BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G31660.1
Length=3812
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg482091 jgi|Araly1|482091|fgenesh2_kg.4__1151__AT2G31660.1 6069 0.0
> Ahg482091 jgi|Araly1|482091|fgenesh2_kg.4__1151__AT2G31660.1
Length=3817
Score = 6069 bits (3286), Expect = 0.0
Identities = 3672/3847 (95%), Gaps = 71/3847 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTCTCCTCCACTCTCGCCAACTATCAATCAAATCTTC-T-T-CTCCTTCTTCTCCGCC 57
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||
Sbjct 1 CCCTCTCCTCCACTCTCGCCAACTATC-ATCAAATCTTCTTCTCCTCCTTCTTCTCCGCC 59
Query 58 ATTCTTGT--C-C-CTCTTAAACCCTATCATGCTCTTCTGAG-ATTCTCCCCTCC-TCTA 111
|||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||| | | || |||| |||
Sbjct 60 ATTCTTGTCGCTCGCTCTAAAACCCTATCATGCTCTTCTGAGAAAT-TCAGCTCCTTCT- 117
Query 112 ATTCAGCTCTCTCTCTTGGTTGGGAATTTCAAATCGAATATCAACCACTGCCTCTGATCG 171
| || ||||||| ||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||
Sbjct 118 -TGAAG-------TCTTGGTCGGGAATTTCAAATCG-A-ATCCACTACTGCCTCTGATCG 167
Query 172 TCATCAAGGTTTACTCTGTTTAGTGTCCGGATTCTCAAACTCCACGGAGAATGGATCTGC 231
|||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 168 TCATCAAGCTTTACTCTGTCTAGTGTCCCGATTTTCAAACTCCACGGAGGATGGATCTGC 227
Query 232 ATAGCCTCGCTTTGATCCTCCGAACCGCCGCTCTTAGCCCTATTCCCGATGAGCGTAAAG 291
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 228 CTAGCCTCGCTTTGATCCTCCGAACCGCCGCGCTCAGCTCTATTCCCGATGAGCGTAAAG 287
Query 292 TTTCTGAGCAGCAACTCAATCAGTTGGAGCACACGCCCCAGCATTTGGTGAGGTTATTGC 351
||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 288 CTTCTGAGCAGCAACTCAATCAGTTGCAGCACATGCCTCAGCATTTGGTGAGGTTATTGC 347
Query 352 AGATAGCCGTGGATGGAAATTGTGACATGGCAGTGCGTCAAATTGCTAGTATTCAGTTCA 411
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 348 AGATAGCCGTGGATGGAAACTGTGACATGGCAGTGCGTCAAATTGCTAGTATTCAGTTCA 407
Query 412 AAAATTTAATTGCTAAGAACTGGTCACCTGAGGATTGTGGTCCTGCAGTAAGGCAGCAGC 471
|| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||
Sbjct 408 AACATTTAATTGCTAAGAACTGGTCACCTGAGGA------TCCTGGAG--A-GCAGCAGC 458
Query 472 AGATATTTG-AGAGTGACAAAGAATTGGTGAGGGACAATATTCTCGTCTATGTCACCCAA 530
||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 459 AGATA-TTGCAGAGTGACAAAGAATTGGTGAGGGACAATATTCTTGTCTATGTCACCCAA 517
Query 531 GTTCCAACCTTACTCAGATCACAACTTGGAGAGTCTCTCAAGACAATTATTTATGCTGAC 590
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 518 GTTCCAACCTTACTCAGATCACAACTTGGAGAGTGTCTCAAGACCATTATTTATGCTGAC 577
Query 591 TACCCAGAACAATGGCCACGTCTTCTGGATTGGGTGAAGTACAACTTGCAAAATCAACAA 650
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 578 TACCCAGAACAATGGCCACGTCTTCTGGATTGGGTGAAATACAACTTGCAAAATCAACAA 637
Query 651 ATTTATGGGGCTTTGTTTGTGTTGCGGATACTCTCTAGAAAATATGAGTTCAAGTCAGAT 710
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 638 ATTTATGGGGCTTTGTTTGTGTTGCGGATACTCTCTAGGAAATATGAGTTCAAGTCAGAC 697
Query 711 GAGGAGAGGACACCGGTTTCCCGCATTGTGGAGGAGACATTTCCTCAACTTTTGACTATT 770
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 698 GAGGAGAGGACACCGGTTTCCCGCATTGTGGAGGAGACATTTCCTCAACTTTTGACTATT 757
Query 771 TTTAATGGGCTTATCCAGATACCAAATCCGTCTCTGGAGATAGCAGAACTTATGAAGTTG 830
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 758 TTTAATGGGCTTATCCAGATACCTAATCCCTCTCTGGAGATAGCAGAACTTATGAAGTTG 817
Query 831 ATATGCAAAATATTTTGGTCATCCATATATCTGGAGCTTCCAAGGCAATTATTTGATCTA 890
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 818 ATATGCAAAATATTTTGGTCATCCATATATCTGGAGCTTCCAAGGCAATTATTTGATCTA 877
Query 891 AACGTCTTTAATGCCTGGATGGTTCTGTTCTTGAGTGTTTCGGAACGTCCTGTTCCAGTT 950
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 878 AATGTCTTTAATGCCTGGATGGTTCTGTTCTTGAGTGTTTCGGAGCGTCCTGTTCCAGTT 937
Query 951 GAAGGTCAGCCTATGGATCCGGAACTTAGAAAATCTTGGGGCTGGTGGAAGGTCAAGAAG 1010
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 938 GAAGGTCAGCCTATGGATCCGGAACTTAGAAAATCTTGGGGCTGGTGGAAGGTCAAGAAG 997
Query 1011 TGGACAGTGCACATTTTAAACAGGCTCTATAGTCGGTTTGGAGATCCAAAACTTCAAAGT 1070
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 998 TGGACAGTGCACATATTAAACAGGCTCTATAGTCGGTTTGGAGATCCAAAACTTCAAAGT 1057
Query 1071 CCAGAAAACAAACCTTTCGCCCAAATGTTTCAAAAGAATTATGCAGGCAGAATTTTGGAA 1130
||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1058 CCAGAAAACAAACCTTTTGCCCAAATGTTTCAGAAGAATTATGCAGGCAGAATTTTGGAA 1117
Query 1131 GGCCACCTAAATTTCTTGAACACAATTCGTGTTGGAGGCTATCTTCCTGACAGAGTTATC 1190
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1118 GGCCACCTAAATTTCTTGAATACAATTCGTGTTGGAGGCTATCTTCCTGACAGAGTTACC 1177
Query 1191 AATCTTCTCCTTCAGTACTTAAGCAACAGCATTTCGAAGAATAGCATGTACAAGTTGCTT 1250
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178 AATCTTCTCCTTCAGTACTTAAGCAACAGCATTTCGAAGAATAGCATGTACAAGTTGCTG 1237
Query 1251 CTGCCTCGGCTGGATGTTCTGCTTTTTGAGATTGTTTTCCCTCTAATGTGCTTTAATGAT 1310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1238 CTGCCTCGGCTGGATGTTCTGCTTTTTGAGATTGTTTTCCCTCTAATGTGCTTTAATGAT 1297
Query 1311 AATGATCAAAAGCTTTGGGAGGAAGACCCTCATGAATATGTGAGGAAAGGTTACAATATC 1370
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1298 AATGATCAAAAGCTTTGGGTGGAAGACCCACATGAATATGTGAGGAAAGGTTACAATATC 1357
Query 1371 ATTGAAGACTTGTACAGTCCGCGAACAGCGTCCATGGATTTTGTAAATGAGTTGGTTCGA 1430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1358 ATTGAAGACTTGTACAGTCCGCGAACAGCGTCCATGGATTTTGTAAATGAGTTGGTTAGA 1417
Query 1431 AAACGTGGGAAAGAAAACCTTCCGAAGTTTGTTAAGTTTGTCGTTGAGATCTTCTTGAGT 1490
|||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||
Sbjct 1418 AAACGTGGGAAAGAGAACCTTCCGAAGTTTGTTCAGTTTATCGTTGGGATCTTCAGGAGT 1477
Query 1491 TATGAAAAAGCTACTGTAGAGGAGAAGCCTTATCGCCAAAAAGATGGTGCGATGCTGGCT 1550
||||| ||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1478 TATGATGAAGCTCCTGCAGAGCATAAGCCTTATCGCCAAAAAGATGGTGCGATGCTTGCT 1537
Query 1551 GTTGGAGCTCTTTGTGACAAATTGAAGCAAACGGATCCCTATAAATCTCAACTAGAGC-T 1609
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 1538 GTTGGAGCTCTTTGTGACAAATTGAAGCAAACGGATCCCTATAAATCTGAACTAGAGCGT 1597
Query 1610 AATGTTGGTGCAACATATTTTTCCTGATTTCAATAGTCCAGTTGGACATCTTAGAGCAAA 1669
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1598 -ATGTTGGTGCAACATATTTTTCCTGATTTCAGTAGTCCAGTTGGACATCTTAGAGCAAA 1656
Query 1670 GGCTGCATGGGTAGCTGGGCAATATGCACACATCAATTTCTCAGATCAGAACAACTTTCG 1729
||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1657 GGCCGCTTGGGTAGCTGGGCAATATGCACATATCAATTTCTCCGATCAGAACAACTTTCG 1716
Query 1730 TAAAGCATTGCACAGTGTTGTTTCGGGACTGCGCGATCCTGATCTCCCTGTTCGTGTTGA 1789
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1717 TAAAGCATTGCACAATGTTGTTTCGGGACTGCGCGATCCTGACCTCCCTGTTCGTGTTGA 1776
Query 1790 TTCAGTTTTTGCATTGCGTTCATTTGTTGAGGCGTGCAAGGATTTAAATGAGATACGTCC 1849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TTCAGTTTTTGCATTGCGTTCATTTGTTGAGGCGTGCAAGGATTTAAATGAGATACGTCC 1836
Query 1850 AATCCTCCCTCAGTTACTTGATGAATTTTTCAAACTCATGAATGAGGTAGAGAATGAGGA 1909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1837 AATCCTCCCTCAGTTACTTGATGAATTTTTCAAACTCATGAATGAGGTAGAGAATGAGGA 1896
Query 1910 CCTTGTTTTTACTTTGGAGACCATCGTAGATAAGTTTGGCGAAGAGATGGCTCCTTTTGC 1969
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1897 CCTTGTTTTTACTTTGGAGACCATCGTAGATAAGTTTGGCGAAGAGATGGCTCCTTTTGC 1956
Query 1970 TTTTGGATTATGTCAAAATCTGGCGGCTGCGTTTTGGAGATGTCTAAACACGTCAGAAGC 2029
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1957 TTTTGGATTATGTCAAAATCTGGCGGCTGCATTTTGGAGATGTCTAAACACGTCAGAAGC 2016
Query 2030 CAATGACGACTCTGATGACATGGGAGCTTTAGCTGCCGTTGGTTGTTTGCGTGCCATAAG 2089
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2017 CAATGACGACTCTGATGACATGGGAGCTTTAGCTGCAGTTGGTTGTTTGCGTGCCATAAG 2076
Query 2090 TACAATCCTTGAATCTGTTAGCAGTCTCCCGCAGCTGTTTGTTGAGATAGAACCAACTAT 2149
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2077 TACAATCCTTGAATCTGTTAGCAGTCTCCCGCAGCTGTTCGTTGAGATAGAACCAACTAT 2136
Query 2150 ACTTCCAATAATGCAGAAAATGTTGACCACTGATGGCCAAGAGGTATTTGAAGAAGTTTT 2209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2137 ACTTCCAATAATGCAGAAAATGTTGACCACTGATGGCCAAGAGGTATTTGAAGAAGTTTT 2196
Query 2210 GGAGATTGCATCATACATGACCTTTTATTCACCTAGCATTTCCTTGGATATATGGAGTCT 2269
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2197 GGAGATTGCATCATACATGACCTTTTATTCACCTAGCATTTCCTTGGATATATGGAGTCT 2256
Query 2270 CTGGCCTTTAATGGTGGAAGCATTGGTTGATTGGGGAATCGATTTCTTTCCAAATATTTT 2329
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2257 CTGGCCTTTAATGGTGGAAGCATTGGTTGATTGGGCAATCGATTTCTTTCCAAATATTTT 2316
Query 2330 GGTTCCAATGGACAACTTTATATCAAGGGGAACGGCTCATTTTCTCACTTGCAAAGAGCC 2389
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2317 GGTTCCAATGGACAACTTTATATCAAGGGGAACGGCTCATTTTCTCACTTGCAAGGAGCC 2376
Query 2390 CGACTATCAGCAAAGTCTATATAACGTTCTTTCAACTCTTATGACCGACAGAAACATAGA 2449
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2377 CGACTATCAGCAAAGTCTGTATAACGTTCTTTCAACTCTTATGACCGACAGAAACATAGA 2436
Query 2450 AGACAGTGAAATTGAGTCTGCTCCAAAGCTTATTGAAGTTGTTTTCCAGAATTGCAAAGG 2509
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2437 AGACAGTGAAATTGAGTCTGCTCCAAAGCTTATTGAAGTTGTTTTCCAGAATTGCAAAGG 2496
Query 2510 GCAGGTGGATCAGTGGGTTGAACCATATCTGCGTCTCACTGTTGACCGGTTACAACGGGC 2569
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2497 GCAGGTGGATCAGTGGGTTGAACCATATCTGCGTCTTACTGTTGACCGGTTACAACGGGC 2556
Query 2570 TGAGACTTCGTATGTTAAATCTCTTCTTATACAAGTGGTGGCAAATATGCTTTACTACAA 2629
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2557 TGAGACTTCGTATGTAAAATCTCTTCTTATACAAGTGGTGGCAAATATGCTTTACTACAA 2616
Query 2630 TCCAGGTTTGACGCTTGGTGTATTGCATAACACAGGACTTGCTTCCAAAGTCTTTGACCT 2689
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2617 TCCAGGTTTGACGCTTGGTGTATTGCATAACACGGGACTTGCTTCCAAAGTCTTTGACCT 2676
Query 2690 TTGGTTCCAGATGTTGCAGCAAAAGAGAAAAAGTGGCCTGCCAGCAAACTTCAAAAGGGA 2749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2677 TTGGTTCCAGATGTTGCAGCAAAAGAGAAAAAGTGGCCTACCAGCAAACTTCAAAAGGGA 2736
Query 2750 ACATGATAAAAAGGTTTGCTGCTTGGGTTTGACTTCATTACTTGCTCTCCCTGGGGGTCA 2809
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 2737 ACATGATAAAAAGGTTTGCTGCTTGGGTTTGACTTCATTACTTGCTCTACCGGGGGGTCA 2796
Query 2810 ATTCCCCGATGAAGCGCTGCAGCGTGTTTTCAGGGCAACACTTGATCTTCTAGTTGCATA 2869
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2797 ATTACCCGATGAAGCGCTGCAGCGTGTTTTCAGGGCAACACTTGATCTTCTAGTTGCATA 2856
Query 2870 TAAGAATCAGCTAGCTGAAGCAGCTAAGGAGACAGAAGTAGATTATGAAGAAGAAATGAA 2929
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 2857 TAAGAATCAGCTAGCTGAAGCAGCTAAGGAGGCAGAAGTAGATTATGAGGATGAAATGAA 2916
Query 2930 TGGACTCCAGAGT-AGtgatgatgattatgatgatgatgggtctgatgg-g-ga-g---a 2982
||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | || | |
Sbjct 2917 TGGACTCCAGAGTGA-TGATGACGATGATGATGATGATGGGTCTGATGGAGAGATGGGGA 2975
Query 2983 tggatgatACAGAGGAAGGAGATGAAGCACAAAGTGTTAAACTGCAGAAGTTAGCTGCAC 3042
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2976 TGGATGATATAGAGGTTGGAGATGAAGCACAAAGTGCTAAACTGCAGAAGTTAGCTGCAC 3035
Query 3043 AGGCAAAGGCCTTCCACTatgatgatgatgatgacgacgattctgatgatgactttagtg 3102
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3036 AGGCAAAGGCCTTCCACTATGATGATGATGATGACGATGATTCTGATGATGACTTTAGTG 3095
Query 3103 atgaGGACGAGTTTCAGTCACCCATCGATGAGGTGGATGCCTTTGTATTCTTTGTCGATG 3162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3096 ATGAGGACGAGTTTCAGTCACCCATCGATGAGGTGGATGCCTTTGTATTCTTTGTCGATG 3155
Query 3163 CAATCAGAGTTATGCAGGCATCAGATGCGCAGAGGTTTCAGAACCTGAACCAGTCACTGG 3222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 3156 CAATCAGAGTTATGCAGGCATCAGATGCGCAGAGGTTCCAGAACCTTAACCAGTCACTGG 3215
Query 3223 ACTTCACTTACCAGGCGATTGCAAACGGAATAGCACAGCATGCAGAGCTGAGAAGAGTGG 3282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3216 ACTTCACTTACCAGGCGATTGCAAACGGAATAGCACAGCATGCGGAGCTGAGAAGAGTGG 3275
Query 3283 AGATCGAGAAGGAGAAGCAAAAGAAGTTAGCAG---CTGCTTCTACTCCTGTTACTGCTC 3339
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||
Sbjct 3276 AGATCGAGAAGGAGAAGCAAAAGAAGTTAGCAGAAGCTGCTTCTACTCCTGTTCCTACTC 3335
Query 3340 TATGAT--T--T-T-T-A--AGCTTTGGATCAAAGTCAGAGTCTGATACACAGATGGTGT 3390
| || | | | | | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3336 T-TGTTCCTACTCTATGATCAGCTTTGGATCAAAGTCACAGTCTGATACACAGATGGTGT 3394
Query 3391 CATTTTTGTGAGAGATTCTCGTTCATAAATATTTGGCATAGTCGCTTGCTTCGAGGTTAT 3450
|||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3395 CATTTTTGTGAGAGATTCTCGTTCATGATTATTTGGCATAGTTGCTTGCTTCGAGGTTAT 3454
Query 3451 ACAAATGAAGAAGCAGATTTTGTGAATTTT-AGCAGAAGAGATCATCCCTAGAACCTTGT 3509
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3455 ACAAATGAAGAAGCAGATTTTGTGAATTTTTAGCAGAAGAGATCATCTCTAGAACCTTGT 3514
Query 3510 GAAACCGTGTGGTTACGGTTGATGAAGATGGAGTCTCTTAT-GGTATGAAGAAAG-TGTG 3567
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||
Sbjct 3515 GAAACCGTGTGGTTAGGGTTGATGAAGATGGAGTCTCTTATTGGT-TGAAGAAAGGTGTG 3573
Query 3568 TACTATACAATGTGTTGCGTCTCTTCTTTTGGATTGGTTGTATTCGTAAAGAAAGACAGT 3627
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3574 TACTATACAATGTGTTGCGTCTCTTCTTTTGGATTGGTTGTATTGGTAAAGAAAGACAGT 3633
Query 3628 TTTT-GGGGAGGGTGGGG-G----ATTTTGTGTACTCTTTATCCTATATTATGTGTTTGG 3681
|||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 3634 TTTTTGGGGAGGGTGGGGTGGGGGATTTTGTGTACTCTTTATCCTAT-T-ATGTGTTTGG 3691
Query 3682 TCTTTT-GGGATGTGATAGAtttttttAGGAAAAGCTATATTGAATTTTTTGTGATCTCA 3740
|||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3692 TCTTTTTGGGATGTGTTAGATATTTTTAGGGAAAGCTATATTGAATTTTT-GTGATCTCA 3750
Query 3741 CAGAGAGATCAGCAA-GGTCACTCATCAGGTTGTACGACCATTCTTTCATAAAGTGATAA 3799
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3751 CAGAGAGATCAGCAAAGGTCACTCATCAGGTTGTACGACCATTCTTTCATAAAGTGATAA 3810
Query 3800 TTATTAT 3806
|||||||
Sbjct 3811 TTATTAT 3817
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 144047913805
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5