 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| Sbjct 61 CGATCTGTCTCACAACGATATAACCATCCCTGTCAAACTAATAACCATCATCTCCTCCAC 120 Query 121 AGTCTCTCATTTAACCACCAGAACGTACTAGCCTTACCGGCAGCAGCAAGGGAGCCGCCT 180 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct 121 AGTCTCTCATTTAACCACCAGAACGTATTAGCCTTGCCGGCAGCGGCAAGGGAGCCGCCT 180 Query 181 GTGGATGTCAAGATTAACGATATCGCTGGGAATTCGATTGCCGGG-ATATTGTACAAATG 239 |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| Sbjct 181 GTGGATGTTAAAATTAACGATATCGCCGGGAATTCGATTG-CGGGAATATTGTACAAATG 239 Query 240 GGTGAACTATGGGAAAGGATGGAGACCAAGATGGTTTGTTTTGCAAGATGGAGTGCTTTC 299 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 240 GGTGAACTATGGGAAAGGATGGAGACCGAGATGGTTTGTTTTGCAAGATGGAGTGCTTTC 299 Query 300 ATATTATAAAATCAAGGGACCTGATAAGATCGTTGTTATCCATGAGACTGAGAAAGGATC 359 || ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| Sbjct 300 GTACTATAAGATCCATGGACCTGATAAGATCGTTGTTTTACGTGAGACTGAGAAAGGATC 359 Query 360 AAGAGTGATCGGAGAGGAGTCCACACGTATGATCTCTAGGAATAAGCGTCACGCCGCCAC 419 || ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| || Sbjct 360 TAGGGTGATCGGAGAGGTGTCCACGCGTATGATCTCCAGGAATAACCGTCACGCCGGCAA 419 Query 420 TAACAACACCAACCACCAGCTCCGCCGCAAGCCATTCGGCGAAGTTCATCTCAAGGTTTC 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| Sbjct 420 TAACAACACCAACCACCAGCTCCGCCGCAAGCCATTTGGCGAAGTCCACCTCAAGGTTTC 479 Query 480 ATCGATTCGGGAGAGTAGATCAGATGATAAGAGATTTTCAATATTCACCGGCACCAAGAG 539 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 480 ATCAATTCGGGAGAGTAGATCAGATGATAAGAGATTTTCAATATTCACCGGCACCAAGAG 539 Query 540 GCTTCACCTACGTGCAGAGACAAGAGAGGACAGAGAAGCTTGGATAGAGGCTTTACAAGC 599 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct 540 GCTTCACCTACGTGCAGAGACAAGAGAGGACAGAGAAGCTTGGATGGAGGCTTTGCAAGC 599 Query 600 TGTCAAAGATATGTTTCCAAGAATGTCAAACTGCGAGTTGATGGCACCGACCAACAACTT 659 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 600 TGTCAAAGAAATGTTTCCAAGAATGTCAAACTGCGAGTTAATGGCACCGACCAACAACTT 659 Query 660 AGACATCTCGATAGAGAAGCTTAGGCTGCGATTGGTTGAGGAAGGAGTGAGTGAGTCAGC 719 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 660 AGACATCTCGATAGAGAAGCTTAGGCTGAGATTGGTTGAGGAAGGAGTGAGTGAGTCAGC 719 Query 720 CATTCAAGACTGCGAACAAATCACGAGGTCTGAGTTCTCGGCAATTCAGAGCCAGCTTTT 779 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 720 CATTCAAGACTGCGAACAAATCACGAGGTCTGAGTTCTCGGCAATTCAGAGCCAGCTTTT 779 Query 780 GCTTCTTAAACAAAAGCAATGGCTTCTCATTGATACACTCAGACAATTAGAGACAGAGAA 839 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || Sbjct 780 GCTTCTTAAACAAAAGCAATGGCTTCTCATTGATACACTCAGGCAACTAGAGACAGAAAA 839 Query 840 AGTAGATTTGGAAAACACGGTTGTAGATGAGACTCAACGACAAGCTGGCAACGGAGACTC 899 ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| Sbjct 840 AGTAGATCTCGAGAACACGGTTGTAGATGAGACTCAACGACAAGTTGACAACGAAGACTC 899 Query 900 AGAAGAAAC-AATTAGTGAATCTGATGATGATAATGAACAATTTGATGAGGCTGAGGAGG 958 ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 900 AGAAGGAACTAAT-AGTGAATCCGATGATGATAATGAACAATTTGATGAGGCTGAGGAGG 958 Query 959 AAATGGATACATGTGACTCTCTTTCTTCAAGTTCATTCAAAAGTATTGGATCCGTTTTTC 1018 |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 959 AAATTGATACATGTGACTCTCATTCTTCAAGTTCATTCAAAAGTATTGGATCCGTTTTTC 1018 Query 1019 GCACATCATCATTCTCTTCAGATGATGATGG-ACTTACTAATGGTTTTGAGTCAGAGAAT 1077 | ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| | Sbjct 1019 GTACATCATCATTCTCTTCAGATGATGATGGGA-TTGCTAATGGTTTTGAGTCAGA-A-- 1074 Query 1078 GATGATGTTGATCCTTCTATCAAGACTATTGGATTTAACTATCCACATGTCAAAAGACGA 1137 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| Sbjct 1075 GATGATGTTGATCCTTCTATCAAGTCTATTGGATTTAACTATCCTCATGTCAAACGACGA 1134 Query 1138 AAGAAGTTACCTGATCCGGTTGAAAAAGAGAAAAGTGTTAGCCTTTGGTCAATGATCAAA 1197 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1135 AAGAAGTTACCTGAACCGGTTGAAAAAGAGAAAAGTGTTAGCCTTTGGTCAATGATCAAA 1194 Query 1198 GACAACATTGGCAAGGATCTCACAAAAGTTTGTCTTCCTGTCTACTTCAATGAGCCTTTA 1257 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1195 GACAACATTGGCAAGGATCTCACAAAAGTTTGTCTTCCTGTTTACTTCAATGAGCCTTTA 1254 Query 1258 TCTTCTCTACAAAAATGCTTTGAAGATTTGGAGTATTCATATCTTCTTGATCAAGCTTCT 1317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1255 TCTTCTCTACAAAAATGCTTTGAAGATTTGGAGTATTCATATCTTCTTGATCAAGCATCT 1314 Query 1318 GAATGGGG-AAAGAGGGGCAATAACCTCATGAGGATTCTGAATGTAGCTGCATTTGCCGT 1376 |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1315 GAATGGGGGAAAAAGGG-CAATAACCTCATGAGGATTCTGAATGTAGCTGCATTTGCTGT 1373 Query 1377 ATCTGGTTATGCATCAACTGAAGGAAGAATTTGCAAACCTTTTAATCCAATGTTAGGTGA 1436 ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1374 ATCCGGTTATGCATCAACCGAAGGAAGAATATGCAAACCTTTTAATCCAATGTTAGGTGA 1433 Query 1437 AACATATGAGGCTGACTATCCCGATAAAGGCCTTCGATTTTTCTCGGAAAAGGTGAGTCA 1496 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1434 AACATATGAGGCTGATTATCCCGATAAAGGCCTTCGATTTTTCTCGGAAAAGGTGAGTCA 1493 Query 1497 TCATCCTATGATTGTGGCATGTCATTGTGATGGCACCGGATGGAAATTTTGGGGAGATAG 1556 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1494 TCATCCTATGATTGTGGCATGCCATTGTGATGGCACCGGATGGAAATTTTGGGGAGATAG 1553 Query 1557 CAACTTAAAAAGCAAATTTTGGGGTCGATCAATTCAACTTGATCCTATTGGTTTGTTGAC 1616 || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1554 TAATTTAAAAAGCAAATTTTGGGGTCGATCAATTCAGCTTGATCCTATTGGTTTGTTGAC 1613 Query 1617 TTTGCAATTTGATGATGGTGAAATTGTGCAATGGAGTAAGGTGACTACATCAATATACAA 1676 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1614 TTTGCAATTTGATGATGGTGAAATTGTACAATGGAGCAAGGTGACTACATCAATATACAA 1673 Query 1677 TCTCATACTTGGTAAATTGTATTGTGATCACTACGGGACAATGAAGATTGAAGGCAACGG 1736 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| Sbjct 1674 TCTCATACTTGGTAAATTGTATTGTGATCACTATGGGACAATGCGGATTGAAGGTAACGG 1733 Query 1737 TGAATATTCATGTAAACTTAAATTCAAGGAACAGTCGATGATCGATAGAAATCCGCATCA 1796 ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1734 CGAATACTCATGTAAACTTAAATTTAAGGAACAGTCGATGATCGATAGAAATCCTCATCA 1793 Query 1797 AGTTCAAGGTATAGTAGAAGACAAGAATGGAAAAACAGTGGCTAGGTTGTTTGGAAAATG 1856 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1794 AGTTCAAGGTATAGTAGAAGACAAAAATGGAAAAACAGTGGCTAAGTTGTTTGGAAAATG 1853 Query 1857 GGATGAGAGTATACACTATGTGATGGTTGATCAAGGAAAGGTGAATGAATCCCATCTTCT 1916 |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| | Sbjct 1854 GGATGAGAGTATGCACTATGTGATGGTCAATCAAGGAAGGGTGAATGAATCTCATCTTTT 1913 Query 1917 GTGGAAACGAAACAAACAGCCCGAAAACCCGACAAAGTATAATCTAACACGGTTTGGGAT 1976 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1914 GTGGAAACGAAACAAACCTCCCGAAAACCCGACAAAGTATAATCTAACACGGTTTGGGAT 1973 Query 1977 CACATTAAACGAGCTCACGCCTGGTTTAAAGGAGAAGTTGCCACCAACAGATTCAAGACT 2036 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1974 CACATTAAACGAGCTAACGCCTGGTTTAAAGGAGAAGTTGCCACCAACAGATTCAAGACT 2033 Query 2037 TAGACCGGACCAGAGGTATTTAGAGAAGGGAGAGTATGAAATGGGAAACGCAGAGAAGTT 2096 |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| Sbjct 2034 TAGACCAGACCAAAGGTATTTGGAGAAGGGAGAGTTTGAAATGGGAAATGCGGAGAAGTT 2093 Query 2097 GAGGTTGGAACAAAGACAAAGACAGGCGAGAGAGATGCAAGAGAGAGGTTGGAAACCAAA 2156 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2094 GAGGTTGGAACAAAGACAAAGACAGGCGAGAGAGATGCAAGAGAGAGGTTGGAAACCAAA 2153 Query 2157 GTGGTTTAGAAAAGAGAAAGGAAGTGAGACTTATAGATACATTGGAGGTTATTGGGAAGC 2216 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2154 GTGGTTTAGAAAAGAGAAAGGAAGTGAGACTTATAGATACGTTGGAGGTTATTGGGAAGC 2213 Query 2217 TCGAGATTCTGGTAGTTGGGATGATTGTCCTGACATCTTTGGTCAAGTTCACCAATCCAT 2276 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2214 TCGAGATTCTGGTCGTTGGGATGATTGTCCTGACATCTTTGGTCAAGTTCACCAATCCAT 2273 Query 2277 CAAGTAAC 2284 |||||||| Sbjct 2274 CAAGTAAC 2281 > Ahg933629 jgi|Araly1|933629|scaffold_401617.1 Length=1507 Score = 1999 bits (1082), Expect = 0.0 Identities = 1185/1235 (96%), Gaps = 6/1235 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1058 ATGGTTTTGAGTCAGAGAATGATGATGTTGATCCTTCTATCAAGACTATTGGATTTAACT 1117 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 265 ATGGTTTTGAGTCAGAG---GATGATGTTGATCCTTCTATCAAGACTATTGGATCTAACT 321 Query 1118 ATCCACATGTCAAAAGACGAAAGAAGTTACCTGATCCGGTTGAAAAAGAGAAAAGTGTTA 1177 |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 322 ATCCTCATGTCAAACGACGAAAGAAGTTACCTGATCCGGTTGAAAAAGAGAAAAGTGTTA 381 Query 1178 GCCTTTGGTCAATGATCAAAGACAACATTGGCAAGGATCTCACAAAAGTTTGTCTTCCTG 1237 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 382 GCCTTTGGTCAATGATCAAAGACAACATTGGCAAGGATCTCACAAAAGTTTGTCTTCCTG 441 Query 1238 TCTACTTCAATGAGCCTTTATCTTCTCTACAAAAATGCTTTGAAGATTTGGAGTATTCAT 1297 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 442 TTTACTTCAATGAGCCTTTATCTTCTCTACAAAAATGCTTTGAAGATTTGGAGTATTCAT 501 Query 1298 ATCTTCTTGATCAAGCTTCTGAAT-GGGGAAAGAGGGGCAATAACCTCATGAGGATTCTG 1356 |||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 502 ATCTTCTTGATCAAGCATCTGAATGGGGGAAA-AAGGGCAATAACCTCATGAGGATTCTG 560 Query 1357 AATGTAGCTGCATTTGCCGTATCTGGTTATGCATCAACTGAAGGAAGAATTTGCAAACCT 1416 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct 561 AATGTAGCTGCATTTGCTGTATCCGGTTATGCATCAACCGAAGGAAGAATATGCAAACCT 620 Query 1417 TTTAATCCAATGTTAGGTGAAACATATGAGGCTGACTATCCCGATAAAGGCCTTCGATTT 1476 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 621 TTTAATCCAATGTTAGGTGAAACATATGAGGCTGATTATCCCGATAAAGGCCTTCGATTT 680 Query 1477 TTCTCGGAAAAGGTGAGTCATCATCCTATGATTGTGGCATGTCATTGTGATGGCACCGGA 1536 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 681 TTCTCGGAAAAGGTGAGTCATCATCCTATGATTGTGGCATGCCATTGTGATGGCACCGGA 740 Query 1537 TGGAAATTTTGGGGAGATAGCAACTTAAAAAGCAAATTTTGGGGTCGATCAATTCAACTT 1596 |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 741 TGGAAATTTTGGGGAGATAGTAATTTAAAAAGCAAATTTTGGGGTCGATCAATTCAGCTT 800 Query 1597 GATCCTATTGGTTTGTTGACTTTGCAATTTGATGATGGTGAAATTGTGCAATGGAGTAAG 1656 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct 801 GATCCTATTGGTTTGTTGACTTTGCAATTTGATGATGGTGAAATTGTACAATGGAGCAAG 860 Query 1657 GTGACTACATCAATATACAATCTCATACTTGGTAAATTGTATTGTGATCACTACGGGACA 1716 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 861 GTGACTACATCAATATACAATCTCATACTTGGTAAATTGTATTGTGATCACTATGGGACA 920 Query 1717 ATGAAGATTGAAGGCAACGGTGAATATTCATGTAAACTTAAATTCAAGGAACAGTCGATG 1776 ||| ||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 921 ATGCGGATTGAAGGTAATGGCGAATACTCATGTAAACTTAAATTCAAGGAACAGTCGATG 980 Query 1777 ATCGATAGAAATCCGCATCAAGTTCAAGGTATAGTAGAAGACAAGAATGGAAAAACAGTG 1836 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 981 ATCGATAGAAATCCTCATCAAGTTCAAGGTATAGTAGAAGACAAAAATGGAAAAACAGTG 1040 Query 1837 GCTAGGTTGTTTGGAAAATGGGATGAGAGTATACACTATGTGATGGTTGATCAAGGAAAG 1896 |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1041 GCTAAGTTGTTTGGAAAATGGGATGAGAGTATGCTCTATGTGATGGTCAATCAAGGAAAG 1100 Query 1897 GTGAATGAATCCCATCTTCTGTGGAAACGAAACAAACAGCCCGAAAACCCGACAAAGTAT 1956 ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1101 GTGAATGAATCTCATCTTTTGTGGAAACGAAACAAACCTCCCGAAAACCCGACAAAGTAT 1160 Query 1957 AATCTAACACGGTTTGGGATCACATTAAACGAGCTCACGCCTGGTTTAAAGGAGAAGTTG 2016 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1161 AATCTAACACGGTTTGGGATCACATTAAACGAGCTAACGCCTGGTTTAAAGGAGAAGTTG 1220 Query 2017 CCACCAACAGATTCAAGACTTAGACCGGACCAGAGGTATTTAGAGAAGGGAGAGTATGAA 2076 |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||| Sbjct 1221 CCACCAACAGATTCAAGACTTAGACCAGACCAAAGGTATTTGGAGAAGGGAGAGTTTGAA 1280 Query 2077 ATGGGAAACGCAGAGAAGTTGAGGTTGGAACAAAGACAAAGACAGGCGAGAGAGATGCAA 2136 |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1281 ATGGGAAATGCGGAGAAGTTGAGGTTGGAACAAAGACAAAGACAGGCGAGAGAGATGCAA 1340 Query 2137 GAGAGAGGTTGGAAACCAAAGTGGTTTAGAAAAGAGAAAGGAAGTGAGACTTATAGATAC 2196 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1341 GAGAGAGGTTGGAAACCAAAGTGGTTTAGAAAAGAGAAAGGAAGTGAGACTTATAGATAC 1400 Query 2197 ATTGGAGGTTATTGGGAAGCTCGAGATTCTGGTAGTTGGGATGATTGTCCTGACATCTTT 2256 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1401 GTTGGAGGTTATTGGGAAGCTCGAGATTCTGGTCGTTGGGATGATTGTCCTGACATCTTT 1460 Query 2257 GGTCAAGTTCACCAATCCATCAAGTAA-CCAAAAA 2290 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1461 GGTCAAGTTCACCAATCCATCAAGTAAACCAAAAA 1495 > Ahg489733 jgi|Araly1|489733|fgenesh2_kg.6__2867__AT4G08180.3 Length=2999 Score = 1107 bits (599), Expect = 0.0 Identities = 1069/1290 (83%), Gaps = 56/1290 (4%) Strand=Plus/Plus Query 964 GATACATGTGACTCTCTTTCTTCAAGTTCATTCAAAAGTATTGGATCCGTTTTTCGCACA 1023 |||||| |||| | ||||||||||||||| ||||| |||| ||| || | |||||| || Sbjct 1368 GATACACGTGATTTTCTTTCTTCAAGTTCTTTCAAGAGTAGTGGTTCTGGTTTTCGTACT 1427 Query 1024 TCATCATTCTCTTCAGATGATGATGGACTTACTAATGGTTTTGAGTCAGAGAATGATGAT 1083 |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| |||| |||||| Sbjct 1428 TCATCATTTTCTTCCGATGAAGATGG-CTT-C----------GAGTC--AGAA-GATGAT 1472 Query 1084 GTTGATCCTTCTATCAAGACTATTGGATTTAACTATCCACATGTCAAAA-GACGAAAGAA 1142 |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| || | ||||| Sbjct 1473 ATTGATCCTTCCATCAAGTCTATTGGATGCAACTATCCTCGCGTCAAAAGGA-GGAAGAA 1531 Query 1143 GTTACCTGATCCGGTTGAAAAAGAGAAAAGTGTTAGCCTTTGGTCAATGATCAAAGACAA 1202 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1532 TTTACCTGATCCGGTTGAAAAAGAGAAAAGTGTTAGCCTTTGGTCAATGATCAAAGACAA 1591 Query 1203 CATTGGCAAGGATCTCACAAAAGTTTGTCTTCCTGTCTACTTCAATGAGCCTTTATCTTC 1262 || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| Sbjct 1592 TATAGGCAAGGATCTAACAAAAGTCTGTCTTCCTGTTTACTTCAACGAGCCACTATCTTC 1651 Query 1263 TCTACAAAAATGCTTTGAAGATTTGGAGTATTCATATCTTCTTGATCAAGC-TTCTGAAT 1321 | |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | || || ||||| Sbjct 1652 TTTACAGAAATGTTTTGAGGATTTGGAATATTCATACCTTCTTGACCGTGCATT-TGAAT 1710 Query 1322 GGGG-AAAGAGGGGCAATAACCTCATGAGGATTCTGAATGTAGCTGCATTTGCCGTATCT 1380 || ||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| Sbjct 1711 ATGGCAAA-AGGGGAAATAGCCTCATGAGGATTCTCAATGTAGCTGCTTTTGCTGTATCT 1769 Query 1381 GGTTATGCATCAACTGAAGGAAGAATTTGCAAACCTTTTAATCCAATGTTAGGTGAAACA 1440 || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1770 GGGTATGCATCAACCGAAGGAAGAATCTGCAAACCTTTTAATCCATTGTTAGGTGAAACA 1829 Query 1441 TATGAGGCTGACTATCCCGATAAAGGCCTTCGATTTTTCTCGGAAAAGGTGAGTCATCAT 1500 || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| Sbjct 1830 TACGAGGCAGACTATCCAGACAAAGGCCTTCGATTTTTTTCAGAAAAGGTCAGTCATCAT 1889 Query 1501 CCTATGATTGTGGCATGTCATTGTGATGGCACCGGATGGAAATTTTGGGGAGATAGCAA- 1559 |||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct 1890 CCTATGGTTGTCGCATGCCATTGTGATGGCACGGGATGGAAATTCTGGGGAGACAGCAAT 1949 Query 1560 CTTAAAAAGCAAATTTTGGGGTCGATCAATTCAACTTGATCCTATTGGTTTGTTGACTTT 1619 |||| | ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||| Sbjct 1950 CTTAGGA-GCAAATTCTGGGGTCGATCTATTCAGCTTGATCCTGTTGGTGTATTGACTTT 2008 Query 1620 GCAATTTGATGATGGTGAAATTGTGCAATGGAGTAAGGTGACTACATCAATATACAATCT 1679 ||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2009 GCAATTTGATGATGGAGAAATCCTTCAGTGGAGTAAGGTGACTACATCAATATACAATCT 2068 Query 1680 CATACTTGGTAAATTGTATTGTGATCACTACGGGACAATGAAG-ATTGAAGGCAACGGTG 1738 ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||| | || Sbjct 2069 CATACTTGGTAAACTGTACTGTGATCACTACGGTACAATGC-GTATTGAGGGCAGTGCTG 2127 Query 1739 AATATTCATGTAAACTTAAATTCAAGGAACAGTCGATGATCGATAGAAATCCGCATCAAG 1798 |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||| ||||| | Sbjct 2128 AATACTCATGTAAACTTAAATTCAAGGAGCAGTCCATCATAGACCGAAATCCTCATCAGG 2187 Query 1799 TTCAAGGTATAGTAGAAGACAAGAATGGAAAAACAGTGGCTAGGTTGTTTGGAAAATGGG 1858 |||| |||||||| ||||||||| ||| || |||||||| | | ||||||| ||||||| Sbjct 2188 TTCATGGTATAGTTCAAGACAAGAGTGGGAAGACAGTGGCAACGATGTTTGGGAAATGGG 2247 Query 1859 ATGAGAGTATACACTATGTGATGGTTGAT----C----AAGG--AAA--G-GTGAA--T- 1902 ||||||| || |||| ||||| || |||| | |||| ||| | ||||| | Sbjct 2248 ATGAGAGCATGCACTTTGTGACGGGTGATTGTTCTGGGAAGGGGAAACAGAGTGAAGCTA 2307 Query 1903 -G--A--ATCCCATCTTCTGTGGAAACGAAACAAACAGCCCGAAAACCCGACAAAGTATA 1957 | | | | || ||||| |||||||| | ||||| || | |||| | |||||||||| Sbjct 2308 TGTCAGGAGCTCAACTTCTTTGGAAACGGAGCAAACCTCCTGGAAACGCAACAAAGTATA 2367 Query 1958 ATCTAACACGGTTTGGGATCACATTAAACGAGCTCACGCCTGGT-TTAAAGGAGAAG--T 2014 |||||||||| |||| ||||| || || ||||| |||||||| |||| ||||| | | Sbjct 2368 ATCTAACACGTTTTGCAATCACGTTGAATGAGCTTACGCCTGGGCTTAA-GGAGA-GCCT 2425 Query 2015 TGCCACCAACAGATTCAAGACTTAGACCGGACCAGAGGTATTTAGAGAAGGGAGAGTATG 2074 | |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| || Sbjct 2426 T-CCACCAACGGATTCAAGGCTGCGACCGGACCAGAGGTATCTCGAGAACGGAGAGTTTG 2484 Query 2075 AAATGGGAAACGCAGAGAAGTTGAGGTTGGAACAAAGACAAAGACAGGCGAGAGA-GATG 2133 |||||| ||| ||||||||||| || ||||||| ||||| | ||||| || || |||| Sbjct 2485 AAATGGCCAACACAGAGAAGTTGCGGCTGGAACAGCGACAACGTCAGGCTAG-GAAGATG 2543 Query 2134 CAAGAGAGAGGTTGGAAACCAAAGTGGTTTA-GAAAAGAGAAAGGAAGTGAGACTTATAG 2192 || |||||||| ||||| || | |||||| | ||| |||||||| || ||| | || | Sbjct 2544 CAGGAGAGAGGATGGAAGCCGAGGTGGTTCATGAAG-GAGAAAGGTAGCGAGTCATACCG 2602 Query 2193 ATACATTGGAGGTTATTGGGAAGCTCGAGA 2222 ||||| |||||||| |||||||| ||||| Sbjct 2603 ATACAAAGGAGGTTACTGGGAAGCCCGAGA 2632 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 91264227020 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5