BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G32730.1
Length=3430
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg482209 jgi|Araly1|482209|fgenesh2_kg.4__1269__AT2G32730.1 5505 0.0
Ahg470466 jgi|Araly1|470466|fgenesh2_kg.1__420__AT1G04810.1 3369 0.0
Ahg315425 jgi|Araly1|315425|fgenesh1_pm.C_scaffold_2000458 767 0.0
> Ahg482209 jgi|Araly1|482209|fgenesh2_kg.4__1269__AT2G32730.1
Length=3302
Score = 5505 bits (2981), Expect = 0.0
Identities = 3205/3313 (97%), Gaps = 15/3313 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 19 AAAA-CACTCTTC-TTCAAATCCAGTAGAGAGATTCAAGACGAGTCTCATCGAAAGTTCG 76
|||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1 AAAACCACTC-TCTTTCAAACCCAGTAGAGAGATTCAAGACGGGTCTCATCGAAAGTTCG 59
Query 77 AATCTTTCGTCATCTGATTAGCTTTCTCTTAGGGTTTATTTCGATTTCGATTTAGTGTTC 136
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 60 AATCTTTCGTCATCTGATTTGCTTTCTCTTAGGGTTT-TTTCAATTTCGATTTAGTGTTC 118
Query 137 TCCATCAATGGCGACACCCATGGTTAGTTCCGCTGGAGGATTACTAGCAATGCTCAACGA 196
| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 119 TTCATCAATGGCGACACCCATGGTTAGTTCGGCTGGAGGGTTACTAGCAATGCTCAACGA 178
Query 197 GCCTCATCCTGTTTTGAAGCTTCATGCGCTCTCTAACCTCAACAATTTGGTTGACCAATT 256
||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 179 GCCTCATCCTGCTTTAAAGCTTCATGCGCTCTCTTATCTCAACAATTTGGTTGACCAATT 238
Query 257 CTGGCCTGAGATCTCCACTAGTGTCCCCATCATTGAGAGTTTATATGAAGATGAAGAATT 316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 239 CTGGCCTGAGATCTCCACTAGTGTCCCCATCATTGAGAGTTTATATGAAGATGAAGAATT 298
Query 317 CGATCTGCATCAAAGACAGCTTGCTGCTTTGCTGGTCTCTAAGGTTTTCTATTACTTGGG 376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 299 CGATCTGCATCAAAGACAGCTTGCTGCTTTGCTGGTCTCTAAGGTTTTCTATTACTTGGG 358
Query 377 CGAGCTTAATGATTCGCTGTCTTATGCCCTAGGAGCCGGTCCCTTATTTGATGTTTCAGA 436
||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 359 CGAGCTTAATGATTCATTGTCTTATGCCCTTGGAGCTGGGCCCTTATTTGATGTTTCAGA 418
Query 437 GGATTCTGATTATGTTCATACGCTTCTGGCCAAAGCAATAGACGAATATGCCAGTCTCAG 496
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 419 GGATTCTGATTATGTTCATACGCTTCTAGCCAAAGCAATAGATGAATATGCCAGTCTCAG 478
Query 497 ATCAAAGGCAGTTGAGTCAAATGAGATGGTGGACATTGATCCCAGGCTAGAGGCGATTGT 556
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 479 ATCAAAAGCAGTTGAGTCAAATGAGATGGTGGACATTGATCCCAGGCTGGAGGCGATTGT 538
Query 557 TGAAAGAATGCTTGGAAAATGCATCAGTGATGGGAAGTATCAACAAGCCATGGGCATTGC 616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 539 TGAAAGAATGCTTGGAAAATGCATCAGTGATGGGAAGTATCAACAAGCCATGGGCATTGC 598
Query 617 GATAGAATGCCGGAGATTGGATAAGTTGGAAGAAGCTATCATTAAGAGCGATAATGTTCA 676
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 599 GATAGAATGCCGGAGATTGGATAAGTTGGAAGAGGCTATCACTAAGAGCGATAATGTTCA 658
Query 677 GGGAACTTTATCATATTGCATCAATGTTTCTCATTCCTTTGTCAACCGCAGAGAGTACAG 736
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 659 GGGAACTTTATCATATTGCATCAATGTTTCTCATTCCTTTGTTAACCGCAGAGAGTATAG 718
Query 737 ACATGAGGTGCTTAGTTTACTTGTAAAAGTCTACCAGAAGCTGCCCTCTCCTGATTATTT 796
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 719 ACATGAGGTGCTTAGTTTACTTGTTAAAGTCTACCAGAAGCTGCCTTCTCCTGATTATTT 778
Query 797 GAGCATTTGTCAATGCCTCATGTTTTTGGATGAACCGCAAGGTGTTGCAAGCATATTGGA 856
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 779 GAGCATTTGTCAATGCCTCATGTTTTTGGATGAACCGCAAGGTGTTGCAAGCATTTTGGA 838
Query 857 GAAGCTTCTTCGCTCAGAGAACAAGGATGATGCTTTATTGGCATTGCAAATTGCATTTGA 916
||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 839 GAAGCTTCTTCGCTCGGAGAGCAAGGATGATGCTTTATTGGCGTTGCAAATTGCATTTGA 898
Query 917 TCTTGTAGAGAACGAGCACCAGGCCTTTCTCTTGAGTGTTAGAGATCGCCTTCCAGCTCC 976
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 899 TCTTGTAGAGAACGAGCACCAGGCCTTTCTCTTGAGTGTTAGAGATCGCCTTCCAGCTCC 958
Query 977 CAAAACACGTGCTGTAGAAGCAACTCAGGCTGTTGAAACAACTATTGCTCCTAATGAGAA 1036
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||
Sbjct 959 CAAAACACGTCCTGTAGAAGCAACTCAGGCTGTTGAAACTACTACTGCTCCGAATGAGAA 1018
Query 1037 CCCTTCGGGAGATGTTCAGATGGCAGATGAAACTCCAGCTCAGACAATTGTGCATGAGAC 1096
||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1019 CCCTTCGGGGGATGTCCAGATGGCGGATGAAACTCCAGCTCAGACAATTGTGCACGAGAC 1078
Query 1097 GGATCCAGTTGATGCTACATATGCTGAGAGGTTAACAAAGATTAAGGGAATTTTATCTGG 1156
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 AGATCCAGTTGATGCTACATATGCTGAGAGGTTGACAAAGATTAAGGGAATTTTATCTGG 1138
Query 1157 AGAGACATCTATTCAGCTGACACTGCAGTTTCTTTACAGCCACAACAAATCGGACCTGCT 1216
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139 AGAGACATCTATTCAGCTGACACTTCAATTTCTTTACAGCCACAACAAATCGGACCTGCT 1198
Query 1217 GATACTGAAGACAATCAAACAGTCTGTAGAGATGCGGAACAGTGTATGCCACAGTGCTAC 1276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199 GATACTGAAGACAATCAAACAGTCTGTAGAGATGCGGAACAGTGTATGCCACAGTGCTAC 1258
Query 1277 AATATATGCTAATGCCATTATGCATGCTGGAACTACAGTGGACACTTTCCTTAGAGAGAA 1336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AATATATGCTAATGCCATTATGCATGCTGGAACTACAGTGGACACTTTCCTTAGAGAGAA 1318
Query 1337 TTTGGATTGGCTAAGCAGGGCAACCAATTGGGCTAAGTTCAGTGCTACCGCGGGATTAGG 1396
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 1319 TTTGGATTGGTTAAGCAGGGCAACCAATTGGGCTAAGTTTAGTGCTACAGCGGGATTAGG 1378
Query 1397 TGTTATTCACAGAGGTCACCTGCAACAGGGTAGGTCATTGATGGCTCCATACTTGCCTCA 1456
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1379 TGTTATTCACAGAGGTCATCTGCAACAGGGTAGGTCATTGATGGCTCCATACTTGCCTCA 1438
Query 1457 GGGAGGAGCAGGTGGTGGTGGGAGTCCTTATTCCGAAGGAGGTGCTTTATATGCTCTTGG 1516
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1439 GGGAGGAGCAGGTGGTGGTGGGAGTCCTTATTCCGAAGGAGGTGCTTTATATGCCCTTGG 1498
Query 1517 CCTTATTCATGCTAACCATGGCGAGGGAATCAAGCAATTTCTACGTGATAGCCTACGCAG 1576
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1499 CCTTATTCATGCTAACCATGGCGAGGGAATCAAGCAATTTCTACGTGATAGCCTACGCAG 1558
Query 1577 CACTAATGTTGAGGTCATTCAACATGGAGCTTGTTTAGGTCTTGGCTTGTCAGCTCTCGG 1636
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1559 CACTAATGTTGAGGTCATTCAACATGGAGCTTGCTTAGGTCTTGGCTTGTCAGCTCTCGG 1618
Query 1637 GACAGCTGATGAAGAGATATATGATGATGTCAAAAGCGTGCTTTATACTGACAGTGCAGT 1696
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1619 GACAGCTGATGAAGAGATATATGATGATGTCAAAAGCGTGCTTTATACTGATAGTGCAGT 1678
Query 1697 TGCTGGTGAAGCTGCTGGCATCAGCATGGGTTTATTATTGGTTGGAACTGCTACTGAAAA 1756
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1679 TGCTGGTGAAGCTGCTGGCATCAGCATGGGTTTATTATTGGTTGGAACTGCTACTGAAAA 1738
Query 1757 GGCAAGTGAGATGCTCGCTTATGCTCATGAGACACAACATGAGAAGATAATAAGGGGATT 1816
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1739 GGCAAGTGAGATGCTTGCTTATGCTCATGAGACACAGCATGAGAAGATAATAAGGGGATT 1798
Query 1817 GGCTCTAGGAATAGCTCTTACAGTATATGGTAGAGAAGAAGGAGCAGATACCTTGATTGA 1876
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1799 GGCTCTAGGAATAGCTCTTACAGTATACGGTAGAGAAGAAGGAGCAGATACCTTGATTGA 1858
Query 1877 GCAGATGACGAGAGATCAGGATCCAATCATTCGTTATGGTGGCATGTACGCATTGGCATT 1936
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1859 GCAGATGACTAGAGATCAGGATCCTATCATTCGTTATGGTGGCATGTACGCATTGGCATT 1918
Query 1937 GGCTTACAGTGGAACCGCAAACAACAAGGCAATTCGACAATTGCTGCACTTTGCTGTATC 1996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1919 GGCTTACAGTGGAACCGCAAACAACAAGGCAATTCGACAATTGCTGCACTTTGCTGTATC 1978
Query 1997 TGATGTCAGTGATGATGTTAGGAGGACTGCCGTTCTGGCACTTGGATTTGTCTTGTACTC 2056
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1979 TGATGTCAGTGATGATGTTAGGAGGACTGCTGTTCTGGCACTTGGATTTGTCTTGTACTC 2038
Query 2057 TGATCCAGAGCAGACTCCCCGTATTGTATCACTGCTTTCTGAGTCATACAATCCACATGT 2116
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2039 TGATCCAGAGCAGACTCCCCGTATTGTATCTCTGCTTTCTGAGTCGTACAATCCACATGT 2098
Query 2117 TCGCTATGGTGCGGCTCTTGCAGTGGGTATTTCTTGTGCAGGCACTGGCCTCAGCGAAGC 2176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2099 TCGCTATGGTGCGGCTCTTGCAGTGGGTATTTCTTGTGCAGGCACTGGCCTCAGCGAAGC 2158
Query 2177 GATATCCTTGTTGGAGCCACTTACATCAGATGTTGTTGACTTTGTTCGTCAAGGTGCTTT 2236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2159 GATATCCTTGTTGGAGCCACTTACATCAGATGTTGTTGACTTTGTTCGTCAAGGTGCTTT 2218
Query 2237 GATTGCAATGGCCATGGTGATGGTTCAAATTAGCGAAGCTAGCGATTCTCGTGTTGGAGT 2296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2219 GATTGCAATGGCCATGGTGATGGTTCAAATTAGCGAAGCTAGCGATTCTCGTGTTGGAGC 2278
Query 2297 ATTTAGGCGCCAACTTGAGAAGATTATACTTGACAAGCACGAAGATACAATGAGCAAGAT 2356
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2279 ATTTAGGCGCCAACTTGAGAAGATTATACTCGACAAGCACGAAGATACAATGAGCAAGAT 2338
Query 2357 GGGAGCGATTCTGGCCTCTGGTATCCTTGATGCTGGTGGTAGGAACGTTACTATAAGACT 2416
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2339 GGGAGCAATTCTGGCCTCTGGTATCCTTGATGCTGGTGGTAGGAACGTTACTATCAGACT 2398
Query 2417 GCTCTCTAAGACCAAACATGACAAAGTCACTGCTGTTATCGGCCTTGCAGTCTTCAGCCA 2476
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2399 ACTCTCTAAGACCAAACATGACAAAGTCACTGCTGTTATCGGCCTTGCAGTCTTCAGCCA 2458
Query 2477 GTTTTGGTATTGGTACCCACTGATCTATTTCATTAGTTTGGCCTTCTCACCAACCGCTTT 2536
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2459 ATTTTGGTATTGGTACCCACTGATCTATTTCATTAGTTTGGCCTTCTCACCAACCGCTTT 2518
Query 2537 CATCGGTTTGAACTATGACCTTAAGGTCCCAAAGTTTGAGTTCATGTCACATGCAAAACC 2596
|||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2519 CATCGGTTTGAATTACGACCTTAAGGTCCCCAAGTTTGAGTTCATGTCACACGCAAAACC 2578
Query 2597 GTCTTTATTTGAGTACCCAAAACCCACCACGGTTCCTACAGCCAATACCGCCGTTAAACT 2656
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 2579 GTCTTTGTTTGAGTACCCAAAACCCACCACGGTTCCTACAGCCAATACCGCTGTGAAACT 2638
Query 2657 TCCAACCGCTGTTCTCTCAACTTCAGTTAAAGCCAAAGCTAGGGCTAAGAAAGAAGCAGA 2716
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2639 TCCAACCGCTGTTCTCTCAACCTCAGTTAAAGCCAAAGCTAGGGCTAAGAAAGAAGCAGA 2698
Query 2717 GCAAAAAGCTATTGCTGAGAAAACATCTGGCCCTGAAAAGCCTGTCAATGAAAGTGGATC 2776
|||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2699 GCAAAAAGCTATTGCTGAAAAAACATCTGGTCCTGAAAAACCTGTCAATGAAAGTGGATC 2758
Query 2777 TGGAAAAGGAAAAGCATCAACTGAGAAGGAAGGAGACTCTATGCAGGTCGATAGCCCAGC 2836
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2759 TGGAAAAGGAAAAGCATCAACTGAGAAGGAAGGAGACTCTATGCAGGTCGATAGCCCAGC 2818
Query 2837 AGCGGTCGAGAAGAAAGCACCTGAGCCTGAGCCAGCGTTTGAGATTTTAGTGAACCCAGC 2896
|||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2819 AGCGGTCGAGAAGAAAGCTGCTGAGCCAGAGCCAGCATTTGAGATTCTAGTGAACCCAGC 2878
Query 2897 TCGAGTAGTCCCAGCTCAAGAGAAATACATAAAGTTACTTGATGACAGCAGATATGTACC 2956
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2879 TCGAGTAGTCCCAGCTCAAGAGAAATACATAAAGTTACTTGAAGACAGCAGATATGTACC 2938
Query 2957 AGTGAAGCTAGCACCGTCAGGTTTCGTTCTTCTCAAAGACTTGCGTGAACACGAGCCAGA 3016
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2939 AGTGAAGCTAGCTCCGTCAGGTTTCGTTCTTCTCAAAGACTTGCGTCAACACGAGCCAGA 2998
Query 3017 GGTTCTCTCTCTGACCGACGCACCAACTTCAACAGCTTCTCCTGCAACTGGTACAGCAGC 3076
|||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2999 GGTTCTCTCTCTGACCGATGCCCCAACTTCAACAGCTTCTCCTGCAACTGGT---GCAGC 3055
Query 3077 GGCTGCACAAGGAACCCCGGCCTCAGCTATGGCCGTAGATGATGAGCCACAACCTCCACA 3136
||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3056 GGC---ACAAGGAACCACAGCCTCGGCTATGGCCGTAGATGATGAGCCACAACCTCCACA 3112
Query 3137 AGCCTTTGAATACGCTTCATGATTTTATTT-CATTTAAAATTAGTGGGAATTTGTTGTTG 3195
|||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3113 AGCCTTTGAATACGCTTCATGATTTTATTTTCTTTTAAAATTAGTGGGAATTTGTTGTTG 3172
Query 3196 GTTTTATTGGTTTCTGTTGAAAGACAAAAGGCAGAGAGAAAAACAGATCTTTGAACTTTG 3255
||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3173 GTTTTATTGGTTTCTGTTGAAAGACAAAAAGCA-A-AGAAAAACAGATCTTTGAACTTTG 3230
Query 3256 AGATAACTGCTTCTTGTCATTTGCAACTGGTTTCATGTTCAACTACGATCTT-GTATTAG 3314
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||
Sbjct 3231 AGATA-CTGCTTCTTGTCATTTGCAACTGGTTTCAAGTTCAATTACGATCTTTGTGTTAG 3289
Query 3315 GTACTTCTCTTTT 3327
|||||| ||||||
Sbjct 3290 GTACTTTTCTTTT 3302
> Ahg470466 jgi|Araly1|470466|fgenesh2_kg.1__420__AT1G04810.1
Length=3177
Score = 3369 bits (1824), Expect = 0.0
Identities = 2670/3072 (87%), Gaps = 84/3072 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 156 ATGGTTAGTTCCGCTGGAGGATTACTAGCAATGCTCAACGAGCCTCATCCTGT-TTTGAA 214
|||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || |||||| | ||||||
Sbjct 27 ATGGTTAGTTCCGCCGGTGGGTTACTGGCAATGCTCAACGAACCCCATCCT-TCTTTGAA 85
Query 215 GCTTCATGCGCTCTCT-A-ACCTCAACA-ATTTGGTTGACCAATTCTGGCCTGAGATCTC 271
||||| |||||||| | | ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 86 ACTTCA--CGCTCTCTCATATCTCAACAGA-TTGGTTGACCAATTTTGGCCTGAGATCTC 142
Query 272 CACTAGTGTCCCCATCATTGAGAGTTTATATGAAGATGAAGAATTCGATCTGCATCAAAG 331
|||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||| |||||||||
Sbjct 143 CACTAGTGTCCCAATCATAGAGAGCTTATACGAAGATGAAGAGTTTGATCAGCATCAAAG 202
Query 332 ACAGCTTGCTGCTTTGCTGGTCTCTAAGGTTTTCTATTACTTGGGCGAGCTTAATGATTC 391
|||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 203 ACAGCTTGCTGCGTTGTTGGTCTCCAAGGTTTTCTATTACTTGGGTGAGCTTAACGATTC 262
Query 392 GC-TGTCTTATGCCCTAGGAGCCGG-TCCCTTATTTGATGTTTCAGAGGATTCTGATTAT 449
| |||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 263 -CTTGTCCTATGCCCTTGGAGCTGGAT-CCTTATTTGATGTGTCAGAGGATTCTGATTAT 320
Query 450 GTTCATACGCTTCTGGCCAAAGCAATAGACGAATATGCCAGTCTCAGATCAAAGGCAGTT 509
||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 321 ATTCATACTCTTCTAGCCAAAGCAATAGATGAGTATGCTATTCTCAGATCAAAGGCAGTC 380
Query 510 GAGTCAAATGA-GATGGTGGACATTGATCCC-AGGCTAGAGGCGATTGTTGAAAGAATGC 567
||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||| || | ||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 381 GAGTCAAGTGAGGAT-GTGGAAATTGA-CCCGAGATTGGAGGCCATTGTTGAACGAATGC 438
Query 568 TTGGAAAATGCATCAGTGATGGGAAGTATCAACAAGCCATGGGCATTGCGATAGAATGCC 627
| | |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 439 TAGAAAAATGTATCACTGACGGGAAGTATCAACAAGCCATGGGCATTGCTATAGAATGCC 498
Query 628 GGAGATTGGATAAGTTGGAAGAAGCTATCATTAAGAGCGATAATGTTCAGGGAACTTTAT 687
||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||
Sbjct 499 GGAGATTGGATAAGTTGGAGGAAGCGATCATAAAGAGCGAAAATGTGCAGGGAACATTAT 558
Query 688 CATATTGCATCAATGTTTCTCATTCCTTTGTCAACCGCAGAGAGTACAGACATGAGGTGC 747
| || |||||||||||||| || || ||||| |||| |||||| || ||||||||||| |
Sbjct 559 CTTACTGCATCAATGTTTCCCACTCTTTTGTTAACCACAGAGAATATAGACATGAGGTTC 618
Query 748 TTAGTTTACTTGTAAAAGTCTACCAGAAGCTGCCCTCTCCTGATTATTTGAGCATTTGTC 807
|| | |||||||| || ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 619 TTCGGTTACTTGTTAATGTCCACCAGAAGCTGGCTTCTCCTGATTATTTGAGCATTTGCC 678
Query 808 AATGCCTCATGTTTTTGGATGAACCGCAAGGTGTTGCAAGCATATTGGAGAAGCTTCTTC 867
||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 679 AATGCCTTATGTTCTTGGATGAACCACAAGGTGTTGCAAGCATATTGGAGAAGCTTCTTC 738
Query 868 GCTCAGAGAACAAGGATGATGCTTTATTGGCATTGCAAATTGCATTT-GATCTTGTAGAG 926
| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||
Sbjct 739 GTTCAGAGAGTAAAGATGATGCTTTATTGGCTTTGCAAATCGC-TTTCGATCTTGTAGAG 797
Query 927 AACGAGCACCAGGCCTTTCTCTTGAGTGTTAGAGATCGCCTTCCAGCTCCCAAAACACGT 986
|| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||
Sbjct 798 AATGAGCACCAGGCATTTCTCATGAGTGTAAGAGACCGCCTTCCAGCGCCCAAGACCCGT 857
Query 987 GCTGTAGAAGCAACTCAGGCTGTTGAAACAACTATTGCTCCTAATGAGAACCCT-TCGGG 1045
||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||| || |||
Sbjct 858 CCTGTAGAAGCAGTTCAAGCTGTTGAAACCTCTACTGCTCAGAATGAGAACACTGAAGGG 917
Query 1046 AGATGTTCAGATGGCAGATGAAACTCCAGCTCAGACAATTGTGCATGAGACGGATCCAGT 1105
||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |
Sbjct 918 -GATGTCCAGATGGCGGATGAAACTCCATCTCAGACAATTGTGCATGAAACAGATCCTGC 976
Query 1106 TGATGCTACATATGCTGAGAGGTTAACAAAGATTAAGGGAATTTTATCTGGAGAGACATC 1165
||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 977 TGACGCTGTGTACGCTGAGAGGTTAACAAAGGTTAAGGGAATTTTATCTGGAGAGACATC 1036
Query 1166 TATTCAGCTGACACTGCAGTTTCTTTACAGCCACAACAAATCGGACCTGCTGATACTGAA 1225
|| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1037 AATACAACTGACCCTCCAGTTTCTTTACAGCCATAACAAATCGGACCTGCTGATCCTGAA 1096
Query 1226 GACAATCAAACAGTCTGTAGAGATGCGGAACAGTGTATGCCACAGTGCTACAATATATGC 1285
|||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1097 GACAATCAAACAATCCGTTGAGATGCGGAACAGTGTATGTCACAGTGCTACAATATATGC 1156
Query 1286 TAATGCCATTATGCATGCTGGAACTACAGTGGACACTTTCCTTAGAGAGAATTTGGATTG 1345
|||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||
Sbjct 1157 TAATGCTATAATGCATGCTGGAACGACAGTTGACACTTTTCTCAGGGAGAATTTGGATTG 1216
Query 1346 GCTAAGCAGGGCAACCAATTGGGCTAAGTTCAGTGCTACCGCGGGATTAGGTGTTATTCA 1405
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 1217 GCTAAGCAGGGCCACCAATTGGGCTAAGTTTAGTGCTACAGCAGGATTAGGTGTTATTCA 1276
Query 1406 CAGAGGTCACCTGCAACAGGGTAGGTCATTGATGGCTCCATACTTGCCTCAGGGAGGAGC 1465
|| |||||| | |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1277 TAGGGGTCACTTACAACAGGGCAGGTCACTGATGGCCCCATACTTGCCTCAAGGAGGAGC 1336
Query 1466 AGGTGGTGGTGGGAGTCCTTATTCCGAAGGAGGTGCTTTATATGCTCTTGGCCTTATTCA 1525
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||
Sbjct 1337 AGGTGGTGGTGGGAGTCCTTATTCCGAAGGGGGTGCGTTATATGCTCTCGGTCTTATTCA 1396
Query 1526 TGCTAACCATGGCGAGGGAATCAAGCAATTTCTACGTGATAGCCTACGCAGCACTAATGT 1585
||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1397 TGCCAACCATGGTGAGGGAATCAAGCAATTTCTTCGTGATAGCCTACGCAGCACTAGTGT 1456
Query 1586 TGAGGTCATTCAACATGGAGCTTGTTTAGGTCTTGGCTTGTCAGCTCTCGGGACAGCTGA 1645
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||
Sbjct 1457 TGAGGTTATTCAACATGGAGCTTGTTTAGGTCTTGGTTTGGCAGCTCTTGGGACAGCTGA 1516
Query 1646 TGAAGAGATATATGATGATGTCAAAAGCGTGCTTTATACTGACAGTGCAGTTGCTGGTGA 1705
|||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1517 TGAAGATATATATGATGATATCAAAAGTGTGCTTTACACTGACAGTGCTGTTGCTGGTGA 1576
Query 1706 AGCTGCTGGCATCAGCATGGGTTTATTATTGGTTGGAACTGCTACTGAAAAGGCAAGTGA 1765
|||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 1577 AGCTGCTGGCATCAGCATGGGTCTATTGTTGGTTGGAACTGCAACTGATAAGGCAAGTGA 1636
Query 1766 GATGCTCGCTTATGCTCATGAGACACAACATGAGAAGATAATAAGGGGATTGGCTCTAGG 1825
|||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1637 GATGCTTGCTTATGCTCACGAGACTCAGCATGAGAAGATAATAAGGGGATTGGCTCTAGG 1696
Query 1826 AATAGCTCTTACAGTATATGGTAGAGAAGAAGGAGCAGATACCTTGATTGAGCAGATGAC 1885
|| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1697 AACAGCTCTCACAGTATATGGTAGAGAAGAGGGAGCAGATACATTGATTGAGCAGATGAC 1756
Query 1886 GAGAGATCAGGATCCAATCATTCGTTATGGTGGCATGTACGCATTGGCATTGGCTTACAG 1945
|||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||
Sbjct 1757 TAGAGATCAGGATCCTATCATCCGTTATGGTGGAATGTATGCACTCGCATTGGCTTACAG 1816
Query 1946 TGGAACCGCAAACAACAAGGCAATTCGACAA-TTGCTGCACTTTGCTGTATCTGATGTCA 2004
|||||| ||||||||||| || ||||| ||| || || ||||||||||| |||||||| |
Sbjct 1817 TGGAACTGCAAACAACAAAGCCATTCGCCAACTT-CTTCACTTTGCTGTGTCTGATGTTA 1875
Query 2005 GTGATGATGTTAGGAGGACTGCCGTTCTGGCACTTGGATTTGTCTTGTACTCTGATCCAG 2064
|||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1876 GTGACGATGTCAGGAGGACGGCTGTTCTTGCACTTGGATTTGTCTTATACTCTGATCCAG 1935
Query 2065 AGCAGACTCCCCGTATTGTATCACTGCTTTCTGAGTCATACAATCCACATGTTCGCTATG 2124
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 1936 AGCAGACTCCCCGTATTGTATCCCTTCTTTCTGAGTCGTACAATCCACATGTCCGCTATG 1995
Query 2125 GTGCGGCTCTTGCAGTGGGTATTTCTTGTGCAGGCACTGGCCTCAGCGAAGCGATATCCT 2184
| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||
Sbjct 1996 GCGCAGCTCTTGCAGTTGGCATATCTTGTGCAGGCACTGGCCTGAGTGAGGCGATATCCT 2055
Query 2185 TGTTGGAGCCACTTACATCAGATGTTGTTGACTTTGTTCGTCAAGGTGCTTTGATTGCAA 2244
||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |
Sbjct 2056 TGTTGGAGCCACTTACATCAGATGTGGTAGACTTTGTTCGTCAAGGTGCTCTGATTGCCA 2115
Query 2245 TGGCCATGGTGATGGTTCAAATTAGCGAAGCTAGCGATTCTCGTGTTGGAGTATTTAGGC 2304
|||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||
Sbjct 2116 TGGCCATGGTGATGGTCCAAATTAGTGAAGCAAGCGATTCTCGCGTTGGAGCATTTAGGC 2175
Query 2305 GCCAACTTGAGAAGATTATACTTGACAAGCACGAAGATACAATGAGCAAGATGGGAGCGA 2364
| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2176 GTCAACTTGAGAAGATAATACTTGACAAGCATGAAGATACAATGAGCAAGATGGGAGCAA 2235
Query 2365 TTCTGGCCTCTGGTATCCTTGATGCTGGTGGTAGGAACGTTACTATAAGACTGCTCTCTA 2424
|| |||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||
Sbjct 2236 TTTTGGCTTCAGGTATTCTTGATGCTGGTGGAAGGAATGTGACGATAAGACTGCTTTCTA 2295
Query 2425 AGACCAAACATGACAAAGTCACTGCTGTTATCGGCCTTGCAGTCTTCAGCCAGTTTTGGT 2484
|||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 2296 AGACAAAACATGACAAAGTCACTGCGGTCATTGGACTTGCTGTCTTCAGCCAATTTTGGT 2355
Query 2485 ATTGGTACCCACTGATCTATTTCATTAGTTTGGCCTTCTCACCAACCGCTTTCATCGGTT 2544
||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||||
Sbjct 2356 ATTGGTACCCATTGATTTACTTCATAAGCTTGGCATTTTCACCAACTGCGTTCATTGGTT 2415
Query 2545 TGAACTATGACCTTAAGGTCCCAAAGTTTGAGTTCATGTCACATGCAAAACCGTCTTTAT 2604
||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |
Sbjct 2416 TGAACTACGATCTCAAAGTCCCAAAGTTCGAATTCATGTCGCATGCAAAACCATCTTTGT 2475
Query 2605 TTGAGTACCCAAAACCCACCACGGTTCCTACAGCCAATACCGCCGTTAAACTT-CCAACC 2663
||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||| || |||||
Sbjct 2476 TTGAGTATCCAAAACCAACCACGGTTGCTACTGCCAACACCGCCGCGAAA-TTACCAACA 2534
Query 2664 GCTGTTCTCTCAACTTCAGTTAAAGCCAAAGCTAGGGCTAAGAAAGAAGCAGAGCAAAAA 2723
||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2535 GCTGTGCTCTCAACCTCAGCCAAAGCCAAAGCTAGGGCTAAGAAAGAAGCAGAGCAGAAA 2594
Query 2724 GCTATTGCTGAGAAAACATCTGGCCCTGAAAAGCCTGTCAATGAAAGTGGATCTGGAAAA 2783
| || | | | | || |||||| ||| ||| ||| | ||||||||
Sbjct 2595 ---A---CT-A-A-----T--G-CC--GAAAAGTCTGGCAACGAA-G-----CTGGAAAA 2630
Query 2784 GGAAAAGCA--T-CA-ACTGAGAAGGAAGGAGACTCTATGCAGGTCGATAGCCCAGC-AG 2838
| ||||||| | || | |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||| |
Sbjct 2631 GCAAAAGCAGCTTCAGA-TGAGAAGGAACCAGAGTCTATGCAGGTTGATAGCACAGCTAC 2689
Query 2839 --CGGTCGAGAAGAAAGCACCTGAGCCTGA-GCCAGCGTTTGAGATTTTAGTGAACCCAG 2895
|||| |||||||| | |||||| || || | ||||||||||| ||||||| ||||
Sbjct 2690 AACGGTGGAGAAGAAGGT---TGAGCCAGAAGCAA-CGTTTGAGATTCTAGTGAATCCAG 2745
Query 2896 CTCGAGTAGTCCCAGCTCAAGAGAAATACAT-AAAGTT-ACTTGATGACAGCAGATATGT 2953
|||| |||||||| | || ||||||||||| ||| || | | || || |||||||||||
Sbjct 2746 CTCGTGTAGTCCCTTCACAGGAGAAATACATCAAA-TTGA-TGGAGGAAAGCAGATATGT 2803
Query 2954 ACCAGTGAAGCTAGCACCGTCAGG-TTTCGTTCTTCTCAAAGACTTGCGTGAACACGAGC 3012
||| ||||||||||| || ||||| ||| || ||||||| |||||||||| || ||||
Sbjct 2804 ACCGGTGAAGCTAGCTCCATCAGGGTTT-GTCCTTCTCAGAGACTTGCGTCCTCATGAGC 2862
Query 3013 CAGAGGTTCTCTCTCTGACCGACGCACCAACTTCAACAGCTTCTCCTGCAACTGGTACAG 3072
| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||
Sbjct 2863 CTGAGGTTCTGTCTCTGACCGATGCACCAACTTCAACAGCATCTCCTGCAGGGGGTGCAG 2922
Query 3073 CAGCGGCTGCACAAGG--AAC---C--CCGGC-C-TCAGCTATGGCCGTAGATGATGAGC 3123
|||| || | ||||| ||| | || | | || ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2923 CAGCTGCAGGACAAGCCCAACAAGCATCCACCACCTCTGCTATGGCCGTAGATGACGAGC 2982
Query 3124 CACAACCTCCACAAGCCTTTGAATACGCTTC---ATGATTTTATTTCATTTAAAATTAGT 3180
||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| | |||||
Sbjct 2983 CACAACCTCCACAGGCCTTTGAATACGCTTCTCCATGATTTTGTTT--TTTGA--TTAGT 3038
Query 3181 GGG-AATTTGTT 3191
|| ||||||||
Sbjct 3039 GGCCAATTTGTT 3050
> Ahg315425 jgi|Araly1|315425|fgenesh1_pm.C_scaffold_2000458
Length=2637
Score = 767 bits (415), Expect = 0.0
Identities = 701/835 (84%), Gaps = 35/835 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 156 ATGGTTAGTTCCGCTGGAGGA-T-TACTAGCAATGCTCAACGAGCCTCATCCTGT-TTTG 212
||| ||||||| || ||| | | |||| |||||||||||||| | |||||| | ||
Sbjct 13 ATGATTAGTTCGGC--GAGTAGTGTACTCGCAATGCTCAACGAAACACATCCT-TCACTG 69
Query 213 AAGCTTCATGCGCTCTCT-AACCTCAACA-ATTTGGTTGACCAATTCTGGCCTGAGATCT 270
|| ||||| |||||| | || ||||||| |||| ||| | ||||| ||||| |||||||
Sbjct 70 AAACTTCAAGCGCTC-ATAAATCTCAACAGATTT-GTTCATCAATTTTGGCCAGAGATCT 127
Query 271 CCACTAGTGTCCCCATCATTGAGAGT--TTATATGAAGATGAAGAA-TTCGATCTGCATC 327
|| |||| |||| ||| || ||||| |||||| |||||||| || ||| ||| |||||
Sbjct 128 CCGCTAGCCTCCCAATC-TT-AGAGTGCTTATATAAAGATGAA-AAGTTCAATCAGCATC 184
Query 328 AAAGACAGCTTGCTGCTTTGCTGGTCTCTAAGGTTTTCTATTACTTGGGCGAGCTTAATG 387
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 185 TAAGACAGCTTGCTGCATTGCTTATCTCTAAGGTTTTCTATTACTTGGGTGAGCTTAACA 244
Query 388 ATTCGCTGTCTTATGCCCTAGGAGCCGG-TCCCTTATTTGATGTTTC-AGAGGATTCTGA 445
|||| |||| |||||||| ||||| || | | || |||| || | | || || |||||
Sbjct 245 ATTCATTGTCCTATGCCCTTGGAGCTGGAT-CTTTGTTTGCTG-TGCTTGATGAATCTGA 302
Query 446 TTA-TGTTCATACGCTTCTGGCCAAAGCAATAGACGAATATGCCAGTCTCAGATCAAAGG 504
||| | || |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||
Sbjct 303 TTACT-TTAATACTCTTCTAGCCAAAGCAATAGATGAGTATGCTAGTCTCAGATGGAAGG 361
Query 505 CAGTTGAGTCAAATGAGA---TGGTGGACATTGATCC-CAGGCTAGAGGCGATTGTTGAA 560
|| | |||| |||||||| ||||||||||||| || ||| || ||||| |||||||||
Sbjct 362 CAATCGAGTTAAATGAGATGGTGGTGGACATTGA-CCACAGACTGGAGGCTATTGTTGAA 420
Query 561 -AGAATGCTTGG-AAAATGCATCAGTGATGGGAAGTATCAACAAGCCATGGGCATTGCGA 618
| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 421 CA-AATG-TTGGAAAAATGTATCAGTGATGGAAAGTATCAACAAGCCATGGGCATTGCTA 478
Query 619 TAGAATGCCGGAGATTGGATAAGTTGGAAGAAGCTATCATTAAGAGCGATA-ATGTTCAG 677
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | | ||||||||
Sbjct 479 TAGAATGCCGGAGATTGGATAAGTTGGAAGAAGCTATAACGAAGAGCAA-AGATGTTCAG 537
Query 678 GGAACTTTATCATATTGCATCAATGTTTCTCATTCCTTTGTCAACCGCAGAGAGTACAGA 737
|| |||||| |||||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| || |||
Sbjct 538 AAAAGTTTATCTTATTGCATCAATGTTTCTCACTCTTTTATTAACCGTAGAGAATATAGA 597
Query 738 CATGAGGTGCTTAGTTTACTTGTAAAAGTCTACCAGAAGCTGCCCTCTCCTGATTATTTG 797
|||||| ||| | |||||||| || ||||||||||||||| | | |||||||||||||
Sbjct 598 TTTGAGGTTCTTCGGTTACTTGTTAATGTCTACCAGAAGCTGACTTGTCCTGATTATTTG 657
Query 798 AGCATTTGTCAATGCCTCATGTTTTTGGATGAACCGCAAGGTGTTGCAAGCATATTGGAG 857
|||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 AGCATTTGCCAGTGCCTTATGTTCTTGGATGAACCGCAAGGTGTTGCAAGCATATTGGAG 717
Query 858 AAGCTTCTTCGCTCAGAGAACAAGGATGATGCTTTATTGGCATTGCAAATTGCATTTGAT 917
|| |||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 718 AAACTTCTTCGTTCGGAGGACAAGGATGATGCTTTACTGGCGTTGCAAATTGCTTTTGAT 777
Query 918 CTTGTAGAGAACGAGCACCAGGCCTTTCTCTTGAGTGTTAGAGATC-GCCTTCCA 971
||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 778 CTTGTAGAGAACGAGCACCAGGCATTCCTCATGAGTGTTAGAGA-CAGCCTTCCA 831
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 129509920919
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5