BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G31020.1
Length=2422
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg482026 jgi|Araly1|482026|fgenesh2_kg.4__1086__AT2G31020.1 3594 0.0
Ahg933629 jgi|Araly1|933629|scaffold_401617.1 1999 0.0
Ahg489733 jgi|Araly1|489733|fgenesh2_kg.6__2867__AT4G08180.3 1107 0.0
> Ahg482026 jgi|Araly1|482026|fgenesh2_kg.4__1086__AT2G31020.1
Length=2385
Score = 3594 bits (1946), Expect = 0.0
Identities = 2176/2288 (95%), Gaps = 11/2288 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGTACGCCGCCACACCCGAAACTCCTTTCGGTTCCGCGAGATCACAACCGGTTATTACC 60
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||
Sbjct 1 ATGTACGCCGCCACACCCGGAACTCCTTTCGGTTCCGCGAGGTCCCAACCTGTTATTACT 60
Query 61 CGATCTGTCTCACAACGATATAACCATCCAGGTCAAAGTAATCACCATCATCTCCTCCAC 120
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 61 CGATCTGTCTCACAACGATATAACCATCCCTGTCAAACTAATAACCATCATCTCCTCCAC 120
Query 121 AGTCTCTCATTTAACCACCAGAACGTACTAGCCTTACCGGCAGCAGCAAGGGAGCCGCCT 180
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 121 AGTCTCTCATTTAACCACCAGAACGTATTAGCCTTGCCGGCAGCGGCAAGGGAGCCGCCT 180
Query 181 GTGGATGTCAAGATTAACGATATCGCTGGGAATTCGATTGCCGGG-ATATTGTACAAATG 239
|||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||
Sbjct 181 GTGGATGTTAAAATTAACGATATCGCCGGGAATTCGATTG-CGGGAATATTGTACAAATG 239
Query 240 GGTGAACTATGGGAAAGGATGGAGACCAAGATGGTTTGTTTTGCAAGATGGAGTGCTTTC 299
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 GGTGAACTATGGGAAAGGATGGAGACCGAGATGGTTTGTTTTGCAAGATGGAGTGCTTTC 299
Query 300 ATATTATAAAATCAAGGGACCTGATAAGATCGTTGTTATCCATGAGACTGAGAAAGGATC 359
|| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||
Sbjct 300 GTACTATAAGATCCATGGACCTGATAAGATCGTTGTTTTACGTGAGACTGAGAAAGGATC 359
Query 360 AAGAGTGATCGGAGAGGAGTCCACACGTATGATCTCTAGGAATAAGCGTCACGCCGCCAC 419
|| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||
Sbjct 360 TAGGGTGATCGGAGAGGTGTCCACGCGTATGATCTCCAGGAATAACCGTCACGCCGGCAA 419
Query 420 TAACAACACCAACCACCAGCTCCGCCGCAAGCCATTCGGCGAAGTTCATCTCAAGGTTTC 479
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||
Sbjct 420 TAACAACACCAACCACCAGCTCCGCCGCAAGCCATTTGGCGAAGTCCACCTCAAGGTTTC 479
Query 480 ATCGATTCGGGAGAGTAGATCAGATGATAAGAGATTTTCAATATTCACCGGCACCAAGAG 539
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 ATCAATTCGGGAGAGTAGATCAGATGATAAGAGATTTTCAATATTCACCGGCACCAAGAG 539
Query 540 GCTTCACCTACGTGCAGAGACAAGAGAGGACAGAGAAGCTTGGATAGAGGCTTTACAAGC 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 540 GCTTCACCTACGTGCAGAGACAAGAGAGGACAGAGAAGCTTGGATGGAGGCTTTGCAAGC 599
Query 600 TGTCAAAGATATGTTTCCAAGAATGTCAAACTGCGAGTTGATGGCACCGACCAACAACTT 659
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 600 TGTCAAAGAAATGTTTCCAAGAATGTCAAACTGCGAGTTAATGGCACCGACCAACAACTT 659
Query 660 AGACATCTCGATAGAGAAGCTTAGGCTGCGATTGGTTGAGGAAGGAGTGAGTGAGTCAGC 719
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 AGACATCTCGATAGAGAAGCTTAGGCTGAGATTGGTTGAGGAAGGAGTGAGTGAGTCAGC 719
Query 720 CATTCAAGACTGCGAACAAATCACGAGGTCTGAGTTCTCGGCAATTCAGAGCCAGCTTTT 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 CATTCAAGACTGCGAACAAATCACGAGGTCTGAGTTCTCGGCAATTCAGAGCCAGCTTTT 779
Query 780 GCTTCTTAAACAAAAGCAATGGCTTCTCATTGATACACTCAGACAATTAGAGACAGAGAA 839
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||
Sbjct 780 GCTTCTTAAACAAAAGCAATGGCTTCTCATTGATACACTCAGGCAACTAGAGACAGAAAA 839
Query 840 AGTAGATTTGGAAAACACGGTTGTAGATGAGACTCAACGACAAGCTGGCAACGGAGACTC 899
||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||
Sbjct 840 AGTAGATCTCGAGAACACGGTTGTAGATGAGACTCAACGACAAGTTGACAACGAAGACTC 899
Query 900 AGAAGAAAC-AATTAGTGAATCTGATGATGATAATGAACAATTTGATGAGGCTGAGGAGG 958
||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 AGAAGGAACTAAT-AGTGAATCCGATGATGATAATGAACAATTTGATGAGGCTGAGGAGG 958
Query 959 AAATGGATACATGTGACTCTCTTTCTTCAAGTTCATTCAAAAGTATTGGATCCGTTTTTC 1018
|||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 AAATTGATACATGTGACTCTCATTCTTCAAGTTCATTCAAAAGTATTGGATCCGTTTTTC 1018
Query 1019 GCACATCATCATTCTCTTCAGATGATGATGG-ACTTACTAATGGTTTTGAGTCAGAGAAT 1077
| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |
Sbjct 1019 GTACATCATCATTCTCTTCAGATGATGATGGGA-TTGCTAATGGTTTTGAGTCAGA-A-- 1074
Query 1078 GATGATGTTGATCCTTCTATCAAGACTATTGGATTTAACTATCCACATGTCAAAAGACGA 1137
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 1075 GATGATGTTGATCCTTCTATCAAGTCTATTGGATTTAACTATCCTCATGTCAAACGACGA 1134
Query 1138 AAGAAGTTACCTGATCCGGTTGAAAAAGAGAAAAGTGTTAGCCTTTGGTCAATGATCAAA 1197
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1135 AAGAAGTTACCTGAACCGGTTGAAAAAGAGAAAAGTGTTAGCCTTTGGTCAATGATCAAA 1194
Query 1198 GACAACATTGGCAAGGATCTCACAAAAGTTTGTCTTCCTGTCTACTTCAATGAGCCTTTA 1257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1195 GACAACATTGGCAAGGATCTCACAAAAGTTTGTCTTCCTGTTTACTTCAATGAGCCTTTA 1254
Query 1258 TCTTCTCTACAAAAATGCTTTGAAGATTTGGAGTATTCATATCTTCTTGATCAAGCTTCT 1317
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1255 TCTTCTCTACAAAAATGCTTTGAAGATTTGGAGTATTCATATCTTCTTGATCAAGCATCT 1314
Query 1318 GAATGGGG-AAAGAGGGGCAATAACCTCATGAGGATTCTGAATGTAGCTGCATTTGCCGT 1376
|||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1315 GAATGGGGGAAAAAGGG-CAATAACCTCATGAGGATTCTGAATGTAGCTGCATTTGCTGT 1373
Query 1377 ATCTGGTTATGCATCAACTGAAGGAAGAATTTGCAAACCTTTTAATCCAATGTTAGGTGA 1436
||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1374 ATCCGGTTATGCATCAACCGAAGGAAGAATATGCAAACCTTTTAATCCAATGTTAGGTGA 1433
Query 1437 AACATATGAGGCTGACTATCCCGATAAAGGCCTTCGATTTTTCTCGGAAAAGGTGAGTCA 1496
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1434 AACATATGAGGCTGATTATCCCGATAAAGGCCTTCGATTTTTCTCGGAAAAGGTGAGTCA 1493
Query 1497 TCATCCTATGATTGTGGCATGTCATTGTGATGGCACCGGATGGAAATTTTGGGGAGATAG 1556
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1494 TCATCCTATGATTGTGGCATGCCATTGTGATGGCACCGGATGGAAATTTTGGGGAGATAG 1553
Query 1557 CAACTTAAAAAGCAAATTTTGGGGTCGATCAATTCAACTTGATCCTATTGGTTTGTTGAC 1616
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 TAATTTAAAAAGCAAATTTTGGGGTCGATCAATTCAGCTTGATCCTATTGGTTTGTTGAC 1613
Query 1617 TTTGCAATTTGATGATGGTGAAATTGTGCAATGGAGTAAGGTGACTACATCAATATACAA 1676
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1614 TTTGCAATTTGATGATGGTGAAATTGTACAATGGAGCAAGGTGACTACATCAATATACAA 1673
Query 1677 TCTCATACTTGGTAAATTGTATTGTGATCACTACGGGACAATGAAGATTGAAGGCAACGG 1736
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 1674 TCTCATACTTGGTAAATTGTATTGTGATCACTATGGGACAATGCGGATTGAAGGTAACGG 1733
Query 1737 TGAATATTCATGTAAACTTAAATTCAAGGAACAGTCGATGATCGATAGAAATCCGCATCA 1796
||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1734 CGAATACTCATGTAAACTTAAATTTAAGGAACAGTCGATGATCGATAGAAATCCTCATCA 1793
Query 1797 AGTTCAAGGTATAGTAGAAGACAAGAATGGAAAAACAGTGGCTAGGTTGTTTGGAAAATG 1856
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1794 AGTTCAAGGTATAGTAGAAGACAAAAATGGAAAAACAGTGGCTAAGTTGTTTGGAAAATG 1853
Query 1857 GGATGAGAGTATACACTATGTGATGGTTGATCAAGGAAAGGTGAATGAATCCCATCTTCT 1916
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |
Sbjct 1854 GGATGAGAGTATGCACTATGTGATGGTCAATCAAGGAAGGGTGAATGAATCTCATCTTTT 1913
Query 1917 GTGGAAACGAAACAAACAGCCCGAAAACCCGACAAAGTATAATCTAACACGGTTTGGGAT 1976
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1914 GTGGAAACGAAACAAACCTCCCGAAAACCCGACAAAGTATAATCTAACACGGTTTGGGAT 1973
Query 1977 CACATTAAACGAGCTCACGCCTGGTTTAAAGGAGAAGTTGCCACCAACAGATTCAAGACT 2036
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1974 CACATTAAACGAGCTAACGCCTGGTTTAAAGGAGAAGTTGCCACCAACAGATTCAAGACT 2033
Query 2037 TAGACCGGACCAGAGGTATTTAGAGAAGGGAGAGTATGAAATGGGAAACGCAGAGAAGTT 2096
|||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||
Sbjct 2034 TAGACCAGACCAAAGGTATTTGGAGAAGGGAGAGTTTGAAATGGGAAATGCGGAGAAGTT 2093
Query 2097 GAGGTTGGAACAAAGACAAAGACAGGCGAGAGAGATGCAAGAGAGAGGTTGGAAACCAAA 2156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2094 GAGGTTGGAACAAAGACAAAGACAGGCGAGAGAGATGCAAGAGAGAGGTTGGAAACCAAA 2153
Query 2157 GTGGTTTAGAAAAGAGAAAGGAAGTGAGACTTATAGATACATTGGAGGTTATTGGGAAGC 2216
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2154 GTGGTTTAGAAAAGAGAAAGGAAGTGAGACTTATAGATACGTTGGAGGTTATTGGGAAGC 2213
Query 2217 TCGAGATTCTGGTAGTTGGGATGATTGTCCTGACATCTTTGGTCAAGTTCACCAATCCAT 2276
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2214 TCGAGATTCTGGTCGTTGGGATGATTGTCCTGACATCTTTGGTCAAGTTCACCAATCCAT 2273
Query 2277 CAAGTAAC 2284
||||||||
Sbjct 2274 CAAGTAAC 2281
> Ahg933629 jgi|Araly1|933629|scaffold_401617.1
Length=1507
Score = 1999 bits (1082), Expect = 0.0
Identities = 1185/1235 (96%), Gaps = 6/1235 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1058 ATGGTTTTGAGTCAGAGAATGATGATGTTGATCCTTCTATCAAGACTATTGGATTTAACT 1117
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 265 ATGGTTTTGAGTCAGAG---GATGATGTTGATCCTTCTATCAAGACTATTGGATCTAACT 321
Query 1118 ATCCACATGTCAAAAGACGAAAGAAGTTACCTGATCCGGTTGAAAAAGAGAAAAGTGTTA 1177
|||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 322 ATCCTCATGTCAAACGACGAAAGAAGTTACCTGATCCGGTTGAAAAAGAGAAAAGTGTTA 381
Query 1178 GCCTTTGGTCAATGATCAAAGACAACATTGGCAAGGATCTCACAAAAGTTTGTCTTCCTG 1237
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 382 GCCTTTGGTCAATGATCAAAGACAACATTGGCAAGGATCTCACAAAAGTTTGTCTTCCTG 441
Query 1238 TCTACTTCAATGAGCCTTTATCTTCTCTACAAAAATGCTTTGAAGATTTGGAGTATTCAT 1297
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 442 TTTACTTCAATGAGCCTTTATCTTCTCTACAAAAATGCTTTGAAGATTTGGAGTATTCAT 501
Query 1298 ATCTTCTTGATCAAGCTTCTGAAT-GGGGAAAGAGGGGCAATAACCTCATGAGGATTCTG 1356
|||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 502 ATCTTCTTGATCAAGCATCTGAATGGGGGAAA-AAGGGCAATAACCTCATGAGGATTCTG 560
Query 1357 AATGTAGCTGCATTTGCCGTATCTGGTTATGCATCAACTGAAGGAAGAATTTGCAAACCT 1416
||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 561 AATGTAGCTGCATTTGCTGTATCCGGTTATGCATCAACCGAAGGAAGAATATGCAAACCT 620
Query 1417 TTTAATCCAATGTTAGGTGAAACATATGAGGCTGACTATCCCGATAAAGGCCTTCGATTT 1476
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 621 TTTAATCCAATGTTAGGTGAAACATATGAGGCTGATTATCCCGATAAAGGCCTTCGATTT 680
Query 1477 TTCTCGGAAAAGGTGAGTCATCATCCTATGATTGTGGCATGTCATTGTGATGGCACCGGA 1536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 681 TTCTCGGAAAAGGTGAGTCATCATCCTATGATTGTGGCATGCCATTGTGATGGCACCGGA 740
Query 1537 TGGAAATTTTGGGGAGATAGCAACTTAAAAAGCAAATTTTGGGGTCGATCAATTCAACTT 1596
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 741 TGGAAATTTTGGGGAGATAGTAATTTAAAAAGCAAATTTTGGGGTCGATCAATTCAGCTT 800
Query 1597 GATCCTATTGGTTTGTTGACTTTGCAATTTGATGATGGTGAAATTGTGCAATGGAGTAAG 1656
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 801 GATCCTATTGGTTTGTTGACTTTGCAATTTGATGATGGTGAAATTGTACAATGGAGCAAG 860
Query 1657 GTGACTACATCAATATACAATCTCATACTTGGTAAATTGTATTGTGATCACTACGGGACA 1716
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 861 GTGACTACATCAATATACAATCTCATACTTGGTAAATTGTATTGTGATCACTATGGGACA 920
Query 1717 ATGAAGATTGAAGGCAACGGTGAATATTCATGTAAACTTAAATTCAAGGAACAGTCGATG 1776
||| ||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 921 ATGCGGATTGAAGGTAATGGCGAATACTCATGTAAACTTAAATTCAAGGAACAGTCGATG 980
Query 1777 ATCGATAGAAATCCGCATCAAGTTCAAGGTATAGTAGAAGACAAGAATGGAAAAACAGTG 1836
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 981 ATCGATAGAAATCCTCATCAAGTTCAAGGTATAGTAGAAGACAAAAATGGAAAAACAGTG 1040
Query 1837 GCTAGGTTGTTTGGAAAATGGGATGAGAGTATACACTATGTGATGGTTGATCAAGGAAAG 1896
|||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1041 GCTAAGTTGTTTGGAAAATGGGATGAGAGTATGCTCTATGTGATGGTCAATCAAGGAAAG 1100
Query 1897 GTGAATGAATCCCATCTTCTGTGGAAACGAAACAAACAGCCCGAAAACCCGACAAAGTAT 1956
||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1101 GTGAATGAATCTCATCTTTTGTGGAAACGAAACAAACCTCCCGAAAACCCGACAAAGTAT 1160
Query 1957 AATCTAACACGGTTTGGGATCACATTAAACGAGCTCACGCCTGGTTTAAAGGAGAAGTTG 2016
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1161 AATCTAACACGGTTTGGGATCACATTAAACGAGCTAACGCCTGGTTTAAAGGAGAAGTTG 1220
Query 2017 CCACCAACAGATTCAAGACTTAGACCGGACCAGAGGTATTTAGAGAAGGGAGAGTATGAA 2076
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct 1221 CCACCAACAGATTCAAGACTTAGACCAGACCAAAGGTATTTGGAGAAGGGAGAGTTTGAA 1280
Query 2077 ATGGGAAACGCAGAGAAGTTGAGGTTGGAACAAAGACAAAGACAGGCGAGAGAGATGCAA 2136
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1281 ATGGGAAATGCGGAGAAGTTGAGGTTGGAACAAAGACAAAGACAGGCGAGAGAGATGCAA 1340
Query 2137 GAGAGAGGTTGGAAACCAAAGTGGTTTAGAAAAGAGAAAGGAAGTGAGACTTATAGATAC 2196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1341 GAGAGAGGTTGGAAACCAAAGTGGTTTAGAAAAGAGAAAGGAAGTGAGACTTATAGATAC 1400
Query 2197 ATTGGAGGTTATTGGGAAGCTCGAGATTCTGGTAGTTGGGATGATTGTCCTGACATCTTT 2256
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1401 GTTGGAGGTTATTGGGAAGCTCGAGATTCTGGTCGTTGGGATGATTGTCCTGACATCTTT 1460
Query 2257 GGTCAAGTTCACCAATCCATCAAGTAA-CCAAAAA 2290
||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1461 GGTCAAGTTCACCAATCCATCAAGTAAACCAAAAA 1495
> Ahg489733 jgi|Araly1|489733|fgenesh2_kg.6__2867__AT4G08180.3
Length=2999
Score = 1107 bits (599), Expect = 0.0
Identities = 1069/1290 (83%), Gaps = 56/1290 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 964 GATACATGTGACTCTCTTTCTTCAAGTTCATTCAAAAGTATTGGATCCGTTTTTCGCACA 1023
|||||| |||| | ||||||||||||||| ||||| |||| ||| || | |||||| ||
Sbjct 1368 GATACACGTGATTTTCTTTCTTCAAGTTCTTTCAAGAGTAGTGGTTCTGGTTTTCGTACT 1427
Query 1024 TCATCATTCTCTTCAGATGATGATGGACTTACTAATGGTTTTGAGTCAGAGAATGATGAT 1083
|||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| |||| ||||||
Sbjct 1428 TCATCATTTTCTTCCGATGAAGATGG-CTT-C----------GAGTC--AGAA-GATGAT 1472
Query 1084 GTTGATCCTTCTATCAAGACTATTGGATTTAACTATCCACATGTCAAAA-GACGAAAGAA 1142
|||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| || | |||||
Sbjct 1473 ATTGATCCTTCCATCAAGTCTATTGGATGCAACTATCCTCGCGTCAAAAGGA-GGAAGAA 1531
Query 1143 GTTACCTGATCCGGTTGAAAAAGAGAAAAGTGTTAGCCTTTGGTCAATGATCAAAGACAA 1202
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1532 TTTACCTGATCCGGTTGAAAAAGAGAAAAGTGTTAGCCTTTGGTCAATGATCAAAGACAA 1591
Query 1203 CATTGGCAAGGATCTCACAAAAGTTTGTCTTCCTGTCTACTTCAATGAGCCTTTATCTTC 1262
|| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||
Sbjct 1592 TATAGGCAAGGATCTAACAAAAGTCTGTCTTCCTGTTTACTTCAACGAGCCACTATCTTC 1651
Query 1263 TCTACAAAAATGCTTTGAAGATTTGGAGTATTCATATCTTCTTGATCAAGC-TTCTGAAT 1321
| |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | || || |||||
Sbjct 1652 TTTACAGAAATGTTTTGAGGATTTGGAATATTCATACCTTCTTGACCGTGCATT-TGAAT 1710
Query 1322 GGGG-AAAGAGGGGCAATAACCTCATGAGGATTCTGAATGTAGCTGCATTTGCCGTATCT 1380
|| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 1711 ATGGCAAA-AGGGGAAATAGCCTCATGAGGATTCTCAATGTAGCTGCTTTTGCTGTATCT 1769
Query 1381 GGTTATGCATCAACTGAAGGAAGAATTTGCAAACCTTTTAATCCAATGTTAGGTGAAACA 1440
|| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1770 GGGTATGCATCAACCGAAGGAAGAATCTGCAAACCTTTTAATCCATTGTTAGGTGAAACA 1829
Query 1441 TATGAGGCTGACTATCCCGATAAAGGCCTTCGATTTTTCTCGGAAAAGGTGAGTCATCAT 1500
|| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||
Sbjct 1830 TACGAGGCAGACTATCCAGACAAAGGCCTTCGATTTTTTTCAGAAAAGGTCAGTCATCAT 1889
Query 1501 CCTATGATTGTGGCATGTCATTGTGATGGCACCGGATGGAAATTTTGGGGAGATAGCAA- 1559
|||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 1890 CCTATGGTTGTCGCATGCCATTGTGATGGCACGGGATGGAAATTCTGGGGAGACAGCAAT 1949
Query 1560 CTTAAAAAGCAAATTTTGGGGTCGATCAATTCAACTTGATCCTATTGGTTTGTTGACTTT 1619
|||| | ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||
Sbjct 1950 CTTAGGA-GCAAATTCTGGGGTCGATCTATTCAGCTTGATCCTGTTGGTGTATTGACTTT 2008
Query 1620 GCAATTTGATGATGGTGAAATTGTGCAATGGAGTAAGGTGACTACATCAATATACAATCT 1679
||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2009 GCAATTTGATGATGGAGAAATCCTTCAGTGGAGTAAGGTGACTACATCAATATACAATCT 2068
Query 1680 CATACTTGGTAAATTGTATTGTGATCACTACGGGACAATGAAG-ATTGAAGGCAACGGTG 1738
||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||| | ||
Sbjct 2069 CATACTTGGTAAACTGTACTGTGATCACTACGGTACAATGC-GTATTGAGGGCAGTGCTG 2127
Query 1739 AATATTCATGTAAACTTAAATTCAAGGAACAGTCGATGATCGATAGAAATCCGCATCAAG 1798
|||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||| ||||| |
Sbjct 2128 AATACTCATGTAAACTTAAATTCAAGGAGCAGTCCATCATAGACCGAAATCCTCATCAGG 2187
Query 1799 TTCAAGGTATAGTAGAAGACAAGAATGGAAAAACAGTGGCTAGGTTGTTTGGAAAATGGG 1858
|||| |||||||| ||||||||| ||| || |||||||| | | ||||||| |||||||
Sbjct 2188 TTCATGGTATAGTTCAAGACAAGAGTGGGAAGACAGTGGCAACGATGTTTGGGAAATGGG 2247
Query 1859 ATGAGAGTATACACTATGTGATGGTTGAT----C----AAGG--AAA--G-GTGAA--T- 1902
||||||| || |||| ||||| || |||| | |||| ||| | ||||| |
Sbjct 2248 ATGAGAGCATGCACTTTGTGACGGGTGATTGTTCTGGGAAGGGGAAACAGAGTGAAGCTA 2307
Query 1903 -G--A--ATCCCATCTTCTGTGGAAACGAAACAAACAGCCCGAAAACCCGACAAAGTATA 1957
| | | | || ||||| |||||||| | ||||| || | |||| | ||||||||||
Sbjct 2308 TGTCAGGAGCTCAACTTCTTTGGAAACGGAGCAAACCTCCTGGAAACGCAACAAAGTATA 2367
Query 1958 ATCTAACACGGTTTGGGATCACATTAAACGAGCTCACGCCTGGT-TTAAAGGAGAAG--T 2014
|||||||||| |||| ||||| || || ||||| |||||||| |||| ||||| | |
Sbjct 2368 ATCTAACACGTTTTGCAATCACGTTGAATGAGCTTACGCCTGGGCTTAA-GGAGA-GCCT 2425
Query 2015 TGCCACCAACAGATTCAAGACTTAGACCGGACCAGAGGTATTTAGAGAAGGGAGAGTATG 2074
| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||
Sbjct 2426 T-CCACCAACGGATTCAAGGCTGCGACCGGACCAGAGGTATCTCGAGAACGGAGAGTTTG 2484
Query 2075 AAATGGGAAACGCAGAGAAGTTGAGGTTGGAACAAAGACAAAGACAGGCGAGAGA-GATG 2133
|||||| ||| ||||||||||| || ||||||| ||||| | ||||| || || ||||
Sbjct 2485 AAATGGCCAACACAGAGAAGTTGCGGCTGGAACAGCGACAACGTCAGGCTAG-GAAGATG 2543
Query 2134 CAAGAGAGAGGTTGGAAACCAAAGTGGTTTA-GAAAAGAGAAAGGAAGTGAGACTTATAG 2192
|| |||||||| ||||| || | |||||| | ||| |||||||| || ||| | || |
Sbjct 2544 CAGGAGAGAGGATGGAAGCCGAGGTGGTTCATGAAG-GAGAAAGGTAGCGAGTCATACCG 2602
Query 2193 ATACATTGGAGGTTATTGGGAAGCTCGAGA 2222
||||| |||||||| |||||||| |||||
Sbjct 2603 ATACAAAGGAGGTTACTGGGAAGCCCGAGA 2632
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 91264227020
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5