BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G33210.1
Length=2107
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg933903 jgi|Araly1|933903|scaffold_401891.1 2841 0.0
Ahg930498 jgi|Araly1|930498|scaffold_302955.1 1223 0.0
Ahg901203 jgi|Araly1|901203|Al_scaffold_0004_1853 534 8e-151
> Ahg933903 jgi|Araly1|933903|scaffold_401891.1
Length=1786
Score = 2841 bits (1538), Expect = 0.0
Identities = 1714/1798 (95%), Gaps = 16/1798 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 145 TGTGAGAGAATCAATCACCATGTATCGGCTTGTCTCCAACGTTGCTTCCAAAGCTAGGAT 204
|||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2 TGTGTGAGAATCAATCATCATGTATCGTCTTGTCACCAACGTTGCTTCCAAAGCTAGGAT 61
Query 205 TGCCAGAAAGTGTACAAGCCAGATTGGAAGCAGGCTCAATTCTACTAGGAATTATGCAGC 264
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||
Sbjct 62 TGCCAGAAATTGTACAAGCCAGATTGGAAGCAGGCTCAGTTCTACTAGGAATTATGCTGC 121
Query 265 AAAAGACATAAGGTTCGGTGTTGAAGCTCGGGCTTTAATGCTTAGGGGTGTTGAGGATCT 324
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||
Sbjct 122 AAAAGACATAAGGTTCGGTGTTGAAGCTCGGGCTTTGATGCTTAAGGGTGTCGAGGATCT 181
Query 325 TGCTGATGCAGTTAAAGTCACTATGGGACCCAAGGGTCGTAATGTCATCATCGAACAAAG 384
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 182 TGCTGATGCAGTTAAAGTCACTATGGGACCTAAGGGTCGTAATGTCATCATCGAACAAAG 241
Query 385 CTGGGGTGCACCAAAGGTGAC-AAAGGATGGTGTGACTGTTGCCAAGAGCATTGAGTTCA 443
||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 242 CTGGGGTGCACCAAAGGTGACTAAA-GATGGTGTGACTGTTGCCAAGAGCATTGAGTTCA 300
Query 444 AGGATAGAATTAAGAACGTTGGTGCCAGTCTTGTGAAACAGGTTGCTAACGCCACAAATG 503
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 AGGACAGAATTAAGAACGTTGGTGCCAGTCTTGTCAAACAGGTTGCTAACGCCACAAATG 360
Query 504 ACGTAGCTGGTGATGGAACAACGTGTGCCACAGTCCTTACTAGAGCTATCTTCACGGAAG 563
|||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||
Sbjct 361 ACGTTGCTGGTGATGGAACAACATGTGCTACAGTCCTAACTCGAGCTATCTTCACGGAAG 420
Query 564 GTTGTAAATCAGTTGCCGCTGGAATGAATGCAATGGACCTAAGACGTGGTATCAAATTGG 623
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GTTGTAAATCAGTTGCCGCTGGAATGAATGCAATGGACCTAAGACGTGGTATCAAATTGG 480
Query 624 CAGTTGATACTGTTGTGACGAACTTGCAGAGCCGAGCACGCATGATTAGCACCTCTGAAG 683
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 481 CAGTTGATACTGTTGTGACAAACTTGCAGAGCCGAGCACGCATGATTAGCACTTCTGAAG 540
Query 684 AAATCGCCCAAGTTGGAACAATATCAGCTAATGGAGATAGGGAAATTGGTGAACTGATTG 743
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 541 AAATTGCCCAAGTTGGAACAATATCAGCTAATGGAGATAGAGAAATTGGTGAACTGATTG 600
Query 744 CAAAGGCTATGGAAACTGTCGGCAAAGAGGGAGTGATCACAATTCAAGATGGCAAGACCT 803
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 CAAAGGCTATGGAAACTGTTGGCAAAGAGGGAGTGATCACAATTCAAGATGGCAAGACCT 660
Query 804 TGTTTAATGAGCTGGAAGTTGTTGAGGGTATGAAGATTGACAGGGGATACATCTCCCCGT 863
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 661 TGTTTAATGAGCTGGAAGTTGTTGAGGGTATGAAGATTGACAGAGGATACATCTCCCCAT 720
Query 864 ACTTCATAACTAACCCGAAAACACAAAAATGTGAACTAGAAGATCCTCTCATTCTTATCC 923
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 721 ACTTCATAACTAACCCGAAAACCCAAAAATGTGAACTAGAAGATCCTCTCATTCTTATTC 780
Query 924 ACGAGAAGAAAATTTCCAATATAAACGCAATGGTGAAAGTATTAGAACTGGCCCTCAAGA 983
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 781 ACGAGAAGAAAATTTCCAATATAAACGCTATGGTGAAAGTCTTAGAACTGGCCCTCAAGA 840
Query 984 AGCAAAGGCCGCTGCTGATCGTTGCTGAGGATGTGGAGAGCGATGCTCTTGCCACCCTAA 1043
||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 841 AGCAAAGGCCGCTGCTGATAGTTGCCGAGGATGTGGAGAGTGATGCTCTTGCCACCCTCA 900
Query 1044 TTCTGAACAAACTTCGTGCTA-ATATCAAGGTCTGTGCTGTGAAGGCCCCTGGTTTTGGA 1102
|||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 TTCTGAACAAACTTCGTGCTGGA-ATCAAGGTCTGTGCTGTGAAGGCCCCTGGTTTTGGA 959
Query 1103 GAGAACCGAAAGGCCAATTTACATGATCTAGCTGCCCTCACTGGAGCCCAGGTAATAACA 1162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 960 GAGAACCGAAAGGCCAATTTACATGATCTAGCTGCCCTCACCGGAGCCCAGGTAATAACA 1019
Query 1163 GAAGAGTTGGGTATGAATCTAGACAACATTGACCTCAGTATGTTTGGAAACTGCAAGAAG 1222
|||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1020 GAAGAGTTAGGTATGAATCTCGACAACATTGACCTCAGTATGTTCGGAAACTGCAAGAAG 1079
Query 1223 GTAACGGTATCCAAAGATGATACTGTTGTTCTCGATGGGGCTGGTGACAAGCAAGCAATT 1282
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 ATAACTGTATCCAAAGATGATACTGTTGTTCTCGATGGGGCTGGTGACAAGCAAGCAATT 1139
Query 1283 GGGGAACGATGTGAACAGATACGATCCATGGTTGAAGCAAGCACTTCTGATTATGACAAG 1342
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 1140 GGGGAGCGATGTGAACAGATACGATCCATGGTTGAAGTGAGCACGTCTGATTATGACAAG 1199
Query 1343 GAGAAGTTGCAAGAAAGGTTGGCTAAGCTTTCGGGTGGTGTTGCTGTACTAAAGATTGGA 1402
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 GAGAAGTTGCAAGAAAGGTTGGCTAAGCTTTCGGGTGGTGTTGCTGTACTAAAGATTGGA 1259
Query 1403 GGAGCAAGTGAGACAGAAGTTAGTGAAAAGAAAGATAGAGTAACGGATGCTCTAAATGCC 1462
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1260 GGAGCGAGTGAGACAGAAGTTAGCGAAAAGAAAGATAGAGTAACTGATGCTCTAAATGCC 1319
Query 1463 ACTAAAGCAGCCGTAGAGGAGGGTATTGTTCCAGGTGGTGGTGTTGCTCTTTTGTATGCT 1522
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 ACTAAAGCAGCCGTAGAAGAGGGTATTGTTCCAGGTGGTGGTGTTGCTCTTTTGTATGCT 1379
Query 1523 TCGAAAGAACTTGAGAAGCTTTCCACAGCTAACTTTGATCAGAAAATTGGTGTTCAAATC 1582
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 TCGAAAGAACTTGATAAGCTTTCCACAGCTAACTTTGATCAGAAAATTGGTGTTCAAATC 1439
Query 1583 ATTCAAAACGCACTCAAGACACCTGTTTACACGATTGCTTCCAATGCTGGAGTCGAGGGT 1642
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 ATTCAAAACGCTCTCAAGACACCTGTTTACACGATTGCTTCCAATGCTGGAGTCGAGGGT 1499
Query 1643 GCAGTTGTCGTAGGCAAGCTTTTGGAACAAGATAATCCTGACCTTGGTTATGATGCTGCT 1702
|| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 GCTGTTATCGTAGGCAAGCTGTTGGAGCAAGATAATCCTGACCTTGGTTATGATGCTGCT 1559
Query 1703 AAAGGAGAATATGTGGACATGATAAAGGCTGGTATTATCGATCCTTTGAAAGTGATCAGA 1762
|||||||||||||| |||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1560 AAAGGAGAATATGTAGACATGGTAAAAGCCGGTATTATTGATCCTTTGAAAGTGATCAGA 1619
Query 1763 ACCGCATTAGTTGATGCTGCAAGTGTTTCGTCTTTGTTGACAACGACGGAAGCAGTTGTG 1822
|| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1620 ACTGCATTGGTTGATGCTGCAAGTGTCTCGTCTTTGTTGACAACGACTGAAGCAGTTGTG 1679
Query 1823 ACTGAGATTCCAACGAAAGAGGTAGCATCTCcgggtatgggcggtggtggcatgggcggc 1882
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1680 ACTGAGATTCCAACGAAAGAGGTTGCGTCTCCGGGTATGGG---TGGTGGCATGGG---- 1732
Query 1883 atgggtggcatgggcggtatgggaggaatgggtTTCTGAGGAGAACTATAAACCCTGA 1940
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||
Sbjct 1733 -TGG----CATGGGCGGTATGGGAGGAATGGGTTTCTGAGAAGAACCATAAACGCTGA 1785
> Ahg930498 jgi|Araly1|930498|scaffold_302955.1
Length=1775
Score = 1223 bits (662), Expect = 0.0
Identities = 1298/1605 (81%), Gaps = 44/1605 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 251 AGGAATTATGCAGCAAAAGACA-TAAGGTTCGGTGTTGAAGCTCGGGCTTTAATGCTTAG 309
||||| |||||||| ||||| | ||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 106 AGGAACTATGCAGCGAAAGAAATTAA-GTTTGGTGTTGAAGCTCGAGCTTTGATGCTTAA 164
Query 310 GGGTGTTGAGGATCTTGCTGATGCAGTTAAAGTCACTATGGGACCCAAGGGTCGTAATGT 369
||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||
Sbjct 165 GGGTGTTGAAGATCTTGCCGATGCTGTTAAAGTCACCATGGGTCCAAAGGGACGTAATGT 224
Query 370 CATCATCGAACAAAGCTGGGGTGCACC-AAAGGTGACAAAGGATGGTGTGACTGTTGCCA 428
| || || ||||| |||||||| || ||| |||||||| |||||||| |||||||| |
Sbjct 225 TGTGATTGAGCAAAGTTGGGGTGCTCCTAAA-GTGACAAAAGATGGTGTTACTGTTGCTA 283
Query 429 AGAGCATTGAGTTCAAGGATAGAATTAAGAACGTTGGTGCCAGTCTTGTGAAACAGGTTG 488
| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 284 AAAGCATTGAGTTCAAAGACAAAATTAAGAACGTTGGTGCTAGTCTTGTGAAGCAGGTTG 343
Query 489 CTAACGCCACAAATGACGTAGCTGGTGATGGAACAACGTGTGCCACAGTCCTTACTAGAG 548
| || || || ||||| || ||||||||||| || || ||||| || || || || | |
Sbjct 344 CAAATGCTACTAATGATGTTGCTGGTGATGGTACTACTTGTGCTACTGTACTCACCCGGG 403
Query 549 CTATCTTCACGGAAGGTTGTAAATCAGTTGCCGCTGGAATGAATGCAATGGACCTAAGAC 608
|||| || || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||
Sbjct 404 CTATATTTACCGAAGGATGCAAATCAGTTGCCGCAGGAATGAATGCAATGGACTTGCGAC 463
Query 609 GTGGTA--TCAAATTGGCAGTTGATACTGTTGTGACGAA-CTTGCAGAGCCGAGCACGCA 665
| |||| || | ||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||| | ||| | |
Sbjct 464 GAGGTATTTC-CA-TGGCAGTTGATGCTGTGGTGACAAACCTT-AAAAGCAGGGCAAGGA 520
Query 666 TGATTAGCACCTCTGAAGAAATCGCCCAAGTTGGAACAATATCAGCTAATGGAGATAGGG 725
|||| ||||| |||||||| || || || ||||| || || || ||||||||||| ||||
Sbjct 521 TGATCAGCACATCTGAAGAGATTGCACAGGTTGGGACCATTTCTGCTAATGGAGAGAGGG 580
Query 726 AAATTGGTGAACTGATTGCAAAGGCTATGGA-AACTGTCGGCAAAGAGGGAGTGATCACA 784
||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || || ||||||
Sbjct 581 AAATTGGTGAACTGATTGCAAAGGCTATGGAGAAG-GTTGGCAAAGAAGGTGTAATCACA 639
Query 785 ATTCAAGATGGCAAGACCTTGTTTAATGAGCTGGAAGTTGTTGAGGGTATGAAGATTG-A 843
|| |||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| |||| |
Sbjct 640 ATCCAAGATGGAAAGACATTGTTTAACGAGTTGGAAGTTGTAGAGGGGATGAA-ATTGGA 698
Query 844 CAGGGGATACATCT-CCCCGTACTTCATAACTAACCCGAAAACACAAAAATGTGAACTAG 902
||| || || | || |||| ||||| || || || | ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 699 CAGAGGTTATA-CTTCCCCTTACTTTATCACGAATCAAAAAACCCAAAAATGTGAACTAG 757
Query 903 AAGATCCTCTCATTCTTATCCACGAGAAGAAAATTTCCAAT-ATAAACGCAATGGTGAAA 961
| |||||||||||||||||||| || ||||| || || || || ||| | || ||||||
Sbjct 758 ATGATCCTCTCATTCTTATCCATGAAAAGAAGATCTC-AAGCATCAACTCTATAGTGAAA 816
Query 962 GTATTAGAACTGGCCCTCAAGAAGCAAAGGCCGCTGCTGATCGT-TGCTGAGGATGTGGA 1020
|| || || |||| || |||| ||||||||| ||| |||| || | |||| ||||||||
Sbjct 817 GTGTTGGAGTTGGCTCTGAAGAGGCAAAGGCCACTGTTGATTGTGT-CTGAAGATGTGGA 875
Query 1021 GAGCGATGCTCTTGCCACCCTAATTCTGAACAAACTTCGTGCTA-ATATCAAGGTCTGTG 1079
|| ||||||||||| || || || || ||||| || || || | |||||||||||||
Sbjct 876 AAGTGATGCTCTTGCAACTCTTATCCTTAACAAGCTCCGCGCCGGA-ATCAAGGTCTGTG 934
Query 1080 CTGTGAAGGCCCCTGGTTTTGGAGAGAACCGAAAGGCCAATTTACATGATCTAGCTGCCC 1139
| | ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| || || || |||||||
Sbjct 935 CCATCAAGGCCCCTGGATTTGGAGAGAATAGGAAGGCCAATTTGCAAGACCTTGCTGCCC 994
Query 1140 TCACTGGAGCCCAGGTAATAACAGAAGAG-TTGGGTATGAATCTAGACAACATTGACCTC 1198
| ||||| | |||| || ||||| ||| |||| |||||||| || || | |||||
Sbjct 995 TTACTGGTGGAGAGGTTATCACAGATGAGCTTGGC-ATGAATCTGGAGAAGGTGGACCTG 1053
Query 1199 AGTATGTTTGGAAACTGCAAGAAGGTAACGGTATCCAAAGATGATACTGTTGTTCTCGAT 1258
| ||| | |||| |||||| ||||| || || ||||| || || |||||| |||| |||
Sbjct 1054 GGCATGCTAGGAACCTGCAAAAAGGTTACAGTCTCCAAGGACGACACTGTTATTCTTGAT 1113
Query 1259 GGGGCTGGTGACAAGCAAG-CAATTGGGGAACGATGTGAACAGAT-ACGATC--CATGGT 1314
|||||||| |||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||| | | || || |
Sbjct 1114 GGGGCTGGCGACAAGAAAGGCA-TTGAGGAAAGATGTGAACAGATTAGG-TCAGCAA--T 1169
Query 1315 TGAAGCA-AGCACTTCTGATTATGACAAGGAGAAGTTGCAAGAAAGGTTGGCTAAGCTTT 1373
|||| | ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1170 TGAA-CTGAGCACCTCAGATTATGACAAGGAAAAACTGCAAGAAAGGTTGGCTAAGCTCT 1228
Query 1374 CGGGTGGTGTTGCTGTACTAAAGATTGGAGGAGCAAGTGA-GACAGAAGTTAGTGAAAAG 1432
| || |||||||| || | |||||||||||||||||||| | | |||||| |||| |||
Sbjct 1229 CTGGAGGTGTTGCAGTTTTGAAGATTGGAGGAGCAAGTGAAG-CTGAAGTTGGTGAGAAG 1287
Query 1433 AAAGATAGAGTAACGGATGCTCTAAATGCCACTAAAGCAGCCGTAGAGGAGGGTATTGTT 1492
||||| ||||| || |||||| | ||||||||||||||||| || || ||||||||| ||
Sbjct 1288 AAAGACAGAGTGACAGATGCTTTGAATGCCACTAAAGCAGCTGTTGAAGAGGGTATT-TT 1346
Query 1493 -CCAGGTGGTGGTGTTGCTCTTTTGTATGCTTCGAAAGAACTTG-AGAAGCTTTCCA-CA 1549
||||| || ||||| |||||| | || || ||| ||| ||| | || ||| ||| ||
Sbjct 1347 GCCAGGAGGAGGTGTGGCTCTTCTATACGCAGCGAGAGAG-TTGGAAAAACTT-CCAACA 1404
Query 1550 GCTAACTTTGATCAGAAAATTGGTGTTCAAATCATTCAAAACGCACTCAAGACACCTGTT 1609
|| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||| | ||||| ||||||
Sbjct 1405 GCCAACTTTGACCAGAAGATTGGTGTCCAGATTATTCAGAACGCATTGAAGACTCCTGTT 1464
Query 1610 TACACGATTGCTTCCAATGCTGGAGTCGAGGGTGCAGTTGTCGTAGGCAAGCTTTTGGAA 1669
||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || |||||||| ||||||
Sbjct 1465 TACACAATCGCTTCAAATGCTGGAGTTGAAGGTGCTGTTATAGTTGGCAAGCTCTTGGAA 1524
Query 1670 CAAGATAATCCTGACCTTGGTTATGATGCTGCTAAAGGAGAATATGTGGACATGATAAAG 1729
|||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||
Sbjct 1525 CAAGATAACCCGGACCTCGGTTATGATGCTGCTAAAGGTGAATATGTGGATATGGTGAAG 1584
Query 1730 GCTGGTATTATCGATCCTTTGAAAGTGATCAGAACCGCAT-TAGTTGATGCTGCAAGTGT 1788
| ||||| || || ||| ||||||| ||||| || || | | ||||||||||| |||||
Sbjct 1585 TCCGGTATCATAGACCCTCTGAAAGTAATCAGGACAGC-TCTGGTTGATGCTGCGAGTGT 1643
Query 1789 TTCGTCTTTGTTGACAACGACGGAAGCAGTTGTGACTGAGATTCC 1833
|| ||||||||||| || || ||||| || ||| |||| ||||
Sbjct 1644 GTCATCTTTGTTGACGACAACTGAAGCTGTAGTGGTTGAGCTTCC 1688
> Ahg901203 jgi|Araly1|901203|Al_scaffold_0004_1853
Length=537
Score = 534 bits (289), Expect = 8e-151
Identities = 389/435 (89%), Gaps = 15/435 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1474 CGTAGAGGAGGGTATTGTTCCAGGTGGTGGTGTTGCTCTTTTGTATGCTTCGAAAGAACT 1533
|||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 111 CGTAGAAGAGGGTATTGTTCCA---GGTGGTGTTGCTCTTTTGTATGCTTCAAAAGAACT 167
Query 1534 TGAGAAGCTTTCCACAGCTAACTTTGATCAGAAAATTGGTGTTCAAATCATTCAAAACGC 1593
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 168 TGAGAAGCTTTCCACAGCTAACTTTGATCAGAAAATCGGTGTTCAAATAATTCAAAACGC 227
Query 1594 ACTCAAGACACCTGTTTACACGATTGCTTCCAATGCTGGAGTCGAGGGTGCAGTTGTCGT 1653
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||
Sbjct 228 CCTCAAGACACATGTTTACACGATTGCTTCCAATGCTGGAGTAGAGGGTGCTGTTATCGT 287
Query 1654 AGGCAAGCTTTTGGAACAAGATAATCCTGACCTTGGTTATGATGCTGCTAAAGGAGAATA 1713
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||
Sbjct 288 AGGCAAGCTGTTGGAGCAAGATAATCCTGACCTTGGTTATGATGCCGCTAAAG-A-A-TA 344
Query 1714 TGTGGACATGATAAAGGCTGGTATTATCGATCCTTTGAAAGTGATCAGAACCGCATTAGT 1773
|| || ||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 345 CGTCGATATGGTAAAGTCTGGTATTATTGACCCTTTGAAAGTGATCAGAACTGCATTGGT 404
Query 1774 TGATGCTGCAAGTGTTTCGTCTTTGTTGACAACGACGGAAGCAGTTGTGACTGAGATTCC 1833
|||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 405 TGATGCTGCA-GTGT--CGTCTTTGTTGACAACAACGGAAGCAGTTGTGACTGAGATTCC 461
Query 1834 AACGAAAGAG--GTA-GCATCTCcgggtatgggcggtggtggcatgggcggcatgggtgg 1890
|||||||||| | | || ||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||| ||
Sbjct 462 AACGAAAGAGAAGGAAGCGTCTCCAGGTATGGACGGTGG---CATGGGTGGCATGGGAGG 518
Query 1891 catgggcggtatggg 1905
||||| || |||||
Sbjct 519 TATGGGAGGAATGGG 533
Score = 165 bits (89), Expect = 1e-39
Identities = 101/107 (94%), Gaps = 0/107 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1301 ATACGATCCATGGTTGAAGCAAGCACTTCTGATTATGACAAGGAGAAGTTGCAAGAAAGG 1360
|||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1 ATACGATCCATGATGGAAGCGAGCACGTCTGATTATGACAAGGAGAAGTTGAAAGAAAGA 60
Query 1361 TTGGCTAAGCTTTCGGGTGGTGTTGCTGTACTAAAGATTGGAGGAGC 1407
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TTGGCTAAGCTTTCGGGTGGTGTTGCTGTACTAAAGATTGGAGGAGC 107
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 79265799845
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5