BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G34300.1
Length=2700
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg482372 jgi|Araly1|482372|fgenesh2_kg.4__1432__AT2G34300.1 3964 0.0
Ahg473159 jgi|Araly1|473159|fgenesh2_kg.1__3113__AT1G29470.1 1781 0.0
> Ahg482372 jgi|Araly1|482372|fgenesh2_kg.4__1432__AT2G34300.1
Length=2584
Score = 3964 bits (2146), Expect = 0.0
Identities = 2407/2531 (95%), Gaps = 25/2531 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGGCCGTAACCCACTTAGCTTGCTTCACTGGAATCAACCCGCTAAGCTCGTTCTCTACTA 60
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||
Sbjct 1 AGGCCGAAACCCACTTAGCTTGCTTCACTGGAATCAACCCACTAAGCTCGTTCTCTGCTA 60
Query 61 GATCCCATCCGAAAAATCCTACTTGCTTCCCAAAGTTGCAATCTTTGAGGATCTTTGACA 120
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GATCCCATCCGAAAAATCCTGCTTGCTTCCCAAAGTTGCAATCTTTGAGGATCTTTGACG 120
Query 121 TAACC--------ATAAATATCCTCTGGTGGATGTGAGTAAGGTTGCATTGATTCCAAGG 172
||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |
Sbjct 121 TAACCATAAATAAATAAATATCCTCTGGTGGATGTGAGTAAAGTTGCATTGACTCGACGA 180
Query 173 ACATGGCGATGGGGAAGTATTCCCGTGTAGACGGGAAGAAATCATCGAGCTATGGTTTAA 232
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 181 ACATGGCGATGGGGAAGTATTCCCGTGTAGACGGGAAGAAATCATCGACCTATGGTTTAA 240
Query 233 CCATTACCATTGTTCTGTTACTTTCCCTCTGTTTAGTTGGGACATGGATGTTCATGTCTT 292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 241 CCATTACCATTGTTCTGTTACTTTCCCTCTGTTTAGTTGGGGCTTGGATGTTCATGTCTT 300
Query 293 CTTGGTCAGCCCCTGCTGATTCTGCTGGCTACTCCTCAACTGATACTGCTAAAGA--T-G 349
| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| | |
Sbjct 301 CGTGGTCTGCCCCTGCTGATTCTGTTGGCTATTCCTCAAGTGATACCGCTAAAGATGTGG 360
Query 350 ----T-TT-CTAAGAATGACTTGAGAAAAGAAGAAGGCGATCGAGATCCGAAGAACTTTT 403
| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 361 AACCTGTTACTAAAAATGACTTGAGTAAAGAAGAAGGCGATCGTGATCCGAAGAACTTTT 420
Query 404 CTGATGAAAAGAATGAAGAAAATGAGGCTGCGACTGAGAACAACCAAGTGAAGACTGATT 463
||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 421 CTGATGAAAAGAAGGAGGAAAATGAGGCTGTGACTGAGAACAACCATGTGAACACTGATT 480
Query 464 CTGAGAACTCTGCTGAGGGAAACCAGGTCAATGAGAGCTCTGGCGAGAAAACTGAAGCAG 523
||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||
Sbjct 481 CTGAGAAATCTGCTGAGGGAAACCAGGTTGATGAGAGCTCTGGCGAGAAAAGTGAGGCAG 540
Query 524 GCGAGG-AAAGAAAAGAGTCTGATGACAACAATGGTGATGGAGATGGGGAGAAAGAGAAG 582
|||| |||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TAGAGGAAAAG-AAGGAGTCTGATGACAGCAGTGGTGATGGAGATGGGGAGAAAGAGAAG 599
Query 583 AATGTGAAAGAAGTAGGATCCGAAAGTGATGAAACAACGCAGAAAGAGAAAACGCAACTG 642
|||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||
Sbjct 600 AATGTGAAAGAAGTAGAATCCGAAAGTGATGAAGCAAAGCAAAAAGAGAAAACGCAACTG 659
Query 643 GAAGAGAGCACAGAAGAAAATAAGTCCGAGGATGGTAATGGCAACGAAGAGAAGGCTGAA 702
||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||
Sbjct 660 GAAGAGAGCACGGAAGAAAACAAGTTTGAGGATGGTAATGGAAACGAAGAAAAGTCTGAA 719
Query 703 GAGAATGCTAGTGAAACTGAAGAAAGCACGGAGAAGAGTAGCAAGGAAGTCTTTCCAGCT 762
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||
Sbjct 720 GAGAGTGCTAGTGAAATTGAAGAAAGCACGGAGAAGAATAACAAGGACGTCTTTCCAGCT 779
Query 763 GGTGACCAGGCTGAAATTACAAAAGAGTCGAGCACTGGAGATGGAGCTTGGTCAACCCAA 822
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 GGTGACCAGGCGGAAATTACAAAAGAGTCGAGCACTGGAGATGGAGCTTGGTCAACCCAA 839
Query 823 TTGGTTGAGTCGCAGAACGAGAAGAAAGCACAACAGTCCTCGATATCTAAGGACCAAAGT 882
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 TTGGTTGAGTCGCAGAACGAGAAGAAAGCACAACAGTCCTCGATATCTAAGGACCAAAGT 899
Query 883 AGCTATGGATGGAAAACGTGCAATGTGACTGCTGGTCCAGACTACATCCCTTGCCTTGAC 942
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 900 AGCTATGGATGGAAAACGTGCAATGTGACCGCTGGGCCAGACTATATCCCTTGCCTTGAC 959
Query 943 AATTGGCAGGCTATCAAAAAGCTTCATACTACAATGCACTATGAACATC-GCGAGCGCCA 1001
|| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||
Sbjct 960 AACTGGCAAGCTATCAAAAAGCTTCATACTACAATGCATTATGAACA-CAGAGAGCGCCA 1018
Query 1002 TTGTCCTGAGGAATCTCCTCATTGTCTTGTGTCTCTGCCTGATGGTTATAAGCGGTCCAT 1061
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019 TTGTCCTGAGGAAACTCCTCGTTGTCTTGTGTCTCTGCCTGATGGTTATAAGCGGTCCAT 1078
Query 1062 CAAGTGGCCAAAGAGCAGGGAAAAGATCTGGTACAACAATGTTCCCCACACCAAGCTTGC 1121
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 CAAGTGGCCAAAGAGCAGGGAAAAGATCTGGTACAACAATGTTCCCCACACCAAGCTTGC 1138
Query 1122 AGAGATCAAGGGGCATCAAAATTGGGTGAAGATGAGTGGTGAACATCTGACGTTCCCTGG 1181
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||
Sbjct 1139 AGAGATCAAGGGACATCAAAATTGGGTGAAGATGAGTGGTGAACATCTTACCTTTCCTGG 1198
Query 1182 TGGTGGTACTCAGTTTAAGAATGGTGCTCTTCATTACATTGATTTCATCCAACAGTCACA 1241
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1199 TGGTGGTACTCAGTTTAAGAATGGTGCTCTTCATTACATTGATTTCATTCAACAGTCACA 1258
Query 1242 TCCTGCTATTGCATGGGGAAATAGAACCCGTGTTATATTGGATGTCGGATGTGGAGTTGC 1301
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1259 TCCTGCCATTGCATGGGGAAATAGAACCCGTGTTATATTGGATGTCGGGTGTGGAGTTGC 1318
Query 1302 TAGCTTTGGTGGTTACCTTTTCGAAAGAGATGTGCTTGCTTTGTCATTTGCTCCCAAAGA 1361
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1319 TAGCTTTGGTGGTTACCTTTTCGAAAGAGATGTGCTTGCTTTGTCATTTGCTCCCAAGGA 1378
Query 1362 TGAGCATGAGGCGCAAGTGCAATTCGCGCTGGAACGTGGTATTCCTGCAATGTTAAACGT 1421
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1379 TGAGCATGAGGCGCAAGTGCAATTCGCGCTGGAACGTGGTATTCCTGCAATGTTAAATGT 1438
Query 1422 TATGGGAACCAAAAGATTACCGTTTCCCGGTTCTGTTTTTGACCTTATCCATTGTGCTCG 1481
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1439 TATGGGAACCAAAAGATTACCCTTTCCCGGTTCTGTTTTTGACCTTATCCATTGTGCTCG 1498
Query 1482 TTGTAGAGTCCCTTGGCATATTGAAGGTGGTAAACTTCTTTTGGAATTGAACCGTGCTTT 1541
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1499 TTGTAGAGTCCCTTGGCATATTGAAGGTGGTAAACTTCTTTTGGAATTGAATCGTGCTTT 1558
Query 1542 GAGGCCGGGTGGTTTCTTTGTCTGGTCAGCGACTCCAGTCTATAGAAAGAACGAGGAAGA 1601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1559 GAGGCCGGGTGGTTTCTTTGTCTGGTCAGCGACTCCAGTCTATAGGAAGAACGAGGAAGA 1618
Query 1602 TTCTGGTATATGGAAAGCAATGTCGGAA-CTCACAAAGGCAATGTGCTGGAAGCTGGTGA 1660
||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1619 TTCTGGTATATGGAAAGCAATGTCG-AAGCTCACAAAGGCAATGTGTTGGAAGCTGGTGA 1677
Query 1661 CAATTAAGAAAGACAAACTGAATGAGGTTGGTGCCGCCATATACCAAAAGCCAACTTCAA 1720
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1678 CAATTAAGAAAGACAAACTGAATGAGGTTGGTGCTGCCATATACCAAAAGCCAACTTCAA 1737
Query 1721 ATAAATGTTACAACAAAAGACCTCAAAATGAGCCACCTCTCTGCAAGGATTCCGATGATC 1780
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1738 ATAAATGTTACAACAAAAGACCTCAAAATGATCCACCTCTCTGCAAGGATTCCGATGATC 1797
Query 1781 AAAATGCAGCCTGGAATGTTCCACTTGAGGCATGTATGCATAAAGTGACAGAAGATTCAT 1840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1798 AAAATGCAGCCTGGAATGTTCCACTTGAGGCATGTATGCATAAAGTGACAGAAGATTCAT 1857
Query 1841 CAAAGCGAGGAGCAGTGTGGCCAAACATGTGGCCAGAGAGGGTTGAAACTGCGCCTGAGT 1900
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 1858 CAAAGCGAGGAGCAGTGTGGCCAAACATGTGGCCAGAGAGGGTTGAGACTGCACCTGAGT 1917
Query 1901 GGTTGGATTCGCAGGAAGGTGTTTATGGAAAACCTGCACCAGAAGATTTCACAGCAGACC 1960
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1918 GGTTGGATTCACAGGAAGGTGTTTATGGAAAACCTGCACCAGAGGATTTCACAGCAGACC 1977
Query 1961 AAGAGAAGTGGAAAACTATTGTCTCAAAGGCATACCTTAATGACATGGGAATCGATTGGT 2020
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1978 AAGAGAAGTGGAAAACTATTGTCTCAAAGTCATACCTTAATGACATGGGAATCGATTGGT 2037
Query 2021 CTAATGTGAGAAACGTGATGGACATGAGAGCAGTCTATGGAGGATTTGCTGCTGCGTTGA 2080
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2038 CTAATGTGAGAAATGTGATGGATATGAGAGCAGTCTATGGAGGATTTGCTGCTGCATTGA 2097
Query 2081 AGGATTTGAAGTTATGGGTGATGAACGTGGTTCCTGTGGATGCGCCAGATACACTTCCCA 2140
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2098 AGGATCTGAAGTTATGGGTGATGAACGTGGTTCCTGTGGATGCGCCAGATACACTTCCCA 2157
Query 2141 TCATATATGAACGTGGTTTATTTGGAATCTATCATGACTGGTGTGAATCATTCAACACTT 2200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2158 TCATATATGAACGTGGTTTATTTGGAATCTATCATGATTGGTGTGAATCATTCAACACTT 2217
Query 2201 ATCCCAGAACTTACGACCTTCTCCATGCCGATCATCTTTTCTCTACCCTGAGGAAGAGGT 2260
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2218 ATCCGAGAACTTACGACCTTCTCCATGCCGATCATCTTTTCTCTACCCTGAGGAAGAGGT 2277
Query 2261 GCAATTTGGTGTCGGTAATGGCTGAGATTGATCGGATTCTTAGGCCACAAGGAACTTTCA 2320
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2278 GCAATTTGGTGTCGGTAATGGCTGAAATTGATCGGATTCTTAGGCCACAGGGAACTTTCA 2337
Query 2321 TCATAAGGGATGACATGGAAACATTAGGAGAAGTTGAGAAAATGGTGAAATCTATGAAAT 2380
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2338 TCATAAGGGACGACATGGAAACATTAGGAGAAGTTGAGAAAATGGTGAAATCCATGAAAT 2397
Query 2381 GGAAGGTTAAAATGACGCAGTCCAAAGACAATGAAGGCTTGCTTTCAATTGAAAAGTCAT 2440
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 2398 GGAAGGTTAAAATGACGCAGTCAAAAGACAATGAAGGCTTGCTTTCGATTCAAAAGTCAT 2457
Query 2441 GGTGGCGTCCTGAAGAAACTGAGACAATCAAATCGGCAATCGCTTAAACAAGTCAGAAAA 2500
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2458 GGTGGCGTCCTGCAGAAACTGAGACAATCAAATCGGCAATCGCTTAAACAAGTCGGAAC- 2516
Query 2501 GAAAA-GAAAA 2510
||||| |||||
Sbjct 2517 GAAAAAGAAAA 2527
> Ahg473159 jgi|Araly1|473159|fgenesh2_kg.1__3113__AT1G29470.1
Length=2723
Score = 1781 bits (964), Expect = 0.0
Identities = 1539/1810 (85%), Gaps = 66/1810 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 692 AGAAGGCTGAAGAGAATGCTAGTGAAACTGAAGAAAGCACGGAGAAGAGTAGCAAGGAAG 751
||||| | ||||| || ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |
Sbjct 810 AGAAGTCAGAAGAAAACGCTGGTGAAACTGAAGAGAGCACTGAGAAGAGT---AAGGATG 866
Query 752 TCTTT-CCAGCTGGTGACCAGGCTGAAATTACAAAAGAGTCGAGCACTGG-AGATGGAGC 809
| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||| ||
Sbjct 867 T-TTTCCCAGCTGGTGACCAGGCTGAAATCACAAAGGAATCAAGCACTGGAAG-TGGGGC 924
Query 810 TTGGTCAACCCAATTGGTTGAGTCGCAGAACGAGAAGAAAGCACAACAGTCCTCGATATC 869
||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||
Sbjct 925 CTGGTCTACCCAGTTGGTTGAATCGCAGAACGAGAAGAAAGCACAAGTGTCCTC-A-AT- 981
Query 870 TAAGGACCAAAGTAGCTATGGATGGAAAACGTGCAATGTGACTGCTGGTCCAGACTACAT 929
| | | ||||| || | ||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 982 T---------A--A---ATGGA---AAGTC-TGCAATGTGACAGCTGGACCAGACTACAT 1023
Query 930 CCCTTGCCTTGACAATTGGCAGGCTATCAAAAAGCTTCATACTACAATGCACTATGAACA 989
||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||| ||| ||||||||
Sbjct 1024 CCCTTGCCTTGACAATTGGCAAGCTATCAGAAAGCTTCATTCGACAAAGCATTATGAACA 1083
Query 990 TCGCGAGCGCCATTGTCCTGAGGAATCTCCTCATTGTCTTGTGTCTCTGCCTGATGGTTA 1049
||| ||| | |||||||| ||||||||||| | || ||||| ||||| || || || ||
Sbjct 1084 TCGTGAGAGGCATTGTCCCGAGGAATCTCCACGCTGCCTTGTTTCTCTTCCCGAAGGGTA 1143
Query 1050 TAAGCGGTCCATCAAGTGGCCAAAGAGCAGGGAAAAGATCTGGTACAACAATGTTCCC-C 1108
|||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |
Sbjct 1144 TAAGCGATCCATCAAGTGGCCTAAGAGCAGAGAAAAGATCTGGTACACCAATG-TCCCTC 1202
Query 1109 ACACCAAGCTTGCAG-AGATCAAGGGGCATCAAAATTGGGTGAAGATGAGTGGTGAACAT 1167
||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1203 ACACCAAGCTTGCAGAAG-TCAAGGGACATCAAAACTGGGTGAAGATGAGTGGTGAATA- 1260
Query 1168 C-TGACGTTCCCTGGTGGTGGTACTCAGTTTAAGAATGGTGCTCTTCATTACATTGATTT 1226
| | || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1261 CTTAACATTCCCTGGTGGAGGCACTCAGTTCAAGAATGGTGCTCTTCACTACATTGATTT 1320
Query 1227 CATCCAACAGTCACATCCTGCTATTGCATGGGGAAATAGAACCCGTGTTATATTGGATGT 1286
| ||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 CCTCCAAGAGTCATATCCTGATATTGCGTGGGGAAATAGGACCCGTGTTATATTGGATGT 1380
Query 1287 CGGATGTGGAGTTGCTAGCTTTGGTGGTTACCTTTTCGAAAGAGATGTGCTTGCTTTGTC 1346
|| ||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||||||
Sbjct 1381 TGGGTGTGGGGTTGCTAGCTTTGGGGGATATCTTTTTGATAGAGATGTACTCGCTTTGTC 1440
Query 1347 ATTTGCTCCCAAAGATGAGCATGAGGCGCAAGTGCAATTCGCGCTGGAACGTGGTATTCC 1406
|||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 1441 ATTTGCACCCAAAGACGAACACGAGGCACAGGTGCAATTTGCTCTGGAACGTGGTATTCC 1500
Query 1407 TGCAATGTTAAACGTTATGGGAACCAAAAGATTACCGTTTCCCGGTTCTGTTTTTGACCT 1466
|||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||
Sbjct 1501 TGCAATGTCAAATGTTATGGGAACCAAGAGATTACCTTTTCCAGGATCTGTTTTCGACCT 1560
Query 1467 TATCCATTGTGCTCGTTGTAGAGTCCCTTGGCATATTGAAGGTGGTAAACTTCTTTTGGA 1526
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1561 TATACATTGTGCTCGTTGTAGAGTCCCTTGGCATATCGAAGGTGGTAAACTACTTTTGGA 1620
Query 1527 ATTGAACCGTGCTTTGAGGCCGGGTGGTTTCTTTGTCTGGTCAGCGACTCCAGTCTATAG 1586
||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1621 GTTGAATCGTGCATTGAGGCCAGGTGGTTTCTTTGTCTGGTCAGCGACTCCAGTCTACAG 1680
Query 1587 AAAGAAC-GAGGAAGAT-TCTGGTATATGGAAAGCAATGTCGGAA-CTCACAAAGGCAAT 1643
|||| | ||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||
Sbjct 1681 GAAGA-CTGAGGAAGATGT-TGGCATATGGAAAGCTATGTCA-AAGCTAACAAAGGCAAT 1737
Query 1644 GTGCTGGAAGCTGGTGACAATTAAGAAAGACAAACTGAATGAGGTTGGTGCCGCCATATA 1703
||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||
Sbjct 1738 GTGCTGGAAACTGATGACGATTAAGAAAGATGAACTGAATGAAGTTGGTGCTGCCATTTA 1797
Query 1704 CCAAAAGCCAACT-TCAAATAAATGTTACAACAAAAGACCTCAAAATGAGCCACCTCTCT 1762
||| ||||||| | || |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||
Sbjct 1798 CCAGAAGCCAA-TGTCGAATAAATGCTACAACGAAAGATCTCAAAATGAGCCTCCTCTCT 1856
Query 1763 GCAAGGATTCCGATGATCAAAATGCAGCCTGGAATGTTCCACTTGAGGCATGTATGCATA 1822
|||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1857 GCAAAGACTCTGATGATCAAAATGCCGCCTGGAATGTTCCACTTGAGGCATGTATGCACA 1916
Query 1823 AAGTGACAGAAGATTCATCAAAGCGAGGAGCAGTGTGGCCA-AACATGT-GGCCAGAGAG 1880
|| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | || ||||||| ||
Sbjct 1917 GGGTAACAGAAGATTCATCAAAACGTGGAGCAGTGTGGCCTGAA-A-GTTGGCCAGAAAG 1974
Query 1881 GGTTGAAACTGCGCCTGAGTGGTTGGATTCGCAGGAAGGTGTTTATGGAAAACCTGCACC 1940
|| || |||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1975 AGTGGAGACTGTTCCTCAGTGGTTAGATTCTCAGGAAGGTGTATATGGAAAACCTGCACA 2034
Query 1941 AGAAGATTTCACAGCAGACCAAGAGAAG-TGGAAAACTATTGTCTCAAAGGCATACCTTA 1999
||| ||||||||||||||||| || | | ||||| |||||||| |||||| | ||||| |
Sbjct 2035 AGAGGATTTCACAGCAGACCATGA-ACGCTGGAAGACTATTGTTTCAAAGTCTTACCTCA 2093
Query 2000 ATGACATGGGAATCGATTGGTCTAATGTGAGAAACGTGATGGACATGAGAGCAGTCTATG 2059
||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 2094 ATGGTATGGGAATCGATTGGTCTTATGTGAGAAATGTGATGGACATGAGAGCTGTGTATG 2153
Query 2060 GAGGATTTGCTGCTGCGTTGAAGGATTTGAAGTTATGGGTGATGAACGTGGTTCCTGTGG 2119
|||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| || || ||| | |
Sbjct 2154 GAGGTTTTGCTGCTGCATTGAAGGATCTGAAACTGTGGGTGATGAATGTAGTACCTATTG 2213
Query 2120 A-TGCGCCAGATACACTTCCCATCATATATGAACGTGGTTTATTTGGAATCTATCATGAC 2178
| | | || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2214 ACT-CACCTGATACACTTCCAATTATATACGAACGTGGTTTGTTTGGAATCTATCATGAT 2272
Query 2179 TGGTGTGAATCATTCAACACTTATCC-CAGAACTTACGACCTTCTCCATGCCGATCATCT 2237
|||||||||||||||| |||||| || | || ||||||||||||| || || ||||||||
Sbjct 2273 TGGTGTGAATCATTCAGCACTTACCCTCGGA-CTTACGACCTTCTTCACGCTGATCATCT 2331
Query 2238 TTTCTCTACCCTGAGGAAGAGGTGCAATTTGGTGTCGGTAATGGCTGAGATT-GATCGGA 2296
||||||| | |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| | | || || |
Sbjct 2332 TTTCTCTTCACTGAAAAAGAGGTGCAACTTGGTGGGGGTAATGGCTGA-AGTAGACCGAA 2390
Query 2297 TTCTTAGGCCACAAGGAACTTTCATCA-TAAGGGATGACATGGAAAC-ATTAGGAGAAGT 2354
||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| || ||||||| |
Sbjct 2391 TTCTTAGACCACAAGGAACTTTCAT-AGTAAGAGATGACATGGAAACGAT-AGGAGAAAT 2448
Query 2355 TGAGAAAATGGTGAAATCTATGAAATGGAAGGTTAA-AATGACGCAGTCCAAAGACA-AT 2412
|||||| || ||||||| ||||||||||| || || |||||| || |||||||| |
Sbjct 2449 TGAGAAGATAATGAAATCGATGAAATGGAATGT-AAGAATGACACATTCCAAAGATGGA- 2506
Query 2413 GAAGGCTTGCTTTCAATTGAAAAGTCATGGTGGCGTCCTGA-AGAAACTGAGACAAT-CA 2470
||||| ||||| || || | |||||||||||||||||| | ||| | |||||||| ||
Sbjct 2507 GAAGGATTGCTCTCTGTTCAGAAGTCATGGTGGCGTCCT-ACAGAGGCCGAGACAATTCA 2565
Query 2471 AATCGGCAAT 2480
||||||||
Sbjct 2566 G-TCGGCAAT 2574
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 101853315130
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5