BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G31970.1
Length=4371
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg344958 jgi|Araly1|344958|fgenesh1_pg.C_scaffold_4001300 2769 0.0
Ahg952500 jgi|Araly1|952500|scaffold_8000008.1 1050 0.0
Ahg339096 jgi|Araly1|339096|fgenesh1_pg.C_scaffold_2001195 313 9e-84
> Ahg344958 jgi|Araly1|344958|fgenesh1_pg.C_scaffold_4001300
Length=3705
Score = 2769 bits (1499), Expect = 0.0
Identities = 1615/1673 (97%), Gaps = 0/1673 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 167 ATGAGTACGGTCGATAAAATGTTGATCAAGGGTATAAGAAGCTTCGACCCAGAAAATAAG 226
||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGTACGGTCGATAAAATGCTGATCAAGGGCATCAGAAGCTTCGACCCAGAAAATAAG 60
Query 227 AACGTTGTTACTTTCTTCAGACCTTTAACCCTAATCGTCGGCGCTAACGGAGCCGGAAAA 286
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 61 AACGTTGTTACCTTCTTCAGACCTTTAACCCTAATCGTCGGTGCCAACGGAGCCGGAAAA 120
Query 287 ACTACGATTATAGAGTGTTTAAAGGTGTCTTGTACCGGAGAGTTGCCACCGAACGCGAGG 346
|||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 121 ACTACGATTATAGAGTGTTTAAAGGTCTCTTGCACTGGAGAGTTGCCACCGAACGCAAGG 180
Query 347 TCTGGTCATAGCTTCATTCATGACCCTAAGGTTGCTGGAGAAACGGAGACAAAAGCACAA 406
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TCTGGTCATAGCTTCATTCATGACCCCAAGGTTGCCGGGGAAACGGAGACAAAAGCACAA 240
Query 407 ATAAAGCTGAGATTCAAGACAGCTGCAGGGAAGGATGTGGTATGTATAAGGTCATTTCAG 466
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 241 ATTAAGCTGAGATTCAAGACAGCTGCAGGGAAGGATGTGGTATGCATAAGGTCATTTCAG 300
Query 467 TTGACGCAAAAGGCTTCAAAGATGGAGTACAAGGCTATTGAGAGTGTGCTTCAAACCATT 526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TTGACGCAAAAGGCTTCAAAGATGGAGTACAAGGCTATTGAGAGTGTGCTTCAAACCATT 360
Query 527 AATCCTCACACTGGAGAGAAAGTATGTCTCAGCTACAGATGCGCTGACATGGATAGGGAG 586
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 AATCCTCACACTGGAGAGAAAGTATGTCTCAGCTACAGATGCGCTGACATGGATAGGGAG 420
Query 587 ATACCAGCTTTGATGGGTGTGTCAAAAGCTATTTTAGAAAACGTCATATTTGTGCATCAG 646
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 421 ATACCAGCTTTGATGGGTGTGTCAAAAGCTATTTTAGAAAACGTCATCTTTGTGCATCAG 480
Query 647 GATGAGTCTAACTGGCCACTGCAAGATCCTTCTACTTTGAAAAAGAAGTTTGATGATATT 706
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GATGAGTCTAACTGGCCACTGCAAGATCCTTCTACTTTGAAAAAGAAGTTTGATGATATT 540
Query 707 TTCTCAGCCACCAGATATACAAAGGCTCTGGAAGTTATTAAGAAACTTCACAAGGATCAA 766
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TTTTCAGCCACCAGATATACAAAGGCTCTGGAAGTTATTAAGAAACTTCACAAGGATCAA 600
Query 767 GCTCAGGAGATAAAAACTTTCAAGTTAAAATTGGAAAATCTGCAGACCTTGAAAGACGCA 826
|||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 601 GCTCAGGAAATAAAAACTTTTAAGTTAAAGTTGGAAAACCTGCAGACCTTGAAAGATGCA 660
Query 827 GCTTATAAGCTTCGTGAGAGCATTGCTCAAGATCAAGAAAGGACAGAATCTTCAAAAGTT 886
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 GCTTATAAGCTTCGGGAGAGCATTGCGCAAGATCAAGAAAGGACAGAATCTTCAAAAGTG 720
Query 887 CAGATGTTGGAACTGGAAACCAGTGTTCAGAAAGTTGATGCTGAAGTTCATAATAAGGAA 946
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 CAGATGTTGGAACTGGAAACCAGCATTCAGAAAGTTGATGCTGAAGTTCATAATAAGGAA 780
Query 947 ATGATGTTAAAAGATCTGAGAAAGCTCCAGGACCAAGTATCAATAAAAACTGCGGAAAGG 1006
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 781 ATGATGTTAAAAGATCTGAGAAAGCTACAAGACCAAGTATCAAGAAAAACTGCGGAAAGG 840
Query 1007 AGCACCTTGTTTAAGGAGCAGCAGAGACAGTATGCAGCATTACCTGAGGAAAATGAAGAT 1066
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 AGCACCTTGTTTAAGGAGCAGCAGAGACAGTATGCAGCATTACCTGAGGAAAATGAAGAT 900
Query 1067 ACTATTGAAGAATTGAAAGAATGGAAAAGCAAGTTTGAAGAAAGACTTGCTCTTTTGGGG 1126
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
Sbjct 901 ACTATTGAAGAACTGAAAGAATGGAAAAGCAAGTTTGAAGAAAGAATTGCTCTTTTGGAG 960
Query 1127 ACCAAAATTCGAAAAATGGAGAGAGAGATGGTTGACACAGAAACTACAATTTCTTCGCTT 1186
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 961 ACCAAAATTCGAAAAATGGAGAGAGAGATGGATGACACAGCAACTACAATTTATTCGCTT 1020
Query 1187 CACAATGCAAAAACTAACTATATGCTGGAGATCAGCAAGCTACAAACAGAAGCTGAAGCT 1246
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 AACAATGCAAAAACTAACTATATGCTGGAGATCAGCAAGCTACAAACAGAAGCTGAAGCT 1080
Query 1247 CATATGCTGCTGAAGAATGAAAGAGATTCTACCATCCAGAACAtttttttCCATTACAAT 1306
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||
Sbjct 1081 CATATGCTGCTGAAGAATGAAAGAGATTCTACCATTCAGAAAATTTTTTCCCATCACAAT 1140
Query 1307 TTAGGAAATGTTCCTAGTACCCCCTTCAGTACTGAGGTAGTTTTGAATCTCACAAATCGA 1366
|||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 TTAGGAAATGTTCCTAGTACTCCCTTCGGTACTGAGGTAGTTTTGAATCTCACAAATCGA 1200
Query 1367 ATAAAATCAAGACTGGGTGAACTTGAGATGGATTTGCTCGATAAGAAGAAATCAAATGAA 1426
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 ATAAAATCAAGACTGGGTGAACTTGAGATGGACTTGCTCGATAAGAAGAAATCAAATGAA 1260
Query 1427 ACTGCTCTAAGTACGGCTTGGGATTGCTATATGGATGCTAATGACCGTTGGAAAAGCATC 1486
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1261 ACTGCTCTAAGTACAGCTTGGGATTGCTATATGGATGCTAATGATCGTTGGAAAAGCATT 1320
Query 1487 GAAGCTCAGAAACGAGCTAAAGATGAAATCAAGATGGGCATATCAAAACGCATAGAAGAG 1546
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 GAAGCTCAGAAACGAGCTAAAGACGAAATCAAGATGGGCATATCAAAACGCATAGAAGAG 1380
Query 1547 AAAGAAATTGAGCGTGATTCATTTGAATTCGAAATTTCCACTGTGGATGTTAAACAAACT 1606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1381 AAAGAAATTGAGCGTGATTCATTTGAATTCGAAATTTCCACTGTGAATGTTAAACAAACT 1440
Query 1607 GATGAAAGAGAGAAACAAGTGCAAGTTGAGCTTGAGAGAAAGACAAAACAGAATTCTGAA 1666
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1441 GATGAAAGAGAGAAACAAGTGCAAATTGAGCTTGAGAGAAAGACAACACAGAATTCTGAA 1500
Query 1667 AGGGGATTTGAATCCAAAATAGAACAGAAACAGCATGAAATATACAGCTTGGAGCATAAA 1726
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct 1501 TTGGGATTTGAATCCAAAATAGAACAGAAACAGCATGAAATCTACAGCATGGAGCATAAA 1560
Query 1727 ATCAAGACACTGAATCGAGAAAGAGACGTTATGGCTGGTGATGCTGAGGATAGAGTGAAA 1786
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 ATTAAGACACTGAATCGAGAAAGAGATGTTATGGCTGGTGATGCTGAGGATAGAGTGAAA 1620
Query 1787 TTGTCTTTAAAGAAGACGGAACAGGAGAATCTTAAGAAGAAACACAAAAAGAT 1839
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1621 TTGTCTTTAAAGAAGACGGAACAGGAGAATCTTAGGAAGAAACACAAAAAGAT 1673
Score = 2193 bits (1187), Expect = 0.0
Identities = 1339/1408 (95%), Gaps = 28/1408 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1933 GTCAATTGAAAGGGAATATGATGACCTCAGTTTGAAATCCCGAGAAGCAGAAAAGGAGGT 1992
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1674 GTCAATTGAAAGGGAATATGATGACCTGAGTTTGAAATCCCGACAAGCAGAAAAGGAGGT 1733
Query 1993 CAACATGTTGCAGATGAAGATACAAGAAGTAAACAATAGCCTATTCAAGCATAACAAGGA 2052
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1734 CAACATGTTGCAGATGAAGATACAAGAAGTAAACAATAGCCTATTCAAGCACAACAAGGA 1793
Query 2053 TACAGAATCAAGAAAGAGATACATTGAGTCCAAGCTTCAGGCCTTAAAACAGGAATCAGT 2112
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1794 TACAGAATCAAGAAAGAAATACATTGAGTCCAAGCTTCAGGCCTTAAAACAGGAATCAGT 1853
Query 2113 TACCATTGATGCTTATCCCAAATTGTTGGAGTCGGCTAAGGACAAAAGAGATGACCGTAA 2172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1854 TACCATTGATGCTTATCCCAAATTGTTGGAGTCGGCTAAGGACGAAAGAGATGACCGTAA 1913
Query 2173 ACGCGAA-TATAACATGGCAAATGGTATGCGTC-AGATGTTTGAACCTTTTGAGAAACGA 2230
| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |
Sbjct 1914 AAGC-AAGTATAACATGGCAAATGGTATGCG-CAAGATGTTTGAACCTTTTGAGGATTTA 1971
Query 2231 GCACGTCAAGAGCATTCTTGTCCTTGCTGCGAGCGCTCTTTTACAGCTGATGAAGAGGCT 2290
||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
Sbjct 1972 GCACGTCAACATCATTATTGTCCTTGCTGTGAGCGCTCTTTTACAACTGATGAAGAGGAT 2031
Query 2291 AGCTTTATTAAGAAGCAAAGGGTAAAGGCTTCAAGCACAGGGGAGCATCTTAAAGCATTA 2350
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||
Sbjct 2032 AGCTTTGTTAAGAAGCAAAGGGTAAAGGCTTCAACCACGGGGGAGCATCTTAAAGAATTA 2091
Query 2351 GCAGTGGAGTCTTCCAATGCTGACTCTGTATTTCAACAGCTAGACAAACTACGGGCAGTT 2410
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2092 GCAGTGGAGTCTTCCAATGCTGACTCTGTATTTCAGCAGCTAGACAAACTACGGGCAGTT 2151
Query 2411 TTTGAAGAATACTCGAAACTAACTACTGAAATTATTCCTCTCGCTGAGAAAACTTTGCAA 2470
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2152 TTTGAAGAATACTCGAAACTAACTAGTGAAATTATTCCTCTCGCTGAGAAAACTTTGCAA 2211
Query 2471 GAGCATACAGAAGAGCTGGGTCAGAAGTCTGAAGCTCTTGATGATGTATTAGGAATCTCT 2530
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2212 GAGCATACAGAAGAGCTGGGTCAGAAGTCTCAAGCTCTTGATGATGTATTAGGAATCTCT 2271
Query 2531 GCACAGATAAAAGCTGACAAAGACTCGATTGAAGCACTGGTGCAGCCCCTCGAAAATGCT 2590
|| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 2272 GCCCAGATAAAAGCTGACAAAGACTCAATTGAAGCACTGGTGCATCCCCTGGAAAATGCT 2331
Query 2591 GACAGGATCTTTCAGGAAATCGTATCCTACCAAAAGCAAATTGAAGATCTTGAATATAAG 2650
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2332 GACAGGACCTTTCAGGAAATCGTATCCTACCAAAAGCAAATTGAAGATCTTGAATATAAG 2391
Query 2651 CTTGATTTTAGGGGTCTTGGGGTTAAAACTATGGAAGAAATCCAATCAGAATTAAGTAGC 2710
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2392 CTTGATTTCAGGGGTCTTGGGGTTAAAACTATGGAAGAAATCCAATCAGAATTAAGTAGC 2451
Query 2711 CTCCAAAGCAGCAAGGATAAATTGCACGGTGAGCTGGAGAAACTTAGAGATGACCAGATT 2770
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2452 CTCCAAAGCAGCAAGGATAAATTGCACGGTGAGCTGGAGAAACTTAGAGATGACCAGATT 2511
Query 2771 TACATGGAACGTGATATATCATGCCTCCAGGCCAGATGGCATGCAGTAAGGGAGGAGAAG 2830
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2512 TACATGGAACGTGATATATCATGCCTCCAGGCCAGATGGCATGCAGTAAGGGAAGAGAAG 2571
Query 2831 GCCAAGGCAGCCAATTTGTTACGGGACGTTACAAAGGCAGAAGAAGACCTGGAGCGTTTA 2890
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2572 GCTAAGGCAGCCAATTTGTTACGCGACGTTACAAAGGCAGAAGAAGACCTGGAGCGTTTA 2631
Query 2891 GCCGAGGAGAAAAGTCAACTTGACCTCGATGTGAAGTATTTGACCGAGGCCCTGGGCCCT 2950
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2632 ACCGAGGAGAAAAGTCAACTTGACCTCGACGTGAAGTATTTGACCGAGGCACTGGGCCCG 2691
Query 2951 TTATCCAAGGAAAAAGAGCAATTACTGAGTGACTACAATGATATGAAGATTAGACGTAAT 3010
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2692 TTATCCAAGGAAAAAGAGCAGTTACTGAGTGACTACAATGATATGAAGATTAGACGTAAT 2751
Query 3011 CAAGAGTATGAAGAACTGGCTGAGAAAAAGAGAAACTACCAACAGGAAGTTGAGGCATTA 3070
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2752 CAAGAGTATGAAGAACTGGCTGACAAAAAGAGAAACTACCAACAGGAAGTTGAGGCATTA 2811
Query 3071 CTCAAGGCCAGTT--A---TAAA--A-TA-----A-A--TG----A---G-TATCATGAT 3106
||||||||||||| | |||| | || | | || | | |||||||||
Sbjct 2812 CTCAAGGCCAGTTCTAAGATAAATGAATATGCTTACAGCTGCTTCACCAGGTATCATGAT 2871
Query 3107 CTGAAGAAAGGGGAGCGCTTAGATGATATTCAAGAAAAGCAGCGGTTATCTGATTCTCAG 3166
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 2872 CTGAAGAAAGGGGAGCGCTTAAATGATATTCAAGAAAAGCAGCGGTTATCCGAATCTCAG 2931
Query 3167 CTTCAGAGCTGTGAAGCTAGAAAGAATGAACTTGCAGGTGAACTGAACAGAAATAAAGAC 3226
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2932 CTTCAGAGCTGTGAAGCTAGAAAGAATGAACTTGCAGGTGAACTGAACAGAAATAAAGAC 2991
Query 3227 TTGATGCGGAATCAAGATCAACTGAGAAGAAATATAGAGGATAACTTGAACTACCGGACA 3286
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2992 TTGATGCGGAATCAAGATCAACTGAGAAGAAATATAGAGGATAACTTGAACTACCGGACA 3051
Query 3287 ACAAAAGCAAAAGTTGAGGAGCTTACAC 3314
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3052 ACAAAAGCAAAAGTTGAGGAGCTTACAC 3079
Score = 612 bits (331), Expect = 8e-174
Identities = 336/338 (99%), Gaps = 2/338 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3421 GCTGAACCGGTGTCGTGGAACAGTGTCTGTTTACGAGAGCAGTATTTCAAAGAACAGAGT 3480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3108 GCTGAACCGGTGTCGTGGAACAGTGTCTGTTTACGAGAGCAGTATTTCAAAGAACAGAGT 3167
Query 3481 GGAGCTAAAA-CAGGCACAATACAAGGACATAGATAAGCGGCACTTTGATCAACTGATCC 3539
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3168 GGAGCTAAAAGC-GGCACAATACAAGGACATAGATAAGCGGCACTTTGATCAACTGATCC 3226
Query 3540 AGCTAAAGACAACTGAAATGGCAAATAAAGACTTGGATAGATACTACAATGCCCTTGACA 3599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3227 AGCTAAAGACAACTGAAATGGCAAATAAAGACTTGGATAGATACTACAATGCCCTTGACA 3286
Query 3600 AAGCACTAATGCGCTTCCACACAATGAAAATGGAGGAAATAAATAAGATTATAAGGGAAC 3659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3287 AAGCACTAATGCGCTTCCACACAATGAAAATGGAGGAAATAAATAAGATTATAAGGGAAC 3346
Query 3660 TGTGGCAGCAGACATACAGAGGTCAAGATATGGATTACATACGAATACACTCAGATTCCG 3719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3347 TGTGGCAGCAGACATACAGAGGTCAAGATATGGATTACATACGAATACACTCAGATTCCG 3406
Query 3720 AAGGTGCAGGCACCCGCTCTTACAGCTACAAGGTTCTT 3757
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3407 AAGGTGCAGGCACCCGCTCTTACAGCTACAAGGTTCTT 3444
Score = 472 bits (255), Expect = 1e-131
Identities = 263/267 (99%), Gaps = 0/267 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3812 AAGGTTCTTGCTTCATTGATAATTAGGTTGGCTTTAGCCGAGACATTTTGCTTAAACTGT 3871
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3436 AAGGTTCTTGCTTCATTGATAATTAGGCTGGCTTTAGCTGAGACATTTTGCTTAAACTGT 3495
Query 3872 GGAATATTAGCCCTTGATGAGCCAACTACAAACCTGGATGGGCCCAATTCAGAATCTCTT 3931
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3496 GGAATATTAGCCCTCGATGAGCCAACTACAAACCTGGATGGGCCCAATTCAGAATCTCTT 3555
Query 3932 GCAGGAGCTCTTCTTAGGATCATGGAAGACAGAAAGGGCCAAGAGAATTTCCAACTCATA 3991
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3556 GCAGGAGCTCTTCTTAGGATCATGGAAGACAGAAAGGGCCAAGAGAATTTCCAACTCATA 3615
Query 3992 GTCATTACCCACGATGAACGCTTTGCTCAAATGATTGGCCAAAGGCAACATGCTGAAAAA 4051
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3616 GTCATTACCCACGATGAACGCTTTGCTCAAATGATTGGCCAACGGCAACATGCTGAAAAA 3675
Query 4052 TATTACCGGGTCGCAAAAGATGATATG 4078
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3676 TATTACCGGGTCGCAAAAGATGATATG 3702
> Ahg952500 jgi|Araly1|952500|scaffold_8000008.1
Length=601
Score = 1050 bits (568), Expect = 0.0
Identities = 584/592 (99%), Gaps = 0/592 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3546 AGACAACTGAAATGGCAAATAAAGACTTGGATAGATACTACAATGCCCTTGACAAAGCAC 3605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 10 AGACAACTGAAATGGCAAATAAAGACTTGGATAGATACTACAATGCCCTTGACAAAGCAC 69
Query 3606 TAATGCGCTTCCACACAATGAAAATGGAGGAAATAAATAAGATTATAAGGGAACTGTGGC 3665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 70 TAATGCGCTTCCACACAATGAAAATGGAGGAAATAAATAAGATTATAAGGGAACTGTGGC 129
Query 3666 AGCAGACATACAGAGGTCAAGATATGGATTACATACGAATACACTCAGATTCCGAAGGTG 3725
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 130 AGCAGACATACAGAGGTCAAGATATGGATTACATACGAATACACTCAGATTCCGAAGGTG 189
Query 3726 CAGGCACCCGCTCTTACAGCTACAAGGTTCTTATGCAGACTGGTGATACAGAACTTGAAA 3785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 190 CAGGCACCCGCTCTTACAGCTACAAGGTTCTTATGCAGACTGGTGATACAGAACTTGAAA 249
Query 3786 TGAGAGGAAGATGCAGTGCAGGTCAAAAGGTTCTTGCTTCATTGATAATTAGGTTGGCTT 3845
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 250 TGAGAGGAAGATGCAGCGCAGGTCAAAAGGTTCTTGCTTCATTGATAATTAGGTTGGCTT 309
Query 3846 TAGCCGAGACATTTTGCTTAAACTGTGGAATATTAGCCCTTGATGAGCCAACTACAAACC 3905
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 310 TAGCTGAGACATTTTGCTTAAACTGTGGAATATTAGCCCTCGATGAGCCAACTACAAACC 369
Query 3906 TGGATGGGCCCAATTCAGAATCTCTTGCAGGAGCTCTTCTTAGGATCATGGAAGACAGAA 3965
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 TGGATGGGCCCAATTCAGAATCTCTTGCAGGAGCTCTTCTTAGGATCATGGAAGACAGAA 429
Query 3966 AGGGCCAAGAGAATTTCCAACTCATAGTCATTACCCACGATGAACGCTTTGCTCAAATGA 4025
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 430 AGGGCCAAGAGAATTTCCAACTCATAGTCATTACCCACGATGAACGCTTTGCTCAAATGA 489
Query 4026 TTGGCCAAAGGCAACATGCTGAAAAATATTACCGGGTCGCAAAAGATGATATGCAACACA 4085
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 490 TTGGCCAACGGCAACATGCTGAAAAATATTACCGGGTCGCAAAAGATGATATGCAACACA 549
Query 4086 GCATAATCGAGGCCCAAGAGATCTTTGATTGATAAACCAGTGGCTTGTTCTA 4137
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 550 GCATAATCGAGGCCCAAGAGATCTTTGATTGATAAATTGGTTGCTTGTTCTA 601
> Ahg339096 jgi|Araly1|339096|fgenesh1_pg.C_scaffold_2001195
Length=1329
Score = 313 bits (169), Expect = 9e-84
Identities = 197/211 (93%), Gaps = 0/211 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2514 ATGTATTAGGAATCTCTGCACAGATAAAAGCTGACAAAGACTCGATTGAAGCACTGGTGC 2573
||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 131 ATGTATTAGAAATCTCTGCCCAGACAAAAGCTGGCAAAGACTCAATTGAAGCACTGGTGC 190
Query 2574 AGCCCCTCGAAAATGCTGACAGGATCTTTCAGGAAATCGTATCCTACCAAAAGCAAATTG 2633
||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 191 AGCCCCTGGAAAATGCTGGCAGGATCTTTCAGGAAATCGTATCCTACCAAAAGCAAATTG 250
Query 2634 AAGATCTTGAATATAAGCTTGATTTTAGGGGTCTTGGGGTTAAAACTATGGAAGAAATCC 2693
||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 251 AAGATCTTGAATATAAGCTCGATTTCAGGGGTCTTTGGGCTAAAACTATGGAAGAAATCC 310
Query 2694 AATCAGAATTAAGTAGCCTCCAAAGCAGCAA 2724
|||||||| |||||| |||||| ||||||||
Sbjct 311 AATCAGAACTAAGTACCCTCCATAGCAGCAA 341
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 165322097112
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5