BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G34660.1
Length=5617
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg482430 jgi|Araly1|482430|fgenesh2_kg.4__1490__AT2G34660.1 8693 0.0
Ahg473263 jgi|Araly1|473263|fgenesh2_kg.1__3217__AT1G30400.2 5177 0.0
> Ahg482430 jgi|Araly1|482430|fgenesh2_kg.4__1490__AT2G34660.1
Length=5382
Score = 8693 bits (4707), Expect = 0.0
Identities = 5142/5348 (96%), Gaps = 45/5348 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 282 TGATTGCTTGTCACTGTTCTATCTTTTATATAT-GATTAAATGCAATTTTGCCCCTTTTT 340
||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||| |||| ||||
Sbjct 68 TGATTGCTTGTCACTGTTCTATCTTTT-T-TATGGATTAAATGCAA-TTTCCCCCCTTTT 124
Query 341 ACGCGCGAATGTATTTATTATCTTTCGCACTCTGGGTCCATTTCTTGTCACTTGAGCACA 400
|||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 125 ACGCGCGAATGTTTTTATTATCTTTCTCACTCTGGGTCCATTTGTTGTCACTTGAGCACA 184
Query 401 TAatgattgatttatga-ctttttaaagttatga-aaatttattatttttgttgctatgg 458
||||||||||||||||| |||||| ||| || | |||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 185 TAATGATTGATTTATGACCTTTTT--AGTGAT-ACAAATTTATGATTTTTGTTGCTGTGG 241
Query 459 ttttttgGAATTAGAAGCTCATTTCAAAGTTGTTGATTTTCTTTGCAGGGTAGGGAATTG 518
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||
Sbjct 242 --TTTTGGAATTAGAAGCTCATTTCAAAGTTGTTGAATTTCTTTGCAGGGTAGAGAATTG 299
Query 519 GTGTGGTAGCTTGTGATGCACTGTGTTTGAGGGAAAGGAAAG-GATAACGATGGGGTTTG 577
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||
Sbjct 300 GTGTGGTAGCTTGTGATGCACTGTGTCTGAGGGAAAGG-AAGAGATAAAGATGGGATTTG 358
Query 578 AGTTTATTGAATGGTATTGTAAGCCGGTGCCTAATGGTGTTTGGACAAAACAAGTGGCTA 637
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 AGTTTTTTGAATGGTATTGTAAGCCGGTGCCTAATGGTGTTTGGACAAAACAAGTGGCTA 418
Query 638 ATGCATTTGGTGCATACACGCCTTGTGCTACTGACTCTTTTGTGCTTGGTATCTCTCAAC 697
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 419 ATGCATTTGGTGCATACACGCCTTGTGCTACTGACTCTTTTGTGCTCGGTATCTCTCAAC 478
Query 698 TGGTTCTGTTGGTTCTGTGCCTGTATCGTATATGGCTCGCC-TTAAAGGATCACAAGGTG 756
|||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||
Sbjct 479 TGGTTCTGTTGGTTTTGTGTCTGTATCGTATATGGCTCACCATGAAA-GATCACAAGGTG 537
Query 757 GAGAGGTTCTGTTTGAGGTCAAGATTGTATAACTATTTCCTGGCTTTGTTGGCTGCGTAT 816
||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 538 GAGAGGTTCTGCTTGAGGTCAAAATTGTATAACTATTTCCTGGCTTTGTTGGCTGCTTAT 597
Query 817 GCTACTGCTGAGCCTTTGTTTAGATTGATCATGGGGATTTCAGTTTTAGATTTTGATGGA 876
|||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 598 GCTACTGCTGAGCCTTTGTTCAGATTGATTATGGGGATTTCAGTTTTGGATTTGGATGGA 657
Query 877 CCTGGACTTCCTCCTTTTGAGGCATTCGGATTGGGTGTCAAAGCTTTTGCTTGGGGCGCT 936
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 658 CCTGGACTTCCTCCTTTTGAGGCATTCGGATTGGGTGTCAAAGCTTTTGCTTGGGGCTCT 717
Query 937 GTAATGGTCATGATTTTAATGGAAACTAAAATTTACATCCGTGAACTCCGTTGGTATGTC 996
| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 718 GCAATGGTCATGATTTTTATGGAAACTAAAATTTACATCCGTGAACTCCGTTGGTATGTT 777
Query 997 AGGTTTGCTGTCATATATGCTCTTGTGGGGGATATGGTCTTGTTAAATCTTGTTCTCTCA 1056
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 778 AGGTTTGCTGTCATATATGCTCTTGTGGGGGATATGGTCTTGCTAAATCTTGTTCTCTCA 837
Query 1057 GTCAAGGAGTACTATAGCAGTTATGTTCTGTATCTCTACACAAGCGAAGTGGGAGCTCAG 1116
|| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||
Sbjct 838 GTTAAGGAGTTCTATAGCAGTTATGTTCTGTATCTCTACACAAGCGAGGTGGCAGCTCAG 897
Query 1117 GTTCTGTTTGGAATTCTCTTGTTTATGCATCTTCCCAATTTGGATACTTACCCTGGCTAC 1176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 898 GTTCTGTTTGGAATTCTCTTGTTTATGCATCTTCCCAATCTGGATCCTTACCCTGGCTAC 957
Query 1177 ATGCCAGTGCGGAGTGAAACTGTGGATGATTATGAGTATGAAGAGATTTCTGATGGACAA 1236
||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 958 ATGCCAGTGCGAAGTGAAACTATGGATGATTATGAGTATGAAGAGATTTCTGATGGACAA 1017
Query 1237 CAAATATGCCCTGAGAAGCATGCAAATATATTTGACAAAATCTTCTTCTCATGGATGAAT 1296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 CAAATATGCCCTGAGAAGCATGCAAATATATTTGACAAAATCTTCTTCTCATGGATGAAC 1077
Query 1297 CCCTTGATGACTTTGGGATCTAAAAGGCCTCTAACAGAGAAGGATGTGTGGTATCTAGAC 1356
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1078 CCCTTGATGACTTTGGGATCTAAAAGGCCTCTAACAGAGAAGGATGTGTGGTATCTGGAC 1137
Query 1357 ACTTGGGATCAGACTGAAACTCTGTTCACGAGTTTCCAGCATTCCTGGGATAAGGAACTA 1416
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1138 ACTTGGGATCAGACTGAAACTCTGTTCACGAGTTTTCAGCAATCCTGGGATAAGGAACTA 1197
Query 1417 CAAAAGCCGCAACCGTGGCTGTTGAGAGCATTGAACAATAGCCTGGGAGGAAGGTTTTGG 1476
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1198 CAAAAGCCGCAACCGTGGCTGTTGAGAGCATTGAACAATAGCTTGGGAGGAAGGTTTTGG 1257
Query 1477 TGGGGAGGATTTTGGAAGATCGGGAATGATTGCTCACAGTTTGTGGGACCTCTTTTACTG 1536
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 1258 TGGGGAGGATTTTGGAAGATCGGGAATGATTGCTCACAATTTGTGGGGCCTCTTTTACTG 1317
Query 1537 AATCAACTCTTAAAGTCAATGCAAGAGGATGCGCCAGCTTGGATGGGTTACATCTATGCG 1596
|||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1318 AATCAACTCTTAAAGTCAATGCAAGAAGATGAGCCAGCTTGGATGGGTTACATCTATGCG 1377
Query 1597 TTCTCAATCTTTGTTGGAGTGGTGTTCGGGGTGCTATGTGAAGCTCAATATTTCCAGAAT 1656
||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1378 TTCTCTATCTTTGTTGGAGTGGTATTGGGGGTGCTATGTGAAGCTCAATATTTCCAGAAT 1437
Query 1657 GTCATGCGTGTTGGTTACCGACTGAGATCTGCTCTGATTGCTGCTGTGTTCCGCAAATCG 1716
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1438 GTCATGCGTGTTGGTTACCGACTGAGATCTGCCCTGATTGCTGCTGTGTTCCGCAAATCG 1497
Query 1717 TTGAGGTTAACTAATGAAGGTCGTAGAAAGTTTCAAACAGGAAAGATAACCAACTTAATG 1776
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 1498 TTGAGGTTAACTAATGAAGGTCGTAGAAAGTTTCAAACTGGAAAGATAACTAACTTAATG 1557
Query 1777 ACGACTGATGCCGAATCTCTTCAGCAAATATGCCAATCACTTCATACCATGTGGTCGGCT 1836
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1558 ACGACTGATGCCGAATCTCTTCAGCAAATTTGCCAATCACTTCATACCATGTGGTCGGCT 1617
Query 1837 CCATTTCGTATAATTATAGCACTGATTCTCCTCTATCAGCAATTGGGTGTTGCCTCGCTC 1896
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1618 CCATTTCGTATAATTATAGCACTGGTTCTCCTCTATCAGCAATTGGGTGTTGCCTCGCTC 1677
Query 1897 ATTGGTGCATTGTTGTTGGTCCTTATGTTCCCTTTACAGACTGTTATTATAAGCAAAATG 1956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1678 ATTGGTGCATTGTTGTTGGTCCTTATGTTCCCTTTACAGACTGTTATTATAAGCAAAATG 1737
Query 1957 CAGAAGCTGACAAAGGAAGGTCTGCAGCGTACTGACAAGAGAATTGGCCTTATGAATGAA 2016
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 1738 CAGAAGCTGACAAAGGAAGGTTTGCAGCGTACTGACAAGGGAATTGGCCTTATGCATGAG 1797
Query 2017 GTTTTAGCTGCAATGGATACAGTAAAGTGTTATGCTTGGGAAAACAGTTTCCAGTCCAAG 2076
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1798 GTTTTAGCTGCAATGGATACAGTAAAGTGTTATGCTTGGGAAAACAGTTTCCAGTCCAAG 1857
Query 2077 GTCCAAACTGTTCGTGATGATGAATTATCTTGGTTCCGGAAATCACAGCTCCTGGGAGCG 2136
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1858 GTCCAAACTGTACGTGATGATGAATTATCTTGGTTCCGGAAATCACAGCTCCTGGGAGCG 1917
Query 2137 TTGAATATGTTCATACTGAATAGCATTCCTGTTCTTGTGACTATTGTTTCATTTGGTGTG 2196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1918 TTGAATATGTTCATACTGAATAGCATTCCTGTTCTTGTGACTATTGTTTCATTTGGTGTG 1977
Query 2197 TTCACATTACTTGGAGGAGACCTGACCCCTGCAAGAGCATTTACGTCACTCTCTCTCTTT 2256
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 1978 TTCACATTACTTGGAGGAGACCTGACCCCTGCAAGAGCGTTTACGTCGCTCTCTCTCTTT 2037
Query 2257 GCTGTGCTTCGTTTCCCTCTCTTCATGCTTCCAAACATTATAACTCAGGTGGTAAATGCT 2316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2038 GCTGTGCTTCGTTTCCCTCTCTTCATGCTTCCAAACATTATAACTCAGGTGGTAAATGCT 2097
Query 2317 AATGTATCCTTAAAACGTCTT-GAGGAGGTATTGGCGACAGAAGAAAGAATTCTCTTACC 2375
|||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2098 AATGTATCCTTAAAACGT-TTGGAGGAGGTCTTGGCGACAGAAGAGAGAATTCTCTTACC 2156
Query 2376 AAATCCTCCCATTGAACCTGGAGAGCCAGCCATCTCAATAAGAAATGGATATTTCTCTTG 2435
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2157 AAATCCTCCCATTGAACCTGGAGAACCAGCCATCTCAATAAGAAATGGATATTTCTCTTG 2216
Query 2436 GGATTCTAAGGGGGATAGGCCGACGTTGTCAAATATCAACTTGGATGTACCTCTTGGCAG 2495
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2217 GGATTCTAAGGGGGATAGGCCGACATTGTCAAATATCAACTTGGATGTACCTCTTGGCAG 2276
Query 2496 CCTAGTTGCTGTGGTTGGTAGTACAGGCGAAGGAAAAACCTCTCTAATATCTGCTATCCT 2555
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2277 CCTAGTTGCTGTGGTTGGTAGTACAGGCGAAGGAAAAACCTCTCTAATATCTGCTATCCT 2336
Query 2556 TGGTGAACTTCCTGCAACATCTGATGCAATAGTTACTCTCAGAGGATCAGTTGCTTATGT 2615
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2337 TGGTGAACTTCCTGCAACATCTGATGCAATGGTTACTCTCAGAGGATCAGTTGCTTATGT 2396
Query 2616 TCCACAAGTTTCATGGATCTTTAATGCAACAGTACGCGACAATATACTGTTTGGTTCTCC 2675
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2397 TCCACAAGTTTCATGGATCTTTAATGCAACAGTACGCGACAATATATTGTTTGGTTCTCC 2456
Query 2676 TTTCGACCGTGAAAAGTATGAAAGGGCCATTGATGTGACTTCACTGAAGCATGACCTAGA 2735
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2457 TTTCGACCGTGAAAAGTATGAAAGGGTCATTGATGTGACTTCACTCAAGCATGACCTAGA 2516
Query 2736 GTTACTGCCTGGTGGTGATCTCACGGAGATTGGAGAAAGAGGTGTTAATATCAGTGGAGG 2795
| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 GCTACTACCTGGTGGTGATCTCACGGAGATTGGAGAAAGAGGTGTTAATATCAGTGGAGG 2576
Query 2796 ACAGAAGCAGAGGGTTTCCATGGCTAGGGCCGTTTACTCAAATTCAGATGTGTACATCTT 2855
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2577 ACAGAAGCAGAGGGTTTCCATGGCTAGGGCCGTTTACTCAGATTCAGATGTGTACATCTT 2636
Query 2856 TGATGACCCGTTAAGTGCCCTTGATGCTCATGTTGGTCAACAGGTTTTTGAAAAATGCAT 2915
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2637 TGATGACCCGTTAAGTGCCCTTGATGCTCATGTTGGTCAACAGGTTTTTGAAAAATGCAT 2696
Query 2916 AAAAAGAGAACTGGGGCAGAAAACGAGAGTTCTTGTTACAAACCAGCTCCACTTCCTATC 2975
|||||||||| | | ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2697 AAAAAGAGAATTAGCGCAGAAAACAAGGGTCCTTGTTACAAACCAGCTCCACTTCCTATC 2756
Query 2976 ACAAGTGGACAGAATTGTACTTGTGCATGAAGGCACAGTGAAAGAGGAAGGAACATATGA 3035
|||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2757 GCAAGTGGATAGAATTGTACTTGTCCATGAAGGCACAGTGAAAGAGGAAGGAACATATGA 2816
Query 3036 AGAGCTATCCAGTAATGGCCCTTTGTTCCAGAGGCTAATGGAAAATGCAGGGAAGGTGGA 3095
||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2817 AGAGCTATCCAATAATGGCCCTTTGTTCCAGAGGTTAATGGAAAATGCGGGGAAGGTGGA 2876
Query 3096 AGAATATTCAGAAGAAAATGGAGAAGCTGAGGCAGATCAAACAGCGGAACAACCAGTTGC 3155
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||
Sbjct 2877 AGAATATTCAGAAGAAAATGGAGAAGCTGAGGCAGATCAAGCAGTGGTACAACCAGTTGC 2936
Query 3156 GAATGGGAACACAAATGGTCTTCAAATGGATGGAAGTGACGATaaaaaatccaaagaagg 3215
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2937 GAATGGGAACACAAATGGTCTTCAGATGGATGGAAGTGACGATAAAAAATCCAAGGAAGG 2996
Query 3216 aaataaaaaaggagggaaa-TCTGTCCTCATCAAGCAAGAAGAACGTGAAACCGGAGTTG 3274
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2997 AAATAAAAAAGGA-GGAAAGTCTGTCCTCATCAAGCAAGAAGAACGTGAAACTGGAGTTG 3055
Query 3275 TAAGTTGGAGAGTCCTGAAGAGGTACCAGGATGCACTTGGAGGGGCATGGGTAGTGATGA 3334
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3056 TGAGTTGGAGAGTCCTGAAGAGGTACCAGGATGCACTTGGAGGGGCATGGGTAGTGATGA 3115
Query 3335 TGCTCCTTTTATGTTACGTCTTAACAGAAGTATTTCGGGTTACTAGCAGCACGTGGTTGA 3394
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3116 TGCTCCTTTTATGCTACGTCTTAACAGAAGTATTTCGGGTTACTAGCAGCATGTGGTTGA 3175
Query 3395 GTGAGTGGACTGATGCAGGAACTCCAAAGAGTCATGGACCCCTTTTCTACAATCTCATAT 3454
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3176 GTGAGTGGACTGATGCAGGAACTCCAAAGAGTCATGGACCCCTTTTCTACAATCTCATAT 3235
Query 3455 ATGCACTTCTCTCGTTTGGACAGGTTTTGGTGACATTGACCAATTCATATTGGTTGATTA 3514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3236 ATGCACTTCTCTCGTTTGGACAGGTTTTGGTGACATTGACCAATTCATATTGGTTGATTA 3295
Query 3515 TGTCCAGTCTTTATGCAGCTAAGAAGTTACACGACAATATGCTTCATTCCATACTGAGGG 3574
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 3296 TGTCCAGTCTTTATGCAGCTAAGAAGTTACACGACAATATGCTTCACTCCATACTAAGGG 3355
Query 3575 CCCCGATGTCCTTCTTCCATACCAATCCGCTAGGACGGATAATCAATCGATTCGCAAAAG 3634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3356 CCCCGATGTCCTTCTTCCATACCAATCCGCTAGGACGGATAATCAATCGATTCGCAAAAG 3415
Query 3635 ATCTGGGTGATATTGATCGAACTGTGGCCGTCTTTGTAAACATGTTTATGGGTCAAGTCT 3694
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3416 ATCTGGGTGATATTGATCGAACTGTGGCTGTCTTTGTGAACATGTTTATGGGTCAAGTCT 3475
Query 3695 CACAGCTTCTTTCAACTGTAGTGTTGATTGGCATTGTAAGCACTTTGTCCTTGTGGGCCA 3754
||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3476 CACAGCTCCTTTCAACTGTTGTCTTGATTGGCATTGTAAGCACTTTGTCCTTGTGGGCCA 3535
Query 3755 TCATGCCCCTCCTGGTCTTGTTTTATGGAGCTTATCTTTATTATCAGAACACAGCCCGTG 3814
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 3536 TCATGCCCCTCCTGGTCTTGTTTTATGGAGCGTATCTTTATTACCAGAACACAGCACGTG 3595
Query 3815 AGGTTAAGCGTATGGATTCAATTTCAAGATCGCCTGTTTATGCACAGTTTGGAGAGGCAT 3874
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3596 AGGTTAAGCGTATGGATTCAATTTCAAGATCGCCTGTTTATGCACAGTTTGGAGAGGCAT 3655
Query 3875 TGAATGGCTTATCAACTATCCGTGCTTACAAAGCATATGATCGTATGGCTGATATCAACG 3934
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3656 TGAATGGCTTATCAACTATCCGTGCTTACAAAGCATATGATCGGATGGCTGATATCAACG 3715
Query 3935 GAAGATCAATGGATAATAACATCAGATTCACTCTTGTCAACATGGGTGCCAATCGGTGGC 3994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3716 GAAGATCAATGGATAATAACATCAGATTCACTCTTGTCAACATGGGTGCCAATCGGTGGC 3775
Query 3995 TTGGAATCCGTTTAGAAACTCTGGGTGGTCTTATGATATGGCTGACAGCATCGTTTGCTG 4054
| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 3776 TCGGAATTCGTTTAGAAACTCTGGGTGGTCTTATGATTTGGCTGACAGCATCCTTTGCTG 3835
Query 4055 TCATGCAGAATGGAAGAGCGGAGAACCAACAGGCATTTGCATCTACAATGGGTTTGCTTC 4114
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3836 TCATGCAGAATGGAAGAGCGGAGAACCAACAGGCATTTGCATCTACAATGGGGTTGCTTC 3895
Query 4115 TCAGTTATGCCTTAAATATTACTAGCTTGTTAACAGGTGTTCTGAGACTTGCGAGTTTGG 4174
| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3896 TTAGTTATGCCTTAAATATTACCAGCTTGTTAACAGGTGTTCTGAGACTTGCGAGTTTGG 3955
Query 4175 CTGAGAATAGTCTAAACGCGGTCGAGCGTGTTGGCAATTATATAGAGATTCCGCCAGAGG 4234
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3956 CTGAGAATAGTCTAAACGCGGTTGAGCGTGTTGGCAATTATATAGAGATACCGCCAGAGG 4015
Query 4235 CTCCGCCTGTCATTGAGAACAACCGTCCACCTCCTGGATGGCCATCATCTGGATCCATAA 4294
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4016 CTCCGCTTGTCATCGAGAACAACCGTCCACCTCCTGGATGGCCATCATCTGGATCCATAA 4075
Query 4295 AGTTTGAGGATGTTGTTCTCCGTTACCGCCCTCAGTTACCGCCTGTGCTTCATGGGGTTT 4354
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4076 AATTTGAGGATGTTGTTCTCCGTTACCGCCCTCAGTTACCCCCTGTGCTTCATGGGGTTT 4135
Query 4355 CTTTCTTCATTCATCCAACAGATAAGGTGGGGATTGTTGGAAGGACTGGTGCTGGAAAGT 4414
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4136 CTTTCTTCATTCATCCAACAGATAAGGTGGGGATTGTTGGAAGGACTGGTGCTGGGAAGT 4195
Query 4415 CAAGCCTGTTGAATGCATTGTTTAGAATTGTGGAGGTGGAAAAAGGAAGGATCTTAATCG 4474
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4196 CAAGCCTGTTGAATGCATTATTTAGAATTGTGGAGGTGGAAAAAGGAAGGATCTTAATCG 4255
Query 4475 ATGATTGTGACGTTGGAAAGTTTGGACTGATGGACCTACGTAAAGTGCTCGGAATCATTC 4534
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4256 ATGAGTGTGACGTTGGAAAGTTTGGACTGATGGACCTACGTAAAGTGCTCGGAATCATTC 4315
Query 4535 CACAGTCACCGGTTCTTTTCTCAGGAACTGTGAGGTTCAATCTTGATCCATTTGGTGAAC 4594
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4316 CACAGTCACCAGTTCTTTTCTCAGGAACTGTGAGGTTCAATCTTGATCCATTTGGTGAAC 4375
Query 4595 ACAATGATGCTGATCTTTGGGAATCTCTAGAGAGGGCACACTTGAAGGATACCATCCGCA 4654
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4376 ACAATGATGCTGATCTTTGGGAATCTCTAGAGAGGGCACACTTGAAGGATACCATCCGCA 4435
Query 4655 GAAATCCTCTTGGTCTTGATGCTGAGGTCTCTGAGGCAGGAGAGAATTTCAGCGTGGGAC 4714
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 4436 GAAATCCTCTTGGTCTTGATGCTGAGGTCTCAGAGGCAGGAGAGAATTTCAGTGTGGGGC 4495
Query 4715 AGAGGCAATTGTTGAGTCTTTCACGTGCGCTGTTACGGAGATCTAAGATACTCGTCCTTG 4774
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4496 AGAGGCAATTGTTGAGTCTTTCACGTGCGTTGTTACGGAGATCTAAGATACTCGTCCTTG 4555
Query 4775 ATGAAGCAACTGCTGCTGTAGATGTTAGAACCGATGCCCTCATTCAGAAGACTATCCGAG 4834
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4556 ATGAAGCAACTGCTGCTGTTGATGTTAGAACCGATGCCCTCATTCAGAAGACTATCCGAG 4615
Query 4835 AAGAATTCAAGTCATGCACGATGCTCATTATCGCTCACCGTCTCAATACCATCATTGACT 4894
||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4616 AAGAATTCAAGTCATGCACGATGCTTATCATCGCTCACCGTCTCAATACCATCATTGACT 4675
Query 4895 GTGACAAAATTCTCGTGCTTGATTCTGGAAGAGTTCAAGAATTCAGTTCACCGGAGAACC 4954
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4676 GTGACAAAATTCTCGTGCTTGATTCTGGAAGAGTTCAAGAATTCAGTTCACCGGAGAACC 4735
Query 4955 TTCTTTCAAATGAAGGAAGCTCTTTCTCCAAGATGGTTCAAAGCACTGGAGCTGCAAATG 5014
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4736 TTCTTTCAAACGAAGGAAGCTCTTTCTCCAAGATGGTTCAAAGCACTGGAGCTGCAAATG 4795
Query 5015 CTGAGTACTTGCGTAGTTTAGTACTCGACAACAAGCGTGCCAAAGATGACTCACACCACT 5074
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct 4796 CTGAGTACTTGCGTAGTTTAGTACTCGACAACAAGCGTGCCAGAGATGACTCACAACACT 4855
Query 5075 TACAAGGCCAAAGGAAATGGCTGGCTTCTTCTCGCTGGGCTGCAGCCGCTCAGTTTGCTC 5134
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4856 TACAAGGCCAGAGGAAATGGCTGGCTTCTTCTCGCTGGGCTGCAGCCGCTCAGTTTGCTC 4915
Query 5135 TGGCTGCGAGTCTTACTTCGTCGCACAACGATCTTCAAAGCCTTGAAATTGAAGATGACA 5194
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4916 TGGCTGTGAGTCTTACTTCGTCGCACAACGATCTTCAAAGCCTTGAAATTGAAGATGATA 4975
Query 5195 GCAGCATTTTGAAGAGAACAAACGATGCAGTTGTGACTCTGCGCAGTGTTCTCGAGGGGA 5254
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4976 GCAGCATTTTGAAGAGAACAAACGATGCGGTTGTGACTCTGCGCAGTGTTCTCGAGGGGA 5035
Query 5255 AACACGACAAAGAGATTGCAGAGTCGCTTGAGGAACATAATATCTCTAGAGAGGGATGGT 5314
||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||
Sbjct 5036 AACACGACAAAGAGATTGCAGAGTCGCTTGAAGAACGTAATATCTCTAAAGAGGGCTGGT 5095
Query 5315 TGTCATCACTCTATAGAATGGTAGAAGGGCTTGCAGTGATGAGCAGATTGGCAAGGAACC 5374
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 5096 TGTCATCACTCTATAGAATGGTAGAAGGGCTTGCGGTGATGAGCAGATTAGCAAGGAATC 5155
Query 5375 GAATGCAACAACCGGATTACAATTTCGAAGGAAATACATTTGACTGGGACAACGTCGAGA 5434
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5156 GAATGCAACAACCGGATTACAATTTCGAAGGAAATACATTTGACTGGGACAATGTCGAGA 5215
Query 5435 TGTAGATAAGTTCATGTTAAACTAGGAATCATTGTCTCTT-CCGTAAGAAACATATA-TT 5492
|||| ||||||| | ||||| |||| ||||||||||| | || || || || || ||
Sbjct 5216 TGTAAATAAGTTAA-GTTAAGCTAGTAATCATTGTCT-TAACC--AA-AATTAT-TAGTT 5269
Query 5493 TATC--TTAACCAAAATTATTAGTTTGGTTTCCATTT-CATAAACTTAATTTTCACCTGC 5549
| | || || ||| | ||| |||||| ||||||||||||||| ||||
Sbjct 5270 T-TGGATT--CC----TTA--A-TTT-----CCATTTTCATAAACTTAATTTTGTTCTGC 5314
Query 5550 AAAGAAAATCAAACCCTGTTGTGTTCTTCGTGATAAGTAGAGAAATTACTTGAGTATCCT 5609
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||
Sbjct 5315 AAAGAAAATCAAACTCTGTTGTGTTCTTCGTGATAAGTAAAGTATTTACTTGAGTTTCCT 5374
Query 5610 TCTAACTC 5617
||||||||
Sbjct 5375 TCTAACTC 5382
> Ahg473263 jgi|Araly1|473263|fgenesh2_kg.1__3217__AT1G30400.2
Length=5079
Score = 5177 bits (2803), Expect = 0.0
Identities = 4237/4926 (86%), Gaps = 111/4926 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 567 GATGGGGTTTGAGTTTATT-GAATGGTATTGTAAGCCGGTGCCTAATGGTGTTTGGAC-A 624
||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |
Sbjct 10 GATGGGGTTTGAG-CCGTTGGATTGGTACTGTAAGCCGGTGCCGAATGGTGTGTGGACAA 68
Query 625 AAACAAGTGGCTAATGCATTTGGTGCATACACGCCTTGTGCTACTGACTCTTTTGTGCTT 684
|||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 69 AAAC-AGTGGATTATGCATTTGGTGCATACACGCCTTGTGCTATTGACTCTTTTGTGCTT 127
Query 685 GGTATCTCTCAACTGGTTCTGTTGGTTCTGTGCCTGTATCGTA-TATGGCTCGCCTTAAA 743
|| |||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||| | |||
Sbjct 128 GGCATCTCTCATCTTGTTCTGTTGATTCTGTGCCTTTATCG-ATTATGGCTCATCACAAA 186
Query 744 GGATCACAAGGTGGAGAGGTTCTGTTTGAGGTC-AAGATTGTATAACTATTTCCTGGCTT 802
||||||||| ||||| | |||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||
Sbjct 187 GGATCACAAAGTGGATAAGTTCTGCTTGAGGTCTAA-ATGGTATAACTATTTCCTGGCTC 245
Query 803 TGTTGGCTGCGTATGCTACTGCTGAGCCTTTGTTTAGATTGATCATGGGGATTTCAGTTT 862
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||
Sbjct 246 TGTTGGCTGCTTATGGTACTGCTGAGCCTTTGTTTAGATTGGTCATGAGGATCTCTGTTT 305
Query 863 TAGATTTTGATGGACCTGGACTTCCTCCTTTTGAGGCATTCGGAT-TGGGT-GTCAAAGC 920
| ||||| |||||| |||| ||||||| | |||||| ||| || | ||| | | ||
Sbjct 306 TGGATTTGGATGGAGCTGGGTTTCCTCCGTATGAGGCGTTC--ATGTTGGTCCTTGAGGC 363
Query 921 TTTTGCTTGGGGCGCTGTAATGGTCATGA-TTTTAATGGAAACTAAAATTTACATCCGTG 979
|||||||||||| ||| | | ||||||| | || |||||||||||| || |||| ||
Sbjct 364 TTTTGCTTGGGGTTCTGCATTAGTCATGACTGTT-GTGGAAACTAAAACGTATATCCATG 422
Query 980 AACTCCGTTGGTATGTCAGGTTTGCTGTCATATATGCTCTTGTGGGGGATATGGTCTTGT 1039
|||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||
Sbjct 423 AACTCCGTTGGTATGTTAGATTCGCTGTCATTTATGCTCTTGTCGGAGACATGGTGTTGT 482
Query 1040 TAAATCTTGTTCTCTCAGTCAAGGAGTACTATAGCAGTTATGTTCTGTATCTCTACACAA 1099
|||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||
Sbjct 483 TAAATCTTGTTCTCTCGGTGAAGGAGTACTATGGCAGTTTTAAACTGTATCTTTACATAA 542
Query 1100 GCGAAGTGGGAGCTCAGGTT-CTGTTTGGAATTCTCTTGTTTATGCATCTTCCC-AATTT 1157
|||| |||| || ||||||| | ||||||| |||||||||| || || ||||| |||||
Sbjct 543 GCGAGGTGGCAGTTCAGGTTGC-ATTTGGAACTCTCTTGTTTGTGTAT-TTCCCTAATTT 600
Query 1158 GGATACTTACCCTGGCTACATGCCAG-TGCGGAGTGAAACTGT-GGATGATTATGAGTAT 1215
|||| |||||||||| |||| |||| || ||| ||||||| | ||| ||||| ||||||
Sbjct 601 GGATCCTTACCCTGGTTACACACCAGTTG-GGACTGAAACT-TCGGAGGATTACGAGTAT 658
Query 1216 GAAGAGATTTCT-GATGGACAACAA-ATATGCCCTGAGAAGCATGCAAATATATTTGACA 1273
|||||| || || || ||| || || ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||
Sbjct 659 GAAGAGCTTCCTGGA-GGAGAA-AATATATGTCCTGAGAGGCATGCAAATTTATTTGACA 716
Query 1274 AAATCTTCTTCTCATGGATGAATCCCTTGATGACTTTGGGATCTAAAAGGCCTCTAACAG 1333
||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| || |
Sbjct 717 GTATCTTCTTCTCATGGTTGAATCCATTGATGACTCTGGGATCGAAACGGCCTCTCACGG 776
Query 1334 AGAAGGATGTGTGGTATCTAGACACTTGGGATCAGACTGAAACTCTGTTCACGAGTTTCC 1393
|||||||||| ||| || | |||||||||||| | ||||||||||| | | ||| ||||
Sbjct 777 AGAAGGATGTATGGCATTTGGACACTTGGGATAAAACTGAAACTCTCATGAGGAGCTTCC 836
Query 1394 AGCATTCCTGGGATAAGGAACTACAAAAGCCGC-AACCGTGGCTGTTGAGAGCATTGAAC 1452
|| | |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 837 AGAAGTCCTGGGATAAGGAACTAGAAAAGCC-CAAACCGTGGCTCTTGAGAGCACTGAAC 895
Query 1453 AATAGCC-TGGGAGGAAGGTTTTGGTGGGGAGGATTTTGGAAGATCGGGAATGATTGCTC 1511
|| |||| |||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| || ||
Sbjct 896 AACAGCCTTGGG-GGAAGGTTTTGGTGGGGTGGCTTCTGGAAGATTGGGAATGACTGTTC 954
Query 1512 ACAGTTTGTGGGACCTCTTTTACTGAATCAACTCTTAAAGTCAATGCAA-GAGGATGCGC 1570
||| || ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||| | ||| |
Sbjct 955 ACAATTCGTGGGGCCTCTTCTACTGAATGAGCTCTTAAAGTCAATGCAACTA-AATGAAC 1013
Query 1571 CAGCTTGGATGGGTTACATCTATGCGTTCTCAATCTTTGTTGGAGTGGTGTTCGGG-GTG 1629
|||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||| ||
Sbjct 1014 CAGCGTGGATAGGTTACATCTATGCAATCTCAATCTTTGTCGGAGTGGTATT-GGGTGTT 1072
Query 1630 CTATGTGAAGCTCAATATTTCCAGAATGTCATGCGTGTTGGTTACCGACTGAGATCTGCT 1689
|||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||
Sbjct 1073 CTATGTGAAGCTCAGTATTTCCAAAATGTGATGCGTGTTGGTTACCGCCTTAGGTCTGCC 1132
Query 1690 CTGATTGCTGCTGTGTTCCGCAAATCGTTGAGGTTAACTAATGAAGGTC-GTAGAAAGTT 1748
|||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| || | | || |||||
Sbjct 1133 CTGATTGCTGCTGTGTTCCGAAAATCGCTGAGGCTAACTAATGAGGGGCGGAAG-AAGTT 1191
Query 1749 TCAAACAGGAAAGATAACCAACTTAATGACGACTGATGCCGAATCTCTTCAGCAAATATG 1808
|||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||
Sbjct 1192 TCAAACAGGAAAAATAACAAACTTAATGACGACTGATGCTGAGTCGCTGCAGCAAATCTG 1251
Query 1809 CCAATCACTTCATACCATGTGGTCGGCTCCATTTCGTATAATTA-TAGCACTGATTCTCC 1867
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||
Sbjct 1252 CCAATCACTTCATACCATGTGGTCGGCTCCATTTCGTATAAT-AGTAGCGCTGGTTCTCC 1310
Query 1868 TCTATCAGCAATTGGGTGTTGCCTCGCTCATTGGTGCATTGTTG-TTGGTCCTTATGTTC 1926
|||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 1311 TCTACCAACAATTGGGTGTTGCCTCGATCATCGGTGCATTGTTTCTTG-TCCTTATGTTC 1369
Query 1927 CCTTTACAGACTGTTATTATAAGCAAAATGCAGAAGCTGACAAAGGAAGG-TCTGCAGCG 1985
||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||| | |||||||
Sbjct 1370 CCTATACAGACTGTTATTATAAGCAAAACGCAGAAGTTAACAAAAGAAGGGT-TGCAGCG 1428
Query 1986 TACTGACAAGAGAATTGGCCTTATGAATGAAGTTTTAGCTGCAATGGATACAGTAAAGTG 2045
||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 1429 TACTGACAAGAGAATTGGCCTAATGAACGAGGTTTTAGCCGCAATGGATACAGTGAAGTG 1488
Query 2046 TTATGCTTGGGAAAACAGTTTCCAGTCCAAGGTCCAAACTGTTCGTGATGATGAATTATC 2105
|||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1489 CTATGCTTGGGAAAACAGTTTTCAGGCCAAGGTTCAAACTGTACGTGATGATGAATTATC 1548
Query 2106 TTGGTTCCGGAAATCACAGCTCCTGGGAGCGTTGAATATGTTCATACTGAATAGCATTCC 2165
||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||||||
Sbjct 1549 TTGGTTCCGGAAAGCACAGCTCCTGTCAGCGTTCAATATGTTCATTCTAAACAGCATTCC 1608
Query 2166 TGTTCTTGTGACTATTGTTTCATTTGGTGTGTTCACATTACTTGGAGGAGACCTGACCCC 2225
||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||
Sbjct 1609 TGTCCTCGTGACTGTTGTTTCATTTGGTGTGTTCTCATTTCTTGGAGGAGATCTGACACC 1668
Query 2226 TGCAAGAGCATTTACGTCACTCTCTCTCTTTGCTGTGCTTCGTTTCCCTCTCTTCATGCT 2285
||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||| | ||||||||
Sbjct 1669 TGCAAGAGCGTTTACGTCACTTTCTCTATTTTCTGTGCTTCGCTTCCCTTTATTCATGCT 1728
Query 2286 TCCAAACATTATAACTCAGGTGGTAAATGCTAATGTATCCTTAAAACGTCTTG-AGGAGG 2344
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |
Sbjct 1729 TCCAAACATTATAACTCAGATGGTAAATGCTAATGTATCCTTAAACCGT-TTGGAGGAAG 1787
Query 2345 TATTGGCGACAGAAGAAAGAATTCTCTTACCAAATCCTCCCATTGAACCTGGAGAGCCAG 2404
| || |||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1788 TGCTGTCGACGGAAGAGAGAGTTCTCTTACCGAATCCTCCCATTGAACCTGGACAGCCAG 1847
Query 2405 CCATCTCAATAAGAAATGGATATTTCTCTTGGGATTCTAAGGGGGATAGGCCGACGTTGT 2464
| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||||
Sbjct 1848 CTATCTCAATAAGAAATGGATACTTCTCATGGGATTCAAAGGCGGATAGGCCAACCTTGT 1907
Query 2465 CAAATATCAACTTGGATGTACCTCTTGGCAGCCTAGTTGCTGTGGTTGGTAGTACAGGCG 2524
|||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |
Sbjct 1908 CAAACATCAACCTGGACATACCTCTTGGCAGCCTAGTTGCGGTAGTTGGCAGTACAGGAG 1967
Query 2525 AAGGAAAAACCTCTCTAATATCTGCTATCCTTGGTGAACTTCCTGCAACATCTGATGCAA 2584
||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 1968 AAGGAAAAACCTCCCTGATATCTGCTATGCTTGGGGAACTTCCTGCAAGATCTGATGCGA 2027
Query 2585 TAGTTACTCTCAGAGGATCAGTTGCTTATGTTCCACAAGTTTCATGGATCTTTAATGCAA 2644
||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2028 CAGTTACTCTTAGAGGATCAGTCGCTTATGTTCCACAAGTTTCATGGATCTTTAACGCAA 2087
Query 2645 CAGTACGCGACAATATACTGTTTGGTTCTCCTTTCGACCGTGAAAAGTATGAAAGGGCCA 2704
||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||| |
Sbjct 2088 CAGTACGTGACAATATATTGTTTGGGGCTCCTTTTGACCAAGAAAAATATGAAAGGGTGA 2147
Query 2705 TTGATGTGACTTCACTGAAGCATGACCTAGAGTTACTGCCTGGTGGTGATCTCACGGAGA 2764
|||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2148 TTGATGTGACAGCACTGCAGCATGACCTTGAGTTACTGCCTGGTGGTGACCTCACGGAGA 2207
Query 2765 TTGGAGAAAGAGGTGTTAATATCAGTGGAGGACAGAAGCAGAGGGTTTCCATGGCTAGGG 2824
|||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2208 TTGGAGAAAGGGGTGTTAACATCAGTGGGGGACAAAAGCAGAGGGTTTCTATGGCTAGGG 2267
Query 2825 CCGTTTACTCAAATTCAGATGTGTACATCTTTGATGACCCGTTAAGTGCCCTTGATGCTC 2884
|||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||| |
Sbjct 2268 CCGTTTACTCAAATTCAGATGTGTGCATCTTCGATGACCCATTGAGTGCCCTTGATGCGC 2327
Query 2885 ATGTTGGTCAACAGGTTTTTGAAAAATGCATAAAAAGAGAACTGGGGCAGAAAACGAGAG 2944
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||
Sbjct 2328 ATGTTGGTCAGCAGGTTTTTGAAAAATGCATAAAAAGAGAACTAGGGCAGACAACAAGAG 2387
Query 2945 TTCTTGTTACAAACCAGCTCCACTTCCTATCACAAGTGGACAGAATTGTACTTGTGCATG 3004
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||
Sbjct 2388 TACTTGTTACAAACCAGCTCCACTTCCTATCACAAGTGGATAAAATCCTACTTGTCCATG 2447
Query 3005 AAGGCACAGTGAAAGAGGAAGGAACATATGAAGAGCTAT-CCAGTAATGGCCCTTTGTTC 3063
| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| ||||||
Sbjct 2448 AGGGAACAGTAAAAGAAGAAGGAACATATGAAGAATTATGCCA-TAGTGGCCCATTGTTC 2506
Query 3064 CAGAGGCTAATGGAAAATGCAGGGAAGGTGGAAGAATATTCAGAAGAAAATGGAGAAGCT 3123
|||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2507 CAGAGGTTAATGGAAAATGCAGGGAAGGTTGAAGAATATTCAGAAGAAATTGGAGAAGCT 2566
Query 3124 GAGGCAGATCAAACAGCGG-AACAACCAGTTGCGAATGGGAACACAAATGGTCTTCA-AA 3181
|| | |||||||||| | | || ||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||
Sbjct 2567 GAAGTAGATCAAACATCTGTAA-AACCAGTTGAAAATGGGAACACTAATAATCTGCAGAA 2625
Query 3182 TGGATGGAAGT-GACGATaaa-aaatccaaagaaggaaataaaaaaggagggaaaTCTGT 3239
||||| || | || || ||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2626 -GGATGAAA-TCGA-GACAAAGAAATCCAAAGAAGGAAAC---------------TCTGT 2667
Query 3240 CCTCATCAAGCAAGAAGAACGTGAAACCGGAGTTGTAAGTTGGAGAGTCCTGAAGAGGTA 3299
|| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||
Sbjct 2668 GCTTGTCAAGCGAGAAGAACGTGAAACTGGAGTTGTGAGTTGGAAAGTCCTGGAGAGGTA 2727
Query 3300 CCAGGATGCACTTGGAGGGGCATGGGTAGTGATGATGCTCCTTTTATGTTACGTCTTAAC 3359
|||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||
Sbjct 2728 CCAGAATGCACTTGGAGGTGCATGGGTAGTGATGATGCTCCTTATATGCTACGTCTTGAC 2787
Query 3360 AGAAGTATTTCGGGTTACTAGCAGCACGTGGTTGAGTGAGTGGACTGATGCAGGAACTCC 3419
|||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2788 TCAAGTATTTCGGGTTTCAAGCAGCACTTGGTTGAGTGAGTGGACTGATGCAGGAACCCC 2847
Query 3420 AAAGAGTCATGGACCCCTTTTCTACAATCTCATATATGCACTTCTCTCGTTTGGACAGGT 3479
|||| |||||||||||| ||||| ||| | | ||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 2848 TAAGACTCATGGACCCCTATTCTATAATATTGTCTATGCGCTTCTTTCGTTTGGACAGGT 2907
Query 3480 TT-TGGTGACATTGACCAATTCATATTGGTTGATTATGTCCAGTCTTTATGCAGCTAAGA 3538
| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 2908 CTCTG-TGACATTGATCAATTCATATTGGTTGATTATGTCCAGTCTATATGCAGCTAAAA 2966
Query 3539 AGTTACACGACAATATGCTTCATTCCATACTGAGGGCCCCGATG-TCCTTCTTCCATACC 3597
|| | || || ||||||| ||||||||| ||||| || ||| || ||||| || |||
Sbjct 2967 AGATGCATGATGCTATGCTTGGTTCCATACTAAGGGCTCCAATGGTC-TTCTTTCAAACC 3025
Query 3598 AATCCGCTAGGACGGATAATCAATCGATTCGCAAAAGATCTGGGTGATATTGATCGAACT 3657
||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 3026 AATCCATTAGGACGGATAATCAATCGATTTGCTAAAGATATGGGCGATATTGATCGAACT 3085
Query 3658 GTGGCCGTCTTTGTAAACATGTTTATGGGT-CAAGTCTCACAGCTTCTTTCAACTGT-AG 3715
||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |
Sbjct 3086 GTGGCAGTCTTTGTAAACATGTTTATGGGTTCAA-TCGCACAGCTTCTTTCAACTGTTA- 3143
Query 3716 TGTTGATTGGCATTGTAAGCACTTTGTCCTTGTGGGCCATCATGCCCCTCCTGGTCTTGT 3775
| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||
Sbjct 3144 TCTTGATTGGCATTGTCAGCACTCTGTCCCTGTGGGCCATCATGCCCTTGTTGGTCGTGT 3203
Query 3776 TTTATGGAGCTTATCTTTATTATCAGAACACAGCCCGTGAGGTTAAGCGTATGGATTCAA 3835
| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||| |
Sbjct 3204 TCTATGGAGCTTATCTGTATTACCAGAACACATCTCGTGAAATTAAACGTATGGATTCCA 3263
Query 3836 TTTCAAGATCGCCTGTTTATGCACAGTTTGGAGAGGCATTGAATGG-CTTATCAACTATC 3894
| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||| | ||||
Sbjct 3264 CTACAAGATCACCCGTTTATGCTCAATTTGGAGAGGCATTGAATGGGCT-ATCTAGTATC 3322
Query 3895 CGTGCTTACAAAGCATATGATC-GTATGGCTGATATCAACGGAAGATCAATGGATAATAA 3953
|||||||| ||||||||||| | | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3323 CGTGCTTATAAAGCATATGA-CAGGATGGCTGAAATTAACGGAAGGTCAATGGATAATAA 3381
Query 3954 CATCAGATTCACTCTTGTCAACATGGGTGCCAATCGGTGGCTTGGAATCCGTTTAGAAAC 4013
|||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||
Sbjct 3382 CATCAGATTCACACTTGTAAACATGGCTGCAAATCGGTGGCTGGGAATTCGTTTGGAAGT 3441
Query 4014 TCTGGGTGGTCTTATGATATGGCTGACAGCATCGTTTGCTGTCATGCAGAATGGAAGAG- 4072
| |||| ||||| ||| | ||| |||| || || || || ||||||||||| |||| ||
Sbjct 3442 TTTGGGAGGTCTCATGGTTTGGTTGACTGCGTCATTAGCCGTCATGCAGAACGGAA-AGG 3500
Query 4073 CGGAGAACCAACAGGCATTTGCATCTACAATGGGTTTGCTTCTCAGTTATGCCTTAAATA 4132
| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 3501 CAGAGAACCAACAAGCATATGCATCTACGATGGGTTTGCTTCTCAGTTATGCGTTAAGCA 3560
Query 4133 TTACTAGCT-TGTTAACAGGTGTTCTGAGACTTGCGAGTTTGGCTGAGAATAGTCTAAAC 4191
|||| |||| | ||||||| ||| |||||||| |||||| | |||||||||||| |||||
Sbjct 3561 TTACCAGCTCT-TTAACAGCTGTACTGAGACTCGCGAGTCTAGCTGAGAATAGTTTAAAC 3619
Query 4192 GCGGTCGAGCGTGTTGGCAATTATATAGAGATTCCGCCAGAGGCTCCGCCTG-TCATTGA 4250
|||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||| || |||||||
Sbjct 3620 TCGGTTGAGCGTGTTGGAAATTATATCGAGATACCATCAGAGGCTCCAT-TGATCATTGA 3678
Query 4251 GAACAACCGTCCACCTCCTGGATGGCCATCATCTGGATCCATAAAGTTTGAGGATGTTGT 4310
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3679 AAACAACCGTCCACCTCCTGGATGGCCATCATCTGGATCCATAAAATTTGAGGATGTTGT 3738
Query 4311 TCTCCGTTACCGCCCTCAGTTACCGCCTGTGCTTCATGGGGTTTCTTTCTTCATT-CATC 4369
||| |||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||| | ||
Sbjct 3739 TCTTCGTTACCGCCCTGAATTACCTCCTGTTCTCCATGGAGTTTCGTTCTTGATTTC-TC 3797
Query 4370 CAACAGATAAGGTGGGGATTGTTGGAAGGACTGGTGCTGG-AAAGTCAAGCCTGTTGAAT 4428
||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||| |||||||| || |||
Sbjct 3798 CAATGGATAAGGTGGGAATTGTTGGAAGAACAGGCGCTGGGAAA-TCAAGCCTCTTAAAT 3856
Query 4429 GCATTGTTTAGAATTGTGGAGGTGGAAAAAGGAAGGATCTTAATCGATGATTGTGACGTT 4488
|| || || | ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||
Sbjct 3857 GCCTTATTCCGGATTGTGGAGCTCGAAAAAGGAAGGATCTTGATCGATGAATGCGACATT 3916
Query 4489 GGAA-AGTTTGGACTGATGGACCTACGTAAAGTGCTCGGAATCATTCCACAGTCACCGGT 4547
|| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| | || ||
Sbjct 3917 GGCAGA-TTTGGACTGATGGACCTACGTACAGTGCTCGGAATTATACCACAGGCGCCAGT 3975
Query 4548 TCTTTTCTCAGGAACTGTGAGGTTCAATCTTGATCCATTTGGTGAACACAATGATGCTGA 4607
|||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||
Sbjct 3976 TCTTTTCTCAGGTACTGTGAGATTCAATCTCGACCCATTTAGTGAACACAACGATGCCGA 4035
Query 4608 TCTTTGGGAATCTCTAGAGAGGGCACACTTGAAGGATACCATCCGCAGAAATCCTCTTGG 4667
||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 4036 TCTTTGGGAATCTCTTGAGAGGGCACACTTGAAAGATACTATACGCAGAAATCCTCTTGG 4095
Query 4668 TCTTGATGCTGAGGTCTCTGAGGCAGGAGAGAATTTCAGCGTGGGACAGAGGCAATTGTT 4727
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||
Sbjct 4096 TCTTGATGCTGAGGTAACTGAGGCAGGAGAGAATTTCAGTGTTGGACAGAGACAGTTGTT 4155
Query 4728 GAGTCTTTCACGTGCGCTGTTACGGAGATCTAAGATACTCGTCCTTGATGAAGCAACTGC 4787
||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 4156 GAGTCTTGCACGTGCATTGTTGCGAAGATCTAAGATACTTGTTCTTGATGAAGCAACTGC 4215
Query 4788 TGCTGTAGATGTTAGAACCGATGCCCTCATTCAGAAGACTATCCGAGAAGAATTCAAGTC 4847
|||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4216 TGCTGTTGACGTTAGAACTGATGTTCTCATCCAAAAGACCATCCGAGAAGAATTCAAGTC 4275
Query 4848 ATGCACGATGCTCATTATCGCTCACCGTCTCAATACCATCATTGACTGTGACAAAATTCT 4907
||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4276 CTGCACGATGCTAATCATCGCTCATCGTCTCAATACTATCATTGACTGTGACAAAGTTCT 4335
Query 4908 CGTGCTTGATTCTGGAAGAGTTCAAGAATTCAGTTCACCGGAGAACCTTCTTTCAAATGA 4967
||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 4336 CGTCCTTGATTCTGGAAAAGTTCAGGAATTCAGTTCACCGGAGAATCTTCTTTCAAACGG 4395
Query 4968 AGGAAGCTCTTTCTCCAAGATGGTTCAAAGCACTGGAGCTGCAAATGCTGAGTACTTGCG 5027
|| ||| |||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||
Sbjct 4396 AGAAAGTTCTTTCTCAAAGATGGTTCAAAGTACAGGAACTGCAAACGCGGAGTACTTACG 4455
Query 5028 TAGTTTAGTACTCGACAACA-AGCGTGCCAAAGATG--A-C--TCAC-A--C-CA-C-TT 5075
|||| || ||| || |||| | ||| ||| ||||| | | | | | | || | ||
Sbjct 4456 TAGTATAACACTTGAGAACACA-CGTACCAGAGATGCTAACGGTGATGATTCACAACCTT 4514
Query 5076 -ACAAGGCCAAAGGAAATGGCTGGCTTCTTCTCGCTGGGCTGCAGCCGCTCAGTTTGCTC 5134
| |||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4515 TAGAAGGTCAGAGGAAATGGCAAGCTTCTTCTCGTTGGGCTGCAGCTGCTCAGTTTGCTT 4574
Query 5135 TGGCTGCGAGTCTTACTTCGTCGCACAACGATCTTCAAAGCCTTGAAATTGAAGATGACA 5194
|||||| ||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 4575 TGGCTGTGAGCCTCACTTCATCTCACAACGACCTTCAAAGCCTTGAAATCGAAGATGATA 4634
Query 5195 GCAGCATTTTGAAGAGAACAAACGATGCAGTTGTGACTCTGCGCAGTGTTCTCGAGGGGA 5254
|||||||||||||| ||| || || || || || ||||| ||||||||||| || ||||
Sbjct 4635 ACAGCATTTTGAAGAAAACGAAGGACGCCGTCGTCACTCTACGCAGTGTTCTTGAAGGGA 4694
Query 5255 AACACGACAAAGAGATTGCAGAGTCGCTTGAGGAACA-TAATATCTCTAGAGAGGGATGG 5313
||||||| |||||||||| ||| || ||| | || | | | |||||||||||| | |||
Sbjct 4695 AACACGATAAAGAGATTGAAGATTCTCTTAACCAA-AGTGACATCTCTAGAGAGCGTTGG 4753
Query 5314 TTGTCATCACTCTATAGAATGGTAGAAGGGCTTGCAGTGATGAGCAGATTGGCAAGGAAC 5373
| | |||| || || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4754 TGGCCATCTCTTTACAAAATGGTCGAAGGGCTTGCGGTGATGAGCAGATTGGCGAGGAAC 4813
Query 5374 CGAATGCAACAACCGGATTACAATTTCGAAGG-AAATACATTTGACTGGGACAACGTCGA 5432
||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||| | |||||||||||||| |||||
Sbjct 4814 CGAATGCAACACCCGGATTACAACTTAGAAGGGAAAT-CGTTTGACTGGGACAATGTCGA 4872
Query 5433 GATGTA 5438
||||||
Sbjct 4873 GATGTA 4878
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 212741833070
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5