BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: halleri_transcript_ahg.fa
           32,672 sequences; 38,939,717 total letters



Query= AT2G31020.1

Length=2422
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  Ahg482026 jgi|Araly1|482026|fgenesh2_kg.4__1086__AT2G31020.1        3594    0.0  
  Ahg933629 jgi|Araly1|933629|scaffold_401617.1                       1999    0.0  
  Ahg489733 jgi|Araly1|489733|fgenesh2_kg.6__2867__AT4G08180.3        1107    0.0  


> Ahg482026 jgi|Araly1|482026|fgenesh2_kg.4__1086__AT2G31020.1
Length=2385

 Score = 3594 bits (1946),  Expect = 0.0
 Identities = 2176/2288 (95%), Gaps = 11/2288 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1     ATGTACGCCGCCACACCCGAAACTCCTTTCGGTTCCGCGAGATCACAACCGGTTATTACC  60
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| 
Sbjct  1     ATGTACGCCGCCACACCCGGAACTCCTTTCGGTTCCGCGAGGTCCCAACCTGTTATTACT  60

Query  61    CGATCTGTCTCACAACGATATAACCATCCAGGTCAAAGTAATCACCATCATCTCCTCCAC  120
             |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct  61    CGATCTGTCTCACAACGATATAACCATCCCTGTCAAACTAATAACCATCATCTCCTCCAC  120

Query  121   AGTCTCTCATTTAACCACCAGAACGTACTAGCCTTACCGGCAGCAGCAAGGGAGCCGCCT  180
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct  121   AGTCTCTCATTTAACCACCAGAACGTATTAGCCTTGCCGGCAGCGGCAAGGGAGCCGCCT  180

Query  181   GTGGATGTCAAGATTAACGATATCGCTGGGAATTCGATTGCCGGG-ATATTGTACAAATG  239
             |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||
Sbjct  181   GTGGATGTTAAAATTAACGATATCGCCGGGAATTCGATTG-CGGGAATATTGTACAAATG  239

Query  240   GGTGAACTATGGGAAAGGATGGAGACCAAGATGGTTTGTTTTGCAAGATGGAGTGCTTTC  299
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  240   GGTGAACTATGGGAAAGGATGGAGACCGAGATGGTTTGTTTTGCAAGATGGAGTGCTTTC  299

Query  300   ATATTATAAAATCAAGGGACCTGATAAGATCGTTGTTATCCATGAGACTGAGAAAGGATC  359
              || ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||
Sbjct  300   GTACTATAAGATCCATGGACCTGATAAGATCGTTGTTTTACGTGAGACTGAGAAAGGATC  359

Query  360   AAGAGTGATCGGAGAGGAGTCCACACGTATGATCTCTAGGAATAAGCGTCACGCCGCCAC  419
              || ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| || 
Sbjct  360   TAGGGTGATCGGAGAGGTGTCCACGCGTATGATCTCCAGGAATAACCGTCACGCCGGCAA  419

Query  420   TAACAACACCAACCACCAGCTCCGCCGCAAGCCATTCGGCGAAGTTCATCTCAAGGTTTC  479
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||
Sbjct  420   TAACAACACCAACCACCAGCTCCGCCGCAAGCCATTTGGCGAAGTCCACCTCAAGGTTTC  479

Query  480   ATCGATTCGGGAGAGTAGATCAGATGATAAGAGATTTTCAATATTCACCGGCACCAAGAG  539
             ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  480   ATCAATTCGGGAGAGTAGATCAGATGATAAGAGATTTTCAATATTCACCGGCACCAAGAG  539

Query  540   GCTTCACCTACGTGCAGAGACAAGAGAGGACAGAGAAGCTTGGATAGAGGCTTTACAAGC  599
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct  540   GCTTCACCTACGTGCAGAGACAAGAGAGGACAGAGAAGCTTGGATGGAGGCTTTGCAAGC  599

Query  600   TGTCAAAGATATGTTTCCAAGAATGTCAAACTGCGAGTTGATGGCACCGACCAACAACTT  659
             ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  600   TGTCAAAGAAATGTTTCCAAGAATGTCAAACTGCGAGTTAATGGCACCGACCAACAACTT  659

Query  660   AGACATCTCGATAGAGAAGCTTAGGCTGCGATTGGTTGAGGAAGGAGTGAGTGAGTCAGC  719
             |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660   AGACATCTCGATAGAGAAGCTTAGGCTGAGATTGGTTGAGGAAGGAGTGAGTGAGTCAGC  719

Query  720   CATTCAAGACTGCGAACAAATCACGAGGTCTGAGTTCTCGGCAATTCAGAGCCAGCTTTT  779
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  720   CATTCAAGACTGCGAACAAATCACGAGGTCTGAGTTCTCGGCAATTCAGAGCCAGCTTTT  779

Query  780   GCTTCTTAAACAAAAGCAATGGCTTCTCATTGATACACTCAGACAATTAGAGACAGAGAA  839
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||
Sbjct  780   GCTTCTTAAACAAAAGCAATGGCTTCTCATTGATACACTCAGGCAACTAGAGACAGAAAA  839

Query  840   AGTAGATTTGGAAAACACGGTTGTAGATGAGACTCAACGACAAGCTGGCAACGGAGACTC  899
             ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||
Sbjct  840   AGTAGATCTCGAGAACACGGTTGTAGATGAGACTCAACGACAAGTTGACAACGAAGACTC  899

Query  900   AGAAGAAAC-AATTAGTGAATCTGATGATGATAATGAACAATTTGATGAGGCTGAGGAGG  958
             ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  900   AGAAGGAACTAAT-AGTGAATCCGATGATGATAATGAACAATTTGATGAGGCTGAGGAGG  958

Query  959   AAATGGATACATGTGACTCTCTTTCTTCAAGTTCATTCAAAAGTATTGGATCCGTTTTTC  1018
             |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  959   AAATTGATACATGTGACTCTCATTCTTCAAGTTCATTCAAAAGTATTGGATCCGTTTTTC  1018

Query  1019  GCACATCATCATTCTCTTCAGATGATGATGG-ACTTACTAATGGTTTTGAGTCAGAGAAT  1077
             | ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |  
Sbjct  1019  GTACATCATCATTCTCTTCAGATGATGATGGGA-TTGCTAATGGTTTTGAGTCAGA-A--  1074

Query  1078  GATGATGTTGATCCTTCTATCAAGACTATTGGATTTAACTATCCACATGTCAAAAGACGA  1137
             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct  1075  GATGATGTTGATCCTTCTATCAAGTCTATTGGATTTAACTATCCTCATGTCAAACGACGA  1134

Query  1138  AAGAAGTTACCTGATCCGGTTGAAAAAGAGAAAAGTGTTAGCCTTTGGTCAATGATCAAA  1197
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1135  AAGAAGTTACCTGAACCGGTTGAAAAAGAGAAAAGTGTTAGCCTTTGGTCAATGATCAAA  1194

Query  1198  GACAACATTGGCAAGGATCTCACAAAAGTTTGTCTTCCTGTCTACTTCAATGAGCCTTTA  1257
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  1195  GACAACATTGGCAAGGATCTCACAAAAGTTTGTCTTCCTGTTTACTTCAATGAGCCTTTA  1254

Query  1258  TCTTCTCTACAAAAATGCTTTGAAGATTTGGAGTATTCATATCTTCTTGATCAAGCTTCT  1317
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  1255  TCTTCTCTACAAAAATGCTTTGAAGATTTGGAGTATTCATATCTTCTTGATCAAGCATCT  1314

Query  1318  GAATGGGG-AAAGAGGGGCAATAACCTCATGAGGATTCTGAATGTAGCTGCATTTGCCGT  1376
             |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  1315  GAATGGGGGAAAAAGGG-CAATAACCTCATGAGGATTCTGAATGTAGCTGCATTTGCTGT  1373

Query  1377  ATCTGGTTATGCATCAACTGAAGGAAGAATTTGCAAACCTTTTAATCCAATGTTAGGTGA  1436
             ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1374  ATCCGGTTATGCATCAACCGAAGGAAGAATATGCAAACCTTTTAATCCAATGTTAGGTGA  1433

Query  1437  AACATATGAGGCTGACTATCCCGATAAAGGCCTTCGATTTTTCTCGGAAAAGGTGAGTCA  1496
             ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1434  AACATATGAGGCTGATTATCCCGATAAAGGCCTTCGATTTTTCTCGGAAAAGGTGAGTCA  1493

Query  1497  TCATCCTATGATTGTGGCATGTCATTGTGATGGCACCGGATGGAAATTTTGGGGAGATAG  1556
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1494  TCATCCTATGATTGTGGCATGCCATTGTGATGGCACCGGATGGAAATTTTGGGGAGATAG  1553

Query  1557  CAACTTAAAAAGCAAATTTTGGGGTCGATCAATTCAACTTGATCCTATTGGTTTGTTGAC  1616
              || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  1554  TAATTTAAAAAGCAAATTTTGGGGTCGATCAATTCAGCTTGATCCTATTGGTTTGTTGAC  1613

Query  1617  TTTGCAATTTGATGATGGTGAAATTGTGCAATGGAGTAAGGTGACTACATCAATATACAA  1676
             ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  1614  TTTGCAATTTGATGATGGTGAAATTGTACAATGGAGCAAGGTGACTACATCAATATACAA  1673

Query  1677  TCTCATACTTGGTAAATTGTATTGTGATCACTACGGGACAATGAAGATTGAAGGCAACGG  1736
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||
Sbjct  1674  TCTCATACTTGGTAAATTGTATTGTGATCACTATGGGACAATGCGGATTGAAGGTAACGG  1733

Query  1737  TGAATATTCATGTAAACTTAAATTCAAGGAACAGTCGATGATCGATAGAAATCCGCATCA  1796
              ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  1734  CGAATACTCATGTAAACTTAAATTTAAGGAACAGTCGATGATCGATAGAAATCCTCATCA  1793

Query  1797  AGTTCAAGGTATAGTAGAAGACAAGAATGGAAAAACAGTGGCTAGGTTGTTTGGAAAATG  1856
             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  1794  AGTTCAAGGTATAGTAGAAGACAAAAATGGAAAAACAGTGGCTAAGTTGTTTGGAAAATG  1853

Query  1857  GGATGAGAGTATACACTATGTGATGGTTGATCAAGGAAAGGTGAATGAATCCCATCTTCT  1916
             |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||| |
Sbjct  1854  GGATGAGAGTATGCACTATGTGATGGTCAATCAAGGAAGGGTGAATGAATCTCATCTTTT  1913

Query  1917  GTGGAAACGAAACAAACAGCCCGAAAACCCGACAAAGTATAATCTAACACGGTTTGGGAT  1976
             |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1914  GTGGAAACGAAACAAACCTCCCGAAAACCCGACAAAGTATAATCTAACACGGTTTGGGAT  1973

Query  1977  CACATTAAACGAGCTCACGCCTGGTTTAAAGGAGAAGTTGCCACCAACAGATTCAAGACT  2036
             ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1974  CACATTAAACGAGCTAACGCCTGGTTTAAAGGAGAAGTTGCCACCAACAGATTCAAGACT  2033

Query  2037  TAGACCGGACCAGAGGTATTTAGAGAAGGGAGAGTATGAAATGGGAAACGCAGAGAAGTT  2096
             |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||
Sbjct  2034  TAGACCAGACCAAAGGTATTTGGAGAAGGGAGAGTTTGAAATGGGAAATGCGGAGAAGTT  2093

Query  2097  GAGGTTGGAACAAAGACAAAGACAGGCGAGAGAGATGCAAGAGAGAGGTTGGAAACCAAA  2156
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2094  GAGGTTGGAACAAAGACAAAGACAGGCGAGAGAGATGCAAGAGAGAGGTTGGAAACCAAA  2153

Query  2157  GTGGTTTAGAAAAGAGAAAGGAAGTGAGACTTATAGATACATTGGAGGTTATTGGGAAGC  2216
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  2154  GTGGTTTAGAAAAGAGAAAGGAAGTGAGACTTATAGATACGTTGGAGGTTATTGGGAAGC  2213

Query  2217  TCGAGATTCTGGTAGTTGGGATGATTGTCCTGACATCTTTGGTCAAGTTCACCAATCCAT  2276
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2214  TCGAGATTCTGGTCGTTGGGATGATTGTCCTGACATCTTTGGTCAAGTTCACCAATCCAT  2273

Query  2277  CAAGTAAC  2284
             ||||||||
Sbjct  2274  CAAGTAAC  2281


> Ahg933629 jgi|Araly1|933629|scaffold_401617.1
Length=1507

 Score = 1999 bits (1082),  Expect = 0.0
 Identities = 1185/1235 (96%), Gaps = 6/1235 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1058  ATGGTTTTGAGTCAGAGAATGATGATGTTGATCCTTCTATCAAGACTATTGGATTTAACT  1117
             |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  265   ATGGTTTTGAGTCAGAG---GATGATGTTGATCCTTCTATCAAGACTATTGGATCTAACT  321

Query  1118  ATCCACATGTCAAAAGACGAAAGAAGTTACCTGATCCGGTTGAAAAAGAGAAAAGTGTTA  1177
             |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  322   ATCCTCATGTCAAACGACGAAAGAAGTTACCTGATCCGGTTGAAAAAGAGAAAAGTGTTA  381

Query  1178  GCCTTTGGTCAATGATCAAAGACAACATTGGCAAGGATCTCACAAAAGTTTGTCTTCCTG  1237
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  382   GCCTTTGGTCAATGATCAAAGACAACATTGGCAAGGATCTCACAAAAGTTTGTCTTCCTG  441

Query  1238  TCTACTTCAATGAGCCTTTATCTTCTCTACAAAAATGCTTTGAAGATTTGGAGTATTCAT  1297
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  442   TTTACTTCAATGAGCCTTTATCTTCTCTACAAAAATGCTTTGAAGATTTGGAGTATTCAT  501

Query  1298  ATCTTCTTGATCAAGCTTCTGAAT-GGGGAAAGAGGGGCAATAACCTCATGAGGATTCTG  1356
             |||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  502   ATCTTCTTGATCAAGCATCTGAATGGGGGAAA-AAGGGCAATAACCTCATGAGGATTCTG  560

Query  1357  AATGTAGCTGCATTTGCCGTATCTGGTTATGCATCAACTGAAGGAAGAATTTGCAAACCT  1416
             ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct  561   AATGTAGCTGCATTTGCTGTATCCGGTTATGCATCAACCGAAGGAAGAATATGCAAACCT  620

Query  1417  TTTAATCCAATGTTAGGTGAAACATATGAGGCTGACTATCCCGATAAAGGCCTTCGATTT  1476
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  621   TTTAATCCAATGTTAGGTGAAACATATGAGGCTGATTATCCCGATAAAGGCCTTCGATTT  680

Query  1477  TTCTCGGAAAAGGTGAGTCATCATCCTATGATTGTGGCATGTCATTGTGATGGCACCGGA  1536
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  681   TTCTCGGAAAAGGTGAGTCATCATCCTATGATTGTGGCATGCCATTGTGATGGCACCGGA  740

Query  1537  TGGAAATTTTGGGGAGATAGCAACTTAAAAAGCAAATTTTGGGGTCGATCAATTCAACTT  1596
             |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  741   TGGAAATTTTGGGGAGATAGTAATTTAAAAAGCAAATTTTGGGGTCGATCAATTCAGCTT  800

Query  1597  GATCCTATTGGTTTGTTGACTTTGCAATTTGATGATGGTGAAATTGTGCAATGGAGTAAG  1656
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct  801   GATCCTATTGGTTTGTTGACTTTGCAATTTGATGATGGTGAAATTGTACAATGGAGCAAG  860

Query  1657  GTGACTACATCAATATACAATCTCATACTTGGTAAATTGTATTGTGATCACTACGGGACA  1716
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  861   GTGACTACATCAATATACAATCTCATACTTGGTAAATTGTATTGTGATCACTATGGGACA  920

Query  1717  ATGAAGATTGAAGGCAACGGTGAATATTCATGTAAACTTAAATTCAAGGAACAGTCGATG  1776
             |||  ||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  921   ATGCGGATTGAAGGTAATGGCGAATACTCATGTAAACTTAAATTCAAGGAACAGTCGATG  980

Query  1777  ATCGATAGAAATCCGCATCAAGTTCAAGGTATAGTAGAAGACAAGAATGGAAAAACAGTG  1836
             |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  981   ATCGATAGAAATCCTCATCAAGTTCAAGGTATAGTAGAAGACAAAAATGGAAAAACAGTG  1040

Query  1837  GCTAGGTTGTTTGGAAAATGGGATGAGAGTATACACTATGTGATGGTTGATCAAGGAAAG  1896
             |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||
Sbjct  1041  GCTAAGTTGTTTGGAAAATGGGATGAGAGTATGCTCTATGTGATGGTCAATCAAGGAAAG  1100

Query  1897  GTGAATGAATCCCATCTTCTGTGGAAACGAAACAAACAGCCCGAAAACCCGACAAAGTAT  1956
             ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||
Sbjct  1101  GTGAATGAATCTCATCTTTTGTGGAAACGAAACAAACCTCCCGAAAACCCGACAAAGTAT  1160

Query  1957  AATCTAACACGGTTTGGGATCACATTAAACGAGCTCACGCCTGGTTTAAAGGAGAAGTTG  2016
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1161  AATCTAACACGGTTTGGGATCACATTAAACGAGCTAACGCCTGGTTTAAAGGAGAAGTTG  1220

Query  2017  CCACCAACAGATTCAAGACTTAGACCGGACCAGAGGTATTTAGAGAAGGGAGAGTATGAA  2076
             |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct  1221  CCACCAACAGATTCAAGACTTAGACCAGACCAAAGGTATTTGGAGAAGGGAGAGTTTGAA  1280

Query  2077  ATGGGAAACGCAGAGAAGTTGAGGTTGGAACAAAGACAAAGACAGGCGAGAGAGATGCAA  2136
             |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1281  ATGGGAAATGCGGAGAAGTTGAGGTTGGAACAAAGACAAAGACAGGCGAGAGAGATGCAA  1340

Query  2137  GAGAGAGGTTGGAAACCAAAGTGGTTTAGAAAAGAGAAAGGAAGTGAGACTTATAGATAC  2196
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1341  GAGAGAGGTTGGAAACCAAAGTGGTTTAGAAAAGAGAAAGGAAGTGAGACTTATAGATAC  1400

Query  2197  ATTGGAGGTTATTGGGAAGCTCGAGATTCTGGTAGTTGGGATGATTGTCCTGACATCTTT  2256
              |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1401  GTTGGAGGTTATTGGGAAGCTCGAGATTCTGGTCGTTGGGATGATTGTCCTGACATCTTT  1460

Query  2257  GGTCAAGTTCACCAATCCATCAAGTAA-CCAAAAA  2290
             ||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  1461  GGTCAAGTTCACCAATCCATCAAGTAAACCAAAAA  1495


> Ahg489733 jgi|Araly1|489733|fgenesh2_kg.6__2867__AT4G08180.3
Length=2999

 Score = 1107 bits (599),  Expect = 0.0
 Identities = 1069/1290 (83%), Gaps = 56/1290 (4%)
 Strand=Plus/Plus

Query  964   GATACATGTGACTCTCTTTCTTCAAGTTCATTCAAAAGTATTGGATCCGTTTTTCGCACA  1023
             |||||| |||| | ||||||||||||||| ||||| |||| ||| || | |||||| || 
Sbjct  1368  GATACACGTGATTTTCTTTCTTCAAGTTCTTTCAAGAGTAGTGGTTCTGGTTTTCGTACT  1427

Query  1024  TCATCATTCTCTTCAGATGATGATGGACTTACTAATGGTTTTGAGTCAGAGAATGATGAT  1083
             |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |          |||||  |||| ||||||
Sbjct  1428  TCATCATTTTCTTCCGATGAAGATGG-CTT-C----------GAGTC--AGAA-GATGAT  1472

Query  1084  GTTGATCCTTCTATCAAGACTATTGGATTTAACTATCCACATGTCAAAA-GACGAAAGAA  1142
              |||||||||| |||||| |||||||||  |||||||| |  ||||||| || | |||||
Sbjct  1473  ATTGATCCTTCCATCAAGTCTATTGGATGCAACTATCCTCGCGTCAAAAGGA-GGAAGAA  1531

Query  1143  GTTACCTGATCCGGTTGAAAAAGAGAAAAGTGTTAGCCTTTGGTCAATGATCAAAGACAA  1202
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1532  TTTACCTGATCCGGTTGAAAAAGAGAAAAGTGTTAGCCTTTGGTCAATGATCAAAGACAA  1591

Query  1203  CATTGGCAAGGATCTCACAAAAGTTTGTCTTCCTGTCTACTTCAATGAGCCTTTATCTTC  1262
              || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||  |||||||
Sbjct  1592  TATAGGCAAGGATCTAACAAAAGTCTGTCTTCCTGTTTACTTCAACGAGCCACTATCTTC  1651

Query  1263  TCTACAAAAATGCTTTGAAGATTTGGAGTATTCATATCTTCTTGATCAAGC-TTCTGAAT  1321
             | |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |  || || |||||
Sbjct  1652  TTTACAGAAATGTTTTGAGGATTTGGAATATTCATACCTTCTTGACCGTGCATT-TGAAT  1710

Query  1322  GGGG-AAAGAGGGGCAATAACCTCATGAGGATTCTGAATGTAGCTGCATTTGCCGTATCT  1380
               || ||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct  1711  ATGGCAAA-AGGGGAAATAGCCTCATGAGGATTCTCAATGTAGCTGCTTTTGCTGTATCT  1769

Query  1381  GGTTATGCATCAACTGAAGGAAGAATTTGCAAACCTTTTAATCCAATGTTAGGTGAAACA  1440
             || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  1770  GGGTATGCATCAACCGAAGGAAGAATCTGCAAACCTTTTAATCCATTGTTAGGTGAAACA  1829

Query  1441  TATGAGGCTGACTATCCCGATAAAGGCCTTCGATTTTTCTCGGAAAAGGTGAGTCATCAT  1500
             || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||
Sbjct  1830  TACGAGGCAGACTATCCAGACAAAGGCCTTCGATTTTTTTCAGAAAAGGTCAGTCATCAT  1889

Query  1501  CCTATGATTGTGGCATGTCATTGTGATGGCACCGGATGGAAATTTTGGGGAGATAGCAA-  1559
             |||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| 
Sbjct  1890  CCTATGGTTGTCGCATGCCATTGTGATGGCACGGGATGGAAATTCTGGGGAGACAGCAAT  1949

Query  1560  CTTAAAAAGCAAATTTTGGGGTCGATCAATTCAACTTGATCCTATTGGTTTGTTGACTTT  1619
             ||||  | ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||
Sbjct  1950  CTTAGGA-GCAAATTCTGGGGTCGATCTATTCAGCTTGATCCTGTTGGTGTATTGACTTT  2008

Query  1620  GCAATTTGATGATGGTGAAATTGTGCAATGGAGTAAGGTGACTACATCAATATACAATCT  1679
             ||||||||||||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2009  GCAATTTGATGATGGAGAAATCCTTCAGTGGAGTAAGGTGACTACATCAATATACAATCT  2068

Query  1680  CATACTTGGTAAATTGTATTGTGATCACTACGGGACAATGAAG-ATTGAAGGCAACGGTG  1738
             ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||  | ||||| ||||  | ||
Sbjct  2069  CATACTTGGTAAACTGTACTGTGATCACTACGGTACAATGC-GTATTGAGGGCAGTGCTG  2127

Query  1739  AATATTCATGTAAACTTAAATTCAAGGAACAGTCGATGATCGATAGAAATCCGCATCAAG  1798
             |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||  ||||||| ||||| |
Sbjct  2128  AATACTCATGTAAACTTAAATTCAAGGAGCAGTCCATCATAGACCGAAATCCTCATCAGG  2187

Query  1799  TTCAAGGTATAGTAGAAGACAAGAATGGAAAAACAGTGGCTAGGTTGTTTGGAAAATGGG  1858
             |||| ||||||||  ||||||||| ||| || |||||||| | | ||||||| |||||||
Sbjct  2188  TTCATGGTATAGTTCAAGACAAGAGTGGGAAGACAGTGGCAACGATGTTTGGGAAATGGG  2247

Query  1859  ATGAGAGTATACACTATGTGATGGTTGAT----C----AAGG--AAA--G-GTGAA--T-  1902
             ||||||| || |||| ||||| || ||||    |    ||||  |||  | |||||  | 
Sbjct  2248  ATGAGAGCATGCACTTTGTGACGGGTGATTGTTCTGGGAAGGGGAAACAGAGTGAAGCTA  2307

Query  1903  -G--A--ATCCCATCTTCTGTGGAAACGAAACAAACAGCCCGAAAACCCGACAAAGTATA  1957
              |  |  | | || ||||| |||||||| | |||||  || | |||| | ||||||||||
Sbjct  2308  TGTCAGGAGCTCAACTTCTTTGGAAACGGAGCAAACCTCCTGGAAACGCAACAAAGTATA  2367

Query  1958  ATCTAACACGGTTTGGGATCACATTAAACGAGCTCACGCCTGGT-TTAAAGGAGAAG--T  2014
             |||||||||| ||||  ||||| || || ||||| ||||||||  |||| ||||| |  |
Sbjct  2368  ATCTAACACGTTTTGCAATCACGTTGAATGAGCTTACGCCTGGGCTTAA-GGAGA-GCCT  2425

Query  2015  TGCCACCAACAGATTCAAGACTTAGACCGGACCAGAGGTATTTAGAGAAGGGAGAGTATG  2074
             | |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||
Sbjct  2426  T-CCACCAACGGATTCAAGGCTGCGACCGGACCAGAGGTATCTCGAGAACGGAGAGTTTG  2484

Query  2075  AAATGGGAAACGCAGAGAAGTTGAGGTTGGAACAAAGACAAAGACAGGCGAGAGA-GATG  2133
             ||||||  ||| ||||||||||| || |||||||  ||||| | ||||| || || ||||
Sbjct  2485  AAATGGCCAACACAGAGAAGTTGCGGCTGGAACAGCGACAACGTCAGGCTAG-GAAGATG  2543

Query  2134  CAAGAGAGAGGTTGGAAACCAAAGTGGTTTA-GAAAAGAGAAAGGAAGTGAGACTTATAG  2192
             || |||||||| ||||| || | |||||| | |||  |||||||| || ||| | ||  |
Sbjct  2544  CAGGAGAGAGGATGGAAGCCGAGGTGGTTCATGAAG-GAGAAAGGTAGCGAGTCATACCG  2602

Query  2193  ATACATTGGAGGTTATTGGGAAGCTCGAGA  2222
             |||||  |||||||| |||||||| |||||
Sbjct  2603  ATACAAAGGAGGTTACTGGGAAGCCCGAGA  2632



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 91264227020


  Database: halleri_transcript_ahg.fa
    Posted date:  Sep 25, 2014  2:02 AM
  Number of letters in database: 38,939,717
  Number of sequences in database:  32,672



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5